为了解上海市儿童流行性感冒(简称流感)的流行特征,为儿童流感防控提供实验室依据,本研究按《全国流感监测方案》和《流行性感冒病毒及其实验技术》要求,对上海市某哨点医院2013-2015年采集的流感样患儿标本,采用实时反转录―聚合酶链反应(reverse transcriptase―polymerase chain reaction,RT―PCR)进行核酸检测.共采集咽拭子标本3359份,检出540份流感病毒阳性,阳性率为16.08%.其中甲型H3流感病毒阳性277例,乙型流感病毒阳性158例,甲型H1N1流感病毒阳性105例.2013-2015年流感病毒检出率依次为10.02%、19.02%和20.81%.阳性率高峰出现在2013年12月-2014年2月(41.77%~64.58%)、2014年7-9月(16.67%~23.29%)、2015年1-3月(35.14%~44.74%)、2015年7-8月(32.65%、40.23%)及2015年12月(41.49%).1.0岁以下婴儿检出率低,为7.67%;7.0岁以上高,为31.83%(148/465).监测结果显示,流感在冬春季和夏秋季均有一个流行高峰,其中乙型和甲型H1N1流行高峰为冬春季,夏秋季流行高峰主要为甲型H3.引起流感的优势病原亚型在2014年由甲型H3转变为甲型H3/乙型.结果提示,该哨点医院儿童流感的优势病原亚型自2014年开始发生明显改变,应加强对乙型流感等的监测.
作者：王平；赵文良；蔡明毅；沈琦；任静；何永频 刊期： 2016年第06期
乙型肝炎病毒X蛋白(hepatitis B virus X protein,HBx)全长154个氨基酸,与肝癌发生密切相关.为确定HBx的优势氨基酸序列和热点突变位点,在GenBank中下载所有HBx的氨基酸序列13950条,剔除插入突变、缺失突变和起始密码子非甲硫氨酸的序列,后保留7126条.通过分析这7126条序列,计算出HBx每个位点的氨基酸分布情况,出现频率高的氨基酸为该位点的优势氨基酸,其他氨基酸为突变氨基酸.154个位点的优势氨基酸组成HBx优势氨基酸序列.突变率>10.0%的热点突变位点有32个.其中第36、42、44、87、88和127位氨基酸有4种(突变率>1.0%)以上突变形式,具有较高的多态性.与肝癌密切相关的K130M/V131I双突变率为34.7%.通过7126条HBx序列与优势序列的同源性比较,随机选出其中50条序列(2条与优势序列同源性<75%,48条同源性为76%~99%),与23条参考序列及优势序列共同构建系统发生树.结果显示,HBx优势氨基酸序列属于基因型C,这与基因型C为全球主要流行型一致.本研究首次系统性分析了GenBank中HBx的优势序列,确定了32个HBx热点突变位点和6个多态性较高的位点,为基于HBx突变的基础和应用研究奠定了基础.
作者：王葳；何永刚；浦永兰；潘少坤；谢幼华 刊期： 2016年第06期
本研究旨在探讨人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)和内皮细胞特异性分子1(endocan)在胶质瘤发生发展中的作用及机制.利用HCMV感染人脑胶质瘤U87细胞,检测感染后第1、2、4天信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)和endocan的表达变化,并分析HCMV、STAT3和endocan三者之间的可能关联.结果显示,HCMV感染的U87细胞中pSTAT3和endocan表达上调,并随感染时间延长而逐渐升高;用RNAi干扰STAT3基因表达,endocan表达量下降;利用抗病毒药物更昔洛韦抑制HCMV复制后,pSTAT3表达量下降,endocan表达量随之下降.进一步利用免疫组织化学法检测79例脑胶质瘤患者和8例对照者脑组织中pSTAT3表达情况,发现pSTAT3在胶质瘤组织中表达上调;与低级别胶质瘤相比,高级别胶质瘤中pSTAT3染色强度较高.结果提示,HCMV感染可能通过STAT3信号通路上调endocan表达,从而参与胶质瘤的进展.
作者：王士杰；范东瀛；罗乔荔；邢燕；王一松；安静 刊期： 2016年第06期
2013-2014年南京市流感病原监测系统分离到31株流感病毒H3N2亚型毒株,通过提取病毒RNA,反转录―聚合酶链反应(reverse transcriptase―polymerase chain reaction,RT―PCR)扩增血凝素(hemagglutinin,HA)基因片段,进行PCR产物纯化、测序并分析其遗传进化特征.结果显示,31株分离株与疫苗株A/Texas/50/2012之间的核苷酸和氨基酸进化距离分别为0.0102和0.0121,核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.9%~99.6%和97.2%~99.3%.遗传进化分析表明,分离株的HA基因分属不同的进化分支,3株2013年分离株属3B基因型,3株2014年分离株属3C.1基因型,2株2014年分离株属3C.2b基因型,其余23株属3C.3a基因型.与疫苗株相比,分离株的分子特征表现为发生N128A/T和P198S/A(去信号肽排列)氨基酸位点变异,均位于抗原决定簇B;分离株抗原决定簇上发生变异的位点共计24个;7株分离株出现126 NWT糖基化位点,3株分离株糖基化位点45NSS和144NNS消失.结果提示,2013-2014年南京市流感病毒H3N2亚型的HA基因较疫苗株发生了较大变异,疫苗对病毒的预防效果需重新评估.
作者：杜雪飞；葛以跃；祁贤 刊期： 2016年第06期
随着基因测序技术的创新和应用,新的高通量测序技术不断涌现,以Pacific Biosciences(PacBio)公司的单分子实时测序(single molecule real time sequencing)为代表的第三代测序(third generation sequencing,TGS)技术开始逐渐应用于基因组研究,包括大型基因组拼装、基因结构变异和表观遗传研究等方面.本文主要对T GS技术的原理、特点和应用,特别是在病毒研究中的应用进行介绍,并与第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术进行比较,为基因组测序技术的选择及其临床应用提供一定参考.
作者：袁易；王铭杰；张欣欣 刊期： 2016年第06期
水痘―带状疱疹病毒潜伏感染后的再活化可引起带状疱疹,其潜伏感染与再活化的机制还不完全清楚.本文综述了该病毒潜伏感染和再活化的实验模型新进展,并概述了从这些实验模型中所获得的新知识.
作者：汤华民；贾俊丽；姚堃 刊期： 2016年第06期
拉沙热(Lassa fever,LF)由拉沙病毒(Lassa virus,LASV)引起,是一种通过鼠类传播给人的急性出血性动物源性传染病,病死率高.主要在西非地区流行,但在全球多个国家发现输入性病例.本文主要针对拉沙病毒的病原学特点、疾病流行现状、临床特征、实验室检测、治疗及预防进展进行综述.同时,建议在全球经济一体化的大形势下,加强对拉沙热国际防控的关注度,建立国际联防联控防治策略和措施,并将其纳入全球防控体系.
作者：邵楠；曹玉玺；王环宇 刊期： 2016年第06期
