学术投稿

黄芪转录组基因模型预测

任伟超;闫嵩;刘振鹏;张开雪;刘秀波;马伟

关键词:黄芪, 转录组, 生物信息学
摘要:目的:黄芪作为传统补气中药具有悠久历史,从黄芪中已经提取出多种有效成分.目前黄芪的基因组还未进行测序,因此基于转录组数据预测基因模型,将有助于黄芪在医药领域的广泛应用.方法:本文基于黄芪转录组数据以及已有的亲缘关系相近物种全基因组序列,对黄芪转录组的unigene在基因组中的情况进行预测分析.结果:预测结果表明,黄芪和大豆Glycine max、蒺藜苜蓿Medicago truncatula、百脉根Lotus japonicus 3种植物有较近的亲缘关系,和蒺藜苜蓿比对上的基因数目是2 039条,碱基相似度是90.14%;和大豆比对上的基因数是1948条,碱基相似度是90.40%;和百脉根比对上的基因数是1003条,碱基相似度是89.77%.结论:黄芪与3种植物比对上的基因在3种植物的各染色体上,以及染色体外基因组上均有分布.
中药材杂志相关文献
  • 茅苍术麸炒前后胃黏膜保护作用的变化研究

    目的:比较茅苍术生品和麸炒品对胃溃疡大鼠的胃黏膜保护作用.方法:以乙酸诱导大鼠胃溃疡模型.采用酶联免疫吸附(ELISA)法检测血清及胃组织中表皮生长因子(EGF)和三叶因子2(TFF2)的含量.实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测胃组织中EGF和TFF2 mRNA的表达.免疫组织化学法检测胃组织中EGF和TFF2的蛋白表达.结果:茅苍术能够明显升高血清及胃组织中EGF和TFF2的含量,上调胃组织中EGF和TFF2mRNA的表达和二者的蛋白表达量,麸炒品的作用优于生品.结论:麸炒能增强茅苍术对乙酸致胃溃疡大鼠胃黏膜的保护作用.

    作者:于艳;才谦;贾天柱 刊期: 2016年第04期

  • 芩百清肺浓缩丸含药血清对肺炎支原体感染RAW264.7细胞NLRP3炎性体表达的影响

    目的:观察芩百清肺浓缩丸含药血清对肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)感染RAW264.7细胞NLRP3炎性体及IL-1β的影响.方法:试验分为空白对照组、模型组和芩百清肺浓缩丸含药血清组.常规培养RAW264.7细胞、肺炎支原体菌株,制备芩百清肺浓缩丸含药血清,用10 MOI MP感染RAW264.7细胞,分别于8、16、24 h收集细胞.FQ-PCR检测NLRP3、ASC、Caspase-1 mRNA表达;Western-blot检测NLRP3、ASC、Caspase-1 p20 蛋白表达;ELISA检测细胞上清液IL-1β含量.结果:与空白对照组比较,MP感染RAW264.7细胞后8、16、24 hNLRP3、ASC、Caspase-1 mRNA表达显著上调(P<0.05或P<0.01);感染后16、24 h NLRP3、ASC、Caspase-1 p20蛋白表达显著上调(P <0.05或P<0.01);感染后24 h细胞上清液IL-1β含量显著升高(P<0.01).与模型组比较,芩百清肺浓缩丸含药血清可显著下调MP感染RAW264.7细胞16、24 h NLRP3、ASC、Caspase-1 mRNA的表达(P<0.05或P<0.01);显著降低感染后24 h NLRP3、ASC、Caspase-1p20蛋白表达和细胞上清液IL-1β的分泌(P <0.05或P<0.01).结论:芩百清肺浓缩丸抗肺炎支原体作用的机制可能与下调NLRP3炎性体表达有关.

    作者:张涵;索绪斌;张云凌;马晶;张树明;许庆瑞;王伟明 刊期: 2016年第04期

  • ICP-MS法研究不同青黛和雄黄配伍组方对大鼠体内砷吸收的影响

    目的:观察青黄散中青黛和雄黄剂量配比对体内砷变化的影响规律,为进一步研究青黄散在治疗白血病中量效关系提供理论基础.方法:以大鼠为研究对象,随机分为3组,分别以不同配伍的青黄散组方,青黛:雄黄分别为7∶3组、8∶2组、9∶1组,其中3组中雄黄的剂量保持一致,每组5只,分别单次灌胃不同配比的青黄散混悬液,于服药后不同时间点采血,采用ICP-MS测得血中砷元素浓度,并计算主要药动学参数.结果:与其他组比较,9:1组方青黄散,在大鼠体内其Cmax显著升高、AUC显著增加.结论:青黄散中青黛比例的增加能促进大鼠体内砷的吸收程度.

    作者:刘耀武;汪电雷;黄鹏;王雪琦;俞娟;黄和平 刊期: 2016年第04期

  • 茅苍术种子醇溶性内源性抑制物的初步研究

    目的:探究茅苍术种子醇溶性内源性抑制物的存在及活性.方法:采用不同浓度的茅苍术种子醇提液(0、0.1、0.2、0.4g/mL)处理油菜种子,并测定油菜种子的发芽率、胚根长度和保护酶活性等.结果:茅苍术种子醇提液能显著抑制油菜种子萌发及胚根的生长,且随着浓度升高,抑制作用更明显,各处理组发芽率依次为90%、64%、35%、9%.并能够直接抑制过氧化氧酶(CAT)、过氧化物酶(POD)的活性,间接影响超氧化物歧化酶(SOD)活性.结论:茅苍术种子中含有内源性抑制物质,这可能是导致茅苍术出苗率不高,幼苗长势缓慢的原因之一.

    作者:侯皓然;巢建国;谷巍;李孟洋;陆奇杰 刊期: 2016年第04期

  • 复方葛根桂枝汤中葛根素在大鼠体内的药动学研究

    目的:通过比较葛根素及复方葛根桂枝汤中葛根素的药动学特点,评价该复方中其他药物对葛根素药动学的影响.方法:大鼠分别灌胃给予葛根素对照品及复方葛根桂枝汤提取物,眼眶后静脉丛采血,分离血浆,以对羟基苯甲酸甲酯为内标,用高效液相色谱-质谱串联法测定血浆中葛根素的浓度,采用DAS 2.0软件计算药动学参数.结果:大鼠灌胃葛根素与复方桂枝葛根汤的主要药动学参数具有明显差异.复方葛根桂枝汤中葛根素在大鼠体内的消除半衰期(t1/2)平均驻留时间(MRT)延长,提示葛根桂枝汤中葛根素在体内停留时间比葛根素对照品长,达峰时间稍微缩短,吸收加快.结论:复方桂枝葛根汤中复杂成分的存在能影响其有效成分葛根素的体内药动学行为.

    作者:吴惠妃;邓继锋;杨雄健;刘志立;全世建 刊期: 2016年第04期

  • HPLC法测定亚麻叶中5种成分含量

    目的:采用HPLC法建立亚麻叶中绿原酸、荭草素、异荭草素、牡荆素、异牡荆素含量的测定方法.方法:InertSustain C18(250 mm×4.6 mm,5 μm)色谱柱;流动相为乙腈(A)-0.1%甲酸溶液(B),梯度洗脱;柱温为40℃;流速为1.0 mL/min;进样量为5μL;检测波长为350 nm.结果:绿原酸、荭草素、异荭草素、牡荆素、异牡荆素分别在4.00 ~40.02 μg/mL(r1 =0.9998)、3.44 ~34.44 μg/mL(r2=0.9999)、3.53 ~35.34 μg/mL(r3 =0.9999)、2.55~ 25.50 μg/mL(r4 =0.9999)、4.33 ~43.32 μg/mL(r5 =0.9998)范围内呈良好线性关系;平均加样回收率分别为100.01%(RSD为0.64%)、98.85%(RSD为1.13%)、98.65%(RSD为2.62%)、98.29%(RSD为2.34%)、103.06%(RSD为3.38%).结论:该方法简便,结果准确、可靠、重复性好,可用于测定亚麻叶中这5种成分的含量.

    作者:赵爱萍;王振宇;魏晓慧;辛敏;鲁安明 刊期: 2016年第04期

  • 野鸡尾与易混品乌蕨的生药鉴别

    目的:为建立野鸡尾药材的质量标准,对其进行生药鉴定研究,并与易混品乌蕨进行比较.方法:采用生药学传统方法对药材进行性状鉴别、显微鉴别、薄层定性鉴别,并用扫描电镜观察孢子的形态.结果:确定野鸡尾根茎的性状鉴别特征、根茎与叶柄基部横切面的显微结构特征、粉末主要显微鉴别特征、薄层定性鉴别特征以及孢子在扫描电镜下的形态特征,并明确了野鸡尾与易混品乌蕨的主要区别是野鸡尾根茎与叶柄基部横切面中分体中柱为2个,乌蕨叶柄基部横切面维管束为1个;野鸡尾的孢子为四面体形,并可见三叉状裂隙,乌蕨的孢子正面观呈内凹形,背面观为椭圆形.结论:野鸡尾与乌蕨在性状鉴别、显微鉴别、薄层定性鉴别以及扫描电镜下的孢子形态方面均不同,本研究为鉴别2种药材以及野鸡尾质量标准的制订提供了实验依据.

    作者:方玉;程佩佩;夏叶;张明高;张秀桥 刊期: 2016年第04期

  • 大蓟与小蓟的显微鉴别研究

    目的:对大蓟、小蓟进行显微鉴别研究.方法:采用冰冻切片、粉末制片对大蓟、小蓟的茎、叶横切面组织显微结构及粉末显微特性进行研究.结果:大蓟、小蓟的横切面显微特征可从茎及叶维管束排列紧密程度来进行区分;粉末的显微特征可从多细胞非腺毛的细胞个数来进行区分.结论:上述显微特征可作为大蓟、小蓟的显微鉴定依据.

    作者:梁鹂;康廷国 刊期: 2016年第04期

  • 四君子汤多糖对IEC-6细胞迁移、钾通道蛋白及膜电位的影响

    目的:观察四君子汤多糖对小肠上皮IEC-6细胞迁移及多胺调控信号通路钾通道蛋白和膜电位的影响,探讨四君子汤修复胃肠黏膜损伤的作用机制.方法:划痕法建立IEC-6细胞迁移模型,观察正常培养及α-二氧甲基乌氨酸(DFMO,多胺合成抑制剂)或4-氨基吡啶(4-AP,钾通道抑制剂)负荷下四君子汤多糖对IEC-6细胞迁移的影响;分别以荧光定量PCR法和Western blot法检测四君子汤多糖对IEC-6细胞钾通道蛋白kv1.1 mRNA和蛋白表达的影响;流式细胞仪检测四君子汤多糖对IEC-6细胞膜电位的影响.结果:与空白对照组比较,四君子汤多糖(40、80、160 mg/L)可促进IEC-6细胞迁移,提高IEC-6细胞kv1.1 mRNA和蛋白表达水平及细胞膜电位超极化水平(P<0.05或P<0.01);与DFMO模型组比较,四君子汤多糖(40、80、160 mg/L)可逆转DFMO所致细胞迁移数减少、kv1.1 mRNA和蛋白表达的降低以及细胞膜电位去极化(P<0.05或P<0.01);与4-AP模型组比较,四君子汤多糖(20、40、80 mg/L)可逆转4-AP所致细胞迁移的抑制、kv1.1 mRNA和蛋白表达的降低(P<0.05或P<0.01).结论:四君子汤多糖可促进IEC-6细胞迁移,作用机制与影响多胺调控信号通路钾通道蛋白表达和细胞膜电位有关.

    作者:涂小华;李茹柳;邓娇;蔡佳仲;伍婷婷;陈蔚文 刊期: 2016年第04期

  • 虎眼万年青总皂苷诱导肝癌HepG-2细胞凋亡的机制研究

    目的:探讨虎眼万年青总皂苷诱导人肝癌HepG-2细胞凋亡的机制.方法:MTT法检测虎眼万年青总皂苷对HepG-2细胞增殖的影响;倒置显微镜观察细胞形态;流式细胞仪测定细胞凋亡率、细胞线粒体膜电位和Cyt-C蛋白表达水平;透射电镜观察细胞超微结构的改变;酶标仪检测细胞内Caspase-3活性.结果:虎眼万年青总皂苷对HepG-2细胞增殖有抑制作用,IC50为(79.80±0.18) μg/mL;虎眼万年青总皂苷作用细胞后,倒置显微镜下可见细胞变圆,折光性减弱,悬浮细胞增多;透射电镜下可见细胞出现典型的凋亡特征;随着虎眼万年青总皂苷浓度的增加,细胞凋亡率、细胞内Cyt-C表达水平及Caspase-3的活性均显著升高,细胞线粒体膜电位显著降低(P<0.05或P<0.01).结论:虎眼万年青总皂苷可显著抑制人肝癌HepG-2细胞的增殖,并可通过启动线粒体途径诱导HepG-2细胞发生凋亡.

    作者:曲中原;石鑫;邹翔;季宇彬 刊期: 2016年第04期

  • 跌打祛风膏基质处方的优化研究

    目的:优化跌打祛风膏的基质处方.方法:采用正交设计,以聚丙烯酸钠NP-700、高岭土、甘羟铝、酒石酸为考察因素,以成型巴布剂的初黏力、持黏力、剥离强度、综合感官为评价指标,进行综合评分,优选跌打祛风膏的基质处方.结果:跌打祛风膏佳基质处方为聚丙烯酸钠NP-700∶高岭土∶甘羟铝∶酒石酸=30∶30∶1∶0.3.结论:按优化基质处方制备的跌打祛风膏性能良好,易涂布、表面均匀、黏着力良好、剥离无残留、使用方便,该处方工艺简单,便于工业化生产.

    作者:周艳;黄志辉;区展龙;吴雪茹 刊期: 2016年第04期

  • 《本草纲目》引据《肘后备急方》之研究

    通过对《本草纲目》引据《肘后备急方》的署录方式、内容考实、药物品种和文献特点进行全面的整理和研究,充分说明李时珍对葛洪医药成果的继承和发展是全面和科学的,《肘后备急方》为李时珍编撰《本草纲目》增加了更为丰富的医药内涵,该文还对《本草纲目》引据《肘后备急方》存在的几个问题提出了讨论.

    作者:王剑;梅全喜 刊期: 2016年第04期

  • 白及与其代用品的形态组织学对比研究

    目的:规范白及的药材市场,建立代用品与正品白及之间的鉴定指标.方法:通过基原、性状、显微鉴别比较代用品与正品白及的异同.结果:代用品为小白及Bletilla formosana (Hayata) Schltr.、筒瓣兰Anthogonium gracileLindl.、苞舌兰Spathoglottis pubescens Lindl.、高褶带唇兰Tainia viridifusca(Hook.) Benth.et Hook.f..5种药材显微结构上有许多共性,但淀粉粒的形状、大小和数量,维管束类型、大小及黏液细胞大小,可作为白及与其代用品的鉴定指标.结论:研究结果建立了代用品与正品白及之间的鉴定指标,可为规范白及药材市场品种提供参考.

    作者:李剑美;尚宇南;叶德平;鲁超 刊期: 2016年第04期

  • 补肾祛瘀汤治疗PCOS患者的疗效及对激素水平的影响

    目的:观察补肾祛瘀汤治疗多囊卵巢综合征(PCOS)患者的临床疗效及对患者激素水平的影响.方法:选取郑州大学第二附属医院2012年1月~2015年1月收治的98例PCOS患者采用随机数字表法分为观察组和对照组各49例,两组患者均采用达英-35治疗,观察组加用补肾祛瘀汤进行辅助治疗,1个月为1疗程,两组患者均治疗3个疗程.结果:治疗后观察组患者血清T、LH、E2水平显著低于对照组(P<0.05);治疗后两组患者的BMI较治疗前均显著降低(P<0.05);观察组治疗后的LP水平显著低于对照组(P<0.05);治疗后观察组患者卵巢体积、卵泡数目、RI较对照组均显著减少或降低,PI显著高于对照组(P<0.05);观察组的治疗有效率显著高于对照组(P<0.05).结论:补肾祛瘀汤联合达英-35治疗PCOS患者的效果优于单用达英-35.

    作者:刘昕媛;谭丽 刊期: 2016年第04期

  • 基于PCR的半夏水煎液中半夏药材定量检测方法研究

    目的:建立基于PCR的半夏水煎液中半夏药材定量检测方法.方法:通过PCR技术,对半夏水煎液中半夏ITS区进行扩增,利用琼脂糖凝胶电泳分析扩增产物,建立半夏药材质量百分比和PCR扩增产物量的对应关系:另外对实时荧光定量PCR法与普通PCR琼脂糖凝胶电泳定量法进行了比较.结果:两种方法都能够实现对半夏药材含量的准确定量,但使用普通PCR琼脂糖凝胶电泳定量法的标准曲线线性更好(r=0.9943).结论:使用普通PCR技术可以实现半夏水煎液中半夏药材的定量检测,该方法特异性强,重复性好.该研究首次实现了基于PCR技术的水煎液中原药材的定量检测.

    作者:吴成丽;陈蓉;王巍;秦少容;余佳文;唐卓;邓赟 刊期: 2016年第04期

  • 多目标同步优化黄马缓释喷雾膜剂的基质处方

    目的:优选黄马缓释喷雾膜剂的基质组成,测定体外释放度及透皮性能,考察其释药规律.方法:采用正交设计法,以聚乙烯醇(PVA17-88)、乙醇和甘油的用量为因素,以成膜性能、士的宁和盐酸小檗碱在8h内的累积释放率为指标,确定优基质处方组成;用Franz扩散池法测定体外释放度及体外透皮渗透率.结果:优选得到的优基质处方为PVA17-88 5%,乙醇15%,甘油6%;黄马缓释喷雾膜剂的成膜性能较好,8h内的体外释放良好,具有一级动力学特征.结论:该喷雾膜剂处方和制备工艺可行;制剂可以喷涂均匀,药物释放缓慢,成膜后对溃疡面具保护作用,对创面刺激性小;药膜的黏附性、柔韧性均较好.

    作者:高倩;刘新;杨敏;刘梅;陈薇 刊期: 2016年第04期

  • 俄色黄酮分子胶囊的制备及表征

    目的:研究俄色黄酮分子胶囊的制备工艺并对其进行表征.方法:采用饱和水溶液-冷冻干燥法,通过Box-Behnken试验,以包合物收率和包合率为指标,优选俄色黄酮分子胶囊的制备工艺;采用X-射线衍射法(XRD)、差示扫描量热法(DSC)、热重分析法(TG)、紫外可见分光光度法(UV)及溶解度试验对其性质进行表征.结果:俄色黄酮分子胶囊佳工艺为:包合时间3.3h,包合温度81℃,β-环糊精(β-CD)与俄色黄酮的投料比1.9∶1.俄色黄酮分子胶囊的溶解度是俄色黄酮的15倍.结论:饱和水溶液-冷冻干燥法可用于制备俄色黄酮分子胶囊,该制备工艺方法简单易行,且β-CD明显提高了俄色黄酮在水中的溶解度.

    作者:沈睿娟;毛羽;舒莎;林灵敏;徐作军;雷敏;杨学军 刊期: 2016年第04期

  • 指纹图谱在前列安栓水提粉工艺质量控制中的应用

    目的:通过前列安栓水提粉HPLC指纹图谱系统,研究水提粉不同工序的成分损失及不同容量设备、不同工艺参数对质量波动的影响.方法:采用HPLC法,以Agilent HC-C18(250 mm×4.6 mm,5μm)为色谱柱;甲醇-0.25%冰醋酸溶液(pH 3.0)为流动相,25℃梯度洗脱;流速为1.0 mL/min;检测波长为280 nm.对两种提取温度的产品进行对比;对水提、醇沉、干燥工序的成分进行检测分析,研究工序损失率;对两种容量的提取设备进行对比.结果:建立有26个共有特征峰的对照图谱对A、B工艺样品进行分析,相似度均大于0.95;对A、B工艺不同工序进行含量分析,考察工序损失率,干燥工序>醇沉工序,A工艺优于B工艺,3M3罐优于2M3罐.结论:以HPLC指纹图谱法对中成药生产过程的中间产品进行分析和定量研究,对优化工艺参数和提高工艺质量控制水平具有重要意义.

    作者:王锐;郭国领;彭维;刘东来 刊期: 2016年第04期

  • 一测多评法测定蒌蒿药材中10种成分的含量

    目的:建立一测多评法同时测定蒌蒿药材中10种成分的含量.方法:以白藜芦醇为内参物,建立白藜芦醇与绿原酸、咖啡酸、芦丁、毛蕊花糖苷、7-甲氧基香豆素、肉桂酸、槲皮素、木犀草素和异鼠李素的相对校正因子,计算各成分的含量.同时采用外标法测定这10种成分的含量,比较两者之间的差异,以验证一测多评法的准确性和可行性.结果:采用一测多评法和外标法测定的结果无显著差异.结论:该方法准确度高、回收率好,可用于蒌蒿药材中多成分的质量评价.

    作者:罗文艳;段和祥;杨毅生;刘绪平;程奇珍 刊期: 2016年第04期

  • 柱前衍生化高效液相色谱法测定鳖甲生、制品中氨基酸的含量

    目的:建立柱前衍生化高效液相色谱法分析鳖甲生、制品中氨基酸的组成和含量.方法:采用酸水解法制备鳖甲生、制品的氨基酸样品溶液,以邻苯二甲醛(OPA)和9-芴甲基氯甲酸酯(FMOC)为柱前衍生化试剂,采用C18色谱柱,梯度洗脱.结果:18种氨基酸在38 min内得到较好分离,在一定浓度范围内线性关系良好(r≥0.9991),鳖甲生、制品中检出的16种氨基酸的平均加样回收率在90.43% ~ 110.69%之间,RSD在0.76% ~5.89%之间(n=6).结论:该方法分离效果较好,可用于测定鳖甲生、制品的氨基酸含量.

    作者:廖彭莹;周利琴;廖丹葵;孙丽霞;孙建华;韦建华 刊期: 2016年第04期

中药材杂志

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主管:国家食品药品监督管理局

主办:国家食品药品监督管理局,中药材信息中心站