司沛茹;刘书莲;仝冬晓;程美锦;王丽雯;程晓丽
目的 探讨1个汉族Wiskott-Aldrich综合征(Wiskott-Aldrich syndrome)家系WAS基因的突变情况.方法 PCR扩增WAS基因的外显子及外显子与内含子的连接区域,对PCR产物直接进行正、反向测序并与数据库进行比对,确定有无WAS基因突变以及突变的位点.测定家系成员B细胞活化因子(B-cell activating factor,BAFF)的水平.结果 家系中2例患者均携带WAS基因第2外显子c.257G>A的半合子突变,先证者的母亲为c.257G>A的杂合突变携带者,其他表型正常家系成员均未检测到该突变,经查阅人类基因突变数据库证实该突变为已知致病突变.家系中患者血清BAFF水平明显高于表型正常的成员.结论 WAS基因c.257G>A的突变可能是该Wiskott-Aldrich综合征家系的致病原因.
作者:时伟丽;侯巧芳;张卉;娄桂予;张玉薇;廖世秀 刊期: 2018年第02期
目的 探讨荧光定量-PCR(quantitative fluorescence PCR,QF-PCR)对羊水细胞染色体非整倍体检测的准确性及在产前诊断中的价值.方法 应用QF-PCR与染色体核型分析技术对6034例孕妇的6066份羊水标本进行检测.结果 QF-PCR与核型分析均检出了135例21、18、13号和X、Y染色体的数目异常,一致率为100%.对67例羊水细胞培养失败的样本成功进行了QF-PCR检测;鉴定出7例母血细胞或母体细胞污染的羊水标本;对32对双绒毛膜双羊膜囊双胎的STR位点的一致性进行了鉴定,22对的STR位点不一致;检出12例胎儿的STR位点荧光峰面积比值处于临界值或部分为异常值,提示可能有染色体数目异常,经核型证实均为染色体数目异常的嵌合体.结论 QF-PCR是产前诊断中染色体核型分析技术的必要补充,在快速产前诊断中具有重要临床价值.
作者:秦胜芳;汪雪雁;陈希敏;叶梦玲;陈春;魏萍;曾兰;邓艺;李运星;席娜;宋筱;孙玲玲 刊期: 2018年第02期
随着辅助生殖技术临床开展规模的日益扩大,以及细胞及分子遗传学诊断技术的快速发展,胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)和植入前遗传学筛查(preimplantation genetic screening,PGS)技术迎来了快速的增长和发展.为使该项技术更加规范且有效地实施,力求临床诊断的精准和出生子代的安全,经中国妇幼保健协会生育保健专业委员会、中国医师协会生殖医学专业委员会、中国医师协会医学遗传学分会、中国遗传学会遗传咨询分会和中国妇幼健康研究会生殖内分泌专业委员会专家讨论,结合国际发展动态和国内临床应用的实际情况,达成以下临床和实验室专家共识.
作者:《胚胎植入前遗传学诊断/筛查专家共识》编写组 刊期: 2018年第02期
目的 对1例发育迟缓伴多发畸形患儿进行遗传学检测,分析其预后及发生机制,为临床咨询提供依据.方法 采用常规G显带和微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)技术分析患儿及其父母的外周血染色体核型和DNA.结果 G显带分析结果显示,患儿染色体核型为46,XX,del(6)(q22),inv(6) (p21.1q21),其父母染色体核型未见异常.aCGH检测结果显示患儿6p21.1区存在800 kb杂合缺失,包含RUNX2基因,6q21-q22.31区存在11.79 Mb杂合缺失,其父母未检测到染色体微重复/微缺失.结论 患儿为染色体新发倒位,两处微缺失均为新发突变,具有致病性.6p21.1区域RUNX2基因微缺失导致锁骨颅骨发育不良,6q21-q22.31区域微缺失可能与患儿脑部结构发育异常相关.
作者:吴东;李涛;侯巧芳;霍晓东;王鑫;王涛;杨艳丽;刘红丽;廖世秀 刊期: 2018年第02期
目的 寻找一个视网膜色素变性家系的致病基因突变,并对该家系进行产前基因诊断.方法 运用高通量测序对该家系的先证者173个遗传性眼病相关基因的序列进行检测,用Sanger测序法对高通量测序的结果进行验证,并对家系的其他患者与携带者进行致病基因突变的检测.结果 先证者存在X染色体连锁、与视网膜色素变性相关的RP2基因第2外显子c.570_571 ins GAAGATGCTGT插入突变,家系中的女性携带者均有该致病基因的杂合突变,男性患者均携带有该致病基因的半合子突变.结论 该家系视网膜色素变性的遗传方式为X-染色体连锁隐性遗传,RP2基因第2外显子的c.570_571ins GAAGATGCTGT插入突变可能为该家系视网膜色素变性的致病突变,可以根据该突变对家系中的携带者进行产前基因诊断.
作者:亢鸿飞;白楠;梅世月;孔祥东 刊期: 2018年第02期
患儿男,因出生后反应差,吃奶量少,皮肤黄染3天入院.患儿系第2胎第1产,39+6剖宫产.有宫内窘迫史,出生时颜面青紫,呼吸表浅,哭声弱,反应差.经吸痰、输氧、拍打足底等抢救数分钟后全身转红.查体:患儿反应差,眼裂小,耳位低,上颚弓高尖.双手食指、中指屈曲畸形,全身皮肤重度黄染,四肢肌张力低.头颅CT示脑缺血缺氧改变;听力筛查双耳未通过,听性脑干反应报告左耳未通过,右耳通过.患儿母亲28岁,父母亲表型均无异常,非近亲婚配,否认家族遗传病史.
作者:乐萍;霍小春;黎文婷;张小珍 刊期: 2018年第02期
目的 探讨一个遗传性凝血因子Ⅴ (coagulation factor Ⅴ,FⅤ)缺陷症家系的表型特征及其分子致病机制.方法 在STAGO全自动血凝仪上检测先证者及家系成员(3代6名成员)凝血酶原时间(prothrombin time,PT)、活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)、纤维蛋白原(fibrinogen,FIB)、血浆凝血因子Ⅱ活性(coagulation factorⅡactivity,FⅡ∶C)、FⅤ活性(FⅤ activity,FV∶C)、凝血因子Ⅶ活性(coagulation factorⅦactivity,FⅦ∶C)和凝血因子Ⅹ活性(coagulation factor Ⅹactivity,FⅩ ∶C)活性;ELISA方法检测FⅤ抗原(FⅤ antigen,FⅤ∶Ag).采用DNA直接测序法分析先证者F5基因的全部外显子、侧翼序列、5'和3'端非翻译区及家系成员相应的突变位点区域,发现突变位点后用反向测序予以证实.采用ClustalX软件分析突变位点的保守性,同时用生物信息学预测软件(PROVEAN和MutationTaster)分析突变对蛋白质功能的影响,用Swiss-PdbViewer软件对突变位点进行蛋白模型和氨基酸相互作用分析.结果 先证者PT和APTT均稍延长,分别为15.2s和41.8 s,FⅤ∶C和FⅤ∶Ag降低,分别为55%和62%;其父亲和儿子FⅤ∶C和FⅤ∶Ag也均有不同程度下降(分别为60%、65%和31%、40%).先证者F5基因第6外显子上发现c.911G>A杂合突变,导致Gly276Glu;其父亲和儿子也为Gly276Glu杂合子;母亲、哥哥和丈夫为正常野生型.保守性分析结果表明,Gly276在同源物种间高度保守;两个生物信息学软件对该突变的预测结果一致:PROVEAN(评分-6.214分)结果预示为有害突变;MutationTaster(评分0.976分)结果预示可引起相应疾病;突变蛋白模型分析显示,在野生型蛋白质中,Gly276的主链与Ile298之间有两个氢键,当Gly276突变为Glu276后,原有的氢键没有改变,但由于Glu侧链延长,与周围氨基酸之间增加了空间位阻,导致蛋白质稳定性下降.结论 该先证者F5基因第6外显子存在c.911G>A杂合突变,导致Gly276Glu,此突变遗传自父亲,且与该家系FⅤ水平减低有关.
作者:田孟茶;夏虹;张志珊;金艳慧;苏看看;王明山 刊期: 2018年第02期
目的 对一个遗传性低纤维蛋白原血症家系进行基因突变分析,并探讨其发病的分子机制.方法 采集先证者及其家系成员(3代共9人)的外周血样,用自动化血凝仪分析凝血酶原时间(prothrombin time,PT)、活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)和凝血酶时间(thrombin time,TT);用凝血酶凝固法(Clauss法)与免疫比浊法分别测定血浆纤维蛋白原的活性(fibrinogen activity,Fg∶C)和抗原水平(fibrinogen antigen,Fg∶Ag);用PCR扩增纤维蛋白原FGA、FGB和FGG基因的所有外显子及其侧翼序列,对PCR产物进行纯化后直接测序;用Swiss软件对突变蛋白进行预测.结果 先证者APTT、PT和TT均延长,Fg∶C(0.69 g/L)和Fg∶Ag(0.72 g/L)明显降低;其母亲、外祖母Fg∶C分别为0.99 g/L和0.83g/L,Fg∶Ag为1.02 g/L和0.87 g/L,均有不同程度的降低.其他家系成员的凝血指标均在正常范围.先证者FGG基因第8外显子存在7590位置的G>T杂合突变,导致纤维蛋白原D结构域的313位丝氨酸突变为异亮氨酸(Ser313Ile);其母亲和外祖母亦为Ser313Ile杂合子,其他家系成员则为野生型.模型分析显示Ser313突变为Ile后,同Asn319、Asp320之间的氢键消失,可能影响钙离子的正常结合.此外,该突变导致中性非极性的Ser变成了非极性、疏水性的Ile,使侧链变长,可能影响纤维蛋白原的折叠、构象及稳定性,导致血浆纤维蛋白原水平降低.结论 纤维蛋白原γ链Ser313Ile的杂合突变是引起该家系遗传性低纤维蛋白原血症的原因.
作者:朱丽青;赵秘胜;程小丽;虞丹丹;李小龙;徐斐;王金果;王明山 刊期: 2018年第02期
目的 应用新型基因编辑工具CRISPR/cas9 (clustered regularly interspaced palindromic repeat/CRISPR-associated system 9)在前列腺癌DU145细胞中部分敲除HIF1α基因,以探讨转录因子HIF1 α(hypoxia-inducible factor-1α)的功能及其对前列腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响.方法 以HIF1α-exon 1为靶点,设计两条sgRNA序列,构建CRISPR/cas9系统,在前列腺癌DU145细胞中敲除HIF1α基因,并利用CCK8、Transwell实验分析部分敲除HIF1α对前列腺癌DU145细胞增殖、迁移、侵袭的影响.结果 酶切及测序结果显示HIF1α部分敲除成功.部分敲除HIF1α基因后,其表达水平明显下调,可显著抑制DU145细胞增殖、迁移、侵袭.结论 成功构建了HIF1α CRISPR/cas9基因敲除系统,可显著抑制前列腺癌DU145细胞增殖、迁移、侵袭能力.该系统可为深入研究HIF1α基因的功能提供新的工具.
作者:许云屹;徐苗;张孟尼;谭珺娅;苏征征;陈雪芹;周桥 刊期: 2018年第02期
目的 报告1个急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)治疗第13个月向t(11;17)(q23;q21)急性单核细胞白血病转化的病例.方法 应用骨髓细胞形态学、免疫分型、细胞遗传学以及实时定量逆转录PCR(real-time quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction,RQ-PCR)方法对疾病进行诊断和分型.结果 患者起病时骨髓细胞形态学和免疫分型均显示为典型的APL,染色体分析核型为t(15;17) (q22;q21),RQ-PCR示PML-RARα融合基因为S型.该患者治疗第13个月时出现疾病反复,骨髓细胞形态学和免疫分型显示转化为急性单核细胞白血病,染色体核型为t(11;17)(q23;q21),进一步的荧光原位杂交和RQ-PCR证实具有MLL-AF17q融合基因而非PLZF-RARα.结论 APL治疗后可以继发治疗相关的急性髓性白血病(therapy-related acute myeloid leukemia,t-AML),t(11;17)(q23;q21)不仅可以出现于变异型APL,还可出现于t-AML,荧光原位杂交和RQ-PCR方法进行融合基因检测是确定诊断的必要手段.
作者:王峥;李叶;党辉;师岩;何琦;冯麟;鲍立;秦亚溱;刘艳荣;黄晓军;赖悦云 刊期: 2018年第02期
目的 分析2例分别表现为多发畸形和生长发育迟缓患儿的遗传学原因.方法 应用靶向基因测序技术对2例患儿的外周血基因组DNA进行高通量测序,用Ingenuity变异分析软件对测序结果进行分析,同时对检出的致病性变异位点进行Sanger测序验证.结果 高通量测序结果显示例1的CHD7基因的第36外显子存在c.7957C>T(p.Arg2653*)无义突变;例2的CHD7基因第2外显子存在c.718C>T (p.Gln240*)无义突变.Sanger测序结果验证了两例患儿CHD7基因的突变,患儿的父母均未检测到突变,患儿CHD7基因的突变均为新生突变(de novo).结论 CHD7基因突变是两例患儿的遗传学病因.
作者:李国强;李牛;胥雨菲;李娟;丁宇;沈亦平;王秀敏;王剑 刊期: 2018年第02期
例1 女,29岁.婚后足月顺产一男婴,出生后自主呼吸微弱,以呼吸机辅助呼吸,放弃治疗后死亡.夫妻表型、智力正常,非近亲婚配,无致畸因素接触史.细胞遗传学检查:在签署知情同意书后,抽取夫妇外周血淋巴细胞培养制备染色体,常规G显带,计数20个中期分裂相,分析5个核型.例1染色体核型为46,XX,t(3;4)(p26;q13)(图1A),丈夫核型正常.例1父母表型、智力均正常.
作者:鲁婷;王瑾;陶靖;高青;金华;蔡艳 刊期: 2018年第02期
目的 探讨细菌人工染色体微珠标记(BACs-on-Beads,BoBs)技术联合羊水细胞核型分析对宁波地区高危孕妇产前诊断临床应用的影响.方法 比较分析2779例高危孕妇的羊水细胞染色体G显带核型分析结果和BoBs检测结果.结果 对于常见染色体非整倍体(13、18、21、X和Y染色体),BoBs检测和染色体G显带核型分析的诊断符合率为98.78%;BoBs还检出未被核型分析发现的8例微重复;BoBs未检出核型分析中的17例染色体结构异常、10例嵌合体及1例三倍体.结论 BoBs技术作为新的分子遗传学产前诊断技术,其通量高、速度快以及可对9种微缺失综合征做出诊断,是传统核型分析很好的补充,提高了本地区产前诊断的水平.
作者:施丹华;张莉超;毛倩倩;周颖;徐玲玲;鲁莉萍;卢文波 刊期: 2018年第02期
目的 明确2例疑似半乳糖血症患儿的分子遗传学病因.方法 应用新一代测序技术对患儿基因组进行外显子捕获检测,对患儿及其父母的突变位点进行Sanger测序验证;用SIFT、PolyPhen-2和MutationTaste软件对新突变进行致病性分析.结果 新一代测序检测结果显示例1携带GALT基因c.564G>C(p.Q188H)和c.116A>T(p.D39V)复合杂合突变;例2携带c.754C>T(p.Q252X)和c.904+1G>T复合杂合突变;Sanger测序验证结果显示2例患儿分别携带c.564G>C(p.Q188H)、c.116A>T(p.D39V)和c.754C>T(p.Q252X)、c.904+ 1G>T突变;例1父亲携带GALT基因c.564G>C杂合突变,母亲携带c.116A>T杂合突变,例2父亲携带c.754C>T杂合突变,母亲携带c.904+1G>T突变,因此患儿的突变分别遗传自父母.4个突变经检索HGMD均为未报道的新突变.结论 GALT基因的复合杂合突变可能是2例半乳糖血症患儿的发病原因.
作者:张海燕;陈栋;刘晨;刘兴锋;盖中涛;刘毅 刊期: 2018年第02期
目的 对1例血清学产前筛查高风险的孕妇进行了胎儿羊水细胞的核型分析以及单核苷酸微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)分析,探讨SNP-array技术在染色体异常诊断方面的价值.方法 应用常规G显带法分析胎儿羊水细胞及其父母外周血白细胞的核型,并采用SNP-array对羊水细胞的基因组DNA进行高分辨率分析.结果 G显带核型分析显示胎儿核型为47,XX,+ mar,高分辨率SNP-array结果显示mar为等臂假双着丝粒psu idic(22) (q11.2),提示胎儿在22q11.1-q11.2区间存在1.7 Mb染色体的四倍性,涉及猫眼综合征(Cat eye syndrome,CES)的关键区域.结论 通过结合常规G显带方法和SNP-array技术,明确了1例罕见的染色体异常.高分辨率SNP-array技术能够提供更详细准确的信息,有助于判定异常染色体的来源.
作者:沈艳艳;孔辉;曾寰;吴琼;陈佳燕;周东兴;张剑;葛运生;丁凤 刊期: 2018年第02期
目的 对1例以肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)为首发症状的遗传性出血性毛细血管扩张症(hereditary hemorrhagic telangiectasia,HHT)的患者及其家系进行基因检测.方法 采用芯片捕获ENG、ACVRL1和SMAD4三个基因全部外显子区域进行高通量测序法检测.结果 高通量测序检出先证者ACVRL1基因的1个致病突变c.814C>T(p.Gln272Ter,Het),其母亲及两儿子均同时携带该致病位点.结论 本病例及其家属ACVRL1基因突变位点为c.814C>T(p.Gln272Ter).对PH尤其是合并HHT者进行基因检测将有助于早期诊断和患病风险预测.
作者:杜旭芹;王旖然;叶俏 刊期: 2018年第02期
目的 分析无创产前筛查(noninvasive prenatal screening,NIPS)提示高风险孕妇的产前诊断结果,探讨二者的符合率.方法 对92例产前NIPS提示染色体数目异常高风险孕妇(其中包括21三体高风险62例、13三体高风险5例、18三体高风险12例、性染色体数目异常高风险11例、其他常染色体数目异常高风险3例)的羊水染色体进行核型分析.结果 羊水培养染色体核型分析发现染色体非整倍体57例,诊断符合率为62%.其中21三体诊断的符合率为69%(43/62).结论 NIPS诊断符合率不同于筛查检出率,高风险孕妇仍需通过产前诊断才能确诊胎儿染色体是否存在异常.
作者:胡祝明;朱海波;李琳琳;何晶;刘睿智;张红国 刊期: 2018年第02期
目的 探讨强直性肌营养不良1型(myotonic dystrophy type 1,DM1)的临床表现、肌电图以及基因学特点.方法 对3个家系拟诊为DM的先证者以及家系成员分析临床表型,进行肌电图、基因检测.结果 3例先证者均为慢性病程,临床症状以肌强直、肌无力、肌萎缩为主要表现,伴有眼部、心脏、内分泌、生殖和神经等多系统损害如白内障、心律失常、脱发、性功能减退、认知功能减退等.肌电图具有特征性肌强直放电和肌源性损害;基因检测结果提示3例先证者DMPK基因3'非翻译区CTG三核苷酸重复扩增异常.结论 DM1临床表型与其他疾病有重叠,结合临床症状、肌电图结果以及早期进行基因检测有助于提高DM1的检出率.
作者:黄宏燕;杨兴隆;徐严明 刊期: 2018年第02期
目的 对1例维吾尔族火棉胶样患儿的TGM1基因进行突变分析,寻找其病因.方法 对患儿及其父母进行常规染色体G显带核型分析,应用芯片高通量测序方法对患儿进行鱼鳞病及鱼鳞病样皮肤病25个相关基因的检测.结果 染色体G显带核型分析结果显示患儿及父母核型均正常;芯片捕获高通量测序检测出患儿TGM1基因的c.919C>T(p.Arg307Trp)和c.856C>T(p.Arg286Trp)复合杂合突变;前者为已知致病突变,后者为临床意义未明突变.Sanger测序验证,患儿父亲携带TGM1基因c.856C>T(p.Arg286Trp)杂合突变,未检出患儿母亲TGM1基因c.919C>T、c.856C>T的位点突变.结论 TGM1基因c.919C>T和c.856C>T复合杂合突变可能是患儿的致病原因.
作者:韩锐;段玲;武爽;刘翛然 刊期: 2018年第02期
目的 探讨Pallister-Killian综合征(Pallister-Killian syndrome,PKS)的临床特征及遗传学特点,分析Affymetrix CytoScan 750K SNP Array和荧光原位杂志(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术在产前诊断中的应用价值.方法 对1例36岁孕34+2周高龄孕妇脐血标本进行G显带染色体核型分析,芯片技术鉴定异常片段来源,运用12pter/12qter探针FISH确认.结果 胎儿脐血G显带染色体核型46,XY[77]/47,XY,+mar[23],出生后新生儿外周血芯片分析结果为arr[hg19] 12p13.33p11.1(173 786~34 835 641)×4,显示12号染色体12p13.33p11.1区段存在34.6 Mb的2次重复;FISH检测显示39%细胞有12号染色体短臂四体.结论 通过结合临床特征,综合应用染色体G显带核型分析、FISH技术和芯片技术能准确确认染色体异常片段来源,有效诊断PKS患者.
作者:张文玲;郭志超;汪伟伟;孙永惠;张晨晰;王晓菲;张立文;王成彬 刊期: 2018年第02期