学术投稿

单核苷酸多态微阵列技术诊断Williams-Beuren综合征一例

金玉霞;刘霞;李素萍;葛加美;吴秀芳;宋勤浩;周赤燕;苗正友

关键词:智力低下, 单核苷酸多态微阵列技术, Williams-Beuren综合征, 拷贝数变异
摘要:目的 探讨1例智力低下、生长发育迟缓并伴有多系统紊乱的患儿的遗传学原因,分析患儿基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)及其所含基因与临床表型的关系.方法 用常规G显带技术分析患儿及其父母外周血染色体核型,之后应用单核苷酸多态微阵列技术(single nucleotide polymorphisms array,SNP-array)对患儿进行全基因组扫描分析,进而采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行实验验证.结果 患儿及其父母的外周血常规染色体核型分析未见异常.SNP-array分析结果显示7q11.23区域杂合性缺失,长度为1673 kb,其缺失与Williams-Beuren综合征相关.FISH实验结果验证了此微缺失的存在,并通过检测其父母FISH结果,证实为一种新发的缺失.结论 用SNP-array结合FISH技术确诊了1例Williams-Beuren综合征,患儿的临床表型与其染色体微缺失的片段7q11.23相关.与传统的细胞遗传学分析方法相比,SNP-array在临床检测不明原因智力低下、发育迟缓患者中具有显著优势.
中华医学遗传学杂志相关文献
  • 母系遗传的染色体异常核型两家系四例

    家系1 先证者,女,27岁,结婚1年,3次妊娠均于50天左右自然流产.月经规律,3次孕期均无患病及服药史,无有毒有害物质及放射线接触史.体检:妇科检查正常,优生四项检查及内分泌检查无异常.夫妻非近亲结婚,否认有遗传病家族史.

    作者:魏晓明;李琳 刊期: 2015年第04期

  • 220例原发闭经患者的遗传学分析

    目的 探讨山东省临沂地区原发闭经患者染色体异常的类型以及与表型的关系,为诊断和治疗提供依据.方法 采用外周血淋巴细胞进行染色体培养和G显带,必要时进行C显带.采用染色体分析系统进行核型分析.对异常核型进行家系调查和遗传学研究.结果 共检查了220例原发闭经患者,就诊原因主要包括无月经、第二性征发育差、生长发育迟缓、不孕等,共检出22种异常染色体核型,共计124例.异常染色体比例为56.36%.结论 山东省临沂地区原发闭经患者染色体异常的发生率较高,对原发闭经患者进行细胞遗传学检查非常必要.

    作者:刘长美;李琳 刊期: 2015年第04期

  • D12S391基因座检出三带型等位基因二例

    目的 探讨华南地区人群亲子鉴定案例中三带型等位基因的频率及特点.方法 采用Chelex-100法提取血液DNA,通过复合荧光PCR扩增和毛细管电泳分析2200个案例(6000名个体)的DNA-STR基因型.结果 在6000名个体中共检出2例D12S391基因座三带型等位基因.结论 在单个STR基因座中,三带型等位基因出现的几率很小,分析时应采用不同检测方法或者试剂盒进行验证,保证检测结果的可靠性.

    作者:兰菲菲;李海霞;秦丹卿;卢建;赵辉;尹爱华 刊期: 2015年第04期

  • 46,XY,t(1;3)(p22;p13),9ph+伴畸形精子症一例

    患者 男,35岁,身高188 cm,婚后2年不育.内分泌检查:促卵泡刺激素5.9 U/L[正常男性参考值(1.5~12.4) U/L],促黄体生成素2.8 U/L[正常男性参考值(1.7~8.6)U/L)],雌二醇106.43 pmol/L[正常男性参考值(27.96~155.92)pmol/L],泌乳素0.24 nmol/L[正常参考值(0.18~0.69)nmol/L],睾酮12.9 nmol/L[正常参考值(9.9~27.8) nmol/L].

    作者:陈爽;姜雨婷;贾春澍;奚琦;王文静;刘睿智 刊期: 2015年第04期

  • NF-κB对Smad泛素化调节因子1表达水平的调节作用

    目的 鉴定Smad泛素化调节因子1(Smad ubiquitination regulatory factor 1,SMURF1)基因启动子区的一个核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)反应元件,并探讨后者对于SMURF1表达的调节作用.方法 构建系列截短的SMURF1基因启动子荧光素酶报告基因载体,转染肝癌Hep G2细胞,检测荧光素酶的活性,分析各段启动子的活性.应用DNA结合实验和染色质免疫沉淀实验鉴定SMURF1基因启动子区的NF-κB反应元件;构建NF-κB位点突变的荧光素酶报告基因载体并检测其活性;转染NF-κB特异性小干扰RNA,检测SMURF1表达水平的变化.结果 SMURF1基因的各段启动子具有高转录活性,其中-519~-378区域为一个正调控区;SMURF1启动子-411~-420区域为NF-κB反应元件,NF-κB特异性结合于该位点;该元件突变可使SMURF1启动子活性明显下降;转染NF-κB特异性小干扰RNA可下调SMURF1的表达水平.结论 NF-κB特异性结合于SMURF1启动子-411~-420区,对SMURF1的表达水平具有重要的调节作用.

    作者:王曦;李英慧;张红军;胡永胜;栾涛;陈芳杰 刊期: 2015年第04期

  • 109例原发性闭经患者的遗传学分析

    目的 探讨原发性闭经与染色体异常及Y染色体上的性别决定基因(sex-determining region of Y-chromosome,SRY)的关系.方法 对109例原发性闭经患者行染色体核型分析,并对核型为46,XY的患者行SRY基因的荧光原位杂交技术(fluorescent in situ hybridization,FISH)检测.结果 在109例患者中共检出49例异常核型,异常率为44.95%.其中数目异常13例、占11.93%,包括45,X9例、45,X嵌合体4例;结构异常18例、占16.51%,包括X等臂10例、X缺失及环状X各3例、X倒位及易位各1例;假两性畸形46,XY 4例,占3.67%;46,XY性反转女性14例,占12.84%.18例46,XY和1例45,X/46,XY原发性闭经患者的SRY基因FISH检测结果均为阳性.结论 染色体核型分析及对46,XY的患者行SRY基因的FISH检测有助于查明原发性闭经的原因,为其治疗提供依据.

    作者:吴坚柱;林少宾;周祎;陈宝江 刊期: 2015年第04期

  • 一例Tietz综合征(或)Waardenburg Type ⅡA综合征患者的临床表型与遗传学分析

    目的 鉴定1例皮肤、虹膜色素沉着异常、先天性听力缺失合并多发先天异常患儿的遗传学病因.方法 应用常规G显带技术分析患儿及其父母外周血染色体,之后应用单核苷酸多态性芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP array)检测患儿的微小染色体改变.用荧光定量PCR验证芯片的检测结果.结果 常规染色体核型分析显示患儿及其父母的染色体均为正常核型,其中患儿核型为46,XY.SNP array分析发现患儿3号染色体短臂结构异常,结果 显示在3p13p14.1区存在3.9 Mb的缺失(位于此区域的MITF基因全部缺失).荧光定量PCR结果与芯片结果一致.患儿临床表现为先天性耳聋(双侧听力严重损失),皮肤和虹膜色素沉积减少及多发畸形.结论 本例患者的异常表型是由3p13p14.1区存在缺失而导致的,并表现为Tietz综合征(或)Waardenburg综合征,为临床表型和基因型的关联研究提供了新的资料.

    作者:王环环;唐利芳;张静敏;胡琴;陈颖伟;肖冰 刊期: 2015年第04期

  • 一例结节性硬化症患者的临床表型和TSC基因突变分析

    目的 检测1例结节性硬化症患者TSC1、TSC2基因突变情况,探讨其分子发病机制.方法 收集1例结节性硬化症患者的临床表型资料,提取患者及其4名家系成员(父母、舅舅、丈夫)的外周血DNA,应用PCR反应扩增TSC1和TSC2基因所有的外显子编码区及其侧翼序列,通过对PCR反应产物直接测序进行序列分析.结果 患者面部血管纤维瘤、前额纤维斑20年,后腰鲨革样斑10年,伴智力障碍,无癫痫发作史.测序结果显示患者在TSC2基因第34外显子第4258位与4261位碱基之间缺失了TCAG 4个碱基,为c.4258-4261delTCAG(p.Ser1420GlyfsX55)移码突变.在4名表型正常家系成员及100名正常对照中均未检测到该位点突变.结论 TSC2基因第34外显子c.4258-4261delTCAG(p.Ser1420GlyfsX55)移码突变可能是该结节性硬化症患者发病的原因.

    作者:张正中;吕永梅;牟韵竹;杨浩;杨萍;刘一平;刘林莉;陈星;眭维耻 刊期: 2015年第04期

  • 家族性腺瘤息肉病家系APC基因c.3925_3929缺失突变分析

    目的 分析家族性腺瘤息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家系结肠腺瘤息肉病(adenomatous polyposis coli,APC)基因的突变特点.方法 提取13个FAP家系成员外周血DNA,采用多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)以及PCR扩增,之后直接测序对APC基因进行检测,将测序及MLPA结果与APC基因的野生序列进行比对,寻找各家系成员APC基因的致病性突变.结果 共有5个家系筛查出基因突变,分别为c.3184_3187 del CAAA、c.5432C>T、c.3925_3928 del AAAA及两个c.3925_3929 del AAAAG.小片段缺失突变多处于AAAAG串联重复序列中.结论 处于APC基因AAAAG串联重复序列中的c.3925_3929可能为APC基因的突变热点区域,该位点以碱基缺失居多,尤其是密码子1309的5个碱基缺失.

    作者:陈青伟;刘思文;冯继锋;张晓梅;陈森清;马国建;朱明;张元颖;俞军 刊期: 2015年第04期

  • 198例Turner综合征患者的核型与临床表现分析

    目的 探讨Turner综合征患者的临床表现、染色体异常核型及遗传特征.方法 对到云南省第一人民医院就诊,并经外周血染色体核型分析确诊的Turner综合征患者进行总结.结果 在198例Turner综合征患者中,共检出24种异常核型,其中45,X为主要的核型,占全部异常核型的50.51%,其次分别为45,X/46,XX和46,Xi(Xq),均占9.09%.除45,X核型外,嵌合体、等臂X、X缺失、X末端重排、环状X、Y染色体等核型共占49.49%.结论 Turner综合征患者不同核型个体的表型可以出现很大差异,特别是嵌合有Y染色体核型的患者,临床表型差异更大.Turner综合征的表型和正确诊断依赖于核型和核型分析结果.因此,对于有身材矮小、生长发育迟缓、原发闭经、性腺发育不全的儿童或成年女性患者,染色体检查对其临床的治疗及预后咨询有重要意义.

    作者:贺静;赵庆芬;王瑞红;唐新华;朱姝;余蕊;黄文明;李海春;朱宝生 刊期: 2015年第04期

  • 原发性肉碱缺乏症一家系的SLC22A5基因突变检测与产前诊断

    目的 对1例原发性肉碱缺乏症患儿及其家系进行SLC22A5基因突变检测,确定其突变位点,为家系提供遗传咨询和产前诊断.方法 收集该家系成员的外周血标本及先证者母亲的羊水标本,提取基因组DNA,运用Sanger法对家系中各成员进行SLC22A5基因10个外显子的直接测序,并对羊水标本行常规染色体核型分析及应用多重连接依赖探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplificating,MLPA)检测常见染色体微缺失综合征.结果 Sanger法DNA测序检测出该家系中先证者携带SLC22A5基因c.760C>T(p.R254X)纯合突变,先证者父亲、母亲和姐姐均携带SLC22A5基因c.760C>T(p.R254X)杂合突变.先证者母亲羊水标本也检测出SLC22A5基因c.760C>T(p.R254X)杂合突变,羊水染色体核型分析及MLPA检测均无异常发现.结论 SLC22A5基因c.760C>T突变可能是本家系中先证者患原发性肉碱缺乏症的致病突变,Sanger测序等技术可为原发性肉碱缺乏症家系提供遗传咨询和产前诊断服务.

    作者:苏艳华;刘洋;谢建生;徐志勇;吴维青;耿茜;罗福薇 刊期: 2015年第04期

  • 一个Usher综合征家系USH2A基因的突变分析

    目的 探讨一个Usher综合征家系的致病基因突变.方法 对一个疑似为Usher综合征Ⅱ型家系的所有11名成员进行全面的眼科检查和听力测试,并提取外周血基因组DNA,采用PCR和直接测序对先证者进行USH2A基因的突变筛查.以正常人和患者的基因组DNA为模版,分别构建包含USH2A基因第42外显子、第42内含子及第43外显子的野生型和突变型minigene真核表达质粒.采用脂质体法将携带minigene的质粒转染Hela细胞,通过实时定量PCR检测minigene的剪切情况.结果 家系分析和临床诊断提示该家族患有常染色体隐性遗传的Usher综合征Ⅱ型.测序发现先证者的USH2A基因中存在纯合的c.8559-2A>G突变.对其他家系成员进行测序验证发现该突变与疾病共分离.c.8559-2A>G突变为剪切突变,可能引起第42内含子的剪切异常.Minigene结果证实该突变可导致第42内含子不能剪切,从而保留至成熟的mRNA中.结论 USH2A基因c.8559-2A>G突变是该Usher综合征Ⅱ型家系的致病原因.该突变可以导致USH2A pre-mRNA的剪切异常.

    作者:李鹏程;刘飞;张明昌;王秋芬;刘木根 刊期: 2015年第04期

  • 同型半胱氨酸水平及其MSR基因多态性与新疆维吾尔族、汉族原发性高血压的相关性

    目的 探讨血浆同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)及其代谢关键酶甲硫氨酸合成酶还原酶(methione synthase reductase,MSR)基因多态性位点66A/G、524C/T与新疆维吾尔族、汉族原发性高血压(essential hypertension,EH)的相关性.方法 收集2011年9月至2014年6月在新疆医科大学第一附属医院住院EH患者415例,其中维吾尔族199例,汉族216例;健康对照组共412名,维吾尔族195名,汉族217名.应用聚合酶链-限制性片段长度多态性方法检测MSR 66A/G、524C/T基因多态性,应用酶标免疫吸附检测法检测血浆Hcy水平,分析各生化指标及66A/G、524C/T基因多态性与EH的关联性.结果 (1)维吾尔族、汉族EH组血浆Hcy水平均高于对照组(P<0.05).MSR 524C/T单核苷酸多态性分布频率在维吾尔族、汉族EH组与对照组比较,差异有统计学意义(维吾尔族:x2=6.559,P=o.038;汉族x2=12.684,P=0.002);MSR 66A/G分布频率差异无统计学意义(P>0.05).(2)维吾尔族、汉族携带66G、524C者血浆Hcy水平高于携带66A及524T者,且差异有统计学意义(P<0.05).(3)通过Logistic回归模型分析,年龄(OR=1.924,95%CI:1.177~3.164,P=0.009)、肥胖(OR=2.491,95%CI 1.584~3.920,P<0.01)、高Hcy(OR=1.609 95%CI:1.016~2.548,P=0.043)是维吾尔族EH患者的独立危险因素;年龄(OR=1.133,95%CI:1.010~81.272,P=0.033)、高Hcy(OR=3.894,95% CI:2.432~6.237,P<0.01)、肥胖(OR=1.864,95%CI:1.141~3.046,P=0.013)是汉族EH患者的独立危险因素;未发现MSR 66A/G、524C/T基因多态性与维吾尔族、汉族EH患者之间存在相关性.结论 年龄、高Hcy、肥胖是维吾尔族、汉族高血压患者共同独立危险因素.维吾尔族、汉族MSR 66G基因变异可升高血浆Hcy浓度而524T可降低血浆Hcy浓度,不排除MSR 524C/T基因变异是高血压保护因素,有待于扩大样本量进一步证实,未发现MSR 66A/G、524C/T基因多态性是新疆维吾尔族、汉族高血压患者的独立危险因素.

    作者:陈芳;张颖;王红;欧阳菊艳;木尼拉·艾尼瓦尔;卡丽比努尔·雅合甫;杨梦智 刊期: 2015年第04期

  • ABO*O04等位基因表达弱A抗原的序列分析

    目的 研究ABO基因O04等位基因表达弱A抗原的分子基础.方法 通过标准血型血清学方法鉴定1名无偿献血者ABO血型疑难样本,应用聚合酶链反应-序列特异性、逆转录-聚合酶链反应和DNA序列分析等方法对1名献血者ABO基因转录调控序列和全编码序列进行检测.结果 无偿献血者的血清学检测结果是AmB,基因测序、基因克隆和cDNA水平验证显示有B101和O04两个等位基因.结论 DNA序列分析表明ABO疑难血型样本含有B101和O04等位基因.O04等位基因表达弱A抗原特性.

    作者:章旭;李剑平 刊期: 2015年第04期

  • 18号染色体长臂部分三体合并Edward综合征一例

    患儿 男,3天,剖宫产出生.出生时外生殖器明显异常,要求遗传咨询.家族史:父26岁,电工;母25岁,仓库保管员,自怀孕前3个月至妊娠40+3周时有频繁接触甲胺磷、锐劲特等农药的机会.父母为非近亲婚配,无家族遗传病史,无自发流产史.患儿为第1胎,母亲怀孕期间未患任何疾病或服用过包括雌激素在内的任何药品.

    作者:戴欧欢 刊期: 2015年第04期

  • 智力低下和孤独症等人群中脆性X综合征的筛查

    脆性X综合征(fragile X syndrome,FXS)是常见的X染色体连锁的遗传性智力低下疾病,也是引起孤独症谱系障碍主要的单基因遗传疾病.约98%的患者是由于X染色体长臂脆性X智力低下基因1(fragile X mental retardation 1,FMR-1)的5'端非编码区的CGG三核苷酸重复序列异常扩增,导致其上游CpG岛异常甲基化引起FMR1基因的表达产物脆性X智力低下蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)缺失[1].

    作者:于莉;段然慧 刊期: 2015年第04期

  • 46,XX,t(12;20)(p12;p12)两例

    孕妇 22岁,结婚1年,G1P0,22周孕.表型正常,身体健康.孕期无服药史及有毒有害物质接触史.既往月经规律,无手术史,无肝炎结核病史,无高血压、糖尿病、心脏病史.查体均未见异常.常规产前检查三维超声发现胎儿心脏影像改变,胎儿颜面部异常影像,左侧侧脑室测量高值,诊断为胎儿多发畸形.

    作者:李卓;陈琳;张卉;祖淑静;张艳影 刊期: 2015年第04期

  • 胎儿新发标记染色体伴平衡易位一例

    孕妇 女,41岁,孕2次,人工流产1次.孕早期有阴道流血,口服保胎药治疗,药物不明.家族内无遗传病史和先天畸形病史.13+1周行NT超声显示:双侧附件区探及异常回声;母体子宫前壁近宫颈处见2.5 cm×2.6 cm低回声区.孕19+2周行胎儿系统超声显示:胎儿双侧脉络丛囊肿,左侧大小0.8 cm×0.5cm,右侧大小0.9 cm×0.8 cm;母体子宫肌瘤.

    作者:姜雨婷;岳嘉明;史青杨;王文静;刘睿智;李付彪 刊期: 2015年第04期

  • 姜黄素对α-突触核蛋白基因突变或过表达诱导的寡聚体形成及线粒体ATP敏感性钾离子通道的影响

    目的 探讨姜黄素对α-突触核蛋白(α-synuclein)寡聚体形成、线粒体膜电位及线粒体ATP敏感性钾通道(mitochondrial ATP-sensitive potassium channels,mitoKATP)的影响.方法 构建野生型、A53T突变型α-synuclein真核表达质粒,用脂质体介导转染方式将构建好的质粒转入PC12细胞,并分别应用姜黄素(20 ìmol/L)、5-羟基葵酸盐(5-hydroxydecanoate,5-HD)进行干预;48 h后应用免疫印迹、斑点杂交检测细胞α-synuclein寡聚体形成;应用JC-1荧光探针及乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)检测线粒体膜电位及细胞膜毒性损伤;并在姜黄素干预处理前15 min给予5-HD预处理,免疫印迹检测mitoKATP蛋白的功能亚基Kir6.2的改变,细胞膜片钳观察mitoKATP的改变.结果 将构建所得EGFP-α-synuclein-WT、EGFP-α-synuclein-A53T真核表达质粒转染PC12细胞,48 h后免疫印迹及斑点印迹结果显示,α-synuclein基因过表达或突变诱导均可促进α-synuclein寡聚体形成,姜黄素可明显减弱α-synuclein基因过表达或突变诱导的α-synuclein寡聚体形成;JC-1及LDH结果显示,与正常PC12细胞相比,转染野生型、A53T突变型组细胞LDH水平分别升高35.5%及42.3%(P<0.05),JC-1红/绿荧光比率与正常PC12细胞相比下降60.44%、65.22%(P<0.05),姜黄素干预后,LDH水平分别下降36.3%及23.5%(P<0.05),红/绿荧光比率上升48.46%、50.33%(P<0.05);转染野生型或A53T突变型α-synuclein融合表达载体组Kir6.2蛋白表达增强,早期通道电流有明显增高的趋势,随后降低,应用姜黄素干预后,α-synuclein基因过表达或突变所诱导的Kir6.2蛋白表达下调,但细胞mitoKATP通道电流增加,与转染组比较有统计学意义(P<0.05).结论 姜黄素可抑制α-synuclein基因过度表达或突变诱导的α-synuclein寡聚体形成;姜黄素可能通过稳定线粒体膜电位阻断了α-synuclein基因过表达或突变所导致的细胞凋亡;mitoKATP通道的开放可能是α-synuclein基因过表达或A53T突变诱导细胞凋亡的自发始动保护机制,姜黄素可能通过开放mitoKATP通道拮抗α-synuclein基因过表达或突变所导致的细胞毒性,mitoKATP通道的开放程度与Kir6.2蛋白的表达不成正相关.

    作者:陈涛;邓益东;廖小平;赵建农;文国强;翁国虎;马飞;郑莹莹 刊期: 2015年第04期

  • 谷氨酰胺转氨酶与神经退行性疾病

    谷氨酰胺转胺酶(transglutaminase,TGase或TG)是一类Ca2+依赖酶.在啮齿动物和人体内已发现的TGase家族包括TG1~7、血浆凝血因子ⅩⅢa和红细胞膜蛋白4.2等共9种,其中前8种具有催化活性.TG可催化谷氨酰氨基的各种转化反应,包括转酰胺基作用、脱酰胺基作用和酯化作用,并参与蛋白质多肽谷氨酰胺残基和赖氨酰残基之间的交联反应等蛋白转录后修饰,稳定蛋白结构,催化蛋白聚集体的形成.目前已发现TGase参与多种重要的生理病理过程,影响多种疾病的发生和发展,尤其是亨廷顿病、脊髓小脑型共济失调、阿尔茨海默病、帕金森病等神经系统退行性疾病与TGase在人体内的作用密切相关.

    作者:刘振;曾俊晟;曾胜;唐北沙;王俊岭 刊期: 2015年第04期

中华医学遗传学杂志

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主管:中国科学技术协会

主办:中华医学会