学术投稿

小脑基因表达数据的模糊多尺度聚类分析

陈军;潘艳;唐世星;张吉强;刘岭;张彦琦;易东

关键词:多尺度分析, FCM算法, Xie-Beni指数, 聚类, 基因
摘要:目的 为了更好地建立符合生物学意义的基因归类,为一些未知基因的功能提出解释提供参考.方法 首先对小脑组织随机抽取100组预处理后的基因表达数据,对每个由7个时间点所成的基因表达信号做多尺度分析,其次在各个尺度下运用改进的FCM算法设计了一个归类阀值,并利用模糊聚类Xie-Beni指数得到了优聚类数并实现各个尺度下小脑组织基因的聚类,并把每一层对应的聚类结果输出到文本文件,后找出各层聚类结果完全一致的基因进行归类并进行生物学解释.结果 得到的小脑组织基因优聚类数为3类,通过分类结果对照发现,各类中的大多数基因生物学意义接近.结论 运用多尺度分析并结合FCM算法应用于基因聚类是有效的,结果具有一定生物学意义,能对生物学基因聚类及基因功能解释具有一定指导作用.
中国卫生统计杂志相关文献
  • 基于ARCH族模型的海西州地区呼吸道感染发病情况研究

    呼吸道感染是危害人们健康的一种发病率较高的疾病,由于人们生活水平的提高、工作压力的增大和不良的饮食习惯及其他原因,近年来呼吸道感染发病率有增加的趋势.通过建立数学模型,研究呼吸道感染和平均气温之间的相互关系,可以帮助我们更好地认识和及时预防呼吸道感染,有效地降低呼吸道感染对人们的危害,从而保障人们的生活质量.

    作者:马亮亮;田富鹏 刊期: 2011年第03期

  • 2010年某传染病院麻疹病例的流行病学分析

    近年来由于麻疹病毒的基因变异(1),发病率有上升趋势,且患者年龄分布也有所改变,儿童麻疹的发病率大幅下降,而成人麻疹的发病率明显增加,部分患者症状不典型,呈多样性.为了掌握近年来麻疹病学特征分析,本文对2010年沈阳市第六人民医院收治的70例麻疹住院患者的流行病学特征进行分析,现报告如下.

    作者:董捷;董志强;刘翠莲 刊期: 2011年第03期

  • 扫描统计及其在流行病学中的应用

    扫描统计(scan statistic)是空间统计学方法之一,其目的在于探测空间、时间、时空范围内某事件发生数的异常增加,并检验这种改变是否由于随机变异所造成.即探测研究区域内是否存在聚集性、聚集性的确切位置、聚集性的风险大小,并检验聚集性有无统计学意义.疾病的发生与流行常常表现为地域性病例数的增加与减少,地域性病例分布的聚集与消失.

    作者:唐咸艳;周红霞 刊期: 2011年第03期

  • 结构方程模型等同性检验及其在分组比较中的应用

    目的 通过探讨结构方程模型等同性检验方法在分组比较中的应用,说明等同性检验的必要性和重要性.方法 结合抑郁症病例-对照临床研究中特质应对方式量表数据,利用LISREL软件实现各种等同性检验及参数估计.结果 通过等同性考察,证实TCSQ量表在病例-对照研究中具有等同性.结论 对量表测量数据在进行分组比较时,首先须进行各种等同性检验,并在此基础上,进一步进行潜变量均值结构的分析,在此前提下研究结果更可靠.

    作者:武淑琴;张岩波 刊期: 2011年第03期

  • 北京市顺义区居民住院费用及影响因素分析

    目的 分析顺义区居民的住院医疗费用及其影响因素,为改善居民医疗卫生服务提供数据支持与政策建议.方法 使用SPSS统计分析软件对住院医疗费用、自付住院医疗费用等情况进行分析.结果 居民次均住院医疗费用为10 138.44元,人均住院医疗费用613.23元;住院费用影响因素有城乡差异、家庭收入、医疗保障形式、住院地点.结论 弱势人群仍需要得到关注;新农合的保障力度有待于提高;增强卫生机构的服务能力.

    作者:孟琴琴;陈豪;张拓红 刊期: 2011年第03期

  • 1666例肺癌患者直接住院费用构成的因子分析

    目的 探讨肺癌患者住院费用的构成及主要影响因子,为减轻肺癌患者经济负担提供参考.方法 选取某三级肿瘤专科医院2006~2008年1 666例肺癌住院病例,采用因子分析法分析出院病人的各项医疗费用.结果 药费和床位费、手术费、检查费、放射和化验费、治疗费以及护理费是影响肺癌住院费用的六个主要因子.结论 有必要规范肺癌患者的合理用药,优化放化疗和手术治疗方案,减少不必要的检查和化验,以降低住院费用;发展肺癌的早期筛检技术,做到早发现、早治疗.

    作者:高月霞;肖静;吴徐明;陆亚玉;仲亚琴 刊期: 2011年第03期

  • 提高医院统计工作质量促进医院科学管理水平

    随着医院信息化建设的不断发展,医院科学管理已变得更加依赖于数据信息,而高质量的统计信息服务让这一需求得以实现.统计工作的内在质量和统计人员素质的培养状况,势必影响医院管理水平的提高和发展.因此提高统计工作的质量,加强统计信息的利用已成为促进医院科学管理的必要条件之一.

    作者:李向红;高月华 刊期: 2011年第03期

  • SPSS实现析因设计资料单独效应分析的四种方法及比较

    析因设计在医学研究中应用广泛,是一种全面、高效的试验设计方法(1).析因设计的资料可以分析各因素的效应(主效应)和各因素间的交互效应.但若因素间存在交互效应,须逐一分析各因素的单独效应,单独效应是指其他因素的水平固定时,同一因素不同水平间的差别(2).本文探讨SPSS实现析因设计资料单独效应分析的四种方法并对其进行比较,进行单独效应分析的四种方法均是利用总的误差均方作为标准误.

    作者:李悦;朱凯;章志红 刊期: 2011年第03期

  • 新疆H1N1甲型流感疫情预测模型的比较研究

    本文针对2009年9月6日至11月17日新疆的甲流病例数据,用多种统计方法建立了数学模型,通过对几种方法的比较以期得到理想的预测模型,数据来源于政府官方网站.1.甲流病例数据的定性分析反映甲流疫情的指标有每日新增病例数、累积病例数、病死率、累积疑似病例数等.

    作者:胡兴;胡锡健 刊期: 2011年第03期

  • 医学生心理健康影响因素分析

    大学生作为一个深受各界关注的特殊群体,其心理健康状况不容忽视.大学生既要及时调整从中学进入大学后生活学习方式的变化,又面临着将来就业的巨大压力.本文对影响医学生心理健康的因素进行了分析,为促进医学研究生的身心健康和培养良好的心理素质提供依据.

    作者:齐雷涛;刘娜 刊期: 2011年第03期

  • 晚期胃肠肿瘤患者疼痛及生存质量的调查分析

    目的 了解晚期胃肠肿瘤患者的生存质量及癌痛症状,以及两者之间的关系.方法 对某宁养院2008、2009年收治的居家宁养的晚期胃癌、结肠癌和直肠癌的患者进行调查.应用癌痛NRS计分法测定患者的疼痛程度,专门的晚期肿瘤患者生存质量量表评价患者的生存质量.结果 晚期胃肠肿瘤患者的疼痛症状普遍比较严重,其中81.76%的患者表现为重度疼痛;患者的生存质量状况普遍较差,生存质量总分平均得分仅28.03.患者的生存质量评分和疼痛计分在不同肿瘤间差异无统计学意义.患者疼痛症状越严重,其生存质量越差.结论 关注和提高患者的生存质量,是晚期胃肠肿瘤患者的姑息治疗的主要内容.缓解患者的癌痛症状,可有效提高其生存质量.

    作者:郭海强;王玉梅;孙建纯 刊期: 2011年第03期

  • 尘肺患者生活质量的相关因素研究

    目的 探讨影响尘肺患者生活质量的相关因素.方法 采用整群抽样的方法在2008年1月至7月间随机抽取广东省3家职业病专科医院和2家慢病站的174例男性尘肺患者进行问卷调查.数据分析采用Spearman相关分析和多重线性回归分析.结果 Spearman相关分析显示焦虑、抑郁和消极应对与WHO生存质量评估简表的各领域呈负相关,与St.George's呼吸问卷各维度测得分值呈正相关(P<0.05);积极应对、家庭支持、朋友支持、其他支持、社会支持与WHO生存质量评估简表的各领域呈正相关,与St.George's呼吸问卷各维度测得分值呈负相关(P<0.05).多重线性回归分析结果表明,尘肺患者生活质量与其心理健康水平、应对方式、社会支持有关.结论 焦虑、抑郁、消极应对是影响尘肺患者生活质量的危险因素,而积极应对和社会支持是其的保护因素.

    作者:邱新香;郝元涛;梁智平;肖素娟;吴秀芳;陈慈珊;林爱华 刊期: 2011年第03期

  • 疾病筛查方法和策略的计量评价研究

    目的 从成本效果、成本效用角度评价疾病的筛查方法和筛查策略.方法 以宫颈癌筛查为例,用VIA/VILI方法模拟对10万名妇女分别终身筛查一次,每1年、3年、5年、10年筛查一次,利用Markov模型预测从现在开始至20年后的宫颈癌的患病率与死亡率,增加的QALY、减少的DALY等.结果 用VIA/VILI方法筛查在20年内可以降低宫颈癌的患病率以及死亡率.即使每1年筛查一次,增加1个QALY的费用仅为532元,减少1个DALY的费用为490元.每3年和每5年筛查一次增加1个QALY的费用相差不大,分别为223元和221元,减少1个DALY的费用都为208元.结论 VIA/VILI方法筛查宫颈癌具有较好的成本效果和效用,在经济不发达地区每3~5年筛查一次,效果较好.

    作者:李国荣;乔友林;马莉;唐晓;宁岩;刘启贵;魏文强 刊期: 2011年第03期

  • 某市手足口病发病数预测三种方法比较

    手足口病是由肠道病毒引起的传染病,该病传染性强,可在短时间内造成较大规模流行(1),常在托幼机构聚集发病.手足口病自2008年5月2日被列入法定丙类传染病管理以来,发病呈上升趋势(2),成为影响儿童健康的主要传染病之一.准确、科学的预测手足口病未来的发病趋势,对制定科学的防治规划,争取佳防治效果极其重要.本文用时间序列模型、多元线性回归模型及BP人工神经网络模型,根据某市2008年5月至2009年5月手足口病发病资料对其发病趋势作预测分析,并比较三种方法的预测精确度,以便寻求预测手足口病发病趋势的佳方法.

    作者:安庆玉;周毅恒;姚伟 刊期: 2011年第03期

  • TOPSIS法与RSR法相结合评价某院单病种医疗质量

    本文采用Topsis法和RSR法相结合,对某院2008年16个常见病种进行统计分析,现报告如下:资料来源与指标选择资料来源于2008年1月1日~12月31日某二甲医院4 680份出院病历,占该院年度出院病历36.55%.依据病种可比性原则, 挑选了常见病、多发病且诊疗技术成熟、治疗效果可靠、较少合并症的16个病种,各病种病例均在60例以上,出院诊断均按ICD-10进行分类.

    作者:于蓓 刊期: 2011年第03期

  • 2003~2008年我院住院死亡病例统计分析

    目的 对2003~2008年我院住院死亡病例进行统计分析,以初步了解其分布特征和变化趋势,为临床医师加强技能培训提供方向,为我院可持续发展提供依据.方法 以所有死亡病例病案首页相关数据为研究对象,利用Excel进行统计分析,以病例第一诊断的ICD-10编码进行死因统计,并按年度、年龄和性别进一步分组分析.结果 6年来,我院死亡病例共计2 619例,病死率为1.61%.从死因顺位看,恶性肿瘤、循环系统疾病和呼吸系统疾病为前三位死因,由此死亡的病例约占所有死亡病例的4/5.进一步分析后不同年龄组病例死因构成明显不同.结论 为降低病死率,我院可针对恶性肿瘤、心脑血管疾病等采取有效措施,开展多样化、多层次健康管理工作,提高应对危急重症的能力等.

    作者:杨晓蓉;秦文敏 刊期: 2011年第03期

  • 亚健康状态评价问卷(SHSQ-25)判定标准的制定

    目的 探讨亚健康状态评价问卷(SHSQ-25)的判定标准.方法 采用多元线性逐步回归分析亚健康状况的影响因素,并按其主要影响因素的低危水平筛选亚健康低危人群,根据该人群亚健康问卷得分的分布情况制定判定标准.结果 以对亚健康状况得分影响有统计学意义的5个主要因素的低危水平为标准,包括:工作中竞争情况、是否接受超出能力的工作、是否参加体育锻炼、是否有可以谈心的朋友和工作时能否进行短暂的休息,筛选出亚健康状态的低危人群共437例,以该人群的单侧P90上限35分(≥35分)作为亚健康状态的判定标准.调查人群中亚健康状态现患率为67.5%,不同性别、年龄和职业类型人群之间的现患率存在统计学差别(P<0.001).结论 工作压力、不良的人际关系和缺乏体育锻炼是引发亚健康状态的主要因素,以其低危水平制定亚健康问卷的判定标准是合理的.

    作者:闫宇翔;董晶;李蔓;杨姗姗;王嵬 刊期: 2011年第03期

  • 新型农村合作医疗测评体系及应用

    通过分析影响我国新型农村合作医疗的主要因素,建立了新农合满意度测评体系.分别运用模糊评判法和马尔柯夫链可对新农合满意度状态进行评价与动态分析,实证研究说明测评体系与评价方法的实用性.引言新型农村合作医疗(新农合)是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度,在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用.

    作者:蒋辉;邓晓东 刊期: 2011年第03期

  • 不同地区已婚育龄妇女生殖道感染及其多水平影响因素分析

    目的 了解我国中等发达地区已婚育龄妇女的生殖道感染(RTI)状况、分布及相关影响因素,探讨相应的预防措施和策略.方法 按省、县、乡、村分层整群抽样方法在我国中等发达的9个省市进行抽样,调查样本点全部家庭及20~49岁已婚育龄妇女,了解她们家庭居住和生活状况、个人特征以及生殖健康状况.以对象自报的生殖道感染(RTI)症状为分析指标,进行单因素和多水平logistic回归分析.结果 在被访的12426名妇女中,28.5%过去一年曾出现RTI症状,以外阴瘙痒和阴道异味分泌物报告率高.农村、年龄偏大、文化程度低、务农、绝育妇女、家庭卫生条件差、个人卫生习惯差的对象RTI发病率较高.不同地区之间,华中、西南地区RTI发病率高于其他地区.结论 农村已婚妇女RTI感染率较高,且不同地区、不同特征妇女存在较大差异.女性RTI防治重点在农村、高龄、文化低、家庭卫生条件差及个人卫生习惯差的对象.

    作者:徐倩倩;胡云;俞华;蔡建华;张妍;周维谨;车焱 刊期: 2011年第03期

  • 列联表资料的关联强度

    目的 探究行列数为2-4的各列联表Pearson列联系数的分布及其与相关系数的关系.方法 采用SAS 9.1.3软件模拟行列数分别为2-4,且行合计固定的各种列联表,计算相关系数和列联系数,绘制两者的散点图,描述其取值变化关系.结果 2×2列联表的相关系数和列联系数成曲线相关,但是其他情况下相关系数和列联系数的关系并非一一对应,此时通过相关系数划分列联系数的关联强度是不合适的.结论 对于2×2列联表,可以通过相关系数的强度范围近似定义列联系数的强度范围.当行列数多于2时,不能根据相关系数的强度范围定义列联系数的强度范围.

    作者:薛允莲;姜世强;刘贵浩;张晋昕 刊期: 2011年第03期

中国卫生统计杂志

中国卫生统计杂志

主管:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会

主办:中国卫生信息学会 中国医科大学