学术投稿

提高窖蛋白基因扩增特异性的逆转录聚合酶链方法

徐阳炎;杨慧龄;游咏;覃丽;涂剑

关键词:聚合酶链反应, 硫化修饰, 校正聚合酶
摘要:目的建立一种可消除逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction, RT-PCR)中非特异条带生成,提高逆转录聚合酶链反应精确度的PCR体系.方法近作者报道了硫化修饰的引物结合具有校正活性聚合酶可提高PCR反应特异性,但其抑制非特异性扩增的效率有待进一步验证和精确测定.用小鼠窖蛋白1(caveolin-1,Cav 1)中1对引物,ECV304细胞、HepG2细胞、小鼠肝、主动脉血管组织逆转录cDNA以及含人窖蛋白基因的倍比稀释质粒为模板,比较普通RT-PCR反应与硫化修饰引物结合不同校正活性聚合酶对非特异性扩增的抑制效率.结果引物3′末端硫化修饰结合具有校正活性的聚合酶可特异性关闭PCR反应中引物3′末端与模板非特异结合而引起的非特异性扩增,只允许引物3′末端与模板完全匹配的延伸反应得以进行.与普通PCR反应相比,能有效抑制50 μL体系中,50 ng约含2×104不匹配模板拷贝数的非特异扩增.结论引物3′端引入抗酶切的硫化修饰后,引物与模板非特异结合将由于校正活性聚合酶长期停留在试图纠正引物与模板不一致状态而得不到有效延伸,提高了PCR反应的特异性.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • Van der Woude综合征家系IRF6基因突变分析

    目的研究Van der Woude综合征(Van der Woude syndrome,VWS)干扰素调节因子6 (interferon regulatory factor 6, IRF6)基因突变.方法提取3个VWS家系成员基因组DNA,聚合酶链反应扩增IRF6基因9个外显子及其侧翼内含子序列,直接测序对患者IRF6基因进行突变的检测.结果在3个家系患者IRF6基因中共发现国际上尚未报道的3个突变:无义突变981(T→A)(Cys327X )和1234(C→T)(Arg412X);错义突变1214(T→C)(Met405Thr).结论 IRF6基因突变可能是VWS发病原因.

    作者:杜新雅;汤炜;田卫东;李晓宇;刘磊;郑晓辉 刊期: 2006年第01期

  • 46,XX,t(6;7)伴习惯性流产一例

    患者女,36岁,结婚4年,怀孕4次,均在孕60天左右流产.查体:身高158 cm,体重52 kg,智力正常.妇科检查:外阴、阴道发育正常,宫颈光滑、子宫大小正常、无压痛,双侧附件未扪及异常.

    作者:贾颐舫;吴爱华;邱毅;张渝 刊期: 2006年第01期

  • 绒毛培养法检出20三体一例

    患者女,37岁,平素月经规律,末次月经2005年5月14日,曾于2005年6月25日、7月13日及7月21日先后3次行超声检查显示:宫内妊娠,未见明显胎心搏动.胚胎未随停经时间的增长而相应发育,考虑胚胎已停止发育,来我院遗传门诊就诊,要求查明自然流产原因.

    作者:潘敏;胡舜妍;易翠兴;廖灿 刊期: 2006年第01期

  • α-synuclein基因过度表达诱导HEK293细胞α-synuclein蛋白病理性积聚

    目的观察α-synuclein过度表达诱导HEK293细胞α-synuclein蛋白病理性积聚的作用. 方法将消除终止密码子α-synuclein基因扩增产物连入pGEM T-easy载体,DNA测序证实后亚克隆入增强型绿色荧光蛋白pEGFP-N1质粒,通过限制性内切酶酶切鉴定重组质粒.采用脂质2000将野生型α-synuclein-EGFP真核表达载体转染HEK293细胞,48 h后采用Axiovert200型倒置荧光显微镜、荧光免疫细胞化学观察其在细胞内的表达,HE染色观察细胞胞浆内嗜酸性小体的形成. 结果消除终止密码子的扩增序列经测序证实并亚克隆入pEGFP-N1质粒后,限制性内切酶酶切鉴定质粒大小、酶切位点上均符合实验设计.将野生型α-synuclein-EGFP真核表达载体转染HEK293细胞,48 h后荧光显微镜下观察细胞在波长488nm蓝色激发光下发出明亮的绿色荧光,其中某些细胞出现绿色荧光物质积聚;免疫荧光细胞化学检测, EGFP阳性细胞同时也表现为a-synuclein免疫反应阳性,某些细胞胞浆内可见α-synuclein免疫阳性产物聚集;HE结果发现一些细胞胞浆内出现圆形的嗜酸性小体形成,约占细胞总数的10.8%.结论野生型α-synuclein基因过表达可诱导α-synuclein蛋白在HEK293细胞内积聚,胞浆内嗜酸性小体形成.

    作者:陈涛;唐北沙;廖小平;严新翔;张如旭;张玉虎;汤建光;曹立;郭纪锋;李静 刊期: 2006年第01期

  • 46,XY,t(13;20) 伴自然流产

    患者男,26岁.其妻自然流产3次,现怀孕80多天阴道流血,B超显示胚胎停止发育而就诊.查体:身高168 cm,体重59 kg.表型及智力正常.细胞遗传学检查,分别抽取患者夫妇外周血进行细胞培养,G显带分析.患者核型为46,XY,t(13;20) (13pter→13q22∷20q13→20pter;20pter→20q13∷13q22→13pter).其妻核型正常.

    作者:张万兴;李玲;胡少华;罗文华 刊期: 2006年第01期

  • 46,XX,t(3;6)(q23;p24)伴习惯性流产一例

    患者女,26岁,结婚4年,怀孕3胎,均于孕1~2月自然流产.妇科检查正常,夫妻双方体健,无药物及毒物接触史,表型、智力正常,非近亲结婚.细胞遗传学检查:外周血培养、制片、G显带分析,患者核型为46,XX,t(3;6)(3pter→3q23∷6p24∷→6pter;6qter→6p24∷3q23→3qter).丈夫染色体核型正常.患者父母非近亲结婚,无不良生育史.有兄长2人均已婚,并生育正常子女.

    作者:何吉娟 刊期: 2006年第01期

  • 频谱染色体核型分析技术诊断部分22三体一例

    传统的细胞遗传学技术能诊断绝大多数染色体疾病,但由于技术的局限性,也存在一些诊断的盲区,如对一些marker染色体、复杂易位或微小易位、缺失异常就无法用常规的G带或者R带来诊断.

    作者:裘俭;沈敏;吴明远;吕时铭 刊期: 2006年第01期

  • 广东汉族人群HLA-B基因多态性研究

    目的调查广东汉族人群HLA-B位点基因多态性,比较不同人群HLA-B等位基因频率分布特征. 方法应用测序技术测定562名广东汉族人HLA-B位点第2、3、4外显子序列,比对数据库得到分型结果,计算HLA-B等位基因频率并与不同人群进行比较. 结果共检测到59种HLA-B等位基因,其中6种等位基因频率≥5%,分别是HLA-B*4601(14.5%),HLA-B*400101(14.4%),HLA-B*1502(11.5%),HLA-B*1301(8.6%),HLA-B*5801(8.1%)和HLA-B*380201(6.4%).这6种等位基因的等位基因频率合计为63.5%.同时,检测到30种等位基因频率<0.5%的HLA-B等位基因,这30种等位基因的等位基因频率合计为4.9%.广东汉族人群HLA-B等位基因频率总体分布与中国香港华人、新加坡华人比较差异无统计学意义(P>0.05),但与日本人比较差异有统计学意义.结论分析了HLA-B基因在广东汉族人群中的分布特征,提供了较完整的HLA-B等位基因频率分布资料,为遗传学及疾病相关性等研究提供了重要的参考数据.

    作者:李焱;汤雪薇;吴洁莹;袁思敏;杨昕;黄以宁;廖灿 刊期: 2006年第01期

  • 马凡氏综合征并主动脉夹层动脉瘤破裂一例

    患者男,37岁,因活动突发剧烈胸、背、腹、腰部疼痛10天入院.疼痛自胸部开始,逐渐延伸至下腹部,伴呼吸困难.其母年轻时猝死,死因不详.查体:脉搏128次/分,呼吸24次/分,血压128/23 mmHg,瘦长体形,身高1.80 m,端坐呼吸,视力正常,口唇发绀,颈动脉搏动明显,双肺散在干罗音,双肺底湿罗音.

    作者:赵玉娟;于汉力;王银燕 刊期: 2006年第01期

  • 藏族X染色体10个STR位点的遗传多态性

    目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423, DXS8378, DXS6799, DXS7424, DXS7130, DXS7132, DXS6789, DXS101, DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布.方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果.结果 DXS7423, DXS8378, DXS6799,DXS7424, DXS7130, DXS7132,DXS6789, DXS101, DXS6804,DXS7133分别检出5种、5种、5种、9种、7种、7种、11种、9种、5种和4种等位基因;基因频率分别分布在0.0172~0.5610、0.0179~0.5595、0.0122~0.5614、0.0122~0.4024、0.0172~0.4828、0.0116~0.4035、0.0119~0.2857、0.0119~0.3774、0.0351~0.0.3929、0.0116~0.6786之间,此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡.结论此10个X染色体STR位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值,对疾病相关研究有重要意义.

    作者:高雅;金天博;余兵;杜宏;李生斌 刊期: 2006年第01期

  • 第六次全国医学遗传学学术会议在北京成功召开

    作者:刘华 刊期: 2006年第01期

  • 50对自然流产史夫妇染色体分析

    自然流产多数是由胚胎染色体的异常所造成的.对于偶发的自然流产,60%有染色体异常,而复发性流产约有30%~60%的胚胎染色体异常.胚胎染色体异常可以由遗传因素引起,也可由环境因素所致.所以,临床上对于有自然流产史的夫妇进行染色体检查是必要的.我们对50对有自然流产史的夫妇染色体进行检查,报告如下.

    作者:巫新春;曹云霞;丛林;魏兆莲;周平;赵济华;李芬;章志国;叶四云 刊期: 2006年第01期

  • 两例唐氏综合征的植入前遗传学诊断

    唐氏综合征(Down's syndrome,DS)又名先天愚型或21三体综合征,是人类发现早、常见的常染色体畸变疾病.其主要特征为严重智力障碍、特殊面容、体格发育落后,并常伴有多发畸形.由于唐氏综合征无法治疗,因此,及早在产前发现、阻止其出生,是产前诊断的重要任务.

    作者:章瑜;朱依敏;黄荷凤 刊期: 2006年第01期

  • 嵌合型18三体一例

    患者男,32岁,因结婚3年不育来我院生殖医学中心就诊.患者夫妇结婚3年余,性生活正常.患者半年前于外院检查精液,示严重少弱精伴精索静脉曲张,并行精索静脉曲张术后治疗无效.查体:身高168 cm,体重60 kg,一般情况好,外观、表型正常,无面部或肢体的明显不对称,亦无脊柱畸形和色素斑表现,第二性征、外生殖器发育正常.

    作者:陆小;樊卫民;冯云;黄晓燕 刊期: 2006年第01期

  • 三个常染色体隐性遗传性青少年型帕金森综合征家系的基因型与表型分析

    目的探讨常染色体隐性遗传性青少年型帕金森综合征(autosomal recessive juvenile parkinsonism, AR-JP)parkin基因的突变及临床特征. 方法应用聚合酶链反应、DNA测序和限制性核酸内切酶酶切等技术对15个AR-JP家系先证者的parkin基因进行突变研究.结果发现3个家系有parkin基因的突变,其中2个家系含parkin基因的杂合缺失突变,分别为第2外显子的202-203delAG及第9外显子的1069-1074delGTGTCC;另一家系发现一个杂合点突变,为第12外显子的1422(T→C).其中1069-1074delGTGTCC和1422(T→C)为新的突变.3个家系共6名患者,发病年龄18~31岁,平均25.2±5.7岁;病情进展慢,腱反射活跃或亢进、症状波动常见;对小剂量多巴制剂反应良好.结论我国的AR-JP家系存在parkin基因的突变;含parkin基因突变的AR-JP患者有帕金森病的一般临床表现,又有其独特的临床特征.

    作者:郭纪锋;唐北沙;张玉虎;刘洪建;严新翔;陈涛;沈璐;江泓;夏昆;蔡芳;潘乾 刊期: 2006年第01期

  • 两个中国常染色体显性遗传性多囊肾病家系的表型与基因型分析

    目的研究中国人多囊肾病基因1(polycystic kidney disease 1 gene, PKD1)突变的特点,检测基因突变位点.方法 25例多囊肾患者,正常对照16名,扩增PKD1基因的第44、45外显子幕蚱危?性梯度凝胶电泳突变检测系统进行初筛,然后测序.结果发现1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T)、1个多态性(A50747C),突变检测率为8%(2/25).结论检测到2个新的可能的致病突变:1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T).

    作者:高德轩;曹庆伟;丁克家;赵跃然;王来成;牛志宏;吕家驹 刊期: 2006年第01期

  • 染色体显带分析结合荧光原位杂交进行产前诊断

    染色体病是引起先天异常的重要原因,在妊娠期取胎儿脐血做染色体核型分析,可发现染色体异常的胎儿,避免这些胎儿出生.我们应用显带分析结合荧光原位杂交产前诊断一例胎儿染色体异常.

    作者:李立;谭跃球;李麓芸;卢光琇 刊期: 2006年第01期

  • 家族性10号与21号染色体易位的细胞遗传学研究

    相互易位在各号染色体间均可发生,新生儿的发病频率约1‰~2‰,相互易位仅有位置的改变,没有可见的染色体片段的增减时称为平衡易位,它通常没有明显的遗传效应,然而平衡易位的携带者与正常人婚后生育的子女中,却有可能得到一条衍生的异常染色体,导致某一易位节段的增多(部分三体)或部分(部分单体)减少,并产生相应的临床效应.

    作者:王军荣;刘志婷;关宝杰 刊期: 2006年第01期

  • 人类XBP1基因5′上游DNA序列的转录激活功能分析

    目的分析人类转录因子X-盒结合蛋白1(X-box binding protein Ⅰ,XBP1)基因启动子在不同细胞系中转录活性的差别,研究其转录调控机制. 方法在对XBP1基因进行生物信息学分析的基础上,设计6种XBP1启动子缺失突变体,分别包括XBP1基因5′上游-1039~66 bp、-859~66 bp、-623~66 bp、-351~66 bp,-227~66 bp、-227~-45 bp,针对每一种缺失突变体构建相应的氯霉素乙酰转移酶(chloramphenicol acetyltansferase, CAT)报告基因载体,再分别瞬时转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02细胞,应用报告基因CAT瞬时表达系统,检测XBP1每一种缺失突变体在K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞中的活性差异,并进一步确定XBP1基因启动子的具体调节部位. 结果成功获得XBP1基因启动子6种缺失突变体的正确克隆和6种相应的报告基因载体p1-XBP1p,p2-XBP1p, p3-XBP1p, p4-XBP1p, p5-XBP1p, p6-XBP1p,每一种报告基因转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞系后,p4-XBP1p和p5-XBP1p在K562、HepG2细胞中的转录活性均高于其它报告载澹琾5-XBP1p在HepG2细胞中转录活性高;而6种报告基因载体在NIH-3T3小鼠成纤维细胞中不具有转录活性. 结论 XBP1基因的转录激活能力在不同细胞中有所差异,其表达活性具有一定的细胞类型特异性,与细胞类型和细胞状态密切相关;XBP1基因启动子的-227~66 bp区域是该启动子的核心部位,而且核心启动子区包括ATG翻译起始密码子的下游部位,这一部位是转录活性的重要部位,一旦缺失,XBP1基因启动子会丧失活性.

    作者:郭风劲;成海恩;易发平;彭惠民;宋方洲 刊期: 2006年第01期

  • 常染色体不完全显性遗传癫痫两家系

    家系1 先证者(Ⅲ8) 女,15岁,半年前无明显诱因突然发作四肢抽搐,跌倒,两眼上翻,口吐白沫,发作持续10分钟左右,发作时意识丧失,醒后不能回忆发作经过,但倒地时颜面擦伤感觉疼痛,同时口述心里难受.一个月后再发,症状类似.检查:智力、发育正常,体格检查未发现明显异常,脑电图显示a节律失调,过度换气出现2.5~3.5 C/S高波幅尖、棘慢波,以额、颞为甚,持续20 s左右.

    作者:唐章龙;王旭;刘静宇;李益妹;刘木根 刊期: 2006年第01期

中华医学遗传学杂志

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