RNA-Seq在老年神经退行性疾病研究中的应用

刘小利；严静

关键词：阿尔茨海默病, 帕金森病, 神经退行性疾病, RNA-seq, 差异表达基因, 可变剪接, IncRNA, miRNA

摘要：阿尔茨海默病及帕金森病是老年人常见的两种神经退行性疾病,但其发病机制及治疗是研究的热点.随着高通量测序技术的进步及成本的下降,RNA-Seq也成为神经退行性疾病机制研究及生物标志物发现的有力手段.RNA-Seq相对于microarray具有高灵敏度、高准确性、高重复性以及噪声低等优势,在阿尔茨海默病及帕金森病研究中有较为广泛的应用,包括检测差异表达基因,可变剪接、新长链非编码RNA预测分析和miRNAs调控等,但是容易受病理复杂性及样本等因素影响.目前阿尔茨海默病及帕金森病转录组研究相比于癌症等还不够深入,在临床诊断及治疗应用还面临较大挑战.但是随着新技术及新方法的发展,RNA-Seq将进一步推动神经退行性相关疾病的研究和临床转化.

中华老年病研究电子杂志相关文献

胃黏膜防御-修复机制相关生物活性因子水平的增龄变化

目的探讨老化对胃黏膜防御-修复机制相关生物活性因子的影响.方法选择2012年6月至12月因胃间质瘤、良性幽门梗阻、早期胃癌在复旦大学附属华东医院拟行手术治疗的36例患者为研究对象,其中中青年(20~59岁)患者14例(中青年组),老年(60~89岁)患者22例(老年组;60~69岁者8例,70~79岁者6例,80~89岁者8例).在胃手术标本离体后,取远离病灶(距病灶≥5 cm)的新鲜正常胃窦黏膜组织,经组织学检查证实为正常黏膜或仅有浅表炎症后,TBA法测定胃黏膜组织内丙二醛(malondialdehyde,MDA)水平,Elisa法测定胃黏膜组织内表皮细胞生长因子(epidermal growth factor,EGF)、Caspase-3、Caspase-9、前列腺素(prostaglandin,PGs)E2(prostaglandin E2,PGE2)、降钙素基因相关肽(calcitonin gene related peptide,CGRP)水平,并比较各年龄段各相关生物活性因子的变化.多组间比较采用Kruskal-Wallis H检验,两组间比较采用Wilcoxon秩和检验.结果与中青年组比较,老年组胃窦黏膜组织中MDA、EGF及Caspase-3水平的差异均无统计学意义(z=-1.785、-0.681、-0.049,均P>0.05);而Caspase-9、PGE2及CGRP水平均明显下降,差异均有统计学意义(z=-1.493、-1.038、-1.103,P<0.05或≤0.01).中青年组及60~69岁、70~79岁、80~89岁老年患者胃黏膜组织中MDA及Caspase-3水平的差异均无统计学意义(H=5.004、0.686,均P>0.05);而4组间EGF、Caspase-9、PGE2、CGRP水平的变化则较明显,差异均有统计学意义(H=6.521、4.306、8.531、10.710,P<0.05或P=0.01).其中80~89岁老年组胃黏膜组织中EGF、Caspase-9、PGE2、CGRP水平均较中青年组明显下降,差异有统计学意义(z=-1.681、-1.493、-1.438、-1.103,P<0.05或≤0.01).结论胃黏膜防御-修复机制的老化可能是多因素、多环节相互作用的结果 .

作者：陈敏敏；郑松柏；塞力思刊期： 2016年第04期
美容心理评估与干预抗衰老规范化指南

老化是人体功能衰退的外部显而易见的变化,而内在心理的衰老却是观察不到的,并且心理老化与身体面容的老化不同,并非增龄的结果,它不是老年人所必有的心理,老年人也可以人老而心不老.人到老年依然可以拥有一颗年轻的心,而年轻人也可能在心理上出现未老先衰的现象.老化的心理会加速人体生理老化过程.

作者：中国整形美容协会抗衰老分会刊期： 2016年第04期
基于能力评估的城市养老机构入住老年人服务需求调查

目的了解城市养老机构入住的不同能力等级老年人对不同服务的需求程度.方法选取全国9个省的18家养老机构中的674名老年人作为调查对象,根据行业标准《老年人能力评估》评定其能力等级,通过自行设计的《养老机构入住老年人服务需求调查表》调查其相关需求情况,并对不同能力等级老年人的不同服务需求(包括日常生活照料服务、医疗健康服务、休闲娱乐服务、心理慰藉服务)进行比较分析.多组间需求评分的比较采用方差分析.结果 674例被调查者中以70~89岁(82.2%)、无配偶(61.3%)、自费入住(86.8%)的老年人为主,入住养老机构的主要原因(占58.9%)是子女亲属无时间照顾.日常生活照料服务、医疗健康服务、心理慰藉指导服务需求得分均随老年人身体受损程度的加重而逐渐上升,休闲娱乐服务需求得分明显下降,差异均有统计学意义(F=177.546、11.269、4.484、10.097,均P<0.01).不同能力等级老年人所有日常生活照料服务各子项(穿衣服务、修饰服务、口腔清洁、饮食照料、排泄护理、皮肤清洁护理、压疮预防、膳食服务、清洁服务、洗涤服务、帮助购物、房间布置与装扮)的需求得分均随老年人身体受损程度的加重逐渐上升(F=150.468、123.718、129.496、78.739、138.319、160.589,均P<0.01).在医疗健康服务项目中除健康教育和中医保健服务外,不同能力等级老年人其余各子项(定期健康体检服务、健康指导和督促服务、健康教育服务、基础护理服务、中医保健服务、诊断治疗服务、康复训练服务、安全用药指导)的需求得分均随老年人身体受损程度的加重逐渐上升(F=8.648、7.948、13.009、10.388、7.703、16.342,均P<0.01).不同能力等级老年人休闲娱乐服务项目各子项(文化类娱乐活动、体育类娱乐活动、娱乐活动的提供或指导)的需求得分均随老年人身体受损程度加重明显下降(F=3.287、16.570、4.127,均P<0.05或0.01),心理慰藉服务项目中增加探视次数的需求得分的差异有统计学意义(F=7.198,P<0.01).老年人能力等级与日常生活照料服务、医疗健康服务及心理慰藉服务需求均呈正相关(r=0.606、0.214、0.108,均P<0.01),与休闲娱乐服务需求呈负相关(r=-0.197,P<0.01).结论城市养老机构入住老年人身体能力等级与日常生活照料服务、医疗健康服务、休闲娱乐服务的需求程度存在相关性且不同等级间需求差异明显,养老机构应重视老年人能力评估工作,并依据相应需求科学开展功能区域划分、照护方案制定、个性服务提供等工作.

作者：楼正渊；冯晓丽；徐璟；徐肖楠；张雪妮；郭清刊期： 2016年第04期
运动医学抗衰老技术规范化指南

众所周知,衰老始终不断地贯穿着生命过程的各个阶段,是不可抗拒的自然规律[1].生命在于运动,如何延缓衰老,保持生命活力,运动不失为一种回归自然的方式.运动医学作为非药物治疗,科学的指导体能锻炼,是一种安全、有效的延缓衰老的方法.

作者：中国整形美容协会抗衰老分会刊期： 2016年第04期
老年心房颤动评估及其指导作用

心房颤动(简称房颤)是老年人群常见的心律失常之一,是老年科医生经常面对的临床问题.缺血性脑卒中是其主要并发症,但老年人多存在出血倾向疾病及共病状态,因此与非老年人群相比,在进行医疗决策时需要更全面的评估以保证抗栓治疗的有效性和安全性.

作者：刘谦；秦明照刊期： 2016年第04期
RNA-Seq在老年神经退行性疾病研究中的应用

阿尔茨海默病及帕金森病是老年人常见的两种神经退行性疾病,但其发病机制及治疗是研究的热点.随着高通量测序技术的进步及成本的下降,RNA-Seq也成为神经退行性疾病机制研究及生物标志物发现的有力手段.RNA-Seq相对于microarray具有高灵敏度、高准确性、高重复性以及噪声低等优势,在阿尔茨海默病及帕金森病研究中有较为广泛的应用,包括检测差异表达基因,可变剪接、新长链非编码RNA预测分析和miRNAs调控等,但是容易受病理复杂性及样本等因素影响.目前阿尔茨海默病及帕金森病转录组研究相比于癌症等还不够深入,在临床诊断及治疗应用还面临较大挑战.但是随着新技术及新方法的发展,RNA-Seq将进一步推动神经退行性相关疾病的研究和临床转化.

作者：刘小利；严静刊期： 2016年第04期
Ac-SDKP通过抑制内质网应激对肺纤维化细胞凋亡的影响

目的探讨体内、外肺间质纤维化模型中Ac-SDKP延缓肺纤维化发展的可能机制.方法体内实验:将24只健康雄性C57BL/6小鼠随机分为对照组(8只)、肺纤维化模型组(8只)、肺纤维化+Ac-SDKP治疗组(8只).采用气管内注入博来霉素(5 mg/kg)法建立小鼠肺纤维化模型,对照组为气管内注入等体积0.9%氯化钠溶液.造模后肺纤维化+Ac-SDKP治疗组小鼠腹腔内埋入Ac-SDKP微量注射泵(Ac-SDKP 800μg·kg-1·d-1,冰乙酸0.1 mol/L,卡托普利100 mg·kg-1·d-1),持续干预21 d.对照组及肺纤维化模型组小鼠均于造模完成后第21天处死,肺纤维化+Ac-SDKP治疗组小鼠于干预21 d后处死,取肺组织观察其病理学变化;按试剂盒说明测定羟脯氨酸含量测定;TUNEL法测定肺泡上皮细胞凋亡率;Western-blot、免疫组化法检测GRP78、CHOP蛋白及mRNA的表达水平.体外实验:培养A549细胞,经TGF-β干预24 h后收集细胞,RT-PCR检测GRP78、CHOP mRNA的表达水平.正态分布计量资料多组间比较采用方差分析,两两比较采用SNK-q检验;非正态分布计量资料多组间比较采用kruskal-WallisH检验.结果 (1)一般观察:对照组小鼠双肺表面及切面光滑,未见结节形成;肺纤维化模型组肺组织表面及切面可见散在小结节;肺纤维化+Ac-SDKP治疗组肺组织表面也可见小结节,但较肺纤维化模型组稀少.(2)HE及Masson染色:肺纤维化模型组出现明显的纤维化改变,肺纤维化+Ac-SDKP治疗组肺纤维化程度有所减轻.(3)羟脯氨酸含量:3组间羟脯氨酸含量差异有统计学意义(H=20.490,P<0.01),其中肺纤维化模型组、肺纤维化+Ac-SDKP治疗组明显高于对照组(q=0.517、0.167,P<0.05),肺纤维化+Ac-SDKP治疗组明显低于肺纤维化模型组(q=0.351,P<0.05).(4)肺泡上皮细胞凋亡指数:3组间差异有统计学意义(F=57.720,P<0.01),其中肺纤维化模型组、肺纤维化+Ac-SDKP组明显高于对照组(q=8.471、3.639,均P<0.01),肺纤维化+Ac-SDKP组明显低于肺纤维化模型组(q=4.832,P<0.01).(5)CHOP、GRP78蛋白水平表达:肺纤维化模型组、肺纤维化+Ac-SDKP治疗组较对照组明显下降(q=22.630、8.921,138.812、41.233;P<0.01),肺纤维化+Ac-SDKP治疗组较肺纤维化组明显升高(q=13.711、97.583,P<0.01).(6)GRP78、CHOP mRNA表达量:TGF-β干预组较对照组明显升高(q=8.791、7.782,P<0.05);TGF-β+Ac-SDKP干预组较单纯Ac-SDKP干预组明显升高(q=4.399、5.561,P<0.05).结论 Ac-SDKP可能通过抑制内质网应激减缓肺泡上皮细胞凋亡,从而发挥其抗肺间质纤维化的作用.

作者：刘丽芳；刘学军；杜毓锋；薛彤彤刊期： 2016年第04期