学术投稿

一例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的MAT1A基因突变分析

孙云;马定远;王彦云;杨冰;蒋涛

关键词:单纯性高甲硫氨酸血症, MAT1A基因, Ion Torrent半导体测序
摘要:目的 对1例串联质谱技术新生儿筛查发现的可疑单纯性高甲硫氨酸血症患儿进行致病基因突变检测,为临床诊断和遗传咨询提供依据.方法 归纳整理1例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的临床资料,提取其基因组DNA,应用半导体测序技术进行高通量测序,对可疑突变用Sanger测序进行验证.结果 患儿除血甲硫氨酸升高外无其他临床症状.Ion Torrent半导体测序结果显示患儿携带MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变,二者均为未报道过的新突变,患儿父亲为c.345del A突变携带者,母亲为c.529 C>T突变携带者.结论 MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变可能为这例单纯型高甲硫氨酸血症患儿的致病原因,新一代半导体测序技术是遗传代谢病诊断的重要手段.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • 46,XX,t(5;18)(q15;q21.3)伴自然流产一例

    患者女,25岁,结婚2年,自然流产2次,均发生于孕45天左右,无明显不良诱因.常规检查夫妻双方生殖系统无明显异常,表型及智力均正常,为非近亲结婚,患者孕期无患病及服药史,无有害化学物质和放射线接触史,无不良嗜好,家族中其他成员无不良孕产史.其它检查未见异常.患者有一姐,已结婚生子,未见异常.

    作者:郭红霞;平慧;田伟;李守霞;陈丁莉;冯丽娟;牛丽辉;陈艳红 刊期: 2017年第01期

  • 母婴结局良好的胎盘间叶发育不良一例

    患者女,23岁,G1P0.因“停经35+5周,彩超发现宫腔内异常回声团5+月,阴道流液2小时”于2013年7月20日入院.停经12+6周当地医院超声检查发现胎盘显示不清,位于子宫后壁,厚约4.4 cm,实质内见多个泡状暗区并建议上级医院就诊.停经13周患者于我院就诊,超声检查提示:胎儿顶臀长7.46cm,胎儿颈部透明层值1.3 mm,羊水3.9cm,胎儿外形未见异常,核实孕周13+4周;宫腔内未探及正常胎盘回声,仅查见8.8cm×4.2 cm×7.6 cm蜂窝状团块回声,其内未探及明显血流信号,部分性葡萄胎不能排除.早期检查绒毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotropin,HCG) 101091.6 U/L,与孕龄相符,甲胎蛋白(alpha foetal protein,AFP)6.22 MOM,升高(参考值0.41~2.49),提示开放性神经管缺陷高风险,但患者拒绝进一步检查.因患者及家属对此次妊娠期望值较高,在被告知孕期有发生子痫前期、严重妊娠滋养细胞疾病、流产及胎儿开放性神经管缺陷等风险后仍选择继续妊娠.孕期定期复查彩超,蜂窝状团块持续增大.停经30周彩超发现其胎儿生长比实际孕周约小3周,蜂窝状团块增大至19.4 cm×7.3 cm×6.8cm.

    作者:张燕萍;周盛萍;何艳梅;王巍;龚云辉;周容 刊期: 2017年第01期

  • 遗传性视网膜病变致病基因及基因治疗的研究进展

    遗传性视网膜病变是临床常见且危害为严重的眼科遗传疾病,主要包括视网膜色素变性、Usher综合征、锥-杆细胞营养不良、Leber先天性黑朦、Leber遗传性视神经病变等.迄今已发现200多个致病基因,但科学家预测还有约50%致病基因未被发现.眼睛的独特生理结构和特征为精准治疗提供了可能.我们对近年来针对几类主要遗传性视网膜病变的致病基因和基因治疗的研究进展进行综述,为今后遗传性眼病研究与防治提供借鉴.

    作者:朱羚;曹聪;孙吉吉;高涛;梁晓阳;聂志鹏;冀延春;蒋萍萍;管敏鑫 刊期: 2017年第01期

  • 两例Miller-Dieker综合征胎儿的产前遗传学分析

    目的 对两例畸形胎儿进行细胞与分子遗传学研究,分析其基因型与表型的关系.方法 对两例产前超声提示异常的胎儿的羊水细胞及其双亲的外周血细胞进行G显带染色体核型分析、单核苷酸多态性微阵列检测(single nucleotide polymorphism array,SNP array)和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测,对SNP array的结果进行生物信息学分析.结果 两例胎儿的羊水染色体核型均为46,XY,其父母外周血核型均未见异常.病例1的SNP array结果为arr[hg19] 17p13.3(83 035~2 567 405)×1,即17p13.3区存在2.484 Mb的末端缺失;病例2的SNP array结果为arr[hg19] 17p13.3p13.2(83 035~3 377 560)×1,即17p13.3区存在3.295 Mb的末端缺失.17p13.3及17p13.3p13.2微缺失区均覆盖了Miller-Dieker综合征(Miller-Dieker syndrome,MDS)的关键区域,包含PAFA H1B1、YWHAE和CRK等MDS的候选致病基因.两例胎儿的羊水细胞中期分裂相FISH结果均提示17p13.3区缺失,验证了SNP array的结果,而胎儿父母外周血中期分裂相FISH结果均未见异常,可排除其父母存在涉及17pter区的微小重排.结论 MDS胎儿的超声特征主要为中枢神经系统畸形.SNP array分析可以有效地诊断MDS并明确17p13.3缺失的断裂点和基因内容,有助于对其基因型与表型对应关系的分析.

    作者:林少宾;罗艳敏;吴坚柱;陈宝江;纪媛君;周祎 刊期: 2017年第01期

  • 一个多发性线粒体功能障碍综合征家系的NFU1基因突变分析

    目的 对一个中国多发性线粒体功能障碍综合征(multiple mitochondrial dysfunction syndrome,MMDS)家系进行致病基因突变分析.方法 应用二代测序(心血管病检测Panel)对1个MMDS家系中2例已故患儿的母亲进行候选基因NFU1的突变检测,发现可疑致病位点后,用PCR和Sanger测序对患儿的父亲进行突变筛查,初步确定该家系的可疑致病位点,在100名健康个体的NFU1基因序列进行突变验证分析.结果 患儿母亲携带NFU1基因c.90delC(p.Tyr30Ter)杂合突变,父亲携带NFU1基因c.572A>T(p.Asp191Val)杂合突变,在100名健康个体未检测到上述突变.结论 NFU1基因突变可能是该MMDS家系的致病原因,二代测序结合Sanger测序方法可以高效准确地对该病进行基因诊断.

    作者:白莹;孔祥东 刊期: 2017年第01期

  • 用新一代外显子捕获测序技术诊断眼皮肤白化病Ⅲ型一例

    目的 对一例疑为眼皮肤白化病的患儿进行临床和遗传学分析.方法 对患儿进行临床检查,提取患儿及其父母基因组DNA,采用新一代外显子目标区域捕获测序技术对患儿进行基因突变分析,并对疑似致病性突变进行患儿及其父母的Sanger测序验证及生物信息学预测.结果 患儿歪头视物,视力低下,伴有双眼水平冲动型眼球震颤,毛发棕黄色.基因测序显示患儿TYRP1基因存在c.1214C>A(p.T405N)和c.1333dupG杂合突变,分别遗传白其母亲和父亲.生物信息学预测为致病性突变.结论 患儿为TYRP1基因复合杂合突变引起的眼皮肤白化病Ⅲ型,TYRP1复合杂合突变致病的病例尚未见报道.

    作者:律玉强;黄静;张开慧;刘国华;高敏;盖中涛;刘毅 刊期: 2017年第01期

  • 产前诊断一例46,XX,del(4),dup(21)

    目的 探讨产前诊断的一例罕见染色体异常的遗传学机制及预后.方法 对常规G显带核型分析发现的胎儿染色体可疑结构异常采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行鉴定,同时应用全基因组基因芯片(whole genome DNA microarray)检测其染色体拷贝数变异.结果 胎儿的一条21号染色体长臂疑似存在重复,即46,XX,dup(21)(? q21q22),专一序列探针FISH检测证实21号杂交区域存在重复,即nuc ish 21q22×3,基因芯片检测证实胎儿染色体21q21.3q22.3区存在17.87Mb的片段重复,涉及GATA1 、JAK2、ALL等121个OMIM基因,涵盖唐氏综合征关键区,与颅面异常、心脏异常、智力低下、发育迟缓、四肢异常等相关.此外,胎儿还存在4p16.1p16.3区8.43 Mb片段的缺失,涉及FGFR3、LETM1、WHSC1、WHSC2等64个OMIM基因,涵盖Wolf-Hirschhorn综合征疾病区域,与生长发育迟缓、头面部异常、心脏异常、智力低下、肌张力减退等相关.经咨询,其家属要求于孕25周时终止妊娠.结论 当核型分析无法确定染色体的结构异常时,应该用特定位点的探针进行FISH检测有利于鉴别异常的类型,结合全基因组基因芯片检测,可以分析染色体拷贝数变异及其所涉及的致病基因,为临床预后及表型分析提供线索.

    作者:张璘;任梅宏;宋桂宁;刘雪霞;张静;张晓红 刊期: 2017年第01期

  • 46,XX,t(3;6;10)复杂易位伴习惯性流产一例

    患者女,26岁,因婚后流产3次,均于孕2个月左右自然流产,曾服用过多种保胎药,均治疗无效,前来我院就诊.身高162 cm,体重50 kg,表型和智力均未见异常,夫妇非近亲婚配,否认有毒药物和放射线接触史,否认遗传病家族史.丈夫身体健康,精液检查活力和形态正常.家系调查:其父母体健,有一姐姐,已生育2个正常女儿,表型正常,均拒绝做染色体检查.

    作者:施建有;陈璐;童郁;杨君瑞;许锴 刊期: 2017年第01期

  • 八例原发性肉碱缺乏症SLC22A5基因突变分析

    目的 分析8例原发性肉碱缺乏症(systemic primary carnitine deficiency,CDSP)患者的SLC22A5基因突变情况.方法 采用串联质谱技术对泉州地区77 511例样本进行遗传代谢病筛查,发现8例原发性肉碱缺乏症患者(其中有1例为母源性CDSP),应用MassArray技术结合Sanger测序法对CDSP患者SLC22A5基因突变位点进行检测,寻找可能的致病突变位点.对发现的新变异采用SIFT和PolyPhen-2进行蛋白功能预测.结果 8例患者均检测到SLC22A5基因突变,其中7例为复合杂合突变,1例为纯合突变.共发现6种突变类型,包括1种无义突变[c.760C>T(p.R254X)]和5种错义突变[c.51C>G(p.F17L)、c.250T>A(p.Y84N)、c.1195C>T(p.R399W)、c.1196G>A(p.R399Q)、c.1400C>G(p.S467C)].其中,c.250T>A(p.Y84N)为SLC22A5基因新变异,新变异可能影响蛋白质的结构和功能.c.760C>T(p.R254X)突变频率高,c.1400C>G(p.S467C)突变频率次之.结论 本研究分析了8例原发性肉碱缺乏症患者的SLC22A5基因突变情况,从基因水平上证实了8例CDSP的诊断,发现了1个新的突变位点,丰富了SLC22A5基因的突变谱.

    作者:林壹明;林卫华;余科;郑发明;郑珍珠;傅清流 刊期: 2017年第01期

  • 46,XY,-9,+der(9)t(4;9)(q21;p24)mat一例

    患儿男,8个月,系第4胎第3产,足月低体重儿,出生时体重2.3 kg,有窒息史.患儿生长发育迟缓,体重不足4 kg,奶摄入量每次60mL.鼻梁宽,嘴小,下颚内收,双手大拇指异常,右手大拇指无指甲,左手大拇指指甲部分缺失.血及尿遗传代谢检查结果未发现异常,已死亡.细胞遗传学检查:常规外周血淋巴细胞培养72h、染色体制备、G显带分析,计数30个分裂相,镜下分析15个分裂相,患儿染色体核型为46,XY,-9,+der(9) t(4;9)(q21;p24) mat,见图1.

    作者:郭智彬;易丽君;黎文婷;乐萍;陈卡;李垠娇;张晓珍;霍小春;张小康 刊期: 2017年第01期

  • 伴t(2;14)(p16;q32)染色体易位的急性早幼粒细胞白血病一例

    患者男,59岁,因“牙龈出血10余天”且症状逐渐加重,于2015年2月10日收入我院治疗.患者入院时有头晕不适,鼻衄,痔疮出血.查体:浅表淋巴结不大,肝脾未及,静脉注射处有陈旧瘀斑.入院血常规示:白细胞3.99×109/L[正常参考值:(3.5~9.5)×109/L],中性粒细胞32.8%(正常参考值:40%~75%),淋巴细胞48.9%(正常参考值:20%~50%),单核细胞18.3%(正常参考值:3%~10%),血红蛋白:63 g/L(正常参考值:130~175 g/L),血小板计数:20×109/L[正常参考值:(125~350)×109/L];骨髓涂片显示:异常早幼粒细胞85%,胞质量丰富,呈淡蓝色,胞质中有粗大,细小,紫红色颗粒,可见成束状Auer小体.

    作者:刘芸;范磊;洪鸣;吴汉新;李建勇 刊期: 2017年第01期

  • 冷“休克”同步化羊水细胞传代培养在产前诊断中的应用

    目的 探讨冷“休克”同步化羊水细胞传代培养在产前诊断中的应用.方法 实验组将原代培养至7天时置换出的旧培养基放置于4℃冰箱冷“休克”15天后,分离其内的M期细胞加入适量新培养基传代培养;对照组直接将原代培养至第7天时置换出的旧培养基离心,收集其内的M期细胞加入适量新培养基传代培养,不做冷“休克”处理.采用流式细胞术检测实验组和对照组活细胞、早期凋亡细胞及晚期凋亡细胞和死细胞的百分比;染色体G显带技术进行实验组和对照组的染色体核型分析,观察实验组染色体核型是否存在畸变.结果 实验组收获的活细胞数(21.65±2.58)与对照组(34.80±2.02)比较差异有统计学意义(t=31.127,P<0.01),实验组收获的早期凋亡细胞数(26.08±2.09)与对照组(23.79±2.31)比较差异有统计学意义(t=5.683,P<0.01),实验组收获的晚期凋亡细胞及死细胞数(13.63±0.68)与对照组(12.95±0.69)比较差异有统计学意义(t=5.384,P<0.01);实验组染色体核型与对照组一致,均未见染色体发生畸变.结论 将原代培养至7天时置换出的旧培养基放置于4℃冰箱15天后,分离其内的M期细胞继续传代培养,仍能获得一定数量的可分析分裂相,且染色体未见畸变,诊断结果可靠,应用该方法可确保一次性穿刺即可确保羊水细胞培养成功并得出终的产前诊断.

    作者:谢金芳;薛万华;纪霞;王燕;蔡富强;孙兆亮;王立;李美芹;黄艳丽 刊期: 2017年第01期

  • 一例罕见的47,XXY综合征女性的遗传学病因分析

    目的 对一例智力发育落后、临床表型为女性的患儿进行细胞与分子遗传学分析,探讨其遗传学病因.方法 对患儿进行常规染色体G显带核型分析,并提取其外周血DNA,采用PCR扩增分析SRY基因的变异,并用定量PCR对SRY基因进行拷贝数检测.结果 核型分析显示患儿为47,XXY.SRY基因及拷贝数变异分析显示SRY基因呈大片段缺失,拷贝数为0.结论 患儿的女性表型是由于Y染色体上SRY基因的缺失所致,为国内首例SRY基因阴性、表型为女性的47,XXY病例.

    作者:李洪英;张开慧;高敏;张海燕;王莹;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期

  • 中国南方汉族人群KIR2DS4基因的多态性

    目的 探讨南方汉族人群KIR2DS4分子遗传多态性.方法 应用特异性PCR引物扩增306名无关个体KIR2DS4基因的全部外显子,确定KIR2DS4框架基因的有无.对存在KIR2DS4的样本,对该基因的全部外显子进行双向测序,用Assign 3.5分析软件鉴定基因型.在测序分型中出现与国际IPD-KIR数据库不完全匹配结果的样本,进行cDNA分子克隆和单倍型测序.结果 306名南方汉族无关个体中,携带KIR2DS4基因的个体为297例,经测序分型,均获得了清晰的序列峰图.共检出了7种等位基因,其中3个新等位基因被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名.检出的等位基因及其频率分别为KIR2DS4* 00101(78.8%)、*003 (10.5%)、*004 (16.0%)、*010 (23.2%)、*017(0.3%)、* 00105(0.3%)和*018(0.7%),未检出KIR2DS4* 007等位基因.能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 00101、*017、*00105)和不能正常表达于细胞表面的等位基因(KIR2DS4* 003、*004、*010、*018)的检出比例分别为79.4%及50.4%,约为1.6∶1.结论 获得了南方汉族人群KIR2DS4等位基因分子遗传多态性,可为移植、疾病关联研究及人类进化等提供基础数据.

    作者:甄建新;张国彬;喻琼;何柳媚;徐筠娉;邹红岩;邓志辉 刊期: 2017年第01期

  • 等臂双着丝粒Ph染色体在慢性粒细胞白血病急淋变中的遗传学分析

    目的 研究等臂双着丝粒Ph染色体在慢性粒细胞白血病急淋变(lymphoid blast crisis of chronic myeloid leukemia,CML-BLC)中的遗传学及临床特征.方法 对2例CML-BLC患者采用24 h骨髓培养法制备染色体标本,R显带核型分析,单核苷酸多态性分析(single nucleotide polymorphism,SNP)基因拷贝数变化.用荧光原位杂交(florescence in situ hybridization,FISH)技术验证SNP结果.用多重连接依赖探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplication,MLPA)检测急性淋巴细胞白血病相关基因如CDKN2A/2B和PAX5等的缺失或扩增.结果 SNP证实例1的衍生9号有缺失及扩增,与FISH结果相符合.例1和例2的FISH分析可见BCR/ABL融合信号在等臂Ph染色体上,距离远近不同,排列方式为脚对脚(例2)和头对头(例1).结论 CML-BLC中等臂双Ph染色体预示对格列卫治疗抵抗,而用达沙替尼治疗有效.

    作者:李倩;林晓骥;林颖;姚荣欣;黄武;梅翰冬;宫剑;陈慧;藤宁燕 刊期: 2017年第01期

  • 一个t(3;22)不平衡易位导致精神发育迟滞家系的临床及遗传学分析

    目的 对1例不明原因精神发育迟滞患儿及其家系进行遗传学分析,以明确诊断.方法 常规染色体核型分析患儿及其家系成员的外周血染色体,再以染色体微阵列检测微缺失/微重复,荧光原位杂交技术验证微阵列检测结果.结果 患儿与家系内同症患者表型一致,染色体核型结果相同,为46,XN,der(22) t(3;22) (q28;q13)pat;其父亲与5位亲属染色体核型为46,XN,t(3;22)(q28;q13),母亲及其他成员正常;患儿染色体微阵列分析示chr3q28q29区域发生9.0 Mb三拷贝重复,chr22q13.3区域发生1.7 Mb单拷贝缺失,荧光原位杂交技术验证了上述结果.结论 该患儿家系中同症患者的异常表型符合3q和22q非平衡易位导致的22q13.3缺失综合征和3q重复综合征,是由于亲代染色体平衡易位产生不正常配子遗传给下一代造成.

    作者:张开慧;董睿;黄艳;杨亚丽;王莹;张海燕;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期

  • 假双着丝粒染色体九例

    例1女,17岁,因原发闭经就诊.患者系第2胎,足月顺产,出生时父亲29岁,母亲26岁,母亲孕期无患病及服药史,无先兆流产史,父母为非近亲婚配,否认家族遗传病史.查体:身高158 cm,智力一般,无颈蹼,轻度肘外翻,双侧乳房未发育,乳间距宽,腋毛稀少.外阴发育幼稚,阴毛稀少,肛门检查子宫及双附件均未扪及.辅助检查:B超检查:无子宫,未探及双侧卵巢.细胞遗传学检查:采用常规方法进行外周血淋巴细胞培养,标本分别用胰酶消化和氢氧化钡处理进行G显带与C显带,按照人类细胞遗传学国际命名体制(ISCN2009)标准进行核型分析.C显带证实一个着丝粒失活,故患者核型为46,X,psuidic(X)(pter→q24∷q24→ pter)36]/45,X[6](图1A).其父母核型正常.

    作者:薛会丽;李英;安刚;范向群;郭南;扶梅妹;何淑琼;张敏;徐两蒲 刊期: 2017年第01期

  • 46,XY,t(9;10)(q34;q11.2)一例

    患者男,31岁.其妻第1次怀孕2+月出现阴道流血,B超示无胎心,胚胎停止发育,手术流产;间隔1年余第2次怀孕,孕50+天可见3个孕囊,绒毛膜促性腺激素水平较低,再次手术流产,孕期无毒物接触史.细胞遗传学检查:在征得知情同意后抽取患者静脉血2mL,肝素抗凝,37℃条件下行淋巴细胞培养72 h,常规G显带,计数20个中期分裂相,分析5个,患者核型为46,XY,t(9;10)(9pter-9q34∷10q11.2→10qter;10pter-10q11.2∷9q34→9qter),见图1.其妻染色体检查未见异常.拒绝家系调查.

    作者:张春晓;蓝信强 刊期: 2017年第01期

  • 96例生长发育迟缓儿童的染色体核型分析

    目的 探讨染色体异常与生长发育迟缓的关系.方法 采集96例生长发育迟缓儿童的外周血样,进行常规染色体核型分析.结果 在96例患者中,共发现异常核型27例,检出率为28.13%,其中常染色体异常23例,检出率为23.96%,包括21三体、7号部分缺失、5p一等,发现性染色体异常4例,检出率为4.17%,主要为45,X及其嵌合体.在体格发育迟缓患者中,异常核型检出率为27.27%(18/66),其中单纯性体格发育迟缓患者异常核型检出率为18.92%(7/37).在体格发育迟缓合并其他异常患者中,异常核型检出率为37.93%(11/29).在智力障碍患者中,异常核型检出率为28.26%(13/46),其中单纯性智力障碍患者异常核型检出率为16.67%(4/24).智力障碍合并其他异常患者异常核型检出率为40.91%(9/22).结论 生长发育迟缓儿童的染色体异常率高,在合并特殊面容和先天性心脏病时异常率更高.对生长发育迟缓儿童行染色体核型分析将有助于明确其病因并采取相应的治疗措施.

    作者:吴坚柱;周祎;黄林环;陈宝江;陈健生;陈筠虹 刊期: 2017年第01期

  • 用体外表达的血小板膜蛋白GPⅢa偶联Luminex微球检测HPA-1a抗体

    目的 拟利用体外克隆表达的GPⅢa蛋白作为HPA-1a抗原与Luminex xMAP微球相连,建立和评估用Luminex微球技术检测血清中抗HPA-1a的效果.方法 扩增并克隆GPⅢa蛋白的编码基因ITGB3至真核表达载体,转染中国仓鼠卵巢癌细胞株.利用G418筛选稳定表达细胞株,体外获取并鉴定相应的特异性膜糖蛋白GPⅢa.将重组蛋白通过表面游离氨基和Luminex xMAP微球表面激活的羧基相偶联,再利用偶联后的微球与待测血清反应.利用PE-抗人IgG进行显色,在Luminex-100仪上读取数据并判断结果.结果 ITGB3基因测序为HPA-1aa,将克隆后的GPⅢa重组蛋白偶联Luminex xMAP微球,Luminex微球法检测HPA 1a抗体的灵敏度为滴度1/32(抗体浓度3.125 U/mL).微球技术能特异性鉴别出待测样本的HPA-1a抗体,与MAIPA结果一致,而且与HLA抗体、ABO抗体以及其他HPA血小板系统抗体(HPA-3a、HPA-5b)均不发生交叉反应,说明建用立的Luminex微球技术来检测血小板抗体是可行的.结论 成功获取了重组表达的血小板膜蛋白GPⅢa,并初步建立了Luminex微球检测HPA-1a抗体方法.

    作者:陶苏丹;刘瑛;和艳敏;应燕玲;何吉;朱发明 刊期: 2017年第01期

中华医学遗传学杂志

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主管:中国科学技术协会

主办:中华医学会