学术投稿

广州市登革1型病毒基因组测序及系统进化分析

文金生;江丽芳;晏辉钧

关键词:登革病毒, 测序, 系统进化分析
摘要:目的:对引起2002年广州登革热的登革1型病毒分离株(71/02GZ)进行全基因组测序和系统进化分析.方法:采用C6/36细胞培养71/02GZ,分别采用RT -PCR,5'RACE和3'RACE扩增基因组中编码区序列、5'和3 '末端非编码区序列,PCR产物克隆到载体并测序,拼接成全基因组序列,分别基于 E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016nt进行系统进化分析.结果:71/02GZ株基因组全长10735 nt,两端非编码区(NCR)长度分别为94 nt和462 nt.基于E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016 nt的进化分析结果显示71/02GZ株和2002年广州分离株(GZ01/02,GZ/218/2002),1995 年广东分离株(GD23/95,GD01/95)、1995年广州分离株(GZ01/95)组成一个基因型;而1999年广东分离株(GD05/99),1997年广东分离株(GD14/97)和1980年广州分离株(GZ/80)属于另一个基因型;另外,71/02GZ株同1998年印度尼西亚分离株(98901530 DF DV-1-ID)的同源性高.结论:71/02GZ株可能是印度尼西亚输入的.
温州医科大学学报杂志相关文献
  • 颞下颌关节紊乱病的物理治疗效果观察

    颞下颌关节紊乱病(TMD)是口腔颌面部的常见病和多发病.主要表现为颞颌关节运动障碍,开口和咀嚼时关节疼痛,张口受限或偏斜,关节弹响,咀嚼肌酸胀无力,常同时伴有头痛、头晕、耳鸣等症状.既可单侧发病,也可双侧同时发病.多属关节功能失调,但极少数病例也可发生器质性改变.症状易反复发作,不易治愈.我科应用物理疗法(超短波/中频电流/TDP)治疗颞下颌关节紊乱病取得的较好疗效,现介绍如下.

    作者:鲁月红 刊期: 2009年第06期

  • 负重位全下肢摄片技巧及影响因素

    目的:探讨数字化负重位全下肢优质X线片的影响因素.方法:用西门子500MA-X线机,根据关节畸形或下肢不等长患者下肢长度采用2~3个14×17in暗盒-IP板对其进行X线投照,经过后处理得到负重位全下肢X线片,分析和总结对下肢全长X线片质量的影响因素.结果:通过正确选择、放置暗盒-IP板及摄影体位,选择合适的摄影条件,合理使用CR系统后处理功能,获得优质负重位全下肢X线片,骨盆至踝关节影像均清晰完整显示在同一胶片上,影像质量完全满足临床对下肢力线、长度的测量要求. 结论:影响数字化负重位全下肢X线片质量的因素有:摄影体位、摄影条件、暗盒 -IP板、CR后处理功能等.

    作者:赵晓君;章智敬;白光辉;虞志康;张弦 刊期: 2009年第06期

  • 高白细胞急性白血病并发急性呼吸窘迫综合征的护理

    急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory dis-tress syndrome,ARDS)是一种由多种疾病引起的综合征,其基本表现是非心源性肺水肿,导致严重低氧、危及生命的呼吸衰竭,病死率高达50%~70%[1].而高白细胞急性白血病(hyperleucytic acute leukemia,HLAL)是指初诊时外周血白细胞大于100×10 9单位的白血病,为一高危组白血病,其并发ARDS时,预后极差,患者可迅速死于呼衰.2004年5月至2008年5月我院诊治10例HLAL 并发ARDS患者,现将护理体会总结如下.

    作者:杨爱弟;孙文瑞;王海治;杜英美;田园 刊期: 2009年第06期

  • 实时荧光定量RT-PCR检测人外周血单个核细胞中 FOXP3 mRNA的表达

    目的:建立实时荧光定量逆转录 -多聚酶链反应(real-time fluorescence quantitative RT-PCR)检测人外周血单个核细胞中FOXP3 mRNA的方法,并研究其与CD4+CD25+ Treg细胞活性相关性.方法: 提取人外周血单个核细胞总RNA,将mRNA逆转录成cDNA,以 β-actin为内参照,实时荧光定量RT-PCR检测29例哮喘患儿及24例同龄对照FOXP3 mRNA的相对表达量,采用融解曲线和琼脂糖电泳鉴定PCR产物特异性;同时采用流式细胞技术检测CD4+CD25 +Treg细胞含量,分析两者相关性.结果:哮喘患儿组 CD4+CD25+Treg细胞百分率明显低于同龄对照组, P<0.01;FOXP3 mRNA的表达也显著降低,P<0.05;FOXP3和β-actin的融解曲线分析表明均仅有单一峰,Tm值分别为82.4℃和87.8℃;琼脂糖电泳显示都仅有单一扩增产物.结论:应用SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR技术检测FOXP3 mRNA表达水平简便易行、结果稳定可靠.初步结果证实,外周血CD4 +CD25+Treg细胞数量和FOXP3 mRNA表达有相同的趋势,存在一定的相关性.

    作者:蒋卫平;丁茂文;朱亚非;李冰;朱晚林;李欣华;林菲菲 刊期: 2009年第06期

  • 血尿酸水平与不同病因分型脑梗死发病及预后的关系

    目的:探讨高尿酸血症与不同病因分型脑梗死发病的关系;探讨脑梗死急性期血尿酸水平与脑梗死发病后3个月预后的关系.方法:选取在我院住院治疗的脑梗死患者405例.在血尿酸水平与脑梗死发病关系研究中,按照患者是否为动脉粥样硬化性脑梗死进行分组,在预后关系研究中按照3个月随访的 mRS评分进行分组.统计方法采用单因素分析和多因素分析相结合的方法,其中多因素分析采用logistic 回归分析.结果:与动脉粥样硬化性脑梗死发病有关的因素为年龄、高尿酸血症、高血压、糖尿病,其中,高尿酸血症的OR值为4.764;与脑梗死3个月预后有关的因素为年龄、NIHSS评分和卒中并发症,尽管血尿酸水平在单因素分析时有意义,但在多因素分析时未达到统计学显著性.结论:高尿酸血症是动脉粥样硬化性脑梗死的一个独立危险因素.急性期血尿酸水平尚不能作为脑梗死3个月预后的独立预测因子.

    作者:冯靓;韩钊;张征;臧秋玲;叶祖森;王苹莉 刊期: 2009年第06期

  • 应用硅胶输液袋分期治疗新生儿腹裂

    新生儿腹裂是新生儿较少见且危重的先天性畸形,尤其是无法一期回纳的新生儿腹裂及合并有其他畸形的病例,有较高的病死率.近年来,由于手术方式的改进,加之重症监护病房(ICU)及完全胃肠外营养(TPN)的发展,手术成功率逐年上升.我院自2003年以来共收治新生儿腹裂10例,采用硅胶输液袋分期修复术,治愈8例,报告如下.

    作者:诸建明;乔键;鲍建华;李勇;陈君贤 刊期: 2009年第06期

  • 先天性肺囊性腺瘤样畸形Ⅱ型1例并文献复习

    目的:探讨先天性肺囊性腺瘤样畸形的临床表现、病理分型、预后及其发病相关因素.方法:结合临床资料,通过尸体解剖,观察肺脏的大体及镜下形态学改变,并采用免疫组化EnVision二步法检测病变肺组织内细胞角蛋白7(CK7)、甲状腺转录因子1(TTF -1)的表达情况并文献复习.结果:肺体积明显增大,切面密布大小不等的囊腔.镜下大囊肿内衬单层柱状纤毛上皮或假复层纤毛柱状上皮;小囊肿内衬单层立方上皮,大量增生的小囊肿形成腺瘤样结构.囊腔之间可见相对正常的肺小叶.囊壁内衬上皮细胞CK7 (+).囊壁的部分柱状上皮、立方上皮细胞TTF-1(+).结论:先天性肺囊性腺瘤样畸形的预后与其病理分型有关,CK7的表达、TTF1的部分表达可作为先天性肺囊性腺瘤样畸形Ⅱ型的辅助诊断.

    作者:董春鸽;郑海红;吴亮;牛三强;陈国荣 刊期: 2009年第06期

  • 贝复济喷剂外用对深Ⅱ度烧伤创面愈合时间的影响

    目的:通过对深II度烧伤创面愈合时间的临床观察及相关对比分析,探讨贝复济喷剂(b -FGF)外用对创面愈合时间的影响.方法:选择本院1999年1月至2006年6月188例单纯小面积深Ⅱ度烧伤患者,以不同时期应用的烧伤创面外用药作为对照,并分A、B、C三组,观察并分析贝复济喷剂外用对烧伤创面愈合时间的影响.结果:2005年7月-2006年6月,合理使用贝复济组,深Ⅱ度烧伤创面愈合时间缩短为(16.76±1.61)d,未使用贝复济组,深Ⅱ度烧伤创面愈合时间为(21.79 ± 3.93)d.结论:单纯深Ⅱ度烧伤创面外用贝复济喷剂能明显缩短创面愈合时间,疗效确切.

    作者:徐建军;王宏清;耿武军;林才 刊期: 2009年第06期

  • 温州地方株HPV16型L1基因多态性及蛋白特性分析

    目的:了解温州地方株HPV16 L1基因结构特点,分析其结构蛋白L1基因多态性及蛋白特性变化,为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据.方法:设计HPV16型L1基因特异性引物,从宫颈癌组织标本提取DNA,进行PCR扩增鉴定,PCR产物直接测序;进一步用Vector NTI 8.0和DNAStar软件分析HPV16型L1基因多态性及蛋白特性变化情况.结果:测定的序列与标准基因序列(NC 001526)比较,温州地区宫颈癌感染的HPV16型L1基因同源性为99.1%~99.8%,分别形成8种突变模式,其中3 处由于核苷酸的改变,翻译的氨基酸也相应发生变化,但其编码蛋白在亲水性、表面可及性及抗原性上与标准株相比较无明显变化.结论:温州地方株HPV16 L1核酸有一定程度的变异.

    作者:陈俊;董海艳;朱珊丽;欧琴;张丽芳 刊期: 2009年第06期

  • 急性肝衰竭大鼠肝组织中钙蛋白酶/钙蛋白酶抑制蛋白的表达及乌司他丁对其的影响

    目的:探讨钙蛋白酶/钙蛋白酶抑制蛋白在急性肝衰竭模型中的表达情况及乌司他丁对其表达的影响.方法:通过腹腔注射D-氨基半乳糖(D-Gal)及脂多糖(LPS)建立大鼠急性肝衰竭模型.大鼠随机分为对照组、模型组及乌司他丁干预组.采用免疫组织化学方法检测钙蛋白酶/钙蛋白酶抑制蛋白表达情况.结果:D-Gal/LPS联合注射成功诱导大鼠急性肝衰竭模型,与对照组相比,模型组钙蛋白酶及钙蛋白酶抑制蛋白表达增加(P<0.05),但经乌司他丁干预后,钙蛋白酶表达较模型组明显减少( P<0.05),而钙蛋白酶抑制蛋白的表达无明显变化( P>0.05).结论:乌司他丁可能通过抑制钙蛋白酶活性,同时保持钙蛋白酶抑制蛋白活性,从而减轻肝脏炎症损伤.

    作者:商振球;陈永平;谷甸娜 刊期: 2009年第06期

  • 单纯性肥胖男性儿童血清瘦素与胰岛素、雌二醇、睾酮的分析

    目的:探讨单纯性肥胖男性儿童血清瘦素(leptin)与胰岛素(Ins)及性激素雌二醇(E2)、睾酮 (T)的水平及其对性发育的影响.方法:测定各年龄组120例肥胖及120例正常的男性儿童血清的leptin 及Ins,E2,T水平,进行比较并行相关性分析.结果:学龄前肥胖儿童与正常儿童比较,leptin,Ins有显著增高(P<0.01),而两组E2,T水平差异无显著性( P>0.05);青春早期、青春期肥胖儿童与正常儿童比较,leptin,Ins,E2有显著增高( P<0.01),而T降低(P<0.05).肥胖儿童血清leptin与Ins呈正相关(r=0.547,P<0.01),而leptin与T呈负相关( r=0.351,P<0.05);正常儿童leptin与各指标无明显相关(P>0.05).结论:单纯性肥胖儿童血清leptin和Ins同时升高,存在leptin抵抗、Ins抵抗;青春期肥胖男童leptin,E2升高,而T降低,存在性激素代谢紊乱,leptin可能影响男性肥胖儿童的性激素水平.

    作者:施灵敏;宫剑;金献江 刊期: 2009年第06期

  • 磁共振水成像技术在动态磁共振子宫输卵管造影的应用

    目的:探讨磁共振水成像技术(magnetic resonance hydrograph,MRH)在动态磁共振子宫输卵管造影(dynamic MR hysterosalpingography,dMR-HSG)中临床价值.方法:对17例不孕女性患者先后行dMR-HSG和传统X线子宫输卵管造影术(hysterosalpingography, HSG)检查.常规MRI扫描包括横轴位T1WI,横轴位和冠状位脂肪抑制T2WI;在MR磁体内通过导管向宫腔内注射0.9%生理盐水后,利用单次激发厚层投射(single shot fast spin-echo,SS-FSE)水成像技术进行动态子宫输卵管造影.结果:所有患者均能顺利完成两项检查,dMR-HSG能观察盆腔结构、子宫腔、黏膜、肌层及卵巢结构;dMR -HSG表现为双侧输卵管阻塞者4例,输卵管单侧阻塞者5例,子宫、输卵管正常者8例.传统X线检查示左侧输卵管不通,dMR-HSG提示两侧输卵管通畅者1例,其余病例dMR -HSG和传统X线HSG两侧输卵管通畅性诊断结果基本一致.结论:dMR-HSG图像结合常规MRI不仅能显示输卵管结构,还能显示盆腔病变,有助于不孕症的病因诊断.

    作者:朱姬莹;王美豪;闻彩云;许云萍;史蓓蓓;张孝琴;李建策;吴恩福 刊期: 2009年第06期

  • 口服结肠靶向载体研究应用进展

    口服结肠靶向给药系统(oral colon targeting-drug delivery system,OCTDS)是20世纪90年代后期发展起来的充分利用结肠特殊的生理特点(pH梯度、小肠相对稳定的转运时间、高浓度微生物及特殊酶、结肠内的较大的压力)的新型给药方式.

    作者:周志彩;赵应征 刊期: 2009年第06期

  • 改革研究生教育二级管理工作的几点思索与实践

    近几年,我国研究生教育规模不断扩大,研究生连年扩招,在校研究生人数逐年增加.具不完全统计,全国在校研究生人数1998年为19.9万人,2001年为39.25万, 2003年为49万,2004年是81.99万,2005年为98万,2008年研究生在校人数已经超过150万人.我国研究生教育规模已经仅次于美国,成为第二大研究生教育国家,也成为真正意义上的研究生教育大国.但是,随着研究生教育规模的不断扩大以及研究生教育类型的不断多元化,在校研究生的教育管理矛盾也日益突出,如何在保证研究生教育质量的前提下,充分利用高校现有的教学科研资源,更好地施行研究生管理工作,提高研究生教育和管理的质量,已经成为许多研究生院校管理部门所面临的一项紧迫而重大的任务之一.

    作者:邵凯隽 刊期: 2009年第06期

  • 广州市登革1型病毒基因组测序及系统进化分析

    目的:对引起2002年广州登革热的登革1型病毒分离株(71/02GZ)进行全基因组测序和系统进化分析.方法:采用C6/36细胞培养71/02GZ,分别采用RT -PCR,5'RACE和3'RACE扩增基因组中编码区序列、5'和3 '末端非编码区序列,PCR产物克隆到载体并测序,拼接成全基因组序列,分别基于 E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016nt进行系统进化分析.结果:71/02GZ株基因组全长10735 nt,两端非编码区(NCR)长度分别为94 nt和462 nt.基于E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016 nt的进化分析结果显示71/02GZ株和2002年广州分离株(GZ01/02,GZ/218/2002),1995 年广东分离株(GD23/95,GD01/95)、1995年广州分离株(GZ01/95)组成一个基因型;而1999年广东分离株(GD05/99),1997年广东分离株(GD14/97)和1980年广州分离株(GZ/80)属于另一个基因型;另外,71/02GZ株同1998年印度尼西亚分离株(98901530 DF DV-1-ID)的同源性高.结论:71/02GZ株可能是印度尼西亚输入的.

    作者:文金生;江丽芳;晏辉钧 刊期: 2009年第06期

  • EphrinA1基因小干扰RNA的构建及其在Huh-7细胞中的沉默效应

    目的:构建针对EphrinA1基因的发夹状RNA(ShRNA)表达载体pSilencer2.1 -EphrinA1-SiRNA,观察其对人肝癌细胞Huh-7中EphrinA1基因表达的特异性抑制效应.方法:设计合成针对EphrinA1 mRNA的RNAi核苷酸片段,并定向克隆到pSilencer2.1-U6载体中,构建重组质粒pSilencer2.1 -EphrinA1- SiRNA,同时构建不针对任何序列的重组质粒pSilencer2.1 -EphrinA1-ScrRNA,通过脂质体介导转染入Huh-7细胞,应用逆转录聚合酶链反应检测小干扰RNA的沉默效应.结果:酶切鉴定证实pSilencer2.1-EphrinA1-SiRNA和pSilencer2.1 -EphrinA1-ScrRNA重组质粒构建成功,转染Huh-7细胞后,pSilencer2.1 -EphrinA1-SiRNA组EphrinA1 mRNA表达较pSilencer2.1-EphrinA1-ScrRNA组和空白对照组明显下调,差异有统计学意义(P<0.05).结论:pSilencer2.1 -EphrinA1-SiRNA载体的成功构建为下一步研究以EphrinA1基因为靶位点的肝细胞癌基因治疗奠定了重要的实验基础.

    作者:王怡;陈钢;陈必成;刘佳明;黄陈平 刊期: 2009年第06期

  • 《温州医学院学报》1959-2008年论文核心作者统计与分析

    目的:进一步了解<温州医学院学报>(以下简称<学报>)核心作者情况.方法:采用文献计量学方法,统计<学报>1959-2008年载文作者的篇数及分布情况.统计指标包括作者发文数量、合作情况、机构分布、核心作者;根据中国期刊全文数据库和中国期刊引文数据库检索统计<学报>1979 年至2008年论文所有署名作者的人数及署名次数及其排序.结果:<学报>1959-2008年刊载作者署名论文4913篇,共有署名作者14 657人次,合作度为2.98,其中独著论文1266篇,占25.77%;合著论文 3647篇,合作率为74.23%.论文作者的机构分布:温州医学院附属第一医院占27.8%,温州医学院附属第二医院占23.6%,温州医学院校本部占26.1%,其他单位占22.5%.结论:<学报>有一支稳定的作者队伍,论文作者的合作度和合作率较高,表明论文涉及的学科群体研究及合作能力较强.

    作者:毛文明;胡苗苗;丁敏娇;郑俊海 刊期: 2009年第06期

  • 130例腔镜甲状腺良性肿瘤手术治疗体会及方法改进

    目的:探讨经乳晕入路腔镜甲状腺良性肿瘤手术的手术方法及疗效.方法:回顾分析2004年1月-2008年12月间,由同一组医师完成的130例经乳晕入路腔镜甲状腺良性肿瘤手术的临床资料.按手术方式改进前后分为2组(A组、B组),A组30例,B组100例,比较两组的手术时间、出血量、术后引流量、术后住院时间和并发症.结果:130例患者均顺利进行腔镜下甲状腺肿瘤切除术,3例出现术后喉返神经暂时性损伤,6例皮下瘀斑.B组的手术时间及术中出血量明显少于A组( P<0.05),两组间的术后并发症发生率均未见统计学差异( P>0.05).结论:腔镜甲状腺良性肿瘤手术安全可靠,具有良好的美容效果,改进手术操作步骤后可缩短手术时间,减少出血量,具有推广价值.

    作者:殷凯;徐鲁白;周斌;王继生;许家;胡海;蔡景理 刊期: 2009年第06期

  • 传承历史,与时俱进——《温州医学院学报》50年发展历程回顾

    在纪念<温州医学院学报>创刊50年之际,对<温州医学院学报>的发展历程进行回顾,简要叙述了<温州医学院学报>不同发展时期的办刊经历及主要成绩,并对影响力进行初步分析,为<温州医学院学报>的未来发展提供借鉴.

    作者:郑俊海 刊期: 2009年第06期

  • 天然高产脂肪酶细菌的分离鉴定及脂肪酶基因的分析

    目的:从环境中分离高产脂肪酶的细菌,并克隆其脂肪酶基因.方法:从天然高油脂含量土壤筛选高产脂肪酶的细菌,鉴定菌种后,设计相应引物PCR扩增脂肪酶基因并进行TA克隆,重组载体转入E.coli DH5α构建工程菌,双酶切及测序鉴定脂肪酶基因.结果:经过微生物菌种鉴定获得4株高活力菌,其中一株金葡菌产酶高,利用PCR技术成功扩增脂肪酶基因,该基因经过克隆测序及其双酶切鉴定证实为新发现的突变脂肪酶基因,其二级结构与标准基因(EU310372)有较大不同.结论:成功分离一株高产脂肪酶的菌株--金黄色葡萄球菌,克隆的脂肪酶基因为新发现的突变型.

    作者:张迎光;施晓聪;林全思;王震;吕建新 刊期: 2009年第06期

温州医科大学学报杂志

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