马骞;赵军红;朱若男;武锦琳;孔祥东
目的 分析不稳定异常血红蛋白Hb Rush及其合并地中海贫血病例的血液学表型和基因型特征.方法 对3例不明病因的贫血病例进行血液学常规检测和血红蛋白电泳,并检测a和β珠蛋白基因、Gγ启动子区-158 XmnⅠ多态性位点和7个β珠蛋白基因簇中限制性酶切多态位点的单倍型.结果 3例病例均具有小细胞低色素贫血表型,血红蛋白电泳HbF区域有定量值显著增高的异常条带(30.5%~59.2%),携带有不稳定血红蛋白Hb Rush突变(HBB CD101 GAG>CAG,Glu>Gln),其中2例还携带有-α3.7,CD17和Hb E地中海贫血突变;Hb Rush突变有不同的β珠蛋白基因簇单倍型;未发现F区异常血红蛋白电泳条带与Gγ启动子区多态和大片段β基因簇缺失的关联.结论 本研究结果证实了中国不同人群中存在Hb Rush突变,是世界范围内第3个病例报告.Hb Rush异常血红蛋白可导致Hb F区域电泳条带的定量值显著增高.单纯Hb Rush突变杂合子可产生小细胞低色素贫血及地中海贫血样临床症状,需进行产前诊断;对血红蛋白电泳Hb F区域条带定量值明显增高的贫血病例及地中海贫血进行诊治时需考虑对Hb Rush的基因诊断和鉴别诊断.
作者:葛世军;杨必清;易薇;黄铠;刘红仙;黄小琴;褚嘉祐;杨昭庆 刊期: 2017年第01期
目的 分析8例原发性肉碱缺乏症(systemic primary carnitine deficiency,CDSP)患者的SLC22A5基因突变情况.方法 采用串联质谱技术对泉州地区77 511例样本进行遗传代谢病筛查,发现8例原发性肉碱缺乏症患者(其中有1例为母源性CDSP),应用MassArray技术结合Sanger测序法对CDSP患者SLC22A5基因突变位点进行检测,寻找可能的致病突变位点.对发现的新变异采用SIFT和PolyPhen-2进行蛋白功能预测.结果 8例患者均检测到SLC22A5基因突变,其中7例为复合杂合突变,1例为纯合突变.共发现6种突变类型,包括1种无义突变[c.760C>T(p.R254X)]和5种错义突变[c.51C>G(p.F17L)、c.250T>A(p.Y84N)、c.1195C>T(p.R399W)、c.1196G>A(p.R399Q)、c.1400C>G(p.S467C)].其中,c.250T>A(p.Y84N)为SLC22A5基因新变异,新变异可能影响蛋白质的结构和功能.c.760C>T(p.R254X)突变频率高,c.1400C>G(p.S467C)突变频率次之.结论 本研究分析了8例原发性肉碱缺乏症患者的SLC22A5基因突变情况,从基因水平上证实了8例CDSP的诊断,发现了1个新的突变位点,丰富了SLC22A5基因的突变谱.
作者:林壹明;林卫华;余科;郑发明;郑珍珠;傅清流 刊期: 2017年第01期
目的 对一个中国多发性线粒体功能障碍综合征(multiple mitochondrial dysfunction syndrome,MMDS)家系进行致病基因突变分析.方法 应用二代测序(心血管病检测Panel)对1个MMDS家系中2例已故患儿的母亲进行候选基因NFU1的突变检测,发现可疑致病位点后,用PCR和Sanger测序对患儿的父亲进行突变筛查,初步确定该家系的可疑致病位点,在100名健康个体的NFU1基因序列进行突变验证分析.结果 患儿母亲携带NFU1基因c.90delC(p.Tyr30Ter)杂合突变,父亲携带NFU1基因c.572A>T(p.Asp191Val)杂合突变,在100名健康个体未检测到上述突变.结论 NFU1基因突变可能是该MMDS家系的致病原因,二代测序结合Sanger测序方法可以高效准确地对该病进行基因诊断.
作者:白莹;孔祥东 刊期: 2017年第01期
目的 对两个遗传性蛋白C(protein C,PC)缺陷症家系进行临床表型和基因突变检测,建立蛋白模型,探讨其分子发病机制.方法 分别应用发色底物法和酶联免疫吸附法检测两个家系先证者和家系成员的血浆蛋白C活性(protein C activity,PC∶A)和蛋白C抗原(protein C antigen,PC∶Ag).用PCR法对先证者蛋白C(protein C,PROC)基因9个外显子及侧翼序列进行扩增,PCR产物纯化后用Sanger测序法进行基因突变检测;对家系其他成员相应基因突变位点进行扩增和测序.用生物信息学软件PolyPhen-2预测突变位点的危害程度;用Clustal X软件分析突变位点的保守性;用Swiss-PdbViewer软件对突变基因进行蛋白模型和氨基酸相互作用分析.结果 家系1先证者PC∶A为30%,PC∶Ag为35%,其父亲、母亲及姑姑的PC.∶A均略低于正常参考值范围;先证者的PROC第7外显子存在c.565 C>T杂合错义突变(p.Arg147Trp),并在第5外显子存在c.383 G>A杂合错义突变(p.Gly86Asp);其父亲和姑姑均携带c.565 C>T杂合突变,母亲携带c.383 G>A杂合突变.家系2先证者和儿子的PC∶A分别为50%、64%;测序结果显示两人的PROC第7外显子均存在c.565 C>T杂合突变.生物信息学软件PolyPhen-2分析显示p.Arg147Trp为良性突变,p.Gly86Asp为有害突变.Clustal X分析显示p.Arg147Trp在同源物种间不保守,而p.Gly86Asp则高度保守.突变蛋白模型分析显示p.Arg147Trp突变产生的Trp147芳香环破坏了Arg147和Lys146、Lys151的两个氢键,并与Arg178之间产生分子碰撞.p.Gly86Asp突变后Asp86侧链延长,和Gln90侧链之间产生分子碰撞力.基因突变导致的氢键破坏和碰撞作用改变了氨基酸的空间构型,使突变蛋白稳定性下降或分泌障碍.结论 两个家系先证者均为遗传性PC缺陷症,杂合突变p.Arg147Trp和p.Gly86Asp是导致患者PC活性下降的主要原因.其中p.Gly86Asp为未报道过的新突变.
作者:杨丽红;金艳慧;杨婷;程晓丽;朱丽青;王明山 刊期: 2017年第01期
患者女,25岁,结婚2年,自然流产2次,均发生于孕45天左右,无明显不良诱因.常规检查夫妻双方生殖系统无明显异常,表型及智力均正常,为非近亲结婚,患者孕期无患病及服药史,无有害化学物质和放射线接触史,无不良嗜好,家族中其他成员无不良孕产史.其它检查未见异常.患者有一姐,已结婚生子,未见异常.
作者:郭红霞;平慧;田伟;李守霞;陈丁莉;冯丽娟;牛丽辉;陈艳红 刊期: 2017年第01期
目的 调查福建厦门地区汉族群体15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座多态性参数,同时评估AmpFLSTR IdentifilerTM体系应用于本地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值.方法 应用AmpFLSTR IdentifilerTM体系荧光标记复合扩增系统,检测400名福建厦门地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数.结果 15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05).15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度0.580~0.868,匹配概率0.036~0.148,个体识别力0.798~0.967,多态性信息含量0.560~0.850,非父排除率0.268~0.730.结论 15个STR基因座在福建厦门地区有较高的多态性.通过检测等位基因频率,为福建厦门地区人群法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性提供了客观依据.
作者:吴莉莉;冉鹏;郑秀娟;周娟娟;裴斌;宋秀宇 刊期: 2017年第01期
目的 提高对伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者的临床及遗传学特征的认识.方法 收集1例同时伴有PDGFRA和EVI1基因重排的髓系肿瘤患者的临床资料,应用常规细胞遗传学方法、荧光原位杂交技术和巢式PCR进行遗传学分析.结果 患者临床表现主要为反复皮疹、关节肿痛及间断发热,外周血白细胞计数明显升高、嗜酸细胞增多,体检示巨脾;骨髓病理示骨髓组织明显增生、嗜酸细胞明显增多;染色体核型分析显示患者染色体核型为46,XY,t(3;5) (q26;q15)[6]/46,XY[10];荧光原位杂交结果显示PDGFRA及EVI1基因重排均为阳性,巢式PCR证实FIP1 L1/PDGFRA阳性.患者经单药伊马替尼(200 mg/d)治疗后临床症状缓解.随访期实时定量PCR检测结果显示FIP1L1/PDGFRA转录本水平逐渐下降,并在治疗第10个月转为阴性,但EVI1表达水平与健康对照相比无明显差异且稳定不变.结论 同时伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者具有独特的临床及遗传学特征,分子遗传学检查有助于早期诊断,单药小剂量伊马替尼治疗有效.
作者:韩文敏;晁红颖;周民;岑岭;陈苏宁;何雪峰;卢绪章 刊期: 2017年第01期
目的 应用单核昔酸多态性微阵列技术(single nucleotide polymorphisms array,SNP array),对1例不明原因智力低下的患儿进行全基因组拷贝数变异(genome-wide copy number variation,CNVs)筛查,并探讨SNP array技术在临床分子遗传学诊断中的应用价值.方法 对1例常规G显带染色体核型分析未见异常的智力低下患儿行CNVs检测.同时检测其父母.结果 患儿全基因组拷贝数检测结果提示:染色体15q25.3-26.2位置存在较大片段缺失,片段大小为7.3 Mb.患儿父母的G显带染色体核型分析及CNVs检测均未见异常.结论 该患儿不明原因智力低下、特殊面容与15号染色体微缺失关联性较大,SNP array技术具有高分辨率和高准确性的优点,同时可作为常规G显带核型分析的有益补充,应用于临床细胞遗传诊断中有重要意义.
作者:孙东兰;穆卫红;张艳华;赵丽娟 刊期: 2017年第01期
目的 对一例智力发育落后、临床表型为女性的患儿进行细胞与分子遗传学分析,探讨其遗传学病因.方法 对患儿进行常规染色体G显带核型分析,并提取其外周血DNA,采用PCR扩增分析SRY基因的变异,并用定量PCR对SRY基因进行拷贝数检测.结果 核型分析显示患儿为47,XXY.SRY基因及拷贝数变异分析显示SRY基因呈大片段缺失,拷贝数为0.结论 患儿的女性表型是由于Y染色体上SRY基因的缺失所致,为国内首例SRY基因阴性、表型为女性的47,XXY病例.
作者:李洪英;张开慧;高敏;张海燕;王莹;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
目的 探讨染色体异常与生长发育迟缓的关系.方法 采集96例生长发育迟缓儿童的外周血样,进行常规染色体核型分析.结果 在96例患者中,共发现异常核型27例,检出率为28.13%,其中常染色体异常23例,检出率为23.96%,包括21三体、7号部分缺失、5p一等,发现性染色体异常4例,检出率为4.17%,主要为45,X及其嵌合体.在体格发育迟缓患者中,异常核型检出率为27.27%(18/66),其中单纯性体格发育迟缓患者异常核型检出率为18.92%(7/37).在体格发育迟缓合并其他异常患者中,异常核型检出率为37.93%(11/29).在智力障碍患者中,异常核型检出率为28.26%(13/46),其中单纯性智力障碍患者异常核型检出率为16.67%(4/24).智力障碍合并其他异常患者异常核型检出率为40.91%(9/22).结论 生长发育迟缓儿童的染色体异常率高,在合并特殊面容和先天性心脏病时异常率更高.对生长发育迟缓儿童行染色体核型分析将有助于明确其病因并采取相应的治疗措施.
作者:吴坚柱;周祎;黄林环;陈宝江;陈健生;陈筠虹 刊期: 2017年第01期
目的 对1例不明原因精神发育迟滞患儿及其家系进行遗传学分析,以明确诊断.方法 常规染色体核型分析患儿及其家系成员的外周血染色体,再以染色体微阵列检测微缺失/微重复,荧光原位杂交技术验证微阵列检测结果.结果 患儿与家系内同症患者表型一致,染色体核型结果相同,为46,XN,der(22) t(3;22) (q28;q13)pat;其父亲与5位亲属染色体核型为46,XN,t(3;22)(q28;q13),母亲及其他成员正常;患儿染色体微阵列分析示chr3q28q29区域发生9.0 Mb三拷贝重复,chr22q13.3区域发生1.7 Mb单拷贝缺失,荧光原位杂交技术验证了上述结果.结论 该患儿家系中同症患者的异常表型符合3q和22q非平衡易位导致的22q13.3缺失综合征和3q重复综合征,是由于亲代染色体平衡易位产生不正常配子遗传给下一代造成.
作者:张开慧;董睿;黄艳;杨亚丽;王莹;张海燕;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
目的 分析一例完全型雄激素不敏感综合征(complete androgen insensitivity syndrome,CAIS)患者及其家系成员雄激素受体(androgen receptor,AR)基因的潜在突变.方法 提取患者及其家系成员的外周血基因组DNA和总RNA,应用PCR技术扩增X染色体上AR基因的7个外显子,对产物直接进行DNA测序,寻找突变位点;应用PCR-限制性片段长度多态性方法分析相应的基因组片段,进一步确证AR基因的突变位点;用逆转录PCR扩增AR基因,再次验证其突变位点.结果 发现患者及其舅舅AR基因第7外显子的第2880个核苷酸G被A替换,引起错义突变,导致第840位密码子CGT突变为CAT,即精氨酸被组氨酸替代.该突变可能引起雄激素受体结合能力的变化,导致CAIS.患者母亲一条AR等位基因的第840位密码子亦存在CGT--CAT改变,另一条等位基因则未发现突变.结论 AR基因第7外显子核苷酸序列2880位点碱基G引起的错义突变很可能是引起CAIS的原因.应用长链RT-PCR技术扩增AR基因可为CAIS的分子诊断提供新的方法.
作者:张晓;曾健;林炎鸿;涂向东 刊期: 2017年第01期
患者男,31岁.其妻第1次怀孕2+月出现阴道流血,B超示无胎心,胚胎停止发育,手术流产;间隔1年余第2次怀孕,孕50+天可见3个孕囊,绒毛膜促性腺激素水平较低,再次手术流产,孕期无毒物接触史.细胞遗传学检查:在征得知情同意后抽取患者静脉血2mL,肝素抗凝,37℃条件下行淋巴细胞培养72 h,常规G显带,计数20个中期分裂相,分析5个,患者核型为46,XY,t(9;10)(9pter-9q34∷10q11.2→10qter;10pter-10q11.2∷9q34→9qter),见图1.其妻染色体检查未见异常.拒绝家系调查.
作者:张春晓;蓝信强 刊期: 2017年第01期
目的 探讨生长停滞特异基因6(growth arrest specific gene 6,GAS6)多态性是否与重度子痫前期发病有关联.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法对成都地区167例重度子痫前期患者和312名健康孕妇GAS6基因834+ 7G/A和+1332C/T多态性进行分析.结果 GAS6基因+1332C/T位点C、T等位基因的频率在重度子痫前期组为85.63%、14.37%,在正常孕妇组为78.04%、21.96%.+1332C/T位点基因型和等位基因频率在重度子痫前期组和正常妊娠对照组之间差异具有统计学意义(均P<0.05),CT+TT基因型携带者在患者组的频率显著低于对照组(28.14% vs 39.42%),发生重度子痫前期的风险降低(OR=0.602,95%CI:0.401~0.904,x2=6.045,P=0.014).834+ 7G/A位点G、A等位基因的频率在重度子痫前期组为72.75%、27.25%,在正常孕妇组为74.36%、25.64%.两组之间基因型和等位基因频率差异无统计学意义(均P>0.05).此外,重度子痫前期组和正常妊娠对照组GAS6基因两位点基因型对血压水平未见显著影响.结论 中国成都地区汉族人GAS6基因+1332T等位基因与重度子痫前期发病的风险降低可能存在关联,但未见834+7G/A位点与重度子痫前期的发生有关.
作者:叶丽燕;关林波;范平;刘兴会;刘瑞;陈瑾歆;朱月;魏星;刘宇 刊期: 2017年第01期
目的 探讨1例因“生长发育迟缓伴小耳畸形”就诊的11岁男童的病因及临床特点.方法 收集患儿的临床资料并进行生化检测、染色体芯片分析(chromosomal microarray analysis,CMA)、下一代基因测序以及Sanger测序.结果 患儿存在宫内发育迟缓、出生后持续生长迟缓、小耳畸形、髌骨发育不良三联征以及特殊面容和正常促性腺激素性发育不良(小睾丸).基因检测发现其16号染色体为单亲二倍体且存在ORC6基因c.67A>G(p.Lys23Glu)纯合新突变.结论 患儿可能为中国首例男童16号染色体为单亲二倍体合并ORC6基因纯合新突变导致的Meier-Gorlin综合征,该ORC6基因新突变经Alamut功能软件预测可能影响蛋白结构域功能.
作者:李娟;丁宇;常国营;程青;李辛;王剑;王秀敏;沈亦平 刊期: 2017年第01期
目的 探讨冷“休克”同步化羊水细胞传代培养在产前诊断中的应用.方法 实验组将原代培养至7天时置换出的旧培养基放置于4℃冰箱冷“休克”15天后,分离其内的M期细胞加入适量新培养基传代培养;对照组直接将原代培养至第7天时置换出的旧培养基离心,收集其内的M期细胞加入适量新培养基传代培养,不做冷“休克”处理.采用流式细胞术检测实验组和对照组活细胞、早期凋亡细胞及晚期凋亡细胞和死细胞的百分比;染色体G显带技术进行实验组和对照组的染色体核型分析,观察实验组染色体核型是否存在畸变.结果 实验组收获的活细胞数(21.65±2.58)与对照组(34.80±2.02)比较差异有统计学意义(t=31.127,P<0.01),实验组收获的早期凋亡细胞数(26.08±2.09)与对照组(23.79±2.31)比较差异有统计学意义(t=5.683,P<0.01),实验组收获的晚期凋亡细胞及死细胞数(13.63±0.68)与对照组(12.95±0.69)比较差异有统计学意义(t=5.384,P<0.01);实验组染色体核型与对照组一致,均未见染色体发生畸变.结论 将原代培养至7天时置换出的旧培养基放置于4℃冰箱15天后,分离其内的M期细胞继续传代培养,仍能获得一定数量的可分析分裂相,且染色体未见畸变,诊断结果可靠,应用该方法可确保一次性穿刺即可确保羊水细胞培养成功并得出终的产前诊断.
作者:谢金芳;薛万华;纪霞;王燕;蔡富强;孙兆亮;王立;李美芹;黄艳丽 刊期: 2017年第01期
目的 拟利用体外克隆表达的GPⅢa蛋白作为HPA-1a抗原与Luminex xMAP微球相连,建立和评估用Luminex微球技术检测血清中抗HPA-1a的效果.方法 扩增并克隆GPⅢa蛋白的编码基因ITGB3至真核表达载体,转染中国仓鼠卵巢癌细胞株.利用G418筛选稳定表达细胞株,体外获取并鉴定相应的特异性膜糖蛋白GPⅢa.将重组蛋白通过表面游离氨基和Luminex xMAP微球表面激活的羧基相偶联,再利用偶联后的微球与待测血清反应.利用PE-抗人IgG进行显色,在Luminex-100仪上读取数据并判断结果.结果 ITGB3基因测序为HPA-1aa,将克隆后的GPⅢa重组蛋白偶联Luminex xMAP微球,Luminex微球法检测HPA 1a抗体的灵敏度为滴度1/32(抗体浓度3.125 U/mL).微球技术能特异性鉴别出待测样本的HPA-1a抗体,与MAIPA结果一致,而且与HLA抗体、ABO抗体以及其他HPA血小板系统抗体(HPA-3a、HPA-5b)均不发生交叉反应,说明建用立的Luminex微球技术来检测血小板抗体是可行的.结论 成功获取了重组表达的血小板膜蛋白GPⅢa,并初步建立了Luminex微球检测HPA-1a抗体方法.
作者:陶苏丹;刘瑛;和艳敏;应燕玲;何吉;朱发明 刊期: 2017年第01期
目的 对一例疑为眼皮肤白化病的患儿进行临床和遗传学分析.方法 对患儿进行临床检查,提取患儿及其父母基因组DNA,采用新一代外显子目标区域捕获测序技术对患儿进行基因突变分析,并对疑似致病性突变进行患儿及其父母的Sanger测序验证及生物信息学预测.结果 患儿歪头视物,视力低下,伴有双眼水平冲动型眼球震颤,毛发棕黄色.基因测序显示患儿TYRP1基因存在c.1214C>A(p.T405N)和c.1333dupG杂合突变,分别遗传白其母亲和父亲.生物信息学预测为致病性突变.结论 患儿为TYRP1基因复合杂合突变引起的眼皮肤白化病Ⅲ型,TYRP1复合杂合突变致病的病例尚未见报道.
作者:律玉强;黄静;张开慧;刘国华;高敏;盖中涛;刘毅 刊期: 2017年第01期
患者 女,26岁.结婚2年,怀孕3次,第1次怀孕50+天,B超显示无胎心及胎芽,诊断为胚胎停止发育,手术流产;第2次怀孕2月,阴道流血,超声示无胎心,诊断为胚胎停育;第3次怀孕诊断为宫外孕.细胞遗传学检查:经患者知情同意,抽取静脉血2 mL,肝素抗凝,37℃条件下行淋巴细胞培养72 h,常规G显带,计数20个中期分裂相,分析5个,患者核型为46,XX,t(3;18)(3pter→3q1 3.2∷ 18q21→18qter;18pter→18q21∷ 3q13.2→3qter),见图1.其丈夫染色体检查未见异常.
作者:王玉娟;蓝信强 刊期: 2017年第01期
例1女,17岁,因原发闭经就诊.患者系第2胎,足月顺产,出生时父亲29岁,母亲26岁,母亲孕期无患病及服药史,无先兆流产史,父母为非近亲婚配,否认家族遗传病史.查体:身高158 cm,智力一般,无颈蹼,轻度肘外翻,双侧乳房未发育,乳间距宽,腋毛稀少.外阴发育幼稚,阴毛稀少,肛门检查子宫及双附件均未扪及.辅助检查:B超检查:无子宫,未探及双侧卵巢.细胞遗传学检查:采用常规方法进行外周血淋巴细胞培养,标本分别用胰酶消化和氢氧化钡处理进行G显带与C显带,按照人类细胞遗传学国际命名体制(ISCN2009)标准进行核型分析.C显带证实一个着丝粒失活,故患者核型为46,X,psuidic(X)(pter→q24∷q24→ pter)36]/45,X[6](图1A).其父母核型正常.
作者:薛会丽;李英;安刚;范向群;郭南;扶梅妹;何淑琼;张敏;徐两蒲 刊期: 2017年第01期