学术投稿

遗传进化分析在广东省一起HCV“暴发流行”事件中的应用

邹霁;胡建兰;安玉玲

关键词:丙型肝炎病毒, 暴发, 进化分析, 基因序列
摘要:目的:通过对广东省一起丙型肝炎病毒(HCV)“暴发流行”事件进行遗传进化分析来了解此次事件的起源时间和传播源头.方法:首先对“暴发流行”事件调查中的192例血清样本作为研究组进行基因分型,得到2a亚型和6a亚型,选取相应基因亚型的对照组样本,采用生物信息学相关软件进行遗传进化分析,通过构建的时间尺度树推断此次HCV可能的起源时间及传播源头.结果:此次“暴发流行”事件的192例患者中,66例为2a亚型,119例为6a亚型,未发现其它的基因亚型.对2a亚型数据集以及6a数据集分别进行遗传进化分析提示两者都主要起源于2~5年前,均符合医源性感染的特点.结论:此次广东省HCV“暴发流行”事件中HCV主要基因型为2a和6a,主要起源于2~5年前,符合医源性传播特点,随着时间的延长积累了众多病例导致“暴发”.
实用医学杂志相关文献
  • 间充质干细胞对皮肤创面的改善作用

    烧伤是一种严重的创伤,研究针对大面积烧伤的新的治疗方法,提高对患者的治疗及护理具有很实际的意义.创面愈合是个复杂的生物学过程,包括炎症、新组织形成和重建三个阶段以及不同的组织和渗透性细胞(中性粒细胞、巨噬细胞、肥大细胞、淋巴细胞)的相互作用.不恰当的烧伤创面的治疗伴随着自由基调节受损,肉芽生长缓慢,血管新生及胶原沉积减慢,创面愈合差,而且感染对创面植皮有很大的影响,不利于烧伤创面的愈合,且由于严重的休克和感染,烧伤的发病率和病死率都很高.

    作者:马诗雨;王欣;李晓庆;刘文军;曾跃勤 刊期: 2017年第07期

  • CYP2C9和CYP4F2基因多态性对瓣膜置换术后华法林维持剂量的影响

    目的:探讨细胞色素P450酶(CYP2C9和CYP4F2)基因多态性对瓣膜置换术后华法林抗凝强度的影响.方法:选择瓣膜置换术后使用华法林抗凝患者136例,将患者分为4组:CYP2C9野生型组(CYP2C9*1*1)、CYP2C9突变型组(CYP2C9*3)、CYP4F2 rs2108622野生型组(CC)、CYP4F2 rs2108622突变型组(CT或TT),用TaqMan MGB探针法,检测CYP2C9* 3位点和CYP4F2 rs2108622位点基因型.记录一般资料,华法林初始剂量和基础国际标准化比率(INR)测定结果,并进行随访;记录初始服用华法林到INR首次达标的时间、华法林达标总用量和平均每日用量.结果:CYP2C9*1*1患者比CYP2C9*3患者INR首次达标时间长、INR首次达标时所需的华法林总量、日均剂量大(P<0.05).CYP2C9和CYP4F2rs2108622基因均变异的患者INR首次达标需要的平均时间短,且INR首次达标时所服用的华法林总剂量和平均日用量少,与2个基因均无变异组比较,差异有显著性(P<0.05);与只有CYP2C9基因变异患者相比,INR首次达标的平均时间缩短,达标时华法林总用量减少(P<0.05).结论:CYP2C9和CYP4F2基因多态性是影响华法林维持剂量重要的遗传因素,患者用药前进行CYP2C9和CYP4F2基因型检查,预测华法林用药剂量,可减少抗凝过量的发生,缩短剂量调整的时间.

    作者:马建新;董兵;马建慧;李胜萍;刘学 刊期: 2017年第07期

  • 老年急性结石性胆囊炎59例腹腔镜手术治疗经验

    老年急性结石性胆囊炎(acute calculous cholecystitis,ACC)作为一种常见、多发疾病,有报道指出其发病率高达8%~ 11%[1.腹腔镜胆囊切除术(laparoscopic cholecystectomy,LC)作为胆囊良性疾病治疗的金标准,亦是治疗ACC的首选方案[2-4],但对老年ACC患者来说,因其机体各脏器功能减退、抵抗力下降,且常合并多种疾病[5],一旦发生ACC,病情往往进展迅速,LC治疗风险较大,且中转开腹率和术后并发症发生率高,因此成为临床一道棘手难题.本研究回顾性分析我院近3年应用LC治疗的59例老年ACC患者的临床资料,总结其临床治疗经验,以期进一步提高其治疗效果.

    作者:魏文平;张宗明;宋蒙蒙;张翀;刘卓;刘立民;于宏伟 刊期: 2017年第07期

  • 小剂量地塞米松在脑梗死不同时期的作用

    目的:探索小剂量地塞米松在脑梗死急性期及亚急性期的作用.方法:将140例脑梗死患者随机分为脑梗死急性期治疗组(急性期组)、脑梗死亚急性期治疗组(亚急性期组)、安慰剂组及对照组.对照组给予脑梗死的常规治疗,安慰剂组则为常规治疗+1 mL生理盐水(安慰剂),急性期组为常规治疗+1mL(5 mg)地塞米松注射液(入院后第1~3天),亚急性期组为常规治疗+1 mL(5 mg)地塞米松注射液(入院后第4~6天),各组分别于治疗后的第7天行血常规及血沉检查,于治疗后的第1及3个月采用Barthel指数及修改后的Rankin量表对受试对象进行神经功能评定.结果:急性期组的血沉较亚急性期组、安慰剂组及对照组明显减慢,且差异有显著性(P<0.05),而亚急性期组与安慰剂组及对照组无明显差异.根据Barthel指数及修改后的Rankin量表评定结果,急性期组的神经功能较亚急性期组、安慰剂组及对照组明显改善,且差异有显著性(P<0.05),而亚急性期组与安慰剂组及对照组无明显差异.结论:小剂量地塞米松在脑梗死急性期发挥了神经保护作用.

    作者:杨直堂;苏进营;王静;刘志军;张辉 刊期: 2017年第07期

  • miR-150通过靶基因c-Myb改善心肌梗死后心肌纤维化

    目的:研究miR-150在心肌梗死后心肌纤维化中的作用及机制.方法:在心梗大鼠,通过过表达miR-150的慢病毒上调miR-150,用RT-PCR及Western bloting检测梗死边缘区col1α1与d-SMA的表达及Masson染色检测纤维化,研究miR-150在心梗纤维化模型中的作用.分离及培养心肌成纤维细胞,用荧光素酶报告载体、慢病毒及c-Myb的siRNA验证miR-150与c-Myb的关系.结果:体内实验表明miR-150在心梗后第2周及第4周心肌表达下调(P< 0.001,P<0.05),而上调miR-150明显改善心肌纤维化(P< 0.001),抑制col1α1及α-SMA的表达(P< 0.01,P<0.05).体外实验表明c-Myb是miR-150的靶基因且miR-150可通过c-Myb抑制col1α1及α-SMA的表达.结论:miR-150在心肌梗死边缘区表达下降,且可通过靶基因c-Myb改善心肌纤维化.

    作者:周小翠;汪涛;李恩 刊期: 2017年第07期

  • 阴茎背侧带蒂包皮内板转移术矫治儿童重度型隐匿阴茎的疗效

    隐匿阴茎是一种阴茎体发育正常,阴茎埋藏于耻骨前皮下组织的一种疾病[1],隐匿阴茎手术方式繁多,但何种术式为佳仍有争议,现在针对重型隐匿阴茎皮肤短缺,皮肤覆盖难问题,皮瓣转移术广泛应用于重度型隐匿阴茎.2013年1月至2015年1月作者采用阴茎背侧带蒂包皮内板转移术治疗小儿重度型隐匿阴茎20例,疗效显著,现介绍如下.

    作者:林海;王玉芸;林国雄;孙为增;符策君 刊期: 2017年第07期

  • 术前外周血中性粒细胞与淋巴细胞计数比鉴别乳腺良恶性肿块的价值

    目的:分析术前外周血中性粒细胞与淋巴细胞计数比(NLR)在乳腺良恶性肿块鉴别诊断中的价值.方法:回顾性分析天津市肿瘤医院乳腺外科2014年1月1号至2016年9月30号经手术治疗的215例乳腺肿块病人临床资料,根据术后常规病理学检查结果分为良性组和恶性组,对每组病例所对应的NLR进行对比分析,应用ROC曲线分析鉴别乳腺良恶性肿块的佳临界值.结果:恶性组有较高的中性粒细胞计数及较低的淋巴细胞计数,恶性组NLR明显高于良性组,两组差异有统计学意义(P<0.05).由ROC曲线分析得出鉴别乳腺肿块良恶性的NLR佳临界值为1.749,这时灵敏度为86.46,特异度为62.71%.NLR与患者淋巴结转移数、瘤体大小、临床分期和Her-2表达相关.结论:术前外周血NLR值可指导乳腺良恶性肿块的鉴别诊断,高NLR值预示肿块恶性.

    作者:林帅;赵颖 刊期: 2017年第07期

  • 右侧肺动脉起源于主动脉的外科治疗12例

    单侧肺动脉起源于升主动脉为一种比较少见的先天性心脏病,发病率接近0.1%,往往合并动脉导管未闭、室间隔缺损、房间隔缺损、主-肺动脉窗等心脏畸形;肺动脉高压产生较早,需早期发现、早期治疗;我院自2010年7月至2016年7月共收治右肺动脉起源于主动脉患儿12例,手术治疗效果满意,现总结其临床经验.

    作者:张金涛;李群;尉新华;张伟涛 刊期: 2017年第07期

  • 不同绒毛膜性质双胎妊娠临床特征比较及选择性胎儿生长受限相关高危因素分析

    目的:探讨不同绒毛膜性质双胎的临床特征及选择性胎儿生长受限的高危因素.方法:将460例双胎妊娠病例分为单绒毛膜组和双绒毛膜组,对两组相关临床特征进行比较,并通过Logistic回归分析选择性胎儿生长受限发生的高危因素.结果:(1)单绒毛膜双胎组和双绒毛膜双胎组在产妇年龄、受孕方式、分娩方式上差异存在显著性(P<0.05);(2)两组病例未足月胎膜早破及选择性胎儿生长受限发生几率差异存在显著性(P<0.05);(3)两组病例的新生儿体重(大、小)、新生儿转科率差异存在显著性(P<0.05);(4) Logistic回归分析显示:分娩孕周及新生儿体重为危险因素.结论:(1)胎盘的“绒毛膜性质”对孕产妇的妊娠过程及结局有着重要的影响;(2)“单绒毛膜性”是选择性胎儿生长受限的高危因素,即选择性胎儿生长受限的主要病因可能来源于胎盘,其应为一种“胎盘源性疾病”.

    作者:陈洁;潘石蕾;钟梅;余艳红;蒋思佳;陈茜 刊期: 2017年第07期

  • 单核细胞趋化蛋白3及微血管密度在皮肌炎和多发性肌炎患者肌肉组织中的测定及意义

    目的:为检测皮肌炎(DM)和多发性肌炎(PM)患者骨骼肌中单核细胞趋化蛋白3(MCP-3)及CD34标记的微血管密度(MVD)的水平,进一步探究DM/PM的发病机制.方法:运用免疫组化法检测DM/PM患者组及对照组肌肉组织中的MCP-3及MVD的水平.结果:MCP-3在DM组和PM组患者肌肉组织中的阳性表达均明显高于对照组(P< 0.001);DM组和PM组患者的肌肉组织中均可见CD34标记的微血管,且其MVD均高于对照组(P< 0.001);MCP-3和MVD在DM/PM组患者肌肉组织中的水平差异均无显著性(P> 0.05);DM组和PM组患者肌肉组织中的MCP-3与MVD水平的相关性均呈正相关(r分别为0.685、0.634,P<0.05).结论:提示DM/PM患者肌肉组织中可能都有新生血管的生成,MCP-3可能参与了DM/PM新生血管的生成过程.

    作者:孔令爽;柴克霞;陈玉琪 刊期: 2017年第07期

  • 神经生长因子对脑梗死大鼠VEGF、SDF-1的影响及其可能机制

    目的:观察神经生长因子(NGF)对脑梗死大鼠血清血管内皮生长因子(VEGF)、基质细胞衍生因子-1(SDF-1)表达的影响,并探讨其可能的机制.方法:将200~ 250 g的SD雄性大鼠,采用线栓法制备大鼠的一侧大脑中动脉缺血再灌注损伤模型,通过随机法将大鼠随机分成NGF治疗组、溶剂对照组及NGF+PI3K拮抗剂组,每组12只.所有大鼠分别于造模后第4和7天行神经功能评分,采用酶联免疫吸附法检测大鼠脑梗死后第4天时血清VEGF及SDF-1的水平.结果:在脑梗死后第4和7天时,与溶剂对照组及NGF+PI3K拮抗剂组大鼠比较,NGF治疗组大鼠的神经功能评分较低(均P<0.05).脑梗死后第4天时,NGF治疗组大鼠的血清VEGF及SDF-1水平均高于溶剂对照组、NGF+PI3K拮抗剂组(P<0.05).结论:NGF治疗可改善成年大鼠脑梗死缺损的神经功能,并促进脑梗死大鼠血清VEGF及SDF-1的表达上调,PI3K/AKT信号通路可能参与上述作用的调控.

    作者:李小强;凌莉;李楚翘;马文斌;尹义臣 刊期: 2017年第07期

  • 半导体基因测序技术筛查地中海贫血的临床应用价值

    目的:探讨半导体基因测序技术在地中海贫血基因筛查中的应用价值.方法:采集随机就诊者的静脉血197例作为前瞻性样本;随机选择临床确诊样本200例作为既往样本.同时采用半导体基因测序技术和PCR技术进行检测与分析,比较两种检测方法结果的差异.结果:前瞻性样本中,PCR技术检出地中海贫血基因突变共22例,其中β-突变18例,β-突变3例,oα合并β-突变1例;采用半导体基因测序技术除检出以上基因位点外,另发现罕见型地中海贫血6例.既往样本共200例,其中d-突变118例,β-突变65例,α合并β-突变17例,采用半导体基因测序技术另发现突变位点1例.统计分析结果显示,PCR技术与半导体基因测序技术总符合率为98.5%,Kappa=0.97(≥0.8).结论:半导体基因测序技术不仅能够覆盖PCR技术能检测到的所有位点,而且可检测到地中海贫血的罕见基因突变位点,且检测成本低,仪器价格低廉,有利于地中海贫血的普查.

    作者:杨茜;娄季武;赵颖;付有晴;巫静帆;何怡;吴春求;周光纪;刘彦慧 刊期: 2017年第07期

  • 新诊断2型糖尿病合并非酒精性脂肪性肝病患者血浆白细胞衍生趋化因子2水平变化及意义

    目的:观察新诊断2型糖尿病(T2DM)合并非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者血浆白细胞衍生趋化因子2 (LECT2)水平变化,并探讨其临床意义.方法:选取研究对象137例,其中新诊断T2DM合并NAFLD患者50例、单纯T2DM患者47例及正常对照者40例,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血浆LECT2水平,同时进行人体测量及测定各项生化指标.结果:T2DM合并NAFLD患者血浆LECT2水平显著高于单纯T2DM组[(32.95±10.11 vs.29.08±7.54)ng/mL,P<0.01],且两组均显著高于正常对照组[(22.38±4.40) ng/mL,P<0.01].血浆LECT2水平与体质指数、血糖、胰岛素、C肽、HbA1c、γ-谷氨酰基转移酶、三酰甘油、HOMA-IR呈正相关,与高密度脂蛋白胆固醇、HOMA-%β呈负相关(均P<0.01).体质指数、空腹血糖及高密度脂蛋白胆固醇是影响血浆LECT2水平的重要因素.结论:T2DM合并NAFLD患者血浆LECT2水平升高,并与胰岛素抵抗、糖脂代谢紊乱密切相关,提示LECT2可能参与胰岛素抵抗及T2DM的发生发展.

    作者:曾惠娴;张振;林江虹;胡颖辉;陈宏 刊期: 2017年第07期

  • 遗传进化分析在广东省一起HCV“暴发流行”事件中的应用

    目的:通过对广东省一起丙型肝炎病毒(HCV)“暴发流行”事件进行遗传进化分析来了解此次事件的起源时间和传播源头.方法:首先对“暴发流行”事件调查中的192例血清样本作为研究组进行基因分型,得到2a亚型和6a亚型,选取相应基因亚型的对照组样本,采用生物信息学相关软件进行遗传进化分析,通过构建的时间尺度树推断此次HCV可能的起源时间及传播源头.结果:此次“暴发流行”事件的192例患者中,66例为2a亚型,119例为6a亚型,未发现其它的基因亚型.对2a亚型数据集以及6a数据集分别进行遗传进化分析提示两者都主要起源于2~5年前,均符合医源性感染的特点.结论:此次广东省HCV“暴发流行”事件中HCV主要基因型为2a和6a,主要起源于2~5年前,符合医源性传播特点,随着时间的延长积累了众多病例导致“暴发”.

    作者:邹霁;胡建兰;安玉玲 刊期: 2017年第07期

  • P2X3受体在病理性疼痛中的研究进展

    腺苷三磷酸(ATP)在机体内不仅作为一种供能物质存在,它还具有兴奋性神经递质的功能,参与神经系统的多种生理功能,其中嘌呤能P2X3受体为配体门控非选择性阳离子通道,高度选择性地表达在与伤害性信息有关的中小直径感觉神经元1.病理性疼痛是指在伤害性刺激消除后仍然有疼痛的持续存在,主要包括炎症性疼痛、神经病理性疼痛、癌性疼痛,其病程长易反复发作、发病机制复杂、疼痛程度重,且临床多为非特异性治疗模式,治疗效果不显著,严重影响了患者的身心健康.

    作者:曹欣娅 刊期: 2017年第07期

  • 不同分型分水岭脑梗死的CT脑灌注表现及其临床相关性

    目的:探讨不同分型分水岭脑梗死的脑血流动力学特点及其临床的相关性.方法:收集2013年1月至2016年5月在我院因急性缺血性脑卒中入院行CT脑灌注检查,选择核磁共振DWI证实分水岭脑梗死患者34例,包括皮层分水岭脑梗死(CWSI)15例,内分水岭脑梗死(IWSI)19例,比较两组患者的影像学特点及临床资料.结果:CT脑灌注显示18例在分水岭梗死区周围出现异常低灌注,与对侧比较脑血流量(CBF)减低、平均通过时间(MTT)及峰值时间(TTP)延迟,脑血容量(CBV)无变化.有异常低灌注组有10例于入院第1周病情出现恶化,无异常低灌注组仅有2例,两者有统计学差异(x2=6.88,P<0.01).IWSI组有13例患者出现异常低灌注,CWSI组有5例,差异有统计学意义(x2=4.14,P<0.05).IWSI组有7例预后不良,CWSI组只有1例,差异有统计学意义(x2=4.24,P<0.05).结论:低灌注是IWSI重要的诱发因素且与预后有关,IWSI较CSWI预后差.

    作者:欧鸿儒;吴巧彬;陈晓华;贾红明;简坚成 刊期: 2017年第07期

  • 玻璃体腔注射雷珠单抗联合复合式小梁切除术及全视网膜光凝治疗新生血管性青光眼

    目的:观察玻璃体腔注射雷珠单抗联合复合式小梁切除术及全视网膜光凝治疗NVG疗效.方法:对我院2014年6月至2016年6月收治的NVG患者进行抽样,选取患者57例(57眼)随机分成两组,对照组予以复合式小梁切除术进行治疗,试验组予以玻璃体腔注射雷珠单抗+复合式小梁切除术+全视网膜光凝联合治疗,观察两组患者的临床疗效.结果:试验组总有效率(96.43%)明显优于对照组(75.86%),且视力、滤过泡及术后1周、1、3、6个月眼压变化情况优于对照组,差异具有显著统计学意义(P<0.05);试验组术后并发症发生率明显低于对照组,差异均有统计学意义(均P< 0.05).结论:玻璃体腔注射雷珠单抗联合复合式小梁切除术及全视网膜光凝治疗新生血管性青光眼患者,能有效地控制眼压,保护视功能.

    作者:周林;李芳芳;冯军 刊期: 2017年第07期

  • ATF5蛋白表达水平与胃癌AGS细胞药敏水平的相关性

    目的:探究ATF5蛋白表达水平与胃癌AGS细胞药敏水平的相关性.方法:采用脂质体载体转染技术转染ATF5 pcDNA3.1质粒、ATF5 siRNA空质粒,构建ATF5蛋白高、中、低表达水平的AGS细胞组.Western blot实验检测AGS细胞中ATF5蛋白表达水平,MTT实验检测AGS细胞对紫杉醇、顺铂药物敏感性,平板克隆形成实验探讨AGS细胞集落形成差异,分析ATF5蛋白表达水平与胃癌AGS细胞药敏水平的相关性.结果:ATF5蛋白过表达组AGS细胞在紫杉醇、顺铂影响后存活率较对照组高,均P< 0.05,ICso值较对照组也明显升高,均P=0.00;而低表达组存活率较对照组低,均P<0.05,IC50值较对照组也明显降低,P顺=0.00,P紫=0.002.过表达组细胞在药物影响后克隆形成数较对照组高,而低表达组克隆形成集落较对照组低,均P< 0.05.结论:ATF5蛋白的过表达能降低胃癌AGS细胞对紫杉醇、顺铂的药物敏感性,而ATF5蛋白的低表达则能增加胃癌AGS细胞对紫杉醇、顺铂的药物敏感性,提示胃癌AGS细胞药敏水平可能与ATF5蛋白表达水平相关.

    作者:刘洁;赵亚刚;朱鸿武;李立平 刊期: 2017年第07期

  • ω-3多不饱和脂肪酸对去势大鼠骨微结构的影响

    目的:观察ω-3多不饱和脂肪酸对去势大鼠骨微结构的影响.方法:将30只雌性大鼠随机分为假手术组、模型组和试验组.假手术组仅切除卵巢周围脂肪组织,其余两组切除双侧卵巢.模型组和假手术组给1 mL/(100 g·d)的生理盐水灌胃,试验组给予ω-3 PUFA 150 mg/(kg·d).干预12周后,处死所有大鼠,检测血钙、磷、碱性磷酸酶和雌激素水平.分离右侧整段股骨应用micro-CT检测骨密度和骨微结构.结果:雌二醇在3组之间存在显著差异,表现为模型组水平低,而假手术组水平高.试验组松质骨骨密度、BV/TV、Tb.Th和Tb.N均显著高于模型组,而Tb.Sp显著低于模型组(P<0.05);试验组皮质骨骨密度、BV/TV和Cr.Th均显著高于模型组,而孔隙率显著低于模型组(P<0.05).结论:ω-3 PUFA对去卵巢大鼠的骨微结构有一定的改善作用,这对于防治骨质疏松具有一定的意义.

    作者:冯晓燕;陈良敬;李竞宇;王杰 刊期: 2017年第07期

  • La相关蛋白1在胃癌组织中的表达及意义

    目的:探讨La相关蛋白1(LARP1)在胃癌组织中的表达情况及与胃癌生物学行为的关系.方法:应用免疫组化S-P法检测30例胃癌组织、癌旁组织和30例正常胃组织中LARP1蛋白质的表达情况,分析LARP1表达情况与胃癌患者临床特征的关系.结果:胃癌组织中LARP1表达平均光密度值(0.19±0.13),明显高于癌旁组织(0.07±0.12)和正常组织(0.01±0.03)(P<0.01).随着TNM分期增加,胃癌组织中的LARP1表达量明显增加(Ⅰ期vs..Ⅱ期vs..Ⅲ+Ⅳ期=0.06±0.07vs..0.20±0.12vs.0.30±0.08,P=0.001),有淋巴结转移患者的LARP1表达水平高于无淋巴结转移患者(0.22±0.12 vs.0.11±0.14,P=0.038),低分化癌中的LARP1的表达量也明显高于高中分化癌(0.24±0.12 vs.0.12±0.12,P=0.022);而不同性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤大小的患者中LARP1表达水平并无明显差异(P>0.05).结论:LARP1在胃癌组织、癌旁组织中高表达,与TNM分期、淋巴结转移和分化程度有关,其可能在胃癌细胞的侵袭和转移过程中起重要作用.

    作者:刘鑫;黄宗声;郭先文;张法灿;农兵;张国;梁列新 刊期: 2017年第07期

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主办:广东省医学情报研究所