许翠洋;马悦;曹非;赵赫;王永洁;肖泽文;唐洁冰;燕飞虎;孙鹏;张娜;陶冀
目的 分析Turner综合征患儿额外小标记染色体的来源与形态.方法 对于经过G显带染色体核型分析发现的5例带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,用双色荧光原位杂交技术进一步明确其额外小标记染色体的来源与形态.结果 5例患儿中有3例的额外小标记染色体来源于X染色体,2例患儿的额外小标记染色体来源于Y染色体.其中3例为X染色体来源的额外小标记染色体,2例为环状染色体,1例为染色体小片段状.标记染色体2例Y染色体来源的额外小标记染色体中,1例以环状染色体和带有双着丝粒的染色体两种形态存在,另1例为双着丝粒染色体.结论 存在额外小标记染色体的Turner综合征患儿,其标记染色体多数来源于性染色体,来源于X染色体的额外小标记染色体主要以环状形式存在,其次为染色体小片段;来源于Y染色体的额外小标记染色体主要以双着丝粒染色体形式存在,其次为环状染色体.对于带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,应进一步采用双色荧光原位杂交技术鉴定额外小标记染色体的来源,以指导遗传咨询及临床诊治方案的制定.
作者:刘楠;佟彤;陈悦;陈艳玲;蔡春泉 刊期: 2018年第01期
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准.首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题.本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展.
作者:黄辉;沈亦平;顾卫红;王伟;王一鸣;祁鸣;沈珺;邱正庆;于世辉;周在威;陈白雪;陈蕾;陈云弟;崔欢欢;杜娟;高勇;郭一然;胡婵娟;胡亮;黄颐;李培培;李厦戎;李秀蓉;刘雅萍;卢洁;马端;马永毅;彭嵋;宋昉;孙洪业;汪亮;王大伟;王静敏;王玲;王正远;王志农;吴继红;吴静;伍建;许怡民;姚宏;杨东声;杨旭;杨艳玲;张颖;周裕林;朱宝生;曾思聪;彭智宇;黄尚志 刊期: 2018年第01期
目的 构建人ABO血型A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体,为研究ABO血型基因及亚型基因的功能奠定基础.方法 从已知ABO基因分型的标本中(A101,B101)提取总RNA,将其逆转录合成cDNA,经特异性引物扩增目的基因片段,将其定向连接到pcDNA3.1(+)真核表达载体;采用定点突变PCR的方法构建CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体,通过测序鉴定其序列正确.将ABO血型A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体分别转染Hela细胞系,通过免疫荧光和Western印迹检测各ABO基因在细胞中的表达.结果 测序结果显示扩增到的A101及B101 cDNA以正确序列和方式插入载体,CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型真核表达载体的测序结果显示相应位点均成功突变;免疫荧光和Western印迹结果显示A101、B101及其CisAB01、Ael05、B(A)04和Bw03亚型在Hela细胞中均有表达.结论 成功构建了ABO血型基因及亚型基因真核表达载体,体外转染Hela细胞成功表达糖基转移酶,为后续研究奠定了基础.
作者:冯智慧;胡彬;王同显;焦淑贤;逄淑涛 刊期: 2018年第01期
目的 探讨1个Peutz Jeghers综合征家系的遗传学病因.方法 收集先证者及其7位3代以内亲属的外周血样或口腔拭子,提取基因组DNA,采用二代测序技术对先证者106个目标基因的外显子以及邻近的内含子区域进行测序,并通过二代测序验证STK11的疑似致病突变.结果 在先证者的STK11基因内检测到一处既往未见报道的杂合突变NM_000455.4:c.419T>C(RefSeq编号Human GRCh37/hg19),该突变导致STK11基因编码蛋白的第140位氨基酸由亮氨酸转变为脯氨酸.先证者母亲的二代测序验证结果为阳性,其余亲属该位点则未发现突变.结论 STK11基因的NM_000455.4:c.419T>C突变可能是先证者发病的原因.
作者:许翠洋;马悦;曹非;赵赫;王永洁;肖泽文;唐洁冰;燕飞虎;孙鹏;张娜;陶冀 刊期: 2018年第01期
患者男,30岁.因曾于其他医院诊断为染色体平衡易位携带者,且配偶“流产4次,且孕期均小于8周”来我院复查.患者表型无明显异常,自述存在性功能障碍.精液检查示精子活力差,数量少,且存在形态异常,激素检查未见明显异常,Y染色体微缺失检测未发现缺失.患者配偶体格检查及实验室检查均未见明显异常.患者夫妻为非近亲结婚,否认家族遗传病史,无手术外伤史.在征得其知情同意后,抽取外周静脉血,常规培养染色体,G显带分析,患者核型为46,XY,t(1;9)(9pter→9p22∷1p13→ 1qter;1pter→ 1p13∷ 9p22→ 9qter)(图1).患者妻子核型为46,XX.
作者:唐思诗;叶远馨;林立;周燕虹 刊期: 2018年第01期
目的 对两个中国人原发性限局性皮肤淀粉样变家系进行致病基因的突变鉴定.方法 在取得知情同意后,采集家系成员的外周血,使用酚-氯仿法提取基因组DNA;应用PCR扩增两家系先证者OSMR基因的全部17个外显子及外显子/内含子衔接区,通过Sanger测序鉴定候选致病突变;通过PCR-限制性片段长度多态性分析以及高分辨熔解曲线分析进行致病突变的家系验证.结果 家系1中6例患者均携带OSMR基因第10外显子c.1538G>A错义突变,家系2中4例患者均携带OSMR基因第14外显子c.2081C>T错义突变;两个家系中所有正常个体及健康对照均未携带上述突变.结论 在两个原发性限局性皮肤淀粉样变家系中发现了OSMR基因内的两个错义突变(c.1538G>A和c.2081C>T).该结果与既往的报道一致,再次证明了这些突变的致病性.
作者:茅彬;姚煦;王铮;赵秀丽 刊期: 2018年第01期
目的 分析伴15q11q13拷贝数重复的自闭症患儿的遗传学特点及基因型-表型对应关系.方法 应用染色体核型分析、染色体微阵列(chromosomal microarray analysis,CMA)和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术联合对患儿及父母进行检测和验证.结果 核型分析提示8例患儿核型均携带标记染色体(supernumerary marker chromosome,SMC),2例患儿核型正常,但CMA结果显示其均在15q11q13区的拷贝数重复(前者为4个重复,后者为3个重复),且均覆盖Prader Willi/Angelman综合征关键区(Prader-Willi/Angelman syndrome critical region,PWACR).通过对其父母进行CMA检测,证实患儿在该区域重复均为新生突变,并应用Chromosome Analysis Suite Software软件对患儿及父母该区域单核苷酸多态性位点进行比对,证实患儿该拷贝数重复片段为母源性,诊断为15q11q13重复综合征.应用该区域特异位点FISH探针对核型分析显示携带SMC的患儿样本进行检测,证实了该SMC即为15q11q13拷贝数重复片段,且为两个拷贝,与CMA检测结果相吻合.结论 联合应用核型分析、CMA和FISH技术对临床10例自闭症患儿做出了诊断,并建立了临床表型与基因型之间的联系.
作者:王维鹏;胡昌明;毕欣;袁海明 刊期: 2018年第01期
患者女,39岁,G3 P0,因习惯性流产就诊.夫妇身体健康,非近亲结婚,否认遗传病家族史,否认有毒有害物质接触史.细胞遗传学检查:在签署知情同意书后,抽取外周血0.5mL接种至RPMI 1640培养基中,在37℃下培养72 h,在终止培养前60 min加入秋水仙素.常规收获中期分裂相细胞,制片,75℃烤片24 h,胰酶消化,G显带处理并染色.结合Ikaros图像分析软件(德国Zeiss公司)分析染色体核型,计数100个细胞,分析10个核型.根据国际人类染色体命名系统(ISCN2013),患者的染色体核型为46,XX,t(1;10)(10pter→10p13∷1p32→ 1qter;1 pter→1p32∷10p13→ 10qter)(图1),其丈夫染色体核型未见异常,拒绝接受家系调查.
作者:孙媛;王桂林;邓胜;张玉洁;梁超;王绪华;刘建勇 刊期: 2018年第01期
患者女,29岁,婚后5年未孕,表型及智力均正常,月经规律.其丈夫身体健康,夫妇为非近亲婚配,否认有毒物质和放射线接触史,妇科检查无异常发现?细胞遗传学检查:经知情同意,抽取患者外周血5 mL,常规培养淋巴细胞,收获染色体,G显带分析,计数30个中期分裂相,分析10个核型?患者核型为:46,XX,der(2)(4qter→4q35∷ 2p23→2q23∷ 7q32→7qter),der(4) (4pter→4q23∷ 2q23→2qter),der(7) (7pter→7q32∷ 4q23→4q35∷2p23→ 2pter)(图1).患者丈夫核型未见异常,家族中无类似患者,其父母体健,弟弟已正常生育,未接受染色体检查.
作者:秦正新;芦清霞;孙雪梅;李静;蒋露薇 刊期: 2018年第01期
目的 探讨一个家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家系APC和MLH1基因的突变情况.方法 通过临床表现、家族史及组织病理学等诊断1例FAP女性患者.患者两年后出现子宫内膜上皮内瘤变(endometrial intraepithelial neoplasia,EIN),而后者是Ⅱ型Lynch综合征的病变之一.提取患者及其家系成员的外周血DNA,采用Sanger测序的方法筛查APC和MLH1基因突变.结果 该家系同时存在APC基因第7外显子的杂合性突变c.637C>T(p.R213X)和MLH1基因第12外显子的杂合性突变c.1153C>T(p.R385C).两种突变同时出现的情况既往未见报道.前者突变造成终止密码子提前出现,后者突变了造成氨基酸的改变.结论 同时出现的APC基因c.637C>T (p.R213X)和MLH1基因c.1153C>T(p.R385C)突变是该家系的致病性突变,其出现临床表现的年龄较晚,且严重程度存在差异.对于FAP患者,应询问其家族史并对APC基因进行突变筛查,同时关注其是否存在肠外病变.对于出现子宫内膜病变的患者,可进行MMR基因的筛查,以确定是否同时存在Lynch综合征.
作者:尚晨光;刘林枝;王小慧;董颖;张岩 刊期: 2018年第01期
先证者男,27岁,婚后7年未育.身高180 cm,智力发育、表型及外生殖器均无明显异常.精液常规检查提示严重少精,否认腮腺炎病史.Y染色体AZF区及SRY基因检测未见异常.细胞遗传学检查:在征得其知情同意后抽取外周血样,常规进行淋巴细胞培养,制备染色体,G显带分析,计数50个分裂相,镜下分析5个核型,患者核型为47,XY,+mar(图1),其母亲核型为46,XX[33]/47,XX,+mar[7](图2).其父亲和妻子核型未见异常.夫妻二人于2015年8月借助卵胞浆内单精子显微注射技术成功怀孕,孕中期羊水穿刺检查未见胎儿染色体异常,于2016年5月剖宫产一健康女婴.
作者:王娜;刘丽丽;盛晴;许蓬 刊期: 2018年第01期
孕妇38岁,因高龄妊娠未进行中孕期血清学筛查,常规超声检查未见胎儿异常.在签署知情同意书后,于孕21周在B超引导下进行羊水穿刺,抽取羊水20 mL,常规进行细胞培养,收获,制片,G显带染色体分析,油镜下计数30个细胞,分析5个核型,胎儿核型为46,XY,t(2;5)(q11.2;p15)(图1).该孕妇孕5产1,第1胎为男性,现已12岁,健康.之后胚胎停育1次,人流2次.夫妻双方染色体核型分析均未见明显异常.
作者:杨会欣;魏淑彦;封纪珍;贾立云 刊期: 2018年第01期
目的 比较外周血胎儿游离DNA无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)对于不同指征的孕妇的临床检测效能.方法 选择接受NIPT检测的孕妇10 275例,对胎儿的染色体非整倍体进行全基因组低覆盖检测,对高风险者进一步进行产前诊断,对所有孕妇的妊娠结局进行随访.结果 NIPT检测提示72例胎儿为常染色体非整倍体高风险(21三体57例、18三体14例、13三体1例).经羊水染色体检查,确诊21三体56例,18三体13例,13三体1例.NIPT对于21三体和18三体的阳性预测值分别为98.25%和91.67%,对于高龄、血清学筛查高风险、临界风险以及自愿要求进行检查者的阳性预测值分别为100%、95%、90%和50%.随访发现1例血清学筛查提示21三体为高风险者为假阴性.在确诊的56例21三体中,血清学筛查高风险占55%,高龄占29%,临界风险者占l4%,自愿要求者占2%.结论 NIPT对21三体、18三体和13三体的筛查效果较为理想,可以有效监管高龄孕妇人群,对血清学筛查高风险和临界风险人群取得了很好的二级筛查效果,能够大限度地降低出生缺陷的发生率.
作者:张玢;潘凌燕;王慧艳;刘建兵;陆蓓亦;陈英苹;龙伟;虞斌 刊期: 2018年第01期
目的 探讨全基因组测序在鉴定新发染色体结构异常方面的应用价值.方法 应用全基因组测序检测1例外周血染色体核型为46,XY,ins(3)(q21p13p21)的患儿,其异常表型包括眼裂小、睑下垂、鼻梁低平等.结果 全基因组测序提示患儿的染色体断裂发生于3号染色体的55 473 257~78 341 929位置,这段序列插入到了3号染色体136 876 730~138 643 831的位置,所涉及的4个染色体断裂点均发生于基因间区,此外患儿在138 643 831~138 694 476之间的序列发生了缺失,其间包含睑裂狭小-睑下垂倒向型内眦赘皮综合征(blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome)的重要致病基因FOXL2.结论 染色体结构异常有可能造成断裂处基因的破坏或者在断裂区域发生染色体微缺失.要准确判断其致病性,需要同时进行基因和基因组层面的检测,而全基因组测序已成为其可选的方案.
作者:张芹;偶健;王玮;冯涛;段程颖;李培培;林春花;李红 刊期: 2018年第01期
目的 探讨钙黏蛋白-13 (T cadherin,CDH13)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与中国人群代谢综合征(metabolic syndrome,MS)的相关性.方法 应用TaqMan方法对453例MS患者和526名正常对照的6个CDH13基因的多态性位点(rs11646213、rs12596316、rs3865188、rs12444338、rs12051272以及rs7195409)进行基因分型.评估以上6个多态性位点与MS的相关性.结果 CDH 13基因rs11646213、rs3865188、rs12444338、rs12051272和rs7195409多态性位点的基因型频率及等位基因频率在MS患者和对照者的差异无统计学意义.校正年龄和性别后,CDH13基因rs12596316AG基因型发生MS的风险为rs12596316 AA+GG基因型的1.38倍(P=0.01,95%CI:1.07~1.78);CDH13基因rs12596316等位基因频率在MS和对照组间差异无统计学意义.rs11646213 rs12596316-rs3865188-rs12444338-rs12051272单倍型频率在MS组和对照组的差异无统计学意义.结论 CDH13基因rs11646213、rs3865188、rs12444338、rs12051272和rs7195409位点多态性可能与中国人群MS无相关;CDH13基因rs12596316AG基因型可能增加中国人群MS发病风险.
作者:李奕平;杨莹;鲁帅尧;李显丽;杨曼;熊煜欣;陶文玉;王晓苓;姚宇峰;肖春杰 刊期: 2018年第01期
目的 探索一种检测22q11.2微缺失综合征的新方法.方法 针对22q11.2微缺失综合征特异缺失区内的TBX1基因和内参基因RPP30设计引物和探针,采用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的方法计算TBX1/RPP30的比值,检测22q11.2区段微缺失.结果 通过数字PCR方法计算TBX1/RPP30的比值检测22q11.2微缺失综合征,检出3例微阵列比较基因组杂交检测结果为22q11.2微缺失综合征阳性的样本.在14例临床诊断为先天性心脏病的患儿中检测出2例22q11.2微缺失阳性样本.结论 微滴数字PCR可以准确检测出22q11.2区段微缺失,可提供一种快速、经济的检测先天性心脏病相关染色体22q11.2微缺失综合征的方法.
作者:周香城;张翠翠;李泌;马健;陈秋平;孙善权;张亮 刊期: 2018年第01期
例1 孕妇,24岁,G1P0,月经周期4/30天,自然怀孕.否认孕期放射线、毒物接触史,否认服用致畸药物.夫妻双方身体健康、无异常表型,非近亲婚配.孕24周行胎儿系统超声检查,发现胎儿左侧脑室后角增宽(10.1 mm),右侧脑室后角宽7mm,第三脑室宽2.4 mm,第三脑室上方见10 mm×8.2 mm×6.6 mm液性暗区,无彩色血流信号,透明隔腔宽3.7 mm,提示胼胝体发育不良.胎儿头颅MRI显示两侧小脑半球尚清,后颅窝蛛网膜下腔宽径约0.57 cm,小脑蚓部存在,未见明确异常信号;胼胝体未见明确显示;双侧脑室分离,右侧脑室后角宽约1.0cm,左侧脑室后角宽约1.1 cm,第三脑室宽约0.2cm,上方可见一直径约8 mm液性间隙,第四脑室大小及形态未见异常;大脑各叶结构对称,未见明确异常信号影,中线结构无明显移位.诊断为胎儿胼胝体缺如.
作者:顾雷雷;朱湘玉;朱雨捷;李洁 刊期: 2018年第01期
孕妇 35岁,孕5产1.胚停2次,药流1次,剖宫产分娩一男婴,现10岁,智力稍低下,生长发育稍落后.本次妊娠无病毒感染,无有毒、有害物质及放射线接触史.孕妇及其父母均非近亲婚配,否认家族遗传病或先天畸形史.孕妇因高龄及不良孕产史,经知情同意后于孕18周行羊膜腔穿刺术,经羊水细胞培养,染色体G显带分析结果显示胎儿核型为46,XN,21q?(图1).进一步行羊水细胞微阵列比较基因组杂交检测,结果显示8p23.3p23.1区存在11.7 Mb的重复,孕妇及其配偶外周血染色体核型分析未见异常.
作者:史青杨;姜雨婷;罗丽丽;刘彦红;李琳琳;靖吉丽 刊期: 2018年第01期
目的 明确5例新生儿肝内胆汁淤积症患儿的分子机制.方法 应用新一代测序技术对患儿的SLC25A13基因进行外显子捕获检测,对突变位点进行Sanger测序验证.用PolyPhen 2软件对新突变的致病性进行分析.结果 5例患儿均携带SLC25A13基因的复合突变,共发现8个突变位点,其中2个既往未见报道(c.1357A>G和c.1663dup23).5例患儿的父母均为突变携带者.结论 SLC25A 13基因的突变可能是5例患儿的发病原因,所携带的突变以851de14和1638 1660dup为主.新发现的c.1357A>G和c.1663dup23突变丰富了SLC25A13基因的突变谱.
作者:徐俊杰;高敏;律玉强;唐运萍;魏旭霞;杨露;张开慧;刘毅;盖中涛 刊期: 2018年第01期
患者男,51天.发现血遗传代谢异常1月余,新生儿血遗传代谢病筛查结果示肉豆蔻烯酰肉碱(C14∶1)3.30 μmol/L(正常参考值:0.02~0.4 μmol/L),今来我院寻求诊治.查体及血液生化内分泌检查无阳性发现.血糖监测均正常.心电图示窦性心动过速.彩超示卵圆孔未闭.纳食夜眠可,精神佳,大小便正常.入院再次行血遗传代谢病筛查结果示肉豆蔻烯酰肉碱(C14∶1)2.20 μmol/L,仍明显偏高.经家属签署知情同意书后,抽取患儿及父母外周血2 mL,用乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,送至郑州金域临床检验中心,应用QIAampDNA提取试剂盒(德国QIAGEN公司)抽提基因组DNA,通过PCR扩增并Sanger测序技术对受检者ACADVL(NM_000018.3)基因的外显子编码区进行直接测序.
作者:李林飞;刘洋利;赵鼎;陈重芬 刊期: 2018年第01期