韩锐;段玲;武爽;刘翛然
目的 比较荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)与传统的染色体核型分析对于未进行CD138分选的多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患者进行检测的灵敏度及预后的价值.方法 回顾109例MM患者的临床资料,分析其初诊时常规核型分析与FISH检测的结果.结果 常规核型分析染色体异常的总体检出率为24.8%(27/109),FISH为51.2%(56/109).13号染色体缺失的FISH检出率为31.2%(34/109),常规核型分析为13.8%(15/109),FISH的灵敏度更高.17号染色体缺失的FISH检出率为7.3%(8/109),常规核型分析为5.5%(6/109),两者灵敏度相仿.高危核型(亚二倍体、13-/13q-、17-/17p-)及FISH阳性MM患者的中位生存期均明显偏短.结论 FISH检测及常规核型分析对于判断MM的预后具有较好的指导价值.FISH的总体检出率高于常规核型分析,且耗费时间短,但费用高,且只能检测特定范围的改变,而核型分析虽然检出率低,但可对所有染色体的数目和结构改变进行识别.两者联合使用不仅能提高MM患者染色体异常的检出率,还能够对其预后做出更准确的判断.
作者:姚颖;魏炜;王攀峰;徐云;颜霜;潘金兰;傅琤琤 刊期: 2018年第02期
目的 对1例发育迟缓伴多发畸形患儿进行遗传学检测,分析其预后及发生机制,为临床咨询提供依据.方法 采用常规G显带和微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)技术分析患儿及其父母的外周血染色体核型和DNA.结果 G显带分析结果显示,患儿染色体核型为46,XX,del(6)(q22),inv(6) (p21.1q21),其父母染色体核型未见异常.aCGH检测结果显示患儿6p21.1区存在800 kb杂合缺失,包含RUNX2基因,6q21-q22.31区存在11.79 Mb杂合缺失,其父母未检测到染色体微重复/微缺失.结论 患儿为染色体新发倒位,两处微缺失均为新发突变,具有致病性.6p21.1区域RUNX2基因微缺失导致锁骨颅骨发育不良,6q21-q22.31区域微缺失可能与患儿脑部结构发育异常相关.
作者:吴东;李涛;侯巧芳;霍晓东;王鑫;王涛;杨艳丽;刘红丽;廖世秀 刊期: 2018年第02期
目的 对1例以肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)为首发症状的遗传性出血性毛细血管扩张症(hereditary hemorrhagic telangiectasia,HHT)的患者及其家系进行基因检测.方法 采用芯片捕获ENG、ACVRL1和SMAD4三个基因全部外显子区域进行高通量测序法检测.结果 高通量测序检出先证者ACVRL1基因的1个致病突变c.814C>T(p.Gln272Ter,Het),其母亲及两儿子均同时携带该致病位点.结论 本病例及其家属ACVRL1基因突变位点为c.814C>T(p.Gln272Ter).对PH尤其是合并HHT者进行基因检测将有助于早期诊断和患病风险预测.
作者:杜旭芹;王旖然;叶俏 刊期: 2018年第02期
目的 分析无创产前筛查(noninvasive prenatal screening,NIPS)提示高风险孕妇的产前诊断结果,探讨二者的符合率.方法 对92例产前NIPS提示染色体数目异常高风险孕妇(其中包括21三体高风险62例、13三体高风险5例、18三体高风险12例、性染色体数目异常高风险11例、其他常染色体数目异常高风险3例)的羊水染色体进行核型分析.结果 羊水培养染色体核型分析发现染色体非整倍体57例,诊断符合率为62%.其中21三体诊断的符合率为69%(43/62).结论 NIPS诊断符合率不同于筛查检出率,高风险孕妇仍需通过产前诊断才能确诊胎儿染色体是否存在异常.
作者:胡祝明;朱海波;李琳琳;何晶;刘睿智;张红国 刊期: 2018年第02期
目的 对1例血清学产前筛查高风险的孕妇进行了胎儿羊水细胞的核型分析以及单核苷酸微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)分析,探讨SNP-array技术在染色体异常诊断方面的价值.方法 应用常规G显带法分析胎儿羊水细胞及其父母外周血白细胞的核型,并采用SNP-array对羊水细胞的基因组DNA进行高分辨率分析.结果 G显带核型分析显示胎儿核型为47,XX,+ mar,高分辨率SNP-array结果显示mar为等臂假双着丝粒psu idic(22) (q11.2),提示胎儿在22q11.1-q11.2区间存在1.7 Mb染色体的四倍性,涉及猫眼综合征(Cat eye syndrome,CES)的关键区域.结论 通过结合常规G显带方法和SNP-array技术,明确了1例罕见的染色体异常.高分辨率SNP-array技术能够提供更详细准确的信息,有助于判定异常染色体的来源.
作者:沈艳艳;孔辉;曾寰;吴琼;陈佳燕;周东兴;张剑;葛运生;丁凤 刊期: 2018年第02期
目的 明确2例疑似半乳糖血症患儿的分子遗传学病因.方法 应用新一代测序技术对患儿基因组进行外显子捕获检测,对患儿及其父母的突变位点进行Sanger测序验证;用SIFT、PolyPhen-2和MutationTaste软件对新突变进行致病性分析.结果 新一代测序检测结果显示例1携带GALT基因c.564G>C(p.Q188H)和c.116A>T(p.D39V)复合杂合突变;例2携带c.754C>T(p.Q252X)和c.904+1G>T复合杂合突变;Sanger测序验证结果显示2例患儿分别携带c.564G>C(p.Q188H)、c.116A>T(p.D39V)和c.754C>T(p.Q252X)、c.904+ 1G>T突变;例1父亲携带GALT基因c.564G>C杂合突变,母亲携带c.116A>T杂合突变,例2父亲携带c.754C>T杂合突变,母亲携带c.904+1G>T突变,因此患儿的突变分别遗传自父母.4个突变经检索HGMD均为未报道的新突变.结论 GALT基因的复合杂合突变可能是2例半乳糖血症患儿的发病原因.
作者:张海燕;陈栋;刘晨;刘兴锋;盖中涛;刘毅 刊期: 2018年第02期
家系1先证者,男,3个月,因表型异常、生长发育迟缓就诊.先证者为第1胎,顺产,出生体重2600 g.父亲26岁,母亲27岁,表型正常,无自然流产史,孕期无药物服用史,无毒物接触史,非近亲结婚,否认遗传病家族史.先证者染色体核型为46,XY,der(6)t(6;16)(16pter→ 16q22∷ 6p25→ 6qter) pat,见图1;先证者母亲染色体核型未见明显异常,父亲染色体核型为46,XY,t(6;16) (16pter→16q22∷ 6p25→6qter;16pter→16q22∷6p25→6pter),见图2.
作者:刘建生 刊期: 2018年第02期
目的 探讨1个汉族Wiskott-Aldrich综合征(Wiskott-Aldrich syndrome)家系WAS基因的突变情况.方法 PCR扩增WAS基因的外显子及外显子与内含子的连接区域,对PCR产物直接进行正、反向测序并与数据库进行比对,确定有无WAS基因突变以及突变的位点.测定家系成员B细胞活化因子(B-cell activating factor,BAFF)的水平.结果 家系中2例患者均携带WAS基因第2外显子c.257G>A的半合子突变,先证者的母亲为c.257G>A的杂合突变携带者,其他表型正常家系成员均未检测到该突变,经查阅人类基因突变数据库证实该突变为已知致病突变.家系中患者血清BAFF水平明显高于表型正常的成员.结论 WAS基因c.257G>A的突变可能是该Wiskott-Aldrich综合征家系的致病原因.
作者:时伟丽;侯巧芳;张卉;娄桂予;张玉薇;廖世秀 刊期: 2018年第02期
随着辅助生殖技术临床开展规模的日益扩大,以及细胞及分子遗传学诊断技术的快速发展,胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)和植入前遗传学筛查(preimplantation genetic screening,PGS)技术迎来了快速的增长和发展.为使该项技术更加规范且有效地实施,力求临床诊断的精准和出生子代的安全,经中国妇幼保健协会生育保健专业委员会、中国医师协会生殖医学专业委员会、中国医师协会医学遗传学分会、中国遗传学会遗传咨询分会和中国妇幼健康研究会生殖内分泌专业委员会专家讨论,结合国际发展动态和国内临床应用的实际情况,达成以下临床和实验室专家共识.
作者:《胚胎植入前遗传学诊断/筛查专家共识》编写组 刊期: 2018年第02期
目的 探讨细菌人工染色体微珠标记(BACs-on-Beads,BoBs)技术联合羊水细胞核型分析对宁波地区高危孕妇产前诊断临床应用的影响.方法 比较分析2779例高危孕妇的羊水细胞染色体G显带核型分析结果和BoBs检测结果.结果 对于常见染色体非整倍体(13、18、21、X和Y染色体),BoBs检测和染色体G显带核型分析的诊断符合率为98.78%;BoBs还检出未被核型分析发现的8例微重复;BoBs未检出核型分析中的17例染色体结构异常、10例嵌合体及1例三倍体.结论 BoBs技术作为新的分子遗传学产前诊断技术,其通量高、速度快以及可对9种微缺失综合征做出诊断,是传统核型分析很好的补充,提高了本地区产前诊断的水平.
作者:施丹华;张莉超;毛倩倩;周颖;徐玲玲;鲁莉萍;卢文波 刊期: 2018年第02期
目的 对一个家族性渗出性玻璃体视网膜病变家系进行致病基因的突变分析,为家系的遗传学咨询及产前诊断提供依据.方法 采集该家系成员临床信息及外周血,对先证者进行晶状体视网膜病变相关基因Panel PCR扩增,经高通量测序技术对扩增产物进行测序分析,经一代验证鉴定该家系基因突变位点并采集胎儿羊水DNA进行产前诊断.结果 检测出先证者存在两个杂合突变:LRP5基因c.1695dupC和ZNF408基因c.552-563del (--AGTGGTGACAGA--),证实均来源于其患病母亲.ZNF408基因c.552-563del为非移码突变,家系中未患病者存在该突变,考虑其为非致病突变.经检索ExAC外显子组整合数据库、dbSNP和人类基因突变数据库,LRP5基因c.1695dupC突变未见报道.产前诊断发现胎儿携带与先证者相同突变位点.结论 应用高通量及一代测序技术联合提高突变位点检出效率并能提供可靠的产前诊断.LRP5基因c.1695dupC为新发移码突变,该突变的报道增加了家族性渗出性玻璃体视网膜病变突变谱,为进一步理解、诊断该疾病提供遗传学基础.
作者:苏宁;秦利涛;王红丹;肖海;郭谦楠;李涛;廖世秀 刊期: 2018年第02期
目的 分析1个Chediak-Higashi综合征(Chediak-Higashi syndrome,CHS)家系中两例患儿的临床表型和基因突变之间的关系,探讨其发病机制.方法 对两例患儿的临床特征和辅助检查结果进行综合分析,并应用靶向捕获的高通量测序及一代测序技术对LYST基因进行突变分析.结果 两例患儿均有免疫缺陷,表现为呼吸道或消化道的反复感染,二者均表现出皮肤白化;骨髓细胞及血涂片检查两例患儿均出现粗大的嗜酸性包涵体颗粒;基因检测结果显示两例患儿的LYST基因均发生c.6077_6078insA(p.Tyr2026Terfs)的纯合突变.结论 基因检测在Chediak-Higashi综合征的诊断、治疗、预后等方面发挥重要的作用.
作者:赵建刚;王志;张李钰;孙宏利;杨颖 刊期: 2018年第02期
目的 明确3个有家族史的先天性白内障家系的致病基因及突变类型,为家系的遗传咨询及产前诊断提供依据.方法 应用外显子组结合目标区域捕获测序芯片对先证者进行突变基因及突变位点捕获,Sanger测序对家系成员进行验证.结果 家系1为多形性白内障,家系2为蓝点状白内障,家系3为珊瑚状白内障.3个家系的遗传方式均符合常染色体显性遗传.家系1患者均检测出CRYβB2基因c.463C>T(p.Q155X)无义突变,家系2患者均检测出CR YGD基因c.43C>T(p.R14C)错义突变,家系3患者均检测出CRYGD基因c.70C>A(p.P23T)错义突变;这些突变均表现为基因型与疾病共分离.结论 家系1、2和3的致病性突变分别为CR YβB2基因c.463C>T(p.Q155X)突变、CRYGD基因c.43C>T(p.R14C)突变和CRYGD基因c.70C>A(p.P23T)突变,本研究结果为家系的遗传咨询及产前诊断提供了依据.
作者:马成霞;郑广瑛;郝莉莉 刊期: 2018年第02期
目的 对1例维吾尔族火棉胶样患儿的TGM1基因进行突变分析,寻找其病因.方法 对患儿及其父母进行常规染色体G显带核型分析,应用芯片高通量测序方法对患儿进行鱼鳞病及鱼鳞病样皮肤病25个相关基因的检测.结果 染色体G显带核型分析结果显示患儿及父母核型均正常;芯片捕获高通量测序检测出患儿TGM1基因的c.919C>T(p.Arg307Trp)和c.856C>T(p.Arg286Trp)复合杂合突变;前者为已知致病突变,后者为临床意义未明突变.Sanger测序验证,患儿父亲携带TGM1基因c.856C>T(p.Arg286Trp)杂合突变,未检出患儿母亲TGM1基因c.919C>T、c.856C>T的位点突变.结论 TGM1基因c.919C>T和c.856C>T复合杂合突变可能是患儿的致病原因.
作者:韩锐;段玲;武爽;刘翛然 刊期: 2018年第02期
目的 探讨一个遗传性凝血因子Ⅴ (coagulation factor Ⅴ,FⅤ)缺陷症家系的表型特征及其分子致病机制.方法 在STAGO全自动血凝仪上检测先证者及家系成员(3代6名成员)凝血酶原时间(prothrombin time,PT)、活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)、纤维蛋白原(fibrinogen,FIB)、血浆凝血因子Ⅱ活性(coagulation factorⅡactivity,FⅡ∶C)、FⅤ活性(FⅤ activity,FV∶C)、凝血因子Ⅶ活性(coagulation factorⅦactivity,FⅦ∶C)和凝血因子Ⅹ活性(coagulation factor Ⅹactivity,FⅩ ∶C)活性;ELISA方法检测FⅤ抗原(FⅤ antigen,FⅤ∶Ag).采用DNA直接测序法分析先证者F5基因的全部外显子、侧翼序列、5'和3'端非翻译区及家系成员相应的突变位点区域,发现突变位点后用反向测序予以证实.采用ClustalX软件分析突变位点的保守性,同时用生物信息学预测软件(PROVEAN和MutationTaster)分析突变对蛋白质功能的影响,用Swiss-PdbViewer软件对突变位点进行蛋白模型和氨基酸相互作用分析.结果 先证者PT和APTT均稍延长,分别为15.2s和41.8 s,FⅤ∶C和FⅤ∶Ag降低,分别为55%和62%;其父亲和儿子FⅤ∶C和FⅤ∶Ag也均有不同程度下降(分别为60%、65%和31%、40%).先证者F5基因第6外显子上发现c.911G>A杂合突变,导致Gly276Glu;其父亲和儿子也为Gly276Glu杂合子;母亲、哥哥和丈夫为正常野生型.保守性分析结果表明,Gly276在同源物种间高度保守;两个生物信息学软件对该突变的预测结果一致:PROVEAN(评分-6.214分)结果预示为有害突变;MutationTaster(评分0.976分)结果预示可引起相应疾病;突变蛋白模型分析显示,在野生型蛋白质中,Gly276的主链与Ile298之间有两个氢键,当Gly276突变为Glu276后,原有的氢键没有改变,但由于Glu侧链延长,与周围氨基酸之间增加了空间位阻,导致蛋白质稳定性下降.结论 该先证者F5基因第6外显子存在c.911G>A杂合突变,导致Gly276Glu,此突变遗传自父亲,且与该家系FⅤ水平减低有关.
作者:田孟茶;夏虹;张志珊;金艳慧;苏看看;王明山 刊期: 2018年第02期
目的 探讨强直性肌营养不良1型(myotonic dystrophy type 1,DM1)的临床表现、肌电图以及基因学特点.方法 对3个家系拟诊为DM的先证者以及家系成员分析临床表型,进行肌电图、基因检测.结果 3例先证者均为慢性病程,临床症状以肌强直、肌无力、肌萎缩为主要表现,伴有眼部、心脏、内分泌、生殖和神经等多系统损害如白内障、心律失常、脱发、性功能减退、认知功能减退等.肌电图具有特征性肌强直放电和肌源性损害;基因检测结果提示3例先证者DMPK基因3'非翻译区CTG三核苷酸重复扩增异常.结论 DM1临床表型与其他疾病有重叠,结合临床症状、肌电图结果以及早期进行基因检测有助于提高DM1的检出率.
作者:黄宏燕;杨兴隆;徐严明 刊期: 2018年第02期
目的 明确2例先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)胎儿的基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的性质,探讨3q微缺失与CHD的关系.方法 提取CHD胎儿脐带组织的DNA,用全基因组低覆盖度测序检测其CNVs.结果 2例CHD胎儿均携带3q微缺失.病例1表现为室间隔缺损、唇腭裂,携带3q29区1.66 Mb的缺失,涉及3q29微缺失综合征的所有关键基因.病例2表现为主动脉骑跨、室间隔缺损,携带3q28区240 kb的缺失,未发现明确与该片段相关的致病信息.结论 3q29微缺失可能导致CHD、唇腭裂等多发畸形.全基因组低覆盖度测序可用于检测CNVs.
作者:龙伟;顾建东;欧阳俊;贾赛玉;张玢;刘建兵;虞斌 刊期: 2018年第02期
患儿男,因出生后反应差,吃奶量少,皮肤黄染3天入院.患儿系第2胎第1产,39+6剖宫产.有宫内窘迫史,出生时颜面青紫,呼吸表浅,哭声弱,反应差.经吸痰、输氧、拍打足底等抢救数分钟后全身转红.查体:患儿反应差,眼裂小,耳位低,上颚弓高尖.双手食指、中指屈曲畸形,全身皮肤重度黄染,四肢肌张力低.头颅CT示脑缺血缺氧改变;听力筛查双耳未通过,听性脑干反应报告左耳未通过,右耳通过.患儿母亲28岁,父母亲表型均无异常,非近亲婚配,否认家族遗传病史.
作者:乐萍;霍小春;黎文婷;张小珍 刊期: 2018年第02期
目的 分析2例分别表现为多发畸形和生长发育迟缓患儿的遗传学原因.方法 应用靶向基因测序技术对2例患儿的外周血基因组DNA进行高通量测序,用Ingenuity变异分析软件对测序结果进行分析,同时对检出的致病性变异位点进行Sanger测序验证.结果 高通量测序结果显示例1的CHD7基因的第36外显子存在c.7957C>T(p.Arg2653*)无义突变;例2的CHD7基因第2外显子存在c.718C>T (p.Gln240*)无义突变.Sanger测序结果验证了两例患儿CHD7基因的突变,患儿的父母均未检测到突变,患儿CHD7基因的突变均为新生突变(de novo).结论 CHD7基因突变是两例患儿的遗传学病因.
作者:李国强;李牛;胥雨菲;李娟;丁宇;沈亦平;王秀敏;王剑 刊期: 2018年第02期
先证者(图1,Ⅳ1)女,21岁,因双手掌和足底皮肤增厚、角化、皲裂多年前来咨询,查体见双手掌跖皮肤增厚,细小或片状脱屑,可见弥漫性黄色斑块,腕部掌侧皮肤明显增厚、隆起,呈胼胝体样,黄色,质硬,病损基本局限于掌跖部皮肤;双手指和指甲异常改变不明显;真菌检测阴性.病情冬天加重,皮肤干燥、皲裂,夏天减轻(图2).自述出生后不久双手掌及足底皮肤出现弥漫分布的红斑、鳞屑,逐年加重,至成年基本保持稳定,无水泡、糜烂、渗出等.局部皮肤干燥出现裂隙时自觉疼痛.皮损组织病理学检查可见表皮明显角化过度,棘层肥厚,真皮胶原纤维及网状层成纤维细胞轻度增生,排列不规则,未见明显炎性细胞浸润.先证者一般情况良好,智力正常,全身浅表淋巴结未触及增大,血、尿、粪常规、肝、肾功能等均正常,无其他组织器官病变.
作者:谢文美;王强;周凤娟;赵小荣;朱春燕 刊期: 2018年第02期