学术投稿

随机模拟法进行混合样本拆分分析

章俊;周密

关键词:法医物证学, 混合样本拆分, 随机模拟法
摘要:目的 以随机模拟法对大量混合样本拆分进行统计分析. 方法 在Identifiler、PP18D、AGCU EX20、PP21、AGCU EX20 & AGCU 21+1等5个系统中,使用自主研发软件模拟100万组混合样本,每组逐个拆分,统计平均拆分基因座数(L)和平均拆分组合数(Π). 结果 Identifiler、PP18D、AGCU EX20、PP21、AGCU EX20 & AGCU 21+1系统的L分别为4.8、5.8、6.7、7.0、11.1;Π分别为3.71×104、1.06×105、3.34×105、6.40×105、2.48×1012. 结论 本文结果对于混合样本拆分具有一定的指导意义.
中国法医学杂志相关文献
  • 从被移动尸体上提取检验嫌疑人DNA的方法探讨

    在凶杀案件中,犯罪分子往往为了掩饰犯罪行为而隐藏尸体.通过尸体的体位状态 [1]可分析出犯罪分子移动尸体的方式、动作,从而对嫌疑人接触尸体的部位进行检验,得到嫌疑人的DNA.笔者在工作中遇到2起凶杀案件,均通过尸体的体位状态分析出移动尸体的动作,从而检验出嫌疑人的DNA.

    作者:伊海;李呈核 刊期: 2018年第01期

  • 利用体视数码显微镜观察分离型舌骨1例

    1 案例资料1.1 案例来源韩某,男,59岁,尸体被发现浮于重庆某区水塘内,高度腐败,解剖中发现左侧舌骨大角与舌骨体连接处不连续、可活动,疑似骨折.因高度腐败颈部皮肤及肌肉等软组织难以认定是否有损伤、出血.经硅藻等检验分析死因为溺死.

    作者:牛鑫;杨鹏飞;王志丽;向禄先 刊期: 2018年第01期

  • 超高效液相色谱-质谱联用法测定生物检材中乌头碱

    目的 建立一种简单、快速测定生物检材(血液、尿液、胃内容物)乌头碱的超高效液相色谱-质谱联用法.方法 样品采用乙腈沉淀处理.色谱柱为UPLC C18(2.1mm×50mm,1.7μm),流动相为乙腈-0.1%甲酸,梯度洗脱,流速为0.4mL/min,柱温40℃.采用ESI离子源,MRM模式检测.结果 乌头碱在血液0.5~500ng/mL,尿液1~1000ng/mL浓度范围内线性良好(r>0.995).乌头碱方法回收率在91.3%~110.2%之间;提取回收率在72.8%~83.5%之间;日内、日间RSD均小于14%.结论 本方法简单、快速检测生物检材中乌头碱.

    作者:张园;陈波;张美玲;赵海芹;林琳;林丹;王贤亲 刊期: 2018年第01期

  • 随机模拟法进行混合样本拆分分析

    目的 以随机模拟法对大量混合样本拆分进行统计分析. 方法 在Identifiler、PP18D、AGCU EX20、PP21、AGCU EX20 & AGCU 21+1等5个系统中,使用自主研发软件模拟100万组混合样本,每组逐个拆分,统计平均拆分基因座数(L)和平均拆分组合数(Π). 结果 Identifiler、PP18D、AGCU EX20、PP21、AGCU EX20 & AGCU 21+1系统的L分别为4.8、5.8、6.7、7.0、11.1;Π分别为3.71×104、1.06×105、3.34×105、6.40×105、2.48×1012. 结论 本文结果对于混合样本拆分具有一定的指导意义.

    作者:章俊;周密 刊期: 2018年第01期

  • 生物信息学在法医学中的应用与展望

    自DNA指纹技术应用于司法实践的报道以来,法医DNA分析发挥着越来越重要的作用.近年来,随着基因组学高通量测序技术的快速发展,生物信息学分析手段也逐渐开始与法医学应用结合,极大地扩展了法医物证的分析能力.本文综合阐述了法医遗传学所涉及的基因组、表观组以及转录组生物信息分析相关研究现状以及发展趋势.

    作者:赵晶;唐晖;严江伟 刊期: 2018年第01期

  • 现场生物斑迹遗留时间推断研究进展

    就现场提取的生物检材而言,我们除了需要准确获得DNA STR分型进行个体识别和亲子鉴定,还希望能够通过技术手段获知其遗留时间、空间定位等更多信息.本文以血迹为主要研究对象,就国内外采用光学、细胞生物学、分子生物学等方法推断生物斑迹遗留时间进行总结,并对法医微生物学这一法庭科学新领域在时空线索推断中的应用做以介绍,为现场生物斑迹遗留时间推断研究提供参考.

    作者:张瑾;高珊;畅晶晶;张颖;杨雪莹;刘开会 刊期: 2018年第01期

  • 基于二代测序的混合检材精细化分型研究

    目的 基于二代测序平台进行混合检材精细化STR分型,并评估其法医学应用价值.方法 收集性侵案件中3例混合检材及其比对样本,采用M48磁珠提取纯化试剂盒提取样本DNA,使用ForenSeqTMDNA Signature Prep试剂盒制备文库,MiSeq FGx平台进行测序,ForenSeqTMUniversal Analysis v1.2.1软件进行数据分析,将STR序列多态分型与长度多态分型进行比较.结果 对3例混合检材STR分型进行拆分,在D3S1358、D13S317与D9S1122基因座发现存在同一长度多态等位基因包含两个个体的序列多态等位基因的情况.结论 二代测序技术可对混合检材进行精细鉴别,为混合分型数据拆分提供更多线索和依据.

    作者:饶旼;赵鹏;张驰;武波;孙启凡;庞敬博;季安全;王乐;聂胜洁 刊期: 2018年第01期

  • circRNA应用于体液斑鉴定的技术可行性研究

    目的 利用circRNA检测技术,探索circRNA分子应用于体液斑迹鉴定的可行性.方法 制备精液、唾液、阴道分泌物三种体液斑迹样本,以Qiagen RNeasy Micro试剂盒提取总RNA,经RNase R消化后得到circRNA,进行逆转录PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测分析. 结果 制备的体液斑迹样本均可检测到circRNA分子,提示circRNA普遍存在于法医常见体液斑迹中,具备一定的应用价值. 结论 circRNA的检测可与现有DNA检测技术兼容,利用其组织特异性,可成为体液斑迹鉴定的新标记,具备重要的研究价值.

    作者:赵禾苗;林清峦;陈静;李万水;王冲 刊期: 2018年第01期

  • 利用PrepFiler ExpressTM提取石蜡包埋组织DNA 1例

    1 材料及方法1.1 样本组织蜡块一份,来自实验室检案.1.2 DNA提取用刀片切开蜡块,从中间取约两份大小为0.2cm×0.2cm的组织,分别采用Chelex-100法和PrepFiler Express BTATM法(PrepFiler Express BTA DNA提取试剂盒,Applied Biosystems,简称BTA法)提取样本DNA.

    作者:张宪;沈效平;胡韬;王峰 刊期: 2018年第01期

  • 抗人SMCY抗原胶体金试纸条的研制

    目的 建立一种快速检测SMCY抗原的方法.方法 采用胶体金免疫层析技术双抗体夹心检测法,在金标垫上包被胶体金标记的SMCY兔多抗,制成胶体金试纸条,用于检测12份猪、牛、狗、鸡和小鼠等动物血清以及50份人血清.结果 制作的胶体金试纸条检测人和常见动物血清具有明显的种属特异性,能够区分男女血清.结论 该方法可尝试用于鉴别男女血清,并具有一定种属特异性,其为法医学快速鉴别人类样本性别提供了研究方向.

    作者:安志远;周怀谷;王建霞;冯晓燕;赵东 刊期: 2018年第01期

  • 死后伤软组织出血成因分析

    1 案例资料案例1 某年6月7日,垃圾场作业工发现运来的垃圾中混有赤祼女尸一具.尸体检验情况:颈部数处新月形或小片状表面剥脱、皮下出血,生活反应明显,右颈部肌肉小片状出血.尸体全身广泛表皮剥脱,生活反应不明显.左右后肋多发骨折,左侧胸壁广泛出血、淤血(图1),未见血凝块,右侧胸壁肋骨骨折处内侧局部小片状出血,外侧出血不明显(考虑原始左侧卧位).胸廓出血部位组织学检验未见血栓形成.死者系被他人掐颈致机械性窒息死亡.死者胸部无外伤,分析认为肋骨骨折与胸壁出血系死后7小时尸体被装运,垃圾车挤压、运输时形成.破案证实,案犯于6月6日20时掐死死者,抛尸于垃圾房.

    作者:胡云星;汤捷衡;林文录 刊期: 2018年第01期

  • 混合斑的研究进展

    混合斑组成复杂,长期以来是法医物证研究的难题之一.混合斑主要分为两类:一是性侵害案件中大量女性阴道上皮细胞混合少量精子;二是普通来源的生物检材之间的混合,如血-血、唾液-血液混合等.近些年来,对混合斑的研究日渐深入,技术层面或理论分析都更加客观和多元化.针对第一类混合斑,出现了荧光/磁性激活、显微操纵、声波差异分离法等分离精子的新技术;第二类混合斑是研究的难点,近年来大规模平行测序、液滴微流控技术、乳液PCR(ePCR)、全基因组扩增等技术的出现,提高了次要成分的检出机率.此外,遗传标记也有相应的发展,传统遗传标记常染色体STR、Y-STR、SNP等检测位点越来越丰富,新兴遗传标记DIP、DIP-STR、SNP-STR、mtDNA-SNP、微单倍型等在混合斑研究中发挥的作用初步显露出来.文章后涉及混合斑分析理论和计算软件的新发展.

    作者:韦甜;黄代新 刊期: 2018年第01期

  • 宁波甬江水域夏冬季节溺死兔内脏硅藻16SrDNA的鉴定

    目的 采用PCR法检测夏季7月和冬季12月宁波甬江水域溺死家兔内脏组织中硅藻16SrDNA,评估其在夏季7月和冬季12月溺死鉴定中的应用价值.方法 于夏季7月和冬季12月分别选取30只大白兔,总计60只大白兔,随机分为溺死组(n=10)、死后入水组(n=10)、空气栓塞组(n=10).各组分别提取心、肝、肺、肾组织,应用PCR技术检测上述兔内脏硅藻16SrDNA.结果 与死后入水组比较,夏季7月兔溺死组心、肝、肺、肾组织中硅藻16SrDNA检出率明显增高(P<0.05);而冬季12月溺死组仅心、肺组织中检见硅藻16SrDNA,与死后入水组比较无明显差异(P>0.05);夏季7月溺死兔组心、肝、肺、肾组织中硅藻16SrDNA检出率明显高于冬季季12月溺死兔组(P<0.05);夏季7月和冬季12月空气栓塞组心、肝、肺、肾组织中硅藻16SrDNA均未检出.结论 宁波甬江水域夏季溺死兔中硅藻16SrDNA检出率高,PCR技术可用于溺死诊断;而冬季硅藻16SrDNA检出率低,运用该技术诊断溺死应慎重.

    作者:傅润熹;应捷;邢景军;蒋雯雯;林荣;余荣军;庞宏兵;韦登明 刊期: 2018年第01期

  • PowerPlex?21体系基因座等位基因丢失2例

    1 案例资料1.1 样本来源全部样本来源于2013年~2015年广东省妇幼保健院法医物证司法鉴定所受理的亲子鉴定案例,共6 700例.签署知情同意书后,采集受检者外周静脉EDTA抗凝血2mL、头发、羊水等用于鉴定分析.

    作者:兰菲菲;陈延冰;丁红珂;梁杰;尹爱华 刊期: 2018年第01期

  • 人体内血醇浓度变化及其影响因素分析

    目的 探索饮酒后人体内血醇浓度(BAC)变化及其影响因素,建立 BAC代谢的数学模型.方法 采用顶空气相色谱氢火焰离子化检测器和内标曲线法测量酒后人体内的BAC,利用SPSS20.0和R软件对数据进行相关性分析并建立数学模型.结果 女性的平均BAC消除速率为9.54mg/100mL/h,男性的平均BAC消除速率为12.19mg/100mL/h,女性消除速率小于男性,并且BAC消除速率与性别中等相关,与体重强相关,与年龄无关.通过构建混合效应模型可以准确的预测BAC,该模型的平均绝对误差(MAE)为1.60mg/100mL,其次利用决策树分析数据,其MAE为9.99mg/100mL.结论 饮酒后人体内BAC消除速率与性别、体重有关,通过时间、饮酒量、性别、体重建立混合效应模型可以准确推断BAC.

    作者:金君;戴家佳;杜彦斌;张艳 刊期: 2018年第01期

  • 环氧乙烷消杀DNA污染效果初探

    目的 初探环氧乙烷消杀DNA污染的效果.方法 收集98例分别含有唾液、皮屑、汗斑、毛发、血斑、肋软骨的法医物证样本,分两组进行环氧乙烷灭菌6h和8h,提取DNA后扩增,使用3130XL或3500XL测序仪检测进行STR分型.结果 EO 6h 组44例样本中有2例口腔拭子检出阳性结果,EO 8h 组54例样本中有1例毛发检出阳性结果,阳性样本STR图谱表明仅有少量DNA残留,其余生物样本未检测到STR图谱.结论 环氧乙烷能有效消杀DNA污染,可适用于DNA检验耗材的灭菌.

    作者:韩海军;张玉红;贾东涛;杨敏;伊海;秦海燕;张浩;朱奇慧 刊期: 2018年第01期

  • 30个中低突变Y-STR基因座复合扩增体系的建立

    目的 建立30个中低突变Y-STR基因座的复合扩增体系,并对其性能进行评估.方法 采用六色荧光标记技术,选择 30个中低突变率、中高多态性的Y-STR基因座自行设计引物,进行复合扩增和毛细管电泳检测.检测该体系的准确性、特异性、灵敏度和耐受性,并观察其在混合检材的分型情况.结果 采用本体系,分型结果准确稳定、特异性好、耐受性强,灵敏度达0.0625ng,混合检材在1:4的比例下,可获准确分型.结论 本研究建立的30个Y-STR基因座的复合扩增体系分型结果良好,对于中国人群的法医Y-STR数据库建设和群体遗传学研究具有重要意义.

    作者:吴微微;郝宏蕾;王怀锋;刘冰;梅兴林;周翔;苏艳佳;任文彦;傅燕芳;郑小婷;吕德坚 刊期: 2018年第01期

  • 左主干冠状动脉瘤继发血栓栓塞猝死1例

    1 案例资料1.1 简要案情及病历摘要张某,男,22岁.2016年6月29日,张某驾驶摩托车与另一辆摩托车迎面相撞受伤1天入院,入院情况:活动受限,咯血,并有呼吸困难及恶心呕吐,查体:体温:36.5℃,脉搏:115次/分,呼吸:35次/分,血压:85/56mmHg,急性病容,平车推入,强迫坐位,右眉弓、左下肢多处挫伤,瞳孔对光反射迟钝,心率:115次/分.6月30日检验报告:LDH 1467U/L(参考范围120~250),CK 4060U/L (参考范围50~310),CK-MB 719U/L(参考范围0~25),hsTnI >5000pg/mL(参考范围0~26.2),查心电图示急性下壁、侧壁、广泛前壁心肌梗塞.于2016年7月5日12时30分经抢救无效死亡.

    作者:邓燕飞;任亮;梁曼;王荣帅;周小伟;黄锶哲;张骏超;孟小楷;刘良 刊期: 2018年第01期

  • 理疗减肥仪漏电电击死亡2例

    1 案例资料1.1 案例1简要案情崔某,女,45岁.某年7月18日14时许,在某美容院用理疗减肥仪做减肥过程中发生抽搐,急送医院,经抢救无效死亡.尸表检验左乳头下5cm处有3个平行的类圆形皮肤紫红印迹,直径2.5cm.腹中部脐上4.5cm处在37cm×16cm范围内有4排共35个类圆形皮肤印迹,直径2.5cm.皮肤印迹边缘表皮剥脱、凹陷,质地略硬、颜色略深,中心部苍白.有的皮肤印迹不完整,呈半圆形、弧形(图1),切开见局部皮内较致密、苍白,皮下散在紫红变色.解剖检验心腔内充满暗红色流动血液.双肺组织实质内暗紫色,淤血、水肿明显.病理组织学检查胸、腹部皮肤印迹处表皮层不完整,边缘区残留的表皮细胞核致密、浓染,棘细胞和基底细胞极性紊乱,细胞核伸长、浓染,呈栅栏状或梳状排列;真皮层致密,胶原肿胀,嗜伊红染色偏蓝;皮下组织内小血管内皮细胞、管壁平滑肌细胞、毛囊、汗腺上皮细胞核伸长、浓染,符合电流斑的病理形态学改变(图2).心外膜下和心肌间质血管扩张、淤血.心肌纤维嗜伊红染色增强、断裂、波浪变.心肌间质小血管内皮细胞、管壁平滑肌纤维和肺内小血管、支气管壁平滑肌细胞核伸长、浓染,呈栅栏状排列.肺淤血、水肿.

    作者:尤家斌;李如波;朱宝利;王鹏飞;王昌亮;徐国辉;王晓龙;冯春梅;于浩;张国华 刊期: 2018年第01期

  • 特发性肺动脉高压尸检1例

    1 案例资料1.1 简要案情李某,女,20岁,2016年12月以来因反复咳嗽、咳痰、胸闷不适等症状多次就诊,听诊双肺呼吸音粗、房颤、心脏收缩音强大,予以消炎、抗病毒药物静脉滴注及口服抗心律失常药物治疗,其咳嗽、咳痰症状在服药后短暂好转又复发、加重,心脏症状一直未见改善;2017年1月26日下午口服止咳药物(磷酸苯丙哌林片、枇杷止咳胶囊)后出现口唇紫绀,继而意识丧失、呼之不应,经抢救无效死亡.

    作者:项明;何一泓;韩志杰 刊期: 2018年第01期

中国法医学杂志

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