学术投稿

X染色体上六个短串联重复序列基因座遗传多态性研究

冯雪;王艳;樊瑛;余兵;李生斌

关键词:X染色体, 短串联重复序列, 遗传多态性
摘要:目的研究陕西西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS7130、DXS1214、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133等位基因及基因型频率分布.方法随机抽取陕西西安汉族118名女性和90名男性无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果.结果在6个基因座中,DXS7130、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133分别检出9个、6个、6个、7个和7个等位基因;分别检出21、14、15、17和12种基因型;基因频率分别分布在0.0112~0.4101、0.0160~0.4840、0.0050~0.3713、0.0053~0.3632和0.0059~0.5235之间,DXS1214检出8个等位基因,基因频率分布在0.0104~0.3161之间;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡.结论此6个X染色体短串联重复序列位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • 两个中国常染色体显性遗传性多囊肾病家系的表型与基因型分析

    目的研究中国人多囊肾病基因1(polycystic kidney disease 1 gene, PKD1)突变的特点,检测基因突变位点.方法 25例多囊肾患者,正常对照16名,扩增PKD1基因的第44、45外显子幕蚱危?性梯度凝胶电泳突变检测系统进行初筛,然后测序.结果发现1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T)、1个多态性(A50747C),突变检测率为8%(2/25).结论检测到2个新的可能的致病突变:1个移码突变(12431delCT)、1个无义突变(C12217T).

    作者:高德轩;曹庆伟;丁克家;赵跃然;王来成;牛志宏;吕家驹 刊期: 2006年第01期

  • 人类XBP1基因5′上游DNA序列的转录激活功能分析

    目的分析人类转录因子X-盒结合蛋白1(X-box binding protein Ⅰ,XBP1)基因启动子在不同细胞系中转录活性的差别,研究其转录调控机制. 方法在对XBP1基因进行生物信息学分析的基础上,设计6种XBP1启动子缺失突变体,分别包括XBP1基因5′上游-1039~66 bp、-859~66 bp、-623~66 bp、-351~66 bp,-227~66 bp、-227~-45 bp,针对每一种缺失突变体构建相应的氯霉素乙酰转移酶(chloramphenicol acetyltansferase, CAT)报告基因载体,再分别瞬时转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02细胞,应用报告基因CAT瞬时表达系统,检测XBP1每一种缺失突变体在K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞中的活性差异,并进一步确定XBP1基因启动子的具体调节部位. 结果成功获得XBP1基因启动子6种缺失突变体的正确克隆和6种相应的报告基因载体p1-XBP1p,p2-XBP1p, p3-XBP1p, p4-XBP1p, p5-XBP1p, p6-XBP1p,每一种报告基因转染K562、HepG2、NIH-3T3和L02 4种不同细胞系后,p4-XBP1p和p5-XBP1p在K562、HepG2细胞中的转录活性均高于其它报告载澹琾5-XBP1p在HepG2细胞中转录活性高;而6种报告基因载体在NIH-3T3小鼠成纤维细胞中不具有转录活性. 结论 XBP1基因的转录激活能力在不同细胞中有所差异,其表达活性具有一定的细胞类型特异性,与细胞类型和细胞状态密切相关;XBP1基因启动子的-227~66 bp区域是该启动子的核心部位,而且核心启动子区包括ATG翻译起始密码子的下游部位,这一部位是转录活性的重要部位,一旦缺失,XBP1基因启动子会丧失活性.

    作者:郭风劲;成海恩;易发平;彭惠民;宋方洲 刊期: 2006年第01期

  • 9号染色体臂间倒位与流产、不孕不育关系的探讨

    9号染色体臂间倒位是一种常见的染色体结构异常,关于9号染色体臂间倒位是否有遗传效应,至今仍有争议,一般认为9号染色体臂间倒位可能是一种正常的多态性现象.而近年来,9号染色体臂间倒位具有遗传效应的报道日渐增多,为探讨9号染色体臂间倒位的细胞遗传效应,我们对2803例有不孕不育或流产史患者进行研究,现报告如下.

    作者:潘倩莹;孙筱放;孔舒;郑育红 刊期: 2006年第01期

  • 第六次全国医学遗传学学术会议在北京成功召开

    作者:刘华 刊期: 2006年第01期

  • Hunter综合征患者IDS基因的一个新突变

    目的研究Hunter综合征患者的艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase,IDS)基因的突变情况,为产前基因诊断等打下基础.方法应用尿粘多糖含量检测、聚合酶链反应-变性高效液相色谱(polymerase chain reaction-denaturing high-performance liquid chromatography,PCR-DHPLC)分析对1例Hunter综合征患者及其父母的IDS基因的突变热点第9、3、8外显子进行突变检测, 并对PCR-DHPLC检出的突变样品进行直接测序.结果经PCR-DHPLC分析发现该患者的IDS基因第9外显子有明显异常峰形;DNA序列分析进一步发现该外显子发生一新的移码突变,突变部位在第482位密码子(TTA)内,即cDNA第1569 bp的T后插入了2个T,致使新肽链提前在第483位遇上终止密码TAA,导致新肽链从原来的550个氨基酸缩短至482个.该患儿为这一突变的半合子,而其母为这一突变的杂合子.结论 PCR-DHPLC和DNA序列分析是诊断Hunter综合征的有效方法,发现的移码突变(1569+TT)导致肽链比正常的少了68个氨基酸,从而引起IDS酶活性明显降低,可能是该Hunter综合征患者的致病原因.

    作者:郭奕斌;林群娣;杜传书 刊期: 2006年第01期

  • 45,XO/46,X,dup(X)q12-22嵌合体一例

    患者女,34岁,已婚.因原发闭经及婚后不孕就诊.患者为第3胎足月顺产,母亲孕时36岁,父亲35岁,父母非近亲结婚.否认家族史,哥、姐表型正常.查体:表型正常,智力一般,心理障碍.发际低,身高163 cm,体重72 kg,乳房大小发育尚可,乳头较小,乳间距较宽,未见腋毛.妇科检查:外阴幼稚型,阴毛稀少,阴道短.B超检查:盆腔内未见卵巢,子宫2.5 cm×2.5 cm×2.2 cm.

    作者:温莉娟;孟昭彦;刘利明;张玫;石福彦;侯鹏 刊期: 2006年第01期

  • 用比较基因组杂交技术研究弥漫大B细胞淋巴瘤分子细胞遗传学异常及其意义

    目的研究弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)的分子细胞遗传学异常,探讨DLBCL的分子细胞遗传学异常与临床特征的相关性.方法采用比较基因组杂交(comparative genomic hybridization, CGH)技术对24例DLBCL患者的全基因组遗传物质的扩增/缺失进行检测,分析CGH检测结果与DLBCL的临床特征及生存期的相关性.结果 24例DLBCL中62.5%病例发生染色体水平的扩增/缺失,20.8%病例发生累及6q的缺失,16.7%病例发生累及18q扩增;CGH检测异常组与正常组比较:CGH异常组患者Ann arbor分期多为Ⅱ~Ⅳ期,出现全身症状的几率较高,治疗疗效较差,生存期较短,但两组结果外累及发生几率无明显差别.结论基因组水平发生的遗传物质扩增/缺失是DLBCL常见的分子细胞遗传学异常;6q15-21缺失和18q11-ter扩增是DLBCL非随机分子细胞遗传学异常;CGH检测异常是DLBCL不良临床过程和预后标志.

    作者:夏海龙;陈丽娟;陈冰;金晓龙;陈赛娟 刊期: 2006年第01期

  • 内蒙古地区鄂温克族人群HLA-DRB1基因多态性

    目的对内蒙古鄂温克族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)Ⅱ类基因DRB1位点进行基因型检测.方法采用DNA序列分析的分型技术(sequencing based typing,SBT),对84名鄂温克族个体进行分析.结果 DRB1等位基因中,共检出25种等位基因,内蒙古鄂温克族以DRB1*03011(14.88%)的频率高,其次为DRB1*09012(13.69%)、*07011 (8.92%) 、* 04011(9.52%)、12011(8.33%).结论鄂温克族人群中HLA-DRB1分布特征有其独特性,为本民族的人类学及疾病相关性研究提供了重要的参考依据.

    作者:海荣;毕力夫;苏秀兰 刊期: 2006年第01期

  • 韩国人calpain-10基因单核苷酸多态性及其组合型的分析

    目的分析发现于墨西哥裔美国人群中的2型糖尿病易感基因calpain-10单核苷酸多态性(single nucletide polymorphism,SNP)及其组合型在韩国人群中的分布.方法采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术,分析312名健康韩国人calpain-10基因UCSNP -43、-19、-63位点的基因型及其组合型,计算基因型、等位基因和组合型频率.结果 UCSNP -43位点基因型频率为1/1型的是86.2%、1/2型的是13.5%、2/2型的是0.3%,等位基因频率为G的是0.930、A 0.070.UCSNP -19位点基因型频率为1/1型的是9.9%、1/2型的是44.6%、2/2型的是45.5%,等位基因频率为D的是0.322、I的是0.678.UCSNP -63位点基因型频率为1/1型的是57.4%、1/2型的是35.9%、2/2型的是6.7%,等位基因频率为C的是0.754、T的是0.246.各基因型分布匀符合Hardy-Weinberg平衡定律.韩国人中上述3个单核苷酸多态性基因型组合类型共见12种,75.6%由3种基因型组合构成.按UCSNP -43,-19,-63排列,分别为GG-DI-CC(单倍型组合111/121)、GG-DI-CT(112/121)、GG-II-CC(121/121),其频率分别为10.6%、28.8%、36.2%.结论韩国人calpain-10基因SNP分布与白人、美籍墨西哥人及美籍Pima印第安人等种族间存在较大差异,与中国和日本人群较为相近,其112/121单倍型组合频率显著高于美籍墨西哥人.

    作者:许青松;许松姬;洪润哲;李宽熙 刊期: 2006年第01期

  • 两例唐氏综合征的植入前遗传学诊断

    唐氏综合征(Down's syndrome,DS)又名先天愚型或21三体综合征,是人类发现早、常见的常染色体畸变疾病.其主要特征为严重智力障碍、特殊面容、体格发育落后,并常伴有多发畸形.由于唐氏综合征无法治疗,因此,及早在产前发现、阻止其出生,是产前诊断的重要任务.

    作者:章瑜;朱依敏;黄荷凤 刊期: 2006年第01期

  • 46,XX,inv(6)(p23;q23)一例

    患者女,25岁,结婚2年,早期自然流产2次.患者月经正常,妇科检查:子宫、附件正常.患者夫妇表型智力正常,非近亲结婚.细胞遗传学检查:取患者外周血淋巴细胞培养G显带分析,患者核型为:46,XX,inv(6)(pter→p23∷q23→p23∷q23→qter).其夫核型正常,家系其他成员未作染色体检查.

    作者:邢江涛;李刚荣;孙丽;张玉娜 刊期: 2006年第01期

  • α-synuclein基因过度表达诱导HEK293细胞α-synuclein蛋白病理性积聚

    目的观察α-synuclein过度表达诱导HEK293细胞α-synuclein蛋白病理性积聚的作用. 方法将消除终止密码子α-synuclein基因扩增产物连入pGEM T-easy载体,DNA测序证实后亚克隆入增强型绿色荧光蛋白pEGFP-N1质粒,通过限制性内切酶酶切鉴定重组质粒.采用脂质2000将野生型α-synuclein-EGFP真核表达载体转染HEK293细胞,48 h后采用Axiovert200型倒置荧光显微镜、荧光免疫细胞化学观察其在细胞内的表达,HE染色观察细胞胞浆内嗜酸性小体的形成. 结果消除终止密码子的扩增序列经测序证实并亚克隆入pEGFP-N1质粒后,限制性内切酶酶切鉴定质粒大小、酶切位点上均符合实验设计.将野生型α-synuclein-EGFP真核表达载体转染HEK293细胞,48 h后荧光显微镜下观察细胞在波长488nm蓝色激发光下发出明亮的绿色荧光,其中某些细胞出现绿色荧光物质积聚;免疫荧光细胞化学检测, EGFP阳性细胞同时也表现为a-synuclein免疫反应阳性,某些细胞胞浆内可见α-synuclein免疫阳性产物聚集;HE结果发现一些细胞胞浆内出现圆形的嗜酸性小体形成,约占细胞总数的10.8%.结论野生型α-synuclein基因过表达可诱导α-synuclein蛋白在HEK293细胞内积聚,胞浆内嗜酸性小体形成.

    作者:陈涛;唐北沙;廖小平;严新翔;张如旭;张玉虎;汤建光;曹立;郭纪锋;李静 刊期: 2006年第01期

  • 三个常染色体隐性遗传性青少年型帕金森综合征家系的基因型与表型分析

    目的探讨常染色体隐性遗传性青少年型帕金森综合征(autosomal recessive juvenile parkinsonism, AR-JP)parkin基因的突变及临床特征. 方法应用聚合酶链反应、DNA测序和限制性核酸内切酶酶切等技术对15个AR-JP家系先证者的parkin基因进行突变研究.结果发现3个家系有parkin基因的突变,其中2个家系含parkin基因的杂合缺失突变,分别为第2外显子的202-203delAG及第9外显子的1069-1074delGTGTCC;另一家系发现一个杂合点突变,为第12外显子的1422(T→C).其中1069-1074delGTGTCC和1422(T→C)为新的突变.3个家系共6名患者,发病年龄18~31岁,平均25.2±5.7岁;病情进展慢,腱反射活跃或亢进、症状波动常见;对小剂量多巴制剂反应良好.结论我国的AR-JP家系存在parkin基因的突变;含parkin基因突变的AR-JP患者有帕金森病的一般临床表现,又有其独特的临床特征.

    作者:郭纪锋;唐北沙;张玉虎;刘洪建;严新翔;陈涛;沈璐;江泓;夏昆;蔡芳;潘乾 刊期: 2006年第01期

  • MLH1、MSH2基因 mRNA突变分析与遗传性非息肉性结直肠癌的基因诊断

    目的检测胚系MLH1和MSH2基因mRNA突变,确立遗传性非息肉性结直肠癌(hereditary nonpolyposis colorectal cancer, HNPCC)家系.方法收集符合Amsterdam标准Ⅱ的12个家系14名家庭成员外周血,用特异引物和耐热性逆转录酶特异地逆转录MLH1和MSH2的RNA;利用长模板PCR扩增酶扩增逆转录产物(cDNA);测序分析扩增产物.提取外周血的DNA,设计与利用上述方法检测出突变对应外显子的特异性引物,利用Taq DNA聚合酶扩增测序,以检测上述方法的有效性.结果利用基于外周血mRNA的方法,在6个家系中检出6个胚系突变,4个MLH1突变和2个MSH2突变,MLH1突变分别位于第8、12、16和第19外显子;MSH2突变分别位于第1和第2外显子.利用基于外周血DNA的方法,上述突变均在MLH1和MSH2相应的外显子中得到验证.突变类型为4个错义突变、1个同义突变和1个非编码区突变;其中5个突变国际上尚未报道; 6个突变中有5个为病理性,分布于5个不同家系,该5个家系被确诊为HNPCC家系.结论基于外周血MLH1和MSH2 mRNA异常的检测能确诊HNPCC家系;该方法敏感、省时、节约成本.

    作者:王朝夫;周晓燕;张太明;孙孟红;徐烨;施达仁 刊期: 2006年第01期

  • 血红蛋白H病合并遗传性椭圆形红细胞增多症一例

    患者女,26岁,未婚.因反复头昏、乏力,巩膜黄染20余年入院.查体:体温36.4℃,脉搏84次/分钟,呼吸21次/分钟,BP 105/70 mmHg,神志清楚,发育正常,营养较差,慢性贫血面容.皮肤未见出血点、皮疹,巩膜黄染.浅表淋巴结无肿大,双肺无口罗音.腹软,肝肋下未触及,脾肋下1.5 cm.无传染病、放射线密切接触史.

    作者:张水生;刘秋莲;陈世林;王晓莉;胡友长;刘光金;程怿 刊期: 2006年第01期

  • 12q部分三体综合征二例

    患儿女,新生儿.系第1胎,孕42周顺产,Apgar评分8分-9分-9分(1 min-5 min-10 min),羊水混浊Ⅲ°.查体:出生体重2315 g.身长45 cm,头围32 cm,胸围31 cm.前额凸,眼距宽,眼裂小,鼻梁扁,小颌,后颈赘皮,躯体前屈,不能仰卧,双上肢、双下肢屈曲,被动活动不能完全伸展,双下肢交叉呈剪刀步态状,双手通贯手.

    作者:李红妩 刊期: 2006年第01期

  • 常染色体不完全显性遗传癫痫两家系

    家系1 先证者(Ⅲ8) 女,15岁,半年前无明显诱因突然发作四肢抽搐,跌倒,两眼上翻,口吐白沫,发作持续10分钟左右,发作时意识丧失,醒后不能回忆发作经过,但倒地时颜面擦伤感觉疼痛,同时口述心里难受.一个月后再发,症状类似.检查:智力、发育正常,体格检查未发现明显异常,脑电图显示a节律失调,过度换气出现2.5~3.5 C/S高波幅尖、棘慢波,以额、颞为甚,持续20 s左右.

    作者:唐章龙;王旭;刘静宇;李益妹;刘木根 刊期: 2006年第01期

  • 提高窖蛋白基因扩增特异性的逆转录聚合酶链方法

    目的建立一种可消除逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction, RT-PCR)中非特异条带生成,提高逆转录聚合酶链反应精确度的PCR体系.方法近作者报道了硫化修饰的引物结合具有校正活性聚合酶可提高PCR反应特异性,但其抑制非特异性扩增的效率有待进一步验证和精确测定.用小鼠窖蛋白1(caveolin-1,Cav 1)中1对引物,ECV304细胞、HepG2细胞、小鼠肝、主动脉血管组织逆转录cDNA以及含人窖蛋白基因的倍比稀释质粒为模板,比较普通RT-PCR反应与硫化修饰引物结合不同校正活性聚合酶对非特异性扩增的抑制效率.结果引物3′末端硫化修饰结合具有校正活性的聚合酶可特异性关闭PCR反应中引物3′末端与模板非特异结合而引起的非特异性扩增,只允许引物3′末端与模板完全匹配的延伸反应得以进行.与普通PCR反应相比,能有效抑制50 μL体系中,50 ng约含2×104不匹配模板拷贝数的非特异扩增.结论引物3′端引入抗酶切的硫化修饰后,引物与模板非特异结合将由于校正活性聚合酶长期停留在试图纠正引物与模板不一致状态而得不到有效延伸,提高了PCR反应的特异性.

    作者:徐阳炎;杨慧龄;游咏;覃丽;涂剑 刊期: 2006年第01期

  • 九个普-杰二氏综合征家系结肠息肉癌变

    普-杰二氏综合征(Peutz-jegher's syndrome,PJS)又称黑斑息肉病,为常染色体显性遗传性疾病,1997年国外用染色体荧光染色法将PJS胚系基因定位于19p13.3,该基因称为STKⅡ,编码丝苏氨酸激酶,本病以口周、肛周、趾指末端黑斑合并消化道息肉为特点.我们以来我院诊治的先证者为线索,追踪9个PJS家系,并对其息肉癌变进行了调查.

    作者:朱铁雁;康连春;苏志良;何爱泽 刊期: 2006年第01期

  • 男性染色体核型异常三例

    例1 男,25岁,婚后2年妻子未孕.男性第2性征欠佳,无胡须及腋毛.细胞遗传学检查:取外周血常规制备染色体,G显带,观察20个中期分裂相,核型分析10个.染色体核型为:48,XXYY.

    作者:常东;曲颖波;张红秀 刊期: 2006年第01期

中华医学遗传学杂志

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