沈希；高子厚
近年来布鲁氏菌病在一些国家和地区呈流行趋势,所致的骨与关节受损较为常见.其中骨关节受累常见的3种形式是骶髂关节炎、脊椎炎和外周关节炎.骨损伤机制逐渐被阐明:TNF-α和参与调节骨质代谢的核因子κB受体活化因子配体(RANKL)参与其中,并由单核巨噬细胞、中性粒细胞、CD4+T细胞和B细胞等炎性细胞介导.此外,布鲁氏菌可直接作用于骨细胞和打破骨重塑的稳态平衡.通过作用成骨细胞抑制骨基质沉积、改变细胞表型产生金属蛋白酶(MMPs)和分泌细胞因子,从而促进骨基质降解.布鲁氏菌还可通过诱导破骨细胞生成和增强破骨细胞活化,进而增加矿物质和有机骨基质吸收,加剧了骨损伤.关节组织的病理学实验发现滑膜组织除了诱导细胞分泌趋化因子的激活、生成炎性细胞因子和基质金属蛋白酶,布鲁氏菌感染也可抑制滑膜细胞凋亡.布鲁氏菌是一种细胞内细菌,在巨噬细胞的内质网中优先复制.近年来骨与关节布鲁氏菌病分子机制的研究揭示布鲁氏菌与人类免疫细胞及骨关节细胞之间的相互作用在骨与关节损伤中发挥了重要作用.
作者：梁晨；魏伟；梁秀文；德恩金；王立军 刊期： 2018年第12期
鼠疫是由鼠疫耶尔森氏菌(简称鼠疫菌)引发的烈性传染病,人类历史上曾发生3次大规模的鼠疫大流行.近年来,考古微生物学得到长足发展,使得研究人员可以对历史上的鼠疫疫情进行探索,为鼠疫的起源、传播以及鼠疫菌的进化等关键问题提供更为深刻的理解.本文就关于考古微生物学方法在古代鼠疫疫情研究领域取得的进展进行简单综述:包括基于PCR、蛋白质分析以及基因组序列测定在内的考古微生物学研究技术方法;基于以上技术确认查士丁尼瘟疫和黑死病的病原体为鼠疫菌;新石器时代晚期至青铜时代就已经存在人类感染鼠疫菌的病例;通过分子钟分析将鼠疫菌的物种形成时间确定为5000-7500年前.考古微生物学方法不仅可以继续推进鼠疫和鼠疫菌的相关研究,也将为其他历史传染病的研究提供有益借鉴.
作者：宋凯；祁芝珍；杨瑞馥；宋亚军 刊期： 2018年第12期
目的 采用移动流行区间法(Moving epidemic method,MEM)判断流感活动开始和流感流行强度,为采取公共卫生措施提供理论依据.方法 以天津市2012-2017流感监测年度的流感病毒检测阳性率数据为基线,分析天津市2017-2018年流感季流感流行强度.结果 2017-2018年流感流行季,流感较去年同期(2016-2017年)提前3周进入流行状态.流感在2017年第45周突破流行阈值,持续4周后,第49周直接跨越中等流行进入高等流行,第50周进入非常高流行,并持续6周(2017年第50～52周,2018年第1～3周),2018年第4周跌至中等流行阶段,2018年第8周进入低等流行阶段,2018年第12周跌破流行阈值.结论 移动流行区间法,可以客观评价流感活动开始和流感流行强度,为比较国家与地区之间流感流行强度提供标准化方法.
作者：徐文体；董晓春；李琳；周朋辉；郭丽茹 刊期： 2018年第12期
目的 探索云南新现蝙蝠SARS样冠状病毒(SARSr-CoV)密码子偏性及其与SARS冠状病毒(SARS-CoV)及其他地区SARSr-CoV密码子偏性的进化关系.方法 运用Lasergene、EMBOSS、CodonW等生物信息软件,以SARS-CoV为对照,对云南新现蝙蝠SARSr-CoV各蛋白的编码序列进行密码子偏性分析,并基于此与不同时期报道的SARSr-CoV及SARS-CoV进行聚类分析.结果 11株云南新现蝙蝠SARSr-CoV各蛋白有效密码子数目均接近61,密码子偏性较弱;各蛋白偏性的密码子有差异,但均以A、U结尾的密码子为主.ENC-Plot、中性绘图分析与PR2规则分析均提示新现蝙蝠SARSr-CoV在进化过程中主要受到自然选择因素的影响.基于密码子偏性的聚类分析发现,部分云南蝙蝠SARSr-CoV与SARS-CoV关系极为密切.同时,其他云南SARSr-CoV分散聚类于其他地区的SARSr-CoV中.结论 新报道的蝙蝠SARSr-CoV的密码子偏性与SARS-CoV相似度较高,在进化过程中主要受到自然选择因素的影响,跨种传播至人的风险较高.
作者：田明明；魏雪玲；杨兴；宋秀锋；李光华；刘奇 刊期： 2018年第12期
目的 查明鹤庆新发野鼠鼠疫疫源地内是否存在鼠疫噬菌体,并对所离分鼠疫噬菌体进行形态鉴定及噬菌谱分析.方法 以鹤庆县马厂村为核心,选择5 km范围内的自然村为采样点,采用鼠铗法进行捕鼠,实验室中取鼠盲肠置入改良PBS中,采用双层平皿对样本进行筛选、纯化得到噬菌体,观察噬菌斑形态,电镜检查噬菌体形态,并在22℃、24℃、28℃及37℃对21株鼠疫菌与115株非鼠疫菌进行裂解特性分析.结果 采集的354份标本,分离到2株鼠疫噬菌体;2株噬菌体在高于24℃温度下可裂解鼠疫菌,低于24℃不能裂解鼠疫菌,而非鼠疫菌在4个温度下均不裂解;电镜形态检测2株噬菌体均属于肌尾噬菌体.结论 鹤庆新发野鼠疫疫源地内存在着鼠疫噬菌体,且所分鼠疫噬菌体只有在高于24℃时才裂解鼠疫菌,此特性与鼠疫菌在鹤庆县的长期存在相关,且两株噬菌体存在裂解谱较窄,特异性良好,可用于备用诊断噬菌体的筛选株.
作者：王波；钟佑宏；丁奕博；郭英；段存娟；张海鹏；赵丹妮；谭红丽；李伟；王鹏 刊期： 2018年第12期
啮齿类动物是哺乳纲中种类和数量多、分布广的的一个类群,其作为鼠疫主要宿主与鼠疫之间的关系一直是鼠疫防治领域研究的热点问题.本文结合啮齿类动物的种群生态学指标与鼠疫流行之间的关系进行综述.
作者：沈希；高子厚 刊期： 2018年第12期
目的 研究山西省长治及周边地区结核分枝杆菌的基因多态性及基因型与耐药的相关性.方法 收集结核分枝杆菌临床分离株,运用MLVA方法进行基因分型,对8种抗结核药物分别采用比例法进行药敏试验,应用BioNumerics 5.0软件进行聚类分析.结果 15个位点中Mtub21、MIRU26和ETRE多态性较高(HGI＞0.6),MIRU40、ETRB、MIRU16、ETRD、MIRU23和ETRC位点多态性较低(HGI＜0.3).127株结核分枝杆菌共分为11个基因群102种基因型,90株为独特型,基因群中Ⅰ群所占比例大(80.31％).127株菌株对一线和二线抗结核药物的总耐药率分别为47.24％和23.62％.一线药物中链霉素(40.94％)的耐药率高,乙胺丁醇(6.30％)低.二线药物中左氧氟沙星(14.17％)的耐药率高,丙硫异烟胺(3.15％)低.链霉素的单耐药率高(11.81％);耐多药率为21.26％(27/127);广泛耐多药率为3.15％.Ⅰ群菌株的耐药率与其它菌株的差别无统计学意义.结论 初步证实山西长治及周边地区的结核分枝杆菌具有明显的多态性,Ⅰ群为主要流行群.结核分枝杆菌对二线药物的敏感性高于一线药物.主要流行菌株Ⅰ群菌株与耐药无明显的相关性.
作者：刘益萍；庞慧；万康林；弓艳娥；郭旭霞；王艳霞；刘海灿 刊期： 2018年第12期
目的 研究309医院结核病研究所接收的肺病病人中非结核分枝杆菌(NTM)肺病的菌种分布及病例特点,为临床诊断提供思路.方法 收集309医院结核病研究所临床实验室2014年9月至2018年3月非结核分枝杆菌阳性报告,根据2012年版中华医学会《非结核分枝杆菌病诊断与治疗专家共识》建立确诊NTM肺病组,研究NTM肺病组中NTM的分布特点;根据NTM肺病组病例的年龄、性别、地域和发病时限建立配对肺结核组,研究两组病人基础状态的差别.结果 NTM阳性108例,分离率为4.66％.确诊NTM肺病72例,分离率为3.10％,90％病例来自华北和东北地区.包括胞内分枝杆菌(33/72,45.8％oo),龟/脓肿分枝杆菌(27/72,37.5％),鸟分枝杆菌(7/72,9.7％),堪萨斯分枝杆菌(3/72,4.2％),蟾蜍分枝杆菌(2/72,2.8％).NTM肺病患者明确诊断用时平均27.8±30.8个月;平均年龄64.1±18.0岁;男女比例1.88∶1;＞80岁组全部为男性,11/13为龟/脓肿分枝杆菌肺病;NTM肺病患者的基础性呼吸系统慢性疾病发生率高于肺结核病患者,差异有统计学意义(X2 =4.141,P=0.042);女性NTM肺病的基础性支气管扩张发生率显著高于男性NTM肺病患者(x2=10.277,P=0.006).龟/脓肿分枝杆菌肺病平均年龄75.2±14.8岁,胞内NTM肺病患者平均年龄59.9±17.0岁,这两种肺病的年龄分布差异有统计学意义(x2 =14.832,P=0.011).结论 华北东北地区主要的NTM肺病致病菌是胞内分枝杆菌和龟/脓肿分枝杆菌;40岁之后NTM肺病发病率随年龄增多;80岁之后以龟/脓肿分枝杆菌为主;女性NTM肺病发病年龄相对小,基础性支气管扩张是女性NTM肺病的易感因素;NTM肺病明确诊断用时长,分枝杆菌核酸检验可以显著提高诊断效率.
作者：杨栗坤；曹彦；曹艳龙；孙雯娜；贺熊；王心静；王仲元 刊期： 2018年第12期
目的 对2017年南京市2株肠道病毒71型分离株进行全基因组序列测定,分析其进化及遗传变异特征,为手足口病疫情的监控与防治提供依据.方法 通过对临床检测EV71阳性的标本进行病毒分离,设计8对特异性引物对病毒全基因组进行PCR分段扩增,经序列测定及拼接获得EV71基因组序列,将其与其他代表毒株序列分别进行核苷酸和氨基酸同源性比对,并进行遗传进化分析.结果 基因组核苷酸同源性分析显示,2株分离株的同源性为94.0％.以EV71 NJ2017iso2作为参照,与2008年安徽流行株Fuyang 17.08-02的同源性高(96.9％),而与原型株BrCr的同源性较低(79.8％).同时基于VP1基因和全基因组序列构建的进化树均可以看出,2株分离株与C4亚型代表株聚为一簇,与国内各地既往的C4流行毒株相比,未发生大的变异.结论 2株EV71分离株均属于C4a型,虽病毒核苷酸序列之间差异显著,但大多为无明显的突变,其相应的氨基酸序列的遗传变化相对稳定.
作者：王子鸣；余倩；张曾娣；黄赞 刊期： 2018年第12期
目的 以绿色荧光蛋白(GFP)标记的鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium,S.Typhi)为研究对象,秀丽隐杆线虫为模式生物,初步探究体内环境下HilD对ssrAB表达的调控作用.方法 通过基因工程技术分别构建携带gfp基因的亲本株S.Typhi(ssrAB-gfp+ pc DNA3.1)、hilD基因缺失株S.Typhi(ΔhilD+ ssrAB-gfp+pc DNA3.1)和hilD基因回补株S.Typhi(△hilD+ ssrAB-gfp+pcDNA3.1-hilD)标记菌.利用荧光显微技术,观察3株标记菌在饲喂感染秀丽隐杆线虫体内外的GFP表达状况及其定殖分布,并通过ImegJ软件进行荧光强度的比较.结果 成功构建的3株标记菌在秀丽隐杆线虫体内外均呈现绿色荧光,荧光强度为S.Typhi(ssrAB-gfp+ pc DNA3.1)高于S.Typhi(ΔhilD+ ssrAB-gfp+pc DNA3.1-hilD)和S.Typhi (ΔhilD+ ssr AB-gfp+ pc DNA3.1),S.Typhi(ΔhilD+ ssrAB-gfp+ pc DNA3.1-hilD)高于S.Typhi(ΔhilD+ ssrAB-gfp+ pcDNA3.1);3株标记菌在线虫体内主要定殖分布于口咽部和肠道中,荧光强度为口咽部较肠道高.结论 GFP在鼠伤寒沙门氏菌中得到稳定表达,感染秀丽隐杆线虫后同样获得GFP的稳定表达,且在线虫的口咽部和肠道具有良好的定殖分布,首次初步证明体内环境下HilD介导ssrAB表达,但并非为单一的调控作用.
作者：韩敏敏；张丽；周妮妮；陈传荣；曹堃；李郁 刊期： 2018年第12期
目的 了解江苏某肉鸡屠宰加工厂不同环节弯曲菌的污染状况及耐药现状.方法 采集屠宰前肉鸡泄殖腔、不同环节鸡酮体以及环境等样品,运用无血弯曲杆菌选择性培养基(modified charcoal-cefoperazone-deoxycholate agar,CCDA)平板法进行分离纯化,PCR鉴定后,采用K-B法测定6大类14种抗生素耐药情况.PCR检测弯曲菌Ⅰ型整合子、四环素耐药基因tet(O)、氨基糖苷类耐药基因簇aadE-sat 4-aphA-3以及弯曲菌gyrA基因第257位碱基的突变情况.结果 细菌分离结果显示170份样品分离到124株弯曲菌(72.95％o).分离株对链霉素、妥布霉素、卡那霉素、环丙沙星、氧氟沙星、萘啶酸、红霉素和四环素耐药率为100％,多重耐药现象普遍,多重耐药率高达100％,其优势耐药谱主要为CTX-CRO-cDA-K-NOR-S-AZM-CIP-TE-NA-E-LEV-ENR-TOB.分离株经PCR扩增未检测到Ⅰ型整合子,所有菌株在gyrA喹诺酮类耐药决定区发生了C-257-T点突变,tet (O)基因和aadE-sat 4-aphA-3检出率分别为100％和90.23％.结论 江苏某肉鸡屠宰加工生产链中弯曲菌污染及耐药情况比较严重,gyrA基因突变、tet (O)基因及aadE-sat 4-a phA-3耐药基因簇的携带,与弯曲菌对喹诺酮类、四环素类和氨基糖苷类耐药密切相关.
作者：唐梦君；周倩；张小燕；周生；张静；唐修君；高玉时 刊期： 2018年第12期
目的 对2013年以来江西省致病性钩端螺旋体进行血清学、基因分型分析,以了解江西省钩端螺旋体血清学和分子流行病学特征.方法 对27株钩端螺旋体进行暗视野显微镜凝集试验确定血清群.PCR扩增16S rRNA基因、测序,确定基因种.利用MLST(multilocus sequence typing)研究进行基因分型分析,并应用BioNumerics (Version5.10)软件进行聚类分析.结果 血清群鉴定:27株菌株隶属于4个血清群,其中黄疸出血群为主要优势血清群,占59.26％,其次依次是爪哇群25.92％、澳洲群7.41％和巴达维亚群7.41％.基因种鉴定:27株菌株隶属于L.interrogans和L.borgpetersenii 2个致病性基因种,L.interrogans为江西省主要优势型别,占77.78％.MLST研究显示27株菌株隶属于5个ST型别,其中ST1为主要基因型,占59.26％.BioNumerics软件分析:27株菌株分为5个Clusters对应于5个ST型,MLST基因型别具有明显的地域性特征,而年代间变化不明显.结论 黄疸出血群为江西省主要流行血清群,L.interrogan为主要致病基因种,ST1为主要基因型,充分了解江西省钩体病血清学和分子流行病学特征将对钩体病防控和疫苗制备有一定的指导意义.
作者：张翠彩；徐建民；邱海燕；张汀兰；蒋秀高 刊期： 2018年第12期
目的 比较并分析我国人兽共患病病原生物学相关期刊基本情况、引用和被引情况,了解此类期刊之间交流以及专业发展现状.方法 通过限制检索条件,以《中国科技期刊引证报告(核心版)》(2011-2017)和中国知网引文数据库数据为基础,查询符合条件期刊的主办单位、创刊年份、载文情况、近十年刊文的学科分布,同时分析了上述期刊的影响因子、学科扩散指数、引文情况及各期刊间相互引用情况.结果 通过筛选共有8种期刊符合条件:《中国人兽共患病学报》、《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》、《中国血吸虫病防治杂志》、《中国热带医学》、《热带医学杂志》、《病毒学报》、《中国媒介生物学及控制杂志》和《中国病原生物学杂志》.上述8种期刊中,月刊和双月刊各4种.除《中国热带医学》外,其他7种期刊均创刊于上世纪80年代.近十年刊文的学科分类主要为基础医学、传染病学、生物学、预防医学和卫生学.上述期刊近年的影响因子均有不同程度升高,尤其是《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》影响因子由2012年0.619上升至0.979、《中国病原生物学杂志》影响因子由2014年0.58上升至1.044.2012年《中国科技期刊引证报告(核心版)》对收录的核心期刊学科分类进行了一次较大调整,除《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》外,其他7种期刊均被调整,使其学科扩散指标也出现了较大的拐点.上述期刊中有5种期刊之间存在全互引现象,病毒学类与寄生虫学类期刊之间的引用罕见.各期刊存在较严重的自引现象,其自引率远高于该期刊对其他期刊的引用率.结论 国内人兽共患病病原学相关期刊交流广泛但总体发展相对缓慢,应理性认识影响因子的科学价值,以建立全面的期刊评价体系.
作者：张智芳；王晓欢；梁小洁；黄丰；林丹；严延生 刊期： 2018年第12期
目的 测定核糖体DNA内转录间隔区1(nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer 1,rDNA-ITS1)序列进行库蠓种类鉴别与系统发育分析,以探究rDNA-ITS1序列在库蠓分子鉴定和系统发育研究方面的适用性.方法 采用DNA扩增、纯化、克隆及测序的方法获得荒川库蠓Culicoides arakawai、凹缘库蠓C.holcus、连斑库蠓C.jacobsoni、印度库蠓C.indianus、霍飞库蠓C.huffi和肩宏库蠓C.humeralis等6种库蠓的rDNA-ITS1序列,基于Kimura 2-parameter公式计算种内和种间遗传距离,应用MEGA 6.06软件分析DNA序列碱基组成并以环纹埃蠓Allohelea annulata为外群构建系统发育树(邻接法和大似然法).结果 上述6种库蠓的rDNA-ITS1序列经过Clustal W比对及人工校对和编辑后的长度为352 bp,其中T、C、A、G4种碱基的含量分别为36.8％、13.0％、30.0％和20.1％,A+T的含量(66.8％)高于C+G的含量(33.1％);K-2p遗传距离在种内和种间具显著差异(t=32.430,P＜0.05);系统发育树中不同种类库蠓各自构成单系(群),同种类不同地理种群聚为一支,其与形态学鉴定结果一致.结论 本研究证实了rDNA-ITS1序列可用于进行库蠓及其近似种的分子鉴定和系统发育分析.
作者：岑常活；韩晓静；常琼琼；段琛；侯晓晖 刊期： 2018年第12期
目的 COI基因对柴达木盆地部分蚤种进行分子生物学鉴定,旨在完善蚤类传统形态分类法的不足.方法 PCR扩增68份蚤类标本的COI基因片段(约600 bp)并进行测序和比对;用MEGA 6软件的K2-P双参数模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树.结果 共测得柴达木盆地19种蚤的68条COI基因序列,种内遗传距离0.01％～2.9％,种间遗传距离3％～15.4％,种间遗传距离显著大于种内遗传距离.结论 NJ树显示同一物种形成高支持率的单系,种间分支很明显,表明COI可以作为DNA条形编码基因对柴达木盆地的常见蚤类进行物种鉴定.
作者：李海龙；何建；赵延梅；杨汉青；马英 刊期： 2018年第12期
目的 对一株腹泻猴源的空肠弯曲菌分离株M166进行鉴定和生物学特性研究.方法 通过多重PCR、生化鉴定、MALDI-TOF-MS质谱鉴定、电镜观察等方法验证猴源分离株,通过与标准株NCTC11168进行比较,对生长曲线、运动力、Balb/c小鼠体内定殖实验等生物学特性进行研究.结果 该分离株多重PCR显示空肠弯曲菌阳性,马尿酸钠水解阳性,VITEK-2生化和MALDI-TOF-MS分析均鉴定为空肠弯曲菌,电镜观察显示为典型的弯曲菌形态;与NCTC11168相比,M166在MH液体培养基中的生长速度和增殖程度弱于NCTC11168,但运动力更为活跃;攻毒后第7d小鼠体内定殖实验结果表明,NCTC11168攻毒组无细菌检出,而M166攻毒组能持续排菌,且在十二指肠、空肠、回肠、盲肠中定殖,每克载菌量分别可达3.09±0.47,3.01±0.84,3.80±0.46,5.63±0.34 CFU/g.结论 M166具有空肠弯曲菌典型的生物学特性,且在小鼠肠道中定殖能力强,这可能是M166能在实验猴体内定殖并导致腹泻的重要因素.
作者：金微微；唐海燕；任方哲；唐虹；焦新安；黄金林 刊期： 2018年第12期
目的 克隆变异链球菌clpP基因启动子,并进行初步验证.方法 PCR分别扩增变异链球菌clpP基因5'-侧翼序列FclpP及其突变体FclpP-ΔRS,插入β-半乳糖苷酶(β-glucuronidase,gusA)报道基因表达载体pIB107 Bam HI/XhoⅠ酶切位点之间,构建clpP基因5'-侧翼序列及其突变体gusA报道基因表达载体pFclpP和pFclpP-ΔRS,PCR、酶切及测序鉴定;经Bgl Ⅱ线性化后转化变异链球菌UA159,卡那霉素筛选阳性克隆,得到clpP基因5'-侧翼序列及其突变体gusA报道基因表达株SClpP和SClpP-ΔRS,经PCR及测序鉴定后,测定SClpP、SClpP-ΔRS、阳性对照SAmi和阴性对照SIB107的GusA活性.结果 成功扩增出变异链球菌clpP基因5'-侧翼序列及其突变体;变异链球菌clpP基因gusA报道基因表达载体经PCR、酶切及测序鉴定正确无误;PCR及测序结果表明成功构建clpP基因5'-侧翼序列及其突变体变异链球菌gusA报道基因表达株SClpP和SClpP-ARS;GusA活性测定证实变异链球菌clpP基因5'-侧翼序列及其变体gusA报道基因表达株SClpP和SClpP-ΔRS的GusA活性分别是阴性对照pIB107的34.6和8.7倍,是阳性对照松鼠葡萄球菌ami基因启动子片段gusA报道基因表达株活性的5.2和1.3倍,提示插入片段FclpP和FclpP-ΔRS具有较强的启动子活性.结论 成功定位并克隆变异链球菌clpP基因启动子,为今后研究clpP基因上游调控序列提供试验和理论依据.
作者：张加勤；侯香华；张世阳；郑港森；马晓波；赵元勋；黄朝阳；洪国粦 刊期： 2018年第12期
中国人兽共患病学报杂志
主管:中国科学技术协会
主办：中国微生物学会
