学术投稿

肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析

杨羚;唐海玲;陈定强;裘宇容

关键词:肺炎克雷伯菌, pNDM-LJ, blaNDM-1基因, 碳青霉烯酶
摘要:目的:通过对肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析,研究其与肺炎克雷伯菌耐药的相关性。方法:利用Illumina Miseq 高通量测序平台进行测序,然后用Edena 软件拼接测序数据,再利用RAST网上工具将拼接得到的contigs 进行注释,并用BLAST网上工具进行分析。结果:pNDM-LJ 为54 kb 大小的环状质粒,GC含量约为49%,预测编码52个功能基因,在不相容群分类中属于IncX3群质粒。该质粒与已知的IncX质粒序列有较高的相似性,blaNDM-1基因所在的基因环境比较复杂,推测其是由多个转座事件共同构建的。在pNDM-LJ中,blaNDM-1基因的5′端和3′端分别与ISAba125和IS26两种插入序列相连,形成大小约为10.8 kb的转座子样结构。结论:pNDM-LJ质粒携带碳青霉烯类耐药基因blaNDM-1,可能对我国的广泛传播blaNDM-1基因发挥重要作用。
实用医学杂志相关文献
  • 颈动脉超声结合脂联素和超敏C反应蛋白在动脉粥样硬化脑梗死中的临床研究

    目的:探讨脑梗死患者危险因素,分析脑梗死患者颈动脉粥样硬化斑块与血清脂联素( ADP )、超敏C反应蛋白(hs-CRP)水平的关系。方法:选择急性脑梗死住院患者70例为脑梗死组,同期健康体检者50例为对照组。通过颈动脉彩超检查和超声造影确定动脉粥样硬化斑块及其类型、级别。分别采用酶联免疫吸附法和免疫比浊法检测血清ADP 和hs-CRP 水平。结果:(1)高血脂、糖尿病、高血压病及吸烟史可能是脑梗死的危险因素;(2)梗死组患者血清 ADP 水平显著低于对照组而 hs-CRP 水平显著高于对照组;(3)脑梗死患者中软斑块者血清 ADP 水平显著低于对照组而 hs-CRP 水平显著高于对照组;(4)Ⅰ/Ⅱ斑块者血清ADP水平显著高于Ⅲ/Ⅳ斑块者而血清hs-CRP 水平显著低于Ⅲ/Ⅳ斑块者。结论:血清ADP与hs-CRP水平不仅与脑梗死相关,还与粥样动脉硬化程度及斑块稳定性存在密切关联。

    作者:王智明;李淮玉;李凤 刊期: 2016年第05期

  • 经彩超引导下腹横肌平面阻滞技术联合罗哌卡因切口局部麻醉用于胃癌手术后的镇痛效果

    目前腹横肌平面阻滞技术越来越受到重视[1-2]。加之罗哌卡因作为局麻药物进行切口局部浸润麻醉可有效减轻术后切口疼痛[3-6]。因此,本科室自2014年7月开始,对胃癌患者创新性采用腹横肌平面阻滞并联合罗哌卡因切口局部浸润麻醉,取得了较好的疗效,现报告如下。

    作者:王有财;任莹坤;王松涛;李剑;韩广森;王刚成;谷博;任柏林;润增慈 刊期: 2016年第05期

  • 髋部骨折患者残障接受度与社会关系质量的相关性

    目的:了解髋部骨折患者残障接受度与社会关系质量水平,讨论二者之间关系。方法:采用随机抽样的方法,选择内蒙古医科大学第二附属医院髋部骨折骨折患者80例作为研究对象,设定纳入和排除标准,采用调查问卷的方式与患者进行直接沟通。应用残障接受度量表(中文版)评估患者的残障接受水平,应用社会关系质量量表(中文版)评估患者的社会关系质量水平,并应用 SPSS 17.0软件包将调查结果进行统计学分析。结果:髋部骨折患者残障接受度总分处于中度水平,与社会关系质量总分呈正相关(r =0.246,P <0.05),且与家庭承担维度、家庭亲密度维度均明显相关(P <0.01)。结论:提高髋部骨折患者残障接受度水平,可有效提高其社会关系质量。反之,若增加心理干预,可提高患者残障接受度,二者相互促进。

    作者:王桂红;刘彦淑;金淑霞 刊期: 2016年第05期

  • 上皮-间充质转化在慢性阻塞性肺疾病中的研究进展

    慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary dis-ease , COPD )是一种以持续存在、呈进行性发展的气流受限为特征的一组慢性肺部疾病[1],而这种持续性的气流受限主要是由小气道病变(气道炎症、气道纤维化、气道阻力增高)和(或)肺实质病变(肺泡薄壁组织破坏、肺泡支撑结构消失、弹性回缩力降低)综合所致。近年来,由于COPD在全球的发病率和病死率逐年增加,国内外对这个疾病的研究也越来越多。很多学者通过研究发现,小气道的纤维化和闭塞可能是导致COPD患者呼吸道生理功能障碍的主要贡献者,其中,气道的上皮-间充质转化(epithelial-mesenchy-mal transition, EMT)在这一过程中扮演着重要的角色。除此之外,EMT 还参与了许多肺部疾病的发病机制,范围从发育障碍、纤维化、组织重塑到肺癌[2]。但是,EMT 在气道重塑过程中的作用机制目前尚罕有报道,本文就近年来 EMT与COPD发生发展的关系作一个简短综述。

    作者:李竹;刘建英 刊期: 2016年第05期

  • Rho GTP酶在阿尔茨海默病中的研究进展

    阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)是常见的进行性神经系统退行性疾病,以渐进性的认知和记忆的障碍和情志的异常改变为主要临床特征。 AD 的标志性病理改变为β-淀粉样蛋白(β-amyloid protein,Aβ)沉积形成的老年斑(senile plaques)和由磷酸化的不溶性 tau 蛋白组成的神经原纤维缠结(neurofibrillary tangles,NFTs)[1]。 Rho GTP 酶家族主要包括RhoA、Rac1和Cdc42,均与神经发育密切相关,它们被认为是位于神经细胞膜表面受体信号通路的分子开关,对调节神经元的发育和轴突结构起到至关重要的作用[2]。近年来,有文献报道Rho GTP酶和作为其重要的下游效应器之一的ROCK 与AD 的发生、发展密切相关,本文就这一研究进展进行综述。

    作者:喻慎仪;张璐 刊期: 2016年第05期

  • 缺血性脑卒中急性期超敏C-反应蛋白水平变化与进展性卒中的相关性

    目的:探讨缺血性脑卒中(IS)急性期超敏C-反应蛋白(Hs-CRP)水平变化与进展性卒中的相关性。方法:收集急性IS患者101例,测定患者入院24 h内和发病48、72 h血清Hs-CRP含量,根据检测结果将患者分为Hs-CRP持续增长组(n =35)和非持续增长组(n =66),完成两组患者的NIHSS 评分,并通过多变量Logistic 回归分析筛选出Hs-CRP持续增长可能的相关因素和进展性卒中发生的可能危险因素。结果:两组间Hs-CRP水平存在明显差异(P <0.001);Hs-CRP 持续增长组进展性卒中发生率明显高于非持续增长组(χ2=32.710,P <0.001);Logistic 回归分析显示:(1)入院血糖、白细胞计数、甘油三酯水平、入院时NIHSS 评分、24 h 内 Hs-CRP 是 Hs-CRP 持续增长的独立相关因素;(2)Hs-CRP 持续增长、入院 NIHSS 评分、糖尿病、肺部感染是进展性卒中发生的独立危险因素。结论:IS 急性期Hs-CRP 的持续增长是进展性卒中发生的独立预测因子。

    作者:姚涛;任明山;李淮玉 刊期: 2016年第05期

  • 38例足月与早产新生儿败血症临床特点及病原学比较

    目的:研究新生儿败血症病例的临床表现、病原菌分布及菌株耐药状况。方法:回顾2011年10月至2014年2月收治的38例足月及早产新生儿败血症病例的临床和病原学资料并进行对比分析。结果:18例足月儿败血症病例中,10例为革兰阳性球菌所致,其中耐苯唑西林8例(8/10),临床多为晚发型(9/10),无院内感染;8例足月儿革兰阴性杆菌有6例为院内感染。20例早产儿败血症病例中,17例病原是革兰阴性杆菌,以大肠埃希菌、肺炎克雷伯杆菌及阴沟肠杆菌为主(16/17),临床多为早发型(11/20),院内感染9例(9/20)。革兰阳性菌对青霉素G、甲氧西林的耐药率接近或超过70%,均对万古霉素敏感;革兰阴性菌对阿莫西林耐药率95.8%,接近或超过70%对哌拉西林/他唑巴坦等含酶抑制剂敏感,对碳青霉烯类及氨基糖甙类100%敏感。结论:本院收治的足月新生儿败血症主要由革兰阳性菌感染所致,病原对苯唑西林耐药率高;早产败血症患儿主要由革兰阴性菌所致,分离株均对碳青霉烯类和氨基糖甙类敏感。

    作者:雷克竞;唐国红;姚开虎 刊期: 2016年第05期

  • 颈椎前路手术中后纵韧带切除与否的临床探讨

    目的:介绍颈椎前路手术中后纵韧带的切除与保留的临床应用。方法:本院2012年3月至2015年3月共118例颈椎病退变患者,其中包括脊髓型颈椎病57例,神经根型颈椎病36例,混合型颈椎病25例。气管插管全麻下,所有病例均行颈椎前路手术,根据病情决定是否行后纵韧带切除术,并行人工椎间盘置换术或植骨融合内固定术。结果:所有患者均成功行颈椎前路减压术,其中后纵韧带切除72例,后纵韧带保留46例。118例患者均获得随访,随访时间3~24个月,平均9个月。术后临床症状获得不同程度改善,X线复查提示内固定位置良好,术后3个月复查MRI均提示脊髓、神经根压迫解除。两组JOA评分术前6~14分,平均(9±3.24)分,术后半年随访时8~16分,平均(11±2.25)分,差异有显著性(P <0.05);改善率22%~93.3%,平均62.5%。结论:并非所有颈椎前路手术均需切除颈椎后纵韧带。应认真评估术前患者影像学资料结合术中实际情况决定是否切除后纵韧带。

    作者:马航展;蔡东岭;李伟宽;何永浩;梁立明 刊期: 2016年第05期

  • 冠心病药物涂层支架置入后再内皮化研究

    目的:探索冠心病患者药物涂层支架(drug-eluting stents,DES)置入1年后冠状动脉再内皮化特点,为术后双联抗血小板时程的制定提供临床参考。方法:入选我院2013年1月至2015年4月入院的冠心病支架置入后1年的患者,进行光学相干断层成像检查的患者纳入本研究,观察支架置入处新生内膜增殖厚度,支架小梁内膜覆盖率等,考察药物涂层支架置入再内皮化的特点。结果:43例患者中的48枚支架,内膜覆盖率90.70%。轻/中/重内膜增殖程度的比例分别为19.92%、37.55%、42.53%。亚组分析,糖尿病组较非糖尿病组以及临床诊断为ACS者较稳定型心绞痛者内膜覆盖率更高,增生程度重。结论:DES置入1年后,绝大多数支架梁被内膜覆盖,但仍存在内皮化不全现象;糖尿病与急性冠脉综合征可能是影响内皮化进程的因素。

    作者:罗明华;关怀敏;解金红;陈玉善;王贺;邱承杰;董文杰;宗永华 刊期: 2016年第05期

  • microRNA-101和COX-2在结肠癌中的表达及其临床意义

    目的:检测结肠癌组织miR-101、COX-2的表达并探讨其临床意义。方法:收集结肠癌组织和癌旁组织标本32例,荧光定量PCR检测miR-101、COX-2 mRNA的表达,分析两者相关性及其与临床病理的关系。结果:与癌旁组织比较,结肠癌组织中miR-101表达相对降低(P <0.01),COX-2 mRNA表达相对增高(P <0.01),且两者表达呈负相关(r =-0.3735,P <0.01)。结肠癌组织中 COX-2的表达与肿瘤的分化程度无关(P >0.05);miR-101随肿瘤分化程度降低其表达也降低(P <0.05)。 Dukes 分期 C~D 期肠癌组织中 COX-2表达量高于 A ~ B 期, miR-101的表达量低于 A ~ B 期,但差异均无统计学意义( P >0.05)。结论:miR-101表达降低及COX-2过表达与结肠癌的发生有关,二者可以成为结肠癌的诊断标志物和潜在治疗靶点。

    作者:赖明广;青海涛;王立生 刊期: 2016年第05期

  • 姜黄挥发油对神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞增殖及侵袭力的影响

    目的:探讨姜黄挥发油(TVO)对神经母细胞瘤SH-SY5Y 细胞株增殖及侵袭力的影响。方法:分别用不同浓度的TVO(1.25~160 mg/L)行体外干预细胞,应用MTT法检测细胞存活率;细胞划痕实验检测160 mg/L TVO 对细胞迁移能力的影响;应用 Transwell 细胞侵袭试验检测细胞侵袭能力;用流式细胞仪检测细胞凋亡情况。结果:随着TVO浓度的升高及干预时间的延长,SH-SY5Y细胞存活率逐渐减低(P <0.01),凋亡率逐渐增加;经160 mg/L TVO 的培养液培养12、24、48 h 后,其细胞迁移度明显低于对照组(P <0.01);随TVO浓度增高,细胞侵袭能力逐渐减弱(P <0.01),且当浓度达到160 mg/L 时,侵袭力与顺铂无明显差异。结论:TVO能有效地抑制SH-SY5Y细胞增殖及侵袭。

    作者:薛月萃;涂云华;叶振源;荣冬芸;昝雪娟;潘军玲;曹煜 刊期: 2016年第05期

  • 血小板源性生长因子基因多态性与冠状动脉粥样斑块性质的相关性

    目的:探讨 PDGF-D rs3809021、rs7950273位点基因多态性与冠状动脉粥样硬化斑块性质的相关性。方法:273例冠心病患者根据冠脉造影及血管内超声检查( IVUS )结果将粥样斑块分为稳定斑块组、易损斑块组、混合斑块组;应用聚合酶链反应(PCR)技术检测 PDGF-D rs3809021、rs7950273基因多态性及测序鉴定,并与112例正常者对照。结果:PDGF-D 基因rs3809021位点多态性在冠心病组和对照组的分布差异无统计学意义。 PDGF-D 基因rs7950273位点中,携带C等位基因的基因型(CG + CC)可增加总体冠心病发病风险;易损斑块组患者的C等位基因频率分布高。结论: PDGF-D rs7950273位点基因多态性与冠状动脉粥样硬化斑块性质相关,C 等位基因使易损斑块的发生率增加,rs7950273位点C等位基因可能是冠心病的遗传易感基因。

    作者:刘相飞;陈玉东;高静 刊期: 2016年第05期

  • 红细胞体积分布宽度在卫氏并殖吸虫病诊断及鉴别诊断中的意义

    目的:探讨红细胞体积分布宽度在卫氏并殖吸虫病诊断及鉴别诊断中的应用及意义。方法:回顾性分析临床诊断为卫氏并殖吸虫病的85位患者,其中胸肺型45例,肺外型40例(包括脑脊髓型5例、腹型16例、肝型15例、皮肤型4例),收集所有患者白细胞计数( WBC )、血小板计数( PLT )、红细胞体积分布宽度-CV 值( RDW-CV )、嗜酸性粒细胞百分数( EO%)、C 反应蛋白( CRP )和血清球蛋白( Glb ),同时收集39位健康体检者的 WBC、PLT、RDW-CV、EO%、CRP 和 Glb ,并按胸肺型组、肺外型组、对照组进行统计分析。结果:3个分组中,胸肺型组和肺外型组所有实验室检查指标均高于对照组(均 P <0.001)。WBC、PLT、EO%、CRP 和 Glb 在胸肺型组和肺外型组中差异均不具有统计学意义(均 P >0.05)。胸肺型组 RDW-CV 值高于肺外型组,差异具有统计学意义( P <0.001)。结论:红细胞体积分布宽度在卫氏并殖吸虫病的鉴别诊断中具有重要价值,可以为临床医生诊断和鉴别诊断卫氏并殖吸虫病提供有力依据。

    作者:周腾坚;杜季梅;楼永良 刊期: 2016年第05期

  • 贝前列腺素钠联合复方玄驹胶囊治疗阴茎勃起功能障碍

    目的:探讨贝前列腺素钠联合复方玄驹胶囊治疗阴茎勃起功能障碍(ED)的有效性及安全性。方法:将62例阴茎勃起功能障碍患者随机分为两组。观察组:32例,口服贝前列腺素钠(20μg/次,3次/d)及复方玄驹胶囊(3粒/次,3次/d);对照组:30例,口服同等剂量的复方玄驹胶囊及维生素 E(10 mg/次,3次/d );疗程4周。观察患者治疗前后 IIEF-5评分、阴茎海绵体血流量的变化,以及不良反应的发生。结果:两组较治疗前IIEF-5评分显著提高(P <0.01),阴茎海绵体血流量明显增加(P <0.01),而观察组在治疗后的评分及血流量均明显高于对照组(P <0.05);在主观感受满意度上,观察组中明显高于对照组(P <0.05);两组间不良反应比较无明显差异(P >0.05)。结论:贝前列腺素钠联合复方玄驹胶囊能显著改善ED患者的阴茎勃起功能。

    作者:延敏博;路静;郑浩;江东;郭振宇;冯旭升 刊期: 2016年第05期

  • 糖尿病足患者抑郁发生的影响因素

    目的:探讨糖尿病足(DF)患者抑郁发生的影响因素。方法:采用患者健康问卷的抑郁症状群分量表( PHQ-9)评估空军总医院的110例 DF患者的抑郁情况,收集和分析 DF患者的一般资料、临床症状及实验室结果等,进行 Logistic 回归分析。结果: DF 患者抑郁率为47.3%。蚁行感( OR =23.401, P =0.009)及腹泻与便秘交替(OR =6.901, P =0.017)是DF患者抑郁的危险因素,医疗保险(OR =0.217, P =0.007)是保护因素。结论:蚁行感、腹泻与便秘交替、无医疗保险对于预测DF患者的抑郁发生有一定价值。

    作者:朱潇潇;刘一苇;霍瑞婷;关小宏 刊期: 2016年第05期

  • 2型糖尿病患者血尿酸与粒淋比相关性分析

    目的:研究2型糖尿病患者血尿酸和中性粒细胞/淋巴细胞比率(neutrophil-to-lymphocyte ratio, NIR)及胰岛素抵抗(insulin resistance,IR)关系。方法:选取273例新诊断的2型糖尿病患者,依据WHO的诊断标准分为高尿酸(HUA)组224例,其余为正常尿酸(NUA)组49例;另选取正常对照组100例。分析血尿酸与NLR和IR的相关性,采用Logistic多因素回归分析高尿酸血症的独立危险因素。结果:(1)HUA组的NLR和IR明显高于NUA 组(2.54±0.63 vs.2.05±0.61, P <0.001;3.70±1.86 vs.2.71±1.43, P <0.001);(2)在HUA组中, UA和NLR、IR呈正相关(分别为r =0.480, P <0.001; r =0.332, P <0.001)。(3)NLR [P <0.001, EXP(B)=8.045,95%CI 4.597~14.079]为HUA的危险因子。结论:研究结果表明NLR可能是高尿酸血症的独立危险因素。

    作者:黄伊华;罗鹏;余思渊;唐如;彭奕贤;何雷 刊期: 2016年第05期

  • 多发性骨髓瘤患者荧光原位杂交检测遗传学异常的回顾性分析

    目的:探究多发性骨髓瘤( MM )患者荧光原位杂交( FISH )结果与临床特征之间的关系。方法:回顾性统计57例初诊 MM 患者的临床特征及 FISH 检测的遗传学异常(其中17例患者经 CD138磁珠分选),分析其间的关系。结果:D13S319缺失和RB1缺失均与更高水平的乳酸脱氢酶(LDH)(P =0.024; P =0.018)及骨髓瘤细胞比例相关(P =0.027; P =0.013)。1q21扩增与更高水平的 LDH 量相关(P =0.030),与轻链型骨髓瘤发生相关(P =0.023)。 IgH 重排与患者发生肾功能损伤相关(P =0.009)。 D13S319缺失、1q21扩增、RB1缺失及IgH 重排之间均两两相关(P <0.01)。结论:FISH 检测的MM患者遗传学异常与多种临床预后指标相关,对于更完善地评估患者的病情及预后有较大作用。

    作者:蔡可;黄红铭;马亚男;姜胜华;丁润生;陆伟;沈毅;孙中伟;吴艳 刊期: 2016年第05期

  • 胃镜组织学活检与细胞学刷检对胃癌的诊断价值比较

    目的:回顾性分析组织学活检及细胞学刷检对提高胃癌的诊断率及影响因素。方法:对1854例经手术诊断为胃癌患者的内镜组织学活检诊断结果及细胞学刷检诊断结果与其诊断肿瘤的阳性率进行分析。结果:本研究中组织学活检诊断阳性率92.9%,细胞学刷检诊断胃癌阳性率92.6%,细胞学刷检阳性率及组织学活检阳性率差异无统计学意义。结论:胃镜组织学活检对胃癌的诊断和治疗具有重要的意义,细胞学刷检诊断符合率与组织学活检无统计学差异,且具有独特优势,值得进一步推广应用。

    作者:陈明;蒋树丽;王亚伟;王东阳;李增军 刊期: 2016年第05期

  • 女性糖调节受损患者降低膳食血糖负荷对血糖的影响

    目的:研究女性糖调节受损( IGR )患者膳食血糖负荷( GL )与血糖变化之间的关系。方法:筛查参与我院2型糖尿病流行病学调查的广州社区40~79岁居民,纳入120例女性 IGR 患者作为研究对象,随访12个月。膳食调查采用连续3 d 24 h 膳食回顾法,并测定研究对象在研究起始和结束时的血糖水平,分析不同膳食 GI、GL 与血糖变化的关系。结果:99例完成12个月的研究。按照 GL 变化百分比(ΔGL )分为Ⅰ组(ΔGL <-30%)、Ⅱ组(ΔGL -30%~-10%)和Ⅲ组(ΔGL≥-10%)。Ⅰ组及Ⅱ组 HbA1c降低率均大于Ⅲ组(P <0.05)。结论:女性 IGR 患者膳食 GL 降低10%或以上有利于改善糖化血红蛋白水平。

    作者:何凤怡;陈超刚;林刁珠;林秀红;袁智敏;严励 刊期: 2016年第05期

  • 无缝焊接技术在胆囊切除术中的对比实验研究

    目的:探讨高频焊接电子凝结器在胆囊切除术中的可行性、安全性和有效性。方法:96只新西兰兔平均分为4组。A 组使用高频焊接电子凝结器,B 组使用超声刀,C 组使用闭合束血管结扎系统(以下简称 Ligasure ), D 组使用丝线和普通手术刀。术中测定 A、B、C 组仪器工作温度,分别于术后1、4、7 d 观察预后并取闭合处组织,行 HE 染色。结果:所有动物均良好存活,无胆漏;A 组手术耗时更短,出血量更少,工作温度更低,肉芽组织出现更早,炎性反应更轻。肝功能术前术后4组之间无明显差异。结论:应用高频焊接电子凝结器行胆囊切除术,能达到与和超声刀、Ligasure 相同的临床愈合效果和质量。

    作者:王冠楠;崔梓铭;班柳娴;谭楚红;厉周;韩帅 刊期: 2016年第05期

实用医学杂志

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主管:广东省卫生厅

主办:广东省医学情报研究所