学术投稿

小鼠肺钩虫感染基因表达谱的生物信息学分析一种系效应

刘华;马文丽;丁大鹏;柯杰兵;郑文岭

关键词:GeneSifter软件, 基因表达谱, 肌萎缩侧索硬化
摘要:目的 从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS的新靶点.方法 通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染的微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA的统计学方法对数据聚类,并结合Gene Ontology和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应的517个差异基因(P<0.001).结果 显示ALS的信号转导通路在两组小鼠间差异具有统计学意义(Z2),与Th2反应相关的多个基因对ALS的代谢异常具有保护作用.结论 筛选出的3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化的新候选基因.
热带医学杂志相关文献
  • 缬沙坦治疗高血压病并逆转左心室肥厚改善心功能的临床研究

    目的 评估缬沙坦治疗高血压病的降压效果、安全性与逆转高血压心肌肥厚和改善心功能的疗效.方法 以氨氯地平为对照药物,在老年性轻、中度高血压患者中进行随机、平行对照的临床研究.结果 缬沙坦组患者治疗4周总有效率为60.8%(45/74),降压幅度15.6/10.9 mmHg;治疗24周后总有效率为78.4%(54/74),降压幅度21.1/17.9 mmHg.缬沙坦组治疗24周后在逆转高血压心肌肥厚中取得满意的疗效,能显著逆转左室肥厚(LVH),左室后壁厚度(PWT),室间隔厚度(IVST),降低左室重量指数(LVMI),且缬沙坦组能有效地改善心功能,经治疗后患者的心脏每分输出量(CO)、左室射血分数(LVEF)、舒张早期与舒张晚期峰值流速的比值(E/A)、E峰减速度(Ede)均不同程度得到改善;缬沙坦组患者血尿酸、C-反应蛋白较治疗前明显下降,不良反应率为8.1%,主要是面红、头昏及心悸.心率、血生化、肝肾功能无明显变化.结论 缬沙坦降压疗效好,且能逆转左心室肥厚,改善心功能,不良反应少,可作为治疗老年性轻、中度高血压伴左心室肥厚的一线药物.

    作者:李挺;廖(钅监)能;张建华;邵丽香 刊期: 2008年第05期

  • 抗病毒护肝治疗对乙肝合并肺结核患者抗结核的作用分析

    目的 乙型肝炎合并肺结核的患者在抗结核化疗过程中,辅以护肝、抗病毒治疗的效果观察.方法 将乙型肝炎合并肺结核患者经抗结核治疗后肝功能异常的患者96例,随机分为3组:抗病毒治疗+抗结核治疗组(A组)、护肝治疗同时抗结核治疗组(B组)、单纯抗结核组(C组),观察肝脏炎症反应情况.结果 抗病毒组ALT和T-Bil高于B组,但两者差异无统计学意义(P0.05),C组ALT和T-Bil明显高于A组和B组,差异有统计学意义(P<0.05);C组停药率明显高于其它两组,差异有统计学意义(P<0.05),A组停药率略高于B组,但两者差异无统计学意义(P0.05);3组肝脏病理炎症分级:C组明显高于A组和B组,差异有统计学意义(P<0.05).结论 肝脏炎症是引起不能继续抗结核的主要因素,而乙肝病毒感染只是其中一种因素.

    作者:潘越峻;范慧敏;张春兰;卢峰岳 刊期: 2008年第05期

  • 小鼠肺钩虫感染基因表达谱的生物信息学分析一种系效应

    目的 从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS的新靶点.方法 通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染的微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA的统计学方法对数据聚类,并结合Gene Ontology和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应的517个差异基因(P<0.001).结果 显示ALS的信号转导通路在两组小鼠间差异具有统计学意义(Z2),与Th2反应相关的多个基因对ALS的代谢异常具有保护作用.结论 筛选出的3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化的新候选基因.

    作者:刘华;马文丽;丁大鹏;柯杰兵;郑文岭 刊期: 2008年第05期

  • 血吸虫病免疫病理研究进展

    血吸虫病主要病理变化是宿主肝组织内虫卵的沉积诱发虫卵肉芽肿及其后的纤维化病变.在动物模型的相关研究已显示Th1细胞主要参与血吸虫虫体抗原的免疫调节反应,而虫卵衍生抗原主要介导Th2细胞免疫反应.研究证明Th1细胞、Th2细胞、巨噬细胞、Treg细胞和IL-17分泌型淋巴细胞对调节虫卵肉芽肿反应和肝脏的纤维化过程起重要作用.

    作者:马铁军;王坤平;顿国栋;张锡林 刊期: 2008年第05期

  • 利用昆虫学推断死亡时间1例分析

    1 案例资料1.1 简要案情2007年3月7日,在一烂尾楼西侧楼梯一楼至地下室的楼梯上发现一具尸体.

    作者:余礼聪;吕国丽;王江峰 刊期: 2008年第05期

  • HBsAg阴性preS1Ag阳性的HBV携带者HBV S基因多态性分析

    目的 探讨HBsAg(-)/HBeAg(+)/HBcAb(+)/preS1Ag(+)少见血清学模式形成的原因.方法 采用聚合酶链反应(PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、异源双链分析(HA)和基因测序的方法,对该少见模式乙肝病毒携带者HBV S基因进行分析,并与其母亲及参考序列HBV S基因进行比较,分析其变异情况.结果 该少见模式乙肝病毒携带者与其母亲HBV S基因PCR扩增结果均为阳性,经SSCP、HA和核苷酸序列比对分析.两者HBV S基因多态性不明显,同源性为99.82%.与其母亲或参考序列(AF411409)比对,该少见模式乙肝病毒携带者HBV S基因在第353位由野生型的C变为A,从而使HBsAg 118位氨基酸由苏氨酸变为赖氨酸(aa118T→K).结论 该少见模式乙肝病毒携带者所感染的HBV在HBsAg第118位氨基酸上错义突变(T→K),改变了HBsAg的空间结构和抗原性,影响了HBsAg与抗-HBs的结合能力.

    作者:祝玲玲;朱平安;梁汉章;赖秀花;张松;谭萍;汪世平 刊期: 2008年第05期

  • 江门成人散发急性腹泻者星状病毒的检测及毒株型别分析

    目的 研究江门地区成人腹泻者星状病毒感染情况及型别特点.方法 收集江门地区病毒性腹泻流行期散发成人腹泻患者粪便标本,经胶体金法、RT-PCR法分别检测轮状病毒和诺如病毒后,运用实时荧光PCR进行星状病毒检测,并对阳性标本进行RT-nested PCR测序,鉴定型别.结果 56份成人病毒性腹泻粪便标本中,荧光PCR法测出3份星状病毒株(5.4%),经RT-PCR测序1份,序列分析鉴定为HAtsV-4型.结论 江门成人散发病毒性腹泻者存在星状病毒感染,型别为HAstV-4,未发现多致泻病毒混合感染.

    作者:徐巧华;唐亚丽;聂军;蔡练功;李建栋;戴迎春;陈清;俞守义 刊期: 2008年第05期

  • 番禺区2006-2007年狂犬病流行病学分析

    目的 了解番禺区狂犬病门诊暴露人群的流行病学特征,为制定狂犬病预防策略提供科学依据.方法 对2006-2007年在狂犬病预防门诊接受诊治的狂犬病门诊暴露人群进行描述性流行病学分析.结果 2006-2007年番禺区共报告狂犬病暴露者19 532人,两年均无因本地动物伤害而引起的狂犬病病例报告.动物伤人一年四季均可发生,其中以7~10月相对较多,第三季度共发生5 574例.暴露者中男性占56.43%,女性占43.57%.所有暴露者中15~44岁占51.22%.中心城区的暴露水平较周边地区高.伤人动物以犬为主,占87.82%,受伤部位以下肢为主共10 190例,占52.17%,暴露人员中以Ⅱ度暴露多共18 193例,占93.14%.结论 当前控制狂犬病流行需加强养犬管理,有效地降低人群狂犬病暴露水平:加强狂犬病防治等相关知识的宣传教育,提高人群的自我保护意识等综合措施,以控制狂犬病的发生.

    作者:陈光艳;许晓茵;李伟强 刊期: 2008年第05期

  • 抗结核分支杆菌治疗对难治性视神经脊髓炎转归的相关性研究

    目的 本研究旨在探讨难治性视神经脊髓炎(NMO)的治疗方法,以及与结核分支杆菌的相关性.方法 本研究对13例激素治疗无效的视神经脊髓炎的病人进行了前瞻性的研究.治疗前均进行磁共振和腰穿检查,脑脊液进行常规检查和应用巢式PCR监测分支杆菌MPB-64基因,治疗前应用EDSS对病人的伤残程度进行评分.进行抗结核诊断性治疗.并进行长期随访和观察.结果 所有的病人在治疗前脊髓MR均有超过3个脊髓阶段的异常信号.EDSS评分在4.5~9;视敏度均有明显下降.巢式PCR扩增结核杆菌基因有3个病人呈阳性结果.病人对抗结核治疗反应良好,治疗后EDSS评分逐步下降,脊髓内的异常信号在治疗后逐渐消退,视力改善.结论 本研究显示结核分支杆菌感染在NMO的发生、发展过程中可能起着重要作用.鉴于该病预后差,以及抗结核治疗在本研究中令人鼓舞的效果,作者认为在激素治疗无效时,应为病人进行诊断性抗结核治疗.

    作者:丰岩清;国宁;陈曦;周畅;孙巧松 刊期: 2008年第05期

  • 骨灵片对去势大鼠骨小梁三维结构/骨强度的干预研究

    目的 通过观察补肾中药骨灵片对骨质疏松大鼠腰椎松质骨二维平面和三维结构的改变以及对骨强度的影响,进一步探讨骨灵片抗骨质疏松的作用机制.方法 选取3月龄SD雌性大鼠18只,随机分为假手术组,去卵巢组,骨灵片低、中、高3个剂量组(根据人鼠剂量换算标准),以雌激素为对照组.通过硬组织切片观测二维形态计量学.在其基础上利用连续切片摄像及图像数码处理技术重建腰椎骨小梁的空间结构.结合计算机3D-Doctor软件测量相关三维参数.结果 去势后的模型组较之假手术组,骨小梁分离度明显升高,其余参数均显著下降(P<0.01);经骨灵片干预后的各组与去卵巢组比较可见,骨灵片各剂量组的骨小梁厚度显著增加,低剂量组对于骨小梁的面积百分数无明显增高,中、高剂量组在骨小梁数量、面积百分数、分离度上的改善较低剂量组显著.三维重建后的结果显示,高剂量组的骨小梁体积百分数和各剂量组的体元总数明显升高(P<0.01);骨灵片组与雌激素对照组相比,中剂量组在骨小梁厚度、体积百分数上的增加有显著差异(P<0.05),高剂量组的体元总数显著升高(P<0.01);相关分析显示三维体元总数及骨小梁体积百分比与二维骨小梁面积百分数、骨小梁厚度、骨小梁数量呈显著正相关,与骨小梁分离度呈明显负相关.各组骨小梁体积百分数在三维重建前后无显著差异(P0.05).结论 构建的三维模型结合相关参数测量的结果反映出模型组在骨小梁结构上存在典型的骨质疏松改变;经骨灵片干预后的大鼠,骨小梁的结构较之模型组有明显改善,尤其是中、高剂量组在骨结构的厚度、紧密性以及体积百分数上有显著升高.结合骨灵片对骨密度以及骨力学的改善,提示该药可以通过增强骨小梁实际结构的方式,起到增加骨强度,改善骨负荷,有效抗骨质疏松的作用.

    作者:张娟;黄少慧;吴湘慧;李娟 刊期: 2008年第05期

  • 弓形虫感染宫内垂直传播的免疫特点

    弓形虫感染宫内垂直传播对母体胎儿有很大危害.妊娠母体处于特殊的免疫状态,即正常妊娠是以Th2型免疫为主,以避免细胞免疫对胎儿的危害;而感染弓形虫后的机体是以Th1型免疫为主来防御细胞内寄生原虫的危害;这两种免疫反应之间的矛盾造成感染弓形虫的母体免疫反应的进一步偏移.这种矛盾的免疫现象也与性激素的免疫抑制作用和子宫内局部免疫有关.同时,由于体液免疫各抗体在母体和胎儿的弓形虫感染宫内垂直传播中变化复杂.给疾病诊治带来很大困难.

    作者:王树萍;杨晓燕;姜素华;陈建萍;黄世光;吕芳丽 刊期: 2008年第05期

  • 微小RNA miR-26a的克隆及其慢病毒表达载体的构建

    目的 克隆微小RNA hsa-miR-26a并构建其慢病毒表达载体.方法 将PCR扩增得到的miR-26a前体序列和pIVTHM载体经双酶切后连接产生pIVTHM-miR-26a慢病毒表达载体,双酶切后测序鉴定,筛选阳性克隆.用pIVTHM-miR-26a、psPAχ2和pMD2.G 3质粒共转染包装细胞293FT,包装产生慢病毒.以293FT细胞绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)的表达水平测定病毒滴度.结果 经双酶切鉴定和测序证实,成功构建了miR-26a的慢病毒表达载体pIVTHM-miR-26a.倒置荧光显微镜下观察可见包装细胞293FT呈绿色荧光,并测得病毒滴度为5×105TU/ml.成功构建hsa-miR-26a的慢病毒表达载体.为深入研究miR-26a的生物学功能奠定了基础.

    作者:鲁娟;王爽;揭荣荣;姚开泰 刊期: 2008年第05期

  • 金黄色葡萄球菌及其肠毒素B对慢性实验性哮喘小鼠的影响

    目的 探索金黄色葡萄球菌肠毒素B(SEB)对实验性支气管哮喘小鼠肺组织Th0细胞分化的在体调节和对气道炎症的作用.方法 32只15~17 d BALB/c小鼠,随机分为4组:对照组、模型组、金黄色葡萄球菌组、金黄色葡萄球菌肠毒素B(SEB)组.用卵蛋白(OVA)致敏和激发建立小鼠慢性哮喘模型,在致敏前14 d对幼年鼠做金黄色葡萄球菌或SEB预防性腹腔注射.观察记录小鼠的耗氧量、肺组织切片、支气管肺泡灌洗液(BALF)中炎性细胞及相关细胞因子等的改变.结果 金黄色葡萄球菌组与模型组相比.肺组织病理切片结构紊乱减轻、炎症细胞明显减少,小鼠耗氧量降低(5.24±0.12 vs 5.59±0.18),BALF中IL-4水平明显下降(44.94±4.51 vs 29.37±4.17),IFN-γ水平明显增加(19.61±3.83 vs 29.33±4.04),SEB组也有上述作用(耗氧量:5.09±0.20;细胞介素4:36.68±5.10;γ干扰素:24.27±3.46).结论 金黄色葡萄球菌能明显减轻实验性哮喘的气道炎症,纠正哮喘小鼠肺组织中Th1/Th2细胞因子的失衡,其作用可能是通过其分泌的SEB.

    作者:孔令恩;陆丽;叶英俊;林明佳 刊期: 2008年第05期

  • 血浆脂蛋白(a)水平与冠心病相关性分析

    目的 观察血浆脂蛋白(a)[LP(a)]水平与冠心病的相关性.方法 入选住院并行选择性冠状动脉造影检查的患者160例,其中急性冠状动脉综合征(ACS)患者60例,稳定型心绞痛(SAP)患者40例,正常对照组60例.测定各组血浆LP(a)浓度并进行比较分析.结果 ACS组和SAP组LP(a)水平显著高于对照组,而ACS组LP(a)水平明显高于SAP组.脂蛋白水平与冠状动脉狭窄程度、狭窄范围呈正相关关系(r2=0.44,P<0.01).结论 LP(a)与冠脉粥样病变的范围、程度及稳定性相关,对冠心病的诊断和预后判断具有一定意义.

    作者:杨丽莉;王树源 刊期: 2008年第05期

  • 病毒性肝炎患者血清中肝纤维化标志物的检测及分析

    目的 探讨病毒性肝炎患者血清中肝纤维化标志物的水平及意义.方法 酶标法检测基质金属蛋白酶-1(MMP-1)、基质金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP-1)和转化因子-β1(TGF-β1),放免法检测转化因子α(TGF-α)、透明质酸(HA)、Ⅲ型前胶原(PCⅢ)、Ⅳ型胶原(C-Ⅳ)和层粘蛋白(LN).结果 病毒性肝炎患者血清中TIMP-1、HA、PCⅢ、C-Ⅳ和LN水平与对照组比较明显升高(P<0.01);MMP-1、TGF-β1水平与对照组比较差异无统计学意义(P0.05).结论 病毒性肝炎患者血清中肝纤维化标志物中TIMP-1、HA、PCⅢ、C-Ⅳ和LN具有较好的临床价值,MMP-1、TGF-β1价值欠佳.

    作者:李石好;叶晓光;徐建英;唐正运 刊期: 2008年第05期

  • 日本血吸虫TGF-β1成熟肽编码序列的克隆、表达及其转录水平

    目的 获得日本血吸虫(Schistosoma japonicum,Sj)转化生长因子β1(TGF-β1)成熟肽基因的DNA,进行原核克隆和表达.并比较它与Sj26kd的谷胱甘肽转移酶(Sj26GST)在成虫和虫卵期的转录水平.方法 根据美国国立生物信息学中心(NCBI)上登录的小鼠TGF-β1基因的全长序列,设计两条位于保守区的寡核苷酸作为引物.利用RT-PCR从日本血吸虫成虫的mRNA中扩增SjTGF-β1基因的部分序列,并利用生物信息学进行分析和鉴定.克隆SjTGF-β1成熟肽基因的cDNA到原核表达载体pGEX-6p-3,将重组载体转化大肠杆菌BL21株并诱导表达.利用RT-PCR半定量分析SjTGF-β1基因与Sj26GST基因在成虫和虫卵期的转录水平.结果 成功获得并构建了SjTGF-β1成熟肽基因的原核表达载体.融合表达后的重组融合蛋白经SDS-PAGE分析,显示其相对分子质量约为3 5000.与目的 基因编码蛋白的预测分子量相符.SjTGF-β1在成虫与虫卵期的转录水平都低于Sj26GST基因,但虫卵期的转录水平比成虫高.结论 SjTGF-β1成熟肽基因的获得为其编码序列全长的获得奠定了基础;重组融合蛋白的成功表达为进一步的功能研究提供保障;虫卵期该基因的转录水平高提示该基因在血吸虫虫卵与宿主的相互作用中可能具有一定的作用.

    作者:朱郇悯;麦璟莹;赵晶晶;马长玲;陈晓湘;张雪雁;杨英;张惠球;李孜 刊期: 2008年第05期

  • 气管内全麻合并颈丛阻滞应用于甲状腺手术的临床观察

    目的 对比气管内全麻合并颈丛阻滞和单纯气管内全麻应用于甲状腺手术的麻醉效果.方法 40例行双侧甲状腺次全切除手术的全麻患者,随机分为A、B两组,A组采用气管内全麻合并颈丛阻滞,B组采用单纯气管内全麻,常规麻醉诱导插管,麻醉维持A组用瑞芬太尼0.05~0.15μg/(kg·min),B组用瑞芬太尼0.1~0.2μg/(kg·min),两组均持续静脉输注异丙酚,记录气管插管、切皮、麻醉维持和气管拔管时血压和心率的变化,术后睁眼和气管拔管时间,以及术后是否需要镇痛.结果 A组气管插管、切皮、麻醉维持时浅麻醉发生率明显低于B组(P<0.05),B组术后需要镇痛的人数明显多于A组(P<0.01).结论 气管内全麻合并颈丛阻滞在甲状腺手术时维持血流动力学稳定方面明显优于单纯气管内全麻,并可减轻术后疼痛.

    作者:罗德兴;高晓枫;蓝胜文 刊期: 2008年第05期

  • ELISA法与RFFIT法检测狂犬病疫苗免疫后血清抗体的比较

    目的 比较狂犬病疫苗免疫后血清抗体酶联免疫吸附试验(ELISA)与快速免疫荧光灶抑制试验(RFFIT)两种检测方法.方法 对93名研究对象采用0、3、7、14和28 d程序进行暴露后免疫,分别采用ELISA法与WHO认可的金标法RFFIT法检测免疫D0、D3、D7、D14、D45 d的血清抗体.结果 免疫D0、D3、D7、D14、D45 d ELISA法检测抗体阳性率分别为8.6%、11.8%、22.6%、49.6%、86%,RFFIT法检测抗体阳性率分别为0%、0%、22.58%、100%、100%,ELISA法与RFFIT法阳性符合率分别为0%、0%、34.8%、100%、100%;阴性符合率分别为100%、100%、81.4%、0%、0%.结论 ELISA法检测狂犬病疫苗免疫后血清抗体,免疫早期D0、D3、D7假阳性率较高,免疫D14、D45则假阴性率较高.建议采用WHO认可的方法做检测.

    作者:刘华章;黄桂花;曹庆;刘远 刊期: 2008年第05期

  • 10 456例住院患者医院感染调查分析

    目的 为了解我院医院感染的发病情况及影响因素.方法 对2004-2006年6、12月份出院患者医院感染情况进行回顾性调查分析.结果 医院感染发病率呈逐年下降趋势,其中下呼吸道感染、上呼吸道感染占主要构成,下呼吸道感染构成比为39.7%,上呼吸道感染构成比为31.9%,医院感染发病率与季节及平均住院日有直接关系,平均住院日越长,医院感染发病率越高.结论 减少平均住院日,加强消毒隔离,有效通风,改善环境,控制呼吸道感染,根据药敏试验合理使用抗菌药物可以有效降低医院感染发病率.

    作者:张秀萍;刘秀玲;赵楠 刊期: 2008年第05期

  • 吸烟与职业噪声暴露对听力损失交互作用的分析

    目的 探讨吸烟与听力损失的关系以及吸烟和职业性噪声对听力损失的交互作用.方法 利用回顾性队列研究,选择广州市某大型空调生产企业连续性噪声作业人员254名吸烟者为吸烟组,在相同的噪声暴露环境中选择154名不吸烟者为非吸烟组,两组间除吸烟外,其它均均衡可比.按照<作业场所噪声测量规范>(WS/T 69-1996)要求对噪声暴露作业场所进行测点选择和噪声强度测量[dB(A)],并计算累积噪声暴露量(CNE).按GB7583-87要求,对工人进行左、右耳500~6000 Hz内6个频率的纯音气导听阈测试.自行设计问卷对研究对象进行调查,问卷内容包括一般情况、个人生活史、职业史、噪声暴露史、家族性耳聋史以及耳毒性药物使用史等.结果 同一噪声暴露环境下,吸烟组左、右耳高频(3 000~6 000Hz)听阈位移均显著高于非吸烟组(P<0.01).吸烟是听力损失独立的危险因素,二者间存在剂量反应关系(χ2=18.464,P<0.001),吸烟每天20支以上听力损失的相对危险度是不吸烟的3.464倍(95%CI:1.739~6.901).累积噪声量达80 dB(A)以上时,吸烟和职业噪声听力损失的RR值分别为3.443(95%CI:1.182~10.024)和4.667(95%CI:1.199~18.169),吸烟与职业噪声联合作用RR值为10.000(95%CI:3.526~28.360),大于两个变量独立作用之和.结论 吸烟是听力损失独立的危险因素,在高强度噪声暴露情况下.吸烟和职业噪声暴露对听力损失可能存在协同作用.

    作者:李旭东;李永胜;郭晓;刘移民;肖吕武;肖启华;何国权;吴琳 刊期: 2008年第05期

热带医学杂志

热带医学杂志

主管:广东省科学技术协会

主办:广东省寄生虫学会 中华预防医学会