学术投稿

SARS冠状病毒S基因序列及细胞抗原表位预测

何凡;郭新雄;赵卫;龙北国;江丽芳;张文炳;晏辉钧;胡族琼

关键词:SARS, S蛋白, 抗原表位, 冠状病毒
摘要:目的比较SARS冠状病毒各分离株S基因序列及氨基酸序列之间的差异,预测SARS-CoV的S蛋白的抗原表位.方法利用Lasergene软件包中的EditSeq从21株SARS冠状病毒分离株截取S基因序列并翻译成氨基酸序列,然后用ClustalX软件对截取序列进行比较分析,确定基准株,后用Protean软件对基准株进行抗原表位预测.结果在21株分离株的S基因中有8株核苷酸序列、13株氨基酸序列没有发生点突变;预测出78个可能性抗原表位.结论SARS-CoV的S蛋白相当保守,只发生个别点突变,可能性抗原表位多,且在其中的14个区域中可能性显著.
中国公共卫生杂志相关文献
  • 静脉吸毒人群HIV/HBV/HCV混合感染分析

    目的了解静脉吸毒人群人类免疫缺陷病毒(HIV)、乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染情况.方法采用血清流行病学方法对412例静脉吸毒者进行抗HIV、抗HBV和抗HCV抗体检测.结果在412例静脉吸毒人群中,HIV阳性检出率为41.75%;在HIV阴性的静脉吸毒人群中,单纯HCV感染比例高(45.1%),其次为抗HCV阳性伴抗HBs阳性(35.83%);在HIV阳性的静脉吸毒人群中,单纯HCV感染比例高(55.81%),其次为抗HCV阳性伴抗HBs阳性(36.05%).结论静脉吸毒是HIV、HBV和HCV多重感染的主要原因之一,且HIV合并HCV感染为常见.

    作者:邵红;彭红;田永芳;杨飞 刊期: 2004年第08期

  • 鲍曼不动杆菌对喹诺酮类耐药机制

    目的探讨鲍曼不动杆菌对氟喹诺酮类药物的耐药机制.方法采用K-B法检测35株鲍曼不动杆菌对氟喹诺酮类药物的药敏情况,十二烷基磺酸钠-聚丙酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法检测鲍曼不动杆菌的外膜蛋白(OMP),直接荧光法检测鲍曼不动杆菌对环丙沙星的吸收和积累,PCR法扩增gyrA基因并对其进行测序.结果35株鲍曼不动杆菌中有20株对氟喹诺酮类药物耐药,耐药菌株与敏感菌株相比,外膜蛋白在约29 Ku条带处消失,在26Ku条带处明显增强.耐药菌株药物积累量不及敏感菌株,经叠氮钠处理后,积累量上升并接近敏感菌株,对PCR扩增产物gyrA测序未发现有突变.结论鲍曼不动杆菌对氟喹诺酮类药物的耐药与外膜蛋白的低通透性和主动外运有关.

    作者:黄艳飞;陈群 刊期: 2004年第08期

  • 丙型肝炎病毒基因和蛋白结构研究进展

    估计全球约有1.7亿人口感染丙型肝炎,是一种严重影响人类健康的传染病.丙型肝炎的病原为丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV).1989年Choo等人首先获得HCV基因组的cDNA全序列,使HCV成为病毒学史上第一个首先通过基因克隆技术确认的病毒[1,2].此后,HCV的分子生物学研究进展迅速.现将HCV病毒分子结构的新研究状况做一综述.

    作者:王旭东;贲昆龙;陈溥言 刊期: 2004年第08期

  • 硒对大鼠肝脏超氧阴离子和羟自由基的作用

    目的研究离体和在体染毒条件下亚硒酸钠对大鼠肝组织超氧阴离子(.O2-)和羟自由基(.OH)生成的影响.方法选用雄性Wistar大鼠.体外实验时,制备肝匀浆,在反应体系中加入亚硒酸钠使剂量分别达到2.185,8.750和35.000μmol/L.采用常规方法测定.O2-和.OH.体内实验时,用0.75,1.50和3.00mg/kg的亚硒酸钠,腹腔注射染毒.采用电子自旋共振测定.O2-和.OH.结果在体外染毒时,2.185 μmol/L的亚硒酸钠对大鼠肝组织产生抗氧化应激作用,使过氧化脂质(MDA)、.O2-和.OH的生成量明显下降,但8.750和35.000 μmol/L的亚硒酸钠则诱导大鼠肝组织产生明显的氧化应激,使.O2-和.OH的生成量显著升高.在体内染毒时,0.75,1.50和3.00mg/kg的亚硒酸钠均可引起大鼠肝组织.O2-和.OH的产生量显著增加.结论适宜剂量的亚硒酸钠抑制自由基生成,具有抗氧化作用,而较高剂量的亚硒酸钠则使自由基生成增多,导致明显的氧化应激.

    作者:余日安;杨成峰;吴志刚;马良;王爱国;陈学敏 刊期: 2004年第08期

  • 吸毒人群队列研究参加者联系信息真实性研究

    目的在静脉吸毒人群队列研究现场,通过6个月随访核实参加者个人联系信息的真实情况初步探讨其影响因素.方法自2003年5~6月在四川省西昌市以社区为基础的HIV阴性的静脉吸毒人群队列研究6个月随访中,使用设计好的调查表通过现场工作人员和种子调查333名队列参加者个人联系信息真实情况.结果本次随访研究对象按约定期限完成回访的占73.3%.28.5%的参加者在队列招募时提供虚假个人联系信息,在单因素和多因素Logistic回归模型分析中具有统计学意义的变量是年龄、文化程度和居住情况.影响联系信息真实性的多因素Logistic回归模型分析中具有统计学意义的变量是年龄、文化程度、居住情况.提供虚假个人联系信息的参加者回访率(44.2%)明显低于提供真实联系信息的参加者回访率(84.9%),在调整了人口学和高危行为因素等变量后,发现联系信息真实性与随访保持率有关.结论需进一步调查队列研究中的静脉吸毒人群提供虚假个人关系信息的情况及其影响因素.

    作者:周枫;郝沁宁;阮玉华;朱国平;刘石柱;何益新;陈康林;秦光明;邵一鸣 刊期: 2004年第08期

  • 农村生态环境改善与肠道传染病的预防控制

    人畜粪便、生活垃圾、生活污水是造成农村严重的环境污染、视觉污染、水系富营养化、土壤污染的主要污染源之一,是农村肠道传染病与寄生虫病高发的主要原因.本文针对近些年来农村生态环境存在的问题,提出4点干预对策.

    作者:于川蓉;王友斌;李筱翠 刊期: 2004年第08期

  • 沈阳市大气污染对小学生肺功能的影响

    目的调查沈阳市大气污染对小学生肺功能的影响,比较不同季节分析动车尾气污染与燃煤污染水平.方法根据近10年沈阳市大气污染监测资料和沈阳市交通流量分布资料,选择地处机沈阳市机动车流量大中小不同区域的3所小学校(依次分为A,B,C小学),调查其中居住3年以上家住距学校1km以内的8~10岁(三年级)健康学生,每个学校调查小学生100名,与冬季和夏季分别检测用力肺活量(FVC),第1秒用力肺活量(FEV1.0)和1秒率(FEV1.0/FVC),结果C小学儿童大小气道功能为好于A,B小学;B小学儿童的大气道功能(FVC)在冬季采暖期结束后下降明显;A小学儿童小气道功能(FEV1.0,FEV1.0/FVC)在采暖期结束后下降明显,好于C小学(P<0.05),但大气道功能改变不明显.环境空气质量资科分析表明,A小学空气环境受交通尾气污染较B、C小学重;B小学学生在采暖期结束后肺功能明显改善,表明B小学环境空气主要以煤烟型污染为主.结论在交通流量大的A小学附近,机动车尾气污染十分严重,可影响小学生的肺功能.提示机动车尾气污染可能成为主要污染源,建议有关部门重视加强防控工作.

    作者:孙宪民;孙贵范;田村宪治;岛正之;郭晓英;刘珊 刊期: 2004年第08期

  • 大连市水发产品甲醛污染调查

    甲醛为原生质毒物,具有防腐、定型、漂白、作用,但因其毒性强,对人体健康危害大,国家已明确规定严禁作为食品添加剂使用,然而一些不法商贩仍用甲醛水溶液浸泡动物产品销售.为维护消费者的合法权利,保护人民的身体健康,本文对大连市区的农贸市场、商场、酒店及个体商贩经营的水发产品甲醛污染情况进行了抽样调查.现将结果报告如下.

    作者:许放;李素秋;张枚;丁原梅;刘明禹;苑迅 刊期: 2004年第08期

  • 25T型直达旅客列车空气卫生质量的调查

    随着铁路第五次提速,引进国外技术的25T型直达旅客列车于2004年4月18日投入使用.为了解其卫生状况,保障旅客及乘务人员身体健康,我站于2004年4月中旬至6月中旬对该车型北京分局承担的所有列车进行了空气卫生质量调查.现将调查结果报告如下.

    作者:石钧 刊期: 2004年第08期

  • 沿海渔民和农民膳食营养状况与高血压关系

    流行病学调查表明,深海鱼油可以减少冠心病的危险,实验研究显示鱼油有降低血压的作用.但流行病学资料未显示鱼消费量高的人群血压较低,有人归因为盐摄入量太多有关[1].为了解渔民的膳食营养状况和进食海鱼与高血压的关系,我们对江苏省沿海渔民和当地乡镇农民的膳食状况进行调查,现将结果报告如下.

    作者:朱圣陶;傅春玲;江伟威;吕燕军 刊期: 2004年第08期

  • 不同剂量维生素A摄入对大鼠DNA损伤的影响

    目的探讨补充不同剂量维生索A(VA)对DNA氧化及烷化损伤的影响.方法将Wistar大鼠随机分为4组,分别为VA缺乏组,及补充VA11.43,42.86,142.86μgRE(视黄醇当量)/(kg·d)3个剂量组.干预时间为8周.采用单细胞凝胶电泳法(SCGE)分析比较不同组之间淋巴细胞DNA氧化损伤;用高效毛细管电泳法测定尿中O6-甲基鸟嘌呤(O6-Methyl-guanine,O6-MeG)的排出量.结果DNA损伤分析显示VA缺乏组淋巴细胞DNA自发性损伤明显高于VA补充组(P<0.01).用H2O2诱导淋巴细胞氧化损伤时,42.86μgRE/(kg·d)组的淋巴细胞损伤轻(P<0.01).缺乏组大鼠尿中的O6-MeG的排出量随缺乏时间的延长明显升高(P<0.01).42.86μgRE/(kg·d)组O6-MeG的排出量无明显改变.142.86 μgRE/(kg·d)组至第8周时,O6-MeG的排出量分别为VA缺乏组、11.43和42.86 μgRE/(kg·d)组的1.38倍(P<0.05)、3.57倍(P<0.01)和11.75倍(P<0.01).结论较长时间VA缺乏可导致机体DNA自发性损伤、H2O2诱导的氧化损伤及DNA烷化损伤均明显增加;高剂量142.86 μgRE/(kg·d)VA补充对DNA损伤不但无防护作用,反而增加DNA损伤;适量摄入42.86 μgRE/(kg·d)的VA能有效地增强DNA抗氧化和烷化损伤的能力.

    作者:韩磊;马爱国;梁惠 刊期: 2004年第08期

  • 应用丹佛发育筛查法评价婴幼儿发育状况

    目的评价婴幼儿发育状况.方法抽取苏州地区1岁以内小儿602名,应用丹佛发育筛查法进行测查,并评价其发育状况.结果近20个项目的通过率明显高于量表通过率,语言、个人-社交能区尤为明显.结论小儿发育呈发育提前的趋势,各功能区发育不平衡.

    作者:赵德才;季成叶;孙军玲;李勇 刊期: 2004年第08期

  • 砷对小鼠肝脏磷脂的影响及VE的保护作用

    砷以其不同的化合物形成引起机体多系统的严重损害.砷中毒研究多数侧重于流行病学调查、毒理学和病理学方面.本研究主要探讨砷中毒对磷脂组成的影响以及维生素E(VE)的保护作用,为阐明地方性砷中毒的机制和防治措施提供资料.

    作者:王茜;贾汉;李树林 刊期: 2004年第08期

  • 广东省成人超重与肥胖的影响因素分析

    目的了解广东省成年人超重肥胖的影响因素,确定可以进行健康干预的重点环节.方法采用多阶段随机整群抽样方法,抽取广东省大、中小城市及2类农村各3个区(县),1类农村4个县.每个县(区)抽取2个街道(乡)的6个居(村)委,共540户居民,进行面对面询问调查,了解18岁以上成年居民个人基本情况,检测体重、身高等数据.结果调查15 130人,超重与肥胖的粗患病率分别为16.8%和1.8%,年龄标化患病率分别为15.0%和1.8%.多因素Logistic回归分析发现,影响超重的因素有家庭人均年收入,年龄,性别,吸烟,体力运动和城乡户籍,OR值分别为1.29,1.11,0.78,0.77,0.72,0.53;影响肥胖的因素主要有家庭人均年收入、年龄、体力活动和城乡户籍,OR值分别为1.47,1.14,0.76,0.41.结论体力活动是超重与肥胖可干预的重要影响因素,加强健康教育,提高居民的体力活动水平是预防控制超重与肥胖的重要措施.

    作者:马文军;许燕君;李剑森;徐浩锋;聂少萍;陈泽池;邓惠鸿;李海康 刊期: 2004年第08期

  • 吉林市艾滋病流行情况调查

    吉林市位于吉林省中部偏东,属内陆欠发达城市,10年间累计报告134例HIV感染者.为进一步加强艾滋病防治工作,本文对吉林市自1994~2003年艾滋病监测资料进行流行病学分析.报告如下.

    作者:任巧伶;廉光春;张志红;于树清 刊期: 2004年第08期

  • 白细胞介素真核表达质粒的卡介苗佐剂作用

    目的研究白细胞介素-2(IL-2)和白细胞介素-3(IL-3)真核表达质粒的佐剂活性,从而达到增强卡介苗(BCG)免疫效果的作用.方法在结核分枝杆菌敏感动物豚鼠体内表达IL-2和IL-3真核表达质粒,分别从细胞免疫和体液免疫水平以及组织水平上比较其对卡介苗免疫效果的调节作用和免疫器官的病理变化,采取问接ELISA和MTT比色法检测及组织病理学检测.结果间接ELISA检测显示,IL-2和IL-3真核表达质粒组抗体水平均高于BCG和空白对照组(P<0.05);MTT比色法检测显示IL-2和IL-3真核表达质粒组细胞免疫水平均高于对照组(P<0.01);组织病理学检测结果显示,IL-2和IL-3真核表达质粒组免疫器官淋巴滤泡增生均显著高于对照组.结论IL-2和IL-3真核表达质粒均能有效地促进机体体液和细胞免疫应答,尤其是细胞免疫应答.

    作者:张俊才;骆雪霞;钟志宏;马正海 刊期: 2004年第08期

  • 前瞻研究中Logistic回归参数估计的应用条件

    Logistic回归模型是分析反应变量为独立二分类资料的常用统计分析方法,对模型中的参数通常采用的是极大似然估计法(Maximum likelihood estimate,MLE),当资料的样本含量足够大、分层后格子不稀疏时,估计的结果是令人满意的,如果所得资料样本含量比较少或者资料中分层很多而致格子稀疏(数据结构不平衡)时,MLE估计结果可靠性会大为减低[1,2].

    作者:张宏;沈其君;陈启光 刊期: 2004年第08期

  • 艾滋病毒感染者家庭避孕套使用影响因素分析

    全世界约有3/4的HIV感染者是由性传播引起,而在性传播的感染者中约3/4由异性性传播引起,其余1/4由男性同性恋引起[1].在不同国家针对HIV感染的高危人群、特种人群推广避孕套的措施都证实了坚持使用避孕套能降低感染HIV的危险[2,3].然而,避孕套的使用受多种因素的影响.为此,我们选择90位已婚HIV感染者,以其夫妻双方为研究对象,分析确定影响HIV感染者家庭使用避孕套的因素,以探讨更有效的推广避孕套的措施,预防HIV夫妻间的性传播.

    作者:杨放;吴尊友;徐臣;张云同;吕莉 刊期: 2004年第08期

  • 辽河油田不同职业人群高血压相关因素分析

    2002年<世界卫生报告>公布,高血压造成全球每年710万人早亡,疾病负担为每天6 340万美元[1].近年来,随着人民生活水平的迅速提高,我国高血压患病率明显增加[2],并且不同职业间患病率不同[3].本文对辽河油田地区不同职业人群的高血压患病率及其危险因素进行了调查分析.结果报告如下.

    作者:袁凤山;王玉霞;齐今吾 刊期: 2004年第08期

  • 机关干部生活方式与慢性病关系的调查

    对辽宁省部分地区进行的抽样调查结果显示[1],机关干部慢性病(高血压、高血脂、冠心病、脑中风、糖尿病)患病率较高.对他们的健康状况和不良的生活方式进一步分析,研究相关影响因素,为采取针对性保护措施提供依据.

    作者:张淑娟;徐肇翊;潘国伟;刘奇男;刘红梅;刘黎明;侯书文;潘百灵;林刚 刊期: 2004年第08期

中国公共卫生杂志

中国公共卫生杂志

主管:中华人民共和国卫生和计划生育委员会

主办:中华预防医学会