学术投稿

华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析

周红娟;余新炳;徐劲;胡旭初

关键词:华支睾吸虫, ATP合酶B亚单位, 生物信息学
摘要:目的 从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中识别ATP合酶B亚基,利用生物信息学方法预测其结构和功能特征,用以指导实验研究.方法 利用生物信息学网站的各种在线分析工具和Vector NTI suite软件包,识别华支睾吸虫ATP合酶B亚基基因并预测编码蛋白质的各种结构与功能特征,并根据该基因构建种系分子进化树.结果 Blastx分析该基因为全长基因,属于ATP合酶B亚基家族,其分子进化树与种系进化过程非常吻合.该基因全长1 008 bp,编码300个氨基酸,含有线粒体转运肽、两个跨膜区、一个核定位序列和多个磷酸化位点,具有较稳定的理化性质.结论 ATP合酶B亚基是一个理想的真核种系进化的分子标志.华支睾吸虫ATP合酶B亚基具有线粒体和细胞核的双重定位序列,提示该蛋白可能在华支睾吸虫的能量代谢途径中发挥独特的调节作用.
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    目的 探讨急性甲醇中毒患者的视觉诱发电位(VEP)波形的异常变化及其与血甲醇浓度的相关性.方法 对26例(52眼)甲醇中毒患者进行VEP检查及血甲醇浓度的测定.结果 病程第一阶段共观察26人(52眼),其中未引出VEP波形的有29只眼,波幅减低的有20只眼,波形P100潜伏期延长的有7只眼;病程第二阶段共观察17 人(34眼),其中未引出VEP波形的有10只眼,波幅减低的有22只眼,波形P100潜伏期延长的有11只眼;病程第三阶段共观察9人(18眼),其中未引出VEP波形的有7只眼,波幅减低的有8只眼,波形P100潜伏期延长的有4只眼.未见血甲醇浓度与双眼P100潜伏期均值之间有明显相关性(P>0.05).结论 VEP检查可以对甲醇中毒患者视神经功能损害提供可靠的诊断依据.急性甲醇中毒引起的视神经损害相对于异常甲醇浓度的降低以及其他临床症状消失具有滞后性与持续性.

    作者:艾宝民;李永胜;黄桂峰;刘移民 刊期: 2007年第04期

  • 瑞替普酶静脉溶栓治疗急性心肌梗死的疗效观察

    目的 观察瑞替普酶静脉溶栓治疗急性心肌梗死的疗效和安全性.方法 30例患者均符合入选和不入选标准,予以瑞替普酶静脉溶栓治疗,观察血管再通的临床指标及不良反应.结果 根据冠脉再通标准判断,30例患者血管再通构成比为76.7%,出血发生率为0.67%.结论 急性心肌梗死患者选用瑞替普酶静脉溶栓是一种安全、有效的治疗方法.

    作者:杨丽莉;王树源 刊期: 2007年第04期

  • 一起多种型别副溶血弧菌引起食物中毒的实验室检测

    目的 对一起可疑食物中毒的病原菌进行实验室检测.方法 依据GB/T 4789-2003(食品卫生微生物检验》进行肠道致病菌的检测,同时采用实时荧光定量PCR的方法,共同鉴定病原菌.结果 选取的6份样本中,有5份副溶血弧菌PCR结果为阳性,16份病人肛拭子中有11份分离出副溶血弧菌,生化反应呈三种模式,血清学分型亦有K6、K41和K56三种.结论 该起食物中毒是由多种型别副溶血弧菌引起.

    作者:侯炎昌;杨晓华;肖娜 刊期: 2007年第04期

  • 广州市海珠区一起小学流感爆发的流行病学分析

    目的 了解小学流感爆发的流行特征,分析所采取防制措施的效果,为控制爆发提供科学依据.方法 采用现况流行病学调查方法,对该小学流感爆发的流行特征进行分析;用MDCK细胞进行病毒分离,用血凝抑制试验对分离到的病毒标本进行分型鉴定.结果 全校967人,有63人发病,罹患率为6.51%.采集9份现症病人漱口液中有4份分离出流感病毒,进一步型别鉴定为B型流感病毒.结论 该事件是由B型流感病毒引起的流感爆发疫情,感染来源为社区获得;早期发现、及时隔离治疗病人,是控制流感爆发的重要措施.

    作者:李铁钢;刘维斯;秦鹏哲;刘于飞;王玉林;何丽娟 刊期: 2007年第04期

  • 梅州市诺瓦克样病毒胃肠炎爆发疫情分析

    目的 分析梅州市群体性诺瓦克样病毒胃肠炎流行特征,为诺瓦克样病毒胃肠炎的预防和控制提供科学依据.方法 采用描述性流行病学方法.对2004-2006年梅州市群体性诺瓦克样病毒胃肠炎疫情进行分析.结果 2004-2006年梅州市共报告4起群体性诺瓦克样病毒胃肠炎,共发病382例,无死亡病例.疫情全部发生在学校,发病时间均在冬春季,症状以恶心、呕吐、腹痛、腹泻、发热为主,每起疫情均从部分患者粪便标本中检出诺瓦克样病毒抗原.结论 学校是诺瓦克样病毒爆发疫情的高发场所.预防诺瓦克样病毒疫情的关键是搞好学校的食品卫生和饮用水卫生工作.

    作者:林立新;杨翼龙 刊期: 2007年第04期

  • 辣椒素受体在肠易激惹综合征内脏痛觉过敏中的作用

    目的 研究辣椒素受体(VR1)在肠易激综合征(IBS)内脏痛觉过敏中的作用.方法 新生雄性SD大鼠21只分为痛觉过敏阳性对照组(P组)、阴性对照组(N组)、去辣椒素受体神经元组(D组),出生第2天D组背部皮下注射辣椒素50 mg/kg.出生第8天起P组和D组给予结肠内充气刺激每天一次,连续2周,7周时给予结直肠扩张(CRD)刺激,进行腹部收缩反射(AWR)评分和腹直肌肌电记录.结果 D组AWR评分低及腹直肌放电活动少(P<0.01,与P组相比).结论 辣椒素受体参与了发育期幼鼠肠激惹致IBS内脏痛觉过敏.

    作者:梁杰贤;季文进;洪迅;吉锦泉;梅莉 刊期: 2007年第04期

  • 幽门螺杆菌基因hp0231和hp0410的克隆表达及生物信息学分析

    目的 获取幽门螺杆菌hp0231和hp0410基因的序列,预测其编码蛋白HP0231和HP0410作为候选疫苗的可行性,在大肠杆菌表达系统中表达hp0231和hp0410.方法 提取幽门螺杆菌标准株NCTC11639的基因组DNA,按照GenBank中幽门螺杆菌标准株22695的序列设计引物PCR,扩增hp0231和hp0410基因,克隆入pMD18-T载体中测序,进行生物信息学分析.将hp0231和hp0410克隆入表达载体pGEX-4T-1中,诱导表达,SDS-PAGE电泳鉴定.结果 生物信息学分析表明HP0231和HP0410均为外膜蛋白,具良好的抗原性,并且与其他生物的同源性较低,其作为Hp疫苗不易产生交叉反应以及自身免疫性反应,构建的重组菌可高水平表达可溶性重组蛋白.结论 HP0231和HP0410是有良好应用前景的Hp候选疫苗.

    作者:胡平;罗军;张文炳;龙北国 刊期: 2007年第04期

  • 尿路结石成分分析及临床应用研究

    目的 探讨本地区尿路结石成分构成情况,并根据尿路结石成分构成指导尿路结石的治疗和预防.方法 收集江门市中心医院住院和门诊上、下尿路结石标本120例,采用化学显色法对尿路结石中磷酸盐、尿酸盐、草酸盐、碳酸盐、钙、铵、胱氨酸等化学成分进行定性分析.结果 本组尿路结石样本中含钙结石多,占80.8%,含磷酸盐结石次之,占67.5%.单纯性结石占35%,其中草酸钙结石为多,占69%.感染性结石中以磷酸盐结石多,占68.7%,含铵结石占61.2%.复发结石含磷酸盐占88.2%,其比例显著高于初发结石.上尿路结石中含钙和磷酸盐结石显著高于下尿路结石,下尿路结石中含尿酸盐结石显著高于上尿路.结论 根据结石分析得到的结石化学成分特点,可有针对性地指导临床治疗,并可指导患者从饮食、生活习惯等方面预防尿路结石的发生和复发.

    作者:孙明;庞健;黄健;陈立新;林天歆;黄海;吴荣海;程洲平 刊期: 2007年第04期

  • RACE:一种研究新基因的有效方法

    RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术是以PCR和RNA反转录为基础,通过部分已知基因序列(如EST)快速扩增cDNA的3'端或5'端未知序列区域,获得全长cDNA,研究新基因的一种有效方法.本文针对该项技术自身存在的优缺点,同时结合国内外的新研究改进方案,对该技术作一概述.

    作者:周维;黄翠琴;王寿昆;朱兴全 刊期: 2007年第04期

  • 季节周期回归模型在肿瘤住院病人中的应用分析

    目的 了解1999-2004年庐江县某二甲医院肿瘤住院患者的基本构成,并预测2005-2007年该院肿瘤住院患者人数,为医院管理决策提供科学依据.方法 整理该院1999-2004年《医院疾病分类年报表》资料,进行统计描述和季节趋势预测.结果 1999-2004年该医院肿瘤患者住院人数占同期总住院人数的10.72%,预计2005-2007年肿瘤住院患者分别为1 216例、1 287例和1 359例,且有明显逐年增加趋势.结论 该院肿瘤患者住院人数在同期总住院人数中占有相当比重,且有逐年增加趋势.医院管理者应合理分配卫生资源.加强肿瘤科室的建设.

    作者:魏跃红;王鸣;许信红;潘冰莹 刊期: 2007年第04期

  • 慢性疲劳大鼠模型的建立及其对肝功能的影响

    目的 建立大鼠慢性疲劳模型,观察慢性疲劳对大鼠肝功能的影响.方法 100只大鼠随机分为正常对照组和慢性疲劳模型组,两组又按强制游泳周数各分为5个亚组,慢性疲劳模型组大鼠每日强制游泳2 h,慢性疲劳模型各亚组造模前及造模后1 d观测大鼠的力竭游泳时间,正常对照组大鼠除在疲劳模型组大鼠游泳期间给予禁食禁水外其他不作干预.实验结束后大鼠腹主动脉采血,检测肝功能相关指标:谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、胆红素(TBIL)、总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、球蛋白(G).结果 慢性疲劳模型组大鼠造模2周以后其力竭游泳时间显著减少(P<0.01),并随着造模时间延长至5周,大鼠力竭游泳时间有减少的趋势,但无统计学意义(P>0.05).与正常对照组比较,慢性疲劳模型组大鼠造模2周时血清AST出现显著升高(P<0.05).并持续到5周(P<0.01);大鼠造模3周时血清ALT出现显著性升高(P<0.05),并持续到5周(P<0.01);其他肝功能相关指标未见异常.结论 大鼠强制游泳2周可造成慢性疲劳模型,并造成大鼠肝功能损伤.

    作者:聂晓莉;李晓勇;靳文;赵晓山;罗仁 刊期: 2007年第04期

  • 8例妊娠期急性脂肪肝的诊治分析

    目的 对妊娠期急性脂肪肝进行早期诊断和正确治疗,以降低孕产妇及围产儿的死亡率.方法 对1995-2005年在我院产科经治的8例妊娠期急性脂肪肝患者的资料进行回顾性分析.结果 8例患者中,单胎6例,双胎2例.3例孕产妇死亡,均为非及时终止妊娠者.其中阴道分娩1例,剖宫产2例,病死率为37.50%;围产儿死亡4例,死亡率为40.00%.分娩后的临床表现及化验结果均较产前明显恶化,以3 d内严重,但与分娩方式无关.结论 早期诊断、及时终止妊娠及多学科的综合治疗,可大大改善妊娠期急性脂肪肝的母儿预后.

    作者:宋鹤兰 刊期: 2007年第04期

  • 武汉社区腹泻病人粪便中致病菌的构成与耐药性研究

    目的 了解夏秋季武汉社区引起腹泻病原菌的流行性及耐药状况.方法 收集2004年7月1日至10月31日武汉社区4所大型医院4 536份门诊腹泻病人粪便标本进行鉴定及药敏试验;REP-PCR对主要致病菌进行基因分型.结果 4 536份粪便标本中,分离出非伤寒沙门菌64株(1.4%),志贺菌29株(0.6%),致病性大肠杆菌33株(0.7%).其中主要致病菌是鼠伤寒沙门菌33株(52%),D群志贺菌16株(55%).挑选13种抗菌药物进行体外敏感试验,并将分离的致病菌对这13种抗生素的耐药率、敏感率、中介率进行比较,其中非伤寒沙门菌对喹诺酮类的耐药率较其他两种要高,但对第三代头孢的敏感性较强.分离的3种致病菌在第三代头孢抗生素的作用中对头孢他啶的敏感性强.32株鼠伤寒沙门菌基因分型为9种,16株D群志贺菌基因分型为7种.结论 武汉社区内感染性腹泻的致病菌主要以非伤寒沙门菌、致病性大肠杆菌和志贺菌为主,其中非伤寒沙门菌占了51%,基因分型提示有社区流行趋势,而且这些致病菌对肠道杆菌常用抗生素的耐药性较为严重.本次调查结果对该社区临床用药起到一定的提示作用.

    作者:陈晶;杨春莉;裘宇蓉;张少芬;童晓文;游升荣 刊期: 2007年第04期

  • 供受者感染乙肝病毒对造血干细胞移植后肝炎复发及愈后的影响

    目的 分析移植前供、受者感染乙肝病毒对造血干细胞移植后肝炎复发及愈后的影响.方法 对上海第一人民医院2006年1~11月移植前供、受者感染乙肝病毒的23例恶性血液病患者,进行移植前后肝功能、乙肝免疫标记物、HBV DNA等检测,并结合临床综合分析.血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)、γ谷氨酰转肽酶(GGT)采用速率法,血清总胆红素(TBIL)采用终点比色法检测;乙肝病毒血清标志物采用酶免疫测定(EIA);HBV DNA测定采用聚合酶链反应(PCR)试剂盒.结果 ①9例HBV感染的自体移植患者移植后3例发生乙型肝炎,其中2例为移植前HBsAg阳性,乙肝发作时3例HBV DNA及肝功能指标均明显增高;②14例HBV感染的供、受者移植后5例患者发生乙型肝炎,HBV DNA及肝功能指标均明显增高;③移植前HBsAg或HBV DNA阳性移植后发生乙肝相关性肝损的几率显著高于阴性组(X2分别为8.44、9.07,均大于)X0.0052,P<0.005);④移植前HBsAg或HBV DNA阳性对移植预后均无影响(X2分别为2.58、0.24,均小于X0.052,P>0.05);⑤1例患者异体移植后41 d,乙肝合并戊肝,发生急性黄疸性肝炎,第46天重症GVHD死亡.结论 移植前HBsAg和HBV DNA阳性均是HBV感染和再激活的高危因素,移植要密切监测免疫标志物和HBV DNA.移植前HBsAg和HBV DNA阳性不影响患者的生存,要注意非常见肝炎的多重感染.

    作者:肖敏敏;黄升海;汪亚勤;姜开明;李肃;姜杰玲 刊期: 2007年第04期

  • 华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析

    目的 从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中识别ATP合酶B亚基,利用生物信息学方法预测其结构和功能特征,用以指导实验研究.方法 利用生物信息学网站的各种在线分析工具和Vector NTI suite软件包,识别华支睾吸虫ATP合酶B亚基基因并预测编码蛋白质的各种结构与功能特征,并根据该基因构建种系分子进化树.结果 Blastx分析该基因为全长基因,属于ATP合酶B亚基家族,其分子进化树与种系进化过程非常吻合.该基因全长1 008 bp,编码300个氨基酸,含有线粒体转运肽、两个跨膜区、一个核定位序列和多个磷酸化位点,具有较稳定的理化性质.结论 ATP合酶B亚基是一个理想的真核种系进化的分子标志.华支睾吸虫ATP合酶B亚基具有线粒体和细胞核的双重定位序列,提示该蛋白可能在华支睾吸虫的能量代谢途径中发挥独特的调节作用.

    作者:周红娟;余新炳;徐劲;胡旭初 刊期: 2007年第04期

  • 1996-2005年广州市水厂原水与出厂水水质卫生状况分析

    目的 探讨广州市自来水水厂原水和出厂水的卫生状况,为保障广大市民饮用水卫生安全提供依据.方法 对广州市1996-2005年自来水水厂原水和出厂水监测资料进行统计,按《地表水环境质量标准》和《生活饮用水卫生规范》分析评价.结果 未发现水源水逐步恶化的趋势,珠江水系广州河段的锰、耗氧量、亚硝酸盐氮污染比珠江水系的北江段和东江段重;出厂水的合格率在62.07%~88.89%之间.结论 需进一步改善珠江水质,各级政府主管部门应重视和加强珠江水源水的保护和治理工作;建设主管部门应加强对水厂建设的投入和制水工艺的改进,提高水厂出厂水的卫生质量;卫生部门应完善新建水厂的卫生学评价,加强饮用水卫生监督监测.

    作者:钟嶷;黄汝明;刘世强;傅雪松;杨轶戬;石同幸;孙兰 刊期: 2007年第04期

  • 广州地区医院脓肿、病灶分泌物及创面感染病原菌群分布与耐药性特点

    目的 了解广州地区临床脓肿、病灶分泌物及创面感染分离病原菌群分布与耐药性特点.方法 耐药性监测网成员医院按《全国临床检验操作规程》要求分离临床送检的各种包括脓肿、病灶分泌物及创面的细菌培养标本.药物敏感试验采用纸片扩散法,耐药性数据分析采用WHONET4软件.结果 2002-2004年间各种临床标本共分离感染病原菌20 087株.其中脓肿、病灶分泌物及创面等标本分离的病原菌2 659株,占13.2%.发生脓肿、分泌物及创面感染的患者主要是青壮年,门诊患者占20%.引起脓肿等感染病原菌以革兰阳性球菌为主,占50.5%.其中葡萄球菌的耐药性及耐甲氧西林(MRS)检出率低于其他标本类型分离的葡萄球菌;铜绿假单胞菌对数种抗生素的耐药率比2002全国资料低,差异有统计学意义;大肠埃希菌与肺炎克雷伯菌对所监测抗生素的耐药率则与2002全国资料较为接近.结论 不同的标本类型其分离株对抗生素耐药特性有所不同,广州地区引起脓肿、病灶及创面等感染的主要病原菌对抗生素的耐药性一般要比其他标本分离菌低.

    作者:魏衍超;何启勇;邹伟民;吴晓蔓;肖柯玲;王敏玲 刊期: 2007年第04期

  • 德清县1951-2005年疟疾防治策略和效果分析

    目的 分析德清县55年来的疟疾防治成果,为制定疟疾防治策略提供依据.方法 总结和分析德清县疟疾流行趋势、疟疾防治策略和措施及其效果.结果 德清县疟疾发病率从五、六十年代的1000/10万以上逐步下降到1979年的10/10万以下,并持续保持低水平.目前,年均发病率为0.68/10万,患者以外地输人为主.结论 德清县在不同时期采取的疟疾防治措施,取得了显著效果.必须继续重视和加强疟疾防治工作,以防止疟疾的死灰复燃和输入性疟疾的发生.

    作者:宋建根;黄亦雄 刊期: 2007年第04期

  • 深圳市肉类食品空肠弯曲菌的污染情况调查

    目的 了解我市常见肉类食品中空肠弯曲菌的污染状况,为控制和预防空肠弯曲菌食物中毒提供科学依据.方法 在食品污监测点随机抽检肉类食品样品117份,用传统国标法和荧光PCR法进行检测.结果 从117份肉类食品中检出4份空肠弯曲菌,阳性检出率为3.4%.结论 深圳市肉类食品中存在空肠弯曲菌的污染,如果加工、销售不当,及监督不严,会对群众健康构成潜在威胁.

    作者:吴平芳;贺连华;刘涛;兰全学;陈妙玲;王瑞端 刊期: 2007年第04期

  • 阴道毛滴虫两个Sir2同源基因的克隆和功能

    目的 探讨寄生性原虫阴道毛滴虫细胞生长和衰老的相关基因.方法 从阴道毛滴虫的cDNA表达文库中分离出两个与酵母沉寂信息调节因子 (Sir2) 有较高同源性的cDNA克隆,分别命名为TvSir2和TvSir2-like,它们的编码框分别长915 bp和1116 bp.结果 序列分析显示这两个cDNA克隆与酵母Sir2同源性很高,其氨基酸序列中含有Sk2p及其同源蛋白三个特征性保守结构域.分别从这两株cDNA克隆中扩增出表达片段植入表达载体pET-41a,转化宿主菌E.coli BL21并用IPTG(isoprupylthio-β-D-galactoside)诱导表达到大量融合蛋白.用亲和层析法纯化的融合蛋白分别免疫豚鼠,获得的抗血清用Western-blot法识别到滴虫虫体全蛋白中大小为34 000 Mr和42 000 Mr的条带.免疫荧光法检测TvSir2和TvSir2-like蛋白位于细胞核外的内质网和高尔基复合体区域.结论 TvSir2和TvSir2-like克隆是酵酶Sir2的同源基因,为TvSir2和TvSir2-like在模式生物阴道毛滴虫的功能研究奠定了基础.

    作者:史咏梅;傅玉才;许铭言;徐晓园;许锦阶;邓致刚 刊期: 2007年第04期

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主管:广东省科学技术协会

主办:广东省寄生虫学会 中华预防医学会