学术投稿

广西HIV-1重组毒株env区快速基因分型方法的建立

梁浩;罗皓;邵一鸣;刘伟;张志勇;邢辉;卢灿健;沈菁;麦志丹

关键词:HIV-1, 基因型, 聚合酶链反应
摘要:目的 建立一种快速简便的基因分型方法,对广西HIV-1重组毒株env基因区进行亚型鉴定.方法 从HIV阳性样品中提取核酸,使用HIV-1 M组通用引物对env区进行第一轮扩增,第二轮则使用分别检测B'/C或C亚型和CRF01-AE亚型的二套特异性引物放入同一反应管中进行扩增,根据不同亚型扩增的目的带位置不同来判断亚型.将通用引物扩增出的所有样本均进行基因测序和系统树分析以验证结果.结果 50份样本中,经基因测序和系统树分析证实CRF08-BC样本3份(6%),CRF01-AE样本43份(86%),4份(8%)样本无法确定亚型.经亚型特异性引物PCR法检测得出B'/C或C亚型样本3份(100%),CRF01-AE样本39份(90.7%),灵敏度为91.3%,特异度为100%.两种方法检测结果经差异性检验显示x2=2.25,P>0.05,差异无统计学意义,结果一致者占92%.与基因分析结果吻合.重复实验显示CRF08-BC平均重复性为100%(10/10),CRF01-AE为93.8%(61/65).结论 该方法是一种简便、快速、低成本,具有高度灵敏性和特异性的HIV-1毒株env基因区分型法,能够直接对广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株进行鉴定.
中华实验和临床病毒学杂志相关文献
  • LMP1基因重组慢病毒载体的构建及表达性能鉴定

    为了进一步探讨EB(Epstein Barr)病毒潜伏膜蛋白1(LMP1)的作用机制及其功能,我们构建了EDL2-N-LMP-慢病毒载体,并对所构建的EDL2-N-LMP-慢病毒载体结构及表达进行鉴定.

    作者:杨玉芳;丁彦青;梁丽;翁德胜 刊期: 2006年第03期

  • 抑制性消减杂交技术筛选重组IFNβ下调HepG2细胞靶基因

    目的 利用抑制性消减杂交(SSH)技术构建重组干扰素β(IFNβ)刺激人肝癌细胞系HepG2差异表达基因的cDNA消减文库,筛选IFNβ下调HepG2相关基因.方法 重组IFNβ 2000 U/ml刺激对数生长期HepG2细胞,以生理盐水作用的HepG2细胞为阴性对照;制备细胞裂解液,从中提取mRNA并逆转录为cDNA,经Rsa Ⅰ酶切后将实验组cDNA分成两份,分别与两种不同的接头连接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠埃希菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析.结果成功构建重组IFNβ刺激HepG2细胞差异表达基因的cDNA消减文库.文库扩增后,得到58个阳性克隆,进行菌落PCR分析,均得到200~1000 bp插入片段.随机挑选其中35个插入片段测序,并通过生物信息学分析,结果 共获得12种编码基因.结论 应用SSH技术成功构建了IFNβ刺激HepG2细胞差异表达基因的cDNA消减文库,为进一步了解IFNβ在肝细胞内的免疫调节机制提供了依据.

    作者:钟彦伟;成军;曲建慧;张黎颖;郭江;李晓东;徐东平 刊期: 2006年第03期

  • 慢性乙型肝炎患者树突状细胞表型的研究

    目的 探讨慢性乙型肝炎患者外周血来源树突状细胞(Dendritic cell,DC)数量及表型的改变,并对其与肝功能、乙肝病毒复制水平的关系进行研究.方法 检测37例慢性乙肝患者和21例健康人肝功能及血清HBV DNA水平,并提取外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)进行体外诱导培养,促使其发育成DC,计数其数量并检测膜表面分子的变化.分析DC数量及表型与肝功能、乙肝病毒复制水平的关系.结果 与正常对照组比较,慢性乙肝患者的树突状细胞数量明显减少(P<0.05),且其膜表面分子CD83、CD86的表达均明显降低(P<0.05).在慢性乙肝患者中,DC数量、DC膜表面分子CD83和CD86与血清HBV DNA之间呈负相关关系,而与肝功能之间无明显相关关系.结论 慢性乙肝患者体内存在DC数量减少及成熟障碍,这种改变与肝内炎症反应程度不相关,但与乙肝病毒(Hepatitis B virus,HBV)的复制水平呈负相关,提示DC参与慢性乙肝患者体内HBV的清除.

    作者:王凯;陈龙岩;王兵;韩利岩;侯云德 刊期: 2006年第03期

  • HIV抗体快速检测试剂的临床评价

    目的 对注册前的HIV抗体快速检测试剂的质量进行临床评价.方法 用不同的评价试剂检测440份健康献血员样品、300份HIV抗体强阳性样品以及264份HIV感染高危人群样品,并分别计算其特异性和敏感性.结果 17家注册前试剂检测300份HIV抗体强阳性样品的敏感性为100%;检测440份健康献血员样品的特异性为97.7%~100%;检测264份HIV感染高危人群样品的特异性为59.1%~100%,敏感性为70.3%~95.1%.结论 不同试剂之间存在敏感性和特异性的差异,而且HIV感染的高危自然人群来源的样品有助于客观地反应试剂的质量差异.

    作者:李秀华;宋爱京;王佑春 刊期: 2006年第03期

  • 贵州乙型肝炎病毒基因型分布及意义分析

    目的 调查贵州乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布.方法 选择贵阳、遵义、凯里、都匀慢性HBV感染者693例,其中无症状携带者(ASC)292例,慢性肝炎(CH)276例,肝硬化(LC)76例,肝细胞肝癌(HCC)49例.用S基因限制性片段长度多态性确定基因型,比较主要基因型的地区分布及其与临床的关系.结果 693例中,B基因449例(64.79%),C型233例(33.62%),A型6例(0.87%),D型5例(0.72%),未发现E、F基因型.B型的分布:凯里高(96.40%),遵义、都匀其次(78.79%、76.19%),贵阳低(53.66%).C型的分布,贵阳(45.68%)高于都匀(23.80%)、遵义(13.13%)及凯里(3.96%),差异有统计学意义(P≤0.01).与B型相比,C型感染者平均年龄大;ALT水平高;HBeAg阳性率低(P≤0.01).除ASC组外,B、C2种基因型在CH、LC和HCC中的分布差异有统计学意义(P均<0.01).结论 贵州存在A、B、C、D 4种HBV基因型,但以B型为主,C型其次,A型、D型仅占很小比例.B、C基因型在贵州不同地区的分布有一定差异.与B型相比,C型感染者肝脏损害的程度较重.

    作者:丁静娟;张权;彭亮;刘悦晖;李忠;刘三都;胡莲 刊期: 2006年第03期

  • 引起人类脑炎的新双链RNA病毒

    全世界已经报道的病毒有5400多种,其中双链RNA病毒除了双RNA病毒科外,绝大多数都存在于呼肠孤病毒科.2005年国际病毒分类委员会(International Committee for Taxonomy of virus,ICTV)第八次分类报告中正式公布在呼肠孤病毒科中增加一个新属,其英文名称为Seadornavirus.

    作者:徐丽宏;梁国栋 刊期: 2006年第03期

  • 中华医学会系列杂志编辑部主任工作会议胜利召开

    作者: 刊期: 2006年第03期

  • 使命与奉献——祝贺顾方舟教授从医55周年

    顾方舟教授是我国著名的老一辈医学科学家、病毒学家、教育家和社会活动家.他专门从事脊髓灰质炎研究40余载.他是中国研究脊髓灰质炎病毒和研发脊灰活疫苗的第一人,成绩卓著,名声斐然.

    作者:王树惠;彭小忠 刊期: 2006年第03期

  • 血浆γ干扰素诱导因子在乙型病毒性肝炎中的作用

    本研究采用ELISA测定各类病毒性肝炎患者血清中IL-18含量,旨在探讨其在各类乙型肝炎(乙肝)患者血清中的变化规律及其与肝功能受损关系,以便为临床诊疗和预后提供依据.

    作者:刘家秀;徐彬;汪习成;刘兴祥;姜玉章;徐秋节 刊期: 2006年第03期

  • 215例急性和亚急性重型肝炎临床特征对比性分析

    目的 进一步了解急性重型和亚急性重型肝炎(简称急重和亚急重)患者的临床特征,以及它们之间的异同.方法 收集和整理215例急重和亚急重住院患者的临床资料,使用x2检验、t检验、回归分析等方法进行相关的统计学分析.结果 ①乙型肝炎病毒感染仍是急重和亚急重型肝炎的主要病因,均占30%以上.抗结核药物是药物性急重和亚急重肝炎的首要原因;②急重和亚急重患者肝性脑病发生率分别为78.13%和43.05%,差异有统计学意义(P<0.001);③急重患者的平均凝血酶原活动度低于20%,而亚急重患者平均凝血酶原活动度低于30%;④急重患者发生率前三位的并发症分别为肝性脑病、电解质紊乱及脑水肿;而亚急重则分别为腹水、电解质紊乱及肝性脑病;⑤急重和亚急重患者的病死率与病情重时PT、WBC及中性粒细胞比例均呈正相关,而与PTA、TC均呈负相关;亚急重还与病情重时TB、BLA及CRE呈正相关,与CHE、TG、PLT、ALB呈负相关.结论 ①急重和亚急重患者无论在好发年龄、肝性脑病发生率、肝性脑病出现时间,还是在凝血功能异常、预后与实验室指标等方面差异较大,属两个独立的疾病;②对于无肝性脑病的急重和亚急重患者,严重的凝血功能异常是一个重要的灵敏和特异性指标.

    作者:李保森;邹正升;张伟;赵军;常彬霞;唐彦;尚丽丹 刊期: 2006年第03期

  • 西尼罗病毒E蛋白结构域Ⅲ特异性单克隆抗体的研制

    目的 研制针对西尼罗Ⅲ重组融合蛋白的特异性单克隆抗体.方法 用西尼罗Ⅲ重组融合蛋白免疫BALB/c小鼠,用淋巴细胞杂交瘤技术进行细胞融合,并用间接ELISA方法进行筛选,所获得的单抗经间接ELISA、免疫印迹和间接免疫荧光试验进行鉴定.结果 共获得了3株能稳定分泌针对西尼罗河病毒E蛋白结构域Ⅲ的特异性单抗的杂交瘤细胞株,分别命名为4F7、6H3和8E4,其单抗亚类鉴定分别属于IgG1、IgG1和Ig2a.这3株单克隆抗体均能与重组西尼罗河病毒E蛋白结构域Ⅲ发生特异性反应,而与日本脑炎病毒无交叉反应,并且,8E4和6H3识别同一抗原位点,4F7识别西尼罗河病毒E蛋白结构域Ⅲ的另一抗原位点.结论 本实验成功研制出针对西尼罗河病毒E蛋白结构域Ⅲ的特异性单克隆抗体,为我国建立西尼罗河病毒的病原学检测方法并与日本脑炎病毒进行鉴别诊断提供了技术贮备.

    作者:陈义平;杨艳菊;吴晓东;王志亮 刊期: 2006年第03期

  • 我国新分离乙脑病毒02-76株的全基因序列特征

    目的 对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析,了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性.方法 设计乙脑病毒全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因序列.通过Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 新分离乙脑病毒02-76株全基因组全长10 977个核苷酸,从96位到10 391位,共10 296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸.与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异,16个氨基酸差异.与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.6%~15.1%,氨基酸总体差异率为0.2%~4.6%.通过PrM/C区段、E区段、3'NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒.结论 新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型,与中国分离株SA-14进化关系接近.

    作者:王环宇;潘晓玲;付士红;王雷;李铭华;Ichiro KURANE;梁国栋 刊期: 2006年第03期

  • 乙型脑炎病毒单克隆抗体制备及其特性鉴定

    目的 制备乙脑病毒单克隆抗体并对其各项生物学性质进行鉴定.方法 通过免疫、融合、克隆和筛选等方法制备乙脑单抗,使用ELISA、IFA、中和试验和Western blot等方法鉴定单抗的敏感性、特异性、种内反应广谱性以及中和活性.结果 终获得3株稳定分泌的乙脑单克隆抗体细胞株,其滴度均超过106.3株单抗只与乙脑病毒反应,与其他9种虫媒病毒皆不反应.ELISA相加试验证明3株单抗的作用位点非常相近,选择其中的F12.37与10个代表性乙脑病毒株反应,F12.37能够敏感地检测到所有10个在细胞内复制的病毒株.F12.37还能够中和乙脑P3株(基因Ⅲ型)和SH03-103株(基因Ⅰ型),保护50%细胞不产生病变的稀释度分别为1:3.2×105和1:105,Western blot结果显示F12.37与乙脑病毒E蛋白相互作用.结论 本研究获得了3个高滴度、高特异性的乙脑单克隆细胞株,其中F12.37具有较高的敏感性和较好的种内反应广谱性,能够中和两个基因型乙脑病毒,其作用位点位于乙脑病毒E蛋白.

    作者:王雷;付士红;李雄;牛新玲;唐青;梁国栋 刊期: 2006年第03期

  • 抗病毒药物治疗慢性乙型肝炎的效果及对预后的影响

    目的 分析北京地区抗病毒药物对慢性乙肝患者治疗的现状、疗效及对预后的影响.方法 采用回顾性前瞻研究的方法.结果 干扰素、拉米夫定抗病毒治疗覆盖率约40%.疗程结束时HBV DNA阴转率拉米夫定组高,但停药随访时180/220例出现反跳.干扰素组HBeAg血清转换率(22.9%)高于其他组,有统计学意义.干扰素及拉米夫定治疗者病情进展较慢且肝硬化、肝癌发生率明显低于非抗病毒组(P<0.001).E系统转换组的并发症和死亡率明显低于非转换组(P<0.05).结论 北京地区干扰素和拉米夫定抗病毒治疗覆盖率高于其他地区,效果优于其他药物组,但总体疗效仍较低.干扰素等抗病毒治疗能减缓病情进展和减少肝硬化、肝癌的发生率.

    作者:陈新月;于岩岩;马丽娜;黄云丽;沈成利;张文瑾;徐道振;斯崇文 刊期: 2006年第03期

  • 体外转染SV40的鼠内皮细胞生长特性的研究

    体外培养的内皮细胞具有血清和生长因子的依赖性,且具有异质性,用其进行体外研究血管生成结果难以分析.本实验拟用SV40转染鼠内皮细胞,为体外研究血管生成提供稳定内皮细胞株.

    作者:贾俊;赵怡芳;张文峰;何三纲 刊期: 2006年第03期

  • 氧化苦参碱治疗小儿慢性乙型肝炎的临床观察

    我院感染科自1999年4月起,选取104例慢性乙型肝炎患者,随机分为治疗组和对照组,每组各52例.治疗组中:男34例,女18例,年龄5~14岁,平均年龄(10.8±5.2)岁.对照组中:男31例,女21例,年龄4~14岁,平均年龄(9.9±5.9)岁.

    作者:彭华彬;杨志国 刊期: 2006年第03期

  • 加强我国病毒性脑炎的监测与研究

    病毒性脑炎是指由多种嗜神经性病毒感染引起的症候群,为了有别于其他病原体所致的脑炎而统称为病毒性脑炎.病毒性脑炎症状严重、死亡率高、许多患者会留有后遗症,对人类健康造成极大威胁.

    作者:梁国栋 刊期: 2006年第03期

  • 2005年流行性乙型脑炎疫情分析

    目的 了解2005年我国贵州、四川和湖北省三个监测点的乙脑流行情况.方法 收集三个监测点的乙脑流行状况、媒介蚊虫、宿主带毒水平.结果 2005年我国贵州、四川和湖北3个省的乙脑报告病例数占全国总数的40.7%,其中贵州和四川省的病例数居全国前2位,发病率均超过1/10万,高于全国平均水平;报道病例中0~10岁儿童占报告病例90%以上;病例以散居儿童为主;乙脑病例主要集中于6~9月,而7~8月发病数多;蚊虫密度调查显示库蚊和三带喙库蚊为主要蚊种.结论 三省监测点与全国乙脑流行规律相同.贵州和四川省乙脑病例居全国前2位.

    作者:李艺星;尹遵栋;杨俊峰;陈园生;程均福;刘力;刘学成;周兴余;王昭孝;周敬祝;梁晓峰 刊期: 2006年第03期

  • 呼吸道病毒感染与细胞凋亡

    呼吸道病毒感染和细胞凋亡的关系是错综复杂的,既可以表现为抗凋亡作用,也可以表现为促凋亡作用.研究呼吸道病毒感染与细胞凋亡关系及凋亡的可能机制,将有助于进一步认识呼吸道病毒感染发生、发展及转归机制,为感染的防治提供一些新的思路.

    作者:杭敏 刊期: 2006年第03期

  • HIV感染消化道黏膜的发病机制

    近年研究表明,黏膜是执行局部特异性免疫功能的主要场所,称为黏膜免疫系统(mucosal immune system,MIS).MIS分为两大部分:有结构的黏膜滤泡和无结构的弥散淋巴组织.抗原由黏膜滤泡进入MIS,被抗原提呈细胞捕获、处理并提呈给T、B细胞,引起免疫应答.浆细胞和致敏淋巴细胞通过归巢机制迁移至弥散淋巴组织,并在此发挥生物学功能.

    作者:黄磊;周先志 刊期: 2006年第03期

中华实验和临床病毒学杂志

中华实验和临床病毒学杂志

主管:实验和临床病毒学杂志

主办:中国科学技术协会