学术投稿

岗梅转录组及其乌索烷型三萜皂苷生物合成相关酶基因的发掘

郑夏生;罗秀秀;徐晖;詹若挺;陈蔚文

关键词:岗梅, 转录组, 三萜皂苷, 生物合成, 基因发掘
摘要:目的:发掘与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。方法:利用Illumina测序平台对岗梅根进行转录组测序,通过基因注释、同源分析、系统发生分析等生物信息学手段,发掘可能参与合成的单基因簇(Unigenes)。结果:在岗梅根转录组中发现了272条与萜类生物合成相关的Unigenes。这其中包括72条可能参与萜类生物合成上游途径的Unigenes,以及26条可能与三萜合成途径下游母核合成、氧化和糖基化相关的Unigenes。对其中部分Unigenes进行系统发生分析,进一步揭示了这些Unigenes与同源基因间的进化关系。利用酵母表达系统,鉴定了两个香树酯醇合酶IaAS1和IaAS2,其中IaAS1为少数以α-香树脂醇为主要产物的香树酯醇合酶之一。结论:本文从岗梅根转录组数据库中发掘到一系列可能与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。对这些基因的进一步研究,有助于从分子水平揭示岗梅中乌索烷型三萜皂苷的生物合成途径。
世界科学技术-中医药现代化杂志相关文献
  • 药用芍药发明专利格局与发展分析

    芍药药用历史悠久,被广泛运用于制药、食品及化妆品工业。本文对芍药在医药方面的发明专利进行检索,得到18192件专利数据集,在此基础上进行了多角度的统计分析。结果显示,我国药用芍药发明专利申请数量远超其他国家,企业专利权人占主体;我国专利的技术质量不高、国际化保护比例较低;与芍药配伍的传统中药多具有补益保健功能。在治疗功效的开发利用方面,心血管疾病和肝病的治疗是未来研究重点,特别需要加大剂型方面的研究力度。资源综合利用方面,对芍药花和种子的开发利用具有较大的拓展空间。本研究可以帮助科研工作者了解药用芍药当前的研究成果和专利格局,把握未来研究方向。

    作者:王秋玲;马运运;孙云波;王晓东;孙志一;刘海波 刊期: 2014年第07期

  • 针刺治疗糖尿病胃轻瘫的取穴规律文献研究

    糖尿病胃轻瘫(DGP)是近年来糖尿病常见的并发症之一,为针灸治疗的优势病种。笔者通过研究近10年来关于针灸治疗DGP的文献,对文献中应用的穴位进行统计分析,寻找其中针灸治疗DGP常用的穴位及组合,探究其用穴规律,并进行总结,从而更好的服务于临床。

    作者:牟建蛟;王琼;曾绍凡;冯庆奎;任正强 刊期: 2014年第07期

  • 再生障碍性贫血T-bet/IFN-γ信号通路及中医研究进展

    再生障碍性贫血(AA)是T淋巴细胞介导的自身免疫性疾病。AA的发病机制研究主要集中在免疫功能异常、造血干细胞损伤、造血微环境异常3个方面。近年来,AA免疫机制异常越来越受到中医药血液病研究者的关注。AA发病机制中细胞因子及相关的细胞内信号转导通路尤其复杂,其中T-bet/IFN-γ信号通路在AA发生发展过程中起着重要的作用。本文就T-bet/IFN-γ及其相关信号传导通路在AA中的作用做一综述。

    作者:张丰丰;赵宗江;张新雪;田晨;吴志奎 刊期: 2014年第07期

  • 中药复方塞络通中银杏内酯类成分的药代动力学及脑分布研究

    目的:塞络通(SLT)是由人参、银杏叶、西红花组方,主治血管性痴呆的现代复方中药。为探讨SLT药效物质基础,并为给药方案提供依据,该文对治疗剂量SLT给与大鼠后,银杏内酯成分的血药浓度、药代特征、以及脑分布进行了研究。方法:实验建立了同时检测生物样品中4种银杏内酯的高灵敏度LC-MS/MS分析方法,经过对线性、专属性、回收率、准确度、精密度的考察,所建立的分析方法符合临床前药代动力学研究要求。结果:灌胃SLT 60 mg·kg-1后,4种目标成分均在大鼠血浆中检出,各成分曲线下面积(AUC0~t)从大到小顺序依次为白果内酯(BB)、银杏内酯A(GA)、银杏内酯B(GB)和银杏内酯(GC)。银杏内酯的血浆消除半衰期(t1/2)较短,在1.61~2.82 h之间,其中BB半衰期短。所有银杏内酯成分均能够快速进入在脑组织,GA和BB仍是脑组织中的主要成分。各银杏内酯在0.25、2、7 h的脑组织浓度均较同时间点血浆中药物成分低得多,且各成分在脑组织中浓度随时间下降较快。结论:研究结果表明,银杏内酯能够快速吸收进入体循环并进入脑组织,GA、BB和GB是其中主要的体内成分,它们能够共同作用于外周和脑组织,通过各自的药理活性机制达到塞络通对缺血性痴呆的疗效。

    作者:张颖;林力;任常英;林成仁;刘建勋;Dennis Chang;Alan Bensoussan 刊期: 2014年第07期

  • 紫河车对围绝经期模型大鼠E2、LH、FSH干预作用研究

    目的:探讨紫河车对围绝经期大鼠血清雌二醇(E2)、促卵泡刺激素(FSH)、促黄体生成素(LH)的影响。方法:选取4月龄阴道细胞学涂片显示动情周期正常的青年雌性SD大鼠,和18月龄阴道细胞学涂片表现为无动情周期的老年SD大鼠,为正常对照组;选取11~12月龄阴道细胞学涂片显示动情周期紊乱的围绝经期SD大鼠,随机分为模型组、治疗组和阳性对照组,正常对照组、模型组给予生理盐水,治疗组给予紫河车,阳性对照组给予教材方,观察紫河车对围绝经期模型大鼠E2、LH、FSH的干预作用。结果:与青年组比较,老年组、模型组血清E2水平均显著降低(P<0.01),FSH和LH水平均显著升高(P<0.01);与模型组比较,治疗组、阳性对照组血清E2水平均显著升高(P<0.01),FSH和LH水平均显著降低(P<0.01)。结论:紫河车及教材方均能降低围绝经期大鼠的FSH、LH水平和提高雌激素水平。

    作者:曾莉;张丽;刘裕萍;季武;陈燕萍 刊期: 2014年第07期

  • 雄芍汤调节TGF-β/Smad通路有效部位的研究

    目的:研究雄芍汤抗肝纤维化的药效物质基础,筛选其调节TGF-β/Smad通路的有效部位。方法:Wistar雄性大鼠随机分为正常组、模型组、扶正化瘀胶囊组(扶正组)、雄芍汤组(雄芍组)、粗多糖组(多糖组)、总苷组、总生物碱组(总碱组),二甲基亚硝胺(DMN)腹腔注射复制大鼠肝纤维化模型。造模成功后,开始灌胃给药,治疗组分别给予扶正化瘀胶囊(0.105 g·mL-1)、雄芍汤粗多糖提取物(35.420 mg·mL-1)、雄芍汤总苷提取物(25.725 mg·mL-1)、雄芍汤总生物碱提取物(0.196 mg·mL-1),正常组与模型组灌服等量生理盐水,每日1次,疗程4周。4周后处死取材,实时荧光定量PCR检测肝组织TGF-β1 mRNA表达, Western blotting检测肝组织Smad3、Smad7蛋白表达。结果:与模型组比较,各治疗组TGF-β1 mRNA、Smad3蛋白表达均显著降低,Smad7蛋白表达均显著升高(P<0.05或P<0.01),总苷组Smad7、总碱组与模型组无显著性差异。结论:粗多糖部位和总苷部位为雄芍汤调节TGF-β/Smad通路的有效部位。

    作者:李霞;门九章;李孝波 刊期: 2014年第07期

  • 茉莉酸甲酯影响阳春砂挥发性萜类代谢和基因转录

    目的:研究茉莉酸甲酯对阳春砂挥发性萜类合成的影响,深入了解挥发性萜类生物合成的分子调控机制。方法:用不同浓度茉莉酸甲酯溶液喷施阳春砂的叶片和果实,用微波法提取果实中的挥发性萜类成分,应用气相色谱-质谱(GC-MS)联用技术检测挥发性萜类成分的变化,通过转录组测序构建cD-NA文库并进行生物信息学分析。结果:果皮和种子团中分别检测到20种和33种挥发性萜类成分,600μmol·L-1 MeJA喷果24 h后果皮和种子团中大部分挥发性萜类成分的积累量明显增加,如乙酸龙脑酯、樟脑和龙脑等;而200μmol·L-1 MeJA喷施叶片或果实对果皮及种子团中不同挥发性萜类含量的影响存在差异,且200μmol·L-1 MeJA喷施果实比喷施叶片更能提高种子团中挥发性萜类成分的积累量。此外,转录组测序共获得68168个Unigene,通过与公共数据库比对,共有48627个Unigene获得注释。对KEGG代谢通路的注释结果进行初步分析,发现挥发性萜类代谢密切相关的Unigene有208个,MYC2类转录因子(JA信号转导的重要调控因子)相关的Unigene有22个。结论:MeJA能有效调控阳春砂中挥发性萜类成分的代谢,转录组测序获得了多个与挥发性萜类合成相关的候选基因,为深入开展阳春砂挥发性萜类生物合成相关功能基因的发掘及调控研究提供了丰富的数据资源。

    作者:王焕;杨锦芬;邓可;何雪莹;詹若挺;唐梁 刊期: 2014年第07期

  • 隐喻的逻辑与信念修正-一种更适合中医研究的逻辑方法

    辨证论治是中医诊疗疾病的精髓,“观其脉证、知犯何逆、随证治之”是辨证论治的具体过程。本文通过使用逻辑学的方法对辨证论治的过程进行研究与分析,指出中医诊治疾病的过程是一个信念修正的过程,中医理论体系的根源是隐喻的,隐喻认知的逻辑和信念修正是一种适合中医理论体系研究的逻辑方法。

    作者:郭瑨;庄梅云;贾春华 刊期: 2014年第07期

  • 岗梅转录组及其乌索烷型三萜皂苷生物合成相关酶基因的发掘

    目的:发掘与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。方法:利用Illumina测序平台对岗梅根进行转录组测序,通过基因注释、同源分析、系统发生分析等生物信息学手段,发掘可能参与合成的单基因簇(Unigenes)。结果:在岗梅根转录组中发现了272条与萜类生物合成相关的Unigenes。这其中包括72条可能参与萜类生物合成上游途径的Unigenes,以及26条可能与三萜合成途径下游母核合成、氧化和糖基化相关的Unigenes。对其中部分Unigenes进行系统发生分析,进一步揭示了这些Unigenes与同源基因间的进化关系。利用酵母表达系统,鉴定了两个香树酯醇合酶IaAS1和IaAS2,其中IaAS1为少数以α-香树脂醇为主要产物的香树酯醇合酶之一。结论:本文从岗梅根转录组数据库中发掘到一系列可能与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。对这些基因的进一步研究,有助于从分子水平揭示岗梅中乌索烷型三萜皂苷的生物合成途径。

    作者:郑夏生;罗秀秀;徐晖;詹若挺;陈蔚文 刊期: 2014年第07期

  • 山药在各历史时期临床运用的研究

    目的:研究山药在各历史时期临床运用,为临床使用山药提供依据。方法:收集《中医方剂大辞典精选本》中的山药方668首,对山药及其各功效出现的频次及频率进行统计分析。结果:山药各功效区别运用从宋代开始广泛,至明、清达到高点,近现代各功效区别运用走低。山药在整个历史时期,各功效的使用以补脾益胃和益肾强阴为主,其次为固肾敛阴和补肺生津。结论:本研究分析了山药在各历史时期临床运用,为临床科学组方及人们日常保健使用山药提供依据。

    作者:周滢;周萍 刊期: 2014年第07期

  • 艾滋病疫毒伤正气与伤元气的理论探讨

    从中医学角度对正气与元气的生理功能、正气与元气的关系进行论述,阐明正气和元气在人体的生命活动中具有重要作用,二者相辅相成。在艾滋病的发病中,艾滋病疫毒具有伤人正气的特点,在艾滋病疫毒侵犯人体正气时,人体的元气先受损,这与艾滋病疫毒的特点和元气自身的生理功能是密不可分的。因此,艾滋病疫毒伤正气与伤元气同时存在,贯穿艾滋病的全过程,伤正气关键在于伤元气。

    作者:黄冠;徐立然;惠高萌;贺小举;李正 刊期: 2014年第07期

  • 基于自适应聚类算法的高脂血症中医诊断辅助平台研究

    高脂血症是血管及脏器疾病的主要基础病变之一,中医药在防治高脂血症方面具有毒副作用小,疗效明显的优势,建立高脂血症诊断辅助平台有助于提高诊疗效率,并为高脂血症辨证分型标准化研究提供数据采集、存储与分析的平台。首先建立高脂血症四诊信息临床采集平台及数据库,记录患者就诊不同时期的望诊图像及其余三诊的文字信息,方便医师更准确地掌握治疗过程中患者的临床表现,从而总结治疗经验,提高治疗效果;在此基础上利用可调整相似度阈值的自适应聚类算法对已采集的897个病例四诊信息进行分类,终得到5类,将得到的每个类别中所对应样本的病症特征与所属中医的证候类别联系起来,后用相似性算法判断新采集病例属于的哪一类,为中医辨证分型诊断提供建议。

    作者:涂泳秋;陈国华;朴胜华;郭姣 刊期: 2014年第07期

  • “探索未知,追求新知”,提高中医学术与现代中基研究水平--现代中医基础理论系列研究(中篇Ⅱ)

    为保障现代中医基础理论研究和建立,本文首次提出现代中基学术规范概念与其逻辑结构和规范要点。借鉴国内外相关研究进展,对学术、学术规范、中医学术、中医学术规范等基本概念,进行深入探讨,给出相关概念逻辑定义,揭示概念内涵和彼此属种概念之间逻辑层次关系。以此为基础,提出现代中基学术规范三层次规范要点。为中医学术研究和现代中医基础理论建立,提供初步的规范保障。

    作者:乔明琦;詹向红;窦学俊;魏盛;王晓茹 刊期: 2014年第07期

  • 基于序列的鳞毛蕨属贯众药材基原植物的鉴定研究

    目的:研究psbA-trnH序列在近缘贯众基原物种鉴定中的有效性。方法:对常见鳞毛蕨属贯众基原物种psbA-trnH序列进行PCR扩增及测序,原始峰图通过CodonCodeAligner软件查看、拼接和校对,并根据GenBank注释截取标准条形码数据。利用TaxonGap方法在实验物种范围(9物种19样品)和扩大范围(17物种44样品)内评估该序列的鉴定效率。结果:物种鉴定范围扩大后psbA-trnH序列鉴定成功率由100%(9/9)降至82.4%(14/17),种内异质性数值高于种间可分离性的比例,由11.1%(1/9)上升为52.9%(9/17)。结论:psbA-trnH序列可作为整体贯众同名异物品种鉴定的推荐条形码,实际应用中需注意种内采样代表性的问题。

    作者:刘锋;蒋研风羊;詹若挺;马新业;陈蔚文 刊期: 2014年第07期

  • 阳春砂果实发育过程中可溶性糖及蔗糖代谢酶活性变化规律的研究

    目的:为研究阳春砂果实发育过程中可溶性糖含量、蔗糖代谢酶活性和基因表达量的动态变化规律,并为提高阳春砂的产量提供依据。方法:本研究以阳春砂幼果期、成熟中期和成熟末期的新鲜果实为试验材料,采用高效液相色谱法、紫外分光光度法对可溶性糖含量和酶活性进行测定,并结合3个发育时期果实的高通量测序表达谱数据,分析糖代谢中3个关键酶基因的表达趋势。结果:果糖、葡萄糖和蔗糖是阳春砂果实中的主要糖分,在果实发育过程中,果皮中的己糖(果糖和葡萄糖)含量逐渐降低,种子团中己糖含量先降低后升高;果皮和种子团中蔗糖含量和蔗糖合成酶净活性(合成方向减去分解方向活性)均逐渐升高。结论:基于RNA-seq的糖代谢中的关键酶基因表达趋势分析表明,蔗糖磷酸合成酶、蔗糖合成酶基因的表达趋势以先上升后不变为主,转化酶基因的表达趋势以逐渐上升为主。蔗糖合成酶是催化阳春砂果实中蔗糖合成与分解的关键酶,果实成熟末期是蔗糖合成酶活性和蔗糖含量高的时期。

    作者:于安民;张敏;杨锦芬;林文华;严萍;梁锦培;詹若挺 刊期: 2014年第07期

  • 慢性阻塞性肺疾病测评工具的现状与思考

    慢性阻塞性肺疾病(COPD)测评工具的研制及应用已成为国内外研究的热点,并出现了大量的量表和问卷。比较不同量表/问卷的特点,选择合适的测评工具是目前亟待解决的问题。本文对国内外常用的测评工具进行了评价,并提出了相关思考,为完善COPD的疗效评价指标体系提供依据。

    作者:张晓莉;谢洋;李建生 刊期: 2014年第07期

  • 薯蓣皂苷片对RSC-364细胞核转录因子-κBp65表达的影响

    目的:观察薯蓣皂苷片对类风湿性关节炎细胞模型核转录因子NF-资Bp65及基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、血管内皮生长因子(VEGF)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)表达的影响。方法:用白介素-17(IL-17)+TNF-α共同孵育大鼠RSC-364细胞,以不同浓度薯蓣皂苷片进行干预,MTT法检测不同药物浓度对细胞存活率影响,采用Western blot检测各组NF-资Bp65及其抑制蛋白(I资B-α)的表达,酶联免疫吸附试验(ELISA)检测细胞培养液上清中VEGF、MMP-9、TNF-α蛋白水平的变化。结果:薯蓣皂苷片可促进资B抑制蛋白的表达量,降低NF-资B蛋白水平的高表达,并降低细胞分泌VEGF、MMP-9、TNF-α水平。结论:薯蓣皂苷片对RSC-364细胞核因子资B有负向调节作用,提升I资B-α的表达并能降低炎性因子和血管新生因子分泌,提示其在类风湿发病中可能起到潜在的调节作用。

    作者:段一娜;王明娟;孔素红;高玉峰;赵秀荣;宋鸿儒 刊期: 2014年第07期

  • 慢性阻塞性肺疾病急性加重危险窗证候分布的临床调查研究

    目的:基于临床调查阐释慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)危险窗证候分布规律并探讨病机转化。方法:收集8所医院AECOPD患者急性加重缓解后进入危险窗的中医证候学相关资料,建立数据库,运用SPSS 13.0进行统计分析。结果:本次调查结果显示,15个基础证候中以肺气虚证频率高,其次是肾气虚证和痰湿证;14个复合证候中以肺肾气虚证和痰湿阻肺证出现频率高;AECOPD危险窗临床常见证候有肺肾气虚兼痰湿阻肺、肺肾气虚、肺脾气虚兼痰湿阻肺、肺脾气虚、肺肾气阴两虚兼痰湿阻肺、肺肾气阴两虚、肺肾气虚兼痰瘀阻肺和肺肾气阴两虚兼痰瘀阻肺。结论:AECOPD危险窗常见证候以虚实夹杂为主,单纯虚证及单纯实证较少。

    作者:张海龙;李建生;王海峰;曹帆;侯聪霞;潘颖超;张盼奎;余学庆 刊期: 2014年第07期

  • 传统药物专利价值评估体系探析

    目前尚缺乏针对传统药物的专利评估方法和体系,鉴于此,本文针对传统药物专利的特点构建了价值评估体系,该体系由10个关键指标构成,并配备原始价值和相对价值的计算方法,专利的相对价值更易于表明专利之间的价值差异。专利的法律价值、技术价值、经济价值之间存在强关联性,本文将这三类价值指标进行有机整合,从整体上进行综合性价值评估。该体系纳入该领域专利所特有的指标的同时,剔除针对性不强及难以取得的指标,且本方法不涉及人工打分,未来可应用于传统药物乃至更多类型的专利价值自动化评估。

    作者:张丛;庆俊梅;刘延淮;李彦博 刊期: 2014年第07期

  • 阳春砂和在烟草中单独及共同过量表达调控萜类化合物的生物合成

    目的:HMGR 和DXR 分别是萜类生物合成途径---MVA和MEP途径的关键酶,本研究探讨阳春砂A vHMGR 和A vDXR 在转基因烟草中的过量表达对不同萜类化合物生物合成的影响。方法:采用实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)技术分析A vHMGR 和 A vDXR 的表达水平,应用专一底物法测定 HMGR 和DXR 的酶活性,利用气相色谱-质谱(GC-MS)联用技术检测不同萜类化合物的变化。结果:A vHMGR 或A vDXR 单独过量表达抑制了HMGR 和DXR 的活性,提高了五针松烯、新植二烯、薄荷烯和甾醇的含量;而A vHMGR 和A vDXR 共同过量表达对不同植株中酶活性的影响有差异,提高了甾醇和植醇的含量,但抑制了新植二烯的积累。结论:A vHMGR 和A vDXR 单独或共同过量表达对烟草中不同萜类化合物的合成调控存在差异,同时也证明了MVA和MEP途径并不完全独立,而是有着相互交流,本研究为利用阳春砂A vHMGR 和A vDXR 进行萜类化合物的代谢调控提供了依据。

    作者:王焕;魏洁书;杨锦芬;詹若挺;陈蔚文;叶圆 刊期: 2014年第07期

世界科学技术-中医药现代化杂志

世界科学技术-中医药现代化杂志

主管:世界科学技术-中药现代化

主办:中国科学院