采用9种终末期肝病预后评分模型对乙型肝炎病毒相关性慢加急肝衰竭(hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure,HBV-ACLF)患者进行预后评估,分析引起HBV-ACLF患者死亡的危险因素.连续收集2014年7月—2018年7月复旦大学附属华山医院确诊的HBV-ACLF患者,通过评估受试者工作特征曲线的曲线下面积(area under receiver operating characteristic curve,AUROC),判断目前9种终末期肝病预后评分模型预测HBV-ACLF患者预后的准确性.采用多因素Logistic回归分析,探讨HBV-ACLF患者死亡的危险因素.共纳入91例HBV-ACLF患者,死亡46例.COSSH-ACLFs评分对轻度、重度患者的短期和中期预后具有佳预测能力(总体死亡率AUROC:28 d为0.946,90 d为0.920;按器官衰竭数量分级,0～1级:28 d为0.900,90 d为0.846;2～3级:28 d为0.957,90 d为0.917);确定COSSH-ACLFs评分的佳临界点为6.245,生存曲线分析显示评分>6.245的患者生存率明显低于评分≤6.245的患者(10.7％vs.81.8％,P<0.0001).年龄、总胆红素、血小板计数、凝血系统衰竭、肝性脑病是HBV-ACLF患者死亡的独立危险因素.死亡组患者血小板计数显著低于生存组(P<0.0022),血小板计数≤63×109/L与HBV-ACLF患者病情严重程度及预后显著相关.本研究证实COSSH-ACLFs评分模型预测HBV-ACLF患者预后的能力较其他评分模型更为准确,血小板计数与HBV-ACLF患者病情严重程度及预后显著相关.
作者：张雪云；应悦；刘小琴；余雪平；张继明；黄玉仙 刊期： 2019年第01期
细菌在翻译过程中,mRNA受到损伤(如缺失终止密码子)时会使翻译提前终止,导致核糖体熄火,细菌自身会启动核糖体拯救途径.由tmRNA-SmpB介导的反式翻译系统是结核分枝杆菌中的核糖体拯救途径,对结核分枝杆菌的生长繁殖有重大影响.为探究分枝杆菌中反式翻译途径的启动及其功能特点,本研究选取耻垢分枝杆菌为实验菌株,分别以mCherry和egfp作为报告基因,通过在报告基因3′端添加大肠埃希菌终止子序列,构建能在菌体中反映反式翻译表达的报告体系,并初步探究该体系中报告基因的动态表达特点.结果显示,相比正常表达mCherry的对照菌株,实验菌株中表达的错误mCherry蛋白很快被水解,菌体颜色均明显浅于前者,增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)定量检测数据也显示错误EGFP水平显著低于正常表达的EGFP水平,表明两种反式翻译报告体系均构建成功.报告基因的动态表达数据显示,蛋白出现翻译异常时,耻垢分枝杆菌可在蛋白翻译过程中快速启动反式翻译途径,并于40～45 h将不成熟错误蛋白完全水解.本研究构建的反式翻译报告体系可为后续开展分枝杆菌反式翻译途径的功能研究及抗结核药物筛选提供帮助.
作者：胡亚文；白嘉诚；葛文雪；姚梦依；张雪莲 刊期： 2019年第01期
为探寻白假丝酵母(又称白念珠菌)早期感染的血浆代谢标记,采用尾静脉注射白念珠菌方法建立大鼠白念珠菌感染模型.将20只大鼠按随机数字法分为对照组和白念珠菌组,每组10只.应用超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography/quadrupole-time-of-flight tandem mass spectrometry,UHPLC-Q-TOF-MS)技术结合数据依赖性采集方式检测大鼠血浆中的代谢物,采用SIMCA-P软件对所测数据分别进行偏小二乘法判别分析(partial least squares discrimination analysis,PLS-DA)、正交偏小二乘法判别分析(orthogonal PLS-DA,OPLS-DA)及主成分分析(principal component analysis,PCA),以进行模式识别,区分白念珠菌组与正常对照组血浆代谢物的差异.根据OPLS-DA模型的变量投影重要度(variable importance in the projection,VIP)筛选可能的代谢标记.结果显示,白念珠菌组与对照组的血浆代谢物存在明显差异,OPLS-DA、PLS-DA及PCA模型均可区分两组,初步确认了18个正离子模式鉴定的差异物,对应化合物可能是大鼠念珠菌感染的潜在标记.受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析发现,LysoPC(14:0)、LysoPC(18:1(9Z))、LysoPC(18:0)、L-Tryptophan、L-Gulonic acidγ-lactone这5个代谢物ROC的曲线下面积均>0.90.本研究初步筛选出早期白念珠菌感染的可能代谢生物标记,可为白念珠菌感染早期诊断和治疗提供理论基础.
作者：童译庆；王秋月；李康馨；周子阳；方阳欣；唐建国 刊期： 2019年第01期
为探讨影响金黄色葡萄球菌杀白细胞素ED(leukocidin ED,LukED)转录表达的佳培养条件,采用定量反转录-聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测金黄色葡萄球菌Newman菌株lukE在TSB、BHI、YCP、MHB和LB培养基中不同生长阶段(对数生长早期、中期、晚期和平台期)的表达情况.以表达量较低的培养基为基础,分别加入表达量高的培养基的不同成分,分析促进lukED表达的物质.结果显示,lukE mRNA水平在YCP培养基中生长至对数晚期时表达高;YCP组分酵母浸出物、酪蛋白氨基酸及丙酮酸钠均能显著促进lukE转录表达,前两者效果更好.
作者：杨涵；黄凯峰；徐溯；赵焕强；徐晓刚；胡付品；何春燕；龚芳；刘庆中 刊期： 2019年第01期
烟曲霉是临床常见的机会性致病真菌,好发于免疫低下人群,常因吸入孢子导致肺部感染,治疗困难.烟曲霉的致病性与其较强的生存能力有关,但主要取决于宿主免疫状态,尤其是天然免疫功能.单核细胞是天然免疫的重要效应细胞,可分化为树突细胞和巨噬细胞.依据其表面分子分型,单核细胞功能上分别以吞噬抗原、呈递抗原和杀伤抗原为特点,在抗烟曲霉感染中具有较高的抵御能力和诊断价值.现阶段研究基于不断发展的荧光标记、灌流培养、光谱成像、基因敲除等技术,通过体外细胞实验和小鼠体内实验,观察到单核细胞与烟曲霉相互作用.在烟曲霉孢子入侵早期,单核细胞即启动基因表达,直接杀灭孢子,也可通过增强中性粒细胞杀孢子活性间接参与抗感染免疫调节,其中白细胞介素家族可能是关键信号分子.
作者：莫非；王桂芳 刊期： 2019年第01期
甲型流感病毒(influenza A virus,IAV)是每年季节性流感的主要病原体,也是全球儿童急性呼吸道感染的重要病毒性病原.非结构蛋白1(nonstructural protein 1,NS1)是由病毒基因组编码的蛋白,表达于被感染的细胞中,但不存在于病毒颗粒中.近年来,大量研究表明NS1是IAV的重要毒力因素,通过NS1-RNA之间、NS1-蛋白之间的相互作用,在拮抗宿主抗病毒反应、抑制宿主细胞凋亡、调节宿主及自身基因表达等多方面发挥作用.深入研究NS1与宿主细胞的相互作用,不仅可加深对IAV致病机制的理解,还可为预防和控制IAV的传播甚至暴发奠定理论基础,在新型抗病毒药物及疫苗研制中有着重要的应用价值.
作者：刘瑞寒；朱汝南；钱渊 刊期： 2019年第01期
随着有效的联合抗反转录病毒疗法(combination antiretroviral therapy,cART)的普及,人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者的生存期逐步延长.这一过程中,HIV感染者自身免疫反应对免疫系统功能的恢复也发挥了至关重要的作用.HIV感染激活干扰素信号通路,诱导干扰素刺激基因(interferon-stimulated gene,ISG)上调表达,从而发挥抗病毒作用.其中,类泛素蛋白ISG15在HIV感染者中显著上调,通过ISG化抑制HIV颗粒的出芽和释放;而HIV的非结构蛋白则通过干扰ISG化过程或结合干扰素信号通路关键分子,逆转ISG15对病毒的抑制作用.本文从ISG15的生物学特性、在不同细胞亚群中的表达、抗病毒功能及病毒逃逸机制等方面进行综述,为进一步解析ISG15在H I V感染中扮演的角色、探索如何获得以抗HIV感染宿主因子为契机的治疗策略提供了思路.
作者：吴还梅；卢洪洲 刊期： 2019年第01期
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染是危害全球健康的严重问题.干扰素(interferon,IFN)治疗是HCV感染的传统疗法,主要通过Janus激酶/信号转导和转录激活因子(Janus kinase/signal transducer and activator of transcription,JAK/STAT)信号通路发挥抗病毒作用,而细胞因子信号转导抑制蛋白3(suppressor of cytokine signaling 3,SOCS3)是这一通路的重要负性调节因子之一.SOCS3的表达水平与宿主IFN抵抗密切相关,HCV感染及IFN治疗可改变宿主微小RNA(microRNA,miRNA)表达水平,靶向SOCS3的miRNA可通过调节SOCS3表达参与宿主抗HCV复制.
作者：高荣；王嘉琪；任浩 刊期： 2019年第01期
2018年已缤纷落幕,2019年带着对未来的期许纷至沓来.回顾过去,展望未来,本文整理了2018年世界乃至中国感染病界的几项重大事件与进展,并进一步梳理了该领域的发展趋势.
作者：艾静文；张文宏 刊期： 2019年第01期
解脲脲原体是一种重要的病原微生物,近年来其耐药形势十分严峻,因此寻找一种全新的有效替代治疗方案尤为重要.本研究旨在探索光动力抗微生物化学疗法对解脲脲原体体外活性的影响.选取解脲脲原体两种生物群(Parvo生物群及 T960生物群)代表菌株,包括标准株及临床株,与系列稀释的2.5~0.0390625 mmol/L光敏剂甲苯胺蓝孵育20 min或60 min,再以(633 ± 10)nm红光照射,设置48、102、204和408 mJ/cm2共4组能量密度,48 h后判读结果.观察不同解脲脲原体与甲苯胺蓝孵育时间、甲苯胺蓝浓度、光照能量密度对光动力抗微生物化学疗法灭活解脲脲原体效果的影响,并观察两种生物群对光动力抗微生物化学疗法敏感性的差异.结果显示,光动力抗微生物化学疗法在体外对解脲脲原体有明显灭活作用.在光照能量密度及解脲脲原体与甲苯胺蓝孵育时间固定的前提下,这种灭活作用随甲苯胺蓝浓度的增加而增强;单一633 nm红光光源在408 mJ/cm2及以下的能量密度对解脲脲原体的活性无明显影响.在甲苯胺蓝浓度及解脲脲原体与甲苯胺蓝孵育时间固定的条件下,光动力抗微生物化学疗法对解脲脲原体的灭活作用随光照能量密度(48~408 mJ/cm2)的增加而增强.随孵育时间(30~60 min)延长,光动力抗微生物化学疗法对解脲脲原体的灭活作用有增强的趋势.结果提示,两种解脲脲原体生物群对光动力抗微生物化学疗法的敏感性相似.本研究证实,光动力抗微生物化学疗法在体外能有效灭活解脲脲原体,有望成为解脲脲原体感染的有效替代治疗方法.
作者：叶庭路；陈办成；于波；杨虹；姜彬；邵勇；黄国新 刊期： 2018年第01期
百日咳是传染性强、感染率高的急性呼吸道传染病,主要感染婴幼儿,是婴儿死亡的主要原因之一.百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis)是引起百日咳的主要病原菌.近年来世界各地多次出现百日咳暴发,迫切需研制更加有效的新型百日咳疫苗.本研究构建了一株减毒百日咳活疫苗BPTM1,利用同源重组方法敲除编码百日咳鲍特菌主要毒力因子百日咳毒素(pertussis toxin,PTX)和皮肤坏死毒素(dermonecrotic toxin,DNT)的基因,并用大肠埃希菌的同源基因置换了负责气管细胞毒素(tracheal cytotoxin,TCT)转运的基因 ampG.通过聚合酶链反应验证毒素及相关基因的敲除和置换,蛋白免疫印迹法检测表明PTX的S1亚基未表达.体外生长曲线和体内定植曲线均表明,相比于野生型百日咳鲍特菌BPMM,减毒BPTM1的生长和定植能力未受影响,其所致肺部病理效应减轻,而所诱导的百日咳鲍特菌特异性IgG、IgG1、IgG2a抗体保持高水平.本研究表明,减毒百日咳鲍特菌BPTM1有可能成为百日咳候选疫苗.
作者：田苗苗；张优仪；王小莲；钟江；李瑞 刊期： 2018年第01期
抗结核活性化合物 HY-152E 是本实验室前期获得的具有良好抗结核活性并拥有授权专利(ZL201210088290.0)的小分子化合物(低抑菌浓度≤0.09 μg/mL).为深入探索HY-152E的抗结核机制,本研究利用药物亲和反应靶点稳定性(drug affinity responsive target stability,DARTS)技术并结合蛋白质谱技术,分析可能与HY-152E相互作用的结核分枝杆菌潜在靶标蛋白.将结核分枝杆菌H37Ra的菌体蛋白裂解液与HY-152E共同孵育,用不同浓度的链霉菌蛋白酶消化30、45、60 min后,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)分离并比较与HY-152E互作前后菌体蛋白耐受蛋白酶消化的差异条带,分别在相对分子质量70000左右和45000~55000处观察到差异蛋白条带.利用蛋白质谱技术分析差异条带的蛋白信息,共获得86个蛋白信息.结合结核分枝杆菌数据库及蛋白功能信息,终筛选到9个蛋白可能是HY-152E的抗结核作用潜在靶标.这些潜在靶标的确定,为后续研究HY-152E的抗结核分子机制奠定了基础.
作者：陈瑞祥；葛文雪；秦云贺；王洪海；张雪莲 刊期： 2018年第01期
细菌性脑脓肿指细菌引起的颅内脓腔性感染,虽然发病率不高,但可导致严重后果.导致细菌性脑脓肿的病原体多为链球菌、葡萄球菌,在我国及亚洲地区,革兰阴性杆菌也是重要病原体.第3代头孢菌素联合甲硝唑是常用的经验性用药方案,能覆盖细菌性脑脓肿的常见病原体.细菌性脑脓肿抗感染治疗的疗程一般长于6周,且须密切监测患者临床表现和头颅影像学改变.目前多采用手术联合内科药物的治疗方案,可明显缩短疗程,预后也大大改善.单纯保守治疗在脓肿较小、病情轻等情况下可考虑,以避免手术等有创操作的风险.但总体来说,细菌性脑脓肿的药物治疗方案仍缺乏足够的循证医学证据.
作者：钱奕亦；金嘉琳；张文宏 刊期： 2018年第01期
干扰素(interferon,IFN)是一类重要的细胞因子,具有多种抗病毒和免疫调节等作用.根据其结构特点、受体、细胞来源和生物学活性,可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型.IFN与其特异性受体结合,通过一个复杂且部分重叠的基因转录过程来发挥作用,其核苷酸多态性和基因突变可影响 IFN反应及对病毒感染的敏感性.几乎所有的病毒都有抵抗IFN的机制和效力,包括直接影响IFN产生和影响下游效应因子.不同型别 IFN在行使抗病毒或免疫调节功能时具有拮抗或协同作用.本文就IFN基因变异、病毒抗IFN策略及IFN之间的协同/拮抗作用进行综述,以期能更好地理解IFN的抗病毒作用.
作者：甘霖；赵俊；陈敬贤；王明丽 刊期： 2018年第01期
表面活性素(surfactin)、伊枯草菌素(iturin)和丰原素(fengycin)是一类主要由革兰阳性芽胞杆菌通过非核糖体合成途径产生的抗菌肽,一般是由1个β-羟基脂肪酸与7~10个氨基酸肽链以酰胺键连接而成的环肽,具有抗细菌、抗真菌、抗病毒、抗肿瘤等生物活性,具有良好的医疗应用前景.目前,人们对这3种新型抗菌肽在医药领域中的研究进展所知甚少,故本文对其发现历史、结构特点、作用机制、生物合成和应用价值进行阐述,为后续研究提供借鉴.
作者：金清；肖明 刊期： 2018年第01期
近年来,通过阿米巴共培养等方法发现了一批新的病毒,统称为巨大病毒(giant virus).它们分布广泛,不仅有很大的病毒颗粒,基因组也非常庞大,还编码许多与蛋白质合成相关的基因,突破了人们对病毒的一般认识,引发了对病毒起源和本质的讨论.巨大病毒被认为有潜在致病性.本文综述了在人体中针对两类早发现的巨大病毒———拟菌病毒(Mimivirus)和马赛病毒(Marseillevirus)开展的血清学、分子生物学、宏基因组检测、病毒分离及其对哺乳动物感染和致病性研究的进展.
作者：夏宇程；钟江 刊期： 2018年第01期
宫颈癌为全球女性常见第二大恶性肿瘤,而人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)是98% 以上宫颈癌的致病因子.HPV感染后,通过与宿主相互作用成功逃避免疫清除,在生殖道中建立持续感染.信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)家族成员是天然免疫应答的重要调节因子,HPV通过抑制STAT1的表达来稳定维持病毒游离基因水平.STAT5是另一重要成员,可调控细胞周期进程.有研究表明,HPV阳性细胞中STAT5被激活对HPV基因组的扩增十分重要.HPV的持续感染与异常表达的STAT蛋白相互作用,可能与宫颈癌的发展密切相关.通过药物靶向这些途径抑制 HPV感染,可能为宫颈癌治疗提供新思路.本文就此方面研究进展进行综述.
作者：吴盈盈；吴思；王爽；孙峥嵘 刊期： 2018年第01期
Epstein-Barr病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是第1个被发现与人类肿瘤发生相关的病毒,且越来越多的数据表明其感染与某些淋巴瘤的发生发展、治疗及预后密切相关.近年来免疫治疗技术发展迅速,但EBV阳性淋巴瘤的治疗目前仍主要以放化疗为基础,结合抗病毒药物.因此,加强EBV及其相关淋巴瘤的研究,寻找有效预防或治疗EBV感染的方法,将有望改善EBV阳性淋巴瘤患者的预后.
作者：谷晓宇；谢彦晖 刊期： 2018年第01期
本研究旨在探讨白细胞介素22(interleukin 22,IL-22)基因多态性位点与肺结核易感性的关系.采用SNPscanTM多重单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型技术,对453例肺结核患者(结核病组)和373例与患者长期密切接触者〔包括109例潜伏结核感染(latent tuberculosis infection,LTBI)者、264例健康对照者〕的 IL-22基因的4个SNP位点(rs1179249、rs2227491、rs17224704、rs2227478)多态性进行分析.结核病组、LTBI组和对照组中4个SNP位点的基因型分布经哈温平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE)检验均处于遗传平衡状态.结果显示,rs17224704位点存在AA、TA和TT基因型.>55岁人群中,此位点TA基因型在对照组中的分布显著高于结核病组(P= 0.0479,OR = 0.365,95% CI= 0.135~0.991);AA基因型在LTBI组中的分布显著低于结核病组(P=0.0276);TA基因型在LTBI组中的分布显著高于结核病组(P=0.00737,OR=0.213,95% CI=0.069~0.660).对照组和LTBI组的等位基因 T频率显著高于结核病组(P= 0.0269,OR= 0.388,95% CI= 0.167~0.897;P= 0.0250,OR = 0.322,95%CI=0.119~0.867).IL-22基因rs17224704的多态性可能与中国重庆地区汉族人群肺结核易感性显著相关,其等位基因T可能是肺结核的保护基因.
作者：熊坤龙；张文宏；王菲菲；程训佳 刊期： 2018年第02期
本文旨在分析2011—2016年上海地区手足口病病原谱的构成和主要病原体流行规律,为手足口病的疫情防控和重症预警提供参考.采集2011—2016年哨点医院临床诊断为手足口病的患儿标本,首先进行肠道病毒通用型核酸和分型检测,其次对2012—2016年核酸检测为柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6, CA6)阳性样本进行基因型重组检测,分离重组型和非重组型 CA6株,比较两者生物学特性.结果显示, 2011—2012年秋季上海地区手足口病主要致病原为肠道病毒71型(enterovirus type 71,EV71)和 CA16;2012年秋季起CA6成为主要病原体;2013—2014年重组型 CA6(recombinant CA6,R CA6)占一定比例;2015—2016年非重组型CA6(non-recombinant CA6,NR CA6)成为优势流行株.R CA6和NR CA6代表株在RD细胞中增殖良好,在KB、MRC-5和HEp-2细胞中未见明显增殖.比较 R CA6与NR CA6代表株接种于RD细胞后细胞活性下降的动态变化,未见显著差异.本研究证实,CA6为近年来上海地区手足口病的主要病原体,R CA6和NR CA6的构成比逐年变化,提示持续监测手足口病主要病原体并了解其生物学特性,对上海地区手足口病的防控预警及疫苗研发具有重要意义.
作者：张晓玲；俞慧菊；刘祎；代发辉；宋志刚；王蔚 刊期： 2018年第02期
DNA的G-四链体(G-quadruplex,G4)是由富含串联重复的鸟嘌呤(guanine,G)的核酸序列折叠形成的四链体螺旋结构,目前认为其与基因表达调控和基因组稳定性有关.已有研究表明,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)的 espK(Rv3879 c)是构成ESX-1分泌系统的一个重要元件,其蛋白序列具有串联重复的GTPITP氨基酸序列多态性.本研究经核酸序列比对分析,确定该氨基酸序列多态性区域对应的模板链上存在G4序列,且该G4序列仅存在于结核分枝杆菌复合群.通过比对结核分枝杆菌临床分离株espK基因的核酸序列,发现 espK基因的高频率G1573C突变位于G4序列.为研究该G4结构及基因表达调控功能,首先利用圆二色谱检测其核酸片段在钾离子存在条件下的光谱学特征,证实其可在体外形成具有顺式平行结构特征的 G4,同义点突变 G4会使其结构稳定性下降.采用重叠聚合酶链反应(overlapping polymerase chain reaction,overlapping PCR)构建含有G4突变的 espK表达质粒,获得重组表达菌株.通过实时定量PCR测定 espK重组表达菌株中基因转录水平变化,发现同义点突变G4后,其基因转录水平比野生型 espK重组菌株提升1.5倍(P<0.05).此外,临床分离株中 espK出现的高频率 G1573C突变会破坏G4结构,但蛋白免疫印迹检测结果显示 espK G1573C突变导致EspK蛋白表达水平上升.以上结果提示, espK的G4结构具有表达调控功能,该G4区域的序列多态性可能通过影响EspK表达水平来调节ESX-1分泌系统的活性.
作者：韩昂轩；牛辰；吕亮东 刊期： 2018年第02期
Rcs是肠杆菌科细菌中的一种复杂的双组分信号转导系统,能调节细菌荚膜异多糖酸合成,以及细菌鞭毛基因、抗酸性基因等的表达.Rcs不同于典型的双组分系统,其由3个蛋白构成,磷酸转移过程分3步进行.不同细菌中的Rcs功能有所区别,主要为调控细菌的毒力和应激.本文在简单介绍细菌双组分信号转导系统的基础上,重点对肠杆菌科细菌Rcs的组成、功能及磷酸转移机制进行综述.
作者：叶立娜；瞿涤 刊期： 2018年第02期
