宋娟娟；张红云；刘志刚；康敏雄
变态反应疾病是临床上的常见病、多发病,是当前世界性的重大卫生学问题之一.随着现代医学、免疫学和分子生物学的迅速发展,变应原以及相关数据的快速增加,生物信息学在变态反应学中的重要性越来越突出.生物信息学以计算机为工具对变应原数据进行储存、检索和分析,是对传统生命科学在变态反应学研究中的一个重要补充.本文主要介绍了生物信息学在变态反应研究中的重要应用,包括变应原的结构分析,蛋白质致敏性的评估,变应原之间交叉反应的预测,确定B-细胞和T-细胞表位的分析.通过这些方法的介绍,旨在说明生物信息学在变态反应研究中的应用价值.
作者：杜智华；刘志刚 刊期： 2006年第04期
目的测定正常大鼠、地塞米松处理大鼠以及小鼠感染弓形虫前后的血清一氧化氮水平,探讨弓形虫感染对其血清一氧化氮水平的影响.方法将36只雌性SD大鼠分为6组,每组6只.Ⅰ组:正常对照组;Ⅱ组:弓形虫感染组;Ⅲ组:地塞米松2 mg/kg体重,隔天皮下注射2周后停止注射;Ⅳ组:地塞米松2 mg/kg体重,隔天皮下注射2周后感染弓形虫,并停止注射地塞米松;Ⅴ组:实验期间,地塞米松2 mg/kg体重,隔天皮下注射;Ⅵ组:地塞米松2 mg/kg体重,隔天皮下注射2周后感染弓形虫,继续注射地塞米松.每周采集实验大鼠血液并分离血清.第6周时处死大鼠,收集血清,将弓形虫感染鼠的脑组织匀浆转种小鼠,并以脑组织为模板PCR扩增弓形虫SAG1基因.雌性昆明小鼠36只,于感染弓形虫后0,1,2,3,4,5 d时每天处死6只,收集血清.硝酸根还原酶法测定大鼠、小鼠血清一氧化氮浓度.结果正常组大鼠6周平均一氧化氮浓度为(29.30±2.77)μmol/L;地塞米松注射2周后,Ⅲ组、Ⅳ组、Ⅴ组、Ⅵ组大鼠血清一氧化氮水平分别为(13.24±2.30)μmol/L、(13.33±2.41)μmol/L、(14.98±1.71)μmol/L、(14.55±2.99)μmol/L;Ⅱ组大鼠感染弓形虫后,血清一氧化氮第3周时升至(76.79±6.93)μmol/L,而后持续下降,至第6周时为(52.34±4.50)μmol/L;Ⅲ组大鼠停止注射地塞米松后血清一氧化氮水平逐渐上升,至第4周时为(26.32±2.93)μmol/L,其后维持在正常水平;Ⅳ组大鼠感染弓形虫后第3周时其一氧化氮水平升至(36.19±7.42)μmol/L,然后继续上升,至第5周时达高至(63.60±16.32)μmol/L,然后下降;Ⅴ组大鼠的一氧化氮浓度则维持在从(13.96±2.50)μmol/L到(14.98±1.71)μmol/L之间的较低水平;Ⅵ组大鼠感染弓形虫后血清一氧化氮水平缓慢上升,至第5周时升至高,为(58.89±21.70)μmol/L,然后下降.采用PCR的方法从Ⅳ组中的1只大鼠的脑组织扩增出SAG1片段,Ⅵ组有2只大鼠的脑组织扩增出SAG1片段,并且其脑组织匀浆转种小鼠后回复分离出弓形虫速殖子;PCR阳性的3只大鼠血清一氧化氮浓度在实验期间均维持在较低水平.小鼠感染弓形虫前一氧化氮水平为(27.47±4.41)μmol/L,感染后1 d其血清一氧化氮水平有所降低,为(19.29±3.07)μmol/L,然后快速升高,至感染后5 d达高峰(114.51±8.19)μmol/L,此时小鼠处于频死状态.结论地塞米松可降低大鼠血清一氧化氮水平,弓形虫感染可升高大鼠血清一氧化氮水平;注射地塞米松或未注射地塞米松的大鼠感染弓形虫后其血清一氧化氮水平都有升高,但升高的幅度与速度有所不同,未注射地塞米松的大鼠升高的速度更快、幅度更高.小鼠感染弓形虫后血清一氧化氮水平先降低而后升高,但不能防止小鼠因急性感染而死亡.
作者：赖植发；刘轼初；陈晓光；刘敏；周晓红；李华 刊期： 2006年第04期
目的探讨35岁以下年轻妇女宫颈癌的发生与人乳头状瘤病毒(HPV)感染的关系.方法对1996年10月至2005年11月在我院就诊的96例宫颈癌患者的发病年龄进行分析,并对其肿瘤组织或宫颈分泌物进行HPV检测.结果35岁以下年轻妇女宫颈癌与同期宫颈癌的构成比从1996年的11%上升至2005年的42%.≤35岁宫颈癌患者的HPV阳性率为65%,较＞35岁者明显升高,后者为32%.宫颈癌患者的平均发病年龄逐年减小,HPV感染率逐渐升高.结论35岁以下年轻妇女宫颈癌的发病率呈上升趋势,与HPV感染有相关性.故应加强对HPV感染高危人群的监测、随访,做好宫颈癌的早期诊断和治疗.
作者：梁莉；陈萍；陈晓 刊期： 2006年第04期
目的应用新鲜全血对实验室不同系列血液分析仪进行校准.方法以可溯源的规范操作的检测系统对新鲜全血的WBC、RBC、HB、HCT和PLT进行定值,再用定值新鲜全血对2台不同型号的仪器进行校准,并比较校准前后的偏差变化.结果校准后偏差超过允许范围的测定参数为30%(3/10),较校准前的偏差超过允许范围测定参数80%(8/10)明显降低.结论定值新鲜全血适用于不同系列血液分析仪的校准.
作者：王希平；李鄂；叶丽燕；黎卓华 刊期： 2006年第04期
目的探讨在不同介质条件下低温对兔肺动脉、肾动脉、颈动脉内皮依赖性舒张与非内皮依赖性舒张的影响.方法选48只新西兰兔,每24只分为一组,每8只兔取一种血管环,每一实验组血管环选自同一只新西兰兔.8只血管环为一实验组,随机分为对照组(37℃)、实验组1(30℃)、实验组2(24℃)、实验组3(16℃).另24只重复相同实验,取平均数.建立不同低温条件下乙酰胆碱、硝酸甘油浓度依赖性曲线.测定不同低温对乙酰胆碱及硝酸甘油引起动脉内皮依赖性舒张及非内皮依赖性舒张的影响.结果各低温与常温组及前一低温组之间相比,显著抑制肺动脉、肾动脉、颈动脉内皮依赖性舒张与非内皮依赖性舒张(P＜0.001).结论低温抑制动脉内皮依赖性舒张与非内皮依赖性舒张功能减弱,这对心脏手术后并发症的发生机制的深入理解有重要临床意义.
作者：李灼；李斌；陈勇；苏文杰；莫昌玉；陈长春 刊期： 2006年第04期
序列相关扩增多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,它具有简便、中等产量、高共显性、重复性、易于分离条带及测序等优点,大的特点是它针对的是基因的阅读框区域(ORFs).SRAP标记中,引物的设计是关键,它是基于两个引物的扩增,上游引物长17 bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18 bp,特异扩增的是内含子及启动子区域,由于个体不同以及物种之间的内含子、启动子之间间隔长度不同而产生多态性.两个引物均由5'端14～15 bp的核心序列,和3'端3个选择性碱基组成,其中核心序列又由长为10～11 bp的无特异性的填充序列以及CCGG(正向引物中),或AATT(反向引物中)组成.且正向和反向引物中的填充序列必须不同.扩增的过程采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30～35个循环则为50℃,扩增后的DNA片段可用聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳分离,EB、银染或放射自显影检测.目前SRAP已开始在植物种质资源鉴定评价、种缘进化关系、遗传图谱构建、基因定位、重要性状标记以及比较基因组学方面得到成功应用.
作者：李巧燕；林瑞庆；朱兴全 刊期： 2006年第04期
目的分析中山市2004年一起登革热爆发的流行病学特征,为制定登革热预防控制措施提供科学依据.方法按登革热诊断标准进行回顾性流行病学调查,使用登革热IgM/IgG快速免疫色谱测试卡对疑似病例血清进行登革热抗体检测,用C6/36细胞对急性期病人血清进行病毒分离.使用布雷图指数(BⅠ)法进行蚊媒密度调查.结果本次疫情流行历时36 d,共发病37例,登革热抗体阳性37例,分离到登革Ⅰ型病毒4株.病例主要集中在城区城乡结合部,男性16例,女性21例,发病年龄小6岁,大63岁,其中10～39岁27例,占72.97%.疫情发生时布雷图指数67.0,经采取以快速杀灭成蚊和清除伊蚊孳生地为主的综合防治措施后,疫情很快得到控制.结论本次疫情是由Ⅰ型登革病毒引起,因早期病例误诊,未及时发现传染源,导致疾病传播.快速灭蚊和清除伊蚊孳生地是控制疫情的有效措施.针对该市的流行因素,今后应继续加强各项控制措施的执行落实,加强可疑病例的监测和杀灭蚊媒的工作,扩大原因不明发热病人血常规监测范围,特别是曾发生疫情的乡镇社区卫生服务站.
作者：张瑞红；吴海东；周海；吴宝燕；吕海英；夏生林；罗乐；陈秀云 刊期： 2006年第04期
目的研制一种新型的鱼病口服疫苗,并进行鱼体内的示踪研究.方法通过物理方法(油/水/油)制备包裹模式蛋白的PLGA微粒;将FITC标记蛋白与PLGA结合,观察该新型疫苗在鱼体内的消化过程;将特异性尘螨Der f1蛋白结合PLGA口服给予鱼,不包裹PLGA的Der f1蛋白作为对照,运用ELISA方法测定该疫苗给予后不同时间在血液中的含量.结果PLGA包裹的荧光标记蛋白在消化道1 h内即可被鱼小肠上皮细胞吸收,24 h小肠消化道内残余很少.包裹特异性尘螨Der f1蛋白的PLGA微粒给予鱼1 h后血液中特异性蛋白浓度高,2、4和24 h后仍在血液中保持一定浓度.而不给药对照或Der f1直接给予则在鱼血液中不能测到该特异性蛋白.结论以PLGA为佐剂的蛋白鱼病疫苗可通过消化道吸收入血,是一种新型的鱼病口服疫苗给药系统.
作者：李荔；刘志刚；喻海琼；邓利；王勤；马慧 刊期： 2006年第04期
目的了解本地区尿石患者支原体感染状况及流行特点,为临床治疗提供参考依据.方法对423例尿石患者的结石标本进行支原体培养和药敏试验以及尿石化学成分分析.结果解脲脲原体(Uu)阳性90例(21.3%),人型支原体(Mh)阳性1例(0.2%),Uu合并Mh阳性11例(2.7%),共102例(24.1%).感染的年龄段主要分布在30～39岁(阳性率为24.5%)、40～49岁(阳性率为19.6%)和50～59岁(阳性率为31.4%);189例女性患者支原体阳性为59例(31.2%),234例男性患者支原体阳性为43例(18.3%),女性感染率明显高于男性(P＜0.01).对强力霉素敏感率为81.5%,四环素敏感率为64.7%,交沙霉素、红霉素、阿齐霉素、原始霉素敏感率分别为44.6%、42.1%、47.8%、45.3%,氧氟沙星、环丙沙星为29.5%和26.5%.其尿石的主要成分为磷酸钙,草酸钙以及尿酸盐,多见于肾和输尿管.结论本地区尿石中的支原体感染以Uu感染为主,检出率达23.98%,好发年龄在30～59岁之间,女性明显高于男性(P＜0.01),并对多种抗生素已产生耐药性,强力霉素可作为治疗尿结石中支原体感染的首选药物.
作者：曾赤佳；仇杭佳；彭健桥 刊期： 2006年第04期
目的探讨脑卒中老年患者医院获得性肺炎(hospital acquired pneumonia,HAP)的相关因素.方法采用回顾性调查的方法,对我院老年病科2000年7月～2003年6月住院治疗的430例老年脑卒中患者的临床资料进行分析研究.结果430例老年脑卒中患者中,145例发生HAP,发生率为33.7%.其中脑出血82例,蛛网膜下腔出血10例,共发生HAP 46例(50%);脑梗死338例,发生HAP 99例(29%).通过对痰液中分离出的致病菌分析,发现HAP常见病原菌分别是金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽假单胞菌、大肠埃希菌、白色念球菌等.结论老年脑卒中患者HAP的发生与多种因素有关,其中住院时间长,呼吸道侵入性操作、反复使用抗生素是脑卒中老年HAP患者的易感因素.预防HAP发生的关键是尽量避免其危险因素,加强护理,早期预防,及时诊断.
作者：梁艳芳 刊期： 2006年第04期
目的了解花都区牲畜屠宰及肉类加工销售人员、奶牛场挤奶员、兽医、禽畜饲养员、饲养宠物者等与动物接触密切的重点人群中弓形虫病血清学IgG抗体状况及流行特点,为制订防制策略提供科学依据.方法在区内选择不同职业的人群作为调查对象,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行弓形虫IgG抗体检测.结果共检测779人,阳性71人,阳性率为9.11%.男女阳性检出率分别为7.84%(33/421)和10.61%(38/358).不同职业人群之间以挤奶员和牲畜屠宰、肉类加工销售人员阳性率高,分别为24.00%、13.74%;饲养员、养宠物者次之,阳性率分别为10.00%、9.94%.结论接触动物或进食污染食物易感染弓形虫,必须加强宣传、改变不良习惯、提高个人防护意识等综合防制措施,以降低人群弓形虫感染率.
作者：梁振波；冯月菊；李凯；卢惠溪；沈秋逢 刊期： 2006年第04期
目的分析苏北农村结核分枝杆菌临床分离株的耐药现状和特点,为结核病防制提供依据.方法应用间接比例法药敏试验测定苏北两县2001年结核病人的初始分离株对异胭肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)和链霉素(STR)的敏感性.结果152株临床分离株的总耐药率为32.9%,初始耐药率和获得性耐药率分别为28.6%和48.5%;耐多药率为17.1%,初始和获得性耐多药率分别为16.0%和21.2%.同时耐INH和STR是常见的耐两药或多药类型,其次是耐INH和RIF.四种抗结核药物的耐药率依次为INH(26.3%)、STR(24.3%)、RIF(18.4%)、EMB(10.5%).RIF耐药株中,92.9%的同时耐INH.结论当地农村结核病耐药水平较高,耐药性的发生趋向于对多种药物同时耐药,RIF耐药可作为耐多药的标志.
作者：杨本付；徐飚；蒋伟利；周佩源；姜庆五 刊期： 2006年第04期
目的了解广州地区无偿献血人群人类疱疹病毒8型(HHV-8)的感染情况.方法从全血标本中提取基因组DNA,用巢式聚合酶链反应检测HHV-8 DNA开放读码框26基因(ORF26),对其中一阳性PCR产物用双脱氧链终止法进行核苷酸序列测定,测序结果用DNAstar软件分析.结果239例献血者标本中有2例(0.84%)扩增出一条约233 bp DNA电泳带.经序列分析证实为HHV-8 DNA片段.结论广州地区无偿献血者存在HHV-8感染,但感染率较低.
作者：付涌水；周豪杰；管洪宇；聂咏梅；汪传喜；江朝富 刊期： 2006年第04期
目的探讨清远市石灰岩地区农村居民高血压的流行趋势、主要危险因素及高血压患者知晓率、治疗率、控制率.方法采用分层随机抽样法,抽取清远市石灰岩地区780名18～69岁农村居民进行高血压流行特征及相关危险因素调查,应用EPI-Info 2002和SPSS11.0进行数据录入和统计分析.结果清远市石灰岩地区农村居民高血压总患病率为17.69%,标化患病率为14.01%.高血压患病率随年龄增长呈增高趋势,农村居民高血压危险因素为饮酒、吸烟、劳动强度大、精神心理因素(如精神紧张)、高体质指数(BMI)、高腰臀比(WHR)等.清远市石灰岩地区农村居民高血压患者知晓率、治疗率、控制率分别为25.36%,21.74%,8.80%.结论清远市石灰岩地区农村居民高血压患病率高、高血压防治知识匮乏、患者治疗率、控制率低的现状已对居民健康构成威胁,因此,应采取相应的干预措施预防控制农村居民高血压的发生.
作者：叶浩风；刘晓明；苏耀安；李昌海；朱永坚；欧亮；孙小康 刊期： 2006年第04期
目的探讨人Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)及α2链(COL1A2)基因型与绝经后妇女骨密度相互关系.方法选取年龄≥42岁绝经后妇女(自然绝经≥2年)231例,采用双能X线吸收法(DEXA)测定其全身、腰椎2～4(L2～4)、股骨颈(Neck)、Ward'三角和大转子区等部位的骨密度(BMD)值,并采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测外周血白细胞基因组Ⅰ型胶原α1链及α2链基因型.结果231例受试对象中,Ⅰ型胶原α1链PCR扩增产物未发现ACCB7I酶切位点,Sp Ⅰ结合位点不存在G→T突变,Ⅰ型胶原α1链基因型均为SS型;Ⅰ型胶原α2链基因型分别为EE型113例,Ee型91例,ee型27例(分别占48.9%、39.4%、11.7%),等位基因频率E和e各为68.6%、31.4%.基因型分布符合Hardy-weinberg定律.携带EE基因型的个体比Ee基因型和ee基因型个体的骨密度值为低,但只在腰椎侧位(L2-L4)、股骨颈(Neck)、大转子(Troch)、Ward's三角(Ward's)等部位的骨密度值EE基因型比Ee基因型携带者明显降低(P＜0.05).结论广州地区绝经后妇女COL1A1 Sp Ⅰ结合位点不存在G→T突变.COL1A2基因EE型个体较Ee基因型及ee基因个体的骨密度值低,绝经后妇女骨密度与COL1A2基因多态性存在一定相关性.
作者：李东风；吴文；蔡雪珍；林凯；智喜梅 刊期： 2006年第04期
目的探讨新生儿肺出血与妊娠高血压综合征(简称妊高征)之间的关系.方法对218例新生儿肺出血患者的临床资料进行分析.结果218例新生儿肺出血患者中,妊娠高血压母亲所生婴儿占62.38%(136例),非妊娠高血压综合征母亲所生婴儿占37.62%(82例),妊娠高血压综合征母亲所生婴儿肺出血的发病率明显高于其它母亲所生婴儿(P＜0.01).结论妊高征母亲所生新生儿肺出血的发生率高,早期干预妊高征对降低新生儿死亡率有重要意义.
作者：张坤尧；严文康；韩思敏；林静吟 刊期： 2006年第04期
目的探讨慢性缺氧与大鼠阴茎勃起功能障碍(ED)之间的相互关系及其可能的致病机理.方法48只白色雄性成年SD大鼠随机分为对照组和实验组,每组按照实验时间(2周、6周、10周)再分为三个亚组,每个亚组8只.其中实验组置于密闭低氧舱中制备低氧模型,对照组在正常环境中饲养,其他条件同实验组.于2周末、6周末、10周末分别取各组大鼠,观察其勃起功能,并采用免疫组化SP法检测大鼠阴茎组织中神经元性一氧化氮合酶(nNOS)染色阳性神经纤维的数量、内皮源性一氧化氮合酶(eNOS)的表达.结果①实验组自身比较,大鼠缺氧前后勃起次数有显著性差异,缺氧后大鼠阴茎勃起次数比缺氧前明显减少(P＜0.001).②实验组与对照组比较,2周末、6周末、10周末阴茎组织中nNOS染色阳性神经纤维数量、eNOS蛋白的表达均有显著性差异(P＜0.01).实验组大鼠阴茎勃起次数6周明显低于2周,10周稍高于6周;阴茎组织中nNOS染色阳性神经纤维数量三个实验亚组间有显著性差异(P＜0.01);eNOS的表达6周低,10周有所回升.结论低氧影响大鼠阴茎勃起功能和nNOS、eNOS的表达.nNOS染色阳性神经纤维数量的减少、eNOS表达的下降,可能是低氧环境中大鼠ED发生的原因之一.
作者：于大鹏；韦安阳；毕惠祥；李煜罡；杜跃军 刊期： 2006年第04期
目的监测近年来医院中心重症监护病房(ICU)各种较常见的细菌感染的发生情况和耐药变迁.方法从2002年7月～2004年12月我院中心重症监护病房分离到的细菌,以美国CLSI/NCCLS文件为执行标准,采用K-B法作体外药敏分析.结果共分离临床细菌647株,革兰阴性杆菌占56.9%(368/647),革兰阳性菌占34.0%(220/647),非发酵菌占革兰阴性杆菌的71.4%(263/368).常见的细菌有凝固酶阴性葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、黄杆菌属、铜绿假单胞等.大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌分离率有下降趋势,占革兰阴性杆菌的10.0%(35/368)和8.0%(30/368),产超广谱β内酰胺酶的大肠埃希菌占56.0%,肺炎克雷伯菌占77.0%.肠杆菌科细菌对亚胺培南耐药率低;铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药率为54.4%.结论ICU病房革兰阴性杆菌仍为主要病原菌,非发酵菌感染已成为较常见病原菌,多重耐药现象严重.强调根据药敏试验结果合理使用抗生素和控制感染.
作者：肖柯玲；陈耀棠；魏衍超；陈文捷 刊期： 2006年第04期
目的构建幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)标准株NCTC11639尿素酶A(UreaseA,UreA)编码基因的重组质粒,测定、分析其核酸序列,并在E.coli中表达,研究其抗原性.方法应用PCR技术从Hp DNA染色体中扩增UreA编码基因片段,将其克隆至pMD18-T载体上进行序列测定,并与GenBank上公布的其它Hp菌株基因序列进行比较,再将目的基因克隆至表达载体pGEX-4T-1上进行表达和纯化,用Western-blot检测产物的抗原性并用于对24株抗Hp全菌小鼠单克隆抗体的鉴定.结果扩增的UreA基因全长675 bp(登录号为DQ141577),与GenBank上公布的其它Hp菌株的UreA核酸序列的同源性为95%～98%,表达的UreA融合蛋白分子量为52 000,表达产物可被病人血清和全菌免疫的小鼠血清识别,29株抗Hp小鼠单克隆抗体中有4株是针对UreA抗原的.结论重组UreA具有较好的抗原性,为Hp检测试剂和疫苗的研究奠定基础.
作者：李妍；宁云山；龙敏；董文其；李明 刊期： 2006年第04期
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是近年来发现的一种转录后基因沉默机制,能抑制特定基因的表达,是研究基因功能的有力工具,由于具有高效、特异、操作简单等特点,在乙型肝炎的研究中也得到了广泛的重视和应用.
作者：唐永玮；吴晓蔓 刊期： 2006年第04期
热带医学杂志
主管:广东省科学技术协会
主办：广东省寄生虫学会 中华预防医学会
