学术投稿

大肠埃希菌O157:H7 Tir基因的生物信息学分析

王玲;龙北国;胡黎平;罗军;陈健文;范宏英

关键词:出血型大肠埃希菌O157, H7, 转位紧密粘附素受体, 生物信息学
摘要:目的 扩增和测序肠出血型大肠埃希菌O157:H7 tir基因,利用生物信息学预测分析其结构和功能特征.以探讨Tir作为疫苗候选抗原的可能性.方法 利用PCR技术扩增咖基因并测序,应用生物信息学网站在线分析工具和vector NTI suite软件分析Tir蛋白结构和生物学功能,预测B细胞抗原表位.结果 该基因全长1 674 bp,编码558个氨基酸,蛋白质总体亲水性高,有稳定的理化性质.含有3个结构和功能域,两段穿膜结构,多个磷酸化位点,预测20个B细胞线性表位.结论 Tir毒力因子是很有前景的疫苗候选抗原,为肠出血型大肠埃希菌O157:H7的疫苗研究提供了理论依据.
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    作者:邓辉;薛永祥 刊期: 2009年第05期

  • 咪唑安定和芬太尼在老年患者纤维支气管镜检查中的应用

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    作者:张锡林;吴智龙 刊期: 2009年第05期

  • HCV反向点杂交基因分型方法的建立

    目的 利用反向点杂交技术建立HCV基因分型新方法.方法 在HCV 5'端非编码区(5'NCR)设计引物和分型探针(1.2.3.6型),采用反向点杂交分型技术对53例HCV RNA阳性(浓度均在102~107 IU/mL之间)血清进行分型,并以基因序列分析作为金标准,对新方法的敏感性、特异性和重复性进行评价.结果 反向点杂交基因分型新方法检出的基因型有52例:1b型32例占60.38%,2a型4例占7.55%,6a型8例占15.09%.3b型8例占15.09%;未检出的基因型有1例,用基因序列分析也未能确定型别(失败的原因应是该HCV RNA扩增产物浓度偏低2.24×102IU/mL).本研究的方法敏感性为98.1%,特异性为100%,随机抽取20份标本再次检测的结果与前次检测的结果完全一致,重复性好.结论 相对现有的型特异性PCR分型、基因芯片、核酸序列分析等各种方法,反向点杂交技术用于HCV基因分型是一种准确有效和简便经济的方法.

    作者:唐文志;杨永强;黄小燕;戴小波;李宇雄;谭星蓉 刊期: 2009年第05期

  • 带组氨酸标签的癌蛋白SET真核表达载体的构建及其表达

    目的 为研究三氯乙烯诱导的差异蛋白SET在肝细胞L-02中的相互作用,构建了癌蛋白SET和His标签融合表达的真核表达载体pcDNA3.1(+)/SET-His.方法 从L-02肝细胞中提取总RNA,采用RT-PCR扩增SET-His基因并进行双酶切,序列纯化后定向克隆至pcDNA3.1/zeo(+)载体,阳性克隆载体进行双酶切和测序鉴定,阳性克隆载体瞬时转染人L-02肝细胞,利用Western blotting检测SET-His融合蛋白的表达.结果 利用RT-PCR从L-02细胞总RNA中成功克隆出SET基因,经双酶切和测序鉴定证实pcDNA3.1(+)/SET-His真核表达载体构建成功.经Western blotting验证表明,SET-His融合蛋白在肝细胞中获得高效表达.结论 该结果为研究SET蛋白相互作用以及三氯乙烯致机体损伤的机理奠定了基础.

    作者:陈谋通;刘建军;杨汝德;何浩伟;蒋英芝;贺连华 刊期: 2009年第05期

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    作者:余治健;邓启文;曾位森 刊期: 2009年第05期

  • 河南省开封地区临床病人肠道寄生虫感染调查

    目的 了解开封地区人肠道寄生虫感染状况,尤其是机会性致病原虫和人兽共患寄生虫的流行情况.方法 采用饱和蔗糖溶液漂浮法、甲醛-乙酸乙酯-改良抗酸染色法和卢戈碘液染色法对该地区门诊和住院病人6 093份粪便样品进行了检查.结果 检出肠道寄生虫8种,总感染率为1.49%,首次摸清了人环孢子虫感染的流行状况,感染率为0.85%;蓝氏贾第虫和粪类圆线虫感染率次之,分别为0.16%和0.15%;蛔虫、人隐孢子虫和阿米巴原虫感染率均为0.10%,钩虫感染率为0.08%,结肠小袋纤毛虫感染率为0.02%,混合感染感染率为0.05%.结论 开封地区临床病人肠道寄生虫感染率较低,但仍应进一步开展健康教育,普及卫生知识.提高自我保健意识和自我保健能力,预防寄生虫病的发生和流行.

    作者:王强;周洋;吕彪;傅侃达;陈雷;王亚强;曹树琴;孙艳茹;张炳报;齐萌;张龙现 刊期: 2009年第05期

  • 粉尘致肺纤维化机制研究现状

    鉴于尘肺病的高发病率、高危害性和不可逆转性,探讨其发病机制以达到早发现、早诊断、早治疗具有重要意义.本文对目前研究的较为深入的自由基学说和细胞因子网络学说进行综述.

    作者:顾春晖;刘移民 刊期: 2009年第05期

  • 血小板特异性抗体及HLA抗体引起血小板输注无效的研究

    目的 分析血小板输注无效(PTR)患者血小板同种抗体,并对其HPA及HLA-Ⅰ类抗原进行基因分型,探讨血小板输注无效与血小板同种抗原/HLA-Ⅰ类抗原相关性.方法 应用ELISA方法对17例血小板输注无效患者血清中的血小板抗体进行检测;运用PCR-SSP方法,采用HPA分型试剂盒检测血小板同种抗原7个抗原系统HPA-1、2、3、4、5、6、15,以及HLA分型试剂盒对HLA-A/B抗原进行基因分型.结果 6名患者单独表达HLA抗体,4名患者表达血小板特异性糖蛋白抗体,3例HLA抗体和血小板特异性糖蛋白抗体共同表达,其中以GP Ⅱ b/Ⅲa为主.对17例患者HPA系统和HLA-Ⅰ类抗原基因分型,发现HPA-3系统中a的基因频率高达0.676,b为0.324;HLA-A*02、HLA-A*24、HLA-A*11和HLA-B*60、HLA-B*13、HLA-B*46多见.结论 HLA抗体和血小板特异性糖蛋白抗体表达引起血小板输注无效,了解PTR与HPA/HLA-Ⅰ类抗原的相关性对指导临床血小板配合性输注具有重要意义.

    作者:徐秀章;夏文杰;叶欣;付涌水;陈扬凯;邓晶;丁浩强;罗广平;许茹 刊期: 2009年第05期

  • 尼妥珠单抗联合化疗药物对人结肠癌细胞株LoVo的实验研究

    目的 探讨表皮生长因子受体(EGFR)的单克隆抗体尼妥珠单(nimotuzumab,h-R3)与化疗药物联合对结肠癌细胞株LoVo的作用.初步探讨其可能的作用机制.方法 采用MTT法测定不同药物单药、两药联合分别对结肠癌细胞株LoVo的IC50值;计算不同药物联合的q值,以确定药物联合的作用;流式细胞仪检测不同药物单药或者联合对细胞周期分布及凋亡比例的影响.结果 联合h-R3能显著提高伊立替康对LoVo细胞的细胞抑制率.诱导更多肿瘤细胞发生凋亡以及产生G0/G1期、G2/M期阻滞,与5-氟尿嘧啶联合具有类似的作用,但较伊立替康不明显,而与奥沙利铂联合无明显增效作用.结论 h-R3通过协同或相加作用提高伊立替康、氟尿嘧啶的细胞杀伤作用,其机制与促进细胞凋亡和影响细胞周期分布有关,奥沙利铂联合对LoVo细胞无明显增效作用.为进一步的体内及体外实验提供了一定的指导作用.

    作者:李小燕;曹梦苒;吕成伟;郑大勇;苏宁;罗荣城 刊期: 2009年第05期

  • 韶关市1956-2007年白喉流行病学及免疫学效果分析

    目的 了解韶关市白喉流行趋势,评估流行病学及免疫学效果,制定针对性措施防止白喉疫情的反复.方法 采用描述流行病学方法.从流行病学、血清学等角度分析白喉流行病学及免疫学效果.结果 随着疫苗接种率的提高,人群免疫水平达到并维持较高水平,白喉发病率自1959年的48.13/10万降至1989年的0.07/10万,1991年报告后1例白喉病例,死亡率由6.19/10万降至1987年的0.02/10万,并经17年的流行病学、免疫学监测及法定传染病漏报调查证实,该市连续17年无白喉病例报告,成本效益比为1:12.53.结论 韶关市在疫苗高接种率的干预下,实现了消除白喉的目标,社会及经济效益显著.但仍需继续做好免疫接种及监测工作,加强成人发病研究,严防白喉重新流行.

    作者:胡国超 刊期: 2009年第05期

  • 微创治疗在子宫肌瘤中的应用

    子宫肌瘤是女性生殖系统常见的良性肿瘤.近年来,以腹腔镜和官腔镜为代表的微创技术在子宫肌瘤治疗的应用中逐渐普及,如腹腔镜子宫切除术、腹腔镜子宫肌瘤切除术、官腔镜子宫肌瘤切除术,以及近年来越来越受到重视的阴式子宫切除术、阴式子宫肌瘤剔除术及子宫动脉栓塞术等.上述手术具有刨伤小、患者痛苦少、恢复快、住院时间短等优点,但适应证、手术方法、并发症又各不相同.

    作者:陈江鸿;陈国伟 刊期: 2009年第05期

  • 辣椒素受体介导氯喹引起的搔痒

    目的 研究辣椒素受体(VR1)在氯喹引起搔痒中的作用及机制.方法 实验分4个部分,分别研究辣椒素受体拮抗剂辣椒平腹腔注射、局部应用辣椒素使VR1脱敏感、局部注射PKA抑制剂H89或PKC抑制剂bisindolylmaleimide Ⅰ、重复肥大细胞脱颗粒后颈背部注射氯喹200μg/100 μl 30 main内引起搔痒的次数,分为9小组,共使用6周龄C57BL/6J雄性小鼠63只.结果 腹腔内注射辣椒平、局部应用辣椒素与重复肥大细胞脱颗粒均明显抑制氯喹引起的搔痒,而H89与BIM对氯喹引起的搔痒均无明显作用.结论 氯喹通过肥大细胞脱颗粒引起搔痒,而辣椒素受体介导了氯喹引起的搔痒.

    作者:季文进;魏涧琦;梁杰贤;赵国栋;李真;李红英 刊期: 2009年第05期

  • 二甲双胍联合达英-35改善多囊卵巢综合征内分泌紊乱的探讨

    目的 探讨多囊卵巢综合征(PCOs)患者治疗过程中单一用药和联合用药对降低体重、提高排卵率和妊娠率有无差异.方法 将确诊为PCOS的患者56例随机分为3组,第1组单用达英-35治疗,第2组单用二甲双胍治疗,第3组联用达英一35和二甲双胍治疗,治疗3个月.分析患者在治疗前后血清中FSH、LH、T、FSH/LH、Ins的含量以及BMI、排卵率、妊娠率的变化.结果 联合用药治疗组的排卵率和妊娠率均显著高于单一用药组(P均<0.01),PCOS患者BMI、血清T的下降差异亦有统计学意义(P均<0.05),而血清P3H、LH含量的变化则无明显差异(P均0.05).结论 联合用药治疗PCOS患者在提高排卵率和妊娠率、降低体重指数、降低雄激素含量方面比单一用药的效果好.

    作者:廖再成 刊期: 2009年第05期

  • 小鼠肝细胞核磷酸化蛋白质组的提取和双向电泳分离

    目的 提取小鼠肝细胞核磷酸化蛋白并利用双向凝胶电泳分离小鼠肝细胞核磷酸化蛋白.方法 提取小鼠肝细胞核蛋白并利用金属磷酸盐亲和层析树脂纯化出磷酸化蛋白后,进行一维等电聚焦分离和二维聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,并挑选其中一个蛋白斑点进行质谱分析.结果 成功提取了肝细胞核磷酸化蛋白,通过双向凝胶电泳分离技术成功建立了小鼠肝细胞核磷酸化蛋白质组图谱.质谱鉴定结果证实被挑选蛋白斑点是小鼠核磷酸化蛋白.结论 磷酸化蛋白纯化技术结合二维凝胶电泳分离技术是研究肝细胞核磷酸化蛋白质组的有效方法,为进一步全面研究和鉴定小鼠肝细胞核磷酸化蛋白的功能打下了基础.

    作者:夏高晓;李红梅;陈丽;赵明哲;胡水旺;王继刚;孙明晶;邓鹏;刘靖华;姜勇 刊期: 2009年第05期

  • 广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株E基因序列分析

    目的 测定广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株的E基因序列并进行分析.方法 收集广州市2006年登革热患者急性期血清,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR法扩增全长E基因,测定序列并绘制系统发生树,进行生物信息学分析.结果 59份标本中38份病毒分离培养阳性,获得广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株GZ2006/1707的E基因序列,其同源性与东南亚缅甸、泰国、柬埔寨等地的流行株接近,但与广州市2002年Ⅰ型登革病毒流行株GZ2002/281较远.结论 广州市2006年流行的登革病毒属输入性,但与2002年流行的登革病毒有不同的输入源.

    作者:吴新伟;蒋力云;伍业健;罗雷;何丽娟;刘于飞;李向忠;王玉林 刊期: 2009年第05期

  • 初发2型糖尿病患者颈动脉内中膜厚度与各代谢指标的关系

    目的 探讨初发2型糖尿病(T2DM)人群中颈动脉内中膜厚度(IMT)与各代谢指标的相关关系,探寻动脉粥样硬化的危险因素.方法 选择正常对照组(NC)44例、糖耐量正常的单纯肥胖组(Ob)42例、新诊的2型糖尿病患者60例.所有对象于清晨空腹测量身高、体重、腰围、臀围、血压,计算体重指数(BMI)和腰臀比(WHR);空腹检测各组生化指标,并同时行糖耐量试验(OGTT),检测OGTT中0、30、60、120 min各时点血糖及胰岛素值,利用Bergman小模型技术计算胰岛素敏感指数(ISI);并以高分辨率彩色血管多普勒超声检查颈总动脉(CCA)内中膜厚度.结果 IMT值T2DM组较NC组(P<0.01)及0b组显著升高(P<0.05).所有初发T2DM患者,IMT与年龄、甘油三酯(TC)、低密度脂蛋白(LDL-C)、餐后2 h血糖(2hPG)及ISI呈正相关(P<0.05~0.01);与BMI、腰围呈负相关(P<0.05).在校正年龄、性别因素的影响后,IMT与BMI、腰围、TC、LDL-C及ISI无显著相关,与2hPG呈显著相关r=0.461,P<0.001).结论 2hPG是初发T2DM人群早期动脉粥样硬化(AS)的独立危险因素,降低2hPG有望改善T2DM人群的血管功能.

    作者:李晓莉;林小波;谢乃强;苏建平;伍华 刊期: 2009年第05期

  • 乙肝病毒前S1抗原时间分辨荧光免疫分析试剂盒的研制

    目的 利用时间分辨荧光免疫分析(TRFIA)技术建立乙型肝炎病毒前S1抗原的检测试剂盒.方法 应用双抗体夹心法建立乙肝preS1抗原TRFIA检测试剂盒,对试剂盒的各项性能指标进行评估.结果 对280份血清样本进行检测并与国产酶联免疫法试剂盒对比,结果显示自制试剂盒的特异性更好;200份正常人血清样本检测结果表明,该试剂盒的cutoff值=阴性对照荧光值×4.5.用自制质控品检测分析内和分析间的精密度分别为3.4%~7.8%,6.9%~8.4%;检测HBsAg及HBeAg无交叉反应.结论 试剂盒各项指标均达到临床检测要求,TRFIA法精密度和特异性有较大提高,可替代酶免法试剂盒.

    作者:胡妮娅;董志宁;周卓龙;李明;吴英松 刊期: 2009年第05期

  • 大肠埃希菌O157:H7 Tir基因的生物信息学分析

    目的 扩增和测序肠出血型大肠埃希菌O157:H7 tir基因,利用生物信息学预测分析其结构和功能特征.以探讨Tir作为疫苗候选抗原的可能性.方法 利用PCR技术扩增咖基因并测序,应用生物信息学网站在线分析工具和vector NTI suite软件分析Tir蛋白结构和生物学功能,预测B细胞抗原表位.结果 该基因全长1 674 bp,编码558个氨基酸,蛋白质总体亲水性高,有稳定的理化性质.含有3个结构和功能域,两段穿膜结构,多个磷酸化位点,预测20个B细胞线性表位.结论 Tir毒力因子是很有前景的疫苗候选抗原,为肠出血型大肠埃希菌O157:H7的疫苗研究提供了理论依据.

    作者:王玲;龙北国;胡黎平;罗军;陈健文;范宏英 刊期: 2009年第05期

  • 子痫前期患者白细胞介素-8和胎盘生长因子的表达及其意义

    目的 通过检测子痫前期患者羊水中白细胞介素-8(IL-8)和胎盘组织中胎盘生长因子(PLGF)的水平,以探讨IL-8和PLGF在子痫前期发病中的作用.方法 采用酶联免疫吸附法和免疫组化法分别测定20例轻度子痫前期患者,22例重度子痫前期患者和30例正常妊娠妇女(对照组)的羊水中IL-8和胎盘组织中的PLGF的表达.结果 子痫前期轻度组及重度组羊水IL-8均高于对照组,重度组羊水IL-8显著高于轻度组,差异均有统计学意义(P<0.01).子痈前期轻度组及重度组胎盘组织中PLGF表达量均低于对照组(P<0.01),而重度组低于轻度组(P<0.01).子痫前期轻、重度组及对照组胎盘组织中PLGF表达量与羊水IL-8水平均呈高度负相关(P<0.01).结论 子痫前期患者羊水中IL-8增高,而胎盘组织中PLGF表达下降,可能与子痫前期的发生、发展有关.

    作者:吴雪琴;赵勇;朱小芳;李玉芳;许瑞环 刊期: 2009年第05期

  • 3起老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

    目的 分析3起发生在老人院内的诺如病毒胃肠炎局部暴发疫情的流行特征,为今后预防类似事件的发生提供参考依据.方法 收集2007年佛山市老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情现场流行病学调查报告,采用描述性流行病学方法对疫情调查处理情况进行分析.结果 2007年佛山市共报告3起老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情,共发病56例,无死亡病例;疫情集中发生在2~3月份:每起疫情均从部分患者粪便标本中检测诺如病毒Ⅱ型核酸;3起疫情主要以人-人密切接触的途径传播.结论 早发现、早报告、早处理疫情,以及日常加强院内卫生,强化护工的规范操作,是预防和控制诺如病毒胃肠炎在老人院发生的关键.

    作者:梁自勉;李艳容;黄祖星 刊期: 2009年第05期

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