学术投稿

一起炭疽疫情中PCR和新一代测序技术应用研究

刘园;王小梅;梁志超;窦相峰;王全意;林长缨

关键词:炭疽芽胞杆菌, 皮肤炭疽, 实时荧光PC R, 新一代测序
摘要:目的 对2016年7月北京市发生的一起炭疽疫情中PCR和新一代测序技术的应用情况进行描述和分析,探讨合理和快速的炭疽疫情实验室检测方法.方法 采集疑似皮肤炭疽患者的焦痂处涂抹样本和血清样本及炭疽疫情现场环境样本,采用实时荧光PCR法检测炭疽芽胞杆菌.同时采用细菌分离培养法分离和鉴定炭疽芽胞杆菌,应用新一代测序法对分离到的菌株进行检测.结果 所有患者的涂抹样本和病死牛血污染土壤样本实时荧光PCR法检测为阳性.1例炭疽患者患处皮肤涂抹样本和病死牛血污染的土壤样本中分别分离到炭疽芽胞杆菌,同属于A.Br.001/002组.5例患者血清中炭疽荚膜抗体阳性,其中1例双份血清检测到抗体阳转.结论 实验室检测结果充分证明了此次疫情是由炭疽芽胞杆菌感染引起.实时荧光PCR、新一代测序等分子生物学方法在快速鉴定炭疽疫情中具有重要意义.
中国卫生检验杂志相关文献
  • 生活饮用水常规项目开展相关问题的讨论

    饮水安全问题直接关系到人类生命健康,生活饮用水卫生检测一直以来都倍受国家的重视,近年国家大力推进饮水安全工程,每年都有一大批饮水安全工程在水利部门的牵头下完成配套工程建设.生活饮用水常规项目检测是水质卫生监测的一项重要内容.通过常规项目的水质卫生监测,系统地了解饮用水卫生基本状况,为加强饮用水安全管理工作提供依据和技术支持,是保证供水水质安全,促进饮水安全工程长期有效运转的重要措施,更是有效评估饮水安全工程防病效果,确保建成后水质达标和如期发挥效益的重要基础[1-2].

    作者:章平均 刊期: 2017年第16期

  • 缺铁性贫血相关参数在幼儿缺铁性贫血诊断中的探讨

    目的 探讨未成熟血小板相关参数在幼儿缺铁性贫血(IDA)疾病中临床应用价值.方法 采用XE-5000全自动血液分析仪检测温州地区63例健康幼儿外周血中未成熟血小板绝对值(IPF)、未成熟血小板比率、高荧光未成熟血小板比率、血小板平均侧向荧光强度(PLT-X)及网织血小板计数(PLT-O).同期测定146例临床确诊的儿童IDA患者外周血的相同参数按贫血的严重程度划分,与对照组进行比较并做统计学分析.结果 对照组PLT-、未成熟血小板比率、高荧光未成熟血小板比率、IPF、PLT-X参数男女之间差异均无统计学意义(P>0.05).儿童IDA患者检测指标IPF、未成熟血小板比率、高荧光未成熟血小板比率及PLT-X指标与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.01).轻度IDA、中度IDA患者PLT-O指标与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.01).结论 提示PLT相关新参数在IPF相关参数对临床IDA患者早期诊断和治疗有一定的价值.

    作者:陈碎朋;余玲玲;江明华;谢奇朋 刊期: 2017年第16期

  • 钙卫蛋白和基质细胞衍生因子-1α在恶性胸腔积液中的表达水平及临床意义

    目的 探讨钙卫蛋白和CXCL12在恶性胸腔积液中的表达水平及其临床意义.方法 选取胸腔积液患者105例作为研究对象,包括恶性胸腔积液患者50例和非恶性胸腔积液患者55例,采用ELISA法测定胸腔积液中钙卫蛋白和CXCL12水平.结果 恶性胸腔积液组患者的钙卫蛋白和CXCL12水平明显低于非恶性胸腔积液组,差异均有统计学意义(P<0.05).ROC曲线分析,胸腔积液钙卫蛋白曲线下面积(AUC)为0.81,灵敏度为71.2%,特异度为81.7%;胸腔积液CXCL12 AUC为0.78,灵敏度为70.5%,特异度为76.4%.结论 钙卫蛋白和CXCL12的检测对恶性胸腔积液与非恶性胸腔积液的鉴别诊断有一定的参考价值.

    作者:褚爱娟;黄伟萍;翁丹丹;田军 刊期: 2017年第16期

  • 实验室认可进程中不同检测系统常规生化结果比对与临床可接受性评价

    实验室认可的国际标准ISO15189(医学实验室一质量和能力的专用要求)对检验结果的溯源性和可比性提出了明确要求,强调方法学比较试验(比对试验)是实现准确度溯源和患者标本检验结果可比性的重要途径[1].对于拥有多个不同生化检测系统的实验室,应参考美国临床实验室标准化委员会NCCLSEP9-A文件,对不同检测系统进行方法比对和偏差评估,并判断其临床可接受性,为实现不同检测系统间检验结果的可比性提供依据[2].本次试验的对象为检验科生化室的美国Beckman公司AU5821和快检中心的美国强生Viros350,选定Urea、Cr、UA 3个项目进行比对,对正常、异常2种浓度质控品和45份患者新鲜血清在AU5821和Viros350全自动生化分析仪上分别进行Urea、Cr、UA的检测,并对检测结果的相关性、精密度进行比对分析,为实验室内不同检测系统的检测结果提供实验依据[3-4].

    作者:肖林林;冯景;魏取好;赵亮;杨晓英 刊期: 2017年第16期

  • 2987例新生儿地中海贫血基因检测结果分析

    目的 了解中山巾新生儿α、β地中海贫血基因型的分布情况.方法 对2 987例新生儿血样采用单管多重聚合酶链反应法结合反向斑点膜条杂交技术同时进行α、β-地中海贫血基因检测.结果 经基因分析,共检出d、β-地中海贫血312例,比例为10.45%.α-地中海贫血226例,以--SEA/αα基因型为常见,占48.67%;非缺失型18例,占7.96%;确定为β-地中海贫血共94例,α、β复合型地中海贫血8例.β-地中海贫血中共计发现8种基因型,其中以CD41-42位点突变所占比例高;2 987例样本中男性1 601例,其中地中海贫血166例(10.37%),女性1 386例,其中地中海贫血146例(10.53%),男性和女性地中海贫血检测阳性率差异无统计学意义(P>0.05).结论 中山地区新生儿地中海贫血基因携带率高,遗传背景多样复杂,所以在新生儿期开展地中海贫血防控工作具有重要意义.

    作者:万志丹;梁睿;黄湘;吴学威;李冬秀;钟裕恒 刊期: 2017年第16期

  • 2014年-2016年广州市自动售水机水质卫生状况调查

    目的 调查广州市街头自动售水机水质的卫生现状,分析可能存在的问题,提出管理对策.方法 于2014年-2016年采用简单随机抽样的方法,对抽取的街头自动售水机的水质监测报告进行整理分析.结果 2014年-2016年街头自动售水机水质合格率分别为85.06%、77.91%和81.58%,主要不合格指标是菌落总数.仅黄埔区、萝岗区、番禺区和白云区合格率达到90%;中心城区的街头自动售水机数量约占3/4,中心城区的合格率(88.96%)明显高于外围城区(61.60%),差异有统计学意义(P<0.05).4间大型厂家的自动售水机数量接近总数的1/2,总合格率为85.02%.结论 街头自动售水机水质卫生状况有所改善,但合格率仍较低,品牌集中度不高,需加强监管和研究,寻找原因和对策.

    作者:黄仁德;吴燕;钟嶷;王德东 刊期: 2017年第16期

  • 超高效液相色谱法同时测定尿中甲苯、二甲苯、苯乙烯代谢产物

    目的 建立超高效液相色谱法同时测定尿中苯乙烯的代谢产物苯乙醇酸(MA)和苯乙醛酸(PGA)、甲苯的代谢产物马尿酸(HA)、二甲苯的代谢产物甲基马尿酸(MHA)(含3种同分异构体)的方法.方法 尿液样本用HCl酸化后,经乙酸乙酯提取,吹氮浓缩,用流动相稀释后直接进样,采用20 mmol/L乙酸铵-甲醇为流动相,波长235 nm,流速0.25 ml/min,Waters ACQUITY UPLC(R)CSH TMc18柱分离,保留时间定性,峰面积定量.结果 标准曲线为2μg/ml~400 μg/ml,相关系数均>0.999 9,相对标准偏差为0.17% ~ 6.51%,回收率为83.2% ~ 107.0%,检出限MA为0.009 μg/ml~0.13 μg/ml,分析时间为6 min.结论 该方法操作简便,快速,准确,灵敏,适合尿中MA、PGA、HA和MHA的测定.可用于日常接触苯乙烯、甲苯、二甲苯等危害因素工作人员的职业健康监测,具有一定的实际应用价值.

    作者:张瑰;陈剑刚;潘俊毅;张艳 刊期: 2017年第16期

  • 血清白蛋白与高血压性脑出血血肿周围水肿的相关性分析

    目的 探究血清白蛋白(ALB)水平与高血压性脑出血血肿周围水肿的相关性.方法 2012年2月-2016年2月本院收治的230例高血压性脑出血患者为研究对象,依据患者血清ALB水甲分为观察组(ALB≤35 g/L)与对照组(ALB >35 g/L),再将观察组分为重度组(<25 g/L)、中度组(25g/L~30g/L)和轻度组(30g/L ~35g/L).分别在入院时、入院后1d、4d和14d分析不同时期的相对水肿体积指数(REI)和水肿体积变化指数(AEI),并分析血清ALB与其的相关性.结果 入院后1d时2组患者REI、AEI相比,差异均无统计学意义(P>0.05);入院后4d和14 d时,观察组的REI、AEI均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).随着观察组病情的加重,患者的REI不断增加,差异有统计学意义(P<0.05).AEI与血清ALB水平呈负相关(r=-0.738,P<0.05).结论 血清ALB水平过低会导致高血压脑出血患者的水肿程度加重,且其严重程度与血清ALB的水平呈负相关.

    作者:王建国 刊期: 2017年第16期

  • 某科研单位妇女保健需求调查分析

    目的 探讨某科研单位女性对妇女保健的需求,为提升妇女保健水平和自我保健意识提供科学依据.方法 采用自制调查问卷对本单位340名妇女进行调查,应用SPSS 21.0软件对问卷进行描述统计与非参数检验的分析.结果 女性对讲座满意程度分别是效果81.20%、重要性78.20%、需求62.40%、认知19.70%,已婚女性对讲座的效果、重要性、认知程度更大,差异有统计学意义(Z值分别为-2.959、-2.171、-2.374,P<0.05),35岁以下女性对讲座的需求更大,差异有统计学意义(Z值=-2.156,P<0.05).结论 大多数妇女对保健的需求更大,但认知较低,因此,需进一步加强该妇女人群的宣教力度,同时采用多元化的服务方式对妇女保健工作具有重要意义.

    作者:杨红宁 刊期: 2017年第16期

  • 同位素标记-超高效液相色谱-串联质谱法测定茶叶中的高氯酸盐

    目的 建立茶叶中高氯酸盐的同位素标记-超高效液相色谱-串联质谱测定法.方法 茶叶样品经超纯水-甲醇(2∶3,V/V)提取后,高速离心,上清液用PRiME HLB柱净化,再经Thermo Acclaim TRINITY P1色谱柱分离,串联质谱法检测,内标法定量.结果 高氯酸盐在0.25 μg/L~ 50.0 μg/L时线性回归方程为y=0.329 86x +0.031 82,相关系数(r)为0.999 3.加标浓度为0.10 mg/kg、0.40 mg/kg、0.80 mg/kg时,绿茶、红茶、茉莉花茶的平均回收率分别为93.8% ~ 103.5%、93.4%~98.6%、94.6% ~ 102.7%,相对标准偏差(RSD)分别为2.4% ~ 4.6%、3.6% ~4.9%、3.7% ~4.8%.检出限为2.0 μg/kg.结论 本方法前处理简单、灵敏度高、准确、可靠,适用于茶叶中高氯酸盐的测定.

    作者:陈东;范赛;沙博郁;王正;吴国华;赵榕 刊期: 2017年第16期

  • 尿液中性粒细胞明胶相关脂质运载蛋白时间分辨免疫荧光分析方法的建立及临床应用评价

    目的 建立尿液中性粒细胞明胶相关脂质运载蛋白(NGAL)时间分辨免疫荧光分析方法并应用于临床检测.方法 根据美国临床和实验室标准化协会(CLSI)制定的相关EP系列评价文件,使用本实验建立的时间分辨免疫荧光分析方法,对尿液NGAL的低检测限、精密度、准确度、稳定性、分析测量范围、Hook效应、生物参考区间进行检测评价.通过检测健康体检人员及临床急性肾损伤患者尿液样本与Abbott ARCHITECT化学发光法进行比对,使用SPSS软件进行统计学分析.结果 本实验所建立的方法低检测限为1.5 ng/ml,批内不精密度与总不精密度均<6.0%,回收率为93% ~ 107%,当NGAL浓度高达3×105 ng/ml时,无Hook效应(5 × 105 ng/ml亦不会出现假阴性),该方法与AbbottARCHITECT化学发光具有很强的相关性(r=0.989),且37℃加速7d荧光信号保留率均>80%.结论 本实验室研究方法检测尿液NGAL各项性能指标均满足临床要求,可应用于急性肾损伤患者的诊断.

    作者:万光辉 刊期: 2017年第16期

  • 血流感染高毒力肺炎克雷伯菌的临床危险因素及耐药性分析

    目的 分析由肺炎克雷伯菌引起的血液感染患者的临床危险因素和耐药性,比较经典与高毒力肺炎克雷伯菌感染的区别.方法 回顾性分析本院2012年-2015年127例感染肺炎克雷伯菌的菌血症患者的临床特征.结果 127株肺炎克雷伯菌中筛选出高毒力型22株.38.3%感染经典肺炎克雷伯菌者是肿瘤患者,医院获得性占67.3%.而毒力型肺炎克雷伯菌的血液感染以社区获得性为主,占81.8%.肝脏疾病、社区获得性、糖尿病是感染毒力型肺炎克雷伯菌的危险因素.药敏结果显示高毒力肺炎克雷伯菌对氨苄西林-舒巴坦、庆大霉素、左氧氟沙星和复方新诺明敏感率比经典肺炎克雷伯菌高.结论 血液感染的肺炎克雷伯菌耐药率高,需引起临床的高度重视,特别对于高毒力型肺炎克雷伯菌的易感人群,必须采取有效措施控制其传播.

    作者:章丹;余方友 刊期: 2017年第16期

  • 2015年永康市食品安全风险监测结果分析

    目的 了解2015年永康市食品微生物及其致病因子污染状况,为政府食品安全监管工作提供参考.方法 根据《2015年永康市食品安全风险监测方案》共采集食品样品230份,依据GB 4789系列标准等进行检测,并对结果进行分析.结果 230份样品致病菌检出率为6.52%,副溶血性弧菌检出率为55.0%,单核细胞增生李斯特菌检出率为1.76%,沙门菌检出率为0.50%.对肉及肉制品等5类180份食品进行了大肠菌群检测,阳性率为24.4%.结论 永康市销售的食品中微生物及其致病因子污染状况总体良好,但仍有部分食品存在隐患.其中水产品、肉与肉制品、餐饮自制食品、鲜榨蔬果汁等食品受污染等现象比较严重,相关部门要引起重视.

    作者:吕春景;支红峰;石晓波 刊期: 2017年第16期

  • 幽门螺杆菌感染类型与冠心病发生、冠脉斑块类型及临床预后的关系

    目的 探讨幽门螺杆菌(Hp)感染类型与冠心病发生、冠脉斑块类型及冠心病患者临床预后的关系.方法 选取本院2014年11月-2015年11月经冠脉造影确诊为冠心病的患者120例为观察组,同期120例健康体检者为对照组,采用酶联免疫吸附法检测患者血清中Hp特异性抗体CagA类型,并检测患者Hp感染与冠脉斑块类型的关系,用Logistics回归分析探讨冠心病患者预后不良的风险因素.结果 Hp阳性患者冠心病风险为阴性患者的2.8倍、Hp+CagA-IgG阴性患者冠心病风险比为2.5,而Hp+ CagA-IgG阳性冠心病风险为Hp阴性患者的3.3倍,Hp阴性的冠心病患者软斑块16例,占64.0%,明显高于Hp+ CagA-IgG阴性和Hp+ CagA-IgG阳性的患者,而纤维斑块6例,占24.0%、钙化斑块3例,占12.0%,均明显低于Hp+ CagA-IgG阴性和Hp+ CagA-IgG阳性的患者.Hp+ CagA-IgG阳性、软斑块是患者心血管事件的独立风险因素.结论 Hp感染患者冠心病风险明显增加,而Hp+ CagA-IgG阳性是冠心病患者软斑块和心血管事件的独立风险因素.

    作者:孙瑞华 刊期: 2017年第16期

  • 自拟凉血解毒汤加减联合西医治疗小儿过敏性紫癜对患者血清炎性因子、免疫功能及凝血功能的影响

    目的 探讨自拟凉血解毒汤加减联合西医治疗对小儿过敏性紫癜(HSP)患者血清炎性因子、免疫功能及凝血功能等生化指标的影响.方法 收集96例小儿HSP患者依据随机数据表法分为对照组(n=48)及观察组(n=48),对照组患儿给予常规西医对症支持治疗,观察组在对照组基础上联合自拟凉血解毒汤加减治疗,连续治疗2个月;比较治疗前后2组的炎性因子、免疫功能和和凝血功能指标水平.结果 观察组治疗后,TNF-α、IL-6、IL-10和FIB水平显著低于对照组,CD3+、CD4+、APTT和PT水平显著高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);2组CD8+水平比较差异无统计学意义(P>0.05),2组治疗后CD4+/CD8+水平较组内治疗前均显著升高,差异均有统计学意义(P<0.05),观察组与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 自拟凉血解毒汤加减联合西医治疗小儿过敏性紫癜的疗效显著,可有效降低患者的炎性因子水平,改善免疫功能及凝血功能,值得临床推广.

    作者:马玲;刘红霞;高昌杰 刊期: 2017年第16期

  • 陕西省一起甲型H1N1流感暴发疫情的流行病调查及实验室诊断

    目的 对2013年陕西省一起流感暴发疫情进行流行病学调查和实验室诊断,为暴发疫情的防控提供科学依据.方法 对该起流感暴发疫情进行现场流行病学调查;对暴发疫情的流感样病例标本进行核酸检测、MDCK细胞培养,RT-PCR法扩增流感病毒血凝素(HA)基因,测定核苷酸序列,用DNAman、Mega软件分析结果.结果 该起暴发疫情发病呈单峰,具有年级聚集性,引起本次流感暴发疫情的病原为甲型H1N1流感病毒.该病毒株的HA基因与2013年-2014年北半球疫苗株相比,在抗原决定簇的180、202、220位发生突变.结论 本次暴发疫情的流行特征与季节性流感相似,引起暴发疫情的甲型H1N1流感为本地流行株突变而来;严格落实晨检制度和停课是控制疫情的关键.

    作者:马萍;卫晶晶;许晶;张蕾;史伟;李慎 刊期: 2017年第16期

  • 2012年-2016年陕西省食品中蜡样芽胞杆菌污染情况调查

    目的 了解陕西省食品中蜡样芽胞杆菌的污染情况,为制定有效的监管措施提供依据.方法 按照食品安全国家标准方法,2012年-2016年在陕西省10个地市的流通、餐饮服务环节采集食品样品,进行监测分析.结果 7类3 157份食品样本中检出蜡样芽胞杆菌469株,总检出率为14.86%,各类食品中均有蜡样芽胞杆菌的检出,乳与乳制品检出率高,为20.00%,其次是婴儿食品,为15.57%.流通和餐饮环节的检出率分别为15.06%,14.65%,差异无统计学意义(P>0.05).2012年-2016年各年份检出率分别为15.25%、15.58%、10.45%、19.05%及14.82%,不同年份检出率差异有统计学意义(P<0.05).商洛市、西安市、榆林市及汉中市检出率高于平均检出率.结论 陕西省食品中存在蜡样芽胞杆菌污染,相关监管部门应加强重视,预防食源性疾病的发生.

    作者:李文涓;马琳;张铮;石一;刘东立 刊期: 2017年第16期

  • 同型半胱氨酸、髓过氧化物酶作为急性心肌梗死早期诊断生物标志物的评价

    目的 评价Hcy、MPO对AMI早期诊断的应用价值.方法 选取本院就诊的急性心肌梗死患者58例为AMI组,冠心病患者70例为CHD组,另收集同期健康体检者80例为对照组,检测所有对象血清中Hcy、MPO、cTn、CK-MB和MYO的水平,分析组间差异,ROC曲线分析各指标对AMI早期诊断的价值.结果 血清中Hcy和MPO在CHD组水平升高,AMI组发病3h水平均显著升高,差异有统计学意义(P<0.01);cTn在发病3h后开始升高,至发病24 h后升高至高水平;CK-MB在发病3h开始升高,至发病12 h升至高水平;MYO发病3h升高至高水平,之后缓慢下降.ROC曲线结果显示Hcy、MPO、cTn、CK-MB和MYO均能很好的区分CHD组和AMI组,AUC分别为0.920 4、0.884 5、0.928 1、0.921 9和0.936 7.结论 Hcy和MPO是非常灵敏的AMI早期诊断潜在生物标志物.

    作者:王文娟;胡志坚;韩峰;谢福生;徐炜;周会祥 刊期: 2017年第16期

  • 海宁市农村成人肥胖流行特点及肥胖测量指标与血脂异常的关系

    目的 了解海宁市农村成年居民肥胖流行特点,探讨肥胖测量指标与血脂异常的关系,为肥胖和血脂异常防控提供依据.方法 通过多阶段分层整群抽样的方法,随机抽取4个镇(街道)居民1 475名进行问卷调查、体格检查及实验室检测,运用非条件Logistic回归模型评价肥胖测量指标BMI和WC与血脂异常的关系.结果 海宁市农村居民肥胖患病率为6.58%;中心性肥胖患病率为33.63%;超重及肥胖人群TG、TC水平高于BMI正常人群,HDL-C水平均低于正常人群,血脂异常患病率均高于正常人群,差异均有统计学意义(P<0.01);BMI、WC与血脂异常呈正相关(P<0.01),BMI、WC每增加一个单位,血脂异常患病风险率分别增加9.30%和6.40%.结论 海宁市农村居民肥胖和中心性肥胖患病率较高,BMI、WC与血脂异常患病密切相关,血脂异常患病风险随肥胖程度的增加而升高.

    作者:苏颖亚 刊期: 2017年第16期

  • 围产期孕妇感染无乳链球菌的流行病学特征与耐药性监测结果分析

    目的 分析围产期孕妇感染无乳链球菌(GBS)的流行病学特征和连续3年的耐药性监测结果,为临床制定有效的预防和治疗措施提供依据.方法 回顾性分析2014年1月-2016年12月围产期孕妇的临床资料,按GBS阳性与阴性、孕妇的类型、文化层次、流产次数、年龄段和标本类型、季节、年度进行分组.结果 1 329例孕妇中共检出GBS携带者172例,检出率为12.9%;GBS阳性与阴性者的临床症状发生率、不同文化层次、不同年龄、不同年度围产期孕妇GBS检出率差异均有统计学意义(P<0.05).GBS对青霉素G、氨苄西林、头孢唑林、头孢曲松和莫西沙星保持较低的耐药率,均<10.0%;未发现对万古霉素、利奈唑胺和亚胺培南的耐药株;对阿奇霉素、红霉素和克林霉素高度耐药,均>70.0%.D试验阳性率为32.7%.结论 围产期孕妇GBS检出率较高,呈逐年上升趋势,GBS阳性者临床症状明显,高龄、文化层次低者易于感染,临床应重视GBS筛查并关注其耐药趋势.

    作者:张莹;任建敏;毛丽芬 刊期: 2017年第16期

中国卫生检验杂志

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主管:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会

主办:中华预防医学会