学术投稿

基因表达数据的聚类分析

王长本;刘兴晖;王伟灵;周新

关键词:基因表达, 聚类分析
摘要:随着大规模基因表达数据获取方法的发展,产生了大量的基因表达数据.聚类分析即是一种目前应用较广的基因表达数据计算学分析方法.目前已有多种聚类算法,现介绍目前应用较多的几种算法,并指出各方法的优缺点.开发从数据预处理、结果评估,到有意义生物学信息提取的高度集成的聚类分析方法,有极高的应用价值.
国际检验医学杂志相关文献
  • 血小板平均体积检测的临床意义

    血小板平均体积(MPV)是血小板活化的一个重要指标.MPV升高,血小板体积增大,活性增强.研究发现MPV与许多疾病(急性冠状动脉综合征、脑梗死等)的发生、发展及预后密切相关,在临床上有一定应用价值.现就MPV检测的临床意义作一综述.

    作者:丁志祥;张乐之;王鸿利 刊期: 2004年第04期

  • 第六届全国儿科学新进展、急重症诊断新技术学术会议征文通知

    作者: 刊期: 2004年第04期

  • HLA基因多态性与临床疾病易感性的研究

    人类白细胞抗原HLA的检测初用于器官移植,但近年来,HLA作为免疫遗传基因在与免疫调节有关的疾病中所扮演的重要角色愈来愈受到重视.现就HLA的分型方法及与其某些临床疾病的关系作一综述.

    作者:章晓鹰;陈建杰;张珏 刊期: 2004年第04期

  • 慢性骨髓炎患者脓性分泌物中检出蜡样芽胞杆菌

    蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)常存在于空气、土壤、尘埃、水及植物中,有时正常人的粪便中亦有,一般不致病.自Frankland首次发现该菌以来,蜡样杆菌在很长一段时间内被视作与食物中毒有关.近年来才有报道本菌引起胃肠外感染.在慢性骨髓炎患者中检出此菌比较少见,且感染时间较长,有10年之久.现将从这一男性患者骨髓炎分泌物中检出的蜡样芽胞杆菌报道如下.

    作者:蒋建华;周祚盛 刊期: 2004年第04期

  • 胎儿肺成熟度测定方法的进展

    在高危妊娠管理中,棘手的问题是选择何时分娩,在保证孕产妇安全的前提下,围产儿能否存活取决于胎儿成熟度,更重要的是胎肺的成熟度.现回顾了胎儿肺成熟度的判断方法及其研究进展,其研究方法从生物物理学、生物化学、免疫化学到分子生物学等多方位的研究,为围产期保健提供了科学的依据.

    作者:杨红玲;丘媛媛;冯琼 刊期: 2004年第04期

  • 高敏C反应蛋白与心血管疾病的关系

    对C反应蛋白(CRP)这个古老项目的新认识、新理论及用途在概述动脉粥样硬化中的作用,预测非冠心病(CHD)患者未来心血管事件发生率及未来心血管事件的可能性研究,高敏感性C反应蛋白(Hs-CRP)与传统CHD危险因素的关系和检测应用前景几方面进行扼要综述.Hs-CRP与传统检测方法不同的是检测正常范围低水平的CRP微小变化,它不仅可能是一种轻度慢性全身性炎症的标志物,而且直接参与了动脉粥样硬化的过程,可以增强预测预后和治疗的能力,hs-CRP的预测价值显著高于与传统危险因素有关的生化指标或其他新发现的指标.

    作者:康红;冯刚 刊期: 2004年第04期

  • 叶酸受体介导的药物靶向投递系统研究进展

    目的肿瘤细胞膜上表达一些正常细胞不表达或低表达的受体,它可成为肿瘤治疗的靶点.一些肿瘤组织高水平表达叶酸受体,利用多聚阳离子为载体,结合药物/DNA形成叶酸交联复合物,通过叶酸受体介导的基因转移方式,将药物/DNA靶向投递到肿瘤组织或细胞,具有转移效率高和靶向性投递的特点.现就叶酸受体、叶酸受体介导的内化机理、基因药物、蛋白毒素、放射性药物靶向投递等方面作一综述.

    作者:蒋建伟;张洹 刊期: 2004年第04期

  • 基质金属蛋白酶与肝癌侵袭和转移的研究进展

    近年来研究发现细胞外基质(ECM)在肿瘤的侵袭和转移过程中起着重要作用,金属蛋白酶(MMPs)通过对ECM的降解而促进肿瘤的转移.现就金属蛋白酶的结构、功能及其与肝癌侵袭、转移的研究进展作一综述.

    作者:兰春慧;陈东风 刊期: 2004年第04期

  • 细菌CpG DNA的免疫激活作用研究进展

    细菌基因组DNA中以较高的频率出现非甲基化的胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpG DNA),免疫活性细胞的Toll样受体-9(TLR9)可以识别CpG DNA并激活NF-κB途径,活化免疫活性细胞,引起以Th1型为主的免疫应答,在诱导天然免疫、疫苗佐剂、抗肿瘤、促进造血、防治过敏性疾病等方面得到广泛应用.

    作者:谢成彬;王跃 刊期: 2004年第04期

  • 中华医学会系列杂志《国外医学临床生物化学与检验学分册》稿约

    作者: 刊期: 2004年第04期

  • 内蒙古少数民族地区人群血清apoAI及apoB水平探讨

    目的研究内蒙古少数民族地区正常人群血清载脂蛋白AI(apolipoprotein AI,apoAI)及载脂蛋白B(apolipoprotein B,apoB)水平,探讨适合内蒙古少数民族地区理想的参考值.方法收集内蒙古各族健康人群血清,按一般生活水平严格筛选1 009例,其中男547例,女462例,年龄1~83岁.用免疫透射比浊法(ITA)测定其apoAI、apoB及AI/B水平并进行统计分析.结果将上述正常人群体检结果与国内外某些资料进行对比分析,得出内蒙古少数民族地区正常人群血清ApoAI、apoB水平较欧美人偏低,与国内宁波地区接近,且低于北京地区.结论说明血清apoAI、apoB及AI/B受种族、环境、生活方式等影响.

    作者:孙文阁;朱振远;费志宏;何述祥;牛丽丽;伍镜池 刊期: 2004年第04期

  • 丙型肝炎病毒感染的实验室检测及临床应用

    全球丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染率约为3%(1.7亿人).HCV传播的主要方式是接触感染者血液,如静脉内用药或输血;透析、外科手术和结肠镜检查也可引起院内HCV传播;针刺损伤的健康保健工作人员血清HCV抗体阳转率为0%~7%.HCV的围生期和性传播很低,但是,如果HCV感染的母亲或性伙伴也感染了HIV-1,这种传播出现率更高.发达国家从1990年开始对献血员筛查HCV抗体,将输血获得HCV感染的危险性大大降低,估计美国当年就防止了40 000 HCV感染.随着酶免疫测定(enzyme immunoassay,EIA)HCV抗体技术的发展和核酸扩增技术的应用,进一步降低了输血传播HCV的发生率,1999年4月~2000年7月,美国和加拿大应用核酸扩增技术从1 630万例血清学阴性献血员中检出HCV阳性62例.

    作者:杨朝国;陈川 刊期: 2004年第04期

  • 抑制性消减杂交技术及其应用研究进展

    抑制性消减杂交是结合抑制性PCR和消减杂交技术发展起来的一种高效分离差异表达基因的方法,具有特异性高、假阳性率低、操作简便、灵敏度高等特点.在正常和异常状态下基因的表达变化、差异基因的克隆和鉴定对新基因的认识和基因表达调控有着重要意义.SSH在心血管疾病、肿瘤等方面的研究中取得了重要进展.

    作者:何鹏;江渝 刊期: 2004年第04期

  • 脑脊液蛋白质分析的临床意义

    脑脊液充满于脑和脊髓的生理腔隙中,可视为中枢神经系统的组织液.随着人们对神经系统疾病的不断发现与认识,相应地对这些疾病的有价值的实验室诊断的研究也越来越多.现对近几年来国内外研究较多的脑脊液蛋白质及其临床意义作一简要综述.

    作者:艾红梅;王昌富 刊期: 2004年第04期

  • 抗SSA/Ro抗体的检测方法比较

    综合比较了四种检测抗SSA/Ro抗体方法的敏感性、特异性及阳性检出率,得出IBT法与ID 法相结合是比较实用、又能显著提高检出率的理想方法.

    作者:罗发兴;向文斌;王继华;何小维 刊期: 2004年第04期

  • 转化生长因子β的生物学特性与肾病综合征慢性纤维化进程

    转化生长因子β能明显促进肾多种细胞肥大、细胞外基质增生,从而导致肾小球和肾小管间质不同程度的纤维化,引起临床上肾病综合征所具有的各种病理改变.在体外,多种慢性肾病动物模型的研究又发现血管紧张素转换酶抑制剂能有效抑制这一过程,减少转化生长因子β在血中的水平及其受体表达,进而减轻肾小球间质纤维化及肾小球硬化的程度及进程,延缓肾病综合征向慢性化方向发展,为肾病综合征的治疗争取时间.转化生长因子β是一个具有多种功能的细胞因子家族,在人体不同器官和组织都有其受体表达.现就转化生长因子β对肾病综合征的发生发展及预后的可能影响作一综述.

    作者:唐雪梅;李秋;李永柏 刊期: 2004年第04期

  • 实时定量PCR分析ST13基因在肿瘤细胞株中的表达

    目的利用实时定量PCR(real-time quantitative PCR)相对定量ST13基因在不同肿瘤细胞株的表达情况.方法提取肿瘤细胞株SW620、A549、Bxpc-3、SMMC-7721、RKO和Bcap-37细胞总RNA,经寡聚脱氧胸腺嘧啶逆转录,实时定量PCR扩增,针对内参照GAPDH基因相对定量ST13基因的表达,比较ST13基因在不同组织癌细胞株中的表达.结果 ST13基因在6种肿瘤细胞株中表达高,相当于GAPDH基因表达的1%~20%,细胞株之间ST13基因表达量分高、中、低三类(P<0.05),呈现Bcap-37、RKO>SMMC-7721和Bxpc-3>A549、SW620.结论本方法简便、快速、高效地反映了ST13基因在细胞株中的表达情况,是基因研究中一个实用的技术手段.

    作者:陈功星;张佳炜;董庆华;丁佳逸;郑树 刊期: 2004年第04期

  • 流式细胞仪检测淋巴细胞亚群糖皮质激素受体的表达:创伤后应激病患者糖皮质激素受体减少

    作者:姜维洁;李培成 刊期: 2004年第04期

  • 心血管疾病的蛋白质组学研究进展

    蛋白质组学是作为继基因组学后提出的新学科,其以组织或细胞的全部蛋白质为研究对象,以蛋白质表达的整体水平为研究特点,为生命科学的研究提供了新视角.心血管疾病的研究是蛋白质组学研究的重要领域,并且取得了不少阶段性成果.现对蛋白质组学在心血管疾病领域,包括比较蛋白质组、功能蛋白质组的研究进展作一综述.

    作者:沈静;钱令嘉 刊期: 2004年第04期

  • 血液代用品及其临床应用

    临床常规输血技术是安全的,但是由于血液贮存期短、供-受血者之间需要配型、血液传播血源性疾病等原因,限制了配体输血技术在紧急状况,如灾难、战争的广泛应用,由此促进了血液代用品的研究开发.

    作者:夏德宜;周剑涛 刊期: 2004年第04期

国际检验医学杂志

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主管:重庆市卫生局

主办:重庆市卫生信息中心