综述了mtDNA 4 977 bp 缺失在辐射损伤生物剂量计上的新发展和应用.阐释了mtDNA 4 977 bp 缺失形成的原因,与辐射损伤的相关性以及国内外目前的研究现状.探讨了目前mtDNA 4 977 bp 缺失在辐射损伤生物剂量计上应用的优势和存在的问题.同时展望关于今后mtDNA 4 977 bp 缺失的研究方向和应用前景.
作者:周鑫;张红 刊期: 2009年第02期
平分型GlcNAc(bisecting N-acetylglucosamine)修饰是糖蛋白N-聚糖核心的常见分支修饰形式,哺乳类动物该糖基化修饰由β1,4-N-乙酰葡糖氨基转移酶Ⅲ催化.该修饰对分子结合、信号传导、生殖发育以及肿瘤细胞的生物学行为都有重要影响.相应地,针对平分型GlcNAc修饰N-聚糖的检测也正逐步成为糖生物学领域内的研究热点之一.
作者:董芳;肖凡;魏红山 刊期: 2009年第02期
线粒体转运蛋白质家族(mitochondrial transporter family)等可溶性物质载体(solute carrier,SLC),主要包括SLC25,广泛存在于真核生物线粒体中,负责可溶性物质跨线粒体内膜的转运.SLC25家族成员拥有相似的结构特征、种类繁多的转运底物,并与细胞的多种生理功能密切相关.有研究表明,SLC25家族蛋白质的缺失或突变可导致多种代谢性疾病或神经系统疾病的发生.
作者:曾志锋;于淼;杨晓明 刊期: 2009年第02期
反义技术是近些年来随着现代分子生物学技术的发展而产生的新的生物医学治疗技术.它采用反义核酸分子抑制、封闭或破坏靶基因组的技术手段,包括反义寡核苷酸、核酶及RNA干扰等.反义分子通过与靶基因异性互补配对结合,阻断靶基因的复制、转录或翻译过程,从而发挥抗病毒作用.针对乙型肝炎病毒的反义技术也有了广泛而深入的研究.根据反义技术在分子、细胞以及动物水平上的研究表明:反义技术能够高效、特异地抑制HBV的复制与表达.
作者:高刚;鲁艳芹;韩金祥;赵丽 刊期: 2009年第02期
血清多肽组谱图(简称血肽图,serum peptidome profiling)是指通过质谱分析技术获得的血清中多肽组的精确质量数的谱图,是临床蛋白质组学研究领域的一个分支,在生物标志物的发现、疾病早期诊断和个性化治疗等领域有着广阔的应用前景.而且在这些应用中,生物信息学分析是其中一个重要环节.为了给有关的生物医学工作者提供较好的支持,文章就与血肽图相关的生物信息学方法进行综述,内容涉及基线删除、标准化、峰检测、峰比对和模型建立等方面.
作者:曹源;邵宁生;李伍举 刊期: 2009年第02期
Rho 家族小分子鸟苷三磷酸酶(small GTPases of Rho family, Rho GTPases)是调节细胞许多生理病理活动的关键分子开关,参与细胞骨架、基因转录、细胞周期进程、细胞黏附的调控及多条信号通路的调节.骨髓间充质干细胞(bone marrow-derived mesenchymal stem cells,MSCs)是一类具有自我更新和多向分化潜能的特殊细胞,通过增殖、迁移、分化等途径参与机体损伤组织的修复过程.研究表明,Rho GTPases在MSCs迁移、分化等过程中起着重要的调节作用.
作者:刘琴丽;宋关斌 刊期: 2009年第02期
c-jun是立早基因家族(immediate early genes,IEGs)中的重要成员之一,在包括癫痫在内的许多应激过程中具有重要作用.近年来,关于c-jun在癫痫发病机制及治疗中作用的研究取得了较大的进展.多种有效的抗癫痫治疗措施可以下调癫痫动物模型中c-jun的过度表达,从而发挥神经保护及抗癫痫效能.
作者:刘曙东;孙红斌 刊期: 2009年第02期
血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)是新发现的与血管紧张素转换酶(ACE)相关的羧肽酶,在肾素-血管紧张素系统(rennin-angiotensin system,RAS)中ACE2可以使AngⅡ转换为Ang1-7,从而产生与血管紧张素Ⅱ相反的效应,同时ACE2还可使AngⅠ转换为Ang1-9 .研究发现:ACE2与高血压、SARS以及肾脏、生殖等系统的疾病有着密切的关系.
作者:范英兰;李鹏飞;张源淑 刊期: 2009年第02期
天然免疫系统在病原微生物入侵的初始阶段发挥着重要的防御作用,其中补体系统可快速识别、杀伤和清除病原微生物,对疾病的发生、发展和转归起着重要的作用.文章综述了补体系统各成份单核苷酸多态性与疾病的关联研究进展,在DNA水平上揭示了补体系统遗传多态性对疾病发生、发展和转归的影响,对疾病的预防和个体化治疗具有重要的意义.
作者:王志富;贺福初;周钢桥 刊期: 2009年第02期
乙型肝炎病毒(HBV)X基因及其编码的多功能蛋白HBx是乙型肝炎病毒基因转录所必需的作用因子.同时,HBx通过与宿主功能蛋白直接或间接地相互作用而调节多种蛋白的功能,参与调控多条细胞信号通路转导,激活多种转录因子,在肝细胞抗凋亡和引发肝癌的过程中起重要作用.
作者:周玉;沈关心 刊期: 2009年第02期
细胞周期素依赖激酶2-相关蛋白1(cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1,CDK2-AP1)基因是一个重要的生长抑制基因,主要通过抑制细胞周期素依赖激酶2(cyclin-dependent kinase 2,CDK2)的活性发挥其生长抑制作用.新的研究发现,在结直肠癌患者中,CDK2-AP1的差异表达与微卫星状态相关,其表达缺陷是高频微卫星不稳定(microsatellite instability-high,MSI-H)结直肠癌(colorectal cancer,CRC)恶性转化的一个显著特点,并且参与疾病的发生发展.
作者:钱昕;来茂德 刊期: 2009年第02期
高通量微阵列杂交技术和测序技术的快速发展,产生了大量的基因数据,生物信息迅速膨胀成为数据的海洋.为适应这种高通量基因表达数据的不断增长和人们共享数据的需要,各种数据库应用而生,其中,NCBI (national center for biotechnology information)的基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)是世界上大的储存高通量分子丰度数据的公共数据库,用户可以提交、储存和检索多种形式的数据并免费使用.迄今为止,GEO已收录了300000个样本的数据,涉及16亿个基因表达丰度数据,涵盖500多种生物体,广泛覆盖各种生物学内容.GEO数据库操作简单,数据全面,免费共享的优势为后期数据挖掘和信息推广提供了良好的平台.文章概述了GEO数据库的结构、数据的提交、检索和其在分子生物学领域中的应用前景.登陆GEO数据库的网址为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo.
作者:阴常欣;马文丽;郑文岭 刊期: 2009年第02期
整合素连接激酶(integrin-linked kinase,ILK)是一种Ser/Thr蛋白激酶.ILK可以与整合素结合,以依赖于PI3K的方式激活,参与多种信号传导通路,包括整合素、生长因子及Wnt信号传导通路.ILK在调节细胞黏附、凋亡、铺展、迁移、生长、细胞周期、肿瘤形成等过程中发挥重要的作用.目前已经发现ILK在多种肿瘤中高表达,包括:神经胶母细胞瘤、黑色素瘤、胃癌、甲状腺肿瘤、卵巢癌、结肠癌、非小细胞肺癌和前列腺癌等.目前国内外大量实验证明ILK和肿瘤密切相关,所以ILK将成为肿瘤基因治疗和肿瘤药物的理想靶位点.
作者:郝一昌;何培英;徐涛;王晓峰 刊期: 2009年第02期
目的 了解我国眼皮肤白化病(oculocutaneous albinism,OCA)的分型和相关基因突变类型,探讨新突变可能的分子致病机制.方法 应用PCR方法扩增TYR基因,经DNA序列测定检出突变,采用错配引物PCR进行新突变的群体筛查,结合生物信息学方法探讨一种新突变的致病性和可能的分子致病机制.结果 10名患者中有5人存在2个突变TYR等位基因,共计8种突变类型,其中c.71G>A(C24Y)和c.841G>T (E281X)是OCA1A致病性新突变;C24极可能参与二硫键形成,C24Y将导致酪氨酸酶肽链内此二硫键消失,进而引起蛋白空间构象变化和功能异常而致病.结论 从基因水平初步了解了我国OCA1所占的比例,探讨了TYR基因C24Y的致病性并初步阐明了其致病的分子机制.本结果丰富了人类TYR基因突变类型,为我国OCA分型诊断、产前基因诊断和遗传咨询等积累了有价值的数据资料.
作者:李卓;魏海云;李洪义 刊期: 2009年第02期
目的 研究早幼粒细胞白血病基因(promyelocytic leukemia,PML)中含环指/B-BOX结构与含coiled-coil结构的两个结构域的功能,构建含其结构域序列的诱饵表达载体,为进一步应用酵母双杂交系统筛选与之相互作用的蛋白建立实验基础.方法 PCR扩增PML的两个结构域序列,克隆入诱饵载体pGBKT7中,经测序鉴定后,将诱饵载体转化到酵母细胞AH109中,检测诱饵蛋白有无毒性,渗漏和自激活作用,同时利用蛋白印迹法分析诱饵蛋白的表达.结果 成功扩增了PML两个结构域的基因片段,并正确克隆入pGBKT7中.诱饵载体成功转化到酵母细胞AH109中,其中一个诱饵蛋白BD-PML-B无毒性,但具有渗漏和自激活作用,另一个诱饵蛋白BD-PML-C无毒性,渗漏和自激活作用,蛋白印迹法分析证实酵母细胞表达诱饵蛋白.结论 含环指/B-BOX的结构域具有转录因子活性,全长PML的转录活性与之有关;成功构建了含coiled-coil结构的PML结合域的酵母诱饵表达载体,为运用酵母双杂交技术筛选与之作用的蛋白并探讨其功能奠定了基础.
作者:王翀;刘北忠;金丹婷;王春光;吴燕;朱丹;钟梁 刊期: 2009年第02期
目的 检测膀胱移行细胞癌中金属蛋白酶组织抑制因子3(tissue inhibitor of metalloproteinase 3,TIMP-3)CpG岛甲基化程度,探讨该基因CpG岛甲基化在该肿瘤中的作用及临床意义.方法 收集60例膀胱移行细胞癌组织标本和30例正常膀胱粘膜标本,用甲基化特异的PCR(methylmion specific PCR ,MSP)法检测TIMP-3基因CpG岛的甲基化状态.结果 膀胱移行细胞癌TIMP-3基因CpG岛的甲基化发生率为45 %(27/60).而出现甲基化的膀胱癌病例,其TIMP-3的蛋白表达水平均不高.结论 膀胱癌细胞TIMP-3基因的CpG岛甲基化发生率较高,检测其表达水平对膀胱移行细胞癌的诊断及预后判断具有一定的参考价值.
作者:钟安;文博 刊期: 2009年第02期
目的 探讨血管紧张素原基因(angiotensinogen gene,AGT)-6A/G,-20A/C,M235T和T174M 4个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与新疆哈萨克族高血压患者左室肥厚的关系.方法 采用低渗溶血法破裂血细胞、蛋白酶K消化、饱和酚/氯仿抽提法提取白细胞基因组DNA.采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术进行个体基因型分型.结果 ①在不考虑年龄、高血压病史时间、性别及收缩压、舒张压对左室肥厚的影响的前提下,未发现-6A/G、-20A/C与哈萨克族高血压左室肥厚的相关关系.②在以性别作为亚变量的分析结果中,我们发现-6A/G和-20A/C分别与哈萨克族女性和男性高血压左室肥厚相关.③不同SNPs间的配对连锁不平衡分析结果显示,除M235T与T174M之间外,其他各位点间存在有统计学意义的连锁不平衡关系.④单体型分析结果发现,研究人群AGT基因-6A/G、-20A/C、M235T和T174M 4个SNPs构成了11种主要的单体型,其中H2(A-G-M-T)、H5(C-A-M-M)、H6(C-A-T-T)、H9(C-A-T-M)的频率在左室肥厚、非左室肥厚两组的分布存在差异,且具有统计学意义(P<0.05).结论 AGT基因-6A/G、-20A/C、M235T和T174M 变异可能与新疆哈萨克族高血压左室肥厚有关.
作者:李南方;周玲;杨进;李涛;洪静 刊期: 2009年第02期
目的 研究γ射线对人外周血淋巴细胞 cx43和ANLN基因转录表达的影响.方法 对数生长期的淋巴细胞,分别给予1、2、3、4、5、6 Gy的60Coγ射线照射,照射后12 h,以及2 Gy照射后4、8、12、24、36、48、72 h,分别提取总RNA,反转录成cDNA.利用实时荧光定量PCR技术,检测各组cx43和ANLN基因表达改变.结果 人外周血淋巴细胞cx43 mRNA表达水平在2 Gy照射后4、8、12 h明显增高,分别为对照组(未照射组)的6.74、9.06、7.22倍(P<0.05);24~72 h,其表达水平与对照组相比没有明显变化.1、2、3、4、5、6 Gy剂量照射后12 h,cx43 mRNA表达水平显著增高(P<0.05).ANLN mRNA表达水平在2 Gy不同时间点及1~5 Gy照射后12 h,表达降低(P<0.05),6 Gy照射后12 h其表达开始升高,为对照组的6.08倍(P<0.05).结论 γ射线照射2 Gy不同时间点及不同剂量照射后12 h,cx43基因表达上调,ANLN 基因表达下调.1~3 Gy剂量照射后12 h,cx43 mRNA表达在此范围内有时间和剂量的依赖性.cx43可能会发展为核事故受照射人员的分子生物学剂量标记物.
作者:李伟;江其生;郭丽杰;宋秀军;李峰生;陈舒;何蕊;于惠杰 刊期: 2009年第02期
目的 筛选血浆中乙型肝炎病毒PreS1结合蛋白.方法 表达纯化了PreS1-谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione-S-transferase,GST)融合蛋白,利用该蛋白与血浆进行Pull-down实验,并设立GST与血浆Pull-down,GST、PreS1-GST与PBS Pull-down对照,Pull-down 产物进行双向电泳分离(2-DE),差异蛋白点通过质谱鉴定.结果 成功表达纯化出PreS1-GST融合蛋白,通过双向电泳分析发现一个PreS1特异结合蛋白,经质谱鉴定为含锚蛋白重复序列的蛋白57(ANKRD57).结论 锚蛋白重复序列的主要功能是介导蛋白质与蛋白质之间的相互作用,ANKRD57与PreS1特异结合后的生理功能值得深入研究.
作者:崔仑标;葛以跃;史智扬;焦永军;唐震;单云峰;单军;汪华 刊期: 2009年第02期
目的 明确甘氨酸对缺氧肾细胞保护作用的分子靶点.方法 分别定点突变甘氨酸受体 (glycine receptor α1, GlyR α1)配基结合位点202位酪氨酸 (Thr)为苯丙氨酸 (Phe) 和亮氨酸 (Leu),野生型及突变型GlyR α1转染入人胚胎肾细胞 (HEK293细胞) 细胞,观察GlyR α1突变是否影响甘氨酸和士的宁对缺氧肾细胞的保护作用;RT-PCR扩增犬肾细胞(MDCK细胞)内人源性GlyR α1的同源基因,设计4对短链寡核苷酸 (siRNA),观察RNAi抑制内源性GlyR α1表达对甘氨酸细胞保护作用的影响.结果 细胞ATP耗竭3 h后,甘氨酸处理组中,转染了正常GlyR α1、苯丙氨酸突变的GlyR α1及亮氨酸突变的GlyR α1的HEK293细胞的LDH释放率分别为(41.17±2.61)%、(62.67±4.53)%及(41.33±6.02)%.士的宁处理组中,分别有(44.50±5.97)%、(45.33±6.60)%及(59.17±6.97)%的LDH自上述3种转染细胞中释放到培养介质.4对siRNA对靶基因表达的抑制不完全相同,强抑制作用达70 %以上,细胞LDH释放率随GlyR α1表达水平下降而升高.结论 GlyRα1配基结合位点的不同突变,影响了不同配基的保护作用.抑制内源性GlyR的表达减弱了甘氨酸对ATP耗竭细胞的保护作用.甘氨酸发挥细胞保护作用时,其靶分子为GlyR.
作者:潘超;白小明;陈琪 刊期: 2009年第02期