学术投稿

通用基因芯片检测感染性细菌方法的研究

翟俊辉;宋亚军;杜宗敏;郭兆彪;王津;杨瑞馥

关键词:基因芯片, 微阵列, 感染性细菌, 通用检测系统, 16S rRNA
摘要:目的为提高临床微生物的检测速度和准确性,建立一次实验就能检测出一个样品中多个目标的方法.方法利用生物信息学手段设计16种常见临床细菌的寡核苷酸探针,对16种临床常见微生物进行检测.结果建立以16S rDNA为对象的基因芯片检测方法.利用寡核苷酸探针芯片对16种临床常见细菌进行检测的结果证明,大部分的细菌都可以由4条探针确定到种的位置.纯细菌菌液低可以检测到200(铜绿假单胞菌)到235(金黄色葡萄球菌)个细胞.血液模拟标本只能得到2 000到23 500个细胞.染色体系列稀释灵敏度实验表明基因芯片检测比PCR-电泳灵敏10倍.混合标本盲测实验结果表明,样品中如果存在一个以上的待测对象也可以检测出来.结论利用寡核苷酸为探针的基因芯片检测系统具有一定的种属鉴别能力,可以将本实验中提及的大部分细菌区分到种的位置.整个检测过程大约需要4.5 h.
中国公共卫生杂志相关文献
  • 工读学校学生智力发育及家庭影响因素分析

    为了矫正工读学校学生不良习惯,引导其走回正常的学习、生活轨道,提高其社会适应能力,我们对沈阳市工读学校48名学生进行智力发育及其影响因素的调查分析.

    作者:李宏革;白春玉;张迪;张秀丽 刊期: 2003年第04期

  • 通用基因芯片检测感染性细菌方法的研究

    目的为提高临床微生物的检测速度和准确性,建立一次实验就能检测出一个样品中多个目标的方法.方法利用生物信息学手段设计16种常见临床细菌的寡核苷酸探针,对16种临床常见微生物进行检测.结果建立以16S rDNA为对象的基因芯片检测方法.利用寡核苷酸探针芯片对16种临床常见细菌进行检测的结果证明,大部分的细菌都可以由4条探针确定到种的位置.纯细菌菌液低可以检测到200(铜绿假单胞菌)到235(金黄色葡萄球菌)个细胞.血液模拟标本只能得到2 000到23 500个细胞.染色体系列稀释灵敏度实验表明基因芯片检测比PCR-电泳灵敏10倍.混合标本盲测实验结果表明,样品中如果存在一个以上的待测对象也可以检测出来.结论利用寡核苷酸为探针的基因芯片检测系统具有一定的种属鉴别能力,可以将本实验中提及的大部分细菌区分到种的位置.整个检测过程大约需要4.5 h.

    作者:翟俊辉;宋亚军;杜宗敏;郭兆彪;王津;杨瑞馥 刊期: 2003年第04期

  • 高中生焦虑抑郁症状及相关因素的研究

    为探讨高中生焦虑、抑郁症状的发生情况及影响因素,以便为开展心理健康教育工作提供依据,我们对1 356名高中生进行调查研究.现报告如下.

    作者:魏俊彪 刊期: 2003年第04期

  • 芥子气染毒剂量及防治药物筛选实验的研究

    目的确定SD大鼠合适的芥子气染毒剂量,以用于进一步的防治药物筛选实验.方法以SD大鼠为动物模型,分别设立正常对照组和芥子气3、3.5、4 mg/kg体重3个染毒剂量组,通过观察1周内动物腹泻率和死亡率、体重变化、血常规和血生化指标变化以及骨髓涂片看细胞增生程度和细胞学分类等来评价各染毒剂量对机体的毒性作用.结果各染毒组都无动物死亡,但染毒剂量越高,腹泻率也越高,分别为0,20%和75%,而动物体重变化则跟染毒剂量呈反比.染毒剂量越高,血常规各检验指标数值与正常组差别越显著,尤其以白细胞总数(WBC)和淋巴细胞分类(LYM)下降为明显.各染毒组与正常组相比,血生化各指标均无显著性差异.各染毒组和正常对照组骨髓涂片均显著增生活跃或明显活跃,但细胞学分类却存在显著性差异(P<0.05).其中淋巴细胞系比例随着芥子气染毒剂量的增高,呈明显下降趋势,而红细胞系比例则呈升高趋势,粒细胞系变化不明显.结论 4mg/kg体重染毒剂量在不引起动物死亡或较少死亡的基础上,既能造成明显的腹泻症状和体重改变,而且又有显著的血常规指标和骨髓细胞学分类改变.因此,使用该染毒剂量作为SD大鼠芥子气防治药物筛选比较合适.

    作者:吕挺;赵炎军;张海云;陈志龙;孙结;马骞;赵杰;樊军文;张黎明 刊期: 2003年第04期

  • 副溶血弧菌tlh基因克隆载体和表达载体的构建

    目的构建含副溶血弧菌(vibrio parahaemolyticus,VP)tlh基因克隆载体和表达载体,检测并鉴定表达载体在转化菌的表达,为制备单抗、诊断试剂及进一步深入研究不耐热性溶血毒素(TLH)的功能奠定基础.方法根据Genbank的tlh全基因序列,设计一对附加EcorⅤ和HindⅢ两个限制性内切酶酶切位点的特异性引物,以VP基因组DNA为模板,用高保真Taq酶扩增出tlh基因.连接pGEM-T载体构建克隆载体,测序鉴定后,再用EcorⅤ和HindⅢ酶切回收目的基因并克隆至表达载体pET32a+,采用PCR和双酶切鉴定筛选阳性质粒,转化DE-3,IPTG诱导,用SDS-PAGE检测tlh的表达.结果扩增的目的基因与GenBank的tlh比较具有99%的同源性,重组表达载体转化DE-3,能表达融合蛋白.结论本研究成功扩增出完整的tlh基因,构建了克隆载体和表达载体,获得融合表达的目的蛋白.

    作者:李志峰;聂军 刊期: 2003年第04期

  • 衣原体感染与男性不育

    衣原体(CT)属于细胞型微生物,可引起泌尿生殖系统疾病.近年来,CT泌尿生殖道感染与男性不育的相关性日益受到人们的重视.为了深入探讨CT感染在男性不育中的作用与影响,笔者对1 070例生育与不育的男性进行CT感染的检测与分析.

    作者:朱庆华 刊期: 2003年第04期

  • 金花养态素SOD活性测定方法的研究

    金花养态素是以羊胎盘为原料,用高科技方法提取活性物质,制得的软胶囊保健食品,其功效成分为超氧化歧化酶(SOD).本文采用邻苯三酚自氧化法进行测定.现报告如下.

    作者:刘华;王江;徐向荣;慕慧;周玲;许昭 刊期: 2003年第04期

  • 山东省结控项目抗痨药品供应程序效果分析

    保证结核病人圆满完成治疗,提高病人治愈率的关键措施,除了强有力的化疗方案[1]、现代化的治疗管理策略-DOTS外[2,3],就是持续为病人提供充分足够的抗结核药物的供药系统[4].卫生部2001~2010年全国结防工作十年规划中提出系统供药的重要性[5],山东省数年实施世行贷款结核病控制项目(简称项目)的实践工作也证实了系统供药是保证病人治疗的关键之一.现将结果报告如下.

    作者:吴志磊 刊期: 2003年第04期

  • 互联网上网服务营业场所卫生现状调查分析

    互联网上网服务营养业场所(网吧)是近年来兴起的新型公共场所,其卫生质量与人体健康密切相关.为了解网吧卫生现状,为实施规范管理提供科学依据,于2001年2月~12月对大同市市区范围内72户网吧进行了专题卫生调查,并实施了卫生监测.报告如下.

    作者:张雁宏;孙占斌 刊期: 2003年第04期

  • 水中氯化物总硬度连续测定的研究

    生活饮用水中氯化物、总硬度是常规监测项目,GB5749-85生活饮用水国家卫生标准中[1],氯化物(以Cl计)、总硬度(以CaCO-3计)是限量指标,氯化物≤250 mg/L,总硬度≤450 mg/L.在GB5750-85<生活饮用水标准检验法>中,氯化物、总硬度是分别取样50.00 ml,单独测定.在实验室水样较多或大批水样时,用移液管取样比较费时,不利于快速测定和及时报出检验数据.为此,我们探讨研究了一次取样连续测定的快速方法,此法对水样中氯化物、总硬度测定具有准确、快速等优点,值得基层实验室推广应用.

    作者:鲁泗林;许长春;吴建平 刊期: 2003年第04期

  • 光合细菌调脂作用的研究

    目的研究光合细菌对血清中脂质的调节作用.方法通过高脂饮食建立高脂大鼠模型,以绞股蓝总甙为阳性对照物,研究光合细菌对高脂大鼠的调脂作用.结果光合细菌能显著降低大鼠血清TC、TG、LDL-c含量,并升高血清HDL-c含量及提高H/L比值,此外还能降低TC在肝脏中的蓄积.结论光合细菌显示出较强的调脂作用,且优于绞股蓝总甙.

    作者:熊琦;张肇铭 刊期: 2003年第04期

  • 5种天然物质提取物抑制煎炸油劣变的研究

    油脂在贮存过程中,尤其在煎炸过程中,发生氧化、水解、聚合等一系列复杂的变化,不仅破坏了油脂原有的维生素及不饱和脂肪酸等营养成分,而且还产生醛、酮、游离脂肪酸等对人体有害的物质[1,2].目前常用抗氧化剂如丁基羟基茴香迷(BHA)、二丁基羟基甲苯(BHT)及特丁基对苯二酚(TBHQ)等可防止油脂的氧化劣变,可这些都是人工合成抗氧化剂.本文采用国家卫生标准规定的指标酸价、羰基价的测定,对5种天然的物质的提取物抑制花生油在高温煎炸过程中劣变进行了研究.

    作者:叶蔚云;罗念慈;黄润根 刊期: 2003年第04期

  • 行为生活方式对恶性肿瘤发病影响的综合分析

    目的通过综合分析主要生活行为危险因素的变化趋势及其对恶性肿瘤影响的严重程度,预测其暴露水平对恶性肿瘤发生发展的影响,为制定恶性肿瘤防治策略和规划提供科学依据.方法采用综合分析方法,估计恶性肿瘤主要行为危险因素的人群归因危险度百分比及其对恶性肿瘤发生的影响.结果通过对吸烟、饮酒和水果蔬菜摄入的人群暴露率的预测及根据暴露率的变化,估计人群归因危险度百分比的变化趋势,以及估计5种恶性肿瘤发病率的变化结果,可以看出,随着以上危险因素暴露率的降低,肺癌、胃癌、食管癌、肝癌和大肠癌的发病率均随之呈不同程度的下降.结论在预防恶性肿瘤的工作中,针对恶性肿瘤的危险因素,加强一级预防,减少人群的不良生活习惯,改善饮食结构,将产生明显的社会效益,具有很大的公共卫生潜能.

    作者:么鸿雁;陈辉;吕美霞;余红平;杨念念;方亚;段纪俊;施侣元 刊期: 2003年第04期

  • 南宁市中老年人心血管健康状况危险因素分析

    目的对南宁市中老年人心血管健康状况及其危险因素进行分析.方法采用随机抽样方法,对南宁市35~74岁之间居民进行心血管健康状况调查,分析发病水平及有关影响因素.结果 (1)样本人群高血压患病率为22.06%,随年龄增长而升高,超重率为27.45%,其中男性的为31.28%,女性为23.66%,男性超重率高于女性(P<0.05).(2)心肌梗塞、脑卒中,心力衰竭患病率分别为0.98%,2.20%,1.71%.(3)高血糖、高总胆固醇、高甘油三脂患病率分别为17.35%,56.67%,30.94%,男、女性别均有显著性差异(P<0.05).(4)多因素回归分析显示:BMI、喝酒、吸烟、高血压、年龄、文化程度、家族中有慢性病史等是心血管病的主要影响因素.结论南宁市中老年人心血管健康状况不容乐观,其危险因素处于较高水平,心血管健康预防控制策略和措施有待进一步加强.

    作者:徐永芳;覃羽乔;陈娜萦;郭琳芳;蒙晓宇;梁桂民 刊期: 2003年第04期

  • 注意力缺陷多动障碍与铅、镁的关系

    目的探讨注意缺陷多动障碍(ADHD)儿童与铅、镁的关系,为根据环境病因制定进一步的个体化防治措施提供理论依据.方法按照美国精神病学会出版的<精神障碍诊断及统计手册>第4版(简称DSM-IV)ADHD诊断标准确定病例组儿童60名;按年龄、性别1∶1匹配正常对照组儿童.采集末梢血及头发,应用原子吸收分光光度计石墨炉法及火焰法化验铅及镁含量.应用SAS 6.12统计软件进行配对样本t检验及交互作用分析.结果 ADHD患儿血铅水平(221 μg/L)明显高于对照组儿童(120 μg/L),P<0.001;血镁含量(29 mg/L)显著低于对照组儿童(43 mg/L),P<0.001;发镁含量(15 μg/g)显著低于对照组儿童(22 μg/g),P<0.05.上述三因素对ADHD影响的交互作用分析显示:血铅含量、血镁含量对ADHD的作用具有显著性意义;血铅与血镁,血镁与发镁交互作用也有显著性意义.结论铅水平增高与镁缺乏均可促使ADHD的发病.交互作用分析则显示在ADHD的发病中血铅与血镁的作用互为拮抗.

    作者:王改青;都萍;王慧聪 刊期: 2003年第04期

  • 大豆异黄酮诱导胃癌细胞凋亡作用研究

    目的体外实验探讨大豆异黄酮诱导胃癌细胞发生凋亡的可能性,揭示该凋亡发生与bcl-2和bax之间的关系.方法采用MTT比色法测定大豆异黄酮对胃癌细胞的生长抑制率;以透射电镜和TUNEL染色法,定性、定量地研究大豆异黄酮与胃癌细胞凋亡的关系;通过免疫组织化学法和RT-PCR检测凋亡相关基因bcl-2和bax的表达.结果大豆异黄酮对胃癌细胞有明显抑制作用,随大豆异黄酮浓度增加和培养时间的延长而增强;透射电镜可见胃癌细胞出现典型的凋亡细胞形态,如细胞核染色质致密浓缩,或聚集于核膜呈新月形小体;TUNEL染色法可见染色阳性的胃癌细胞出现细胞核碎裂,核质固缩,细胞膜突出形成质膜小泡等凋亡细胞形态学变化.免疫组织化学和RT-PCR法发现大豆异黄酮下调bcl-2的表达,上调bax的表达.结论诱导胃癌细胞发生凋亡是大豆异黄酮抗胃癌作用的机制之一,大豆异黄酮可能通过下调bcl-2的表达和上调bax的表达而诱导胃癌细胞发生凋亡.

    作者:马吉祥;苏军英;李会庆;王显军;颜云 刊期: 2003年第04期

  • 肾综合征出血热流行病学数学模型研究进展

    肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS),是由汉坦病毒(HV)引起的人类自然疫源性动物源性病毒性急性传染病,严重危害着人类的健康和生命.我国从1984年在全国开展了HFRS监测工作,目前,数学模型在肾综合征出血热探讨发病原因、分析发病现状和预测流行趋势等方面应用较广,应用的主要数学模型总结如下.

    作者:郭秀花;曹务春;张习坦 刊期: 2003年第04期

  • 我国虫媒病毒研究10年回顾

    虫媒病毒(Arbovirus)是通过吸血的节肢动物叮咬敏感的脊椎动物,使脊椎动物发病从而传播疾病的一类病毒.其特点是病毒在节肢动物体内繁殖,但是动物自身却不发病.虫媒病毒性疾病大多数是自然疫源性疾病,由于节肢动物叮咬人、畜引起疾病,因此虫媒病毒属于人畜共患病毒.

    作者:王环宇;梁国栋 刊期: 2003年第04期

  • 环境农药暴露和人群肺癌发病、死亡的相关分析

    目的研究环境中农药暴露与农业人群肺癌发病率和死亡率的相关关系.方法利用生态比较研究方法,收集沈阳市郊区县农药接触人群1993~1998年各年的农药使用种类、使用量和农作物播种种类、播种面积等资料,同时收集1998~2000年相应地区的肺癌发病和死亡资料.应用SPSS 10.0统计软件进行等级相关分析.结果总的肺癌发病率与农药使用密度无显著性相关.年龄别分析表明,男性40~49岁及女性60~69岁年龄组的发病率与农药使用密度有显著性相关,P<0.05.1998年男性及男、女合计的肺癌死亡率与1993年农药使用密度有显著性相关,相关系数均为0.886,P<0.05.按年龄别、性别分析显示,40~49岁年龄组的男性、女性和男、女合计的肺癌死亡率与农药使用密度有显著性相关,相关系数分别为0.886,0.886,0.943.结论农业人群肺癌的发病率和死亡率与环境中农药暴露存在一定的相关.

    作者:何钦成;陈佳鹏;周宝森 刊期: 2003年第04期

  • 水源水及饮用水中的有机物对人体健康的影响

    饮用水的水源中一般都含有一定浓度的天然有机物(Natural Organic Matters,NOM),而随着生活污水和工业废水,特别是有机化工、制药、石油化工、农药和杀虫剂等行业的废水的注入,自来水厂的原水中会增加多种人工合成有机物(Synthetic organic compounds,SOC),经过混凝-沉淀-过滤-消毒的常规工艺或其它工艺的处理后,饮用水中又会增加消毒副产物(Disinfection Byproducts,DBPs)等,它们对人体健康都有着不同程度的间接或直接的影响.

    作者:于鑫;张晓健;王占生 刊期: 2003年第04期

中国公共卫生杂志

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