学术投稿

生物信息学辅助克隆和分析人GLUT-9基因启动子

林绍鹏;潘速跃

关键词:生物信息学, GLUT-9, 启动子, 转录调控
摘要:目的:对人GLUT-9基因5'-非翻译区进行克隆,并对其启动子和转录调控区进行生物信息学分析,为后续的GLUT-9基因的转录调控研究奠定基础.方法:通过搜索网络数据库,得到GLUT-9基因翻译起始点上游约2 kb的序列.以人总DNA为模板,采用PCR方法进行序列克隆.运用BDGP:Neural NetworkPromoter Prediction软件对上述序列进行分析,预测出该段序列可能的启动子区域;运用TFSEARCH软件分析潜在的转录因子结合位点.结果:人GLUT-9基因的启动子可能位于转录起始点上游反义链的-550到-503区,序列上存在包括CdxA、SRY和Lyf-1等12个转录因子的潜在结合位点.结论:克隆得到人GLUT-9基因5'-非翻译区2 kb的序列,对人GLUT-9基因启动子和5'-非翻译区调控区序列进行了初步的生物信息学分析,为后续试验提供了研究基础.
实用医学杂志相关文献
  • 利多卡因联合地佐辛预防苏醒期躁动的临床观察

    目的:观察全麻患者在手术结束前20 min静脉注射地佐辛及气管导管内滴入利多卡因预防苏醒期躁动的效果.方法:60例择期开腹手术全麻插管患者,随机分为实验组(A组)和对照组(B组)各30例:A组术毕前20 min气管导管内滴入2%利多卡因1 mg/kg及静脉注射5 mg/2 mL地佐辛;B组术毕前20 min气管内滴入及静脉注射等容量生理盐水.观察术后苏醒时间、拔管期间呛咳反射程度、拔管后10 min疼痛视觉模拟评分(VAS)和拔管即刻躁动RSS评分.结果:术后苏醒时间,A组与B组之间差异无统计学意义(P>0.05);拔管期间呛咳反射程度、VAS评分和拔管即刻躁动RSS评分,A组与B组之间差异有统计学意义(P<0.05).结论:手术结束前20 min静脉注射地佐辛及气管内滴入利多卡因能够减低苏醒期躁动的发生率.

    作者:王长明;关占颖;蔡长华;张静;杨德荣;肖勇 刊期: 2013年第18期

  • 椎间盘镜和小切口手术治疗腰椎间盘突出症的对比研究

    目的:探讨比较椎间盘镜(micro endoscopic discectomy,MED)和小切口手术治疗椎间盘突出症的近期疗效.方法:比较椎间盘镜椎间盘手术(MED组)和小切口椎间盘髓核摘除术(小切口组)各52例患者的手术时间、术中出血量、术后下地时间、平均住院时间、Oswestry功能障碍指数(0swestry disability index,ODI)、VAS评分(visual analogue scale,VAS)、JOA评分(Japanese orthopedics association,JOA).结果:MED组的术中出血量、平均住院时间及下地时间少于小切口组,手术时间多于小切口组.两组患者手术前后的JOA值、VAS评分和ODI值均差异没有显著性.结论:椎间盘镜和小切口椎间盘髓核摘除术治疗椎间盘突出症的手术疗效差异无显著性,他们之间各有优缺点,需根据患者情况及医院条件选择恰当的手术方法.

    作者:杨泽龙;冯大雄;林宏;苟林;向勇;白亦光;冯刚 刊期: 2013年第18期

  • 预存式自体输血对结直肠癌患者围术期细胞免疫功能的影响

    目的:观察预存式自体输血对结直肠癌患者围术期细胞免疫功能的影响.方法:选择直肠癌、结肠癌ASA Ⅰ ~Ⅱ级患者40例,随机分为预存式自体输血组(P组)和异体输血(H组),每组20例.P组患者于手术前1周采血400 mL;H组患者手术前配悬浮红细胞2 U(400 mL),两组均于手术中止血完毕后输入.两组病例均在麻醉诱导前、输血前、手术后第1天、手术后第5天分别抽取静脉血,以流式细胞仪测定T淋巴细胞亚群CD3+、CD4+、CD8+和NK细胞数量的变化,并计算CD4+/CD8+比值.结果:两组输血前CD3+、CD4+、CD4+/CD8+和NK细胞数量均较麻醉前明显下降.术后1dH组继续下降,P组开始恢复,但仍低于术前水平.术后第5天P组恢复至麻醉前水平,H组继续降低至明显低于正常水平,与麻醉前比较差异有统计学意义(P<0.05).结论:预存式自体输血可以显著恢复结直肠癌患者围术期细胞免疫功能.

    作者:屈常伟;骆喜宝;刘志贵;陈燕;卜文豪 刊期: 2013年第18期

  • 经导管栓塞治疗医源性损伤性假性动脉瘤

    医源性损伤性假性动脉瘤并不少见,传统治疗多以外科手术和经动脉导管栓塞术为主,但其适应证较局限,且存在定位困难、操作复杂、损伤性大、疗效不确定等不利因素[1-2].我科2001年7月至2012年10月共介入栓塞治疗各种医源性损伤性假性动脉瘤23例,取得了较好的疗效,现报告如下.1 资料与方法1.1 一般资料本组23例,男15例,女8例,年龄25~74岁,平均46岁.其中肝破裂修补术后持续低血压致休克1例,肝段切除术后3例,胆囊切除术后3例,胃及十二指肠球部手术后5例,经皮肾镜取石术后出血7例,气管镜活检术后大咯血1例,下肢骨折内固定术后3例.所有患者均有不同程度出血征象,其中18例表现为大出血.

    作者:陈华;段杨军;黄新阶 刊期: 2013年第18期

  • 腹腔镜后联合诺雷德综合治疗卵巢囊肿的临床疗效分析

    目的:探究腹腔镜术后联用诺雷德治疗卵巢巧克力囊肿的治疗效果.方法:选取我院2005-2010年间我院妇产科收治的192例卵巢巧克力囊肿患者为研究对象,诺雷德组96例患者行腹腔镜下卵巢囊肿剔除,术后加用诺雷德治疗;孕三烯酮组96例术后予孕三烯酮治疗.监测患者术后激素水平变化并观察两组患者疗效、卵巢囊肿复发率、妊娠率及副作用的情况.结果2诺雷德组E5水平明显低于孕三烯酮组(P<0.05);孕三烯酮组治疗有效率为65.22%,明显低于诺雷德组的80.43%(P< 0.05);孕三烯酮组复发率达41.30%,明显高于诺雷德21.74% (P< 0.05);孕三烯酮组妊娠率44.44%低于诺雷德组的62.32% (P<0.05).结论:腹腔镜术后联用诺雷德治疗卵巢巧克力囊肿,术后雌激素控制在低水平且较稳定,停药后可恢复;卵巢囊肿复发率低,受孕率高,疗效好,副作用少,安全可靠,推荐临床使用.

    作者:周晓宁;万淑梅 刊期: 2013年第18期

  • 对管道患者的照顾者实施健康教育的方法与效果

    目的:探讨对管道患者的照顾者进行有效健康教育的方法.方法:将146例放置管道患者的照顾者随机分为对照组与实验组,对照组给予传统方式健康教育,实验组在此基础上采用书面健康资料阅读、影像图片、操作演示的方式开展健康教育.评价两组照顾者护理能力和管道并发症情况.结果:实验组照顾者管道知识问卷得分显著高于对照组(P<0.05);常见管道并发症低于对照组.结论:对管道患者的照顾者进行有效健康教育,提高照顾者护理能力,可以弥补由于特殊时间段护士人手少,管道患者无法得到全程监护的缺陷,充分调动家庭支持作用,减少管道并发症的发生.

    作者:杨红莉;张树桐 刊期: 2013年第18期

  • 新疆地区溃疡性结肠炎发病的相关危险因素分析

    目的:探讨溃疡性结肠炎(UC)发病可能的危险因素.方法:经结肠镜检查和病理活检确诊的101例初发型UC患者为病例组,以同期结肠镜检查为正常肠黏膜的非结肠疾病患者101例作为对照组,采用问卷调查的方式采集人口统计学资料、生活方式、饮食习惯等信息,对可能与UC发病相关的11个变量行单因素分析,对差异有统计学意义的变量行多因素Logistic回归分析.结果:单因素分析显示,对于男性患者饮酒、吸烟、油腻饮食、肠道感染、精神紧张、牛奶摄入6个变量与UC发病有关,多因素Logistic回归分析显示偶尔摄入牛奶(P=0.011,OR=4.269,95%CI:1.404~12.976)为男性UC发病的危险因素,吸烟(P=0.003,OR=0.081,95%CI:0.015 ~ 0.431)可能是男性UC发病的保护因素;而对于女性患者油腻饮食、精神紧张、牛奶摄入3个变量与UC发病有关,多因素Logistic回归分析显示精神紧张(P=0.012,OR=4.421,95%CI:1.380~14.161)、偶尔摄入牛奶(P=0.006,OR=4.029,95%CI:1.492~10.878)为女性UC发病的危险因素.结论:牛奶摄入、精神紧张可能是UC的致病危险因素,而吸烟可能是UC发病的保护因素.

    作者:何玉环;高峰;卢加杰;艾合买江;李月娴 刊期: 2013年第18期

  • 液基细胞学、阴道镜下活检及LEEP术联合对宫颈上皮内瘤变诊治的临床价值

    目的:探讨液基细胞学、阴道镜下活检与LEEP术在诊治宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)中的价值.方法:回顾性分析近3年来,在我院妇科门诊行LEEP手术的CIN患者560例,对比研究液基细胞学检查(thinprep cytology test,TCT)、阴道镜下活检及LEEP术后病理结果的差异及符合情况.结果:细胞学与阴道镜活检结果符合率LSIL 30.8%(45/146),HSIL 84.2%(133/158).TCT检查HSIL病理符合率高于LSIL,差异具有统计学意义(P<0.05).TCT检查结果为ASC-H活检病理CINⅡ和CINⅢ的比率高于ASCUS患者,差异具有统计学意义(P<0.05).阴道镜下活检病理与LEEP术后标本病理符合率:总符合率为57.9%,CIN Ⅰ符合率为42.1%,CINⅡ为61.5%,CINⅢ为73.7%.CIN级别越高,符合率随之升高,其有统计学意义(P<0.05).结论:LEEP术是一种能够准确诊断CIN病变的较好方法,其弥补了液基细胞学与阴道镜下活检的局限性和盲目性,三者联合使宫颈癌前病变的诊断和治疗更加完善,减少漏诊、误诊率.

    作者:赵虹;潘惠艳;卢丹;王雁;吴玉梅;张为远 刊期: 2013年第18期

  • 2-BFI对实验性自身免疫性脑脊髓炎大鼠脊髓内IFN-γ、TNF-α的影响

    目的:探讨2-BFI对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)大鼠脊髓内IFN-γ和TNF-α的影响.方法:50只雌性SD大鼠随机分为5组,对照组、EAE组、低、中、高剂量2-BFI干预组,每组10只,采用豚鼠脊髓匀浆(GPSCH)免疫诱导SD大鼠建立EAE模型,观察每组大鼠发病情况;采用HE染色观察中枢神经系统(CNS)的病理变化,对其炎症浸润程度加以评分;ELISA法测定颈髓IFN-γ和TNF-α含量.结果:中剂量2-BFI组在EAE临床症状和病理学改变差异有统计学意义(P<0.05);中剂量2-BFI组脊髓内IFN-γ和TNF-α下降为显著(P<0.05).结论:中剂量2-BFI对EAE大鼠具有神经保护作用,其作用机制可能与2-BFI抑制了IFN-γ、TNF-α表达有关.

    作者:朱振国;黄艳君;王新施;陈艳艳;张元涛;郑荣远 刊期: 2013年第18期

  • 超声在抗环瓜氨酸抗体阳性的早期类风湿关节炎中的应用价值

    目的:探讨超声检查抗环瓜氨酸(CCP)抗体阳性的早期类风湿性关节炎(RA)患者关节炎性病变的价值.方法:对53例临床诊断的早期RA双腕及手指掌指关节(MCP)、近端指间关节(PIP)进行高频超声检查,比较抗CCP抗体阳性组与阴性组之间的不同.结果:本研究中抗CCP抗体阳性者29例,阴性者24例.超声检查两组均发现关节腔积液、滑膜炎(有滑膜增厚及滑膜内血流信号级>Ⅰ级)、腱鞘积液、软骨破坏及骨侵蚀.抗CCP抗体阳性组更易发现软骨破坏及骨侵蚀.抗CCP抗体阳性组超声发现骨侵蚀12例,以MCP受损为高发,1年后经X线随访观察,其中9例发现骨侵蚀.结论:超声检查早期RA的关节炎性病变具有优势,尤其是抗CCP抗体阳性患者的骨质侵蚀改变,可以对临床判断病情进展及远期预后提供更多依据.

    作者:陈洋;宗绍云;马惠;李芹;范洪涛 刊期: 2013年第18期

  • 剔除食物治疗在腹泻型肠易激综合征中的价值

    目的:观察食物不耐受在腹泻型肠易激综合征(IBS-D)发病中的作用,为IBS的防治提供理论依据.方法:选取符合罗马Ⅲ诊断标准的腹泻型肠易激综合征患者77例和健康对照组26例,采用酶联免疫吸附法测定血清中14种食物抗原的特异性IgG抗体,对检测结果阳性的IBS-D患者,剔除阳性食物治疗12周,观察其主要症状的变化情况.结果:腹泻型肠易激综合征组中有39例患者食物抗原的特异性IgG抗体升高,阳性率为50.65%,健康对照组为15.39%,两组间差异存在显著性(P<0.01).饮食治疗4周后,IBS-D患者的症状总评分由(9.06士2.06)分降至(6.40±2.57)分,8周后降至(4.54±2.59)分,12周后降至(3.60±2.58)分,与治疗前比较差异均有统计学意义(P<0.01).治疗12周,腹痛程度、腹痛频率、腹泻频率、腹胀程度、粪便性状、IBS总体症状评分均与治疗前差异有统计学意义(P<0.01).结论:食物特异性IgG抗体介导的体液免疫反应异常在IBS的发病机制中具有重要的作用,根据食物特异性IgG抗体剔除阳性食物治疗IBS-D是一种简便有效的方法.

    作者:郭虹;王金梁;江涛;常永超;马海军 刊期: 2013年第18期

  • OREM护理模式在原发性肝癌TACE围术期中的应用

    目的:探讨OREM护理模式在原发性肝癌TACE治疗中的应用.方法:将原发性肝癌行TACE治疗的100例患者随机分为对照组和观察组,每组各50例,对照组实施传统护理模式,观察组实施OREM护理模式,观察两组患者自我护理能力和术后并发症的发生情况.结果:两组患者在自我护理能力测评得分的比较中,观察组得分明显高于对照组,x2=6.15,P< 0.05,差异有统计学意义;术后并发症和不良反应的比较中,两组患者在栓塞综合症和骨髓抑制方面,差异无统计学意义,P> 0.05;在穿刺部位出血、腰背部疼痛、排尿困难的比较中,观察组的发生率明显低于对照组,P< 0.05,差异有统计学意义.结论:在原发性肝癌TACE围术期中的护理,OREM护理模式明显优于传统护理模式.

    作者:田素红;周士琦;陈雪梅;孙秀红 刊期: 2013年第18期

  • 金黄色葡萄球菌引发医院感染的分子流行病学特征

    目的:观察院内感染主要的金黄色葡萄球菌克隆及其特征.方法:从200例院内感染患者痰液分离出金黄色葡萄球菌样本,分析核糖基因型组成及特异的附属基因调节(agr)多态性和特有毒素.结果:200例样本中均未见万古霉素耐药性.不同的群体及不同的核糖基因型样本的抗生素耐药性不同,agrⅡ型等位基因是一种流行克隆,而agrⅠ型只存在于散发病例中.在68%的样本中发现LukD/LukE白细胞毒素基因.结论:流行的核糖基因型对于几乎所有的抗生素均敏感,其中没有LukD/LukE基因.因此可能有其他未发现的因素造成流行克隆的院内感染.

    作者:刘宝欣 刊期: 2013年第18期

  • 慢性阻塞性肺疾病患者肺组织和血清高迁移率族蛋白B1的表达

    目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织和血清中高迁移率族蛋白B1(HMGB1)的表达,及与TNF-α和IL-1β的相关性.方法:RT-PCR及免疫组织化学染色法检测24例肺叶切除术患者(COPD组和对照组各12例)肺组织中HMGB1的mRNA和蛋白表达.ELISA法检测同期COPD患者AECOPD组78例,COPD稳定期组40例及健康者40例血清中HMGB1、TNF-α和IL-1β水平.结果:COPD组肺组织中HMGB1平均光密度值和mRNA相对转录水平均显著高于对照组.AECOPD组和COPD稳定期组血清中HMGB1、TNF-α和IL-1β水平均显著高于对照组.AECOPD组血清中HMGB1与TNF-α和IL-1β水平均呈正相关.结论:HMGB1在COPD患者肺组织和血清中表达水平显著升高,提示可能参与COPD的炎症反应过程.HMGB1血清水平测定有助于反映COPD患者病情的严重程度.

    作者:杨晓敏;杨华 刊期: 2013年第18期

  • 红细胞体积分布宽度水平与危重症患儿预后的关系

    目的:探讨红细胞体积分布宽度(RDW)与危重症患儿预后的关系及其在危重症患儿疾病发生发展及预后中的临床意义.方法:分析186例危重症患儿,按预后分为存活组和死亡组,检查其RDW、血小板、危重症病例评分(PCIS).结果:死亡组中RDW较存活组明显升高(P=0.002),血小板、PCIS评分较存活组明显减少(P< 0.001).结论:患儿RDW愈高,预后愈差,RDW联合血小板、PCIS评分可评估危重症患儿的病情严重程度,对评估该类患儿预后有重要临床意义.

    作者:金伶;黄贤贵;龙兴江 刊期: 2013年第18期

  • 肝切除术中处理肝短静脉22例的经验

    涉及半肝切除、扩大半肝切除或累及肝尾状叶的肝脏肿瘤切除常常需要对肝短静脉进行处理,术中意外导致的凶险失血屡有发生[1],手术风险高,因而手术开展较为局限.我院自2007年1月至2011年12月对22例涉及半肝切除、扩大半肝切除或累及尾状叶的肝脏肿瘤切除患者实行解剖第三肝门的解剖,获得了较满意的效果,现报告如下.1 资料与方法1.1 一般资料 22例患者中男15例,女7例,年龄29~68岁,平均47.5岁.术前影像检查常规行CT增强扫描+血管三维成像,临床诊断为原发性肝细胞癌17例,肝血管瘤5例.主要位于肝Ⅴ~Ⅷ段12例,肝Ⅰ段4例,肝Ⅳ~Ⅷ段3例,肝Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ段3例,平均直径7.8 cm.

    作者:乔鸥;胡平海;金焰 刊期: 2013年第18期

  • 石家庄地区精子发生障碍患者发病原因分析

    目的:从染色体核型、Y染色体微缺失状况及性激素水平等方面分析石家庄地区精子发生障碍患者发病原因.方法:273例精子发生障碍患者临床表现为无精子症或严重少、弱精子症.取外周血进行染色体核型分析及性激素测定;同时,提取全血DNA,应用多重PCR反应技术,采用无精子因子区16个序列标签位点对所有患者进行Y染色体微缺失分析.结果:273例精子发生障碍患者中,检测出染色体核型异常者35例,异常率为12.82%.Y染色体存在微缺失患者24例,异常率为8.79%.另外,染色体与Y染色体微缺失同时异常的9例,占总样本3.3%,并且发现Y染色体微缺失与激素水平有很大相关性.结论:对于精子发生障碍患者的诊断和人工辅助生殖治疗,染色体核型分析和Y染色体微缺失的应该作为常规检查,激素水平可作为辅助检查.

    作者:张焕铃;甄秀丽;郑龙;张娜;连伟光;刘健敏;尤红煜;郭丽娜;乜照燕 刊期: 2013年第18期

  • 慢性阻塞性肺疾病合并不同类型房颤患者血浆脂联素与B型利钠肽前体及心功能的关系

    目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)合并房颤患者脂联素(APN)的变化及其与脑利钠肽前体(NT-proBNP)和左室射血分数(LVEF)的关系及临床意义.方法:146例研究对象中有COPD患者114例,分为窦性心律组(A组)30例、阵发性房颤组(B组)29例、持续性房颤组(C组)29例和永久性房颤组(D组)26例,另32例为对照组.检测患者血浆APN、NT-proBNP,并行心脏超声检查测定LVEF.结果:与对照组比,COPD患者血浆APN水平均显著升高(均P<0.05);D组血浆APN显著高于A组、B组和C组(均P<0.05).D组NT-proBNP显著升高,LVEF显著下降,与对照组、A组、B组、C组相比差异具有统计学意义(均P< 0.05).相关分析表明,血浆APN与NT-proBNP正相关(r=0.29,P<0.05),与LVEF负相关(r=-0.28,P< 0.05),NT-proBNP与LVEF负相关(r=-0.32,P<0.05).结论:COPD患者血浆APN水平升高可能与肺组织纤维化有关,房颤患者APN水平变化可能与房颤的持续状态有关,APN与NT-proBNP和LVEF一样,可能在心衰的诊断及危险分层中具有重要价值.

    作者:蔡静;李洁琪 刊期: 2013年第18期

  • 不同胰肠吻合方式胰十二指肠切除术后胰瘘发生率比较

    目的:分析不同胰肠吻合方式胰十二指肠切除术(pancreaticoduodenectomy,PD)后胰瘘发生情况,探讨胰瘘发生的主要原因.方法:总结我院1994年8月至2012年12月18年间540例胰十二指肠切除术后胰瘘的发生情况,按3种不同胰肠吻合方式进行分组,其中采用单纯套入吻合32例为A组;采用胰管空肠黏膜对端吻合363例为B组;套入加捆绑式胰肠吻合145例为C组,胰瘘的定义参照国际胰瘘研究组(ISGPF)诊断标准.结果:胰瘘总发生率为6.5%,其中A组为28.1%,B组为5.8%,C组为3.4%;总手术死亡率为2.0%,A组为21.9%,B组为0.8%,C组为0.7%,在发生胰瘘的病例中,A组主要为C级瘘,B、C组主要为A、B级瘘,胰瘘发生率A组与B组间差异显著(x2=17.85,P=0.00),A组与C组间差异同样显著(x2=18.65,P=0.00),B组与C组间差异无统计学意义(x2=1.165,P=0.28).结论:胰肠吻合方式的改进与完善以及熟练的手术技巧是降低胰瘘发生率的主要因素,加强手术前后综合治疗是防止胰瘘的重要保障.

    作者:张秋学;王铁功;刘汝海;李学锋;杨冬山;张磊;张执全;李凤山 刊期: 2013年第18期

  • 艾灸治疗术后疲劳综合征的随机对照研究

    目的:艾灸治疗术后疲劳综合征(POFS)的临床观察,探索治疗POFS的有效方法.方法:160例POFS患者随机1∶1分为两组,A组仅给予术后常规支持治疗,B组在术后常规治疗基础上给予艾灸治疗.检测两组转铁蛋白水平和观察比较两组疲劳程度(疲劳评分、心境评分,围手术期疲劳测评量表).结果:A组患者在术后3、7、14、30天的VAS、ICFS量表疲劳评分均较B组患者同期的疲劳评分高(P<0.05).术后B组的转铁蛋白值明显高于A组(P<0.05).结论:艾灸双脾肾俞、足三里能明显改善术后疲劳症状,促进术后胃肠功能的恢复,能改善术后营养状况.

    作者:梁雪芳;冯淑仪;温丹婷 刊期: 2013年第18期

实用医学杂志

实用医学杂志

主管:广东省卫生厅

主办:广东省医学情报研究所