李奕颖;梅世月;孔祥东;赵振华;朱晓帆;杨欣雨;秦智;吴晗
目的 探讨中国南方汉族人群KIR-HLA系统基因多态性与慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)的相关性.方法 对172份成年CML患者及480份随机正常对照的样本,采用PCR-SSP方法检测KIR基因,用测序分型法进行HLA-A、-B、-C基因分型.从KIR基因及其基因组合型、HLA Ⅰ类配体、已知的单个KIR+ HLA受-配体组合及KIR-HLA基因型组合等4个层次比较病例组与对照组分子遗传多态性的差异.结果 与KIR2DL1配位的HLA-C2、KIR2DL1+ HLA-C2、与KIR3DL1配位的HLA-B Bw4-80I的检出频率均显著低于正常对照组,为CML保护因素(HLA-C2:OR=0.386,95%CI:0.240~0.620,P<0.01;KIR2DL1-+ HLA-C2:OR=0.316,95%CI:0.191~0.525,P<0.01;HLA-B Bw4-80I:OR=0.576,95%CI:0.384~0.862,P<0.01).HLA-C2及HLA-B Bw4-80I分子表达机率降低,可能导致与相应的抑制性KIR亲和力的减弱,有利于NK细胞活化.值得注意的是:KIR-HLA基因型组合ID2(KIR AA1-HLA-C1/C1-Bw6/Bw6-A3/11)在CML组的检出频率显著高于正常对照组,为CML易感因素(OR=2.163,95%CI:1.198~3.906,P<0.01).结论 本研究识别了KIR-HLA与CML白血病相关的易感或保护性因素,可为CML白血病的发病机制和个体化免疫治疗提供新的线索及理论依据.
作者:邓志辉;甄建新;王大明;何柳媚;邹红岩 刊期: 2017年第01期
目的 对一例智力发育落后、临床表型为女性的患儿进行细胞与分子遗传学分析,探讨其遗传学病因.方法 对患儿进行常规染色体G显带核型分析,并提取其外周血DNA,采用PCR扩增分析SRY基因的变异,并用定量PCR对SRY基因进行拷贝数检测.结果 核型分析显示患儿为47,XXY.SRY基因及拷贝数变异分析显示SRY基因呈大片段缺失,拷贝数为0.结论 患儿的女性表型是由于Y染色体上SRY基因的缺失所致,为国内首例SRY基因阴性、表型为女性的47,XXY病例.
作者:李洪英;张开慧;高敏;张海燕;王莹;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
患者男,59岁,因“牙龈出血10余天”且症状逐渐加重,于2015年2月10日收入我院治疗.患者入院时有头晕不适,鼻衄,痔疮出血.查体:浅表淋巴结不大,肝脾未及,静脉注射处有陈旧瘀斑.入院血常规示:白细胞3.99×109/L[正常参考值:(3.5~9.5)×109/L],中性粒细胞32.8%(正常参考值:40%~75%),淋巴细胞48.9%(正常参考值:20%~50%),单核细胞18.3%(正常参考值:3%~10%),血红蛋白:63 g/L(正常参考值:130~175 g/L),血小板计数:20×109/L[正常参考值:(125~350)×109/L];骨髓涂片显示:异常早幼粒细胞85%,胞质量丰富,呈淡蓝色,胞质中有粗大,细小,紫红色颗粒,可见成束状Auer小体.
作者:刘芸;范磊;洪鸣;吴汉新;李建勇 刊期: 2017年第01期
例1女,17岁,因原发闭经就诊.患者系第2胎,足月顺产,出生时父亲29岁,母亲26岁,母亲孕期无患病及服药史,无先兆流产史,父母为非近亲婚配,否认家族遗传病史.查体:身高158 cm,智力一般,无颈蹼,轻度肘外翻,双侧乳房未发育,乳间距宽,腋毛稀少.外阴发育幼稚,阴毛稀少,肛门检查子宫及双附件均未扪及.辅助检查:B超检查:无子宫,未探及双侧卵巢.细胞遗传学检查:采用常规方法进行外周血淋巴细胞培养,标本分别用胰酶消化和氢氧化钡处理进行G显带与C显带,按照人类细胞遗传学国际命名体制(ISCN2009)标准进行核型分析.C显带证实一个着丝粒失活,故患者核型为46,X,psuidic(X)(pter→q24∷q24→ pter)36]/45,X[6](图1A).其父母核型正常.
作者:薛会丽;李英;安刚;范向群;郭南;扶梅妹;何淑琼;张敏;徐两蒲 刊期: 2017年第01期
目的 提高对伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者的临床及遗传学特征的认识.方法 收集1例同时伴有PDGFRA和EVI1基因重排的髓系肿瘤患者的临床资料,应用常规细胞遗传学方法、荧光原位杂交技术和巢式PCR进行遗传学分析.结果 患者临床表现主要为反复皮疹、关节肿痛及间断发热,外周血白细胞计数明显升高、嗜酸细胞增多,体检示巨脾;骨髓病理示骨髓组织明显增生、嗜酸细胞明显增多;染色体核型分析显示患者染色体核型为46,XY,t(3;5) (q26;q15)[6]/46,XY[10];荧光原位杂交结果显示PDGFRA及EVI1基因重排均为阳性,巢式PCR证实FIP1 L1/PDGFRA阳性.患者经单药伊马替尼(200 mg/d)治疗后临床症状缓解.随访期实时定量PCR检测结果显示FIP1L1/PDGFRA转录本水平逐渐下降,并在治疗第10个月转为阴性,但EVI1表达水平与健康对照相比无明显差异且稳定不变.结论 同时伴有PDGFRA和EVI1重排的髓系肿瘤患者具有独特的临床及遗传学特征,分子遗传学检查有助于早期诊断,单药小剂量伊马替尼治疗有效.
作者:韩文敏;晁红颖;周民;岑岭;陈苏宁;何雪峰;卢绪章 刊期: 2017年第01期
患者男,25岁,以“结婚4年,未避孕未怀孕”为主诉来我院就诊.男患者体格发育正常,偏瘦,生殖器检查:阴茎发育正常,阴毛发育正常:双侧睾丸等大,形态正常,包膜光滑,实质回声均匀,血供正常:双侧附睾大小形态正常,左侧附睾头囊肿:双侧精索静脉曲张:双侧输精管未见明显异常.精液分析结果:量2.6 mL,pH=7.4,活动率0%,A级0,B级0,密度0/mL,液化时间10 min.经精液多次检查被确诊为无精症.男方无乙肝、结核、高血压、糖尿病病史,无手术、外伤、输血史等.其妻14岁初潮,平时月经规律,3~4 d/30 d,量中.女方发育正常,外阴正常,分泌量正常,子宫大小正常,光滑,质中,各种激素水平正常.婚后,女方曾在当地医院被诊断为双侧输卵管阻塞,经通液治疗后复查为双侧输卵管通畅.
作者:代鹏;余明聪;侯雅勤;赵勇江;李姝芳;孔祥东 刊期: 2017年第01期
目的 探讨多重连接依赖探针扩增(multiplex ligation dependent probe amplification,MLPA)技术在分析流产组织染色体异常中的应用,分析染色体异常与超声指标的相关性,对不明原因流产的遗传学因素进行评估.方法 收集421例自然流产、宫内死胎和用超声异常终止妊娠的样本,用MLPA的P036、P070试剂盒进行检测.结果 在421例流产样本中,MLPA提示异常者有232例,占55.11%.在孕13周前的286例样本中,有206例存在异常,比例高达72.03%,在孕14~19周的49例样本中,有14例检出异常,占28.57%.在孕20周及以后的86例样本中,有12例检出异常,占13.95%.在117例超声提示胎儿存在畸形或异常的样本中,有33例检测出异常,占28.21%.其中28例为染色体数目异常、4例为染色体微缺失和/或微重复、1例同时存在数目异常和微重复.在颈部超声异常、胎儿水肿综合征、多发畸形、消化系统异常组中,MLPA检测的阳性率分别为71.4%、58.8%、37.8%、9.1%.在心脏、神经、面部、骨骼和泌尿系统超声异常者中则未发现异常.结论 在自然流产中,染色体数目异常占主要因素.随着孕周的增大,染色体异常与流产的关系逐渐减弱.联合应用超声检查和MLPA检测,可以有效地提升染色体异常的检出率.
作者:赵颖;娄季武;孙曼娜;付有晴;刘彦慧 刊期: 2017年第01期
目的 对1例串联质谱技术新生儿筛查发现的可疑单纯性高甲硫氨酸血症患儿进行致病基因突变检测,为临床诊断和遗传咨询提供依据.方法 归纳整理1例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的临床资料,提取其基因组DNA,应用半导体测序技术进行高通量测序,对可疑突变用Sanger测序进行验证.结果 患儿除血甲硫氨酸升高外无其他临床症状.Ion Torrent半导体测序结果显示患儿携带MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变,二者均为未报道过的新突变,患儿父亲为c.345del A突变携带者,母亲为c.529 C>T突变携带者.结论 MAT1A基因c.345del A和c.529 C>T突变可能为这例单纯型高甲硫氨酸血症患儿的致病原因,新一代半导体测序技术是遗传代谢病诊断的重要手段.
作者:孙云;马定远;王彦云;杨冰;蒋涛 刊期: 2017年第01期
目的 对一例疑为眼皮肤白化病的患儿进行临床和遗传学分析.方法 对患儿进行临床检查,提取患儿及其父母基因组DNA,采用新一代外显子目标区域捕获测序技术对患儿进行基因突变分析,并对疑似致病性突变进行患儿及其父母的Sanger测序验证及生物信息学预测.结果 患儿歪头视物,视力低下,伴有双眼水平冲动型眼球震颤,毛发棕黄色.基因测序显示患儿TYRP1基因存在c.1214C>A(p.T405N)和c.1333dupG杂合突变,分别遗传白其母亲和父亲.生物信息学预测为致病性突变.结论 患儿为TYRP1基因复合杂合突变引起的眼皮肤白化病Ⅲ型,TYRP1复合杂合突变致病的病例尚未见报道.
作者:律玉强;黄静;张开慧;刘国华;高敏;盖中涛;刘毅 刊期: 2017年第01期
线粒体tRNASer(UCN)基因突变与感音神经耳聋密切相关.tRNASer(UCN)基因上游部分的突变将影响tRNASer(UCN)结构以及转录后的加工,例如位于tRNASer(UCN)前体3'端的线粒体7444 G>A等突变,以及位于tRNAser(UCN)二级结构茎以及环上的线粒体7472insC和7511T>C等突变可改变tRNASer(UCN)的稳定性,进而影响线粒体内多肽的合成,降低ATP的产量,终导致耳聋.本文主要讨论与耳聋相关的线粒体tRNASer(UCN)基因突变及其致聋的机理.
作者:范文露;唐霄雯;郑斌娇;管敏鑫;薛凌 刊期: 2017年第01期
目的 分析不稳定异常血红蛋白Hb Rush及其合并地中海贫血病例的血液学表型和基因型特征.方法 对3例不明病因的贫血病例进行血液学常规检测和血红蛋白电泳,并检测a和β珠蛋白基因、Gγ启动子区-158 XmnⅠ多态性位点和7个β珠蛋白基因簇中限制性酶切多态位点的单倍型.结果 3例病例均具有小细胞低色素贫血表型,血红蛋白电泳HbF区域有定量值显著增高的异常条带(30.5%~59.2%),携带有不稳定血红蛋白Hb Rush突变(HBB CD101 GAG>CAG,Glu>Gln),其中2例还携带有-α3.7,CD17和Hb E地中海贫血突变;Hb Rush突变有不同的β珠蛋白基因簇单倍型;未发现F区异常血红蛋白电泳条带与Gγ启动子区多态和大片段β基因簇缺失的关联.结论 本研究结果证实了中国不同人群中存在Hb Rush突变,是世界范围内第3个病例报告.Hb Rush异常血红蛋白可导致Hb F区域电泳条带的定量值显著增高.单纯Hb Rush突变杂合子可产生小细胞低色素贫血及地中海贫血样临床症状,需进行产前诊断;对血红蛋白电泳Hb F区域条带定量值明显增高的贫血病例及地中海贫血进行诊治时需考虑对Hb Rush的基因诊断和鉴别诊断.
作者:葛世军;杨必清;易薇;黄铠;刘红仙;黄小琴;褚嘉祐;杨昭庆 刊期: 2017年第01期
目的 研究中国南方汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、B、C、DRB1 、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等位基因的多态性.方法 采用聚合酶链式反应-测序分型方法(sequence based typing,SBT)对481名随机南方汉族个体的HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和D PB1基因进行序列分析,用直接计数法计算等位基因频率.结果 共观察到HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等位基因数分别为28、57、28、40、18、17、6和21个.其中频率高于0.05的常见等位基因有A* 1101、A* 2402、A* 0207、A* 8303和A*0201;B*40:01、B*46:01、B*58:01、B*13:01和B* 15:02;C* 01:02、C* 07:02、C* 03:04、C* 03:02、C* 08:01、C* 03:03和C* 04:01;DRB1* 09:01、DRB1* 15:01、DRB1* 12:02、DRB1* 08:03、DRB1* 03:01、DRB1* 04:05和DRB1* 11:01;DQA1* 01:02、DQA1* 03:02、DQA1* 03:03、DQA1* 06:01、DQA1* 01:03、DQA1* 05:05、DQA1* 01:04、DQA1*03:01和DQA1* 05:01;DQB1* 03:01、DQB1* 03:03、DQB1* 06:01、DQB1* 05:02、DQB1* 03:02、DQB1* 02:01和DQB1* 06:02;DPA1* 02:02、DPA1* 01:03和DPA1*02:01;DPB1* 05:01、DPB1* 02:01、DPB1* 13:01、DPB1* 04:01和DPB1* 02:02.这些常见等位基因的频率总和分别占相应位点的75.57%、52.81% 、78.28% 、62.16% 、86.70% 、77.23% 、95.32%和81.59%.结论 中国南方汉族人群的HLA-A、B、C、DRB1、DQA1、DQB1、DPA1和DPB1等8个位点的等位基因多态性数据可作为人类学、法医学、移植配型和疾病相关性研究和应用的参考数据.
作者:金士正;邹红岩;甄建新;王大明;何柳媚;邓志辉 刊期: 2017年第01期
患者 女,37岁,14岁月经初潮,平素月经规律.婚后9年未孕,现因欲做试管婴儿来我院检查.查体:身高163 cm,体重58 kg,第二性征及智力发育均正常.妇科B超检查示子宫6.2 cm×5.1 cm×3.5 cm,双侧附件均未见异常,第二性征发育正常.内分泌检查:雌二醇290.2 pmol/L(正常参考值:45.4~854 pmol/L),卵泡生成素7.31 U/L(正常参考值:3.5~12.5 U/L),促黄体生成素10.01 U/L(正常参考值:2.4~12.6 U/L),孕酮1.1 nmol/L(正常参考值:0.6~4.7 nmol/L),垂体泌乳素18.03 ng/mL(正常参考值:4.79~23.3 ng/mL),睾酮1.05 nmol/L(正常参考值:0.29~1.67 nmol/L).抗精子抗体阴性.其丈夫精液常规检查:精液量3 mL,精子活动率88.54%,精子数量5.4×107/mL,液化时间正常.
作者:刘彩玉;蓝信强 刊期: 2017年第01期
目的 探讨产前诊断的一例罕见染色体异常的遗传学机制及预后.方法 对常规G显带核型分析发现的胎儿染色体可疑结构异常采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行鉴定,同时应用全基因组基因芯片(whole genome DNA microarray)检测其染色体拷贝数变异.结果 胎儿的一条21号染色体长臂疑似存在重复,即46,XX,dup(21)(? q21q22),专一序列探针FISH检测证实21号杂交区域存在重复,即nuc ish 21q22×3,基因芯片检测证实胎儿染色体21q21.3q22.3区存在17.87Mb的片段重复,涉及GATA1 、JAK2、ALL等121个OMIM基因,涵盖唐氏综合征关键区,与颅面异常、心脏异常、智力低下、发育迟缓、四肢异常等相关.此外,胎儿还存在4p16.1p16.3区8.43 Mb片段的缺失,涉及FGFR3、LETM1、WHSC1、WHSC2等64个OMIM基因,涵盖Wolf-Hirschhorn综合征疾病区域,与生长发育迟缓、头面部异常、心脏异常、智力低下、肌张力减退等相关.经咨询,其家属要求于孕25周时终止妊娠.结论 当核型分析无法确定染色体的结构异常时,应该用特定位点的探针进行FISH检测有利于鉴别异常的类型,结合全基因组基因芯片检测,可以分析染色体拷贝数变异及其所涉及的致病基因,为临床预后及表型分析提供线索.
作者:张璘;任梅宏;宋桂宁;刘雪霞;张静;张晓红 刊期: 2017年第01期
目的 应用单核昔酸多态性微阵列技术(single nucleotide polymorphisms array,SNP array),对1例不明原因智力低下的患儿进行全基因组拷贝数变异(genome-wide copy number variation,CNVs)筛查,并探讨SNP array技术在临床分子遗传学诊断中的应用价值.方法 对1例常规G显带染色体核型分析未见异常的智力低下患儿行CNVs检测.同时检测其父母.结果 患儿全基因组拷贝数检测结果提示:染色体15q25.3-26.2位置存在较大片段缺失,片段大小为7.3 Mb.患儿父母的G显带染色体核型分析及CNVs检测均未见异常.结论 该患儿不明原因智力低下、特殊面容与15号染色体微缺失关联性较大,SNP array技术具有高分辨率和高准确性的优点,同时可作为常规G显带核型分析的有益补充,应用于临床细胞遗传诊断中有重要意义.
作者:孙东兰;穆卫红;张艳华;赵丽娟 刊期: 2017年第01期
环状RNA(circular RNA,circRNA)是区别于传统线性RNA的一类新型RNA,具有闭合环状结构,广泛存在于各种生物细胞中,具有丰度高、结构稳定和组织特异性表达等特征.circRNA在转录及转录后水平具有很多重要的调控基因表达功能.circRNA在肿瘤、神经系统紊乱和动脉粥样硬化等疾病发生、发展过程中起着较为重要的作用.研究显示circRNAs有巨大潜力成为新型的疾病临床诊断标志物或人类疾病治疗的潜在靶点,在疾病的防治领域展现出潜在的应用前景.本文就circRNA与疾病的关联及其潜在临床价值做一综述.
作者:陈拥华;李程;谭春路;麦刚;刘续宝 刊期: 2017年第01期
目的 对1例不明原因精神发育迟滞患儿及其家系进行遗传学分析,以明确诊断.方法 常规染色体核型分析患儿及其家系成员的外周血染色体,再以染色体微阵列检测微缺失/微重复,荧光原位杂交技术验证微阵列检测结果.结果 患儿与家系内同症患者表型一致,染色体核型结果相同,为46,XN,der(22) t(3;22) (q28;q13)pat;其父亲与5位亲属染色体核型为46,XN,t(3;22)(q28;q13),母亲及其他成员正常;患儿染色体微阵列分析示chr3q28q29区域发生9.0 Mb三拷贝重复,chr22q13.3区域发生1.7 Mb单拷贝缺失,荧光原位杂交技术验证了上述结果.结论 该患儿家系中同症患者的异常表型符合3q和22q非平衡易位导致的22q13.3缺失综合征和3q重复综合征,是由于亲代染色体平衡易位产生不正常配子遗传给下一代造成.
作者:张开慧;董睿;黄艳;杨亚丽;王莹;张海燕;张玉凤;刘毅;盖中涛 刊期: 2017年第01期
目的 对一个黏多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosistypeⅡ,MPSⅡ)家系的艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase,IDS)基因进行突变分析,为家系的遗传咨询和产前诊断提供理论依据.方法 应用PCR扩增和直接双向测序对1个黏多糖贮积症Ⅱ型家系中的先证者及其母亲的IDS基因的全编码区序列进行基因突变分析.结果 测序结果显示先证者携带IDS基因c.709-1G>A突变,先证者母亲携带IDS基因c.709-1G>A杂合突变.结论 IDS基因c.709-1G>A剪接突变可能是该黏多糖贮积症Ⅱ型家系的致病原因,产前诊断是避免患儿出生的有效方法.
作者:李奕颖;梅世月;孔祥东;赵振华;朱晓帆;杨欣雨;秦智;吴晗 刊期: 2017年第01期
目的 探讨Turner综合征的细胞遗传学特点与临床表现的关系.方法 对细胞遗传学诊断为Turner综合征和临床具有Turner综合征主要表现之一的607例患者进行常规外周血染色体G显带核型分析,探讨不同核型与临床表现的关系.结果 在607例Turner综合征异常核型中,共发现X单体型154例,占25.37%(154/607);X染色体数目异常嵌合型240例,占39.54%(240/607),其中45,X低比例嵌合型(3≤45,X个数≤5,正常细胞≥30)194例,占X染色体数目异常嵌合型的80.83%(194/240);X染色体结构异常型173例,占28.50%(173/607);含标记染色体40例,占6.59%(40/607).具有Turner综合征典型临床表现的患者主要为11岁以下患儿,主要核型为45,X;11~18岁患者除具有Turner综合征的典型临床表现外,主要的就诊原因为原发闭经,其核型主要为45,X、46,X,i(X) (q10)和mos45,X/46,X,i(X)(q10);18岁以上患者主要就诊原因为原发不孕,其核型主要以45,X低比例嵌合型为主.607例患者中53例有孕产史,其中X染色体数目异常嵌合型48例,X染色体结构异常型5例.结论 Turner综合征患者异常核型比例越高,临床症状越严重,临床发现越早.染色体核型分析可对Turner综合征患者,尤其是45,X低比例嵌合型的早期临床诊治提供一定的指导.
作者:郑杰梅;刘之英;夏培;赖怡;魏杨君;刘燕燕;陈久容;秦利;谢良玉 刊期: 2017年第01期
目的 调查福建厦门地区汉族群体15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座多态性参数,同时评估AmpFLSTR IdentifilerTM体系应用于本地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值.方法 应用AmpFLSTR IdentifilerTM体系荧光标记复合扩增系统,检测400名福建厦门地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数.结果 15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05).15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度0.580~0.868,匹配概率0.036~0.148,个体识别力0.798~0.967,多态性信息含量0.560~0.850,非父排除率0.268~0.730.结论 15个STR基因座在福建厦门地区有较高的多态性.通过检测等位基因频率,为福建厦门地区人群法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性提供了客观依据.
作者:吴莉莉;冉鹏;郑秀娟;周娟娟;裴斌;宋秀宇 刊期: 2017年第01期