学术投稿

Alu-LTR PCR检测整合型HIV-1实验方法的优化

李娟;焦艳梅;画伟;张彤;吴昊;高艳青

关键词:Ah-PCR, 整合型HIV-1, CD4+T细胞
摘要:目的 对AJu-LTR PCR检测整合型HIV-1的实验方法进行优化.方法 收集20例HIV-1感染患者及10例健康对照者的抗凝血标本,纯化CD4+T细胞并提取DNA,根据整合型HIV-1 DNA的特点设计引物,首轮PCR 5'端引物来自于人类保守的Alu序列,3'端引物来自于HIV-1 L11R U5区序列,扩增片段包含了整合位点上游的人类基因组DNA序列和整合的HIV-1 LTR的序列.第二轮引物针对HIV-1 LTR U3区的序列.在首轮PCR基础上,PCR产物稀释后进行第二轮PCR.结果 经过优化的Alu-LYR PCR,20例HIV病人全部检测到整合的HIV-1.结论 经优化后,Ah-LTR PCR检测整合型HIV-1的实验方法的灵敏度明显提高.
首都医科大学学报杂志相关文献
  • 开拓进取任重道远

    [编者按]胡大一,主任医师、教授、博士生导师,卫生部健康教育首席专家,教育部重点学科心血管内科负责人,国家突出贡献专家、享受政府特殊津贴.现任北京大学人民医院心脏中心主任、心血管病研究所所长、首都医科大学心血管病研究所所长、复旦大学公共卫生学院临床流行病学研究中心主任.

    作者: 刊期: 2009年第05期

  • HIV/AIDS患者免疫重建炎性综合征研究进展

    免疫重建炎性综合征发生于艾滋病患者应用高效抗反转录病毒疗法后的免疫重建过程中,本文分别对其概念、发病机制、诊断、临床表现和治疗等方面进行了综述.综合文献资料认为在病人的诊治上重要的一点是提高对免疫重建炎性综合征的诊断和鉴别,以免延误病情.免疫重建的特征之一是恢复了针对机会性感染致病原的免疫反应,因此除非有可能威胁患者生命或导致高致残率外,都应继续应用高效抗反转录病毒疗法.

    作者:吴巍;黄世敬;王阶 刊期: 2009年第05期

  • 视交叉上核脑片与NIH/3T3成纤维细胞共培养模型的建立

    目的 建立视交叉上核(suprachiasmatic nucleus,SCN)脑片与NIH/3T3成纤维细胞共培养的分子时钟诱导模型.方法 选用7日龄SD大鼠,分离SCN脑片或皮层脑片,分别与NIH/3T3细胞共培养,分为SCN共培养组和对照组皮质共培养组,6 d后连续24 h每间隔6 h收集NIH/3T3细胞,抽提细胞总RNA,实时定量RT-PCR检测时钟基因Per1mRNA水平.结果 SCN共培养组Per1的表达均表现明显的节律性(P=0.001),对照组大脑皮质共培养组Per1基因表达均无明显节律性变化.结论 成功建立SCN脑片与NIH3T3细胞共培养模型并诱导细胞内分子时钟的节律性表达,为研究SEN调控外周组织细胞生物节律提供有力工具.

    作者:左晓虹;蔡彦宁;李宁;于顺;张燕莉;陈彪 刊期: 2009年第05期

  • α-突触核蛋白促进大鼠原代培养神经元突起生长

    目的 研究人α-突触核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)对神经元突起牛长的作用.方法 原代培养新生大鼠大脑皮质神经元,细胞外添加α-Syn蛋白,测定不同时间神经元突起的长度;观察添加不同浓度的α-Syn蛋白后神经元突起的生长情况.结果 α-Syn处理组神经元突起的平均长度在培养1 h、2 h和4 h时均明显大于对照组,α-Syn的这一作用可被其特异性单克隆抗体阻断;向培养基中添加不同浓度的α-Syn后,神经元突起的长度随α-Syn浓度的增加而增加.结论 α-Syn具有促进神经元突起生长的作用,并且呈明显的量-效关系.

    作者:刘光伟;王鹏;李尧华;李昕;何欣;于顺 刊期: 2009年第05期

  • α-突触核蛋白在大鼠脊髓的表达

    目的 研究α-突触核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)在正常大鼠脊髓中的表达.方法 利用2种抗α-Syn单抗3D5和2E3进行免疫组化染色,观察α-Syn在脊髓的表达和分布;用免疫荧光双标方法观察α-Syn与神经肽Y(NPY)共存的情况.用Luxolfast blue染色鉴别有髓与无髓神经纤维.结果 α-Syn主要存在于脊髓灰质神经元核及灰质无髓神经纤维中.富含α-Syn的神经纤维主要分布在脊髓灰质的第Ⅰ、Ⅱ层,而α-Syn核阳性神经元主要分布在第Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ、Ⅹ层;后根第Ⅰ、Ⅱ层一小部分α-Syn阳性纤维与NPY共存;前角细胞核呈α-Syn阳性神经元胞质中存在NPY,而其他部位的α-Syn核阳性神经元胞质中无NPY.结论 α-Syn存在于大鼠脊髓灰质的神经元核及无髓神经纤维中,部分阳性神经纤维和神经元胞体呈NPY免疫阳性反应.

    作者:殷娟娟;Giorgio Vivaqua;李昕;刘光伟;李尧华;于顺 刊期: 2009年第05期

  • 北京市部分男男同性恋人群中HIV-1分子流行病学研究

    目的 了解北京市部分男男同性恋(men who have sex with men,MSM)人群HIV-1的分子流行情况,监测该地区人群HIV毒株的新流行情况.方法 提取17例男男同性恋者HIV-1抗体阳性样本全血基因组DNA,直接进行巢式PCR扩增HIVenv基因C2-V5区及gag基因P17-P24区,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,确定基因亚型.结果 17例患者中,共存在CRF01-AE、B亚型和CRF07-BC 3种亚型,其中CRF01-AE 9例(52.94%),B亚型5例(29.41%),CRF07-BC 3例(17.65%).结论 小样本量的流行病学调查显示,北京地区部分男男同性恋人群中主要存在CRF01-AE、B和CRF07-BC 3种亚型;CRF01-AE已取代B亚型而成为北京市MSM人群中HIV主要流行亚型,CRF07-BC重组亚型在北京市MSM人群中增长迅速.

    作者:刘志英;李海英;张彤;黄晓婕;魏飞力;徐萌;焦艳梅;徐小宁;陈德喜;吴昊 刊期: 2009年第05期

  • 帕金森病患者血清对α-突触核蛋白寡聚体形成的促进作用

    目的 研究帕金森病(PD)患者血清对外源性α-突触核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)寡聚体形成的影响,初步分析血清促进α-Syn寡聚体形成的机制.方法 将重组人α-Syn加入PD患者和对照组血清中,37℃振荡孵育,用免疫印迹方法鉴定α-Syn寡聚体的形成情况,用ELISA分析α-Syn寡聚体的形成量.结果 α-Syn在血清中振荡孵育后主要形成二聚体和十四聚体.与对照组血清相比较,PD患者血清具有促进α-Syn寡聚体形成的作用.在血清中加入还原性谷胱甘肽可明显减弱PD患者血清促进α-Syn寡聚体形成的作用.结论 PD患者血清促进α-Syn寡聚体的形成,其机制可能与α-Syn的氧化修饰有关.

    作者:李雁;殷娟娟;李昕;吴燕川;刘光伟;李尧华;于顺 刊期: 2009年第05期

  • 窦神经压力感受器聚类分析

    目的 探讨应用Spike2软件从颈动脉窦压力感受器多重纤维放电记录中提取单纤维放电信息的可能性和具体方法.方法 对离体条件下同步记录的家兔颈动脉窦压力和窦神经少纤维放电数据,应用Spike2软件的聚类分析功能对所有动作电位进行分类.结果 ①分析过程中,设定模板参数必须紧密结合压力感受器的自身特点;②对于具有较高信噪比的、简单(含2-3个单位)或稍复杂的窦神经放电(含5个单位),应用spike 2进行分析可获得可靠的单位放电结果;③对于包含更多单位的压力感受器放电,应用Spike 2分析时,对所得结果需持审慎的态度.结论 Spike 2软件适用于窦神经压力感受器少纤维(<5个单位)放电的聚类分析;正确分析结果取决于原始记录良好的信噪比和对模版参数有针对性的设置.

    作者:赵海燕;魏华;刘萍;刘廷会;王伟;黄海霞;钮伟真 刊期: 2009年第05期

  • HIV-1潜伏库研究进展

    HIV-1在未经治疗的艾滋病患者体内虽可以持续复制,但也可潜伏在细胞内以逃避宿主的免疫清除,这一现象即病毒潜伏.病毒潜伏对抗病毒治疗带来了挑战,也引起人们的高度关注.本文对HIV-1病毒潜伏库的研究进展进行了综述.

    作者:焦艳梅;吴昊 刊期: 2009年第05期

  • 帕金森病的发病机制与早期诊断

    帕金森病是常见的与衰老有关的神经系统变性疾病,临床上以静止振震颤、运动迟缓、僵直、姿势不稳定为主要症状,其主要病理变化为黑质多巴胺能神经元的大量丢失,在尚存活的神经元中存在嗜酸性细胞内包涵体--Lewy body.

    作者:首都医科大学宣武医院神经生物学研究室 刊期: 2009年第05期

  • 20例HIV/AIDS患者耐药结果分析

    目的 对高效抗逆转录病毒治疗(highly active antiretroviral therapy,HAART)失败的HIV/AIDS患者,进行回顾性基因型耐药检测,了解HAART过程中HIV-1耐药位点的产生,分析基因型耐药检测在HAART过程中的必要性及指导意义.方法 采用Versant HIV-1 RNA 3.0检测病毒载鼍;采用TriTEST CD4 FITC/CD8 PE/CD3 PerCP Reagent检测CD4+T淋巴细胞计数;采用Tmgene HIV-1 Genotyping Kit和OpenGene DNA系统进行基因型耐药检测;用Blast等分子生物学软件进行HIV-1亚型分析.结果 20例患者中,17例保存有治疗前的血浆标本,其中1例在治疗前即存在非核苷类逆转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)耐药相关突变.20例患者均进行了治疗后耐药检测,其中3例未检出耐药相关突变.其他17例检出耐药相关突变,其中13例出现NNRTIs耐药相关突变;突变位点主要为K103N、Y188L、Y181C、V106M和G190A;11例显示有核苷类逆转录酶抑制剂(nucleoside/nucleotide reverse transcriptase inhibitors,NRTIs)耐药相关突变,突变位点主要为M184V、T/215Y/F、D67N、K70R以及K219E/Q;3例出现蛋白酶抑制剂(protease inhibitors,PIs)耐药相关突变,其中主突变为M46I/L、V82WA,而次级突变中以M36I、L63P出现的频率高.20例患者中B亚型9例(45%,9/20),CRF01_AE重组亚利5例(25%,5/20),CRF07_BC重组亚型5例(25%,5/20),CRF06_CPX1重组亚型1例(5%,1/20).结论 对治疗失败的患者进行基因型耐药检测可以帮助医生判断HAART失败的原因,并指导治疗方案的优化;亚型分析显示HIV-1病毒亚型的流行与感染途径之间存在明显的联系.

    作者:魏飞力;吴昊;张彤;李庆;刘志英;王蕊;焦艳梅;陈德喜 刊期: 2009年第05期

  • 新型隐球菌动物模型的建立及PCR快速诊断

    目的 建立从活检肺组织中进行隐球菌PCR诊断的小鼠模型.方法 向BALB/c小鼠气管插管内注入隐球菌菌液制成小鼠隐球菌感染模型,取肺组织匀浆提取DNA进行PCR诊断.结果 从位于新型隐球菌基因组的编码核糖体RNA(rRNA)和位于其中的内部转录区(internal transcribed spacer,ITS-1和ITS-2)基因位点的8对引物中筛选出1对引物(ITSI-CN4),其对从活检肺组织中诊断新型隐球菌具有较好的敏感性和特异性.结论 成功建立了从活检肺组织中进行隐球菌PCR诊断的小鼠模型.从8对引物中筛选出的1对引物(ITSI-CN4)对从活检肺组织中诊断新型隐球菌具有较好的敏感性和特异性.

    作者:衣恩通;阴赪宏;李敏 刊期: 2009年第05期

  • 老年代谢综合征患者的临床特点分析

    目的 探讨老年2型糖尿病患者合并代谢综合征(MS)的临床特征及对糖尿病大血管病变及肾脏损害的影响.方法 选择2型糖尿病患者257例,分为合并代谢综合征组(MS组,120例)和非代谢综合征组(非MS组,137例),对比分析2组患者的临床资料及冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)、下肢动脉硬化、脑梗死的发病情况.结果 代谢综合征组患者的体质量指数(BMI)、胰岛素抵抗值、胆固醇、三酰甘油均较非代谢综合征组明显增高,MS组B细胞功能较非Ms组差,差异有统计学意义(P<0.01);代谢综合征组患者尿酸及尿白蛋白排泄率较非代谢综合征组均明显增高,差异有统计学意义(P<0.01),代谢综合征组冠心病的发病比例显著高于非代谢综合征组(P<0.05).结论 与非代谢综合征组的老年2型糖尿病患者比较,合并代谢综合征患者的β细胞功能较差、胰岛素抵抗及肾脏损害较重,冠心病发生率更高.

    作者:洪旭;马清;陈海平;于恒池;尹洁;郝雅斌 刊期: 2009年第05期

  • 黏附分子在阻塞型睡眠呼吸暂停低通气综合征与冠状动脉粥样硬化性心脏病关系中的作用

    目的 探讨黏附分子在阻塞型睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea-hypopnea syndrome,OSAHS)与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)关系中的作用.方法 应用酶联免疫吸附法(ELISA)检测31例OSAHS合并冠心病患者(OSAHS+CHD组)、31例单纯OSAHS患者(OSAHS组)和28例健康志愿者(正常对照组)血清中细胞间黏附分子1(ICAM-1)、血管细胞黏附分子1(VCAM-1)的含量.结果 OSAHS+CHD组和OSAHS组血清中ICAM-1高于正常对照组(P<0.05);OSAHS组血清VCAM-1与正常对照组比较差异有统计学意义(P<0.05),而OSAHS+CHD组血清VCAM-1与正常对照组比较差异无统计学意义.OSAHS患者的ICAM-1与睡眠呼吸暂停低通气指数呈显著正相关(r=0.544,P<0.01),ICAM-1、VCAM-1均与体质量指数呈正相关(r=0.280,P<0.05).结论 血清ICAM-1水平增高是OSAHS患者发生冠心病的重要危险因子之一.

    作者:樊昕;魏欣;杜凤和 刊期: 2009年第05期

  • 肺耐药蛋白在乳腺癌中的表达及临床意义

    目的 研究乳腺癌组织中肺耐药蛋白(lung resistance protein,LRP)的表达,探讨其在乳腺癌多药耐药机制中的作用及其临床意义.方法 2000年首都医科大学附属北京友谊医院普通外科收治的乳腺癌病例81例,均为女性,年龄30至83岁(平均年龄53.2岁),接受以手术为主的综合治疗且均未进行新辅助化疗.病理类型包括浸润性导管癌、浸润性小叶癌、单纯癌、黏液癌和早期浸润癌.根据2003版国际抗癌联盟(International Union Against Cancer,UICC)乳腺癌分期标准进行临床病理分期,Ⅰ期:17例,Ⅱ期:43例,Ⅲ期:21例.术后5年随访者36例,无瘤生存30例,转移6例(带瘤生存1例,死亡5例).制作组织芯片,采用SP免疫组化染色法,测定81例未经过新辅助化疗的乳腺癌标本中LRP的表达,与临床病理因素及雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)、抑癌基因p53(p53)、人表皮生长因子受体2(Her-2)、增生细胞核抗原Ki-67(Ki-67)的表达进行相关性分析.应用X2检验及等级相关检验,使用SPSS 11.5统计学软件进行数据处理及分析.结果 乳腺癌组织中LRP的阳性表达率为70.4%(57/81).老年患者的LRP表达比中青年患者明显降低(P<0.05);LRP的表达与病理分期、预后无相关关系(P0.05).LRP与ER和PR的表达存在一定的正相关关系,相关系数分别为0.327、0.264(P<0.05);LRP与p53、Her-2、和Ki-67的表达无相关关系(P0.05).结论 LRP在乳腺癌组织中有较高的表达率,与年龄及ER、PR的表达有关,本结果为临床化疗药物的选择提供了依据.

    作者:赵宁;张忠涛;屈翔;王宇 刊期: 2009年第05期

  • 实验性糖尿病大鼠坐骨神经损伤后神经再生微环境变化

    目的 观察实验性糖尿病大鼠在坐骨神经挤压伤后神经生长相关蛋白的表达水平;探讨神经元分子微环境变化对神经再生修复的重要意义.方法 制作实验性糖尿病大鼠模型,在此基础上制作双侧坐骨神经挤压伤模型.观察神经挤压损伤后7、14、21和28 d大鼠背根神经节TUNEL标记阳性细胞百分比变化;利用免疫组化和蛋白印迹技术(Western-blot),观察神经生长相关蛋白(GAP-43)和神经生长因子受体(trk A)表达水平变化.结果 实验性糖尿病大鼠坐骨神经损伤后,所有时程背根神经节细胞均有较多的TUNEL标记细胞,但以14~21 d显著;各时程背根神经节细胞GAP-43和trk A蛋白均有一定水平的表达,但其表达水平低于非糖尿病组.结论 实验性糖尿病大鼠坐骨神经背根神经节存在凋亡应激,其神经再生相关基因表达体系不完整,对神经损伤的再生修复能力下降.

    作者:张在强;曹世俭;王拥军 刊期: 2009年第05期

  • 端粒、端粒酶的发现和意义——2009年诺贝尔生理学或医学奖简介

    2009年诺贝尔生理学或医学奖颁发给3名美国科学家,其主要贡献为解决了生物学研究领域中一个重大问题,即细胞分裂过程中,染色体如何完整复制,它们是如何受到保护而免于降解?Elizabeth H.Blackburn和Jack W.Szostak发现染色体末端的端粒DNA序列能保护染色体不被降解;Carol W.Greider和Elizabeth H.Blackburn鉴定出合成端粒DNA的酶--端粒酶.这些发现为推动衰老及肿瘤等领域的研究做出了巨大贡献.

    作者:张婷;王晓民 刊期: 2009年第05期

  • 激素干预哮喘模型大鼠证候学评价的实验研究

    目的 探讨地塞米松对哮喘模型大鼠治疗的不同阶段(撤停前、撤停中、撤停后)的阴虚与阳虚证证候属性.方法 建立大鼠慢性哮喘模型,腹腔注射地塞米松模拟激素干预过程,观察哮喘大鼠在激素干预不同阶段的症状表现,包括体质量、腋温、爪温、爪r值、尾r值.结果 激素干预组于激素撤停前阶段首先表现为阴虚证,在阴虚证的基础上又出现阳虚证的表现;撤停中及撤停后阶段基本符合阳虚证的辩证特点.结论 激素干预哮喘模型在激素应用的不同阶段具有不同的证候特点.

    作者:刘仁慧;赵晖;穆阳;王培;杨婧;张翼;刘苏;王秀娟 刊期: 2009年第05期

  • HIV慢性感染者CD8+T淋巴细胞及其各亚群细胞增生、消亡情况的观察

    目的 探讨HIV-1慢性感染者(病程12个月)CD8+T淋巴细胞及其各亚群:纯真CD8+T细胞(TN)、中心记忆CD8+T细胞(TCM)、效应记忆CD8+T细胞(TEM)和效应记忆CD8+T细胞RA(TEMRA)的增生、消亡情况.方法 观察23例未经抗病毒治疗、病程大于12个月的HIV-1感染者以及16例健康对照者,通过流式细胞仪分析,根据CIM5RO,CD27表达情况,CD8+T细胞分为TN(CD45R0-CD27+)、TCM(CD45R0+CD27+)、TEM(CD45RO+CD27-)和TEMRA(CD45R0-CD27-).以Ki-67抗原的表达代表细胞的增生,Annexin V检测阳性代表细胞的消亡,比较HIV-1慢性感染者和健康者CD8+T细胞及其各亚群增生消亡的情况;并把HIV-1慢件感染者按CD4+T细胞计数200个/mm3以及350个/mm3为观察点分成3组,比较3组间的CD8+细胞及其各亚群增生消亡的情况.结果 健康组(n=16)CD8+细胞各亚群检出率为TN 34.92%±12.68%、TCM25.44%±10.36%、TEM 14.64%±10.58%和TEMRA25.00%±12.59%;与之相比HIV-1慢性感染组(n=23)检出率为TN17.14%±8.03%(t=5.368,P=0.000)、TCM 31.40%±14.02%(t=-1.448,P=0.156)、TEM 20.17%±13.17%(t=-1.393,P=0.172)和TEMRA31.48%±15.16%(t=-1.405,P=0.168).CD8+T细胞增生率为:健康组0.15%±0.09%,感染组1.33%±0.90%(x=4.655,P=0.000);健康组消亡率为8.74%±4.73%,感染组24.08%±13.72%(x=-4.169,P=0.000).HIV-1慢性感染者按CD4+T细胞计数分成CD4≤200个/mm3组(A组,n=5)、CD4计数200~350个/mm3组(B组,n=12)和CD4 ≥350个/mm3组(C组,n=6),3组间各亚群组成比中TN所占比例在A组明显减少,而CD8+T细胞各哑群的增生率、消亡率在3组间差异没有统计学意义.结论 ①与健康对照组相比,HIV-1慢性感染者CD8+T细胞及其各亚群消亡率增加,增生率也相应大幅增加,细胞进入高速更新的状态;②HIV-1慢性感染者CD8+TN亚群的检出率明显下降,并在CD4≤200个/mm3组降至低,CD8+TM资源随病情进展不断耗竭.

    作者:任翊;刘意;李海英;张彤;吴昊;陈新月 刊期: 2009年第05期

  • 一个小型人酪氨酸羟化酶基因启动子的分离和活性分析

    目的 探讨酪氨酸羟化酶(tyrosine hydroxylase,TH)基因上游调控区的功能.方法 PCR法扩增人TH基因上游片段,插入pGL3-Basic质粒,构建一个表达荧光素酶的报告基因.将报告基因瞬间转染MES23.5、293及Cos7细胞,用Dual Luciferase Assay法测定目的 DNA片段的启动子活性.结果 测序结果表明,分离的DNA片段长度为520 bp,与人TH基因-493/+27区一致.与pGL3-Basic质粒相比较,构建的报告基因在3种细胞中显著表达(P<0.01).结论 TH基因-493/+27区具有明显的启动子活性,构建的报告基因有助于研究TH基因表达的调节.

    作者:李尧华;叶懿文;高楠;李昕;于顺;杨慧;陈彪 刊期: 2009年第05期

首都医科大学学报杂志

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主办:首都医科大学