顾雷雷；朱湘玉；朱雨捷；李洁
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准.首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题.本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展.
作者：黄辉；沈亦平；顾卫红；王伟；王一鸣；祁鸣；沈珺；邱正庆；于世辉；周在威；陈白雪；陈蕾；陈云弟；崔欢欢；杜娟；高勇；郭一然；胡婵娟；胡亮；黄颐；李培培；李厦戎；李秀蓉；刘雅萍；卢洁；马端；马永毅；彭嵋；宋昉；孙洪业；汪亮；王大伟；王静敏；王玲；王正远；王志农；吴继红；吴静；伍建；许怡民；姚宏；杨东声；杨旭；杨艳玲；张颖；周裕林；朱宝生；曾思聪；彭智宇；黄尚志 刊期： 2018年第01期
目的 探讨1个Peutz Jeghers综合征家系的遗传学病因.方法 收集先证者及其7位3代以内亲属的外周血样或口腔拭子,提取基因组DNA,采用二代测序技术对先证者106个目标基因的外显子以及邻近的内含子区域进行测序,并通过二代测序验证STK11的疑似致病突变.结果 在先证者的STK11基因内检测到一处既往未见报道的杂合突变NM_000455.4:c.419T＞C(RefSeq编号Human GRCh37/hg19),该突变导致STK11基因编码蛋白的第140位氨基酸由亮氨酸转变为脯氨酸.先证者母亲的二代测序验证结果为阳性,其余亲属该位点则未发现突变.结论 STK11基因的NM_000455.4:c.419T＞C突变可能是先证者发病的原因.
作者：许翠洋；马悦；曹非；赵赫；王永洁；肖泽文；唐洁冰；燕飞虎；孙鹏；张娜；陶冀 刊期： 2018年第01期
患者男,30岁.因曾于其他医院诊断为染色体平衡易位携带者,且配偶“流产4次,且孕期均小于8周”来我院复查.患者表型无明显异常,自述存在性功能障碍.精液检查示精子活力差,数量少,且存在形态异常,激素检查未见明显异常,Y染色体微缺失检测未发现缺失.患者配偶体格检查及实验室检查均未见明显异常.患者夫妻为非近亲结婚,否认家族遗传病史,无手术外伤史.在征得其知情同意后,抽取外周静脉血,常规培养染色体,G显带分析,患者核型为46,XY,t(1;9)(9pter→9p22∷1p13→ 1qter;1pter→ 1p13∷ 9p22→ 9qter)(图1).患者妻子核型为46,XX.
作者：唐思诗；叶远馨；林立；周燕虹 刊期： 2018年第01期
孕妇38岁,因高龄妊娠未进行中孕期血清学筛查,常规超声检查未见胎儿异常.在签署知情同意书后,于孕21周在B超引导下进行羊水穿刺,抽取羊水20 mL,常规进行细胞培养,收获,制片,G显带染色体分析,油镜下计数30个细胞,分析5个核型,胎儿核型为46,XY,t(2;5)(q11.2;p15)(图1).该孕妇孕5产1,第1胎为男性,现已12岁,健康.之后胚胎停育1次,人流2次.夫妻双方染色体核型分析均未见明显异常.
作者：杨会欣；魏淑彦；封纪珍；贾立云 刊期： 2018年第01期
目的 比较外周血胎儿游离DNA无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)对于不同指征的孕妇的临床检测效能.方法 选择接受NIPT检测的孕妇10 275例,对胎儿的染色体非整倍体进行全基因组低覆盖检测,对高风险者进一步进行产前诊断,对所有孕妇的妊娠结局进行随访.结果 NIPT检测提示72例胎儿为常染色体非整倍体高风险(21三体57例、18三体14例、13三体1例).经羊水染色体检查,确诊21三体56例,18三体13例,13三体1例.NIPT对于21三体和18三体的阳性预测值分别为98.25％和91.67％,对于高龄、血清学筛查高风险、临界风险以及自愿要求进行检查者的阳性预测值分别为100％、95％、90％和50％.随访发现1例血清学筛查提示21三体为高风险者为假阴性.在确诊的56例21三体中,血清学筛查高风险占55％,高龄占29％,临界风险者占l4％,自愿要求者占2％.结论 NIPT对21三体、18三体和13三体的筛查效果较为理想,可以有效监管高龄孕妇人群,对血清学筛查高风险和临界风险人群取得了很好的二级筛查效果,能够大限度地降低出生缺陷的发生率.
作者：张玢；潘凌燕；王慧艳；刘建兵；陆蓓亦；陈英苹；龙伟；虞斌 刊期： 2018年第01期
例1 孕妇,24岁,G1P0,月经周期4/30天,自然怀孕.否认孕期放射线、毒物接触史,否认服用致畸药物.夫妻双方身体健康、无异常表型,非近亲婚配.孕24周行胎儿系统超声检查,发现胎儿左侧脑室后角增宽(10.1 mm),右侧脑室后角宽7mm,第三脑室宽2.4 mm,第三脑室上方见10 mm×8.2 mm×6.6 mm液性暗区,无彩色血流信号,透明隔腔宽3.7 mm,提示胼胝体发育不良.胎儿头颅MRI显示两侧小脑半球尚清,后颅窝蛛网膜下腔宽径约0.57 cm,小脑蚓部存在,未见明确异常信号;胼胝体未见明确显示;双侧脑室分离,右侧脑室后角宽约1.0cm,左侧脑室后角宽约1.1 cm,第三脑室宽约0.2cm,上方可见一直径约8 mm液性间隙,第四脑室大小及形态未见异常;大脑各叶结构对称,未见明确异常信号影,中线结构无明显移位.诊断为胎儿胼胝体缺如.
作者：顾雷雷；朱湘玉；朱雨捷；李洁 刊期： 2018年第01期
患者女,39岁,G3 P0,因习惯性流产就诊.夫妇身体健康,非近亲结婚,否认遗传病家族史,否认有毒有害物质接触史.细胞遗传学检查:在签署知情同意书后,抽取外周血0.5mL接种至RPMI 1640培养基中,在37℃下培养72 h,在终止培养前60 min加入秋水仙素.常规收获中期分裂相细胞,制片,75℃烤片24 h,胰酶消化,G显带处理并染色.结合Ikaros图像分析软件(德国Zeiss公司)分析染色体核型,计数100个细胞,分析10个核型.根据国际人类染色体命名系统(ISCN2013),患者的染色体核型为46,XX,t(1;10)(10pter→10p13∷1p32→ 1qter;1 pter→1p32∷10p13→ 10qter)(图1),其丈夫染色体核型未见异常,拒绝接受家系调查.
作者：孙媛；王桂林；邓胜；张玉洁；梁超；王绪华；刘建勇 刊期： 2018年第01期
患儿1天,因“早产,新生儿窒息”入院.患儿系第3胎,孕36+2周因母体“妊娠期糖尿病合并甲状腺功能减低”经剖宫产术娩出,出生体重3050 g,身长46 cm,出生时无呼吸,心率慢,全身皮肤青紫,无肌张力,立即给予“气管内吸痰,面罩加压给氧”,出生后1分钟Apgar评分为4,5分钟Apgar评分为9,无特殊面容及明显畸形.其父母为非近亲婚配,智力、表型均无异常.母亲孕3产2,育有1子,体健;第二胎自然流产;此次怀孕期间否认有毒物质、药物及射线接触史,B超无异常发现.
作者：陈璐；金一帮；施建有；童郁；蔡晓晓；杨君瑞 刊期： 2018年第01期
目的 了解精神发育迟滞患儿异常染色体核型分布及病因学分析.方法 常规外周血淋巴细胞培养,制备染色体,G显带进行核型分析.结果 在982例精神发育迟滞患儿中,共发现异常染色体401例,检出率为40.8％.其中21三体综合征(包括标准三体型、嵌合型和易位型)共326例,占异常核型的81.3％.除21三体核型外,其余异常核型75例,包括染色体易位、缺失及多态等异常.结论 染色体异常是引起儿童精神发育迟滞的晕要原因.应开展相关的遗传咨询及产前诊断,以减少缺陷患儿的出生率.
作者：李瑞；谢博；王美烨；许召杰 刊期： 2018年第01期
患者男,51天.发现血遗传代谢异常1月余,新生儿血遗传代谢病筛查结果示肉豆蔻烯酰肉碱(C14∶1)3.30 μmol/L(正常参考值:0.02～0.4 μmol/L),今来我院寻求诊治.查体及血液生化内分泌检查无阳性发现.血糖监测均正常.心电图示窦性心动过速.彩超示卵圆孔未闭.纳食夜眠可,精神佳,大小便正常.入院再次行血遗传代谢病筛查结果示肉豆蔻烯酰肉碱(C14∶1)2.20 μmol/L,仍明显偏高.经家属签署知情同意书后,抽取患儿及父母外周血2 mL,用乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,送至郑州金域临床检验中心,应用QIAampDNA提取试剂盒(德国QIAGEN公司)抽提基因组DNA,通过PCR扩增并Sanger测序技术对受检者ACADVL(NM_000018.3)基因的外显子编码区进行直接测序.
作者：李林飞；刘洋利；赵鼎；陈重芬 刊期： 2018年第01期
目的 对两个中国人原发性限局性皮肤淀粉样变家系进行致病基因的突变鉴定.方法 在取得知情同意后,采集家系成员的外周血,使用酚-氯仿法提取基因组DNA;应用PCR扩增两家系先证者OSMR基因的全部17个外显子及外显子/内含子衔接区,通过Sanger测序鉴定候选致病突变;通过PCR-限制性片段长度多态性分析以及高分辨熔解曲线分析进行致病突变的家系验证.结果 家系1中6例患者均携带OSMR基因第10外显子c.1538G＞A错义突变,家系2中4例患者均携带OSMR基因第14外显子c.2081C＞T错义突变;两个家系中所有正常个体及健康对照均未携带上述突变.结论 在两个原发性限局性皮肤淀粉样变家系中发现了OSMR基因内的两个错义突变(c.1538G＞A和c.2081C＞T).该结果与既往的报道一致,再次证明了这些突变的致病性.
作者：茅彬；姚煦；王铮；赵秀丽 刊期： 2018年第01期
目的 对1例Waardenburg综合征Ⅱ型先证者及其家系成员进行SOX10基因的突变分析,探讨其可能的分子生物学致病原因.方法 抽提先证者及其家系成员的外周血基因组DNA,芯片捕获高通量测序方法对MITF、PAX3、SOX10、SNA12、END3和ENDRB基因的全部外显子及其侧翼序列进行检测.根据高通量测序结果,对先证者及其父母进行突变位点的Sanger测序验证分析.结果 Sanger测序结果显示先证者存在SOX10 c.127 C＞T(p.R43X)杂合突变,导致SOX10基因第43位编码精氨酸的密码子(CGA)突变为终止密码子(UGA),产生截短蛋白,影响蛋白质功能的正常发挥.经检索人类基因突变数据库,该突变为未报道过的新突变.患儿父母未检测到该突变.结论 先证者SOX10基因c.127C＞T(p.R43X)杂合突变可能是其分子生物学致病原因.
作者：郑雷；闫有圣；陈雪；张钏；张庆华；冯暄；郝胜菊 刊期： 2018年第01期
孕妇29岁,G1P0,因“停经12+周、唐筛18三体高风险”前来咨询.既往体健,表型、智力正常,不嗜烟酒,孕期及孕前无不良接触史.其丈夫表型正常,夫妇非近亲结婚,否认家族遗传病史.辅助检查:唐筛:游离绒毛膜促性腺激素β亚单位(free beta subunit of human chorionic gonadotropin,free β-hCG) 2.10ng/mL,校正中位数0.03(参考范围0～2.5);妊娠相关血浆蛋白A(pregnancy associated plasma protein-A,PAPP-A) 413.0mU/L,校正中位数0.11(参考范围＞0.43);颈项透明层(nuchal translucency,NT) 2.2 mm,校正中位数1.53;18三体风险值1∶119.孕12+周B超:胎儿颅内囊肿(0.8 cm×0.7cm),NT 2.2 mm.
作者：潘丽；苏文；林道彬 刊期： 2018年第01期
先证者男,27岁,婚后7年未育.身高180 cm,智力发育、表型及外生殖器均无明显异常.精液常规检查提示严重少精,否认腮腺炎病史.Y染色体AZF区及SRY基因检测未见异常.细胞遗传学检查:在征得其知情同意后抽取外周血样,常规进行淋巴细胞培养,制备染色体,G显带分析,计数50个分裂相,镜下分析5个核型,患者核型为47,XY,+mar(图1),其母亲核型为46,XX[33]/47,XX,+mar[7](图2).其父亲和妻子核型未见异常.夫妻二人于2015年8月借助卵胞浆内单精子显微注射技术成功怀孕,孕中期羊水穿刺检查未见胎儿染色体异常,于2016年5月剖宫产一健康女婴.
作者：王娜；刘丽丽；盛晴；许蓬 刊期： 2018年第01期
硫胺素又称维生素B1,是体内重要的维生素.作为多种酶的辅酶,其活化形式硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate,TPP)参与细胞的新陈代谢.硫胺素转运和激活缺陷将导致细胞缺乏硫胺素,影响正常的代谢功能,导致多种疾病.本文就硫胺素转运和激活缺陷及其相关疾病做一综述.
作者：冼肖英；林发全 刊期： 2018年第01期
目的 确定1个先天性肌营养不良症(congenital muscular dystrophy,CMD)家系的POMT1致病基因突变,并对该家系中孕11周的胎儿进行产前诊断.方法 收集1例CMD患者及其表型正常父母的外周血标本,抽取母亲孕11周胎儿的绒毛标本.采用PCR扩增POMT1基因的第19和第20外显子,对PCR产物进行双向测序检测基因突变,明确致病突变来源后,进一步对胎儿进行产前诊断.结果 先证者POMT1基因第19外显子检测到c.1939G＞A(p.Ala647Thr)杂合错义突变,来自其母亲;第20外显子检测到c.2141delG (p.Trp714Ter)杂合框移突变,导致蛋白质翻译的提前终止,该突变来自其父亲.产前诊断结果显示胎儿携带POMT1基因第19外显子c.1939G＞A杂合错义突变,推测其为与母亲相同POMT1基因致病突变携带者的可能性大.结论 POMT1基因第19外显子c.1939G＞A错义突变和第20外显子c.2141delG移码突变的复合杂合突变可能是该CMD家系的致病原因,符合常染色体隐性遗传的规律,通过基因产前诊断可以有效阻止致病突变的传递.
作者：陈晨；梅世月；朱朝锋；任依琳；孔祥东 刊期： 2018年第01期
患者女,29岁,婚后5年未孕,表型及智力均正常,月经规律.其丈夫身体健康,夫妇为非近亲婚配,否认有毒物质和放射线接触史,妇科检查无异常发现?细胞遗传学检查:经知情同意,抽取患者外周血5 mL,常规培养淋巴细胞,收获染色体,G显带分析,计数30个中期分裂相,分析10个核型?患者核型为:46,XX,der(2)(4qter→4q35∷ 2p23→2q23∷ 7q32→7qter),der(4) (4pter→4q23∷ 2q23→2qter),der(7) (7pter→7q32∷ 4q23→4q35∷2p23→ 2pter)(图1).患者丈夫核型未见异常,家族中无类似患者,其父母体健,弟弟已正常生育,未接受染色体检查.
作者：秦正新；芦清霞；孙雪梅；李静；蒋露薇 刊期： 2018年第01期
目的 对1例仅表现为哭声无力,声音嘶哑,无特殊面容,不伴有先天性心脏病等其他症状或体征的不典型新生儿猫叫综合征患儿的临床及遗传学特点进行分析.方法 对患儿及其父母外周血淋巴细胞G显带染色体核型分析,对患儿用应荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行验证,之后用染色体微阵列法(chromosome microarray analysis,CMA)进一步精确遗传学分析.结果 患儿染色体核型分析结果为46,XX,del(5)(p14p15),其父母外周血染色体核型分析未见异常.FISH结果证实了此缺失的存在.染色体微阵列检测结果显示患儿chr5p15.33p14.1区域存在25.7 Mb片段缺失.结论 猫叫综合征患者个体表型可存在较大差异,尤其是对于新生儿易导致漏诊、误诊.应用细胞遗传学与分子遗传学技术相结合的综合分析有利于弥补单一方法的不足,更加精确地对缺失片段进行定位.
作者：贺文凤；陈贺；牟海燕；李洁 刊期： 2018年第01期
目的 探索一种检测22q11.2微缺失综合征的新方法.方法 针对22q11.2微缺失综合征特异缺失区内的TBX1基因和内参基因RPP30设计引物和探针,采用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的方法计算TBX1/RPP30的比值,检测22q11.2区段微缺失.结果 通过数字PCR方法计算TBX1/RPP30的比值检测22q11.2微缺失综合征,检出3例微阵列比较基因组杂交检测结果为22q11.2微缺失综合征阳性的样本.在14例临床诊断为先天性心脏病的患儿中检测出2例22q11.2微缺失阳性样本.结论 微滴数字PCR可以准确检测出22q11.2区段微缺失,可提供一种快速、经济的检测先天性心脏病相关染色体22q11.2微缺失综合征的方法.
作者：周香城；张翠翠；李泌；马健；陈秋平；孙善权；张亮 刊期： 2018年第01期
目的 分析Turner综合征患儿额外小标记染色体的来源与形态.方法 对于经过G显带染色体核型分析发现的5例带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,用双色荧光原位杂交技术进一步明确其额外小标记染色体的来源与形态.结果 5例患儿中有3例的额外小标记染色体来源于X染色体,2例患儿的额外小标记染色体来源于Y染色体.其中3例为X染色体来源的额外小标记染色体,2例为环状染色体,1例为染色体小片段状.标记染色体2例Y染色体来源的额外小标记染色体中,1例以环状染色体和带有双着丝粒的染色体两种形态存在,另1例为双着丝粒染色体.结论 存在额外小标记染色体的Turner综合征患儿,其标记染色体多数来源于性染色体,来源于X染色体的额外小标记染色体主要以环状形式存在,其次为染色体小片段;来源于Y染色体的额外小标记染色体主要以双着丝粒染色体形式存在,其次为环状染色体.对于带有额外小标记染色体的Turner综合征患儿,应进一步采用双色荧光原位杂交技术鉴定额外小标记染色体的来源,以指导遗传咨询及临床诊治方案的制定.
作者：刘楠；佟彤；陈悦；陈艳玲；蔡春泉 刊期： 2018年第01期
中华医学遗传学杂志
主管:中国科学技术协会
主办：中华医学会
