学术投稿

用文献轮廓挖掘大肠癌转移芯片表达谱

黄仲曦;孙青;丁彦青;姚开泰

关键词:大肠癌, 肿瘤转移, 基因芯片, 信息存储与检索
摘要:目的寻找新的大肠癌转移相关基因.方法根据大肠癌转移芯片的表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,后基于词的发生频率对基因进行功能聚类,进一步结合文献及已有的分子生物学检测结果进行分析.结果发现两个新的可能与大肠癌转移相关的基因TIAM1和NM23H1.
南方医科大学学报杂志相关文献
  • 血管紧张素原基因多态性与2型糖尿病合并高血压的相关研究

    目的探讨血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因多态性与2型糖尿病合并高血压的关系.方法随机选择2型糖尿病患者240例,分为正常血压组(NBP)和高血压组(HBP),采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测其AGT基因多态性,分析AGT基因型在NBP组和HBP组的分布情况.结果各组AGT基因型的分布频率均呈TT>MT>MM,其中M等位基因在女性2型糖尿病HBP组的频率明显高于NBP组.结论AGT基因的M等位基因与女性2型糖尿病患者的高血压密切相关.

    作者:薛耀明;关美萍;刘仕群;张倩;周琳 刊期: 2003年第11期

  • 制作皮肤坏死模型的一种新方法

    目的介绍一种利用L-精氨酸(L-ARG)制作成年大鼠皮肤坏死模型的新方法.方法给大鼠饮水中增加L-ARG,用量为500mg/kg@b.w.@d,时间1周左右.结果L-ARG可使50%左右的大鼠皮肤坏死、溃疡面形成.结论一定量的L-ARG可引起成年大鼠皮肤坏死,可用于制作皮肤坏死模型.该方法简捷、成模时间短、成模率高.

    作者:尹艳茹;柏林 刊期: 2003年第11期

  • 外源性超氧化物歧化酶保护6-羟基多巴所致大鼠中脑多巴胺能神经元凋亡的实验研究

    目的明确6-羟基多巴(6-OHDA)致多巴胺能神经元凋亡与氧化应激的关系,中脑区总抗氧化能力、超氧化物歧化酶(SOD)活性的变化情况,以及外源性SOD对多巴胺能神经元凋亡的保护作用.方法144只SD大鼠数字化随机分为正常组、模型对照组、模型组、处理对照组及处理A、B、C、D、E组,应用相关试剂盒分别检测各组大鼠左、右中脑活性氧、总抗氧化能力和SOD活性水平;术后第10天,大鼠腹腔注射阿扑吗啡(0.5 mg/kg@b.w.)进行旋转行为测试;应用冰冻切片漂浮法,分别进行酪氨酸羟化酶(tyrosinehydroxylase,TH)单克隆抗体免疫组化和TUNEL法染色,观察各组大鼠中脑黑质部位TH阳性细胞和阳性凋亡细胞的情况.结果6-OHDA注入黑质区后,总抗氧化能力变化不明显,活性氧升高至(130±17)μ/mg@prot,SOD活性下降;外源性SOD注入后中脑区活性氧水平降低,SOD活性提高,使大鼠右侧中脑黑质TH阳性细胞数明显增多,而凋亡细胞有所减少,大鼠的旋转圈数从(166.7±31.0)圈/30min明显减少至(87.6±25.0)圈/30min.同时,处理各组出现SOD保护作用的时相性差异.结论在6-OHDA致大鼠中脑多巴胺能神经元凋亡的过程中,氧化应激起着一定的作用;而外源性SOD增强了对活性氧的灭活能力,减弱了6-OHDA的神经毒作用,提高了多巴胺能神经元的存活率,改善了大鼠的旋转行为.同时,也提示外源性SOD作用短暂,对急性期氧化应激抑制有较明显的时相性特点.

    作者:徐强;徐如祥;张世忠;张旺明 刊期: 2003年第11期

  • 环孢素A+甲氨蝶呤+霉酚酸酯+抗胸腺细胞球蛋白四联方案预防无关供体造血干细胞移植中的移植物抗宿主病

    目的评价环孢素A(CsA)+甲氨蝶呤(MTX)+霉酚酸酯(MMF)和低剂量抗胸腺细胞球蛋白(ATG)预防无关供体造血干细胞移植(URD-HSCT)中移植物抗宿主病(GVHD)的疗效.方法13与11例白血病患者分别接受URD-HSCT和相关供体(RD)-HSCT.移植预处理方案:19例应用全身放疗+环磷酰胺方案、5例应用改良BuCY(羟基脲、马利兰、阿糖胞苷、环磷酰胺)方案;无关移植病人供体与受体之间HLA-A、B、DR基因位点完全相合11例,1个基因位点不合2例.所有相关移植病人供体与受体之间血清学位点均为全相合;预防GVHD方案:所有病人均接受CsA+MTX方案,行URD-HSCT病人在CsA+MTX方案基础上加用MMF和ATG.结果移植后所有患者均获得造血重建,移植中预处理相关毒性(RRT)发生率和程度在无关与相关移植中二者无差异(P>0.05);急性GVHD(aGVHD)在无关与相关移植病人分别为46.2%和55.6%,在可统计的慢性GVHD(cGVHD)病人中,无关移植是4/7例,相关移植6/9例;无关与相关移植病人中分别有1例死于移植相关并发症,移植后1年估计无病生存率在无关与相关移植分别为87.5%和90.9%;移植后巨细胞病毒(CMV)抗原阳性率在无关与相关移植无差异(P>0.05).结论CsA+MTX+MMF+ATG四联方案预防URD-HSCT中GVHD能降低aGVHD的发生及其程度,不增加移植后相关死亡率和CMV感染率.

    作者:刘启发;孙竞;张钰;徐丹;刘晓力;徐兵;孟凡义;周淑芸 刊期: 2003年第11期

  • 微创伤非体外循环房间隔缺损封堵术5例

    目的介绍一种闭合房间隔缺损的微创伤非体外循环手术方法.方法对2002年1~12月在我院治疗的5例继发房间隔缺损患者经右前胸小切口直接闭合房间隔缺损.结果5例手术均1次成功,无残余分流,无封堵器脱落,平均住院时间7 d.结论该方法创伤小,操作简单,安全性高,具有推广应用价值.

    作者:童健;阎玉生;钱希明;陈群清;陈坤堂;唐晓明 刊期: 2003年第11期

  • 应用PCR快速制备细小病毒B19诊断芯片探针

    目的制备细小病毒诊断芯片探针.方法利用Primer Premier 5.0针对细小病毒B19基因保守区域设计PCR引物,将PCR产物克隆pMD-18 T载体.结果序列分析显示,PCR产物均为细小病毒B19特异保守基因.结论利用PCR扩增产物制备诊断芯片探针是一种简便有效的方法.

    作者:吕梁;马文丽;王洪敏;马晓冬;孙朝晖;郑文岭 刊期: 2003年第11期

  • 充血性心力衰竭患者巨噬细胞移动抑制因子与心功能的相关性

    目的探讨慢性充血性心力衰竭患者血浆巨噬细胞移动抑制因子(MIF)水平的变化及MIF水平与心功能分级的关系.方法采用双抗体夹心ELISA法检测278例不同程度心衰患者及85例正常人血浆MIF浓度.结果重度心衰时MIF水平显著升高,升高的幅度在不同病因心衰存在差异,冠心病心衰时MIF水平升高较明显(P<0.05).结论MIF与心衰严重程度密切相关,推测MIF可能参与了心力衰竭发生、发展的病理生理过程,在冠心病心衰的发病机制中MIF可能发挥更重要的作用.

    作者:刘媛;余细勇;林秋雄;杨敏;单志新;郑猛 刊期: 2003年第11期

  • STI 571治疗慢性期慢性粒细胞白血病的初步结果分析

    目的观察STI 571治疗慢性粒细胞白血病慢性期(CML-CP)与加速期(CML-AP)患者的疗效差异.方法19例CML患者(Ph染色体阳性率和/或荧光原位杂交(FISH)检测双标双融合bcr/abl基因阳性率均>90%)的中位年龄38岁,12例曾经干扰素-α(IFN-α)治疗失败.CML-AP 5例,CML-CP 14例,其中CML-CP早期(诊断≤1年)9例,CML-CP晚期(诊断3~6年)5例.19例患者全部服用STI 571 300~500mg/d,其中5例CML-AP同时联用高三尖杉酯硷1~2 mg/d,7~14 d为1疗程(中位数疗程1.5个).治疗的中位数时间4.5个月,治疗≥3个月后复查Ph染色体和FISH-bcr/abl.结果CML患者的血液学完全缓解率为100%,主要细胞遗传学反应率79%:CML-CP早期患者的细胞遗传学完全缓解率高于CML-CP晚期和CML-AP的患者(88.9%vs40.0%vs0%).结论STI 571治疗CML的血液学完全缓解率高,细胞遗传学反应率在CML-CP早期的患者中高.

    作者:孟凡义;郑维扬;刘晓力;徐兵;宋兰林;张钰;黄芬 刊期: 2003年第11期

  • 广东地区2037例大肠癌临床病理分析

    目的探讨广东地区大肠癌发病特点.方法统计南方医院1986~2002年经病理确诊的所有大肠癌病例并进行分析.结果17年共收治大肠癌2 037例,其中男性患者1 165(57.19%)例、女性患者872(42.81%)例,男女比例为1.34:1.41~70岁为发病高峰(70.74%).发病人数从1994年来呈现较快增长的趋势.直肠仍为大肠癌的好发部位(55.87%),但结肠癌有明显上升趋势(44.13%).与中老年大肠癌病人相比,青年病人(年龄≤40岁)右半结肠癌发生率较高.根据Dukes分期,B、C和D三期病例共占96.17%,表明大肠癌患者就诊时大部分已为中、晚期.组织学类型主要为高、中分化腺癌(71.18%),而低分化癌、粘液癌也有较高比例(21.11%).青年大肠癌以低分化癌及粘液癌居多(35.96%),远高于中老年患者(12.74%),按Dukes分期则以C、D两期所占比例多.结论该地区大肠癌呈较快增长趋势,且患者就诊时多为中晚期.由于青年大肠癌多具有家族遗传倾向,因此对大肠癌应早发现、早诊断、早治疗,从而提高病人生存率.

    作者:杨磊;丁彦青;张进华 刊期: 2003年第11期

  • 胃底贲门癌手术入路的探讨

    目的探讨胃底贲门癌手术入路的佳方法.方法将157例胃底贲门癌患者按手术入路分为经腹组(57例)和经胸组(100例),对比两组疗效.结果经腹组平均术中输血(164.91±36.83)m1,手术时间(219.04±10.72)min,住院时间(14.39±1.39)d,淋巴结清除数(6.04±2.84)个,未出现胸腔积液并发症,随访期间(3~60月)复发率22.80%;经胸组平均术中输血(575.50±40.12)ml、手术时间(286.40±7.94)min、住院时间(20.32±0.81)d,淋巴结清除数(3.62±2.56个),术后并发左侧胸腔积液15例,随访期间复发率41.00%,两组疗效有统计学差异.结论与经胸入路手术相比,胃底贲门癌经腹手术平均术中输血少、手术和住院时间短、淋巴结清除率高、肺部并发症少、术后复发率低,具有较好的临床疗效.

    作者:郑永波;黄祥成;何仕平;吴承堂;姚学清 刊期: 2003年第11期

  • 美国科学引文索引(Science Citation Index,SCI)的检索途径

    作者: 刊期: 2003年第11期

  • pcDNA3.1+-HIF-1α载体的构建和初步表达鉴定

    目的克隆和构建带人低氧诱导因子-1α(HIF-1α)基因真核表达载体pcDNA3.1+-HIF-1α.方法以大肠癌细胞株HT29的总RNA为模板,进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),获得HIF-1α的cDNA,克隆入T载体,测序证实后克隆入真核表达载体pcDNA3.1+,酶切鉴定重组子.将构建好的pcDNA3.1+-HIF-1α用脂质体法转入HEK293细胞,RT-PCR鉴定重组质粒的表达.结果扩增出HIF-1α cDNA全长,测序结果与Genbank记载完全一致,成功克隆入真核表达载体pcDNA3.1+;建立了稳定的细胞株HEK293/PcDNA3.1+-HIF-1α.结论成功克隆和构建带人HIF-1α基因真核表达载体pcDNA3.1+-HIF-1α,并证明其能在真核细胞内表达.

    作者:傅锐斌;吴平生;戴铁英;赖文岩;邱建 刊期: 2003年第11期

  • 唯支持细胞综合征1例报告

    我科于2002年12月收治1例唯支持细胞综合征,现报告如下.1临床资料患者男,24岁.因发现射精困难3个月后于2002年12月6日入住本科,患者自述2002年9月第一次性交时持续勃起约3 min后自感力量不足,继而不能射精,以后多次性交无射精,且述平常常于每日早晨约6时左右能自行勃起,但无射精,余无其它不适.

    作者:谢纹;沈洁;王欣 刊期: 2003年第11期

  • 混沌和周期的交感神经刺激对大鼠受损背根节神经元放电的影响

    目的研究受损背根节(DRG)神经元对不同时间序列的交感神经刺激反应.方法采用单纤维记录神经元自发放电的方法,在DRG慢性压迫模型上,电刺激腰交感神经干,比较受损DRG神经元对周期和混沌的交感神经刺激的反应.结果慢性压迫DRG中存在交感-感觉耦联现象.受损DRG神经元对交感神经刺激的反应随刺激频率(在5~20Hz范围内)的增加而增大(p<0.01).将刺激平均频率和刺激强度相同而刺激时间序列不同的交感神经刺激引起受损DRG神经元的反应进行比较发现,混沌的交感神经刺激引起的反应比周期的交感神经刺激引起的反应大(P<0.01).结论除刺激频率外,交感神经刺激的时间序列是影响受损DRG神经元反应的重要因素,混沌刺激引起的效应比周期刺激效应强,突触前神经元的混沌放电比周期放电可引起更大的突触后效应,神经元的混沌放电可能是神经传递信息的一种有效形式.

    作者:杨红军;胡三觉 刊期: 2003年第11期

  • 颅内室管膜瘤13例MRI临床分析

    目的分析颅内室管膜瘤的MR表现.方法回顾分析13例经手术病理证实的颅内室管膜瘤的MR表现.结果脑室系统室管膜瘤10例,其中四脑室室管膜瘤3例、侧脑室室管膜瘤7例,其MRI T1WI呈等或稍低信号,T2WI呈不均匀高信号,瘤周无水肿,增强扫描呈不均质强化.脑实质室管膜瘤3例,幕上2例、幕下1例,肿瘤实质MRI T1WI信号稍低于脑实质,T2WI似灰质信号或稍高于灰质信号,肿瘤周围有轻度水肿,增强扫描肿瘤实质部分呈轻到中度强化.结论MRI表现有助于室管膜瘤的鉴别诊断.

    作者:邱士军;张雪林 刊期: 2003年第11期

  • 稳定表达含HBV多表位短肽的杂合HBc颗粒的重组NS-1细胞株的筛选与鉴定

    目的建立稳定表达含HBV多表位短肽的杂合HBc颗粒的重组NS-1细胞株.方法将以HBV多表位复合基因取代脊区基因的杂合HBc真核表达质粒转染NS-1细胞,经G418及亚克隆筛选高表达阳性细胞株,并以RT-PCR、ELISA、间接免疫荧光及Western blotting等方法检测、鉴定重组细胞表达产物.结果筛选所得稳定表达细胞株经RT-PCR、ELISA、间接免疫荧光及Westernblotting等方法检测均呈阳性反应,而阴性对照及空白对照未出现相应阳性反应.结论筛选获得稳定表达含HBV多表位短肽的杂合HBc颗粒的重组细胞株,命名为NS/HBc-Mep.为建立HBc-Mep特异的cELISA及CTL活性测定等实验方法提供可靠的靶细胞.

    作者:田泽维;董文其;刘朝霞 刊期: 2003年第11期

  • 睡眠状态下人体生理信号模糊分析系统的研究

    采用LabVIEW技术完成对心电、呼吸、无创血氧和无创血压信号的采集与处理,而后通过MATLAB模糊测量系统对采集的人体生理信号进行模糊预测分析.通过实验检验了人体生理信号检测、处理和模糊预测分析方法的可靠性.LabVIEW技术对人体生理信号的模糊预测分析是有效的,可用于检测阻塞性睡眠呼吸暂停患者的生理状态信号.

    作者:徐现通;卢广文;马波 刊期: 2003年第11期

  • 肝豆状核变性并发急性溶血及急性肝衰竭1例报告

    1临床资料患者女,18岁,因乏力、纳差、尿黄2周于2003年6月18日入本院.入院前1周患呼吸道感染,其一姐10岁时死于肝豆状核变性.

    作者:徐成润;杨铮;饶日春;郑瑞丹 刊期: 2003年第11期

  • 评价中文科技期刊的常用工具

    作者: 刊期: 2003年第11期

  • 局部激素治疗胫前粘液性水肿1例报告

    胫前粘液性水肿是一种自身免疫病变,可伴或不伴甲亢,在临床上尚无统一有效的治疗方案.作者近期在临床上遇到1例典型病例,采用局部激素治疗效果显著,现报告如下.

    作者:关美萍;沈洁;薛耀明 刊期: 2003年第11期

南方医科大学学报杂志

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