学术投稿

基因芯片技术及其应用现状的浅思

宋怀东

关键词:寡核苷酸序列分析, 应用, 局限性
摘要:基因芯片技术是一种新近发展的新技术,在许多不同领域里都有广泛的应用,用基因芯片作为基本技术进行内分泌临床与基础研究的论文也日益增多,但基因芯片应用的本身仍存在一些问题,如样品的制备和处理,芯片结果的分析等.本文主要就芯片的应用及其局限性等方面进行分析,并进一步探讨如何解决这些问题.
中华内分泌代谢杂志相关文献
  • 催乳素和免疫系统

    催乳素(PRL)是一种具有多种功能的垂体激素,其受体广泛存在于免疫系统各个组织和器官中,参与调节细胞和组织的免疫活性,介导各类生理或病理的免疫反应,对自身免疫性疾病、器官移植和肿瘤的发生都有一定影响.本文介绍了近年来PRL在免疫领域中相关的研究进展.

    作者:茅江峰;邓洁英;史轶蘩 刊期: 2004年第06期

  • 基因芯片技术及其应用现状的浅思

    基因芯片技术是一种新近发展的新技术,在许多不同领域里都有广泛的应用,用基因芯片作为基本技术进行内分泌临床与基础研究的论文也日益增多,但基因芯片应用的本身仍存在一些问题,如样品的制备和处理,芯片结果的分析等.本文主要就芯片的应用及其局限性等方面进行分析,并进一步探讨如何解决这些问题.

    作者:宋怀东 刊期: 2004年第06期

  • 警惕非法医学期刊的招摇撞骗

    作者: 刊期: 2004年第06期

  • 罗格列酮对低滴度谷氨酸脱羧酶抗体的LADA患者胰岛β细胞功能的影响

    目的探讨罗格列酮对谷氨酸脱羧酶抗体(GAD-Ab)低滴度的成人隐匿性自身免疫糖尿病(LADA)患者胰岛β细胞功能的影响.方法将病程≤5年、空腹C肽(FCP)≥0.3 nmol/L且GAD-Ab滴度介于0.05~0.30之间的34例LADA患者随机分为磺脲类组(SUR组,n=16)和罗格列酮组(RSG组,n=18).每6个月随访一次,采血检测空腹血糖、C肽、HbA1c、75g葡萄糖负荷后2 h血糖和C肽以评价胰岛功能变化.采用放射免疫法检测GAD-Ab和C肽.结果(1)随访至6个月时,SUR组患者的HOMA-IS较治疗前下降;而RSG组患者的HOMA-IS无变化,其HOMA-IR及FCP水平较前降低.(2)随访至12个月时,SUR组患者的HOMA-IS水平较基线继续呈显著性下降(97.2 vs 107.3 mU/mmol,P<0.05);而RSG组患者的HOMA-IS水平无显著性变化.(3)随访至18个月时,RSG组糖负荷后2 h C肽(4.32 vs 1.99nmol/L,P<0.05)及△CP水平(3.47 vs 1.33 nmol/L,P<0.05)均高于SUR组.结论与磺脲类药物相比,罗格列酮能更好地保护GAD-Ab低滴度LADA患者的胰岛β细胞功能.

    作者:李霞;周智广;黄干;陈小燕;颜湘;杨琳;王建平 刊期: 2004年第06期

  • 有2型糖尿病家族史的初诊糖尿病患者胰岛素第一和第二时相分泌的异常

    采用精氨酸刺激法和OGTT法观察初诊糖尿病患者胰岛素第一和第二时相分泌的变化.结果提示,有糖尿病家族史患者存在胰岛素第一时相和早期分泌功能异常.

    作者:赵世华;王颜刚;阎胜利;王伟;綦玉芹;王娈 刊期: 2004年第06期

  • TSH受体基因SNP与Graves病、桥本甲状腺炎和结节性甲状腺肿之间的相关性研究

    目的探讨TSH受体基因单核苷酸多态性(SNP)与甲状腺疾病[包括Graves病(GD),结节性甲状腺肿,桥本甲状腺炎(HT)]有无相关性.方法以60例有甲状腺疾病家族史患者(其中30例GD、10例HT、20例结节性甲状腺肿患者),48例散发Graves病患者及96名健康对照者作为研究对象,采用外周血白细胞抽提DNA,设计引物,PGR扩增,对扩增产物纯化后测序.结果患者中共发现8个多态位点,其中第8外显子上的多态位点(E8A+40C)在SNP库中未见报道,为首次发现;将这些多态位点基因型变化与正常组比较,无明显统计学差异.结论本研究提示汉族人TSH受体基因与这几种甲状腺疾病无相关性;该基因的多态位点在不同的人种间存在明显差异.

    作者:梁军;赵家军;高聆;钟霞;张丽;章国卫;盛燕;阮铮;陈漪;宋怀东;陈家伦 刊期: 2004年第06期

  • 应用基因芯片技术研究甲状腺乳头状癌的基因表达

    目的应用基因芯片技术研究甲状腺乳头状癌(PTC)和正常成人甲状腺组织基因的差异表达.方法分别用Cy5和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将PTC组和对照组甲状腺组织的mRNA分别标记成探针,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交.通过扫描荧光强度,计算机软件分析,寻找两组差异表达基因,并用RT-PCR、免疫组化对其中两条基因进行验证.结果共有65条差异表达基因,其中表达增加的有48条(2.0倍以上),表达降低的有17条(0.5倍以下).RT-PCR、免疫组化结果与芯片扫描结果一致.结论基因芯片是筛选PTC与正常成人甲状腺组织差异表达基因的有效方法.通过筛选所得差异基因提示,PTC的发病涉及细胞外基质、细胞因子、受体信号转导等多个方面.

    作者:阮晔;刘志民;陈向芳;何金 刊期: 2004年第06期

  • E-选择素与糖尿病视网膜病变相关性的研究

    糖尿病患者伴视网膜病变组(DR)血浆中可溶性E-选择素水平高于不伴DR组,且与DR严重程度相关,提示E-选择素在DR的发生发展中起一定的作用.

    作者:牛小燕;朱本章;姚孝礼;杨玉 刊期: 2004年第06期

  • 年龄对血清皮质醇和硫酸脱氢表雄酮水平及其昼夜变化的影响

    目的研究年龄对男性血清皮质醇和硫酸脱氢表雄酮(DHEAS)水平及其昼夜节律的影响.方法26名男性健康志愿者按年龄(每增龄10岁)分为四组:30~(8名)、40~(6名)、50~(5名)和60~(7名)岁组.8:00~22:00每2小时,22:00~8:00每小时采血一次,ELISA检测血清皮质醇,化学发光免疫法检测血清DHEAS.结果血清皮质醇和DHEAS水平均呈明显昼夜变化,余弦法证实有统计学意义.皮质醇峰值4:00~6:00,谷值18:00~24:00,较白种人的峰、谷时间提前约2 h;DHEAS峰值在16:00左右.年龄对血清皮质醇水平及其昼夜变化无明显影响,但影响血清DHEAS水平,60岁组的血清DHEAS水平较其它3组明显降低(P<0.05或P<0.01),皮质醇/DHEAS比值也均显著增高(均P<0.01).结论年龄对血清皮质醇水平及其昼夜变化无明显作用,但明显影响血清DHEAS水平.

    作者:赵子彦;付越榕;谢毅;李玉阳;李新华;Yvan Touitou 刊期: 2004年第06期

  • CYP17A1基因TAC329AA纯合突变致17α-羟化酶缺陷症一例家系研究

    目的通过对一个17α-羟化酶缺陷症家系的临床和分子生物学研究,探讨其分子机制.方法针对在本中心就诊的一个17α-羟化酶缺陷症家系,全面收集患者及其家庭成员的临床和实验室资料,同时采用PCR和亚克隆测序方法检测17羟化酶基因(CYP17A1)序列.结果患者临床及内分泌功能检查完全符合17α-羟化酶缺陷症.CYP17A1基因序列分析发现,第6号外显子329位密码子发生了TAC329AA突变,引起Tyr329Lys错义突变和以后的移码突变.患者为纯合突变,患者的父母均为携带该突变基因的杂合子.结论本研究的这个家系,CYP17A1基因突变是17α-羟化酶缺陷症的致病基因.CYP17A1第6号外显子329位密码子TAC被AA替代为一新的纯合突变类型.

    作者:孙首悦;毕宇芳;刘建民;王卫庆;赵咏桔;宁光;李小英 刊期: 2004年第06期

  • 肥胖症儿童血浆脂联素、促酰化蛋白水平变化的临床意义

    目的探讨血浆脂联素和促酰化蛋白(ASP)水平与儿童肥胖症发病的关系.方法研究对象共121名,年龄2~6岁,男62名,女59名,其中肥胖儿童62名,正常对照儿童59名.采用ELISA方法检测血浆脂联素、ASP水平.结果(1)肥胖儿童血浆脂联素低于正常对照组(P<0.05);ASP高于正常对照组[(98.4±28.0)nmol/L vs(68.9±35.9)nmol/L,P<0.01].不同性别血浆脂联素、ASP水平差异无显著性;(2)肥胖儿童的血脂各指标与正常对照组相比,差异无显著性;(3)相关性分析:脂联素与BMI呈负相关(r=-0.35,P<0.05),与甘油三酯呈负相关(r=-0.51,P<0.01),与其他血脂指标无相关性;ASP与BMI呈正相关(r=0.51,P<0.01),除与游离脂肪酸呈正相关外(r=0.67,P<0.01),与其它血脂指标无相关性.结论在儿童肥胖症中,脂源性激素脂联素和ASP在血脂异常之前即有显著性变化.测定血浆脂联素和ASP水平为儿童肥胖症的防治提供新的检测指标.

    作者:卢慧玲;王宏伟;Katherine Cianflone;温宇;林汉华 刊期: 2004年第06期

  • 同型半胱氨酸及其相关酶基因多态性与糖尿病周围神经病变的关系

    研究对象为2型糖尿病(DM)有周围神经病变组(60例)、2型DM无周围神经病变组(46例)和正常对照组(50例).分别测定3组血浆同型半胱氨酸(Hcy),血清叶酸、维生素B12水平及Hcy代谢关键酶亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因型.结果显示,高Hcy及低叶酸、维生素B12水平与2型DM患者伴发周围神经病变相关,而MTHFR的基因多态性只与DM有关而与DM周围神经病变无相关性.

    作者:孙磊;陈丽;任建民;王德全;郑秀英;许玲 刊期: 2004年第06期

  • 白细胞介素1α、4、6、TNF-α基因多态性与桥本甲状腺炎的关系

    对中国山东地区汉族人群白细胞介素(IL)-1α、IL-4、IL-6、TNF-α基因多态性与桥本甲状腺炎(HT)的关联性进行研究.结果显示,HT组IL-4启动子区(-590)位置t等位基因频率明显低于对照组(0.060 vs 0.155,P<0.05),HT组IL-4(-590)c/t杂合基因型频率显著低于对照组(0.100 vs 0.250,P<0.05),HT组IL-1α、IL-6、TNF-α基因多态性与对照组比较差异无显著性.

    作者:蒋玲;龚莹;江维岩;曲卫;张晓黎;武传龙 刊期: 2004年第06期

  • 维吾尔族糖稳态受损人群心血管危险因素分析

    以口服葡萄糖耐量试验将313例研究对象分为正常糖耐量组、糖稳态受损(IGH)组和糖尿病组,研究维吾尔族IGH人群是否存在冠心病(CHD)危险因素.结果提示,其CHD危险因素主要是胰岛素抵抗及由此产生的高胰岛素血症.

    作者:张明琛;谢自敬;阿不力克木;伊力哈木;伊力多斯;卓士侠 刊期: 2004年第06期

  • 2004国际骨质疏松基金会大会简介

    国际骨质疏松基金会(IOF)是一世界性组织.现有包括从事基础研究的科学家、临床医生、患者协会和合作者在内的165个成员学会.

    作者:刘建民 刊期: 2004年第06期

  • 17β-雌二醇对人破骨样细胞RANK、CK mRNA表达的作用

    目的观察17β-雌二醇(17β-E2)对破骨样细胞破骨细胞分化因子受体(RANK)和组织蛋白酶K(CK)mRNA表达的影响.方法人巨细胞瘤组织经过滤、培养、洗涤、胰酶消化后再经孔径25μm微过滤网过滤,得到纯化的破骨样细胞,用RT-PCR观察17β-E2对人破骨样细胞CK及RANK mRNA表达的影响.结果(1)破骨样细胞具有成熟破骨细胞的表型特征,如抗酒石酸酸性磷酸酶和酸性磷酸酶染色阳性、具有溶骨作用,可表达CK和RANK;(2)17β-E2对人破骨样细胞RANK mRNA表达无明显影响,但下调CK mRNA表达(P<0.05).结论破骨样细胞是进行破骨细胞研究的较好细胞来源;17β-E2可下调破骨样细胞CK mRNA表达.下调CK基因表达是绝经后雌激素补充治疗的药理机制之一.

    作者:王运林;廖二元;向光大;周后德;彭依群;肖涛 刊期: 2004年第06期

  • iNOS基因微卫星多态性与中国汉族人群糖尿病肾病相关

    诱导型一氧化氮合酶(iNOS)基因(CCTTT)14等位基因频率在糖尿病肾病组(0.044)显著低于糖尿病无肾病组(0.170,P<0.01)和对照组(0.143,P<0.05),提示iNOS基因(CCTTT)n微卫星多态性与中国汉族2型糖尿病肾病有关.

    作者:张政;彭惠民;张素华;郭风劲;晏宁 刊期: 2004年第06期

  • IA-2A与GADA检测对1型糖尿病的诊断价值

    目的了解蛋白酪氨酸磷酸酶抗体(IA-2A)与谷氨酸脱羧酶抗体(GADA)在1型糖尿病(DM)中的检出率及其诊断价值.方法采用放射配体法检测114例1型DM患者及188名正常对照者IA-2A与GADA水平,并以放免法检测1型DM患者空腹C肽(FCP)、甲状腺球蛋白抗体(TGAb)与甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)水平.结果(1)1型DM患者中GADA、IA-2A检出率分别为49.1%(56/114)和24.6%(28/114),高于正常对照1.1%与0.6%(均P<0.01).15岁以下、病程≤0.5年的1型DM患者GADA、IA-2A检出率分别为66.7%(8/12)和58.3%(7/12),与白种人(56.0%~82.0%与56.4%~74.4%)比较,GADA差异无显著性;而IA-2A仅低于检出率高的国家芬兰(85.7%,P<0.01);(2)15岁以下与15岁以上1型DM组GADA阳性率分别为61.8%(21/34)和43.8%(35/80,P>0.05);而IA-2A阳性率分别为41.2%(14/34)和17.5%(14/80,P<0.01).病程1年以内与病程1年以上1型DM患者GADA阳性率分别为56.4%(31/55)与42.4%(25/59,P>0.05);而IA-2A阳性率分别为34.5%(19/55)对15.2%(9/59,P<0.05);(3)1型DM中GADA和IA-2A阳性患者与GADA和IA-2A阴性患者比较,FCP水平较低(均P<0.01);(4)单纯GADA阳性患者中甲状腺自身抗体检出率为38.5%(15/39),高于单纯IA-2A阳性患者的0%(0/9,P<0.05);(5)1型DM患者IA-2A与GADA联合检测检出率为58.8%,而病程1年内1型DM患者达69.1%,均高于IA-2A单一抗体检测的阳性率(P<0.01).结论(1)中国儿童新发1型DM患者IA-2A与GADA检出率与欧美白种人接近;IA-2A阳性率受发病年龄及病程影响较大,而GADA受其影响小;(2)GADA或IA-2A阳性预示1型DM患者胰岛β细胞功能更差;IA-2A是一个比GADA更特异的胰岛自身免疫指标;(3)GADA和IA-2A联合检测可提高自身免疫性1型DM诊断的敏感性.

    作者:王建平;周智广;黄干;邝建;金萍;邓志明;张弛;张冬梅 刊期: 2004年第06期

  • 2型糖尿病对急性冠状动脉综合征患者血钾的影响

    目的对比分析2型糖尿病患者与非糖尿病患者在急性冠状动脉综合征(ACS)早期血钾水平的变化.方法对1999年1月至2003年3月进行急诊冠状动脉介入治疗的连续745例ACS患者,以症状持续时间、2型糖尿病和院前β-受体阻滞剂使用进行分层.结果2型糖尿病ACS患者的血清钾水平较非糖尿病ACS患者明显高[(4.34±0.48)mmol/L vs(4.00±0.52)mmol/L,P<0.05].多变量分析表明,2型糖尿病是血清钾水平的独立预测因素(OR 1.70,95% CI:1.40~2.10,P<0.01).非糖尿病ACS患者在发病6 h内血钾水平随症状持续时间进行性升高[≤2 h:(3.61±0.51)mmol/L;2~4 h:(4.10±0.45)mmol/L;4~6 h:(4.22±0.51)mmol/L(与≤2 h比,均P<0.01)],2型糖尿病或院前服用β-受体阻滞剂治疗患者这种趋势不明显.结论在ACS早期,2型糖尿病患者不出现非糖尿病患者的早期血钾降低,反映了2型糖尿病患者存在交感神经功能障碍.

    作者:张永珍;李海燕;毛节明;陈明哲 刊期: 2004年第06期

  • 上海市6~18岁儿童青少年体重指数的分布特征

    目的研究上海市6~18岁儿童青少年体重指数(BMI)的分布特征.方法采用整群系统抽样的方法抽取上海市区二个区,普查所有中小学学生共70 431名的身高体重,分析BMI的年龄别分布特点,并与美国疾病控制中心(CDC)2000年儿童青少年BMI的标准进行比较.结果(1)研究人群中男性BMI显著高于女性(P<0.01).(2)研究对象的各百分位数呈现男高女低的特点,BMI的增幅在7~16岁间较为明显,16岁后BMI增幅减小.(3)在18岁时,男性BMI的P85为25.0 kg/m2,P95为28.2 kg/m2;女性BMI的P85为23.3 kg/m2,P95为25.7 kg/m2.(4)上海男性儿童青少年BMI的分布曲线与美国CDC标准的比较,P85、P95在16岁前要高于美国标准,随后低于美国标准;女性BMI在10岁前与美国标准基本接近,但在10岁后美国儿童即开始超过上海儿童.结论上海儿童青少年的BMI分布特征与国外有较大的不同,特别是16岁后的BMI增长情况差异更大,因此,制定适合我国民族特征的BMI是我国未来儿童青少年肥胖防治工作的重要一环.

    作者:罗飞宏;沈水仙;屠月珍;夏红;支涤静;姚经建;孙兰;洪庆荣;叶江枫;赵诸慧;徐秀;郭志平 刊期: 2004年第06期

中华内分泌代谢杂志

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主办:中华医学会