孙云;马定远;王彦云;杨冰;蒋涛
目的 分析不稳定异常血红蛋白Hb Rush及其合并地中海贫血病例的血液学表型和基因型特征.方法 对3例不明病因的贫血病例进行血液学常规检测和血红蛋白电泳,并检测a和β珠蛋白基因、Gγ启动子区-158 XmnⅠ多态性位点和7个β珠蛋白基因簇中限制性酶切多态位点的单倍型.结果 3例病例均具有小细胞低色素贫血表型,血红蛋白电泳HbF区域有定量值显著增高的异常条带(30.5%~59.2%),携带有不稳定血红蛋白Hb Rush突变(HBB CD101 GAG>CAG,Glu>Gln),其中2例还携带有-α3.7,CD17和Hb E地中海贫血突变;Hb Rush突变有不同的β珠蛋白基因簇单倍型;未发现F区异常血红蛋白电泳条带与Gγ启动子区多态和大片段β基因簇缺失的关联.结论 本研究结果证实了中国不同人群中存在Hb Rush突变,是世界范围内第3个病例报告.Hb Rush异常血红蛋白可导致Hb F区域电泳条带的定量值显著增高.单纯Hb Rush突变杂合子可产生小细胞低色素贫血及地中海贫血样临床症状,需进行产前诊断;对血红蛋白电泳Hb F区域条带定量值明显增高的贫血病例及地中海贫血进行诊治时需考虑对Hb Rush的基因诊断和鉴别诊断.
作者:葛世军;杨必清;易薇;黄铠;刘红仙;黄小琴;褚嘉祐;杨昭庆 刊期: 2017年第01期
患儿男,8个月,系第4胎第3产,足月低体重儿,出生时体重2.3 kg,有窒息史.患儿生长发育迟缓,体重不足4 kg,奶摄入量每次60mL.鼻梁宽,嘴小,下颚内收,双手大拇指异常,右手大拇指无指甲,左手大拇指指甲部分缺失.血及尿遗传代谢检查结果未发现异常,已死亡.细胞遗传学检查:常规外周血淋巴细胞培养72h、染色体制备、G显带分析,计数30个分裂相,镜下分析15个分裂相,患儿染色体核型为46,XY,-9,+der(9) t(4;9)(q21;p24) mat,见图1.
作者:郭智彬;易丽君;黎文婷;乐萍;陈卡;李垠娇;张晓珍;霍小春;张小康 刊期: 2017年第01期
患者女,26岁,因婚后流产3次,均于孕2个月左右自然流产,曾服用过多种保胎药,均治疗无效,前来我院就诊.身高162 cm,体重50 kg,表型和智力均未见异常,夫妇非近亲婚配,否认有毒药物和放射线接触史,否认遗传病家族史.丈夫身体健康,精液检查活力和形态正常.家系调查:其父母体健,有一姐姐,已生育2个正常女儿,表型正常,均拒绝做染色体检查.
作者:施建有;陈璐;童郁;杨君瑞;许锴 刊期: 2017年第01期
目的 探讨南方汉族人群KIR2DS4分子遗传多态性.方法 应用特异性PCR引物扩增306名无关个体KIR2DS4基因的全部外显子,确定KIR2DS4框架基因的有无.对存在KIR2DS4的样本,对该基因的全部外显子进行双向测序,用Assign 3.5分析软件鉴定基因型.在测序分型中出现与国际IPD-KIR数据库不完全匹配结果的样本,进行cDNA分子克隆和单倍型测序.结果 306名南方汉族无关个体中,携带KIR2DS4基因的个体为297例,经测序分型,均获得了清晰的序列峰图.共检出了7种等位基因,其中3个新等位基因被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名.检出的等位基因及其频率分别为KIR2DS4* 00101(78.8%)、*003 (10.5%)、*004 (16.0%)、*010 (23.2%)、*017(0.3%)、* 00105(0.3%)和*018(0.7%),未检出KIR2DS4* 007等位基因.能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 00101、*017、*00105)和不能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 003、*004、*010、*018)的检出比例分别为79.4%及50.4%,约为1.6∶1.结论 获得了南方汉族人群KIR2DS4等位基因分子遗传多态性,可为移植、疾病关联研究及人类进化等提供基础数据.
作者:甄建新;张国彬;喻琼;何柳媚;徐筠娉;邹红岩;邓志辉 刊期: 2017年第01期
目的 对1个琥珀酸半醛脱氢酶缺陷症家系进行ALDH5A1基因突变分析,为疾病的诊断及遗传咨询提供依据.方法 收集患者及其父母外周血,提取基因组DNA,应用PCR扩增产物直接测序法对致病基因ALDH5A1的11个外显子序列及其两侧内含子区域进行分析,以100名健康人为正常对照.结果 在患者的ALDH5A1基因上发现第2外显子c.398_399delAA以及第4外显子c.638G>T(p.R213L)复合杂合突变,家系成员检测证实其中c.398_399delAA突变来自母亲,而c.638G>T(p.R213L)突变来自父亲.100名健康对照未见上述突变.结论 c.398_399delAA和c.638G>T复合杂合突变是该家系患儿的致病原因,上述突变尚未见报道,丰富了琥珀酸半醛脱氢酶缺陷症致病基因ALDH5A1的突变谱.
作者:舒剑波;蔡凤英;范文轩;孟英韬;张春花;蔡春泉;张玉琴;林书祥 刊期: 2017年第01期
目的 探讨联合应用染色体G显带核型分析与多重连接依赖探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)在检测先天性心脏畸形胎儿的染色体异常中的应用价值.方法 应用染色体核型分析联合MLPA技术对104例中孕期B超提示先天性心脏畸形胎儿进行染色体数目和结构异常检测.对检出的染色体异常,进一步通过染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)予以验证.结果 染色体G显带核型分析与MLPA检测结果显示,在104例先天性心脏畸形胎儿羊水标本中,检出19例染色体异常,异常检出率为18%.93例心脏畸形胎儿的羊水标本进行CMA检测,共检出14例染色体异常,其中10例异常为已知的致病性拷贝数变异(copy number variation,CNV),4例为临床意义未明的CNV.10例致病性CNV羊水标本的MLPA检测结果也显示相同的染色体异常,4例临床意义未明CNV的羊水标本的MLPA检测结果仅1例检出异常.结论 染色体G显带核型分析联合MLPA技术是一种快速、经济、有效的检测先天性心脏畸形胎儿染色体异常的方法.
作者:刘洋;谢建生;耿茜;徐志勇;吴维青;罗福薇;李素丽;王勤;陈武斌 刊期: 2017年第01期
目的 对1例串联质谱技术新生儿筛查发现的可疑单纯性高甲硫氨酸血症患儿进行致病基因突变检测,为临床诊断和遗传咨询提供依据.方法 归纳整理1例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的临床资料,提取其基因组DNA,应用半导体测序技术进行高通量测序,对可疑突变用Sanger测序进行验证.结果 患儿除血甲硫氨酸升高外无其他临床症状.Ion Torrent半导体测序结果显示患儿携带MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变,二者均为未报道过的新突变,患儿父亲为c.345del A突变携带者,母亲为c.529 C>T突变携带者.结论 MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变可能为这例单纯型高甲硫氨酸血症患儿的致病原因,新一代半导体测序技术是遗传代谢病诊断的重要手段.
作者:孙云;马定远;王彦云;杨冰;蒋涛 刊期: 2017年第01期
目的 对一个中国多发性线粒体功能障碍综合征(multiple mitochondrial dysfunction syndrome,MMDS)家系进行致病基因突变分析.方法 应用二代测序(心血管病检测Panel)对1个MMDS家系中2例已故患儿的母亲进行候选基因NFU1的突变检测,发现可疑致病位点后,用PCR和Sanger测序对患儿的父亲进行突变筛查,初步确定该家系的可疑致病位点,在100名健康个体的NFU1基因序列进行突变验证分析.结果 患儿母亲携带NFU1基因c.90delC(p.Tyr30Ter)杂合突变,父亲携带NFU1基因c.572A>T(p.Asp191Val)杂合突变,在100名健康个体未检测到上述突变.结论 NFU1基因突变可能是该MMDS家系的致病原因,二代测序结合Sanger测序方法可以高效准确地对该病进行基因诊断.
作者:白莹;孔祥东 刊期: 2017年第01期
目的 拟利用体外克隆表达的GPⅢa蛋白作为HPA-1a抗原与Luminex xMAP微球相连,建立和评估用Luminex微球技术检测血清中抗HPA-1a的效果.方法 扩增并克隆GPⅢa蛋白的编码基因ITGB3至真核表达载体,转染中国仓鼠卵巢癌细胞株.利用G418筛选稳定表达细胞株,体外获取并鉴定相应的特异性膜糖蛋白GPⅢa.将重组蛋白通过表面游离氨基和Luminex xMAP微球表面激活的羧基相偶联,再利用偶联后的微球与待测血清反应.利用PE-抗人IgG进行显色,在Luminex-100仪上读取数据并判断结果.结果 ITGB3基因测序为HPA-1aa,将克隆后的GPⅢa重组蛋白偶联Luminex xMAP微球,Luminex微球法检测HPA 1a抗体的灵敏度为滴度1/32(抗体浓度3.125 U/mL).微球技术能特异性鉴别出待测样本的HPA-1a抗体,与MAIPA结果一致,而且与HLA抗体、ABO抗体以及其他HPA血小板系统抗体(HPA-3a、HPA-5b)均不发生交叉反应,说明建用立的Luminex微球技术来检测血小板抗体是可行的.结论 成功获取了重组表达的血小板膜蛋白GPⅢa,并初步建立了Luminex微球检测HPA-1a抗体方法.
作者:陶苏丹;刘瑛;和艳敏;应燕玲;何吉;朱发明 刊期: 2017年第01期
目的 研究中国南方汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、B、C、DRB1 、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等位基因的多态性.方法 采用聚合酶链式反应-测序分型方法(sequence based typing,SBT)对481名随机南方汉族个体的HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和D PB1基因进行序列分析,用直接计数法计算等位基因频率.结果 共观察到HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等位基因数分别为28、57、28、40、18、17、6和21个.其中频率高于0.05的常见等位基因有A* 1101、A* 2402、A* 0207、A* 8303和A*0201;B*40:01、B*46:01、B*58:01、B*13:01和B* 15:02;C* 01:02、C* 07:02、C* 03:04、C* 03:02、C* 08:01、C* 03:03和C* 04:01;DRB1* 09:01、DRB1* 15:01、DRB1* 12:02、DRB1* 08:03、DRB1* 03:01、DRB1* 04:05和DRB1* 11:01;DQA1* 01:02、DQA1* 03:02、DQA1* 03:03、DQA1* 06:01、DQA1* 01:03、DQA1* 05:05、DQA1* 01:04、DQA1*03:01和DQA1* 05:01;DQB1* 03:01、DQB1* 03:03、DQB1* 06:01、DQB1* 05:02、DQB1* 03:02、DQB1* 02:01和DQB1* 06:02;DPA1* 02:02、DPA1* 01:03和DPA1*02:01;DPB1* 05:01、DPB1* 02:01、DPB1* 13:01、DPB1* 04:01和DPB1* 02:02.这些常见等位基因的频率总和分别占相应位点的75.57%、52.81% 、78.28% 、62.16% 、86.70% 、77.23% 、95.32%和81.59%.结论 中国南方汉族人群的HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等8个位点的等位基因多态性数据可作为人类学、法医学、移植配型和疾病相关性研究和应用的参考数据.
作者:金士正;邹红岩;甄建新;王大明;何柳媚;邓志辉 刊期: 2017年第01期
目的 探讨羊水细胞异常核型发生的频率、类型与不同产前指征的关系.方法 对3827例孕妇胎儿羊水细胞进行染色体核型分析.结果 3827份羊水细胞中检出异常核型310例,异常检出率为8.1%,其中21三体99例,18三体26例,13三体5例,克氏综合征20例,超雌综合征6例,特纳综合征13例,平衡易位125例,正常多态16例.根据不同产前指征进行分组,高龄组异常率为6.0%,染色体异常儿分娩史组异常率为4.6%,B超示多发畸形组6.5%,本人或丈夫染色体异常组异常率为7.9%,羊水过多/过少组异常率为14.2%,家族性基因病遗传史组异常率为7.3%,无创/唐筛高危检测异常组异常率为13.1%.结论 羊膜穿刺术是一种较好检测胎儿染色体异常的方法,具备较高胎儿染色体异常的检出率,无创产前检查不能完全代替羊水细胞核型分析.
作者:马骞;赵军红;朱若男;武锦琳;孔祥东 刊期: 2017年第01期
目的 探讨生长停滞特异基因6(growth arrest specific gene 6,GAS6)多态性是否与重度子痫前期发病有关联.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法对成都地区167例重度子痫前期患者和312名健康孕妇GAS6基因834+ 7G/A和+1332C/T多态性进行分析.结果 GAS6基因+1332C/T位点C、T等位基因的频率在重度子痫前期组为85.63%、14.37%,在正常孕妇组为78.04%、21.96%.+1332C/T位点基因型和等位基因频率在重度子痫前期组和正常妊娠对照组之间差异具有统计学意义(均P<0.05),CT+TT基因型携带者在患者组的频率显著低于对照组(28.14% vs 39.42%),发生重度子痫前期的风险降低(OR=0.602,95%CI:0.401~0.904,x2=6.045,P=0.014).834+ 7G/A位点G、A等位基因的频率在重度子痫前期组为72.75%、27.25%,在正常孕妇组为74.36%、25.64%.两组之间基因型和等位基因频率差异无统计学意义(均P>0.05).此外,重度子痫前期组和正常妊娠对照组GAS6基因两位点基因型对血压水平未见显著影响.结论 中国成都地区汉族人GAS6基因+1332T等位基因与重度子痫前期发病的风险降低可能存在关联,但未见834+7G/A位点与重度子痫前期的发生有关.
作者:叶丽燕;关林波;范平;刘兴会;刘瑞;陈瑾歆;朱月;魏星;刘宇 刊期: 2017年第01期
目的 探讨产前诊断的一例罕见染色体异常的遗传学机制及预后.方法 对常规G显带核型分析发现的胎儿染色体可疑结构异常采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行鉴定,同时应用全基因组基因芯片(whole genome DNA microarray)检测其染色体拷贝数变异.结果 胎儿的一条21号染色体长臂疑似存在重复,即46,XX,dup(21)(? q21q22),专一序列探针FISH检测证实21号杂交区域存在重复,即nuc ish 21q22×3,基因芯片检测证实胎儿染色体21q21.3q22.3区存在17.87Mb的片段重复,涉及GATA1 、JAK2、ALL等121个OMIM基因,涵盖唐氏综合征关键区,与颅面异常、心脏异常、智力低下、发育迟缓、四肢异常等相关.此外,胎儿还存在4p16.1p16.3区8.43 Mb片段的缺失,涉及FGFR3、LETM1、WHSC1、WHSC2等64个OMIM基因,涵盖Wolf-Hirschhorn综合征疾病区域,与生长发育迟缓、头面部异常、心脏异常、智力低下、肌张力减退等相关.经咨询,其家属要求于孕25周时终止妊娠.结论 当核型分析无法确定染色体的结构异常时,应该用特定位点的探针进行FISH检测有利于鉴别异常的类型,结合全基因组基因芯片检测,可以分析染色体拷贝数变异及其所涉及的致病基因,为临床预后及表型分析提供线索.
作者:张璘;任梅宏;宋桂宁;刘雪霞;张静;张晓红 刊期: 2017年第01期
目的 提高对伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者的临床及遗传学特征的认识.方法 收集1例同时伴有PDGFRA和EVI1基因重排的髓系肿瘤患者的临床资料,应用常规细胞遗传学方法、荧光原位杂交技术和巢式PCR进行遗传学分析.结果 患者临床表现主要为反复皮疹、关节肿痛及间断发热,外周血白细胞计数明显升高、嗜酸细胞增多,体检示巨脾;骨髓病理示骨髓组织明显增生、嗜酸细胞明显增多;染色体核型分析显示患者染色体核型为46,XY,t(3;5) (q26;q15)[6]/46,XY[10];荧光原位杂交结果显示PDGFRA及EVI1基因重排均为阳性,巢式PCR证实FIP1 L1/PDGFRA阳性.患者经单药伊马替尼(200 mg/d)治疗后临床症状缓解.随访期实时定量PCR检测结果显示FIP1L1/PDGFRA转录本水平逐渐下降,并在治疗第10个月转为阴性,但EVI1表达水平与健康对照相比无明显差异且稳定不变.结论 同时伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者具有独特的临床及遗传学特征,分子遗传学检查有助于早期诊断,单药小剂量伊马替尼治疗有效.
作者:韩文敏;晁红颖;周民;岑岭;陈苏宁;何雪峰;卢绪章 刊期: 2017年第01期
目的 探讨多重连接依赖探针扩增(multiplex ligation dependent probe amplification,MLPA)技术在分析流产组织染色体异常中的应用,分析染色体异常与超声指标的相关性,对不明原因流产的遗传学因素进行评估.方法 收集421例自然流产、宫内死胎和用超声异常终止妊娠的样本,用MLPA的P036、P070试剂盒进行检测.结果 在421例流产样本中,MLPA提示异常者有232例,占55.11%.在孕13周前的286例样本中,有206例存在异常,比例高达72.03%,在孕14~19周的49例样本中,有14例检出异常,占28.57%.在孕20周及以后的86例样本中,有12例检出异常,占13.95%.在117例超声提示胎儿存在畸形或异常的样本中,有33例检测出异常,占28.21%.其中28例为染色体数目异常、4例为染色体微缺失和/或微重复、1例同时存在数目异常和微重复.在颈部超声异常、胎儿水肿综合征、多发畸形、消化系统异常组中,MLPA检测的阳性率分别为71.4%、58.8%、37.8%、9.1%.在心脏、神经、面部、骨骼和泌尿系统超声异常者中则未发现异常.结论 在自然流产中,染色体数目异常占主要因素.随着孕周的增大,染色体异常与流产的关系逐渐减弱.联合应用超声检查和MLPA检测,可以有效地提升染色体异常的检出率.
作者:赵颖;娄季武;孙曼娜;付有晴;刘彦慧 刊期: 2017年第01期
患者女,25岁,结婚2年,自然流产2次,均发生于孕45天左右,无明显不良诱因.常规检查夫妻双方生殖系统无明显异常,表型及智力均正常,为非近亲结婚,患者孕期无患病及服药史,无有害化学物质和放射线接触史,无不良嗜好,家族中其他成员无不良孕产史.其它检查未见异常.患者有一姐,已结婚生子,未见异常.
作者:郭红霞;平慧;田伟;李守霞;陈丁莉;冯丽娟;牛丽辉;陈艳红 刊期: 2017年第01期
目的 探讨中国南方汉族人群KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)的相关性.方法 对172份成年CML患者及480份随机正常对照的样本,采用PCR-SSP方法检测KIR基因,用测序分型法进行HLA-A、-B、-C基因分型.从KIR基因及其基因组合型、HLA Ⅰ类配体、已知的单个KIR+ HLA受-配体组合及KIR-HLA基因型组合等4个层次比较病例组与对照组分子遗传多态性的差异.结果 与KIR2DL1配位的HLA-C2、KIR2DL1+ HLA-C2、与KIR3DL1配位的HLA-B Bw4-80I的检出频率均显著低于正常对照组,为CML保护因素(HLA-C2:OR=0.386,95%CI:0.240~0.620,P<0.01;KIR2DL1-+ HLA-C2:OR=0.316,95%CI:0.191~0.525,P<0.01;HLA-B Bw4-80I:OR=0.576,95%CI:0.384~0.862,P<0.01).HLA-C2及HLA-B Bw4-80I分子表达机率降低,可能导致与相应的抑制性KIR亲和力的减弱,有利于NK细胞活化.值得注意的是:KIR-HLA基因型组合ID2(KIR AA1-HLA-C1/C1-Bw6/Bw6-A3/11)在CML组的检出频率显著高于正常对照组,为CML易感因素(OR=2.163,95%CI:1.198~3.906,P<0.01).结论 本研究识别了KIR-HLA与CML白血病相关的易感或保护性因素,可为CML白血病的发病机制和个体化免疫治疗提供新的线索及理论依据.
作者:邓志辉;甄建新;王大明;何柳媚;邹红岩 刊期: 2017年第01期
目的 对1例不明原因精神发育迟滞患儿及其家系进行遗传学分析,以明确诊断.方法 常规染色体核型分析患儿及其家系成员的外周血染色体,再以染色体微阵列检测微缺失/微重复,荧光原位杂交技术验证微阵列检测结果.结果 患儿与家系内同症患者表型一致,染色体核型结果相同,为46,XN,der(22) t(3;22) (q28;q13)pat;其父亲与5位亲属染色体核型为46,XN,t(3;22)(q28;q13),母亲及其他成员正常;患儿染色体微阵列分析示chr3q28q29区域发生9.0 Mb三拷贝重复,chr22q13.3区域发生1.7 Mb单拷贝缺失,荧光原位杂交技术验证了上述结果.结论 该患儿家系中同症患者的异常表型符合3q和22q非平衡易位导致的22q13.3缺失综合征和3q重复综合征,是由于亲代染色体平衡易位产生不正常配子遗传给下一代造成.
作者:张开慧;董睿;黄艳;杨亚丽;王莹;张海燕;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
目的 对一例智力发育落后、临床表型为女性的患儿进行细胞与分子遗传学分析,探讨其遗传学病因.方法 对患儿进行常规染色体G显带核型分析,并提取其外周血DNA,采用PCR扩增分析SRY基因的变异,并用定量PCR对SRY基因进行拷贝数检测.结果 核型分析显示患儿为47,XXY.SRY基因及拷贝数变异分析显示SRY基因呈大片段缺失,拷贝数为0.结论 患儿的女性表型是由于Y染色体上SRY基因的缺失所致,为国内首例SRY基因阴性、表型为女性的47,XXY病例.
作者:李洪英;张开慧;高敏;张海燕;王莹;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
目的 探讨1例因“生长发育迟缓伴小耳畸形”就诊的11岁男童的病因及临床特点.方法 收集患儿的临床资料并进行生化检测、染色体芯片分析(chromosomal microarray analysis,CMA)、下一代基因测序以及Sanger测序.结果 患儿存在宫内发育迟缓、出生后持续生长迟缓、小耳畸形、髌骨发育不良三联征以及特殊面容和正常促性腺激素性发育不良(小睾丸).基因检测发现其16号染色体为单亲二倍体且存在ORC6基因c.67A>G(p.Lys23Glu)纯合新突变.结论 患儿可能为中国首例男童16号染色体为单亲二倍体合并ORC6基因纯合新突变导致的Meier-Gorlin综合征,该ORC6基因新突变经Alamut功能软件预测可能影响蛋白结构域功能.
作者:李娟;丁宇;常国营;程青;李辛;王剑;王秀敏;沈亦平 刊期: 2017年第01期