学术投稿

生物信息学中的基因序列分析软件

马晓冬;马安德

关键词:人类基因组计划, 生物信息学, 开放阅读框架
摘要:近年来,随着人类基因组计划的实施,极大的推动了生物信息学的发展.随之而来的大量核酸和蛋白质数据的积累及分析这些数据中所蕴涵的生物学意义成为生物学的主要任务.这样,大量的基因组数据不得不借助生物信息学技术进行自动分析和处理,如利用开放阅读框架(Open Reading Fram)检测算法自动寻找基因组DNA序列中的基因;对蛋白质、核苷酸数据库进行类似性检索或同源性检索等[1].相应的,生物信息学各个领域中的软件层出不穷,已广泛用于基因序列数据的获取、处理、分析和管理,并得到不断的改进和完善.本文研究观察了一些本地计算机上运行的基因序列处理、分析软件,目的在于帮助生物学研究者选择有效的基因序列分析工具.
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    作者:李永志;孙清晨;贾立刚 刊期: 2004年第08期

  • 心力衰竭的流行病学现状

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    作者:刘彤;李志忠;杜昕;马长生 刊期: 2004年第08期

  • 激光对不同类型中心性浆液性脉络膜视网膜病变的疗效比较

    目的探讨激光对不同类型中心性浆液性脉络膜视网膜病变(central serous chorioretinopathy,CSC)疗效的比较.方法用多波长氪离子激光治疗仪黄色激光治疗渗漏点型CSC 26例26眼,色素上皮失代偿型CSC 24例24眼.随访视力、中心视野及FFA.结果2组病例激光治疗后视力都很快提高,术后1个月及2年视力与术前比较均有非常显著差异,所有病例视野均有好转,灰度值减少与术前比较有非常显著差异.2组间比较无论是视力还是视野渗漏点组都较色素上皮失代偿组恢复更好,差异有显著性.2年间2组分别有1例及2例复发病例,经检验差异无显著性.结论激光治疗渗漏点型CSC较色素上皮失代偿型CSC有更好的效果.

    作者:沈伟;蔡琴华;吴燕琴;李龙标 刊期: 2004年第08期

  • 肺炎后期阴虚火旺不寐治验

    肺炎,尤其重症者,常可导致全身感染中毒和缺氧,出现中枢神经系统症状,如阵发性烦躁不安,甚至整夜不寐、哭闹、尖叫、多汗等.上述症状西医治疗以镇静为原则,常用一些镇静药物来解除症状,有的患儿一夜曾用3次镇静药物也只能睡1-2h,甚至完全无效,束手无策.近我们对这些患儿用祖国医学辨证施治,给予中药治疗,取得较好效果,现将有代表性的2例报道如下.

    作者:樊静 刊期: 2004年第08期

  • 急诊服毒病人的特点及急救医德要求

    生物、心理、社会医学模式揭示了这样一个真理:医德是一种特殊的社会意识现象,医德对于被防治者的心理状态具有直接的和重要的影响,而心理状态又直接影响着被防治者的疾病和健康.因此,探讨急诊服毒病人的特点及急救医德要求是十分必要的.

    作者:白成敏;姚伟英;陈维军 刊期: 2004年第08期

  • 肱骨干骨折外固定术术后康复护理

    肱骨干骨折可由直接暴力或间接暴力引起,主要表现为上臂出现疼痛,肿胀,畸形,皮下瘀斑,上肢活动障碍.若合并桡神经损伤,可出现垂腕,各手指掌指关节不能背伸,前臂旋后障碍,手背桡侧皮肤感觉减退或消失.针对此临床表现,我科室采用外固定术式治疗了20例患者,经过医护人员精心护理,取得满意的疗效,现报告如下.

    作者:徐金萍 刊期: 2004年第08期

  • 交通事故伤骨盆骨折伴尿道损伤的急救护理(附74例报告)

    骨盆骨折泌尿系损伤多因强大暴力导致骨折片的锐性损伤所致,其中严重挤压伤及车祸伤是常见原因.由于尿道接近耻骨联合和耻骨支,游离骨片容易刺伤尿道.骑跨伤常可导致耻骨联合分离或挤压尿道骨盆内环软组织上形成一个侧向撕拉力,从而造成通过尿生殖膈的膜部损伤,形成腹膜后血肿或合并腹腔内脏器损伤,伤情危重治疗护理难度大.

    作者:张琼;陶根惠 刊期: 2004年第08期

  • 肺栓塞40例临床诊断及治疗

    目的分析40例肺栓塞的临床特点,提高对肺栓塞的认识.方法回顾分析40例肺栓塞病人的病因、症状、体征和实验室检查结果.结果下肢深静脉血栓是肺栓塞发生的重要原因.结论肺栓塞是一种误诊率很高的疾病,核素肺通气/灌注扫描具有很高的诊断价值,及时诊断和溶栓治疗是改善预后的关键.

    作者:马文英;于连凤 刊期: 2004年第08期

  • 医学院校医学物理学课程体系改革的研究和实践

    物理学是关于自然界基本形态的科学.由于物理学所研究的物质运动形态和运动定律具有基本和普遍的性质,使得物理学的基本知识成为研究其他自然科学所不可缺少的基础,医学也不例外.医学物理学是将物理学的理论、方法和技术应用于医学而形成的一门边缘学科.它的出现大大提高了医学教育水平,促进了临床诊断、治疗和康复手段的改进和更新进程,所以是医学院校一门非常重要的必修基础课程.但是,现有医学院校使用的医学物理学教材内容较多较杂,程度深浅不一.

    作者:谭小丹;刘国庆;田辉勇 刊期: 2004年第08期

  • CT导引下肾囊肿硬化治疗的护理

    肾脏囊性病变是常见的良性先天性病变.小的无症状不需治疗,大囊肿或有症状的需治疗,以往采用手术治疗.其损伤大,容易出现并发症且治疗费用较高,手术治疗主要用于囊肿较大,伴有出血、感染或穿刺治疗效果不好的囊肿[1].我院CT室自1994年3月-2004年1月对278例肾囊肿患者行CT经皮穿刺囊肿抽吸,并注入无水酒精硬化治疗肾囊肿,在治疗过程中无一例并发症.

    作者:张静;周晓明;刘炜 刊期: 2004年第08期

  • 急性心肌梗死病人T波交替变异性与心脏功能关系的研究

    目的研究心肌梗死(AMI)病人T波交替变异性(TWA)与心脏功能及其他因素的关系.方法对71名AMI病人进行TWA,TWA导联数目,左室射血功能(LVEF),磷酸肌酸激酶心肌同工酶(CK-MB)检测,同时对临床上恶性室性心律失常(室速,室颤)的发生进行观察.根据LVEF将病人分为二组;LVEF<50%(Ⅰ组)和LVEF≥50%(Ⅱ组),比较二组各指标的差异.结果二组病人在LVEF有显著差异的情况下(43.1±5.6%vs63.1±8.2%,P<0.05),Ⅰ组的TWA,TWA导联数目,CK-MB峰值及达到CK-MB峰值的时间均分别显著高于Ⅱ组(3.5±3.7vs1.7±2.7;11.9±9.2vs7.5±7.6;120.8±94.4IU/mlvs65.9±36.9IU/ml:17.3±7.5hvs12.6±3.3h,P<0.05);同时临床上恶性心律失常事件的发生率Ⅰ组也显著高于Ⅱ组(24.1%vs7.1%,P<0.05).结论AMI病人的TWA与LVEF及CK-MB的释放量有密切关系,TWA和LVEF均为预测室性心律失常的有力因子,表明AMI病人的LVEF越低,易形成TWA,引发恶性心律失常.

    作者:魏妤;赵文淑;林向敏;崔亮;顼志敏;杨舒玲 刊期: 2004年第08期

  • 强化法律意识加强安全护理管理预防护理纠纷

    随着国民经济的发展,人民的科学文化素质的不断提高,维护自身权益的法律意识也在逐渐增强.近年来,关于护理纠纷及投诉亦有所增加.如何从管理着手,加强安全护理,强调自我保护意识,重视内涵建设,完善管理措施,防范护理纠纷已成为当前护理管理中的重要内容.现将护理实践中如何强化安全管理,确保安全护理的做法报告如下.

    作者:张建秀;王光红 刊期: 2004年第08期

  • 干扰素治疗病毒性疾病

    干扰素是一组体内存在的、有广泛生物活性的微量调节蛋白,它具有广谱抗病毒,抗细胞增殖和免疫调节活性,已广泛应用临床.本文就其分类、性能及病毒性疾病的治疗作用作一般综述.

    作者:路洪玲 刊期: 2004年第08期

  • 脑包虫病诊治体会

    脑包虫病少见,其发病率仅占全部包虫病的1%-2%.脑包虫病以包虫囊肿多见,脑泡球蚴病较为罕见,我科1993年-2003年收治的脑包虫病15例.

    作者:哈米提;王桂林;叶尔兰 刊期: 2004年第08期

  • 血管重建术治疗糖尿病下肢缺血的探讨

    目的探讨糖尿病动脉硬化造成下肢肢体缺血濒临截肢的外科治疗体会和可行的治疗方案.方法自2001年1月-2003年12月收治糖尿病合并严重下肢缺血病例33例,术前平均踝肱指数(ABI)=0.27,对其中28例31条肢体进行血管重建术,其中人工血管旁路术27条肢体,自体大隐静脉旁路术4条肢体.结果手术后均可及足背或胫后动脉搏动,术后平均ABI=0.88,2例术后24h血管通路阻塞,再次行手术取栓及血管重建术.术后随访2-30个月,一期通畅率82.8%,再次手术后总通畅率93%.结论糖尿病伴有严重下肢缺血造成下肢肢体濒临截肢,血管重建术仍为抢救肢体、降低截肢平面的有效方法.

    作者:严立;郁正亚 刊期: 2004年第08期

  • 高频喷射通气辅佐治疗重症肺部疾病的体会

    高频喷射通气(HFJV)技术出来以来,国内外做了大量有关实验研究的临床观察,它以近于或小于正常潮气量和较高频率进行通气,能有效的提高血氧浓度,改善缺氧状况.目前国内外多采用气管插管的方式进行通气,由于其操作繁琐,使应用受到一定限制.我科使用的JN-Ⅲ(DL)型高频喷射呼吸机,采用普通鼻导管连接,进行氧疗,辅佐治疗小儿重症肺部疾患,取得了明显的效果.为使高频通气在临床上充分发挥作用,本文介绍对30例中、重度缺氧患儿HFJV前后做了经皮无创血氧饱和度(Tcso2)监测的比较,指导临床选择合适的驱动压和频率,避免以往的盲目性,可作为判断氧疗效果的一项可靠指标,通过此项监测,也可充分证明,高频喷射通气对各种小儿肺部疾病所致的低氧血症,以及一般状况的改善,效果非常明显,为其它治疗发挥作用,争得了宝贵的时间.

    作者:陈莉平 刊期: 2004年第08期

  • Pilon骨折36例治疗体会

    Pilon骨折是指波及踝关节的胫骨下三分之一骨折.我们自1996年2月-2003年6月共收治36例,现报告如下.

    作者:徐德太;李言杰;史璞章 刊期: 2004年第08期

  • 一氧化碳中毒引起ST-T变化及阵发性房性心动过速

    1临床资料病例1,患者,女,39岁,于2003年11月20日急诊入院.入院查体:嗜睡状态,呼吸浅弱,口唇稍樱红,脉快而弱,血压偏低,心律规整,率约100次/min,心音稍低钝.心电图示:心率100次/min,P-R 0.19s,QT0.34s,STⅡ、Ⅲ、aVF下移0.1mV,T波浅倒.

    作者:管文博;姜建勇 刊期: 2004年第08期

  • 碱性成纤维细胞生长因子在大鼠肝组织中的表达及其与肝纤维化的关系

    目的研究四氯化碳(CCl4)损伤大鼠肝组织中碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)的表达及其与肝纤维化的关系.方法用CCl4诱导大鼠肝纤维化模型,分别检测其血清谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、Ⅲ型前胶原(PCⅢ)、透明质酸(HA)的含量.肝组织中bFGF表达采用免疫组化ABC法标记.结果bFGF表达的强度及范围与肝内炎症及血清纤维化指标密切相关.结论bFGF在肝纤维化的发展过程中起着重要的作用.

    作者:丁体龙;马勇;严家春;张文学;于莉 刊期: 2004年第08期

  • 贲门、食管癌术后吻合口狭窄的胃镜下扩张治疗(附30例分析)

    目的总结探讨贲门、食管癌术后吻合口狭窄胃镜下扩张治疗的远、近期效果,以及并发症发生.方法采用日本奥林巴斯电子胃镜及国产硅胶探条,通过对30例贲门、食管癌术后病人吻合口狭窄扩张治疗观察分析.结果本文30例病人中多数效果良好,部分病人进食困难症状缓解,解决了外科手术后患者进食困难问题,无并发症发生.结论该方法近期效果显著,远期效果稳定,方法简便易行而且安全.

    作者:王先训 刊期: 2004年第08期

中华实用医学杂志

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