学术投稿

狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立和阳性对照的制备

王云龙;赵瑞红;李智涛;李玉林;王国强;沈飞

关键词:聚合酶链反应, 狂犬病病毒, 假病毒颗粒
摘要:目的 建立狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法,制备狂犬病病毒(rabies virus,RV)的假病毒颗粒阳性对照.方法 在RV的N基因保守区设计引物和探针,建立反转录实时荧光定量PCR检测方法,克隆得到噬菌体MS2的装配蛋白和壳蛋白基因(MS2),将其重组到质粒pET-28b(+)中,再将RV的N基因片段重组到MS2下游,经原核表达得到RV假病毒颗粒.结果 实时荧光定量PCR检测RV重组质粒低检测限为15拷贝/μl,重组表达质粒经原核表达可形成耐RNase的RV病毒样颗粒.结论 建立了反转录实时荧光定量PCR检测RV核酸的方法,成功构建了可耐受RNase且无传染性的RV阳性对照.
中华实验和临床病毒学杂志相关文献
  • 高危型人乳头状瘤病毒和宫颈细胞学联合检测在诊断宫颈病变中的临床价值

    目的 探讨高危型人乳头状瘤病毒(hish-risk human papillomavirus,HR-HPV)和宫颈细胞学联合检测在诊断宫颈病变中的临床价值.方法 对2004年10月至2006年12月北京大学第一医院就诊的患者进行HR-HPV检测和宫颈细胞学检查,对一项或两项结果异常者均行阴道镜下宫颈活检,并以宫颈活检结果为金标准,比较HR-HPV检测、宫颈细胞学检查、HR-HPV和宫颈细胞学联合检测对宫颈病变的诊断价值.结果 HR-HPV检测、宫颈细胞学检查及HR-HPV检测联合宫颈细胞学检查对诊断宫颈病变有不同价值.HR-HPV检测筛查CINⅡ、CINⅢ的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为94.83%、31.06%、55.22%、87.02%,宫颈细胞学筛查CINⅡ、CINⅢ的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为92.10%、31.06%、54.50%、81.43%,HR-HPV和宫颈细胞学联合检测筛查CINⅡ、CINⅢ的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为99.65%、18.55%、61.46%、97.62%.结论 采用HR-HPV和宫颈细胞学联合检测可提高宫颈病变的检出率,并可指导临床医生对宫颈病变的治疗.

    作者:周金年;赵健;杨英捷;廖秦平 刊期: 2008年第06期

  • 四川地区部分人群和与人接触密切的家畜禽戊型肝炎病毒感染的调查及基因分型的研究

    目的 了解四川地区人群和与人接触密切的家畜猪和鸡戊型肝炎(戊肝)病毒感染的分布及病毒基因分析.方法 采用万泰生物药业的HEV EIA诊断试剂检测人群、猪和鸡血清中戊肝病毒(HEV)IgG抗体.采用逆转录套式PCR方法(RT-nPCR)检测猪胆汁和血清中戊肝病毒核酸,并对阳性产物进行纯化和部分核苷酸序列分析.结果 学龄前儿童血清672份中有41份阳性,阳性率6.1%,成人血清661份中有280例阳性,阳性率42.36%,猪血清36份中有32份阳性,阳性率为88.89%,59份鸡血清HEV抗体均阴性.对15份HEV IgM抗体阳性的患者血清和54份猪胆汁进行RT-nPCR,从1份患者血清和3份猪胆汁扩增到戊肝病毒核酸,4株核苷酸序列之间同源性92.1%~98.6%,与GenBank HEV参考株ORF2相对应序列比较,核苷酸序列与Ch-T21(我国散发性急性肝炎人分离株HEV4 B亚型)之间同源性高占90.1%~96.9%.结论 四川地区部分人群和与人接触密切的家畜猪均存在HEV感染,尤其是家畜猪感染率高达90%左右,从人和猪分离到的病毒株核苷酸同源性很高,均属于戊肝病毒基因4型.

    作者:江永珍;鲁健;张丽萍;田瑞光;刘青恋;毕胜利 刊期: 2008年第06期

  • EB病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒和柯萨奇病毒感染和多发性硬化复发关系的研究

    目的 探讨0EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、单纯疱疹病毒-1(HSV-1)、柯萨奇病毒B组Ⅰ-Ⅵ型近期活动性感染和复发.缓解型多发件硬化(RR MS)复发的关系.方法 采用酶联免疫吸附法检测34例RR MS患者和200名正常对照者血浆EB病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒-1、柯萨奇病毒B组Ⅰ-Ⅵ型IgM抗体,比较病例组和对照组间上述病毒近期活动性感染率的差别,并对病例组病毒近期活动性感染者和无活动性感染者的临床资料进行分析比较.结果 两组问EB病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒-1及柯萨奇病毒B组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅵ型IgM抗体阳性率的差异无统计学意义.RR MS组和对照组间柯萨奇病毒B组Ⅳ型、Ⅴ型IgM抗体阳性的差异有统计学意义(分别为3/34和0/200,P<0.05;2/34和0/200,P<0.05).病例组中任一病毒近期活动性感染者和无活动性感染者相比,其年龄、病程、发作次数、入院体温、血白细胞分类计数(中性粒细胞、淋巴细胞和单核细胞)、糖皮质激素应用与否及EDSS分值间的差异均无统计学意义.结论 RR MS患者复发期柯萨奇病毒B组Ⅳ型、Ⅴ型近期活动性感染率较高,但近期病毒活动性感染和症状的严重度无关,未发现EBV、CMV、HSV与RR MS复发的关系.

    作者:冯子敬;赵日光;王得新 刊期: 2008年第06期

  • 一起不明原因感染性腹泻疫情的病原学诊断

    目的 明确一起不明原因感染性腹泻疫情的病原体及其基因型别.方法 通过流行病学调查的方法,查明罹患率.对28例疑似病例的28份样本(粪便22份,呕吐物3份,肛拭子3份)采用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对5份阳性标本的核酸进行序列测定及遗传进化分析.结果 在调查的5694人中,发病160例,罹患率为2.81%.2007年3月7-9日为发病高峰.RT-PCR检测28份样本中,确定14份为阳性.对其中的5株毒株的核酸序列测定及序列遗传进化分析确定为GⅡ/4型诺如病毒,并与2006年诺如病毒流行株2006b同源性高,为97.9%.结论 本次感染性腹泻疫情由诺如病毒引起.

    作者:刘运芝;黄一伟;靳淼;张红;刘富强;王静;胡世雄;欧新华;段招军 刊期: 2008年第06期

  • 含HPV16L1基因重组腺病毒和1型重组AAV载体联合免疫效果的研究

    目的 对表达HPV16L1抗原的重组腺病毒及1型重组AAV载体联合免疫效果进行研究.方法 分别构建含密码子优化型HPVl6LI基因重组腺病毒rAd-mod.HPV16L1及1型重组从V载体rAAV1-mod-HPV 16L1,将纯化的重组AAV病毒载体以肌注及滴鼻途径单独及联合免疫C57BL/6小鼠,使用体外中和实验检测各组小鼠血清中特异性中和抗体.结果 rAAV1-med-HPV16L1单独及与rAd-mod-HPV16L1联合肌注可诱导高滴度的血清中和抗体,在初免后第16周抗体滴度显著高于其他免疫组,联合肌注组诱导的抗体滴度高于单独肌注组;重组病毒联合滴鼻虽能产生一定的免疫加强作用,但抗体滴度仍显著低于rAAV1-mod-HPV16L1单独及联合肌注组.结论 型重组从V载体联合重组腺病毒以初免.加强模式肌注可诱导更高滴度的血清中和抗体.

    作者:周玉柏;李泽琳;周玲;盛望;马洪涛;曾毅 刊期: 2008年第06期

  • 503例残留麻痹急性弛缓性麻痹病例病原流行病学特征分析

    目的 分析广东省1994-2007年间残留麻痹病例的病原流行病学特征.方法 对1994-2007年广东省503例残留麻痹病例的粪便标本进行病毒分离、血清型鉴定和脊髓灰质炎(脊灰)病毒型内鉴定,并使用统计学方法,综合分析病原学结果与残留麻痹病例的免疫史、性别、年龄等流行病学资料之间的关系.结果 收检了503例残留麻痹病例的粪便标本,其中150例分离到脊灰病毒(PC),均为疫苗类似株,59例分离到非脊灰肠道病毒(NPEV),PV和NPEV的年度分离率分别在18.92%.47.06%和4.17%~25.00%之间浮动.PV分离率随年龄组的增大而降低,0岁组高,为61.11%;0~2次免疫的病例的PV分离率远高于全程免疫者,差异有统计学意义;残留麻痹病例中的PV和NPEV分离率均高于无残留麻痹的病例.结论 1994-2007年广东省未发现由脊灰野病毒引起的残留麻痹病例,2岁以下年龄组和0~1剂次免疫者中的PV分离率与残留麻痹有相关性.NPEVs也可能是儿童出现残留麻痹病例的病原之一.

    作者:郑焕英;郭雪;刘冷;黄平;林永杰;张勇;柯昌文;许文波 刊期: 2008年第06期

  • 改良Lowry法测定Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗蛋白质含量的研究

    目的 建立Sabin株脊髓灰质病毒灭活疫苗(Sabin strain inactivated poliovims vaccine,SabinIPV)中微量蛋白质含量测定的方法.方法 采用lowry法结合三氯乙酸沉淀法测定试样中的蛋白质含量,摸索并优化各个实验条件.结果 该方法能够排除Sabin IPV疫苗样品中游离氨基酸、多肽和酚红指示剂等的干扰,线性范围为2.5-40μg/ml,r=0.9998;加标平均同收率为95.32%,批内和批间变异系数均小于10%.结论 三氯乙酸沉淀法结合Lowry法的改良方法可以用于测定生物制品中微量蛋白含量.

    作者:蔡玮;孙明波;陈洪波;洪超;宋晓艳;余磊;姜述德;廖国阳;杨净思 刊期: 2008年第06期

  • 应用医用三氧治疗慢性乙型肝炎的临床分析

    目的 探讨医用三氧治疗慢性乙型肝炎的疗效.方法 慢性乙型肝炎患者42例随机分为两组,对照组患者22例给予基础治疗,治疗组患者20例,常规基础治疗加用医用三氧治疗.分别在治疗前及治疗8周后观察生化及病毒学指标.结果 治疗结束时,治疗组及对照组肝功能均明显改善.治疗组显效、部分显效分别为10%,35%;对照组显效、部分显效分别为4.6%,13.6%(P<0.05).结论 医用三氧治疗慢性乙型肝炎有一定的疗效.

    作者:焦秀娟;彭勋 刊期: 2008年第06期

  • 腺相关病毒载体介导造血干细胞基因转导的策略

    腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)已被广泛用作基因治疗的载体.本文就提高AAV载体在HSCs中的基因转导效率的策略综述如下.

    作者:赵卫红;吴剑卿 刊期: 2008年第06期

  • 四川绵阳部分人群甲、乙、丙和戊型肝炎病毒感染血清学调查

    目的 了解健康人群肝炎病毒感染现状.方法 采用ELISA方法检测体检人群血清中抗甲(HAV-IgG)、乙(HBsAg和HBsAb)、丙(HCV-IgG)和戊型肝炎病毒抗体(HEV-IgG和IgM).人群血清均收集于2007年.结果 1352份人群血清肝炎病毒抗体阳性率,HAV-IgG为81,07%(1096/1352),HBsAg和HBsAb为5.4%(73/1352)和61.32%(829/1352),HCV-IgG为0.37%(5/1352),HEV-IgG为49.26%(666/1352).不同年龄段的人群HAV-IgG阳性率,10~19岁组为38.21%,20~29岁组为83%,30~39岁组为88%,40岁以上各年龄组为95.03%~97.77%.HBsAg和HBsAb阳性率,各年龄组依次为5.65%和50.83%、10.0%和68.0%、5.20%和78.80%、5.97%和78.11%、6.50%和62.50%、1.12%和51.40%、4.96%和30.58%.HCV-IgG阳性总数5份,其中10~19岁组1份,阳性率占0.33%,30~39岁组2份,占0.80%,60~69岁1份占0.56%,≥70岁1份占0.83%.HEV-IgG阳性率,10~19岁为26.58%,20~29岁组为42.0%,30岁以上各年龄组阳性率为55.22%~61.0%.对HEV-IgG阳性者再检测HEV-IgG,总阳性率为10.06%(53/527),各年龄组均有阳性者.结论 青少年HAV和HBsAb抗体低于人群总体水平,应及时加强免疫预防.人群HBsAg和HCV感染率与往年相比下降明显.HEV感染率随年龄增长而升高,特别是各年龄段均有新近感染者,应加强餐饮和公共卫生管理.

    作者:张丽萍;杨平;李凤华;闫钰;文鸣;张玉蓉;江永珍 刊期: 2008年第06期

  • SARS-CoV N基因重组腺病毒对树突状细胞前炎症细胞因子mRNA表达和分泌的影响

    目的 探讨严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒(SARS-CoV)感染后炎症细胞因子的mRNA表达和分泌水平的动态变化,在蛋白质水平上阐明SARS-CoV的致病机理.方法 本研究在建立树突状细胞(dendritic cells,DC)培养方法的前提下,利用SARS-CoV的N基因重组腺病毒(rAd-N)和对照的腺病毒(rAd-LacZ)来感染成熟的DC,用RT-PCR和ELISA法检测DC对IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-a的mRNA表达和分泌水平的变化.结果 IL-6和TNF-a mRNA的表达和分泌水平在前24 h之内是逐渐升高的,与对照组(rAd-LacZ感染)相比,差异有统计学意义(P<0.05或P<0.01).结论 SARS-CoY的N蛋白与SARS的急性期DC分泌过量的前炎症细胞因子有关.

    作者:马春玲;姚堃;周锋 刊期: 2008年第06期

  • 广西家鼠型肾综合征出血热病毒的发现和鉴定

    目的 从广西各地捕获的鼠肺标本检测汉坦病毒并鉴定其型别.方法 结合广西鼠疫监测采集啮齿类宿主动物,用ELISA法检测鼠肺标本,对汉坦病毒抗原阳性标本通过RT-PCR法扩增部分M片段上的核苷酸序列并测序,将扩增片段的核苷酸序列与已知病毒序列进行比对并分型.结果 在306份鼠肺标本中检测到1株SEO型的出血热病毒,阳性标本为广西沿海地区钦州市捕获的褐家鼠.结论 在广西沿海地区检测到SEO型汉坦病毒,其流行病学意义有待进一步研究.

    作者:谭毅;闭福银;韦增良 刊期: 2008年第06期

  • Nonidet P-40致流感病毒脱包膜的AFM观察研究

    目的 利用原子力显微镜(AFM)观察经非离子表面活性剂Nonidet P-40(NP-40)不同浓度系列处理的A型流感病毒表面形态变化,观察不同表面活性剂-病毒表面相互作用情况,以提供一种较为温和的病毒表面裂解条件,为利用AFM进一步研究病毒下层结构提供基础.方法 用不同浓度的非离子犁表面活性剂NP-40对完整的A型流感病毒进行处理,以轻敲模式经AFM成像,获得病毒球状体和丝状体的高度图、振幅图以及相位图,并观察和比较不同浓度非离子表面活性剂对病毒表面形态和结构的影响.结果 NP-40各浓度对病度表面破坏程度不一,病毒随NP-40浓度增高而逐渐降解,并出现部分剥离病毒表面.暴露下层衣壳,更清晰地展示包膜下层表面突起的表面形态学结果.结论 通过表面活性剂优化处理病毒颗粒,实现了利用AFM观测流感病毒包膜下形态结构的设想.

    作者:胡孔新;张丽萍;米超;刘燕飞;索华倩;王静;张乐;王宝麟 刊期: 2008年第06期

  • 麻疹实验室监测网络的建立和运转

    麻疹是由麻疹病毒引起的一种具有高度传染性的急性发热出疹性疾病.其病死率在一些发展中国家和地区超过10%,少部分病例伴有巨细胞肺炎、包涵体脑炎等严重后遗症,个别病例会并发亚急性硬化性全脑炎.在全球广泛使用麻疹减毒活疫苗之后,麻疹在世界大多数地区得到了成功地控制.即使如此,据世界卫生组织(WHO)估计,近年来,每年仍有接近3000万人感染麻疹病毒,在2000年还有超过77万例的死亡病例.

    作者:许文波 刊期: 2008年第06期

  • 定位表达于溶酶体、泛素的PrP载体的构建及鉴定

    目的 构建定位于溶酶体、泛素的PrP表达载体,并进行蛋白表达特点及定位的鉴定.方法 将泛素基因、溶酶体膜定位信号序列基因和PrP基因连接,克隆至pcDNA3.1载体中,构建表达载体pcDNA3.1-UPrP、pcDNA3.1-PrPL;瞬时转染真核表达细胞,经Western Blot和间接免疫荧光技术检测PrP表达特点.结果 构建的各种PrP定位表达载体均可定位表达具有三种类型的糖基化分子的PrP,以双糖基化分子类型多.带有泛素、溶酶体信号的质粒pcDNA3.1-UPrP、pcDNA301-PrPL的PrP表达随着时间的延长蛋白表达量下降,提示泛素、溶酶体信号能加速表达PrP在细胞内的降解.结论 成功构建了溶酶体、泛素定位表达的PRNP核酸疫苗载体pcDNA3.1-UPrP、pcDNA3.1-PrPL,为PRNP核酸疫苗的研究奠定了一定的基础.

    作者:李媛;梅国勇;姜慧英;王桂荣;田婵;陈操;王新;王克霞;韩俊;董小平 刊期: 2008年第06期

  • 汉坦病毒ZJ5株M和S全片段的分子特性及序列的比较分析

    目的 对浙江新分离的汉坦病毒疫苗后备筛选毒株ZJ5株的M和S全片段进行基因序列测定与基因分型,了解该毒株分子基础,并分析与其他病毒株以及20年前浙江分离的汉坦病毒ZIO、Z37疫苗株的差异.方法 提取汉坦病毒Z15株感染细胞总RNA,进行逆转录PCR扩增,产物纯化后克隆于T载体并测定序列.结果 扩增出ZJ5病毒M和S全片段并测定了序列,经对核苷酸和氨基酸序列分析表明,与汉城型(SEO)病毒有高的同源性,为SEOV,但与国内外已知的SEOV核苷酸差异高达11.7%~19.2%和6.7%~14.5%;用M和S片段核苷酸序列所构建的系统进化树显示,病毒株分在SEOV发生群,与SEOV的Gou3株亲缘关系近,但独自构成一进化支.结论 ZJ5株为一不同于现已报道的SEO型毒株的新亚型.

    作者:姚苹苹;朱函坪;徐芳;谢荣辉;梅玲玲;陆群英;朱智勇;邓小昭;张云 刊期: 2008年第06期

  • PD-1/PDL1信号通路与乙肝病毒慢性感染关系的研究进展

    乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染自然史可分为康复、表面抗原(HBsAg)无症状携带者、慢性乙肝、急性乙肝、乙肝后肝硬化、乙肝相关性肝癌等[1].慢性乙肝(chronichepatitis B,CHB)是HBV感染发病的常见状态,CHB的预后主要取决于病毒感染时机和宿主的免疫状况.

    作者:沈立萍;毕胜利 刊期: 2008年第06期

  • 实时荧光逆转录聚合酶链反应检测人类偏肺病毒方法的建立与应用

    目的 建立一种快速、准确、特异的实时荧光逆转录聚合酶链反应方法(PCR),以检测人类偏肺病毒.方法 根据Hmpv-L基因序列设计引物和探针并对实时荧光PCR反应体系进行优化,提取总RNA,通过随机引物进行反转录反应;产生的cDNA通过实时荧光PCR进行鉴定.进一步评价实时荧光反转录PCR方法的特异性、灵敏度、重复性,对180例临床样本进行检测.结果 本实验所建立的实时荧光反转录PCR方法可准确、特异地检测人类偏肺病毒;该方法的灵敏度可达到1拷贝/μl;检测的批间和批内的变异系数均小于5%.180例肺炎和支气管炎患儿痰标本中共检测出28例人类偏肺病毒阳性,阳性率为15.56%(28/180);肺炎患儿检出率为15.60%(17/109);支气管炎患儿检出率为15.49%(11/71).男性患儿检出率18.56%(18/97),女性患儿检出率12.05%(10/83).患儿年龄小于2岁者检出率22.34%(21/94),2~5岁者检出率8.70%(6/69),大于5岁者检出率5.88%(1/17).结论 本研究建立的人类偏肺病毒实时荧光逆转录PCR方法快速、准确,结果可靠,实用性强;人类偏肺病毒已成为小儿呼吸道感染的重要病原体之一.

    作者:邢建明;翁学军;张甦;袁新华;沈翠芬;张雅琴;程红玲;李刚;姚丽惠 刊期: 2008年第06期

  • 慢性乙型肝炎患者肝细胞凋亡的研究

    目的 探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者肝细胞凋亡与肝组织诱导性一氧化氮合酶(iNOS)、肝脏病理及血清转氮酶水平之间的相关关系.方法 取37例CHB患者和10例正常对照,采用dUTP缺口末端标记技术(TUNEL)检测肝组织中的细胞凋亡情况,免疫组化法检测肝组织iNOS的表达,并常规测定患者肝组织炎症分级和纤维化分期、血清丙氨酸转氨酶(ALT)、HBV DNA水平.结果 所有CHB患者的肝组织中均见到不同程度的TUNEL染色阳性.正常对照肝组织中未见到TUNEL阳性肝细胞.在CHB肝组织中,凋亡指数(A1)与炎症分级(r=0.404,P=0.015)及肝组织iNOS水平(r=0.465,P=0.004)明显相关并有统计学意义,而与血清ALT水平、HBV DNA以及组织学纤维化分期无明显关系.结论 慢性乙型肝炎患者体内氧化应激水平可能是肝细胞凋亡的诱导因素之一,细胞凋亡参与了CHB的肝细胞损伤过程,但并不影响患者的生物化学指标.

    作者:刘仪;王凯;王介非 刊期: 2008年第06期

  • 应用简便逆转录环介导等温扩增方法检测麻疹病毒核酸

    目的 应用简便快速的核酸检测新方法--逆转录环介导等温扩增方法(RT-LAMP)检测麻疹病毒核酸,并与巢式逆转录多聚酶链式反应(nest-RT-PCR)方法进行比较.方法 比较RT-LAMP方法与nest-RT-PCR方法对吉林省历年麻疹病毒分离株以及临床疑似麻疹咽试子中麻疹病毒核酸检测的检出率.结果 两种方法对23株麻疹分离株麻疹病毒核酸阳性检出率均达到100%.针对18份麻疹病毒分离阴性的临床疑似麻疹咽试子分别利用RT-LAMP和巢式RT-PCR两种方法进行麻疹核酸检测,RT-LAMP方法阳性率为56.52%,巢式RT-PCR方法阳性率为47.83%.结论 RT-LAMP方法比巢式nest-RT-PCR方法更敏感.

    作者:周剑惠;侯祥;陈超;王爽;常新;刘桂艳;王兆南;许松涛;姬奕昕;许文波 刊期: 2008年第06期

中华实验和临床病毒学杂志

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主管:实验和临床病毒学杂志

主办:中国科学技术协会