学术投稿

PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达microRNAs潜在作用通路的生物信息学分析

麦仲伦;姜茂竹;曾融;吴钢;郑燕芳;张积仁

关键词:乳腺癌, 孕激素受体, microRNAs, 生物信息学
摘要:目的 通过对乳腺癌中与孕激素受体(PR)状态相关的microRNAs差异表达谱进行生物信息学分析,探讨microRNAs在PR表达状态中可能参与的调控机制,为深入研究乳腺癌不同分子亚型的分化提供新思路.方法 利用文献挖掘方法找到与PR状态相关的microRNAs差异表达数据集,然后利用生物信息学方法(Targetscan软件和DAVID数据库)预测microRNAs的靶基因,再对靶基因进行基因本体论(GO)富集和通路分析.结果 通过文献挖掘找到3个差异表达microRNAs数据集,生物信息学分析获得3个相应靶基因集和1个靶基因合集.靶基因的GO分类主要涉及细胞内的信号级联、蛋白氨基酸磷酸化、蛋白质甲基转移酶活性及转录因子活性等生物学过程及分子功能.通路分析发现3条KEGG信号通路和3条BIOCARTA代谢通路可能参与不同PR表达状态的调节.结论 通过生物信息学方法,初步分析了microRNAs在不同PR表达状态中可能参与调控的信号和代谢通路,为进一步探索microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化的调控机制奠定基础.
热带医学杂志相关文献
  • 十堰地区铜绿假单胞菌流行趋势及耐药性变迁

    目的 调查十堰地区某教学医院铜绿假单胞菌流行趋势和耐药变化趋势,为指导临床合理使用抗菌药物提供参考.方法 运用WHONTE 5.5软件分析2001-2011年2 839株医院感染铜绿假单胞菌的药敏结果,Cox-Staurt趋势检验分析医院感染铜绿假单胞菌检出率和耐药趋势.结果 2001-2011年铜绿假单胞菌的检出率呈上升的趋势,常见分离标本为痰和外伤分泌物.铜绿假单胞菌仅对头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南的耐药率小于30%,对其他抗菌药物的耐药率均较高.Cox-Staurt趋势检验分析显示,医院感染铜绿假单胞菌对头孢噻肟、头孢他啶、氨曲南、阿米卡星、庆大霉素、环丙沙星、亚胺培南和哌拉西林耐药率呈上升趋势(P<0.05),而对复方新诺明、氯霉素和头孢哌酮/舒巴坦耐药率未见升高趋势.结论 铜绿假单胞菌引起的医院感染越来越严重,其临床分离率高,且对多种药物的耐药率呈上升趋势,应加强细菌耐药性监测和抗菌谱分析,以控制耐药菌株.

    作者:张昭勇;张吉才;吕军;娄国平;王元元 刊期: 2013年第01期

  • 骨折患者医院感染临床特征和风险因素分析

    目的 了解基层医院内骨折患者感染情况,探讨骨科住院患者医院感染的相关因素,从而降低感染率.方法 于2009-2010年共收集骨折患者719例,进行细菌培养鉴定,并对检出的病原菌按照K-B法进行药敏试验,同时收集患者的一般信息.结果 骨折患者719例中发生医院感染56例,感染率为7.79%.其中革兰阳性球菌23株(41.07%),主要包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肠球菌等;革兰阴性杆菌33株(58.93%),主要包括大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌等.药敏结果显示革兰阳性菌和阴性菌均对青霉素类抗生素耐药率较高.万古霉素和亚胺培南分别是革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌敏感性较高的抗菌药物.骨科感染的发生与骨折类型、住院时间、年龄、围手术期抗菌药物使用以及是否有基础疾病有明显关系(P<0.05).结论 骨折患者感染与多种因素相关,应采取积极有效的措施以及合理应用抗生素药物,从而降低骨科患者感染的发生.

    作者:王占武 刊期: 2013年第01期

  • 原发性肝癌血行转移与乙肝病毒的相关性研究

    目的 探讨原发性肝癌患者血行转移与乙肝病毒感染之间的关系.方法 检测原发性肝癌患者HBV感染标志物(HBV-M)和HBV-DNA的结果,比较其与血行转移的关系.结果 125例原发性肝癌患者中HBV感染96例,占76.8%.96例HBV感染阳性的原发性肝癌患者中,发生血管内转移者65例(67.7%),HBV感染阴性的原发性肝癌患者29例,发生血管内转移者8例(27.6%),HBV感染阳性的患者血行转移率明显高于HBV感染阴性患者(P<0.01).结论 乙肝病毒的感染和复制与原发性肝癌的发生和血行转移密切相关.

    作者:曾颖玲;毛惠南 刊期: 2013年第01期

  • 64例Ⅳ期上皮性卵巢癌的临床分析

    目的 研究Ⅳ期上皮性卵巢癌的临床病理特征及预后影响因素,为Ⅳ期上皮性卵巢癌的治疗提供参考.方法 回顾性分析1997年1月至2009年12月中山大学肿瘤医院收治的经手术及病理确诊为Ⅳ期上皮性卵巢癌患者共64例的临床病例资料及随访资料,其中32例患者直接行手术治疗(PDS),32例患者先行新辅助化疗(NACT),再接受中间性肿瘤细胞术(IDS).分析各临床病理因素及治疗方法对预后的影响.结果 未发现年龄、治疗前CA125水平、病理类型、肿瘤分化程度、原发肿瘤大小、转移类型、是否新辅助化疗及手术满意程度等与总生存时间相关(P>0.05).仅因胸水细胞学阳性诊断为Ⅳ期的患者行新辅助化疗+中间性肿瘤细胞减灭术者总生存时间中位数较直接行手术治疗者长39个月(P=0.020).新辅助化疗与手术的满意程度相关(P<0.001).结论 在经过评估无法行满意的肿瘤减灭术的患者,新辅助化疗+中间性肿瘤细胞减灭术可考虑成为Ⅳ期卵巢癌治疗的选择之一.

    作者:黄绮丹;黄鹤;刘继红 刊期: 2013年第01期

  • 中药面膜联合胶原贴辅助治疗面部激素依赖性皮炎疗效观察

    目的 观察中药面膜联合胶原贴辅助治疗面部激素依赖性皮炎的临床疗效.方法 98例患者随机分成两组,治疗组50例,对照组48例.所有患者均口服氯雷他定片,对照组给予胶原贴敷料外敷,每晚1次,连续使用2周,以后1次/2 d;治疗组在上述治疗基础上加用中药面膜,第1周1次/d,第2周后1次/2 d.共4周.结果 治疗后,两组主观指标、客观指标及临床症状总积分均明显下降,治疗组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).且两组患者的症状、体征均有不同程度的好转,治疗组有效率为82.0%,对照组有效率为64.6%,差异有统计学意义(P<0.05).结论 中药面膜联合胶原贴辅助治疗面部激素依赖性皮炎安全、有效.

    作者:邹凌云;宋英;王秀霞;马小鹏 刊期: 2013年第01期

  • 女性冠心病患者高密度脂蛋白亚组分的检测及临床意义

    目的 研究女性冠心病患者高密度脂蛋白(HDL)亚组分及相对含量的变化并分析其临床意义.方法 采用双相电泳-免疫印迹法分析78例女性冠心病患者(观察组)及82例女性非冠心病组(对照组)血清HDL各亚组分的含量.结果 观察组血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、LDL-C/HDL-C的值明显高于对照组,而HDL-C明显低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.01);女性冠心病患者血清中Preβ 1-HDL、HDL-3b、HDL-3c水平显著高于对照组,差异有统计学意义(P均<0.05),而HDL-2b水平显著低于对照组(P<0.05).结论 女性冠心病患者血清中,HDL颗粒有变小的趋势,HDL-2b预测冠心病的可能性更高.

    作者:肖华;陈英;姚振国 刊期: 2013年第01期

  • 香港地区流行性腮腺炎月发病例数SARIMA模型预测分析

    目的 研究季节性差分自回归滑动平均模型(SARIMA)拟合季节时间序列的方法,并将其应用于预测香港流行性腮腺炎疫情趋势.方法 利用R软件对2000年1月至2012年8月香港流行性腮腺炎月发病例数资料进行建模,用所构建模型进行预测分析.结果 流行性腮腺炎发病呈上升趋势,SARIMA(2,1,1)×(1,1,1)12模型较好地拟合了香港流行性腮腺炎的月发病例数,模型残差为白噪声序列,回代考核平均相对误差为17.5%;后8个月的数据作为前瞻性预测考核,平均相对误差为16.4%.结论 SARIMA模型较好地模拟腮腺炎的流行特征,并进行中、短期预测.

    作者:徐燕;阎玉霞;韩剑锋;陈平雁 刊期: 2013年第01期

  • 香港海鸥形菌TaqMan-MGB探针实时荧光PCR的建立与应用

    目的 建立快速、灵敏、特异的香港海鸥形菌TaqMan-MGB探针实时荧光PCR体系,用于食源性致病菌监测和淡水鱼产品贸易往来的快速检测.方法 根据GenBank公布的香港海鸥形菌16S rRNA基因高保守序列,设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立和优化快速检测体系,评价反应体系的特异性、灵敏度、重复性,并在淡水鱼类、急性胃肠炎腹泻患者标本中临床应用,结合细菌分离方法和序列测定分析进行验证.结果 建立的香港海鸥形菌TaqMan-MGB探针实时荧光PCR反应体系检测时限短,仅40 min就可出结果,特异性好,与沙门氏菌、志贺氏菌、副溶血弧菌等非目标菌无交叉反应,灵敏度高,检测下限达10拷贝/反应,稳定性好,同一浓度阳性质粒进行16次重复检测的Ct值变异系数0.183%.92份淡水鱼及211份医院急性胃肠炎腹泻标本实时荧光PCR与常规细菌分离结果完全一致,均检出了12株香港海鸥形菌,16S rRNA测序结果显示与HKU1株同源性在99.5%以上,进一步验证了实时荧光PCR的特异性.结论 本研究建立的香港海鸥形菌TaqMan-MGB探针实时荧光PCR反应体系快速、特异、灵敏,在防止食源性疾病的传播和加快贸易通关速度方面,具有较强的的应用价值.

    作者:谭翰清;谭海芳;林凤;丁丽娜;程洁萍;朱颖梅;苏乐斌;陈华 刊期: 2013年第01期

  • 槲皮素抗肿瘤机制的研究进展

    槲皮素是一种存在于水果、蔬菜等天然植物中的黄酮类化合物,具有多种药理作用,如抗氧化作用、抗炎作用、抗纤维化作用、抗肿瘤作用、抗病毒作用等.目前越来越多的学者致力于槲皮素的研究.本文就近年来槲皮素抗肿瘤作用的分子机制研究及其过量时的副作用作一综述.

    作者:王惠丽;胡子有;苑召虎;吴炳义 刊期: 2013年第01期

  • 广州增城市2011年手足口病流行病学分析

    目的 了解增城市手足口病流行病学特征和流行因素,探讨防制对策.方法 对2011年国家疾病监测信息管理系统监测的2011年增城市手足口病发病情况进行流行病学的描述性分析,采用SPSS13.0软件进行统计分析.结果 增城市共报告手足口病5 327例,其中重症病例3例,无死亡病例;发病范围广,人口密集且流动性大的新塘镇发病率为257.77/10万,城区发病率高于农村(x2=9.414,P<0.01);发病季节性明显,发病高峰主要集中在5-7月;发病人群主要为散居儿童,以6岁以下儿童为主(占98.89%),其中0~6岁和6~22岁两个年龄段发病率比较差异有统计学意义(P<0.01),男性发病率显著高于女性(x2=252.186,P<0.01);检出病原体以人肠道病毒71型(EV71)为主.结论 手足口病发病与年龄、季节有关,发病主要致病菌为EV71;人群的健康教育和相关的预防措施将有助于更好的预防手足口病.

    作者:郑丽琼;黎金祥;萧炯尧;唐侍豪;孟晓静 刊期: 2013年第01期

  • PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达microRNAs潜在作用通路的生物信息学分析

    目的 通过对乳腺癌中与孕激素受体(PR)状态相关的microRNAs差异表达谱进行生物信息学分析,探讨microRNAs在PR表达状态中可能参与的调控机制,为深入研究乳腺癌不同分子亚型的分化提供新思路.方法 利用文献挖掘方法找到与PR状态相关的microRNAs差异表达数据集,然后利用生物信息学方法(Targetscan软件和DAVID数据库)预测microRNAs的靶基因,再对靶基因进行基因本体论(GO)富集和通路分析.结果 通过文献挖掘找到3个差异表达microRNAs数据集,生物信息学分析获得3个相应靶基因集和1个靶基因合集.靶基因的GO分类主要涉及细胞内的信号级联、蛋白氨基酸磷酸化、蛋白质甲基转移酶活性及转录因子活性等生物学过程及分子功能.通路分析发现3条KEGG信号通路和3条BIOCARTA代谢通路可能参与不同PR表达状态的调节.结论 通过生物信息学方法,初步分析了microRNAs在不同PR表达状态中可能参与调控的信号和代谢通路,为进一步探索microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化的调控机制奠定基础.

    作者:麦仲伦;姜茂竹;曾融;吴钢;郑燕芳;张积仁 刊期: 2013年第01期

  • 湖沼型疫区沟渠反复药物灭钉螺效果观察

    目的 观察湖沼型疫区沟渠反复药物灭钉螺效果,为制定防治对策提供科学依据.方法 选择有感染性钉螺分布的灌渠1条,采用50%氯硝柳胺乙醇胺盐可湿性粉剂2 g/m2喷洒法反复实施药物灭螺,每次药物灭螺后采用系统抽样方法进行近期(14 d)和远期(30~90 d)效果现场考核,观察钉螺死亡率、螺口密度和感染性钉螺变化情况.结果 4次药物灭螺,近期效果考核钉螺死亡率在87.35%~90.48%之间,校正死亡率分别87.29%、84.69%、88.74%、88.47%,与灭前比较,差异有统计学意义(x2=302.14、430.00、241.83、61.07,P均<0.01);活螺平均密度下降率分别为94.35%、85.48%、91.94%、94.35%;未发现感染性钉螺.3次远期效果考核钉螺死亡率在4.76%~23.33%之间,与灭前比较无差异;活螺平均密度下降率分别为35.48%、29.84%、50.87%;后2次未发现感染性钉螺.结论 反复药物灭螺对控制感染性钉螺作用明显,但对年度钉螺螺口消长作用有限.

    作者:苏文;苏尚洋;任晓晴;蒋世福;张道颖;何亮才 刊期: 2013年第01期

  • 短时受精在体外受精-胚胎移植治疗周期中的应用价值

    目的 比较体外受精-胚胎移植(IVF-ET)治疗中精卵孵育不同时间对胚胎质量的影响.方法 按精卵共孵育时间不同将280个周期采集到的卵子3 342枚随机分为短时受精组(A组,精卵共同孵育4~6 h后随机选取1/2数量卵子脱颗粒细胞)、长受精组(B组,所剩1/2数量卵子,精卵孵育过夜).分别比较两组的受精率、多精受精率、卵裂率、优质胚胎率、临床妊娠率和胚胎种植率.结果 两组的受精率、多精受精率和卵裂率比较差异无统计学意义(P>0.05);A组的优质胚胎率、临床妊娠率和胚胎种植率显著高于B组(P<0.05).结论 缩短精卵孵育时间不影响受精率及卵裂率,相反能提高胚胎质量,从而提高临床妊娠率.

    作者:李宜学;田喜凤;王晓波;郭全;樊桂玲;刘娜 刊期: 2013年第01期

  • 广州市医院成人病毒性腹泻的分子流行病学研究

    目的 了解广州市医院门诊成人病毒性腹泻的感染情况和分子流行病学特征.方法 2011年6月至2012年5月在广州市两家哨点医院收集门诊18岁以上腹泻患者粪便标本127份.采用酶联免疫技术检测A群轮状病毒,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测粪便标本中的诺如病毒、星状病毒和札幌病毒,聚合酶链反应(PCR)检测腺病毒.结果 共127份腹泻患者粪便标本,其中男性占54.33%(69/127),女性占45.67%(58/127),年龄以60岁以上所占比例高,为25%(7/28).127份粪便标本中,单一腹泻病毒感染25份,阳性率19.69%,其中检出轮状病毒阳性7份,阳性率5.52%(7/127);诺如病毒阳性11份,阳性率8.66%(11/127);札幌病毒3份,腺病毒阳性3份,阳性率均为2.36%(3/127);星状病毒1份,阳性率0.79%(1/127).未见混合感染,发病具有明显的秋冬季节升高现象,诺如病毒、札幌病毒、腺病毒、星状病毒流行株为别为GⅡ-4型、GⅠ-2型、AD41和HAstV-1.结论 医院就诊成人腹泻病例中约1/4为病毒性腹泻,其中诺如病毒是重要的病原体,感染对象主要是60岁以上人群.

    作者:胡婷婷;罗敏红;冀新凤;陈惠芳;姚月娴;黄燕惠;陈清;俞守义 刊期: 2013年第01期

  • 反复自然流产患者外周血中CD4+CD25+ Treg细胞、IL-8和IL-10的表达

    目的 对反复自然流产患者外周血CD4+CD25+调节性T细胞(CD4+CD25+Treg)百分率和IL-8、IL-10含量变化及可能产生的作用进行探讨.方法 采用三色流式细胞术检测120例反复自然流产患者、120名正常妊娠妇女和120名正常非妊娠妇女外周血中CD4+CD25+ Treg细胞比例,ELISA法检测上述研究对象IL-8和IL-10含量.结果 反复自然流产组妇女外周血CD4+CD25+Treg细胞的百分率和IL-10水平明显低于正常非妊娠组和正常妊娠组,而IL-8明显高于正常非妊娠组和正常妊娠组,差异均有统计学意义(P均<0.05).结论 外周血CD4+CD25+Treg细胞、IL-8和IL-10水平与反复自然流产的发生有关.

    作者:王振荣;刘娜;王晓波;李宜学;陈小君 刊期: 2013年第01期

  • 寄生原虫microRNA研究进展

    miRNA是一类非常重要的非编码小分子,作为RNA干扰(RNAi)中的一个重要元件能够在生物体中通过对mRNA表达的控制在转录后水平上对调节众多基因起到负调控作用.在研究多个物种microRNA的功能时,人们发现miRNA的表达具有时序性和组织特异性,提示其在特定功能基因的表达方面可能发挥着重要的调控作用.本文就miRNA的研究进展作一综述.

    作者:梅妹;孙喜东;王洁琳;宫鹏涛;陈启军;姜宁 刊期: 2013年第01期

  • 深圳市宝安区2007-2011年流行性腮腺炎分析

    目的 掌握深圳市宝安区流行性腮腺炎流行特征,为制定防制措施及评价防制效果提供科学依据.方法 采用描述流行病学方法分析深圳市宝安区流行性腮腺炎疫情资料.结果 2007-2011年流行性腮腺炎平均报告发病率为25.74/10万,发病高峰在5-7月,占全年总发病数的44.53%;男性年均报告发病率为35.77/10万,女性为17.46/10万,差异有统计学意义(P<0.01);学生和儿童发病分别占全部报告发病数的34.79%、45.34%; 3~15岁年龄组发病占全部报告发病的79.45%,呈典型的儿童和少年发病高峰.结论 宝安区流行性腮腺炎发病呈逐年上升趋势,防控应以中小学校学生和幼托及散居儿童为主.

    作者:任海燕;熊田甜;刘洁媛;吴泰顺;马智超 刊期: 2013年第01期

  • 丙型肝炎病毒感染与2型糖尿病发病关系的研究

    目的 通过调查2型糖尿病患者中丙型肝炎病毒抗体(抗-HCV)的流行情况,探索HCV感染是否为2型糖尿病发病的危险因素.方法 采用酶联免疫法(ELISA)对710例2型糖尿病患者与696例非糖尿病者(对照组)的血清进行抗-HCV检测,并进行比较.结果 2型糖尿病组的抗-HCV阳性率(3.10%)明显高于对照组的阳性率(1.29%),两者比较差异有统计学意义(x2=5.313,P<0.05).但在所有年龄组中,只有60~69岁年龄组中两者比较差异有统计学意义(x2=6.891,P<0.01).2型糖尿病组与对照组之间比值比(OR)为2.44(95%CI l.14-5.21).结论 HCV感染可能是2型糖尿病发病的危险因素之一.

    作者:韦艳妮;梁能秀;苏齐鉴;徐斌;何晓;徐世民;谢志春 刊期: 2013年第01期

  • 食道鳞状上皮细胞癌转移体外细胞模型的建立

    目的 建立一个适宜的食道鳞状上皮细胞癌(ESCC)体外转移研究模型.方法 将ESCC细胞系HK2置于未处理细胞培养皿中培养、传代,筛选出具有非锚定依赖生长能力的细胞株.以体外侵袭实验,软琼脂克隆形成实验比较、验证筛选细胞系与母代细胞的侵袭能力和非锚定依赖生长能力.利用比较蛋白质学的方法分析筛选细胞与母代细胞间的蛋白表达图谱差异.结果 成功筛选出具有较高转移能力并可传代培养的HK2-AD细胞株.HK2和HK2-AD细胞侵袭至小室膜反侧的细胞数分别为(16.7±2.5)和(28.7±7.4),软琼脂集落生成实验表明,HK2和HK2-AD细胞形成的集落数分别为(16.8±3.2)和(25±5.1),差异均有统计学意义(P<0.05).HK2-AD细胞中一些与细胞运动、细胞无氧代谢及抑制凋亡相关的蛋白质分子表达明显上调.结论 利用肿瘤细胞的非锚定依赖生长特性建立了一个高转移能力、呈三维生长的HK2-AD细胞株,为ESCC肿瘤转移机制研究和药物筛选提供了一个有价值且易于操作的食道癌转移体外细胞模型.

    作者:蔡贞;周园;温淑娟;谷祯梅;裘宇容 刊期: 2013年第01期

  • 儿童腹型过敏性紫癜胃肠道损害的彩超与胃镜表现

    目的 探讨腹部彩超与胃镜检查对儿童腹型过敏性紫癜的胃肠道损害的诊断价值.方法 结合临床特点回顾性分析126例腹型过敏性紫癜患儿腹部彩超及胃镜检查结果.结果 126例患儿均有腹痛,有或无伴阵发性加重,腹痛可出现皮肤紫癜前(n=22)、紫癜中(n=54)、紫癜后(n=50).腹痛重而体征较轻微,腹部部位不固定.腹痛较轻者腹部超声多无阳性表现,腹痛持续或伴阵发性加重者腹部超声表现为病变部位肠管壁节段性水肿,血流增加,严重者可发现肠套叠、肠梗阻或肠坏死.胃镜下均有不同程度胃肠粘膜病理改变,包括胃肠粘膜充血、糜烂、点状出血及多发性溃疡.结论 腹部彩超及胃镜检查对儿童腹型过敏性紫癜有早期诊断价值.

    作者:梁燕;周惠梅;魏青;梁文青 刊期: 2013年第01期

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