学术投稿

舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析

邹波;季平;孙守娟;漆小娟

关键词:肿瘤干细胞, 舌鳞癌, 表达序列标签, 生物信息学分析
摘要:目的:对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressed squence tag,EST)进行电子克隆及序列分析.方法:利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索克隆差异表达基因的研究方法和策略.结果:通过电子延伸得到1个1 705 bp的cDNA序列;核酸序列分析显示,该cDNA定位在1号染色体,含有1个编码146个氨基酸的完整开放阅读框;对氨基酸序列进行结构域预测显示其存在1个与Translin超家族同源的区域;BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关蛋白X(Translin associated protein X,TRAX)具有较高的同源性.结论:利用生物信息学技术获得了舌鳞癌相关表达序列标签的基本信息,为深入研究该表达序列标签的功能奠定基础.
重庆医科大学学报杂志相关文献
  • 艾滋病暴露前用药优先干预人群筛选研究

    目的:筛选艾滋病暴露前用药(Preexposure prophylaxis,PrEP)扩大规模临床试验的适宜高危人群.方法:采用Topsis 法对高危人群的9个指标基于PrEP必要性和可行性两个层面进行评估.结果:男性性行为者为佳目标人群,艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)感染者配偶次之,女性性工作者为较不适宜人群.结论:评价结果符合实际情况,选择的评价指标代表性较好,结果可靠.

    作者:贾元元;钟晓妮;张燕;彭斌;黄文祥;梁浩;邹云锋;戴江红;罗锦昆;彭鸿斌;刘倩萍;宋本莉;黄爱龙 刊期: 2011年第10期

  • 多药耐药基因MGMT在脑胶质瘤干细胞中表达的实验研究

    目的:探讨甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(Methylguanine-dna methyltransferase,MGMT)在脑胶质瘤细胞和胶质瘤干细胞(Brain glioma stem cells,BGSC)中的表达情况.方法:由手术切除的多形性胶质母细胞瘤中分离培养胶质瘤细胞和BGSC;应用免疫细胞化学染色和流式细胞术(Flow cytometry,FCW)鉴定BGSC;应用RT-PCR法测定MGMT mRNA在胶质瘤细胞、BGSC和正常脑组织中的表达.结果:本研究中获得的BGSC具有典型的BGSCs细胞生物学特征和免疫学标记;RT-PCR检测结果表明MGMT mRNA在BGSC中的相对表达量明显高于胶质瘤细胞(0.562±0.021 vs 0.112±0.023,P<0.01),而胶质瘤细胞MGMTmRNA的相对表达量明显高于正常脑组织(0.112+0.023 vs 0.005±0.001,P<0.01).结论:多药耐药基因MGMT主要在BGSC而非胶质瘤细胞中表达,其可能是BGSC产生多药耐药性的主要分子机制之一.

    作者:徐忠烨;陈松;程远;王志刚 刊期: 2011年第10期

  • 宁夏城市中老年人群牙体健康状况的研究

    目的:了解宁夏城市中老年人群牙体健康状况,为制定防治方案提供基线资料.方法:采用世界卫生组织口腔健康调查方法并参考全国口腔流行病学调查方案,对宁夏地区2 160名城市中老年人的牙体健康状况进行检查,检查项目包括龋病,楔状缺损,残根和磨损情况.应用SPSS12.0统计软件对结果进行分析.结果:(1)宁夏城市35~44岁中年人患龋率为29.17%,龋均为0.49,女性较男性患龋严重,龋齿充填率为57.17%;楔状缺损患病率为45.19%;残根滞留率与重度磨耗率分别为12.87%和46.20%;(2)宁夏城市65~74岁以上老年人患龋率为38.98%,龋均为1.57,龋齿充填率为54.08%;楔状缺损患病率为55.09%,残根滞留率与重度磨耗率分别为40.83%和60.65%,其中女性较男性残根滞留率高.结论:宁夏城市中老年人患龋率较低,楔状缺损,残根滞留和重度磨耗患病率较高,口腔自我保健意识有待于进一步提高,需要加强口腔预防与保健宣传教育.

    作者:段志斌;马敏;董文亮;王兵;黄永清;朱琳虹;韩春华 刊期: 2011年第10期

  • 共刺激分子PD-L1、PD-L2和B7-H4在人子宫颈癌的表达及意义

    目的:研究共刺激分子程序性死亡配体1 (Programmed death ligand 1,PD-L1)、程序性死亡配体2(Programmed death ligand 2,PD-L2)和B7-H4在人子宫颈癌的表达及其与临床病理特征的关系.方法:采用免疫组织化学PV -6000法检测PD-L1、PD-L2和B7-H4在10例正常人宫颈组织、10例高级别CIN(CINⅡ~Ⅲ级)和67例子宫颈癌中的表达,并分析3种共刺激分子的表达与子宫颈患者临床病理特征的相关性.结果:正常人宫颈组织上皮不表达PD-L1和B7-H4,而基底层细胞微弱表达PD-L2;CINⅡ~Ⅲ的瘤变宫颈上皮微弱表达PD-L1、PD-L2和B7-H4;子宫颈癌细胞表达PD-L1、PD-L2和B7-H4的阳性率分别为70%(47/67)、51%(34/67)和46%(31/67).统计学分析显示宫颈癌细胞PD-L1的表达与癌细胞浸润深度明显相关(P<0.01),与年龄、组织学类型无关;PD -L2的表达与肿瘤的淋巴结转移(P<0.05)有关;B7-H4的表达与肿瘤的淋巴结转移(P<o.05)和局部血管内瘤栓形成(P<0.05)相关.结论:人子宫颈癌细胞异常表达PD-L1、PD-L2和B7-H4,且与肿瘤浸润和转移密切相关.PD-L1、PD-L2和B7-H4可能成为子宫颈癌免疫治疗的潜在靶点.

    作者:耿卫朴;徐曼;王渝琦;徐光旭;陈瑜;王婷婷;黄文炼;赵涌 刊期: 2011年第10期

  • 转录因子ZNF191腺病毒表达载体的构建及鉴定

    目的:构建转录因子ZNF191腺病毒表达载体,为进一步研究ZNF191的生物学功能与肿瘤的基因治疗奠定基础.方法:从HEK293细胞中提取总RNA,RT-PCR扩增ZNF191基因,并将ZNF191亚克隆到穿梭质粒pAdTrack-CMV中,酶切及DNA测序鉴定后,将含ZNF191基因的重组穿梭质粒pAdTrack-ZNF 191经PmeⅠ线性化后转化pAdEasy-1感受态细菌.pAdEasy-ZNF191质粒经Pme Ⅰ线性化后转染293T细胞,包装重组腺病毒Ad-ZNF191,并进行PCR鉴定、Western blot检测受感染MCF-7细胞内ZNF191蛋白的表达.结果:证实pAdTrack-CMV-ZNF191及pAdEasy-ZNF191质粒构建正确,收获病毒后PCR及DNA测序结果证明Ad-ZNF191包装成功,腺病毒感染MCF-7细胞内ZNF191蛋白表达明显提高.结论:成功构建了ZNF191基因重组腺病毒表达载体Ad-ZNF191,为进一步研究ZNF191的生物学功能与肿瘤的基因治疗奠定基础.

    作者:王晓鹏;李梦文;厉建中 刊期: 2011年第10期

  • 维吾尔民族非小细胞肺癌组织中的ERCC1、BRCA1的表达及预后关系的研究

    目的:研究探讨维吾尔民族非小细胞肺癌组织中DNA切除修复交叉互补基因1(Excision repair cross-complementing 1,ERCC1)、乳腺癌易感基因1(Brest cancer susceptibility gene 1,BRCA1)的表达与患者预后及生存的关系.方法:收集2004年1月-2008年12月间的80例维吾尔族NSCLC病灶活检的福尔马林固定标本,采用免疫组化方法检测ERCC1、BRCA1的表达情况,将患者的疗效和生存资料与该指标的表达进行比较.结果:80例患者中,ERCC1染色阳性率为38.6%(31/80),与患者的年龄、性别、病理类型、TNM分期无相关性,与吸烟史及PS评分有关.BRCA1染色阳性率为88.8%(71/80),表达与患者年龄、性别、吸烟史、TNM分期、病理类型均无关,与PS评分有关.ERCC1、BRCA1表达对中位生存用Kaplan-Meier进行单因素生存分析,其差异无统计学意义(P>0.05).ERCC1阴性患者生存期长于阳性,1年生存率有统计学意义(P=0.035),但总生存无差异.结论:ERCC1阴性表达有助于预测维吾尔族患者预后及生存,BRCA1表达暂无统计学意义.本研究可为临床上维吾尔民族非小细胞肺癌患者个体化治疗及判断预后提供参考.

    作者:穆清爽;韩利梅 刊期: 2011年第10期

  • 心脏再同步化治疗心力衰竭的Meta分析

    目的:评价心脏再同步化治疗(伴或不伴除颤功能)在降低心力衰竭患者的死亡率方面的作用.方法:查阅已公开发表的有关心脏再同步化治疗心力衰竭的临床随机对照试验文献,以死亡率为主要评价指标,用Cochrane协作网的软件RevMan5.1进行Meta分析.结果:本次分析终纳入文献12篇(n=7 539).与单纯药物治疗组相比,心脏再同步化治疗(Cardiac resynchronization therapy,CRT)加药物治疗组的死亡率明显降低(RR 0.73,95%CI 0.62-0.85);而与埋藏式除颤器(Implantable cardioverter defibrillator,ICD)治疗组相比,带除颤功能的心脏再同步化治疗组(CRT-D)死亡率亦显著降低(RR 0.83,95%CI 0.72-0.96).在心功能Ⅰ、Ⅱ级(NYHA)的心力衰竭患者中,上述结果十分明显(RR 0.81,95%CI 0.67-0.97);但在心功能Ⅲ、Ⅳ级的患者中则不然(RR 0.86,95%CI 0.69-1.07).结论:药物加心脏再同步化治疗及具备除颤功能的心脏再同步化治疗能显著降低心力衰竭患者的死亡率.

    作者:卢庭义;考国营;苏立 刊期: 2011年第10期

  • 改进大鼠胰十二指肠移植模型的建立

    目的:提高大鼠胰十二指肠移植模型(Pancreaticoduodenal transplantation,PDT)的制作效率,为胰腺移植的临床和基础研究奠定模型基础.方法:以SD大鼠作为供体,Wistar大鼠作为受体,共行40例大鼠胰腺移植.采用自制套管吻合供体门静脉和受体左肾静脉、供体腹主动脉和受体左肾动脉,术中不需阻断下腔静脉和腹主动脉.结果:40例手术中,供体平均手术时间为(68±4)min,受体平均手术时间(55±4)min,静脉袖套吻合时间(6±1)min,动脉套管吻合时间(5±1)min,术后24h移植物恢复功能,有轻度组织病理学改变,移植成功率达90%.结论:该方法简化了血管吻合的步骤,减少了术后大出血的并发症,大大提高了造模效率.

    作者:赵雪云;张力;刘胜春 刊期: 2011年第10期

  • 直肠癌术前三维适形放疗不同剂量的比较研究

    目的:通过比较三维适形放疗(3-dimension conformal radiotherapy,3D-CRT)计划不同处方剂量的剂量学特点,探讨直肠癌术前放疗处方剂量对危及器官的影响.方法:应用PINNACLE3治疗计划系统分别对25例拟行术前放疗的直肠癌患者进行3D-CRT计划设计,比较处方剂量46、50 Gy的靶区剂量学特点以及小肠、膀胱、双侧股骨头等正常组织的受照射剂量及体积.结果:(1)处方剂量46、50 Gy均能很好满足95%等剂量曲线对100%计划靶区(Planning target volume,PTV)体积的完全覆盖,而两者CI、HIGTV、HICTV和HIPTV没有差别.(2)3D-CRT处方剂量50 Gy中小肠和膀胱的V50明显高于46 Gy中的V50;而其他指标差异无统计学意义(P>0.05).结论:直肠癌术前放疗不同处方剂量对小肠、膀胱接受较高剂量照射的体积影响较大.

    作者:叶序卷;姚兰;贾钰铭;雷开键;胡明宗;肖伟;黄强 刊期: 2011年第10期

  • 变应性支气管肺曲霉病伴中心型支气管扩张1例

    1 临床资料患者男性,37岁,因“发热17d,咳嗽、咯痰伴呼吸困难9d”入院.入院前17d患者因受凉后出现畏寒、发热,测体温37.8℃~38.8℃,无咳嗽、气促、咯血,院外予头孢曲松钠抗炎治疗无效.入院前9d开始出现咳嗽,咳大量黄绿色脓痰,伴呼吸困难,作胸片示“肺炎”,予氨苄西林钠、左氧氟沙星抗感染5d无效,换为头孢哌酮/舒巴坦及甲基强的松龙等治疗3天,症状仍无好转,呼吸困难逐渐加重,作胸部CT提示双侧肺内病灶明显增多,呈蜂窝样改变,故来我院.患病以来,精神、食欲明显下降,体重下降约10 kg.入院查体:T 37.6℃,P133次/min,R 32次/min,BP 100/70 mmHg,神清神萎,半卧位,可见吸气性三凹征,口唇紫绀;双肺闻及大量湿罗音和散在哮鸣音;心界不大,心率133次/min,律齐,无杂音;腹部无阳性体征;双下肢不肿.

    作者:余纪会;郭述良;王璞 刊期: 2011年第10期

  • “漏斗技术”置入胸椎椎弓根螺钉在青少年特发性脊柱侧弯矫形术中的应用

    目的:探讨应用“漏斗技术”置入胸椎椎弓根螺钉,在青少年特发性脊柱侧弯(Adolescent idiopathic scoliosis,AIS)矫形手术中的实用性和安全性.方法:采用21例AIS,在手术矫形过程中,胸椎椎弓根螺钉的置入均采用“漏斗技术”,记录置入操作和术后并发症;对术中确信度不高的胸椎椎弓根置钉行三维C臂(3D-C-arm)断层扫描,观察螺钉在椎弓根的位置,记录穿出骨皮质螺钉的数目及距离;术后早期均行X线摄片判断置入螺钉位置.结果:采用“漏斗技术”置入胸椎椎弓根螺钉268枚,术中三维C臂断层扫描确信度不高的39枚螺钉,无1枚穿透椎弓根内、外侧壁;3枚螺钉(7.69%)穿透椎体前壁,穿透距离<3mm.所有病例术后行X线摄片,观察发现椎弓根钉位置良好;术中及术后未出现血管、神经、脑脊液漏等并发症.结论:在AIS矫正术中,应用“漏斗技术”置入胸椎椎弓根螺钉的方法是实用的、安全的.

    作者:刘显宏;欧云生;权正学;蒋电明;唐可;罗小辑 刊期: 2011年第10期

  • 不同稀释容积芬太尼鞘内注射对分娩镇痛术中瘙痒的影响

    目的:探讨不同稀释容积芬太尼鞘内注射对分娩镇痛术中瘙痒的影响.方法:100例分娩镇痛产妇随机分成4组,每组25例,均采用腰硬联合麻醉鞘内注入芬太尼20 μg.4组稀释容积分别为1.5、2、2.5、3 ml.分别评估各组产妇瘙痒率、瘙痒程度以及疼痛视觉模拟评分(Visual analogue scale,VAS),并记录产妇感觉减退平面以及呼吸抑制、胎心减慢、恶心呕吐、低血压等不良反应.结果:3 ml组产妇瘙痒率和瘙痒程度低于1.5、2ml2组(P<0.05),较2.5 ml组有减轻趋势.4组产妇VAS评分及不良反应率差异无显著性(P>0.05).结论:增加鞘内注射芬太尼的稀释容积可减轻分娩镇痛术中瘙痒.

    作者:陈伟业;王爱群;张立贤 刊期: 2011年第10期

  • CXCR4-siRNA重组腺病毒载体沉默人卵巢癌细胞株CXCR4基因表达的研究

    目的:研究CXCR4-siRNA重组腺病毒载体对人卵巢癌细胞株SKOV3的CXCR4基因表达的影响.方法:Pac Ⅰ酶切CXCR4-siRNA重组腺病毒载体使其线性化,应用HEK293细胞大量包装扩增病毒,收集病毒液,转染人卵巢癌细胞株SKOV3.细胞分为3组:siRNA组,转染空病毒载体的阴性对照组,细胞不做任何处理的空白对照组.通过PCR、Western blot、免疫组化检测CXCR4基因沉默效果.结果:包装扩增后病毒滴度为6×108 PFU/ml,荧光显微镜下可观察到SKOV3细胞中绿色荧光蛋白的大量表达,重组腺病毒能够有效抑制SKOV3细胞中CXCR4的表达.结论:CXCR4-siRNA重组腺病毒载体可高效转染靶细胞和沉默CXCR4基因的表达,为RNA干扰技术应用于卵巢癌的临床基因治疗奠定基础.

    作者:刘瑜;袁瑞 刊期: 2011年第10期

  • 透明质酸介导的细胞游走受体在胆管癌侵袭和转移中的作用

    目的:探讨透明质酸介导的细胞游走受体(Receptor for hyaluronan-mediated motility,RHAMM)在胆管癌侵袭和转移中的作用.方法:收集临床上行胆管癌手术的患者的组织标本及正常胆管组织标本,根据分化程度将胆管腺癌组织标本分为高、中、低分化3组;按TNM分期标准将所有组织标本分为对照组、胆管癌组以及胆管癌伴转移组.免疫组织化学(SP)法测定RHAMM平均光密度值.RT-PCR及Western blot法检测RHAMM mRNA和蛋白的表达水平.结果:免疫组织化学检测在不同分化程度的胆管腺癌中RHAMM均有不同程度的表达(P>0.05);RHAMM在胆管癌伴转移组阳性率高,在对照组表达阳性率低.RT-PCR和Western blot检测RHAMM mRNA和蛋白表达水平在对照组和胆管癌组差异无统计学意义(P>0.05).在胆管癌伴转移组明显高于对照组和胆管癌组,差异有统计学意义(P<0.05).结论:RHAMM的表达程度与胆管腺癌的分化程度无关,但在胆管癌伴转移组中的高表达可能与胆管癌的侵袭相关,并终促进了胆管癌的转移.

    作者:陈波;赖星;罗玉政;廖汪洋;刘长安 刊期: 2011年第10期

  • 低糖高脂肪营养支持治疗慢性阻塞性肺病并发呼吸衰竭患者的临床疗效观察

    目的:评价低糖高脂肪营养支持治疗慢性阻塞性肺病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)并发呼吸衰竭患者的临床疗效.方法:将60例COPD并发呼吸衰竭患者随机分成2组:研究组30例,对照组30例.2组均予抗感染、吸氧、解痉平喘、化痰、纠正酸碱失衡及电解质紊乱等治疗.研究组予低糖高脂肪营养支持,对照组予传统营养支持,疗程10 d.在研究前1d、研究后10 d分别对2组患者进行血气分析指标、呼吸功能状况测定.结果:研究组在血气分析指标、呼吸功能状况方面改善情况均较对照组有显著性差异(P<0.05).结论:低糖高脂肪营养支持治疗可明显改善COPD并发呼吸衰竭患者的症状和体征,明显改善人体血气分析和肺功能,对纠正呼吸衰竭有良好疗效.

    作者:夏艳;王宏星;邵少英 刊期: 2011年第10期

  • 抗血吸虫药物吡喹酮的新合成路线

    目的:构建一条绿色、环保且能适合工业化生产抗血吸虫药物吡喹酮的新合成路线.方法:以苯乙胺为原料,用氯乙酰氯酰化,再用邻苯二甲酰亚胺钾氨基化反应,在P2O5作用下经Bischler-Napieralski环合反应制得N-[(1-亚甲基)-3,4-二氢异喹啉]邻苯二甲酰亚胺,经肼解和还原得到1-氨甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉盐酸盐,经环己烷甲酰化、氯乙酰氯酰化和环合得目标化合物.结果:该合成路线的总收率可达32.8%,为原总收率的2.13倍.结论:该合成工艺路线操作简便,原料廉价易得,条件温和,绿色环保,收率较高,具有一定的工业化生产前景.

    作者:程训官;郑小红;夏铸;张昕宇;王宇;余瑜 刊期: 2011年第10期

  • C型利钠肽在髂动脉球囊成形术后再狭窄发生中的作用

    目的:探讨C型利钠肽(C-type natriuretic peptide,CNP)在髂动脉球囊成形术后再狭窄发生中的作用.方法:构建兔髂动脉粥样硬化模型,将动物分为球囊成形术(Percutaneous transluminal angioplasty,PTA)组和假手术组,观察PTA术后CNP表达变化;将CNP基因转染髂动脉,观察CNP基因过表达对PTA术后再狭窄的影响.结果:PTA术后2、4周RT-PCR、荧光定量RT-PCR、免疫组化、Western blot检测显示CNP表达明显降低;PTA术后8周CNP表达无明显差异.CNP基因过表达组内膜增生程度、内膜/中膜比及血管狭窄率明显降低.结论:CNP表达减少可能是PTA术后再狭窄发生原因之一,增加CNP表达可一定程度预防再狭窄发生.

    作者:肖乐;龚昆梅;王昆华;欧阳一鸣;凌平;李临海;龙亚新 刊期: 2011年第10期

  • 紫龙金逆转人膀胱癌细胞多药耐药研究

    目的:研究中药紫龙金逆转人膀胱癌细胞多药耐药(Multidrug resistance,MDR)机理.方法:应用MTT法检测紫龙金的细胞杀伤作用,采用流式细胞仪检测细胞凋亡,RT-PCR法检测Bcl-2、Bax基因mRNA水平表达.结果:BIU-87/ADM细胞生存率为(98.00±1.48)%,加入紫龙金后(浓度分别为200、500 μg/ml),其细胞生存率分别为(68.14±5.62)%、(52.36±1.87)%,差异显著(P<0.01);流式细胞仪检测发现:经200、500 μg/nl的紫龙金处理后,BIU -87/ADM细胞凋亡率[(17.32±2.35)%、(22.76±3.65)%]明显高于对照组(5.86±1.37)%,差异显著(P<0.01);RT-PCR结果显示,紫龙金可以下调Bcl-2基因的表达,可使Bax基因表达增强.结论:紫龙金可通过下调Bcl-2基因的表达,增强Bax基因表达诱导人膀胱癌多药耐药细胞凋亡.

    作者:王祥卫;张远宁;李杰;方针强;易善红;叶钢 刊期: 2011年第10期

  • 前列腺电切术中防治电切综合征的临床体会(附318例病例报告)

    目的:探讨前列腺电切术(Transurethral resection of prostate,TURP)中术后前列腺电切综合征(Transurethral resection syndrome,TURS)的防治.方法:对318例前列腺增生患者TURP手术时间、术中是否发生包膜穿孔、是否使用利尿剂和诊治情况进行回顾性分析.结果:19例发生包膜穿孔的患者中有14例发生TURS(73.7%);16例手术时间超过90 min的患者中有9例发生TURS(56.3%);对36例手术时间超过60 min的患者,23例预防性使用利尿剂后TURS发生率为23.1%; 13例未预防性使用利尿剂TURS发生率为38.4%.包膜穿孔和手术时间过长可显著提高TURS的发生率(P<0.05);对超过60 min的患者预防性应用利尿剂可以显著降低TURS发生率(P<0.05).结论:尽量避免包膜穿孔和手术时间过长是预防TURS的有效手段,对于手术时间过长(超过60min)的患者预防性使用利尿剂可以有效降低TURS的发生率.

    作者:廖肇州;郑剑;袁野;杨凡 刊期: 2011年第10期

  • Id1与肿瘤侵袭

    分化抑制因子-1(Inhibitor of differentiation-1,Id1),属于螺旋-环-螺旋(Helix-loop-helix,HLH)蛋白,初研究发现在正常细胞发育过程中Id1能抑制细胞的分化,近年来发现Id1还参与到细胞周期的调控过程中,促进细胞增殖.Id1不仅影响正常细胞的发育生长,在许多肿瘤中也出现高表达.Id1能影响细胞外基质的降解及肿瘤血管的生成,与肿瘤的侵袭密切相关.本文主要探讨Id1在肿瘤侵袭中的作用及其可能的分子机制.

    作者:谯波;罗小辑;蒋电明 刊期: 2011年第10期

重庆医科大学学报杂志

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主办:重庆医科大学