学术投稿

蛋白质指纹图谱技术在疾病研究中的应用

胡朝军;李永哲

关键词:蛋白质指纹图谱技术, 蛋白质组学, 生物标志物
摘要:人类基因组测序完成为通过分析蛋白质来诊断疾病提供了前所未有的机会.作为研究蛋白质全貌的蛋白质组学技术也因此得到了空前的发展.人们对采用蛋白质组学技术寻找新的生物标志物并应用于临床寄予了很高期望.既往,主要是通过双向凝胶电泳比较差异蛋白质寻找蛋白质生物标志物,虽然该技术分离蛋白质有很好的效果,但由于操作繁琐、敏感性低,特别是在分析小分子量蛋白时更是显得力不从心,限制了该技术用于临床标本的大规模筛查分析,使其一直局限于基础研究,难以进入临床研究及应用.
临床检验杂志相关文献
  • 实时荧光定量检测人血浆中RASSF1A基因启动子甲基化

    目的 建立检测人血浆DNA中RASSF1A基因甲基化的方法.方法 以肺癌细胞株NCI-H460作为RAssF1A基因启动子区甲基化阳性样本,传统酚/氯仿法提取细胞DNA,经紫外分光光度计定量后以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200 μl健康人血浆中,制备得到模拟肺癌患者血浆.用磁珠法从模拟血浆样本和15例早期肺癌患者血浆中提取总DNA.对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰,并以TaqMan技术的实时荧光定量甲基化特异性PCR(MSP)进行检测.以模拟血浆样品作为标准品,用外标准曲线法对肺癌患者血浆中的甲基化RASSF1A进行定量.结果 实时荧光定量MSP对模拟肺癌患者血浆的检测低限为150拷贝(甲基化的肿瘤DNA)/ml(血浆).15例肺癌患者5例RASSF1A甲基化阳性(33.3%).5例肺癌患者血浆中甲基化的RASSF1A基因的浓度分别为2.56×103,8.20×104,1.45×104,3.31×104和4.24×104拷贝/ml.结论 实时荧光定量MSP法检测肺癌患者血浆DNA中RASSF1A基因甲基化,灵敏度高,特异性强.

    作者:高丽;潘世扬;束永前;谢而付;陈进步;赵文君;穆原;张丽霞;陈丹;黄珮珺;张寄南 刊期: 2008年第03期

  • 新生儿肺炎链球菌分离株头孢菌素耐药与pbp2B、murM基因突变研究

    目的 了解分离自新生儿的肺炎链球菌pbp2B、murM基因突变状况与头孢菌素耐药情况.方法 用PCR法检测8株肺炎链球菌pbp2B、murM突变基因.结果 8株肺炎链球菌均检出pbp2B突变基因.murM基因获得3种不同的序列,与美国国立生物信息中心(NCBI)已登录的序列均不同.结论 pbp2B突变基因并不一定导致头孢菌素耐药,murM基因突变可致青霉素高水平耐药和头孢菌素耐药.

    作者:承晓京;范燕燕;周惠娜;郑亚芬 刊期: 2008年第03期

  • Modular-PPI全自动生化分析仪试剂携带污染及其解决措施

    目的 探讨M0dular-PPI全自动生化分析仪检测标本时可能存在的携带污染及其处理措施.方法 对34项检测项目逐一配对共1 122项次,观察污染情况,并采取相应的措施避免污染.结果 1 122项次携带污染检测中,污染项目45项次,污染率为4%.经纯水清洗(32项),碱性清洗(2项),酸性清洗(10项),有效地消除了携带污染,有效率为97.78%.结论 全自动生化分析仪无论在全部试剂通道为封闭、开放或封闭通道和开放通道并存时,均必须了解试剂间的携带污染状况并确立相应的处理方法,消除携带污染后方可进行临床检测.

    作者:沈振亚;李智;左玫;施惠兰;龙聆群 刊期: 2008年第03期

  • 血浆抗X因子活性在择期经皮冠脉介入术中的变化

    肝素浓度(活性)检测是指导抗凝用药的金标准[1],血浆抗Xa水平在0.5~1.8 IU/ml之间是比较理想的依诺肝素在PCI术中的抗凝强度[2-3].依诺肝素是低分子肝素的一种,具有异质性的葡糖胺聚糖.

    作者:赵秀清;苑飞 刊期: 2008年第03期

  • 流式细胞术检测表达FoxP3的CD4+CD25+调节性T细胞

    目的 探讨转录因子FoxP3在外周血CD4+CD25+调节性T细胞(Treg)内的表达特性.方法 取正常人外周血单个核细胞(PBMC),经固定/透膜处理进行细胞内染色,用流式细胞术(FCM)检测T细胞内FoxP3.以抗人CD3/CD28诱导T细胞活化,再用定量PCR及FCM术分别检测FoxP3 mRNA及蛋白质表达水平.结果 FoxP3主要表达于CD4+ T细胞,尤其是CD25高表达的CD4+T细胞,达97%左右;中等程度表达CD25的细胞中也含有少量FoxP3阳性细胞.T细胞活化后,表达FoxP3的CD4+ CD25+T细胞比例显著增高,FCM检测结果与定量PCR结果一致.结论 FoxP3不仅参与维持Treg细胞的功能,也与T细胞的活化有关.FCM检测细胞核内表达的FoxP3分子为研究Treg细胞提供了一种快速、简便的方法.

    作者:焦志军;尤海燕;陈蕾;汪毅;王文红;邵启祥 刊期: 2008年第03期

  • 男性患者血清CA125水平增高的临床意义分析

    目的 评价男性血清CA125增高的临床意义.方法 对蛋白芯片(C-12)法测出CA125阳性的418例男性患者的病因进行分析.结果 243例肿瘤患者血清CA125阳性率分别为肺癌(21.77%),肝、胆系统癌(11.72%),胃癌(10.29%),结、直肠癌(5.02%),胰腺癌(3.59%),食道癌(3.35%)等.175例非肿瘤患者CA125阳性率分别为肾脏疾病(13.16%),肺部感染(12.68%),消化道疾病(7.66%),肝硬化(4.55%),结核性胸膜炎(2.39%),心功能衰竭(1.44%).两组患者CA125增高水平无显著差异.非肿瘤组单项CA125阳性率显著高于肿瘤组(P<0.01),但≥2项肿瘤标志物(TM)阳性率显著低于肿瘤组(P<0.001).结论 男性患者CA125联合其他TM阳性,高度提示有肺或消化系统恶性肿瘤的可能,即使单项CA125阳性,也应做进一步检查,以排除肿瘤.

    作者:王艾丽;栾正云;李梅;罗冰;刘国瑞;黄梅 刊期: 2008年第03期

  • 人工肝治疗重症肝炎对止、凝血系统的影响

    人工肝支持系统(artificial liver support system,ALSS)对于重症肝炎病人可以暂时替代病变的肝脏,使肝脏功能恢复或为下一步肝移植作准备.重症肝炎病人易出现凝血、抗凝血、纤溶系统功能失衡,表现多种指标异常.

    作者:张小琼;张杰;陆琳 刊期: 2008年第03期

  • 苏州地区急性呼吸道感染患儿呼吸道合胞病毒抗原的检测及其意义

    呼吸道合胞病毒(RSV)是引起婴幼儿急性下呼吸道感染的重要病原.我们用直接免疫荧光技术对2001~2006年苏州地区因急性呼吸道感染就诊的门诊及住院患儿13 793例进行鼻咽分泌物的RSV抗原检测,探讨其感染特点,报道如下.

    作者:张润;张学兰;季正华;丁云芳;朱宏 刊期: 2008年第03期

  • 用UF-50尿沉渣分析仪检测尿中红细胞

    本院采用UF-50型尿沉渣分析仪检测随机尿液标本439份尿沉渣并与显微镜检查对照,结果(表1)报告如下.

    作者:翁厚光 刊期: 2008年第03期

  • 痰培养分离出人苍白杆菌1例

    人苍白杆菌(Ochrobactrum anthropi)是有鞭毛的革兰阴性需养菌,属苍白杆菌属,为条件致病菌,临床比较少见.我院从1例肺部感染患者痰中分离出1株.

    作者:宋艳红;薛秋婷 刊期: 2008年第03期

  • 血清抗Ⅱ型胶原蛋白抗体检测法的建立与应用

    目的 建立血清抗Ⅱ型胶原蛋白抗体的ELISA法,探讨其在类风湿关节炎(RA)患者中的应用价值.方法 以自提可溶性鸡Ⅱ型胶原蛋白(soluble chicken collagen type Ⅱ,SCC Ⅱ)作为包被抗原,优化实验条件,建立抗Ⅱ型胶原蛋白抗体间接ELISA法.对124例RA病人和54例健康人血清抗II型胶原蛋白抗体进行检测.结果 血清抗Ⅱ型胶原蛋白抗体的检测条件为:SCCⅡ包被浓度为20 μg/ml;以含10%羊血清的缓冲液进行封闭、稀释血清和酶标抗体;采用双波长(450nm/630 nm)进行测定.RA患者和健康人血清抗Ⅱ型胶原蛋白抗体阳性率分别为19.35%(24/124)和1.85%(1/54),两组有明显的统计学差异(P<0.01).结论 以SCCⅡ为包被抗原检测抗Ⅱ型胶原蛋白抗体可作为判断RA患者病情的一个辅助诊断指标.

    作者:姜旭淦;陈盛霞;吴琴;汤俊民;马建芬;储青;吴亮;颜小云;刘获;姚加平;许化溪;XU Huaxi 刊期: 2008年第03期

  • 不同加样方式对竞争ELISA法检测抗HBc的影响

    目的 探讨不同加样方式对竞争ELISA法结果的影响.方法 收集乙肝病毒标志物(HBV M)62份常见阳性模式(A组)、45份单项抗HBe阳性(B组)、36份HBVM全阴性(C组)及89份随机收集的血清标本,用竞争ELISA法以2种加样方式检测抗HBc,以夹心ELISA法检测抗HBc为对照.结果 3组血清标本用竞争法2种加样方式检测的抗HBc结果A值均存在统计学差异(t=2.887~6.096,P=0.00~0.009),且B组的2种方式定性结果符合率仅为86.7%;对随机收集的89份血清标本,加样方式一与夹心法结果存在统计学差异(X2=5.56,P<0.05).结论 不同加样方式对竞争ELISA法结果的影响应引起重视.

    作者:成军;孙长责;成玉生;王国政;詹峰 刊期: 2008年第03期

  • RBP4多态性与2型糖尿病患者的相关性研究

    目的 探讨视黄醛结合蛋白(RBP4)基因多态性在苏州地区汉族人群中的频率分布及其与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 采用TaqMan探针基因分型技术结合琼脂糖凝胶电泳技术,检测384例T2DM患者和384例健康人RBP4的多态性,同时测定其空腹血糖(FBG)、总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)水平.结果 T2DM组和对照组RBP4-803,G>A;+5169,C>T;+6969,G>C 3个单核苷酸多态性(SNP)位点的基因型频率和等位基因频率分布的差异无统计学意义(P>0.05).经Logistic回归分析,校正年龄、性别、体质指数等因素影响后,各位点基因型相对风险分析未发现与T2DM发生有关的基因型,而且通过年龄、性别、高血压病史、TG、TC进行的分层分析,也未发现各基因型之间发生T2DM风险的差异性.单倍体表型分析也未发现与T2DM有关的单倍型.结论 RBP4 -803,G>A;+5169,C>T;+6969,G>C多态性与中国苏州地区T2DM的发生无关.

    作者:杨春香;顾国浩;卢大儒;刘宏亮;钟逾;史进方;金晓华 刊期: 2008年第03期

  • Abbott CD 1700血液分析仪使用体会

    1 在固定时间内作管道冲洗由于使用时间较长,管路存在一定程度的老化现象,容易附着一些结晶物之类的物质,造成堵塞、负压减低等一系列问题,必须在固定时间内作管道冲洗.

    作者:贾方增 刊期: 2008年第03期

  • 不育患者精子活力与精浆及精子核DNA完整性关系的初步研究

    目的 探讨不育患者精子活力与精浆及精子DNA完整性的关系.方法 50例男性不育患者,按a+b级活力分为2组,a+b级精子百分率≥50%为Ⅰ组,<30%为Ⅱ组,Ⅱ组25例,Ⅱ组25例.各组精液分成两部分,一部分用于两组间精浆互换,另一部分用作各自的时照.精浆互换后37℃温育40 min、90 min,用计算机辅助精液分析系统(CASA)分析精浆互换前后及其对照组的a+b级精子百分率.同时检测这些患者的精浆α-葡糖苷酶、酸性磷酸酶和果糖含量,并用吖啶橙荧光染色检测随机抽取的40名患者精子核DNA的完整性.结果 Ⅰ组与Ⅱ组精浆置换后,温育40 min和90 min时Ⅰ组的精浆置换组精子活力为27.5±18.7、25.8±17.1,比相应的对照组33.9±17.3、26.0±15.6降低;Ⅱ组的精浆置换组精子活力为16.7±11.6、14.4±10.5,比相应的对照组12.2±8.7、11.2±9.3升高;两组的精浆置换组与相应的对照组的精子活力均随着温育时间的延长而降低,但均无统计学意义.精浆果糖、酸性磷酸酶与精子活力间没有相关性,而精浆α-葡糖苷酶与Ⅰ组的精子活力呈正相关.精子活力与精子核DNA的完整性呈正相关性.结论 精子活力主要与精子结构有关,精浆成分也是决定精子活力的一个因素.

    作者:黄祝;蒋超;徐会茹;王晨阳;侯林;姚兵 刊期: 2008年第03期

  • 侵袭性阿萨希毛孢子菌和克柔假丝酵母菌双重感染1例

    我科从1例慢性肾功能衰竭患者多标本中分离培养出侵袭性阿萨希毛孢子菌(Trichosporon asahii)和克柔假丝酵母菌,报告如下.1 临床资料患者,女,35岁,2007年6月25日因患狼疮性肾炎(肾功能衰竭期)并发腹膜感染入住我院肾科.

    作者:唐芹芳;文怡;梅亚宁;顾兵;赵旺胜;陈友华 刊期: 2008年第03期

  • 人乳头瘤病毒基因分型方法的建立和应用

    目的 建立一种简便快捷、灵敏度高、经济实用的人乳头瘤病毒(HPV)基因分型的低密度基因芯片技术,并对该方法进行评价.方法 用低密度基因芯片技术对355例疑似HPV感染女患者检测HPV并分型;用杂交捕获Ⅱ代(HCⅡ)法进行评价.并用该法对珠江三角洲地区的730例标本进行HPV分型检测.结果 355例疑似样本中,低密度基因芯片技术和HCⅡ法分别检出211例(59.4%)和222例(62.5%)阳性标本,符合率达94.1%(334/355).低密度基因芯片技术共检测出15种常见高危型和5种低危型,其中16、52、58、56型检出率较高.结论 低密度基因芯片技术能具体分型和检测混合感染,HPV检测与细胞学检测结合.对宫颈癌筛查有重要意义.

    作者:王方金;王敏;王丁;肖克林;何蕴韶 刊期: 2008年第03期

  • 中国人血浆DNA定量多中心合作研究进展报道

    血浆DNA又称循环DNA,是血液中的细胞外DNA,可以以DNA-蛋白质复合物的形式存在,也可以是游离DNA片段.正常情况下来源于少量衰老死亡细胞的DNA释放.

    作者:蒋叶 刊期: 2008年第03期

  • HBsAg阴性HBV感染1例

    患者,女,25岁,乡镇医院护士,自述10个月前曾给一婴儿打针,扎伤自己手指,婴儿的母亲是HBV携带者.护士于当日注射了乙肝疫苗(30 μg/支).半年后在当地医院查HBVM 5项指标,结果为HBsAg阴性,HBeAg和抗HBc阳性.

    作者:李甲芬;李炳法;綦跃花;王加芬;杨柳;王雯 刊期: 2008年第03期

  • 颗粒溶素对U937细胞分泌MCP-1、RANTES与TNF-α功能的影响

    目的 探讨颗粒溶素对U937细胞分泌MCP-1、RANTES与TNF-α功能的影响.方法 ①在U937细胞中加入终浓度为100 ng/ml的乙酰肉豆蔻佛波酯(phorbol mynstate acetate,PMA),刺激2 d后,再加入不同组合的脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)、葡萄球菌的脂膜酸(lipoteichoic acid,ETA)、颗粒溶素(granulysin,GNLY),刺激培养4 h后收集细胞上清,用ELISA检测肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor,TNF-α)的含量.②在U937细胞或原代单核细胞中加入GNLY后,在37℃条件下,刺激4 h,收集上清,以ELISA分析MCP-1(monocyte chemoattractant protein-1,单核细胞趋化因子-1)和RANTES(reduced upon acti-vation normal T expression and secreted,正常T细胞活化时表达和分泌减少因子)的含量;收集细胞并抽提总RNA后,以实时荧光定量RT-PCR方法检测部分基因表达水平的改变.结果 加入GNLY后,LPS诱导U937细胞分泌的TNF-α水平显著增加(P<0.05);U937细胞或单核细胞的MCP-1、RANTES的mRNA水平显著增加(P<0.05),上清液中MCP-1和RANTES水平也增加(P<0.05).结论 GNLY可促进LPS诱导单核细胞分泌TNF-α,本身可刺激单核细胞表达MCP-1、RANTES增高,这为以后进一步研究颗粒溶素的作用机制打下了基础.

    作者:黄东标;胡晓燕;钱(王争);陈燕;周晔;陈波;邓安梅;仲人前 刊期: 2008年第03期

临床检验杂志

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