学术投稿

云南省2009年埃可病毒6型分离株KM57-09全基因序列分析

朱艳菊;潘玥;陈俊英;马忠飞;邓新强;刘建生;马绍辉

关键词:埃可病毒6型, 全基因组, 序列分析
摘要:目的 对云南埃可病毒6型(Echo6)分离株KM57-09全基因序列进行分析和研究,了解其遗传特性.方法 设计针对Echo6引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列.利用Mega 5.05、RDP 3和SimPlot 3.5.1等生物学软件分析全基因序列.结果 获得KM57-09全基因组核苷酸序列长度为7419 bp,编码含2191个氨基酸残基的多聚蛋白;与其他Echo6参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79.3% ~ 80.2%和93.3%~ 94.4%,与原型株D' Amor核苷酸和氨基酸同源性分别为79.3%和93 6%.在基因组各个区段上,Echo6KM57-09分离株的2C和3A区,与HN-2-E25核苷酸同源性高,分别为86.3%和85.0%,而其5'UTR、VP4、3D和3'UTR区则与CoxB5-Henan-2010核苷酸同源性高,分别为91.7%、81.2%、89.7%和96.9%.在VP1区上,与中国其他省份分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.0%~96.0%和95.8%~ 99.0%,而与其他国家分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为77.6% ~ 96.0%和95.2% ~ 99.0%.进化分析发现Echo6可分为5个分支,中国分离株分属C和E分支,其中KM57 09属于E分支,且5个分支之间核苷酸的差异为15.6% ~23.3%.3D基因序列种系进化分析以及RDP3和SimPlot 3.5.1软件分析发现KM57-09序列在非结构区可能存在重组.结论 Echo6可分为5个基因型,KM57- 09分离株属于E基因型;中国大陆曾存在不同 Echo6株传播链的流行.
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    作者:李洁;曲梅;贾蕾;张新;刘白薇;黄芳;黎新宇;王全意 刊期: 2012年第09期

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    流行性脑脊髓膜炎(流腑)是脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)感染引起以腑膜炎和败血症为主要临床表现的呼吸道传染病.全球每年流脑发病人数约为50万,死亡5万,病死率和致残率较高,是大多数国家的重要公共卫生问题.Nm已发现12个血清群,儿乎所有侵袭性腑膜炎球菌病都是由A、B、C、Y和W135群感染引起.自20世纪以来,不同国家和地区均存在流行菌群变迁现象[1].

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    作者:朱艳菊;潘玥;陈俊英;马忠飞;邓新强;刘建生;马绍辉 刊期: 2012年第09期

  • 郑州市男男性行为人群HIV-1毒株变异特征及其与既往有偿供血感染者的关系

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    作者:王哲;崔为国;孙国清;刘佳;田遂安;刘春华;薛秀娟;李林;李敬云 刊期: 2012年第09期

  • 新疆汉族和维吾尔族糖调节受损人群胰岛素分泌及其功能的比较研究

    目的 比较新疆地区汉族和维吾尔(维)族人群空腹血糖受损(IFG)、糖耐量减低(IGT)及混合性糖调节受损(CGI,IFG/IGT)阶段胰岛素分泌及其功能.方法 2007-2008年在新疆部分地区采用多中心横断面调查(中国第三次糖尿病流行病学调查),共计2203名研究对象(汉族111 8人,维族1085人)行口服75 g葡萄糖耐量试验(OGTT),用胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)评估胰岛素抵抗,胰岛β细胞功能指数(HOMA-β评估基础胰岛素分泌,OGTT中空腹和30 min胰岛素、血糖差值的比值(ΔI30/ΔG30)评价胰岛素早相分泌,ΔI30/ΔG30/HOMA-IR评估葡萄糖处置指数(DI).结果 腰围、体重指数、血脂水平、0及120 min胰岛素值在汉维两民族不同糖代谢组的差异有统计学意义.在糖调节正常(NGT)、IFG、CGI组,维族人群的腰围要显著高于汉族(P<0.01).在NGT、IFG、IGT组,汉族人群的120 min血清胰岛素水平则显著高于维族(P<0.01).汉族人群的HOMA-IR、HOMA-β在不同糖代谢组均显著高于维族(P<0 01).ΔI30/ΔG30、DI在两民族不同糖代谢组间的差异无统计学意义.结论 汉族人群较维族在糖调节受损阶段有显著的胰岛素抵抗,同时存在胰岛β细胞代偿性分泌以维持血糖水平.

    作者:王燕;马艳荣;李素丽;玛依努;吴岚;赵力敏;宋向欣;葛家璞;徐焱成 刊期: 2012年第09期

  • 台湾地区30~59岁健康体检人群肥胖5年发病风险预测模型

    目的 构建台湾地区30 ~ 59岁健康体检人群肥胖5年发病风险(个体化)预测模型.方法 选择1998 -2006年首次参加台湾美兆健康体检的30~59岁人群15 085人,剔除基线患肥胖者91 8人共计14 167人.将4个体检中心分为建模队列(台北中心,n=8104)和验证队列(另3个中心,n=6063).按建模队列5年后是否发生肥胖为因变量、基线指标为自变量进行单变量分析,并建立多元逐步logistic回归模型,以ROC曲线下面积(AUC)为判定预测模型拟合优度的主要指标,用验证队列对模型的外部效度进行评估.建模后再将人群预测风险概率正态化转为可实际应用操作的4个风险等级.结果 4个体检中心基线时正常体重、超重和肥胖人群的比例分别为50.00%~ 60.00%、26.47% ~ 31.11%和5.76%~7.24%.剔除基线患者后,全部受检者5年肥胖发病率为2.73%(386/14 167),4个中心肥胖发病率为2.66%~2.91%.多变量logistic回归构建的预测模型包括年龄、性别、糖尿病家族史、近3个月体重变化≥4kg和腰围5个指标.建模队列建立的预测模型AUC约为0.898(95%CI:0.884~ 0.912),验证队列外部效度验证结果为AUC=0.881(95%C1:0.862 ~ 0.900).将建模队列划分为4个风险等级后,显示中危(16 0%)和高危(2.9%)的个体5年内发生肥胖的危险分别比一般人群高7.8倍和16.6倍.结论 利用台湾美兆健康体检纵向数据资料建立的肥胖5年个体风险预测模型,其效度和信度均较高,且评价标准简单实用,无论对个体自身肥胖风险评价还是对社区人群肥胖监测均具有应用价值.

    作者:孙凤;陶庆梅;陶秋山;杨兴华;曹纯铿;詹思延 刊期: 2012年第09期

  • 甘肃省临夏回族自治州2006年和2010年食盐加碘改善儿童智力评估

    目的 评估食盐加碘对学龄儿童的智力改善情况.方法 2006年和2010年均采用中国联合型瑞文测验第二次修订版(CRT-C2)对甘肃省临夏回族自治州(临夏州)8个县(市)3518名和1611名8~10岁儿童智力进行测试.结果 2006年儿童平均智商为85.1,IQ≤69比例为16 7%;各县(市)儿童平均智商为80 ~ 90,差异有统计学意义(P<0 05);8、9和10岁儿童平均智商分别为92.0,90 6和81 8,10岁组低于其他两组8~10个IQ值,差异有统计学意义(P<0 05);男女童智商平均值分别为84 5和85 6,差异无统计学意义.2010年儿童平均智商为97 2,比2006年提高12个IQ,差异有统计学意义(P<0.05),但低于同期全省平均水平(105个IQ值),差异有统计学意义(P<0 05),IQ≤69的比例为4 7%;临夏市和永靖县儿童均达到100个IQ值的理论水平,其他县(市)儿童平均智商约为95个IQ值,差异有统计学意义;8、9和10岁儿童平均智商分别为96 3,97 1和98 4,年龄别差异无统计学意义(P>0 05),男女童智商平均值分别为98 8和95 9,差异有统计学意义(P<0.05).结论 随着全民食盐加碘措施逐步落实,临夏州儿童平均智商接近理论水平,碘盐对儿童智力发育起到关键性作用,但2010年儿童智商仍然低于甘肃省同期水平,且各县(市)儿童平均智商有明显差异.

    作者:曹永琴;王燕玲;朱小南;窦瑜贵;李洪波;孙玮;郑菁 刊期: 2012年第09期

  • 云南省德宏州2011年HIV-1不同亚型人群分布特征分析

    目的 研究云南省德宏州HIV-1亚型的流行特点.方法 收集2011年1-5月德宏州HIV-1抗体确认阳性血浆样品300份,提取RNA后用巢式PCR对gag基因和env基因的部分片段进行扩增.扩增产物经基因序列测定,所得序列通过构建系统进化树确定HIV-1的分子亚型.结果结合2个基因片段,共有222份样品获得分型结果,主要为C亚型(43 2%,96/222),其他依次为独特重组形式(URF;27.0%,60/222)、CRF01_AE(212%,47/222)、CRF08 BC(5.0%,11/222)、B'(2 3%,5/222)和CRF07 BC( 1.4%,3/222).C亚型是性传播人群和注射吸毒人群中的首要亚型,但不同传播途径人群中亚型分布具有不同的模式.异性传播人群包括该地区检测到6种基因型,主要为C亚型(40 7%,70/172)、CRF 01AE(25.0%,43/172)和多种URF(25.0%,43/172),呈现亚型分布的多样化.注射吸毒人群中包括除B '和CRF07 BC以外的3种亚型及多种URF,主要为C亚型(54.8%,23/42)和URF(38.1%,16/42),呈现亚型相对集中的趋势.URF比例的显著上升成为该地区的另一个流行特点,包括BC重组(41 7%,25/60)和与CRF01 AE相关的重组(58 3%,35/60),这两种URF在性传播和注射吸毒人群中分布的差异无统计学意义.结论 德宏州HIV-1流行株较为复杂,存在5种亚型和多种URF,其中C亚型为主要流行株,不同传播途径亚型分布模式存在差异.

    作者:陈敏;姚仕堂;马艳玲;何翔;王继宝;程春林;杨锦;苏莹珍;李艳玲;段松;陈会超;付丽茹;贾曼红;陆林 刊期: 2012年第09期

  • 河南省2000-2010年婴儿死亡率变化趋势及孕产妇保健影响因素分析

    目的 分析2000-2010年河南省婴儿死亡率变化趋势及孕产妇保健方面的影响因素.方法 采用描述性分析、Cox-Stuart检验和多元线性回归分析的方法,对2000-2010年河南省监测地区人群婴儿死亡率变化趋势及其孕产妇保健因素进行分析.结果 2000-2010年河南省及其城乡婴儿死亡率分别由30.91‰、10.05‰和33.99‰下降至712‰、5.51‰和8.03‰,年均下降分别为13.65%、5.83%和13.44%,下降趋势均有统计学意义(P<0.05),农村下降幅度(25 96%)超过城市(4.54%),城乡间差异由23.49%逐年减少至2.52%.孕产妇建卡率、产后访视率、住院分娩率、新法接生率、低出生体重率与婴儿死亡率之间多元线性回归分析差异有统计学意义(F=229.738,P=0.004),影响强度依次为住院分娩率、低出生体重率、新法接生率、建卡率、产后访视率.结论 河南省及其城乡婴儿死亡率呈下降趋势,下降幅度农村超过城市,城乡间差异逐年减小;孕产妇建卡率、产后访视率、住院分娩率和新法接生率是影响婴儿死亡率 下降的重要因素,应进一步加强孕产妇住院分娩和产后访视工作.

    作者:朱新义;黄祚军;刘利容;崔兆麟 刊期: 2012年第09期

  • 中国部分省市社区高血压患者血压控制状况及影响因素分析

    目的 了解中国部分社区高血压患者血压控制情况以及影响血压控制的因素.方法 以2005版《中国高血压防治指南》为依据,制定基层高血压规范化管理方案,并规范化培训全国基层医务人员按照方案管理高血压患者.以北京、河北、甘肃、江苏、浙江、广东省(市)实施项目社区内符合人选标准的管理高血压患者为对象,分析基线登记时的血压控制情况和危险因素.结果 至2010年12月接受项目社区管理的高血压患者共242 182例,平均年龄(61.0±10.5)岁,其中男性48.5%.调查人群血压控制率为27.4%.较低年龄组、男性、较高BMI、吸烟、饮酒、膳食偏成的高血压患者控制率较低,而有高血压家族史、常参加体育锻炼及接受抗高血压治疗人群的血压控制率较高.结论 中国社区高血压人群血压控制率仍处于较低水平,需进一步加强高血压规范化管理的干预措施.

    作者:王增武;王馨;王文;陈伟伟;朱曼璐;胡盛寿;雷正龙;孔灵芝;刘力生 刊期: 2012年第09期

  • 云南省德宏州2010-2011年新报告HIV-1感染者中新近感染比例及其影响因素

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    作者:王继宝;李艳玲;杨锦;杨跃诚;李丹;项丽芬;叶润华;段星;龚渝蓉;高洁;徐翠萍;冯晓静;郭彩红;方可芬;李菊央;肖瑶;蒋岩;何纳;段松 刊期: 2012年第09期

  • 陕西省0~12岁农村儿童意外伤害影响因素分析

    探讨陕西省农村地区0~ 12岁儿童意外伤害发生的影响因素,对今后开展儿童意外伤害健康教育,做好预防工作提供依据.1.资料与方法:2010年5-6月,在陕西省蒲城、淳化、西乡、佳县、榆阳5个区县开展农村儿童意外伤害调查.以儿童是否发生意外伤害为结局变量,以村庄为2水平,个体为1水平建立两水平logistic回归模型.将家庭住房特征和耐用消费品等因素做主成分分析,构造综合财富指数.数值越大,说明家庭经济状况越好.分析时将其划分为3个等级,即贫困、中等、富裕.使用SPSS 20.0软件和SAS 9.1软件对数据进行整理和分析.

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  • 浙江省动物米库尔新埃立克体及其16S rRNA基因分析

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    作者:陆群英;程苏云;彭伟龙;赵江灵;姜理平;葛君华 刊期: 2012年第09期

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    作者:任爱国 刊期: 2012年第09期

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    目的 分析河南省更换抗病毒治疗方案的艾滋病患者治疗状况.方法 选择84例接受国家免费一线抗病毒治疗5年以上即将更换治疗方案的艾滋病患者进行基线调查,6个月后随访.调查项目主要包括CD4+T淋巴细胞计数、病毒载量和基因型耐药.结果 基线调查时84例患者均使用早期一线方案(DDI+ AZT+ NVP),一周内31例患者开始使用后期一线方案(3TC+AZT+NVP),53例患者开始使用二线方案(3TC+TDF+LPV/r).6个月后随访发现84例患者CD4T淋巴细胞中位数从基线的374.00 cell/HI上升至406.50 cell/μl (P=0.005),其中更换二线方案患者CD4+T淋巴细胞中位数从基线时的267.00 cell/μl上升至365.00 cell/μl(P=0.015),而更换后期线方案患者的CD4+T淋巴细胞中位数则无显著变化(P=0.158). 84例患者的病毒载量中位数从基线时的3.61 log10copies/ml下降至6个月后的0.00 log10copies/ml( P=0.000),更换不同方案的两组患者随访时病毒载量中位数相比基线时也都有所下降(后期一线方案:P=0.007;更换二线方案:P=0.000).随访时有13例患者体内病毒载量>1000 copies/ml,其中5例检测到3个以上胸苷类似物耐药突变,另4例患者前后两次调杳的病毒载量无明显变化(<3倍)且未检测到任何耐药突变.结论 长时间接受治疗的艾滋病患者,在更换治疗方案6个月后机体健康状况有所改善,但合适的调整方案、及时有效的耐药检测以及随访仍不容忽视.

    作者:刘佳;崔为国;薛秀娟;孙国清;田随安;刘春华;程耀武;王哲 刊期: 2012年第09期

  • 中国首批8个社区美沙酮维持治疗门诊5年治疗效果分析

    目的 分析中国首批8个社区美沙酮维持治疗(MMT)门诊的长期治疗效果.方法 在MMT门诊开诊(基线)及运行5年后(5年评估)两个时间点,采用一对一问卷调查的方法,比较分析研究对象的人口学特征、HIV感染危险行为、毒品滥用相关违法犯罪、家庭社会功能恢复等.结果 基线与5年评估调查的研究对象分别为252人和195人,其中66人参加了2次调查.基线与5年评估时研究对象在民族、文化程度、职业、婚姻状况居住状况等特征差异无统计学意义(P>0 05).参加MMT后,研究对象在毒品滥用(100.0%vs.24.1%,P<0.001)、共用注射器吸毒(19.4%vs.0.0%,P<0.001)及因毒品而与他人发生性行为(34.5%vs.0.0%,P<0.001)等HIV感染危险行为方面有显著降低.在安全套使用率(10.6%vs.25.0%,P=0.004)、有工作的比例(27.8%vs.47.7%,P<0.001)、吸毒相关违法犯罪发生率(15.1%vs.1.5%,P<0.001)及与吸毒人员交往比例(88.9%vs.31.3%,P<0.001)均有明显改善.结论 MMT在降低HIV感染危险行为、恢复社会功能、减少违法犯罪等方面具有显著作用.应通过加强培训等措施,提高工作人员能力及服务质量,尽可能减少脱失、延长治疗时间.

    作者:曹晓斌;吴尊友;庞琳;柔克明;王常合;罗巍;殷文渊;米国栋;李建华;社区药物维持治疗国家级工作组 刊期: 2012年第09期

  • 成人重组酿酒酵母和汉逊酵母乙型肝炎疫苗免疫应答及相关因素研究

    乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)是乙肝防治的有效手段.我国自1992年在新生儿中普种HepB,儿童HBsAg携带率显著下降,但成人HBsAg携带率仍较高.目前我国成人尚无确定的免疫策略,不同种类、剂量HepB的抗体应答仍有争议.本研究对10 μg重组酿酒酵母HepB(HepB-SC)和10μg重组汉逊酵母HepB(HepB-HP)的抗体应答及其影响因素进行观察.

    作者:颜丙玉;张丽;吕静静;刘甲野;冯艺;纪峰;徐爱强;陈士玉;龚晓红;崔富强;梁晓峰 刊期: 2012年第09期

中华流行病学杂志

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