学术投稿

微滴数字PCR技术检测先天性心脏病患儿染色体22q11.2区段微缺失

周香城;张翠翠;李泌;马健;陈秋平;孙善权;张亮

关键词:22q11.2微缺失综合征, 微滴数字PCR, 先天性心脏病
摘要:目的 探索一种检测22q11.2微缺失综合征的新方法.方法 针对22q11.2微缺失综合征特异缺失区内的TBX1基因和内参基因RPP30设计引物和探针,采用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的方法计算TBX1/RPP30的比值,检测22q11.2区段微缺失.结果 通过数字PCR方法计算TBX1/RPP30的比值检测22q11.2微缺失综合征,检出3例微阵列比较基因组杂交检测结果为22q11.2微缺失综合征阳性的样本.在14例临床诊断为先天性心脏病的患儿中检测出2例22q11.2微缺失阳性样本.结论 微滴数字PCR可以准确检测出22q11.2区段微缺失,可提供一种快速、经济的检测先天性心脏病相关染色体22q11.2微缺失综合征的方法.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • 应用全基因组测序鉴定一例新发的染色体结构异常

    目的 探讨全基因组测序在鉴定新发染色体结构异常方面的应用价值.方法 应用全基因组测序检测1例外周血染色体核型为46,XY,ins(3)(q21p13p21)的患儿,其异常表型包括眼裂小、睑下垂、鼻梁低平等.结果 全基因组测序提示患儿的染色体断裂发生于3号染色体的55 473 257~78 341 929位置,这段序列插入到了3号染色体136 876 730~138 643 831的位置,所涉及的4个染色体断裂点均发生于基因间区,此外患儿在138 643 831~138 694 476之间的序列发生了缺失,其间包含睑裂狭小-睑下垂倒向型内眦赘皮综合征(blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome)的重要致病基因FOXL2.结论 染色体结构异常有可能造成断裂处基因的破坏或者在断裂区域发生染色体微缺失.要准确判断其致病性,需要同时进行基因和基因组层面的检测,而全基因组测序已成为其可选的方案.

    作者:张芹;偶健;王玮;冯涛;段程颖;李培培;林春花;李红 刊期: 2018年第01期

  • 46,XY,t(7;13)(q34;q22)一例

    先证者男,27岁,其妻孕2产0,两次均于孕50+天发生胚胎停育.细胞遗传学检查:在获得其知情同意后,抽取双方的外周血样,常规细胞培养,收获制片,G显带分析.先证者核型为46,XY,t(7;13) (7pter→7q34∷13q22→ 13qter;13pter→ 13q22∷7q34→7qter)(图1),其妻核型为46,XX.先证者父母拒绝接受染色体检查.

    作者:封纪珍;魏淑彦;杨会欣;李天洁 刊期: 2018年第01期

  • BoBs技术在690例孕妇的产前诊断中的应用

    目的 探讨BoBs技术联合传统的染色体核型分析对于减少出生缺陷的价值.方法 对690例具有产前诊断指征的单胎孕妇的羊水标本,用BoBs技术检测13、18、21、X、Y染色体的非整倍体异常和9种微缺失/微重复,并与羊水染色体核型分析的结果进行对比.结果 染色体核型分析的异常检出率为6.08%(42/690),其中包括数目异常36例、结构异常6例.BoBs检测的阳性率为5.95%(41/689),除常规羊水核型分析检出的染色体非整倍体外,另检出3例Xp22区微缺失、1例22qll区微重复、1例5p15区微重复,未检出染色体的平衡易位和正常多态性.结论 BoBs技术结合传统的核型分析适用于对大量的产前病例进行快速诊断,提高胎儿染色体异常的检出率.

    作者:张健;张燕 刊期: 2018年第01期

  • 一个遗传性多发性骨软骨瘤家系EXT1基因的突变分析

    目的 对1个遗传性多发性骨软骨瘤(hereditary multiple exostosis,HME)家系的先证者进行候选致病基因EXT1和EXT2的所有外显子检测,以寻找该HEM家系的致病性突变.方法 应用PCR技术扩增EXT1、EXT2的全部外显子并进行直接Sanger测序分析.结果 测序结果显示先证者EXT1基因第4外显子存在c.1202delT(p.I401Tfs*2)杂合缺失突变,该突变导致401位后的编码氨基酸发生移码,并在第402位引入终止密码,使EXT1编码的全长746氨基酸组成的蛋白质缩减至由402个氨基酸组成的截短型蛋白.该家系的其他6例患者均存在EXT1 c.1202delT的杂合移码突变,而表型正常家系成员未检测到该突变,符合基因型-表型共分离.未检测到EXT2基因的可疑突变.结论 EXT1c.1202delT杂合移码突变是导致这个HME家系患者发病的分子机制.

    作者:娄桂予;杨科;秦立涛;张玉薇;王红丹;侯巧芳;何淼;廖世秀 刊期: 2018年第01期

  • 一个先天性肌营养不良症家系的POMT1基因突变鉴定与产前诊断

    目的 确定1个先天性肌营养不良症(congenital muscular dystrophy,CMD)家系的POMT1致病基因突变,并对该家系中孕11周的胎儿进行产前诊断.方法 收集1例CMD患者及其表型正常父母的外周血标本,抽取母亲孕11周胎儿的绒毛标本.采用PCR扩增POMT1基因的第19和第20外显子,对PCR产物进行双向测序检测基因突变,明确致病突变来源后,进一步对胎儿进行产前诊断.结果 先证者POMT1基因第19外显子检测到c.1939G>A(p.Ala647Thr)杂合错义突变,来自其母亲;第20外显子检测到c.2141delG (p.Trp714Ter)杂合框移突变,导致蛋白质翻译的提前终止,该突变来自其父亲.产前诊断结果显示胎儿携带POMT1基因第19外显子c.1939G>A杂合错义突变,推测其为与母亲相同POMT1基因致病突变携带者的可能性大.结论 POMT1基因第19外显子c.1939G>A错义突变和第20外显子c.2141delG移码突变的复合杂合突变可能是该CMD家系的致病原因,符合常染色体隐性遗传的规律,通过基因产前诊断可以有效阻止致病突变的传递.

    作者:陈晨;梅世月;朱朝锋;任依琳;孔祥东 刊期: 2018年第01期

  • 羊水染色体倒位家系四例

    例1 女,38岁,孕2产1,孕15+6周产前筛查结果提示21三体高风险(1/64),18三体高风险(1/10),胎儿超声未见异常.孕18周在超声引导下抽取羊水进行染色体培养,常规制片及G显带,计数20个分裂相,分析5个核型,胎儿核型为46,XN,inv(22)(? p11p12),见图1A.孕妇核型为46,XN,inv(22)(?p11p12),其丈夫核型未见异常.孕妇选择继续妊娠,剖宫产一表型正常儿.

    作者:邓舒;姜雨婷;潘袁;张馨月;李德军;陈爽;刘睿智 刊期: 2018年第01期

  • 新发胎儿8号染色体短臂部分重复伴多发畸形一例

    孕妇 35岁,孕5产1.胚停2次,药流1次,剖宫产分娩一男婴,现10岁,智力稍低下,生长发育稍落后.本次妊娠无病毒感染,无有毒、有害物质及放射线接触史.孕妇及其父母均非近亲婚配,否认家族遗传病或先天畸形史.孕妇因高龄及不良孕产史,经知情同意后于孕18周行羊膜腔穿刺术,经羊水细胞培养,染色体G显带分析结果显示胎儿核型为46,XN,21q?(图1).进一步行羊水细胞微阵列比较基因组杂交检测,结果显示8p23.3p23.1区存在11.7 Mb的重复,孕妇及其配偶外周血染色体核型分析未见异常.

    作者:史青杨;姜雨婷;罗丽丽;刘彦红;李琳琳;靖吉丽 刊期: 2018年第01期

  • 胼胝体发育不良二例

    例1 孕妇,24岁,G1P0,月经周期4/30天,自然怀孕.否认孕期放射线、毒物接触史,否认服用致畸药物.夫妻双方身体健康、无异常表型,非近亲婚配.孕24周行胎儿系统超声检查,发现胎儿左侧脑室后角增宽(10.1 mm),右侧脑室后角宽7mm,第三脑室宽2.4 mm,第三脑室上方见10 mm×8.2 mm×6.6 mm液性暗区,无彩色血流信号,透明隔腔宽3.7 mm,提示胼胝体发育不良.胎儿头颅MRI显示两侧小脑半球尚清,后颅窝蛛网膜下腔宽径约0.57 cm,小脑蚓部存在,未见明确异常信号;胼胝体未见明确显示;双侧脑室分离,右侧脑室后角宽约1.0cm,左侧脑室后角宽约1.1 cm,第三脑室宽约0.2cm,上方可见一直径约8 mm液性间隙,第四脑室大小及形态未见异常;大脑各叶结构对称,未见明确异常信号影,中线结构无明显移位.诊断为胎儿胼胝体缺如.

    作者:顾雷雷;朱湘玉;朱雨捷;李洁 刊期: 2018年第01期

  • 一例皮肤松弛症患儿的临床与遗传学分析

    目的 采用遗传病相关基因外显子测序的方法确定1例皮肤松弛症患儿的致病基因,并对其相关的临床表型及基因型进行总结.方法 收集先证者及其父母的临床资料,首先对先证者进行遗传病相关基因的外显子测序,确定了可能的致病突变,对先证者及其父母进行Sanger测序验证,确定基因突变位点.结果 先证者存在A TP6V0A2基因c.187C>T(p.R63X)杂合突变和c.1189G>C(p.A397P)杂合突变,先证者父母分别携带ATP6V0A2基因c.1189G>C(p.A397P)杂合突变和c.187C>T(p.R63X)杂合突变.结合患儿临床表型,诊断为常染色体隐性遗传皮肤松弛症2A型(autosomal recessive cutis laxa type 2A,ARCL2A).结论 通过遗传学方法确诊了ARCL2A型患儿,总结了ARCL2A患儿的典型临床特征,新突变的发现扩大了ATP6V0A2基因的突变谱.外显子测序可作为诊断复杂遗传病致病基因的重要工具.

    作者:张平平;王昕;高志杰;刘晓雁;陈倩 刊期: 2018年第01期

  • ABO血型基因及亚型真核表达载体的构建及鉴定

    目的 构建人ABO血型A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体,为研究ABO血型基因及亚型基因的功能奠定基础.方法 从已知ABO基因分型的标本中(A101,B101)提取总RNA,将其逆转录合成cDNA,经特异性引物扩增目的基因片段,将其定向连接到pcDNA3.1(+)真核表达载体;采用定点突变PCR的方法构建CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体,通过测序鉴定其序列正确.将ABO血型A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体分别转染Hela细胞系,通过免疫荧光和Western印迹检测各ABO基因在细胞中的表达.结果 测序结果显示扩增到的A101及B101 cDNA以正确序列和方式插入载体,CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体的测序结果显示相应位点均成功突变;免疫荧光和Western印迹结果显示A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型在Hela细胞中均有表达.结论 成功构建了ABO血型基因及亚型基因真核表达载体,体外转染Hela细胞成功表达糖基转移酶,为后续研究奠定了基础.

    作者:冯智慧;胡彬;王同显;焦淑贤;逄淑涛 刊期: 2018年第01期

  • 10172例不良生育史男性的染色体核型分析

    目的 对有不良生育史的男性进行染色体核型分析,探讨染色体异常及多态性与不良生育的关系.方法 对10 172例男性进行常规外周血淋巴细胞培养,染色体制备以及G显带核型分析.结果 共检出染色体异常核型268例,检出率为2.63%,其中包括染色体结构异常205例,数目异常55例,46,XX性发育睾丸疾病8例(2.99%,8/268).染色体多态性748例,检出率7.36%.结论 男性染色体异常和多态性可导致不良生育的发生.在进行遗传咨询时,必须重视男性染色体核型分析.

    作者:王游声;黄演林;陈汉彪;郭莉;钟银环;尹爱华 刊期: 2018年第01期

  • 家族遗传性Peutz-Jeghers综合征STK11基因新发突变一例

    目的 探讨1个Peutz Jeghers综合征家系的遗传学病因.方法 收集先证者及其7位3代以内亲属的外周血样或口腔拭子,提取基因组DNA,采用二代测序技术对先证者106个目标基因的外显子以及邻近的内含子区域进行测序,并通过二代测序验证STK11的疑似致病突变.结果 在先证者的STK11基因内检测到一处既往未见报道的杂合突变NM_000455.4:c.419T>C(RefSeq编号Human GRCh37/hg19),该突变导致STK11基因编码蛋白的第140位氨基酸由亮氨酸转变为脯氨酸.先证者母亲的二代测序验证结果为阳性,其余亲属该位点则未发现突变.结论 STK11基因的NM_000455.4:c.419T>C突变可能是先证者发病的原因.

    作者:许翠洋;马悦;曹非;赵赫;王永洁;肖泽文;唐洁冰;燕飞虎;孙鹏;张娜;陶冀 刊期: 2018年第01期

  • Turner综合征患儿额外小标记染色体的来源及形态学特点

    目的 分析Turner综合征患儿额外小标记染色体的来源与形态.方法 对于经过G显带染色体核型分析发现的5例带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,用双色荧光原位杂交技术进一步明确其额外小标记染色体的来源与形态.结果 5例患儿中有3例的额外小标记染色体来源于X染色体,2例患儿的额外小标记染色体来源于Y染色体.其中3例为X染色体来源的额外小标记染色体,2例为环状染色体,1例为染色体小片段状.标记染色体2例Y染色体来源的额外小标记染色体中,1例以环状染色体和带有双着丝粒的染色体两种形态存在,另1例为双着丝粒染色体.结论 存在额外小标记染色体的Turner综合征患儿,其标记染色体多数来源于性染色体,来源于X染色体的额外小标记染色体主要以环状形式存在,其次为染色体小片段;来源于Y染色体的额外小标记染色体主要以双着丝粒染色体形式存在,其次为环状染色体.对于带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,应进一步采用双色荧光原位杂交技术鉴定额外小标记染色体的来源,以指导遗传咨询及临床诊治方案的制定.

    作者:刘楠;佟彤;陈悦;陈艳玲;蔡春泉 刊期: 2018年第01期

  • 一个家族性低钾型周期性麻痹家系的基因突变研究

    目的 探讨一个家族性低钾型周期性麻痹(familial hypokalemic periodic paralysis,FPP)家系的致病突变.方法 采集先证者及9名家系成员的外周静脉血样,用PCR扩增目的基因CACNA1S、SCN4A的编码区,将扩增产物纯化后直接送测序,以100名健康个体为对照组.结果 先证者和5例患病亲属(共5男1女)均表现为低钾型周期性麻痹发作且均携带SCN4A基因c.664C>T(p.Arg222Trp)突变.在3名无症状家系成员及100名健康对照中未发现相同的突变.在该家系中未发现CACNA1S基因的突变.结论 SCN4A基因c.664C>T突变是该家系发病的分子基础.家系中的患者均表现为完全外显.

    作者:郭曼丽;张国文;马绍刚;许铁;彭易根 刊期: 2018年第01期

  • 硫胺素转运和激活缺陷及其相关疾病

    硫胺素又称维生素B1,是体内重要的维生素.作为多种酶的辅酶,其活化形式硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate,TPP)参与细胞的新陈代谢.硫胺素转运和激活缺陷将导致细胞缺乏硫胺素,影响正常的代谢功能,导致多种疾病.本文就硫胺素转运和激活缺陷及其相关疾病做一综述.

    作者:冼肖英;林发全 刊期: 2018年第01期

  • 一个家族性腺瘤性息肉病家系同时出现的APC和MLH1基因突变

    目的 探讨一个家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家系APC和MLH1基因的突变情况.方法 通过临床表现、家族史及组织病理学等诊断1例FAP女性患者.患者两年后出现子宫内膜上皮内瘤变(endometrial intraepithelial neoplasia,EIN),而后者是Ⅱ型Lynch综合征的病变之一.提取患者及其家系成员的外周血DNA,采用Sanger测序的方法筛查APC和MLH1基因突变.结果 该家系同时存在APC基因第7外显子的杂合性突变c.637C>T(p.R213X)和MLH1基因第12外显子的杂合性突变c.1153C>T(p.R385C).两种突变同时出现的情况既往未见报道.前者突变造成终止密码子提前出现,后者突变了造成氨基酸的改变.结论 同时出现的APC基因c.637C>T (p.R213X)和MLH1基因c.1153C>T(p.R385C)突变是该家系的致病性突变,其出现临床表现的年龄较晚,且严重程度存在差异.对于FAP患者,应询问其家族史并对APC基因进行突变筛查,同时关注其是否存在肠外病变.对于出现子宫内膜病变的患者,可进行MMR基因的筛查,以确定是否同时存在Lynch综合征.

    作者:尚晨光;刘林枝;王小慧;董颖;张岩 刊期: 2018年第01期

  • SLC12A3和SCNN1B基因多态性与朝鲜族原发性高血压的相关性研究

    目的 探讨Na-C1协同转运蛋白基因SLC12A3 rs11643718位点和上皮细胞钠通道基因SCNN1B rs12447134位点的多态性与朝鲜族原发性高血压的相关性.方法 对204例原发性高血压患者和186名健康对照进行研究,运用改进的多重连接酶检测反应(improved multiplex ligation detectionreaction,iMLDR)技术检测rs11643718、rs12447134位点的多态性.结果 患者组和对照组在SLC12A3 rs11643718位点的基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P值均<0.05),且与收缩压相关(P<0.01,隐性模型);SCNN1B rs12447134位点的基因型与等位基因频率在两组间的差异无统计学意义(P值均> 0.05),但与舒张压存在相关性(P<0.05,隐性模型).结论 SLC12A3基因rs11643718位点的多态性与中国朝鲜族人群原发性高血压易感性相关,可作为预测发病的分子标记物.

    作者:史嘉翊;张春军;卜晓波;韩彦龙;邓代千;宋洁 刊期: 2018年第01期

  • 982例精神发育迟滞患儿的核型分析

    目的 了解精神发育迟滞患儿异常染色体核型分布及病因学分析.方法 常规外周血淋巴细胞培养,制备染色体,G显带进行核型分析.结果 在982例精神发育迟滞患儿中,共发现异常染色体401例,检出率为40.8%.其中21三体综合征(包括标准三体型、嵌合型和易位型)共326例,占异常核型的81.3%.除21三体核型外,其余异常核型75例,包括染色体易位、缺失及多态等异常.结论 染色体异常是引起儿童精神发育迟滞的晕要原因.应开展相关的遗传咨询及产前诊断,以减少缺陷患儿的出生率.

    作者:李瑞;谢博;王美烨;许召杰 刊期: 2018年第01期

  • 46,XX,t(1;10)一例

    患者女,39岁,G3 P0,因习惯性流产就诊.夫妇身体健康,非近亲结婚,否认遗传病家族史,否认有毒有害物质接触史.细胞遗传学检查:在签署知情同意书后,抽取外周血0.5mL接种至RPMI 1640培养基中,在37℃下培养72 h,在终止培养前60 min加入秋水仙素.常规收获中期分裂相细胞,制片,75℃烤片24 h,胰酶消化,G显带处理并染色.结合Ikaros图像分析软件(德国Zeiss公司)分析染色体核型,计数100个细胞,分析10个核型.根据国际人类染色体命名系统(ISCN2013),患者的染色体核型为46,XX,t(1;10)(10pter→10p13∷1p32→ 1qter;1 pter→1p32∷10p13→ 10qter)(图1),其丈夫染色体核型未见异常,拒绝接受家系调查.

    作者:孙媛;王桂林;邓胜;张玉洁;梁超;王绪华;刘建勇 刊期: 2018年第01期

  • 46,XX,t(2;7;4)复杂易位一例

    患者女,29岁,婚后5年未孕,表型及智力均正常,月经规律.其丈夫身体健康,夫妇为非近亲婚配,否认有毒物质和放射线接触史,妇科检查无异常发现?细胞遗传学检查:经知情同意,抽取患者外周血5 mL,常规培养淋巴细胞,收获染色体,G显带分析,计数30个中期分裂相,分析10个核型?患者核型为:46,XX,der(2)(4qter→4q35∷ 2p23→2q23∷ 7q32→7qter),der(4) (4pter→4q23∷ 2q23→2qter),der(7) (7pter→7q32∷ 4q23→4q35∷2p23→ 2pter)(图1).患者丈夫核型未见异常,家族中无类似患者,其父母体健,弟弟已正常生育,未接受染色体检查.

    作者:秦正新;芦清霞;孙雪梅;李静;蒋露薇 刊期: 2018年第01期

中华医学遗传学杂志

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