学术投稿

DNA芯片技术筛选K562肿瘤细胞特异性基因

彭桂福;马文丽;宋艳斌;彭翼飞;石嵘;毛向明;郑文岭

关键词:基因芯片, 白细胞, 正常人, K562细胞, 差异基因
摘要:目的应用DNA芯片技术筛选人白血病K562细胞中的肿瘤特异性基因.方法提取正常人白细胞和K562细胞基因组DNA,并用限制性内切酶Sau3AI酶切.其中K562细胞基因组酶切产物经DNA聚合酶Ⅰ补平加A后克隆到T-载体,挑选阳性克隆,用PCR扩增,以纯化的PCR产物做探针,制备K562细胞基因组DNA芯片.正常人白细胞基因组酶切产物加上人工通用接头,用限制性标记技术标记上荧光标记物Cy3,与制备的K562细胞基因组DNA芯片杂交.结果芯片杂交结果经扫描分析,发现42个K562细胞肿瘤特异性基因,进一步用序列分析证实,其中有1个为BCR(breakpoint cluster gene)基因.结论我们自制的K562细胞基因组DNA芯片可以成功地用于筛选肿瘤特异性基因,为更好地从基因组水平研究肿瘤发生的分子机制提供了新的技术途径.
南方医科大学学报杂志相关文献
  • 基底神经节区脑损害与汉语失写症关系的研究

    目的研究基底神经节损害所致汉语失写症的特点.方法采用汉语失语检查法(ABC)及汉语失写检查法(CAB)测试基底神经节损害患者的口语和书写能力,统计言语障碍类型,计算各项书写得分和失写指数.结果 38例患者中,左侧基底神经节损害21例,其中失语18例,失写18例;右侧损害14例,其中失语1例,失写4例,左右两侧失语失写率有显著性差异(P<0.01);双侧损害3例,均伴失语,失写2例.汉语书写障碍类型主要为构字障碍、字词错写和语句篇章层级书写障碍.结论基底神经节损害可导致汉语失写症,其失写语言机制可能有低灌注机制、整合中枢、环路受损、字形在脑内结构的记忆提取受损等.

    作者:金梅;刘晓加;陆兵勋;尹文刚 刊期: 2004年第05期

  • 抗HPV16E6核酶对宫颈癌CaSKi细胞侵袭表型和VEGF表达的影响

    目的探讨特异性抗HPV16E6核酶对宫颈癌CaSKi细胞侵袭表型和VEGF表达的影响.方法以脂质体法将抗HPV16E6核酶、空载体质粒分别导入CaSKi细胞,分别为CaSKi-R和CaSKi-P.测定CaSKi,CaSKi-R和CaSKi-P3种细胞的生长曲线、软琼脂克隆形成率和裸鼠体内成瘤性,RT-PCR检测3种细胞中VEGF的表达.结果 CaSKi、CaSKi-P细胞生长速率和软琼脂克隆形成率相近,CaSKi-R细胞的生长速度和软琼脂克隆形成率明显降低.CaSKi、CaSKi-P致瘤性无显著差异,而CaSKi-R致瘤性显著低于CaSKi(P<0.05).RT-PCR检测CaSKi-R细胞的VEGF mRNA的表达水平明显低于CaSKi、CaSKi-P细胞的表达,而后者的VEGF mRNA的表达水平相近.结论特异性抗HPV16E6核酶的导入降低了宫颈癌CaSKi细胞的增殖和侵袭表型,可能与宫颈癌CaSKi细胞内VEGF的表达下降有关.

    作者:刘柯;王丽莉;郑燕芳;张积仁 刊期: 2004年第05期

  • DNA芯片技术筛选K562肿瘤细胞特异性基因

    目的应用DNA芯片技术筛选人白血病K562细胞中的肿瘤特异性基因.方法提取正常人白细胞和K562细胞基因组DNA,并用限制性内切酶Sau3AI酶切.其中K562细胞基因组酶切产物经DNA聚合酶Ⅰ补平加A后克隆到T-载体,挑选阳性克隆,用PCR扩增,以纯化的PCR产物做探针,制备K562细胞基因组DNA芯片.正常人白细胞基因组酶切产物加上人工通用接头,用限制性标记技术标记上荧光标记物Cy3,与制备的K562细胞基因组DNA芯片杂交.结果芯片杂交结果经扫描分析,发现42个K562细胞肿瘤特异性基因,进一步用序列分析证实,其中有1个为BCR(breakpoint cluster gene)基因.结论我们自制的K562细胞基因组DNA芯片可以成功地用于筛选肿瘤特异性基因,为更好地从基因组水平研究肿瘤发生的分子机制提供了新的技术途径.

    作者:彭桂福;马文丽;宋艳斌;彭翼飞;石嵘;毛向明;郑文岭 刊期: 2004年第05期

  • 少酸链球菌性大量腹腔积液1例

    妇科腹腔大量积液多见于结核性和卵巢恶性肿瘤,致病菌为少酸链球菌者实属罕见.2003年3月10日,我科收治腹腔大量积液1例,术后积液经细菌学检查,培养结果为少酸链球菌,现报道如下.

    作者:张广亮;钱沁佳 刊期: 2004年第05期

  • CT图像特征的自动获取与检索新方法

    目的自动获取CT图像特征,提出实现基于内容的CT图像数据库检索新方法.方法本研究针对CT医学图像,提出应用大期望分割算法来获取其区域特征,并组合感兴趣区域的累积直方图特征、纹理和形状信息构成检索的特征向量,从而把图像表征为特征空间中的一个向量集合.结果当向数据库提交查询图像时,经过特征匹配,终按相似度由大到小的顺序返回目标图像.结论实验结果表明,本研究提出的基于内容的CT图像检索方案在满足临床需求的同时,获得了较高的查询精度和效率.

    作者:周杰;冯前进;林亚忠;陈武凡 刊期: 2004年第05期

  • 双胎之一胎儿无脑畸形1例报告

    目前国内文献尚无双羊膜囊单卵双胎之一发生无脑畸形的报告.本例病案报告为此类疾病提供产科诊断及处理经验.

    作者:苏桂栋;宋天蓉;万淑梅;龚时鹏;沈立勇;余艳红 刊期: 2004年第05期

  • 应用根管钉-复合树脂桩核制作烤瓷长桥修复牙列缺损

    目的探讨保留更多残根、扩大桩核范围修复牙列缺损的新方法.方法应用多个预成根管钉-复合树脂桩核,制作烤瓷长桥,对40例牙列缺损的患者进行缺损修复.结果经随访2~4年,有37例修复效果良好,修复成功率达92.5%.结论保留多个残根,应用多个根管钉-复合树脂桩核,联合制作烤瓷长桥,是修复牙列缺损的一种行之有效的方法.

    作者:黄坚 刊期: 2004年第05期

  • 冠心病患者血浆尾加压素Ⅱ的临床研究

    目的探讨血管活性物质尾加压素Ⅱ(UⅡ)在冠心病患者体内的表达及其变化.方法采用放射免疫法测定50例冠心病患者及20例健康体检者的血浆UⅡ的水平.结果 (1)健康对照组静脉血浆UⅡ含量为3.70±1.30pg/ml,冠心病患者的血浆UⅡ含量为1.61±1.02 pg/ml,两者有统计学差异(P=0.000).冠心病患者中稳定性心绞痛者血浆UⅡ含量为2.62±1.20pg/ml,不稳定心绞痛者UⅡ含量为1.39±0.80 pg/ml,急性心肌梗死者UⅡ含量为1.04±0.45 pg/ml,3组之间有显著性差异(P=0.004).(2)冠心病患者中冠脉血管有闭塞组静脉血浆UⅡ含量为1.29±1.02 pg/ml,单纯狭窄组UⅡ含量为1.76±1.00pg/ml,两者无统计学差异(P=0.131).(3)经皮腔内冠状动脉成型术(PTCA)及支架植入术后,出现再狭窄患者组血浆UⅡ含量为2.28±0.94pg/ml,而其他病人的血浆UⅡ含量为1.40±0.96pg/ml,两者有统计学差异(P=0.008).(4)PTCA治疗前后,股动脉血浆UⅡ的含量分别为1.18±1.14、2.22±1.77 pg/ml,两者有统计学差异(P=0.001).结论 UⅡ可能参与了冠心病的发病;在PTCA治疗后出现支架内再狭窄中可能起作用.

    作者:方石虎;李志樑;吴宏超;唐朝枢;陆青;刘海潮;严全能 刊期: 2004年第05期

  • 碘-131治疗重度甲状腺肿大伴机能亢进征38例临床观察

    目的评价碘-131对重度甲状腺肿大伴机能亢进征的疗效和安全性.方法确诊重度甲状腺肿大伴甲亢后,根据现有公式和触诊经验确定甲状腺质量,按每克甲状腺组织实际投入3.7~5.55MBq计算治疗剂量,1次口服确定剂量后随访观察治疗效果和副作用,部分病例进行了第2次甚至第3次碘-131治疗.结果 38例患者经过1~3次碘-131治疗后全部获得治愈,其中第1次治愈23例(60.5%),第2次治愈13例(34.2%),第3次治愈2例(5.3%),4例发生甲低(10.5%),无1例患者发生甲亢危象和呼吸困难.结论碘-131治疗重度甲状腺肿大伴甲亢安全又有效,可以作为常规治疗方法.

    作者:赵永胜;赵丛雯;黄铁军;何蓓;易炜 刊期: 2004年第05期

  • 人RHD基因外显子多态性研究

    目的研究人RHD基因外显子多态性,探讨中国人RhD阴性个体遗传学机制.方法用PCR-SSP法检测40例RhD(+)、120例RhD(-)和2例弱D型样本的10个外显子.结果 40例RhD阳性和2例弱D型样本均检出RHD基因的10个外显子,120例RhD阴性样本中28例样本的10个外显子全存在(占23.33%),19例样本10个外显子部分存在(占15.83%),大部分为中间缺失型,73例样本10个外显子全缺失(占60.835%).从120例RhD阴性样本中检出的19例Del型样本均能检出RHD基因的10个外显子.结论 RhD表型阴性个体的RHD基因外显子结构具有多态性,主要表现为RHD基因全缺失、RHD基因部分缺失、RHD基因不缺失3种.

    作者:周华友;兰炯采;王晓珠;王毅;樊红;孟庆宝;龚宏伟 刊期: 2004年第05期

  • PTCA及支架植入术治疗心肌梗死并重症泵功能衰竭近期效果观察

    目的探讨经皮冠状动脉血管成形术(PTCA)及支架植入术治疗心肌梗死合并重症泵功能衰竭对心功能的影响.方法分析2000年5月~2002年1月在珠江医院成功接受PTCA及支架植入术治疗的73例心肌梗死合并重症泵功能衰竭患者的临床资料,按其是否有伴发症、血管病变程度及手术的复杂程度分组,比较术前和术后7 d的左室射血分数(LvEF).结果血管病变的程度和手术的复杂程度与是否有伴发症无相关(P>0.05).除合并慢性肾功能不全的患者,其余各组患者术前和术后7 d心功能的改善均有统计学意义(P<0.05).不同程度的血管病变和不同手术复杂程度的患者心功能术前和术后7 d的提高均有显著差异.结论 PTCA及支架植入术能明显改善心肌梗死合并重症泵功能衰竭患者近期的心功能.

    作者:万颂国;严全能 刊期: 2004年第05期

  • 成肌调节因子MyoD与myogenin在肌肉损伤修复过程的动态变化

    目的探讨成肌调节因子MyoD与myogenin在肌肉损伤修复过程中的动态表达.方法用盐酸布比卡因局部注射制作肌肉损伤模型,在损伤后不同时间点取腓肠肌行冰冻切片,HE染色显示损伤肌肉的病理变化,用SABC法检测MyoD与myogenin的表达.结果 MyoD在肌肉损伤后18 h开始表达,48 h达高峰;myogenin在肌肉损伤后24 h开始表达,72 h达高峰.结论 MyoD与myogenin在肌肉损伤后的再生修复过程中起作用,可作为鉴定肌肉前体细胞和反映肌肉再生的指标.

    作者:曾缨;张成;刘克玄;李才明;冯善伟;李群;柳太云;黄文 刊期: 2004年第05期

  • 人组织型纤溶酶原激活剂牛乳腺生物反应器的研究

    目的构建组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)乳腺定位表达载体,使其在牛乳汁中高效表达,从而建立牛乳腺生物反应器.方法 RT-TD-PCR法克隆目的基因,通过酶切、连接、分离、纯化等方法构建含t-PA-cDAN的乳腺定位表达载体;采用显微注射法和乳腺注射法将融合基因转入小鼠的受精卵和小鼠及牛的乳腺组织中.结果显微注射法和乳腺注射法转基因后,t-PA可在小鼠和牛的乳汁中表达.结论所构建的乳腺定位表达载体可有效地使t-PA基因在小鼠和牛乳汁中表达,t-PA基因的表达不受转基因方法的影响,但t-PA在牛乳汁中的表达量明显高于小鼠的表达量,提示不同动物的乳蛋白调控系统有一定的差异,可能受着不同的因素或调控系统的影响.

    作者:安靓;李振林;黄伟民;黄吴键;李进 刊期: 2004年第05期

  • 海马注射淀粉样蛋白β大鼠与正常大鼠脑蛋白质组双向电泳图谱比较

    目的比较海马注射淀粉样蛋白β(Aβ)大鼠与正常大鼠脑蛋白质组双向电泳(2-DE)图谱差异,从蛋白质水平初步探索阿尔茨海默病(AD)发病机制.方法以固相pH梯度等电聚焦为第1向,SDS-PAGE垂直电泳为第2向进行2-DE.以图像分析软件ImageMaster 2D-Elite分析电泳图谱.结果海马注射Aβ大鼠与正常大鼠脑组织2-DE图谱分别检出496和491个蛋白点.对2张电泳图进行匹配后,发现有11个蛋白点仅在海马注射Aβ大鼠脑蛋白2-DE图谱中表达,而有6个蛋白点只在正常对照大鼠检测到.部分蛋白在2组大鼠脑组织中含量发生了明显变化.结论初步建立了AD动物模型比较蛋白质组学的技术方法;差异点的发现为深入理解AD发病机制及研发新药提供了有益的线索.

    作者:杨国锋;王鲁宁;赵馨;聂永慧 刊期: 2004年第05期

  • 泰索帝联合阿霉素治疗乳腺癌对心电图的影响

    目的探讨化疗药物泰索帝(taxotere)联合阿霉素一线治疗局部晚期或转移性乳腺癌对心电图的影响,并分析其临床意义.方法被确诊为局部晚期或转移性乳腺癌的250例患者,经静脉滴注泰索帝75 mg/m2和阿霉素5 mg/m2,每3周1次,每个疗程开始前和结束后各观测心电图1次,共动态观察10个疗程.结果 10个疗程结束后,250例患者中心率加快8例(3.2%),肢体导联QRS波低电压12例(4.8%),Q-T时间延长28例(18%),ST段压低18例(7.2%),T波低平29例(11.6%),T波倒置12例(4.8%),未发生变化143例(57.2%).结论化疗药物泰索帝和阿霉素对心脏有毒性,能够引起心包积液和心肌不同程度损伤,造成慢性心肌缺血缺氧,从而引起心电图QRS波群及ST-T的异常改变.

    作者:黄邹琴;李活霞;王嘉丽;万颂国 刊期: 2004年第05期

  • 骨髓间质干细胞移植治疗DKO鼠后肌组织的超微结构改变

    目的观察Duchenne型肌营养不良症模型DKO小鼠经骨髓间质干细胞(MSC)移植治疗后肌组织的超微结构改变情况.方法用体外培养纯化的第五代SD大鼠MSC经尾静脉移植治疗DKO鼠,在移植后15 w取鼠后肢腓肠肌组织进行透射电镜超微结构的观察.结果传5代后的MSC均一性好,免疫源性低;移植治疗后DKO鼠的运动功能有所改善,生存时间也有延长.肌组织的超微结构观察发现,肌细胞膜断裂、膜下组织分离水肿、核中移、局部肌原纤维松散、炎症细胞浸润和结缔组织增生等病变情况较对照鼠有改善,并出现肌膜下多个幼稚核融合现象.结论 MSC具有强大的可塑性,通过血循环可趋向病变肌组织并参与鼠肌萎缩组织的修复与再生作用.

    作者:李中;张成;陈国俊;刘晓蓉 刊期: 2004年第05期

  • 肌球蛋白轻链激酶在烧伤大鼠血清引起的内皮细胞骨架改变过程中的作用

    目的观察烧伤大鼠血清刺激人脐静脉内皮细胞株ECV-304引起的纤维状肌动蛋白在细胞内分布变化的时间效应以及肌球蛋白轻链激酶在其中的作用.方法用烧伤大鼠血清分别孵育细胞30min、1 h、2h、4h和6h.或在烧伤血清作用30 min之前或之后使用5μmol/L的ML-7作用30 min.使用罗丹明标记的鬼笔环肽探针特异性结合并显示细胞内的纤维状肌动蛋白,并在NikonTE-300荧光显微镜下观察照相.结果正常情况下,纤维状肌动蛋白主要分布在内皮细胞内的外周膜部位.使用烧伤大鼠血清进行30min~12 h的刺激后,内皮细胞内可观察到明显的应力纤维形成,并且随着刺激时间的延长而增强.可以通过使用肌球蛋白轻链激酶特异性抑制剂ML-7预处理细胞30min来抑制这种效应.此外,ML-7还能够改善烧伤大鼠血清引起的内皮细胞内肌动蛋白重排.结论本研究表明,大鼠烧伤血清能够通过激活肌球蛋白轻链激酶引起明显的细胞内肌动蛋白排列的改变.在烧伤血清刺激细胞后,抑制肌球蛋白轻链激酶可以改善烧伤大鼠血清引起的内皮细胞骨架重排.

    作者:陈波;郭晓华;王述昀;黄绪亮;黄巧冰 刊期: 2004年第05期

  • 基因工程抗体anti-HBsAg Fab原核表达体系大规模培养条件的实验研究

    目的探讨含anti-HBsAg Fab/pBAD表达载体的工程化大肠杆菌的大规模培养条件.方法在摇瓶发酵条件下探讨工程菌的生长和表达规律,摸索佳的培养模式及诱导表达条件.后根据摇瓶发酵结果于发酵罐中行补料高密度发酵试验,确定佳补料模式.结果由摇瓶发酵获得的数据表明,以培养体系处于对数生长中期为诱导表达的起点、在25℃条件下以0.2%阿拉伯糖诱导12 h,Fab的得率佳,采用溶氧控制补料模式可使培养体系的大D600达到55.2,相当于湿菌含量110g/L水平;同时,经证实Fab的抗原结合活性良好.结论初步确定了周期短、产率高且稳定可靠的发酵工艺路线,为应用原核表达体系工业化大批量生产基因工程抗体奠定了基础.

    作者:郑大勇;罗荣城;蔡红兵 刊期: 2004年第05期

  • CD86在大鼠角膜移植排斥反应中的表达及意义

    目的观察大鼠角膜组织中共刺激分子CD86(B7-2)的原位表达,以了解共刺激分子在大鼠角膜移植排斥反应中的作用和意义.方法制作大鼠角膜移植模型,观察角膜透明度、新生血管.采用免疫组化法检测CD86在角膜、脾脏组织中的表达.结果术后角膜植片均出现不同程度的新生血管,角膜水肿、混浊,基质增厚.CD86在正常的角膜组织中无阳性表达;在移植后出现急性排斥反应的角膜上皮层中有大量阳性细胞表达.在脾脏的阳性细胞表达与文献报道的一致.结论共刺激分子CD86在移植后发生排斥的角膜组织中的阳性表达,可能与免疫排斥反应有关.

    作者:白浪;陆晓和;周瑾;党森涛;张进华 刊期: 2004年第05期

  • 反义hTERT体外抑制白血病细胞增殖的研究

    目的研究反义hTERT基因对白血病细胞体外增殖的抑制作用.方法体外通过SuperFect将已构建好的正、反义hTERT真核表达载体转染HL60白血病细胞,再经过G418及PCR筛选鉴定分别转入了正、反义hTERT载体的抗性克隆细胞HL60-s和HL60-as.随后运用实时荧光定量RT-PCR技术及TRAP-银染法对各组细胞内源性hTERTmRNA的表达情况及端粒酶的活性进行检测.同时还采用MTT法、双层软琼脂克隆形成试验、流式细胞术观察和分析反义hTERT对白血病细胞体外生长增殖活力的影响及是否能诱导瘤细胞的凋亡.结果与空白对照、正义hTERT组相比,反义hTERT能显著地降低HL60细胞内源性hTERT mRNA的表达(P<0.01)和下词端粒酶活性.当各组细胞传至第25代后,与HL60、HL60-s比较,HL60-as细胞的生长速度和集落形成能力明显地减慢和降低,同时伴有凋亡率的显著增加.结论反义hTERT在体外能抑制白血病细胞的生长增殖能力,其潜在、广谱的抗肿瘤作用的分子生物学机制可能是首先通过抑制和下调hTERT表达(端粒酶活性)而终引发瘤细胞衰亡的途径来实现的.

    作者:孙来保;李成荣;文剑明;王国兵;张萌;杨军;李若馨 刊期: 2004年第05期

南方医科大学学报杂志

南方医科大学学报杂志

主管:广东省教育厅

主办:南方医科大学