学术投稿

Hunter综合征患者IDS基因的一个新突变

郭奕斌;林群娣;杜传书

关键词:Hunter综合征, 粘多糖贮积症Ⅱ型, 艾杜糖-2-硫酸酯酶, 基因突变, 变性高效液相色谱, DNA序列分析
摘要:目的研究Hunter综合征患者的艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase,IDS)基因的突变情况,为产前基因诊断等打下基础.方法应用尿粘多糖含量检测、聚合酶链反应-变性高效液相色谱(polymerase chain reaction-denaturing high-performance liquid chromatography,PCR-DHPLC)分析对1例Hunter综合征患者及其父母的IDS基因的突变热点第9、3、8外显子进行突变检测, 并对PCR-DHPLC检出的突变样品进行直接测序.结果经PCR-DHPLC分析发现该患者的IDS基因第9外显子有明显异常峰形;DNA序列分析进一步发现该外显子发生一新的移码突变,突变部位在第482位密码子(TTA)内,即cDNA第1569 bp的T后插入了2个T,致使新肽链提前在第483位遇上终止密码TAA,导致新肽链从原来的550个氨基酸缩短至482个.该患儿为这一突变的半合子,而其母为这一突变的杂合子.结论 PCR-DHPLC和DNA序列分析是诊断Hunter综合征的有效方法,发现的移码突变(1569+TT)导致肽链比正常的少了68个氨基酸,从而引起IDS酶活性明显降低,可能是该Hunter综合征患者的致病原因.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • 46,XY,t(13;20) 伴自然流产

    患者男,26岁.其妻自然流产3次,现怀孕80多天阴道流血,B超显示胚胎停止发育而就诊.查体:身高168 cm,体重59 kg.表型及智力正常.细胞遗传学检查,分别抽取患者夫妇外周血进行细胞培养,G显带分析.患者核型为46,XY,t(13;20) (13pter→13q22∷20q13→20pter;20pter→20q13∷13q22→13pter).其妻核型正常.

    作者:张万兴;李玲;胡少华;罗文华 刊期: 2006年第01期

  • 12q部分三体综合征二例

    患儿女,新生儿.系第1胎,孕42周顺产,Apgar评分8分-9分-9分(1 min-5 min-10 min),羊水混浊Ⅲ°.查体:出生体重2315 g.身长45 cm,头围32 cm,胸围31 cm.前额凸,眼距宽,眼裂小,鼻梁扁,小颌,后颈赘皮,躯体前屈,不能仰卧,双上肢、双下肢屈曲,被动活动不能完全伸展,双下肢交叉呈剪刀步态状,双手通贯手.

    作者:李红妩 刊期: 2006年第01期

  • 一例治疗相关性白血病染色体异常核型

    患者女,56岁,因诊断急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)48个月,发现双侧腹股沟淋巴结肿大1月及腰背部肿物于2005年3月9日入院.患者于2001年3月经细胞形态学、细胞化学、免疫学、细胞遗传学、分子遗传学、分子生物学和临床特征确诊APL,当时骨髓染色体核型为:46,XX,t(15;17)(q22;q12).

    作者:刘基铎;刘光平;沈云;何惠;彭智 刊期: 2006年第01期

  • 汉族人群caspase10基因中存在一个新的微卫星位点

    目的检测汉族人群caspase10基因(CASP10)编码区外显子及剪接区域的多态性位点,研究CASP10基因与多基因复杂疾病的关联性.方法采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)、变性高效液相色谱技术(denaturing high-performance liquid chromatography, DHPLC)、直接测序及克隆测序技术检测CASP10基因第9外显子及其部分侧翼序列.结果 CASP10基因第9外显子在本人群70例血样本中未检测到存在于其他人群中已知的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism, SNP),但初步发现在第8内含子中靠近第9外显子处存在连续重复的单核苷酸T,且T的数目在不同的个体中存在差异.测序分析显示该处为一单核苷酸重复序列,提示该位点为一单核苷酸重复微卫星位点.经比较现存的基因组数据库,先前未有类似报道.进一步采用高保真酶扩增及测序都证实同样结果.用DHPLC法检测了70例浙江汉族人群血样本,结果均呈杂合状态,暂命名为IVS8-13(T)n.结论我们的结果提示汉族人群中该位点为一杂合度较高的单核苷酸重复的微卫星位点.这一结果与NCBI的dbSNP数据库中公布的该位点为一缺失型的SNP不同,提示这一位点的遗传差异可能与种族相关.汉族人群CASP10基因中存在的这个微卫星的意义还有待于深入研究.

    作者:叶月芳;周韧;毛峥嵘;张伟 刊期: 2006年第01期

  • 藏族X染色体10个STR位点的遗传多态性

    目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423, DXS8378, DXS6799, DXS7424, DXS7130, DXS7132, DXS6789, DXS101, DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布.方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果.结果 DXS7423, DXS8378, DXS6799,DXS7424, DXS7130, DXS7132,DXS6789, DXS101, DXS6804,DXS7133分别检出5种、5种、5种、9种、7种、7种、11种、9种、5种和4种等位基因;基因频率分别分布在0.0172~0.5610、0.0179~0.5595、0.0122~0.5614、0.0122~0.4024、0.0172~0.4828、0.0116~0.4035、0.0119~0.2857、0.0119~0.3774、0.0351~0.0.3929、0.0116~0.6786之间,此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡.结论此10个X染色体STR位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值,对疾病相关研究有重要意义.

    作者:高雅;金天博;余兵;杜宏;李生斌 刊期: 2006年第01期

  • X染色体上六个短串联重复序列基因座遗传多态性研究

    目的研究陕西西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS7130、DXS1214、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133等位基因及基因型频率分布.方法随机抽取陕西西安汉族118名女性和90名男性无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果.结果在6个基因座中,DXS7130、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133分别检出9个、6个、6个、7个和7个等位基因;分别检出21、14、15、17和12种基因型;基因频率分别分布在0.0112~0.4101、0.0160~0.4840、0.0050~0.3713、0.0053~0.3632和0.0059~0.5235之间,DXS1214检出8个等位基因,基因频率分布在0.0104~0.3161之间;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡.结论此6个X染色体短串联重复序列位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义.

    作者:冯雪;王艳;樊瑛;余兵;李生斌 刊期: 2006年第01期

  • 男性染色体核型异常三例

    例1 男,25岁,婚后2年妻子未孕.男性第2性征欠佳,无胡须及腋毛.细胞遗传学检查:取外周血常规制备染色体,G显带,观察20个中期分裂相,核型分析10个.染色体核型为:48,XXYY.

    作者:常东;曲颖波;张红秀 刊期: 2006年第01期

  • 人类XBP1基因5′上游DNA序列的转录激活功能分析

    目的分析人类转录因子X-盒结合蛋白1(X-box binding protein Ⅰ,XBP1)基因启动子在不同细胞系中转录活性的差别,研究其转录调控机制. 方法在对XBP1基因进行生物信息学分析的基础上,设计6种XBP1启动子缺失突变体,分别包括XBP1基因5′上游-1039~66 bp、-859~66 bp、-623~66 bp、-351~66 bp,-227~66 bp、-227~-45 bp,针对每一种缺失突变体构建相应的氯霉素乙酰转移酶(chloramphenicol acetyltansferase, CAT)报告基因载体,再分别瞬时转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02细胞,应用报告基因CAT瞬时表达系统,检测XBP1每一种缺失突变体在K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞中的活性差异,并进一步确定XBP1基因启动子的具体调节部位. 结果成功获得XBP1基因启动子6种缺失突变体的正确克隆和6种相应的报告基因载体p1-XBP1p,p2-XBP1p, p3-XBP1p, p4-XBP1p, p5-XBP1p, p6-XBP1p,每一种报告基因转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞系后,p4-XBP1p和p5-XBP1p在K562、HepG2细胞中的转录活性均高于其它报告载澹琾5-XBP1p在HepG2细胞中转录活性高;而6种报告基因载体在NIH-3T3小鼠成纤维细胞中不具有转录活性. 结论 XBP1基因的转录激活能力在不同细胞中有所差异,其表达活性具有一定的细胞类型特异性,与细胞类型和细胞状态密切相关;XBP1基因启动子的-227~66 bp区域是该启动子的核心部位,而且核心启动子区包括ATG翻译起始密码子的下游部位,这一部位是转录活性的重要部位,一旦缺失,XBP1基因启动子会丧失活性.

    作者:郭风劲;成海恩;易发平;彭惠民;宋方洲 刊期: 2006年第01期

  • 马凡氏综合征并主动脉夹层动脉瘤破裂一例

    患者男,37岁,因活动突发剧烈胸、背、腹、腰部疼痛10天入院.疼痛自胸部开始,逐渐延伸至下腹部,伴呼吸困难.其母年轻时猝死,死因不详.查体:脉搏128次/分,呼吸24次/分,血压128/23 mmHg,瘦长体形,身高1.80 m,端坐呼吸,视力正常,口唇发绀,颈动脉搏动明显,双肺散在干罗音,双肺底湿罗音.

    作者:赵玉娟;于汉力;王银燕 刊期: 2006年第01期

  • K562细胞VEGF基因表达下调后的基因表达谱改变

    目的探讨血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)基因VEGF表达下调对白血病K562细胞株基因表达谱的影响.方法采用脂质体介导的方法将抗VEGF发夹状核酶基因真核表达载体pcDNA-RZ转染白血病细胞株K562、G418抗性筛选获得阳性克隆;抽提基因组DNA,用PCR方法验证核酶基因已转入K562细胞;荧光定量PCR和免疫印迹反应检测白血病细胞中VEGF mRNA和蛋白表达量的改变;应用cDNA微阵列技术检测VEGF基因表达下调对白血病K562细胞株基因表达谱的影响.并用逆转录PCR验证PCNA、GSN基因的表达改变.结果抗VEGF发夹状核酶基因真核表达载体pcDNA-RZ转入白血病细胞株K562、G418筛选两周获得阳性克隆,PCR检测证实核酶基因整合入白血病细胞基因组DNA;与K562及K562/PC细胞(转染空质粒的K562细胞)相比,转染VEGF核酶基因的K562/RZ细胞VEGFmRNA和蛋白的表达量明显降低,芯片中共有表达差异的基因191条,包括周期相关基因、细胞凋亡相关基因、癌基因以及细胞信号和传递蛋白等基因,其中104条表达下调,87条表达上调.逆转录PCR证实GSN基因表达上调,PCNA基因表达下调.结论 VEGF基因表达下调能引起白血病K562细胞株基因表达谱的改变,这些基因的改变可能对白血病细胞增殖、分化和凋亡等生物学行为产生了一定的影响.

    作者:许文林;沈慧玲;吴朝阳;唐华容;王法春 刊期: 2006年第01期

  • 中国人CHRNA4基因的多态性分析

    目的对中国人神经型烟碱性胆碱能受体alpha4亚单位(CHRNA4)全基因进行扫描,检测CHRNA4基因多态位点及基因变异频率.方法随机抽取100名北京地区流行病学调查老年人和100例原发性帕金森病患者(从2000年至2002年首都医科大学宣武医院就诊的原发性帕金森病患者中随机抽取),用PCR扩增CHRNA4的6个外显子及邻近内含子区.用变性高效液相色谱和限制性酶切片段长度多态检测CHRNA4的多态位点,测序确定变异的碱基,统计各多态位点基因频率.结果检测出10个CHRNA4多态性位点,420C/T (0.873/0.127), 870C/T (0.828/0.172), 1440A/C (0.858/0.142), 1860C/T(0.738/0.262), 1890C/T (0.605/0.395),第5内含子+14T/C (0.553/0.447),第2内含子+22G/A(0.873/0.127)与以往报道相同(GenBank NM00074).新发现3个多态位点,第3内含子+182 Del 22 bp (0.813/0.187),1758C/T和1809C/T.帕金森病组第3内含子+182 Del 22 bp缺失变异频率(0.235)高于对照组(0.140)(P=0.015).结论 CHRNA4是高度多态的基因,多态位点多在第5外显子.帕金森病患者第3内含子+182 Del 22 bp缺失变异者多.

    作者:张丽梅;陈彪;冯秀丽;董秀敏;王维治 刊期: 2006年第01期

  • 提高窖蛋白基因扩增特异性的逆转录聚合酶链方法

    目的建立一种可消除逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction, RT-PCR)中非特异条带生成,提高逆转录聚合酶链反应精确度的PCR体系.方法近作者报道了硫化修饰的引物结合具有校正活性聚合酶可提高PCR反应特异性,但其抑制非特异性扩增的效率有待进一步验证和精确测定.用小鼠窖蛋白1(caveolin-1,Cav 1)中1对引物,ECV304细胞、HepG2细胞、小鼠肝、主动脉血管组织逆转录cDNA以及含人窖蛋白基因的倍比稀释质粒为模板,比较普通RT-PCR反应与硫化修饰引物结合不同校正活性聚合酶对非特异性扩增的抑制效率.结果引物3′末端硫化修饰结合具有校正活性的聚合酶可特异性关闭PCR反应中引物3′末端与模板非特异结合而引起的非特异性扩增,只允许引物3′末端与模板完全匹配的延伸反应得以进行.与普通PCR反应相比,能有效抑制50 μL体系中,50 ng约含2×104不匹配模板拷贝数的非特异扩增.结论引物3′端引入抗酶切的硫化修饰后,引物与模板非特异结合将由于校正活性聚合酶长期停留在试图纠正引物与模板不一致状态而得不到有效延伸,提高了PCR反应的特异性.

    作者:徐阳炎;杨慧龄;游咏;覃丽;涂剑 刊期: 2006年第01期

  • 45,XX,ter(14;15)(q10;q10)伴生殖器发育异常一例

    患者女,23岁,因无月经来潮入院.患者曾于19岁时在当地医院行人工周期治疗3个月,仍无月经来潮,亦无周期性下腹痛.曾有性生活史,因性交困难而中止.患者父母体健,非近亲婚配,其母孕期无放射及有害化学物质接触史,孕早期曾感冒发热过一次,未曾服药,孕期未用过保胎药.家族中无遗传病及传染病史.

    作者:肖松舒;薛敏 刊期: 2006年第01期

  • 中国上海家族性乳腺癌BRCA1和BRCA2基因的突变

    目的研究上海地区家族性乳腺癌中BRCA1/BRCA2基因的突变位点及携带情况.方法研究对象来自35个汉族家族性乳腺癌家系,家系中至少有一个一级亲属乳腺癌患病史.共35例患者,其中13例发病年龄≤40岁.由静脉血提取基因组DNA,对BRCA1/BRCA2基因的全部编码序列进行扩增.扩增产物突变分析先由变性高效液相色谱分析进行筛查,之后进行DNA直接测序证实.结果在BRCA1基因中发现有4个突变位点,其中2个为新发现位点--拼接点突变(IVS17-1G>T; IVS21+1G>C);另两个为已报道的致病突变位点--移码突变(1100delAT;5640delA).BRCA2基因的1个致病突变位点位于11号外显子上,为移码突变(5802delAATT).另外,共发现有12个新的单核苷重复多态位点,都未引起氨基酸编码改变;其中,8个在BRCA1基因上,4个在BRCA2基因上.在家族性乳腺癌中,BRCA1突变频率(11.4%)高于BRCA2基因(2.9%).结论新发现的2个BRCA1基因的拼接点突变可能是中国上海人群家族性乳腺癌的特有突变位点;在我国上海地区人群中,BRCA1基因突变起着比BRCA2基因更大的作用;该研究丰富了中国人群中BRCA基因的突变谱,并为未来的临床基因检测提供了筛查模式.

    作者:宋传贵;胡震;袁文涛;狄根红;沈镇宙;黄薇;邵志敏 刊期: 2006年第01期

  • 兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1等位基因多态性分析

    目的分析兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性特点.方法采用序列特异性引物聚合酶链反应技术对兰州地区200名健康无血缘关系的汉族个体HLA-A、B和DRB1基因座进行分型,并与西北、北方和南方汉族、西北回族、维吾尔族和藏族人群进行比较.结果兰州汉族人群中HLA-A基因座共检出14个等位基因,以A*02,A*11,A*24,A*33,A*30,A*01和A*31基因常见;HLA-B基因座共检出32个等位基因,以B*40,B*15,B*46,B*13,B*51,B*60,B*58和B*44基因为常见;HLA-DRB1基因座共检出13个等位基因,多见的基因依次为DRB1*09,DRB1*15,DRB1*12,DRB1*04, DRB1*11,DRB1*07,DRB1*08和DRB1*14,接近北方汉族而与南方汉族有差异,与西北回族无明显差异,但与西北维吾尔族和藏族差异有统计学意义.结论兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性与南、北汉族人群存在不同程度的差异,与西北维吾尔族和藏族差异显著.

    作者:李彩丽;唐朝晖;方丽华;李元荣;苏海翔;魏虎来 刊期: 2006年第01期

  • 绒毛培养法检出20三体一例

    患者女,37岁,平素月经规律,末次月经2005年5月14日,曾于2005年6月25日、7月13日及7月21日先后3次行超声检查显示:宫内妊娠,未见明显胎心搏动.胚胎未随停经时间的增长而相应发育,考虑胚胎已停止发育,来我院遗传门诊就诊,要求查明自然流产原因.

    作者:潘敏;胡舜妍;易翠兴;廖灿 刊期: 2006年第01期

  • 九个普-杰二氏综合征家系结肠息肉癌变

    普-杰二氏综合征(Peutz-jegher's syndrome,PJS)又称黑斑息肉病,为常染色体显性遗传性疾病,1997年国外用染色体荧光染色法将PJS胚系基因定位于19p13.3,该基因称为STKⅡ,编码丝苏氨酸激酶,本病以口周、肛周、趾指末端黑斑合并消化道息肉为特点.我们以来我院诊治的先证者为线索,追踪9个PJS家系,并对其息肉癌变进行了调查.

    作者:朱铁雁;康连春;苏志良;何爱泽 刊期: 2006年第01期

  • 湖北汉族人群TIM-3基因多态性与变应性哮喘的相关性

    目的分析湖北地区汉族人群T细胞免疫球蛋白域粘蛋白域蛋白-3(T cells immunoglobulin domain and mucin domain protein-3,TIM-3)启动子区-1541 C/T和-574 G/T单核苷酸多态性,探讨其与支气管哮喘易感性之间的关系.方法分别采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和等位基因特异性聚合酶链反应检测湖北地区153例哮喘患者和130名健康者TIM-3启动子区-1541 C/T和-574 G/T的单核苷酸多态性,计算基因型和等位基因频率.结果 (1)湖北地区健康人群TIM-3启动子区-1541位CC、CT和TT基因型频率分别是0.961、0.039和0,而哮喘人群其频率分别为0.935、0.065、0,其基因型和等位基因频率均与对照组差异无统计学意义(P=0.314,P=0.321);(2)湖北地区健康人群TIM-3启动子区-574位GG、GT和TT基因型频率分别是0.992、0.008和0,而哮喘人群频率分别为0.941、0.059、0,其基因型和等位基因频率均与对照组差异有统计学意义(P=0.046,P=0.048).结论湖北汉族人群TIM-3启动子区存在多态性变异,其中-574 G/T单核苷酸多态性可能与湖北地区汉族成人变应性哮喘易感性有关.

    作者:张才成;吴健民;崔天盆;王平;潘世秀 刊期: 2006年第01期

  • 两个中国常染色体显性遗传性多囊肾病家系的表型与基因型分析

    目的研究中国人多囊肾病基因1(polycystic kidney disease 1 gene, PKD1)突变的特点,检测基因突变位点.方法 25例多囊肾患者,正常对照16名,扩增PKD1基因的第44、45外显子幕蚱危?性梯度凝胶电泳突变检测系统进行初筛,然后测序.结果发现1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T)、1个多态性(A50747C),突变检测率为8%(2/25).结论检测到2个新的可能的致病突变:1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T).

    作者:高德轩;曹庆伟;丁克家;赵跃然;王来成;牛志宏;吕家驹 刊期: 2006年第01期

  • 基质金属蛋白酶-2和-9基因多态性与结直肠癌的相关性

    目的探讨基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase, MMP)-2和-9基因启动子区多态性与结直肠癌的关系.方法应用变性高效液相色谱法和限制性片段长度多态性分析方法分别检测126例结直肠癌患者和126名正常对照者的MMP-2 -1306C/T和MMP-9 -1562C/T多态性,分析其基因型与结直肠癌发病风险及临床病理参数的相关性. 结果 MMP-2 -1306C/C基因型频率在结直肠癌组中显著高于对照组(P<0.05), 与CT+TT基因型携带者比较,CC基因型携带者患结直肠癌的风险约增加2倍(OR:1.959;95% CI:1.055~3.637).而且在结直肠癌中,MMP-2 -1306C/T多态性与肿瘤的浸润深度之间差异有统计学意义(P<0.05),CC基因型的肿瘤更容易浸润到外膜. MMP-9 -1562C/T多态性的基因型及等位基因频率在结直肠癌组和对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05).结论 MMP-2 -1306C/T多态性可能与中国人群结直肠癌的遗传易感性相关,且CC基因型的肿瘤更易浸润到外膜.

    作者:徐恩萍;黄琼;吕炳建;邢晓明;来茂德 刊期: 2006年第01期

中华医学遗传学杂志

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主管:中国科学技术协会

主办:中华医学会