马利阁；王凯；刘阳
目的 分析幽门螺杆菌感染与反流性食管炎之间的关系,为临床治疗提供科学依据.方法 选择2009年1月-2012年12月胃镜室行胃镜检查的明确诊断为反流性食管炎患者1 281例,根据2000年中华医学会消化病学分会提出的Tygatat分级标准,将所有反流性食管炎患者分为Ⅰ～Ⅴ级,比较不同分级反流性食管炎患者幽门螺杆菌感染率及感染程度.结果 幽门螺杆菌感染率反流性食管炎患者为63.00％;在不同分级反流性食管炎患者中,感染率Ⅰ级为67.84％、Ⅱ级为67.68％、Ⅲ级为54.64％、Ⅳ级为47.50％、Ⅴ级为33.33％,随着反流性食管炎疾病程度的加重,幽门螺杆菌感染率降低,两者呈反比关系;患者反流性食管炎病情越轻,幽门螺杆菌感染程度越重,幽门螺杆菌感染程度与反流性食管炎疾病严重程度呈反比关系.结论 幽门螺杆菌对反流性食管炎具有一定的保护作用,反流性食管炎严重程度随幽门螺杆菌感染率及感染程度的增加而降低,两者呈负相关,反流性食管炎患者在行幽门螺杆菌根除治疗时,应选择恰当的时机,以免使原有疾病加重.
作者：白璐；马英杰；冯素萍 刊期： 2014年第06期
目的 探讨孟鲁司特治疗肺炎支原体感染患儿临床的效果及其对白三烯的影响,以提高临床治愈率.方法 选取2012年3月-2013年3月在医院呼吸内科治疗的50例肺炎支原体感染患儿,随机分为对照组和治疗组,每组各25例,两组患儿均采用常规抗肺炎支原体治疗,治疗组在对照组的基础上加用孟鲁司特,连续治疗3个疗程后比较两组患者的临床疗效及血液、尿液中白三烯水平;采用SPSS13.0软件进行统计分析.结果 治疗总有效率治疗组为88.00％,对照组为72.00％,两组比较差异有统计学意义(P＜0.05);治疗组发热、咳嗽、喘息症状的消失时间及X线检查恢复正常的时间均明显短于对照组,差异有统计学意义(P＜0.05);经过为期3个疗程的治疗后,血白三烯、尿白三烯的水平治疗组与对照组患儿分别为(156.23±1.58)、(150.38±2.45) pg/ml与(187.28±1.57)、(190.69±2.39)pg/ml,均较治疗前明显降低,差异有统计学意义(P＜0.01),且治疗组明显低于对照组水平,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 孟鲁司特能改善肺炎支原体感染患儿的临床症状,提高治愈率,对肺炎支原体感染患儿有良好的治疗作用.
作者：宁静；徐勇胜；董汉权 刊期： 2014年第06期
目的 研究幽门螺杆菌感染对于桥本甲状腺炎的影响,探讨桥本甲状腺炎与幽门螺杆菌感染的治疗方法和效果.方法 从2012年1月-12月入院治疗桥本甲状腺炎的患者中随机选取150例,对应选取150名健康人员作为对照组;对这两组研究对象进行幽门螺杆菌检查,将检测出阳性者进行对比;经检查后发现150例桥本甲状腺炎患者中有96例幽门螺杆菌检测阳性,将其随机平分为对照组和观察组;观察组采取合理的方法进行抗菌感染的治疗,而对照组则未进行任何治疗,4个月后检测甲状腺过氧化酶抗体和甲状腺球蛋白抗体的滴度这两个指标值,研究比较检测值.结果 150例桥本甲状腺炎患者中有96例幽门螺杆菌感染,感染率64.0％;150名健康人员中幽门螺杆菌感染65例,感染率43.3％,桥本甲状腺炎患者的幽门螺杆菌感染率高于健康人群;幽门螺杆菌检测阳性的桥本甲状腺炎患者治疗4个月后观察组患者甲状腺过氧化酶抗体和甲状腺球蛋白抗体的滴度均比治疗前有大幅度的下降,对照组的两项指标无明显的变化.结论 发生幽门螺杆菌感染时患者更易患桥本甲状腺炎,一旦对该类患者进行抗幽门螺杆菌感染的治疗,桥本甲状腺炎易治愈,加快其治愈的过程.
作者：赵艳红；李红；范惠惠 刊期： 2014年第06期
目的 了解肿瘤患者鲍氏不动杆菌医院感染状况及耐药性特征,探索预防与控制鲍氏不动杆菌医院感染的监控措施,并为临床治疗提供依据.方法 对2011年1-12月肿瘤患者发生医院感染分离出的鲍氏不动杆菌及其耐药性进行回顾性统计分析,采用美国临床实验室标准化委员会推荐的纸片扩散法进行测定初筛和确证试验,药敏试验为CLSI推荐的K-B法,采用WHONET新版本进行数据统计分析.结果 在检出的451株病原菌中检出鲍氏不动杆菌28株,检出率6.21％,其中多药/泛耐药鲍氏不动杆菌20株占71.43％;检出率居首位的为痰液标本占57.14％;临床分布主要在外科、ICU;鲍氏不动杆菌对常用抗菌药物均敏感,多药耐药鲍氏不动杆菌对除碳青霉烯类与多黏菌素E外的常用抗菌药物均耐药,泛耐药鲍氏不动杆菌仅对多黏菌素E敏感.结论 肿瘤患者鲍氏不动杆菌,尤其是多药/泛耐药鲍氏不动杆菌医院感染情况日趋严重,应加强临床合理使用抗菌药物的管理,并对感染病例实施监控,防止多药/泛耐药鲍氏不动杆菌医院感染的暴发.
作者：李桃；龚光明 刊期： 2014年第06期
目的 研究医院侵袭性肺曲霉菌的药物敏感试验和分子鉴定及基因分型,对感染源的确定及控制医院曲霉菌属感染提供策略.方法 收集并统计医院2010-2011年53例侵袭性肺曲霉菌病患者送检标本分离的侵袭性曲霉菌,用萨布罗培养基培养和乳酸棉酚蓝染色直接镜检进行菌种初筛鉴定;用钙调蛋白基因序列分析进行分子鉴定和基因分型;药敏试验采用E-test法对两性霉素B、卡泊芬净、伏立康唑、伊曲康唑、泊沙康唑5种抗真菌药物进行MIC值测定.结果 从53例侵袭性肺曲霉菌病患者痰液标本中分离出62株曲霉菌属,其中9例患者两种曲霉菌混合感染;检出烟曲霉菌37株占59.68％,黄曲霉菌22株占35.48％,黑曲霉菌、土曲霉菌、迟缓曲霉菌各1株,各占1.61％;体外药敏试验MIC90由低到高依次为卡泊芬净、泊沙康唑、伏立康唑、伊曲康唑、两性霉素B.结论 烟曲霉菌和黄曲霉菌仍然是侵袭性曲霉菌病感染的主要病原菌,分子鉴定可将曲霉菌属准确鉴定到种,有良好的应用前景;唑类药物对于曲霉菌属的体外抗菌活性优于两性霉素B.
作者：栗方；王龙；曹彬；张雨雨；刘颖梅 刊期： 2014年第06期
目的 探讨髋膝关节置换术后假体周围感染的危险因素,为临床降低感染率提供依据.方法 选择医院2000年1月-2012年1月髋膝关节置换手术后出现假体周围感染的27例患者作为病例组,髋关节置换15例、膝关节置换12例,按1∶2的比例配比术后未出现感染的54例患者为对照组,比较两组间相关危险因素的差异,采用SPSS 13.0软件进行统计处理,两组计数资料比较采用两独立样本的￡检验或Wilcoxon秩和检验,将有意义的单因素代入多变量logistic回归分析模型进行多因素分析.结果 髋关节假体周围感染以表皮葡萄球菌感染多占40.0％,而膝关节假体感染以金黄色葡萄菌为主占54.5％;膝关节置换患者在脓性渗液和引流管两组比较差异有统计学意义,髋关节置换患者两组间在体质量指数、引流量和表浅感染差异有统计学意义.结论 脓性渗液的出现对膝关节假体感染具有重要的临床意义,使用引流管可以降低膝关节置换假体感染的风险,肥胖及术后引流量较多的患者髋关节假体感染的风险较高.
作者：黄小敬；杨胜武；袁健东 刊期： 2014年第06期
目的 分析胎儿宫内TORCH感染的超声表现特点,探讨超声检查对胎儿宫内感染的诊断价值,以期为提高胎儿宫内感染的诊断水平提供参考.方法 对医院2010年3月-2013年3月收治的92名孕妇胎儿宫内先天性感染产前超声表现进行回顾性分析,对所有胎儿的资料进行调查,并对其结局进行随访,评价超声检查对胎儿宫内感染诊断的临床价值.结果 92例孕妇感染病原体依次为细菌、乙型肝炎病毒、巨细胞病毒、风疹病毒、支原体属、衣原体属、苍白密螺旋体、弓形虫、人类免疫缺陷病毒,分别占42.39％、26.09％、13.04％、5.43％、3.26％、1.09％、6.52％、1.09％、1.09％ ;92例产妇经确诊为宫内感染后3例经干预未能有效改善宫内感染状况而终止妊娠、6例家属要求终止妊娠、死胎及死产各1例,早产儿23例、低体质量儿16例、先天畸形儿1例、新生儿感染16例,其中1例HIV病毒感染、5例风疹病毒感染及10例巨细胞病毒感染,余25例均正常.结论 超声检查可以检出胎儿宫内感染发生的一系列细微变化,可及时提示临床医师进一步进行病原学和病毒学检查,以确诊胎儿是否发生宫内感染,对孕妇及胎儿结局选择具有重要的临床意义.
作者：蒋江帆；覃艳玲；梁凤玲 刊期： 2014年第06期
目的 了解医院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌耐药性,指导临床合理使用抗菌药物.方法 统计分析2010年1月-2011年1月30例耐碳青霉烯类铜绿假单胞感染患者感染部位、科室分布及耐药性;细菌鉴定采用VITEK-32细菌鉴定系统,药敏试验采用纸片扩散(K-B)法,采用WHO细菌耐药监测网提供的WHONET5.4软件进行统计分析.结果 全年共分离出铜绿假单胞菌1 144株,其中耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌30株,检出率为2.6％;30株耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌以痰液检出率高,占66.6％;科室分布以重症监护病房为主,其次是神经内科,分别占50.0％、26.7％;耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌仅对多黏菌素B的耐药率为0,对阿米卡星耐药率为17.7％,对其他抗菌药物耐药率均＞80.0％.结论 耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌临床分布比较集中,对常用抗菌药物呈高度耐药,给临床治疗带来严重挑战,提示临床加强抗菌药物的管理和对耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌感染病例的实时监控,防止和减少此类耐药菌在医院内传播.
作者：余艳芳；唐丽华；金凤玲 刊期： 2014年第06期
目的 探讨自身免疫性脑炎(AE)临床鉴别诊断及治疗,以期提高该病的临床诊治水平.方法 回顾性分析2011年3月-2013年1月90例老年自身免疫性脑炎患者临床资料,将其分成3组,分别为抗VGKC脑炎、抗NMDA脑炎和边缘叶脑炎,比较3组年龄、性别、临床特点、脑脊液、辅助检查等的差异性,采用SPSS13.0软件进行统计分析.结果 抗VGKC脑炎和抗NMDA脑炎好发性别、肿瘤的相关性、临床特点、辅助检查、脑脊液、MRI和免疫肿瘤效果等差异明显;边缘叶脑炎相关疾病中代谢性脑炎、桥本脑病、非血管炎自身免疫性脑膜脑炎均表现为困倦和意识障碍;代谢性脑炎、精神病、桥本脑病、非血管炎自身免疫性脑膜脑炎MRI检查正常;代谢性脑炎、阿尔茨海默病、精神病、非血管炎自身免疫性脑膜脑炎、Wernicke-Korsakoff脑病、进行性多灶性白质脑病脑脊液检查正常;诊断性检查可明确的有单疱脑炎、代谢性脑炎、克罗伊茨费尔特-雅各布病、桥本脑病、进行性多灶性白质脑病等.结论 自身免疫性脑炎病种较多,在临床上鉴别时要依据患者的临床特点结合相关的检查等予以诊治.
作者：陆卉；张雅静 刊期： 2014年第06期
目的 观察类风湿性关节炎患者肺部真菌感染的危险因素及相应的诊治措施,以预防真菌感染.方法 选择2008年3月-2013年5月就诊的62例类风湿性关节炎患者,调查分析患者年龄、性别、平均病程、糖皮质激素应用与否、是否合并肺间质纤维化、长期抗菌药物联合应用及实验室的检查指标等,观察引起肺部真菌感染的危险因素.结果 62例类风湿性关节炎患者出现肺部真菌感染28例,感染率为45.16％,检出的真菌中曲霉菌属19株占67.86％,白色假丝酵母菌5株占17.86％,新型隐球酵母菌1株占3.57％,其他真菌3株占10.71％;研究结果表明,＞50岁、女性患者、病程较长、糖皮质激素的长期足量应用、合并肺间质纤维化及长期的抗菌药物联合应用均是类风湿性关节炎患者发生肺部真菌感染的危险因素,差异有统计学意义(P＜0.05);实验室的检查指标白细胞计数、血沉和C-反应蛋白异常与类风湿性关节炎患者发生肺部真菌感染无明显相关,差异无统计学意义.结论 针对研究结果可以指导相应的预防诊治方案,对于类风湿性关节炎患者要合理使用糖皮质激素,适时停用抗菌药物,避免患者出现肺部真菌感染,尽快使患者康复.
作者：范仰钢；胡尊玲；姚国忠 刊期： 2014年第06期
目的 探讨急性播散性脑脊髓炎临床和诊治特点分析,为临床治疗提供依据.方法 回顾性分析2009年6月-2013年6月医院治疗的66例急性播散性脑脊髓炎患者临床资料,根据治疗方案的不同分为甲泼尼龙治疗组39例和地塞米松治疗组27例;观察两组患者治疗效果,同时记录MRI检查情况及临床表现;采用SAS 14.0软件进行统计分析.结果 急性播散性脑脊髓炎患者临床症状主要以意识障碍、头痛头晕、恶心呕吐、运动障碍为主;经头颅MRI检测异常的患者中病变发生部位集中在大脑皮层下、侧脑室、脑干和小脑为主;甲泼尼龙治疗组总有效率为97.44％,地塞米松治疗组为74.07％,组间比较,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 急性播散性脑脊髓炎临床起病急骤,症状复杂多样,采用甲泼尼龙联合丙种球蛋白治疗效果可靠,给予及时治疗预后良好.
作者：莫国毅；吴平；许贝琳；周悦 刊期： 2014年第06期
目的 调查重症烧伤患者医院感染的特点,分析病原菌的分布及药敏特征.关注患者血清中IL-18和IL-23的表达特点,以期为临床观察感染患者的病情及治疗提供帮助.方法 收集医院180例重症烧伤患者的临床资料,同时重点关注医院感染的患者,调查感染率、病原菌的特点及药敏特征、感染患者血清中IL-18、IL-23的表达特点,采用SAS6.12进行统计分析,应用x2检验或t检验.结果 共82例患者发生医院感染,感染率为45.56％,创面感染64例、肺部感染10例、泌尿系感染5例、消化系感染3例;患者感染分泌物送检标本共培养出细菌136株,其中革兰阴性菌76株,革兰阳性菌60株;革兰阳性菌中金黄色葡萄球菌和溶血葡萄球菌多,对万古霉素高度敏感;革兰阴性菌中铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌多,对亚胺培南高度敏感,患者感染后血清中IL-18、IL-23的表达明显增高.结论 重症烧伤患者感染高发,血清中以IL-18、IL-23为代表的炎性因子变化明显,临床应加强医院感染的管理,对出现感染的患者,要进行分泌物的培养及药敏试验,以期对临床治疗提供帮助.
作者：庞久玲；马征；刘爱东；高小英；李冰；刘悦 刊期： 2014年第06期
目的 探讨苯基甲巯咪唑(C10)注射对内毒素休克小鼠生存改善效应的量效关系,以及不同给药时间的影响.方法 小鼠随机分为C10预处理不同剂量组(0.25、0.5、1.0 mg/kg)、生理盐水对照组、基线对照组以及C10后处理组(造模后30 min注射),采用脂多糖(LPS,25mg/kg)腹腔内注射造模,在10个不同时间点观察小鼠的生存情况并作中毒症状评分(ESS),观察终点存活鼠和提前死亡鼠均留取肺、肾、肝组织行HE染色和组织病理观察,使用STATA10.0软件对实验数据进行统计分析.结果 造模后12 h C10预处理组和C10后处理组分别与生理盐水组的ESS比较,差异均有统计学意义;C10预处理组、生理盐水对照组以及C10后处理组7d生存率分别为0、25.0％、75.0％、0、62.5％;1.0 mg/kg C10预处理组和1.0 mg/kg C10后处理组生存曲线比较差异无统计学意义;死亡鼠靶器官病理学检查可见显著炎性渗出和组织损伤.结论 C10预处理对内毒素休克小鼠的保护作用存在明显的量效关系;同等剂量C10在造模前后给药对内毒素休克小鼠生存具有同等的保护效应.
作者：罗毅；刘明祥；黄振宇；刘路培；毛文雄；黄善华；龙春萍 刊期： 2014年第06期
目的 探讨影响老年患者股骨粗隆间骨折术后感染的危险因素及病原菌耐药性,为控制老年股骨粗隆间骨折术后感染提供依据.方法 对医院2009年8月-2011年3月收治的251例老年股骨粗隆间骨折患者进行回顾性分析,采用K-B细菌药敏试验进行耐药性分析,所有数据采用SPSS13.0进行统计分析,对多因素分析采用COX分析.结果 术后31例患者出现感染症状,感染率12.4％,31例感染患者手术清创8 h后创口分泌物中共分离出病原菌37株,其中革兰阴性菌25株、革兰阳性菌12株,大肠埃希菌、铜绿假单细胞菌及阴沟肠杆菌对头孢哌酮耐药率分别为37.5％、33.3％及28.5％,对其他抗菌药物耐药性均较高,金黄色葡萄球菌对万古霉素耐药率为0,对其他抗菌药物耐药性均较高.结论 高龄、住院时间长、侵人性操作、围术期未使用抗菌药物、糖尿病及冠心病是影响老年股骨粗隆间骨折术后感染的危险因素,应行严格术前、术后清创,于围术期合理使用抗菌药物,降低患者术后感染风险.
作者：马利阁；王凯；刘阳 刊期： 2014年第06期
目的 探讨黄曲霉菌引起急性淋巴细胞白血病患者化疗后多发性骨感染的试验诊断和治疗方法,总结免疫低下患者多发性曲霉菌骨髓炎的诊治措施.方法 通过行C型臂透视引导下椎间隙穿刺活检术对患者进行取材做真菌培养,根据真菌培养菌落特点和镜下形态鉴定致病真菌,采用MIC方法进行真菌体外药敏试验,根据药敏试验结果进行治疗并进行文献复习.结果 从患者腰椎间隙内采集的血性液体标本经培养、鉴定为黄曲霉菌,对伏立康唑、卡泊芬净有较低的MIC值,分别为0.25、0.03 μg/ml;随后选用伏立康唑和两性霉素B脂质体联合治疗有效;经检索中国期刊网全文数据库、美国国立图书馆PubMed数据库,未见有关白血病患者合并曲霉菌性骨髓炎的中文报道,国外报道文献4篇(4例),但未见曲霉菌属引起白血病患者多发感染的报道.结论 血液系统恶性肿瘤化疗后合并黄曲霉菌造成的多发性骨感染极其罕见,且难诊断、难治疗,病死率极高,应引起足够重视;应尽快对感染部位进行穿刺取活检或抽取液体行病原菌培养及药敏试验,积极获取病原学证据;早期诊断和及时进行合理的抗真菌治疗是降低高病死率的关键.
作者：尹秀云；陈建魁；曾利军；蒋虔；于农；宋世平；宁红梅；黄媛；金欣 刊期： 2014年第06期
目的 探讨皮瓣和肌皮瓣修复治疗小腿及足部软组织缺损并感染的临床效果,以期降低皮瓣修复手术方法的感染率,提高临床诊治水平.方法 选取2010年1月-2013年1月小腿及足部软组织缺损感染患者161例,将其分为观察组与对照组,观察组81例为单纯采用植皮患者,根据创面情况选择腓肠肌、比目鱼肌、小腿前外侧、小腿外侧、小腿内侧、内踝上等6种皮瓣;选取80例小腿及足部软组织缺损感染患者采用植皮加抗菌药物作为对照组,观察两组治疗后的效果.结果 治疗后对照组的优良率为76.3％,观察组为96.3％;两组患者在感染控制时间比较差异无统计学意义;而两组在一般临床效果和近远期的并发症差异有统计学意义(P＜0.05).结论 皮瓣和肌皮瓣修复治疗小腿及足部软组织缺损并感染的近远期临床效果满意.
作者：樊安未；刘学亮；高文华；王海英 刊期： 2014年第06期
目的 探讨脑梗死患者医院感染的危险因素及相应的预防对策,为早期预防和控制脑梗死患者医院感染提供科学依据.方法 回顾性分析2011年11月-2013年11月医院收治的1 360例脑梗死患者的临床资料,将62例脑梗死医院感染的患者为研究组,并随机选择同期无医院感染的62例脑梗死患者为对照组,比较两组患者的一般资料,分析医院感染的危险因素,提出相应的预防对策,所有数据采用SPSS11.0软件进行统计分析.结果 1 360例患者发生医院感染62例,感染率4.56％;感染部位以呼吸道感染为主33例占53.23％,包括上呼吸道感染5例和下呼吸道感染28例,其次为泌尿道、胃肠道、皮肤软组织、口腔和血液感染,分别占20.97％、12.90％、4.84％、4.84％和3.22％;医院感染的危险因素有年龄、合并基础疾病、住院时间、意识障碍、抗菌药物的滥用、留置导尿管及胃管、机械通气等,两组患者相比差异有统计学意义(P＜0.05).结论 脑梗死患者医院感染与患者高龄、住院时间的延长、存在意识障碍、医院感染前抗菌药物的滥用及侵入性操作等有关,针对这些高危因素给予相应的预防对策,可有效降低脑梗死患者医院感染的发生率.
作者：吴舟娜；杜文杰；包苏凤；李七 刊期： 2014年第06期
目的 分析血液科患者医院感染的相关因素,并针对感染危险因素提出相应的护理措施.方法 回顾性分析医院血液科2011年2月-2013年2月收治的血液科患者临床资料482例,统计分析入选患者感染情况及其感染相关因素;根据患者感染情况分为感染组和非感染组,进行对比分析;研究数据使用统计软件SPSS 13.0进行分析.结果 482例患者发生医院感染共106例,感染率21.99％;呼吸道感染52例、口腔感染11例、肛周感染19例、肠道感染12例、血液感染6例和泌尿道感染6例,分别占49.06％、10.38％、17.92％、11.32％、5.66％和5.66％;共分离鉴定102株病原菌,其中革兰阳性菌20株、革兰阴性菌71株、真菌11株,分别占19.61％、69.61％、10.78％;感染患者的年龄、侵入性操作、化疗次数、住院时间和预防应用抗菌药物等与非感染患者差异有统计学意义(P＜0.01).结论 感染危险因素有患者的年龄、侵入性操作、化疗次数、住院时间和预防应用抗菌药物等;针对感染危险因素,积极开展感染防治护理措施,可降低或避免医院感染发生.
作者：沈国英；谢亚萍；励佳 刊期： 2014年第06期
目的 观察护理于预对心胸外科术后肺部感染及肺不张的影响,以促进患者呼吸功能的恢复.方法 将60例心胸外科手术患者随机分为观察组和对照组各30例,观察组在常规治疗基础上采取术前健康教育、呼吸功能锻炼、术后健康指导等护理干预措施,对照组采取常规护理模式,观察两组呼吸功能恢复情况及肺部感染率,采用SPSS13.0软件进行统计分析.结果 患者呼吸功能相关指标、带管时间等观察组均优于对照组(P＜0.05);观察组发生术后肺部感染1例感染率3.33％,肺不张1例发生率3.33％,均低于对照组的10.00％、6.67％,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 完善护理干预措施有助于患者术后肺功能恢复,降低肺部感染率的发生,促进预后.
作者：张海燕；朱希燕；张荣泽；李晓峰；付立萍 刊期： 2014年第06期
目的 通过高通量测序结合生物信息学分析,预测110株志贺菌属中与耐药基因库序列相似度差异较大的潜在新型耐药基因.方法 110株志贺菌属来源于2006年6月-2011年6月温州地区不同医院腹泻患者粪便标本,采用碱裂解法提取志贺菌属的混合基因DNA,Illumina HiSeq 2000高通量测序;通过基于同源比对核心算法的基因分析,挖掘与已知耐药基因遗传变异较大、相似性较低的潜在新型耐药基因.结果 110株志贺菌属中福氏志贺菌30株、宋氏志贺菌80株,福氏、宋氏志贺菌高通量测序总碱基数分别为4.9和3.5 Gb;志贺菌属高通量测序数据信息挖掘,分别获得潜在的耐药片段宋氏志贺菌255个和福氏志贺菌272个,分布于712条Uni-gene中;GO和COG蛋白功能数据库注释,发现其分子功能绝大多数与转运(21.3％)、催化(25.2％)、结合(25.2％)和转录调控(9.3％),福氏志贺菌denovo组装后预测发现外排泵基因mdt操纵子.结论 研究提出的基于同源比对的核心算法,可以有效地预测与参考耐药基因序列相似性较低的基因,为新型耐药基因的发现提供了思路.
作者：靳春雷；宋智健；周铁丽；包其郁；李劲松 刊期： 2014年第06期
中华医院感染学杂志
主管:中国人民解放军总医院
主办：中华预防医学会 中国人民解放军总医院
