林壹明;韩明亚;郑珍珠;林卫华;余科;傅清流
目的 探讨荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)在诊断培养后的羊水细胞Y染色体结构异常中的应用价值.方法 采用羊水细胞培养和G、C显带技术制备染色体,应用FISH技术进一步分析确定其核型.结果 G显带结果显示胎儿染色体核型为45,X[45]/46,X,dic(Y;Y)(p11.3;p11.2)[56]/46,XY[2],FISH检测结果与羊水染色体核型分析结果一致.结论 FISH技术结合传统细胞遗传学核型分析,对于诊断Y染色体结构异常非常重要.
作者:戴美珍;郑瑞琳;何哲航;潘一红;郑瑞 刊期: 2018年第01期
目的 确定1个先天性肌营养不良症(congenital muscular dystrophy,CMD)家系的POMT1致病基因突变,并对该家系中孕11周的胎儿进行产前诊断.方法 收集1例CMD患者及其表型正常父母的外周血标本,抽取母亲孕11周胎儿的绒毛标本.采用PCR扩增POMT1基因的第19和第20外显子,对PCR产物进行双向测序检测基因突变,明确致病突变来源后,进一步对胎儿进行产前诊断.结果 先证者POMT1基因第19外显子检测到c.1939G>A(p.Ala647Thr)杂合错义突变,来自其母亲;第20外显子检测到c.2141delG (p.Trp714Ter)杂合框移突变,导致蛋白质翻译的提前终止,该突变来自其父亲.产前诊断结果显示胎儿携带POMT1基因第19外显子c.1939G>A杂合错义突变,推测其为与母亲相同POMT1基因致病突变携带者的可能性大.结论 POMT1基因第19外显子c.1939G>A错义突变和第20外显子c.2141delG移码突变的复合杂合突变可能是该CMD家系的致病原因,符合常染色体隐性遗传的规律,通过基因产前诊断可以有效阻止致病突变的传递.
作者:陈晨;梅世月;朱朝锋;任依琳;孔祥东 刊期: 2018年第01期
患者男,30岁.因曾于其他医院诊断为染色体平衡易位携带者,且配偶“流产4次,且孕期均小于8周”来我院复查.患者表型无明显异常,自述存在性功能障碍.精液检查示精子活力差,数量少,且存在形态异常,激素检查未见明显异常,Y染色体微缺失检测未发现缺失.患者配偶体格检查及实验室检查均未见明显异常.患者夫妻为非近亲结婚,否认家族遗传病史,无手术外伤史.在征得其知情同意后,抽取外周静脉血,常规培养染色体,G显带分析,患者核型为46,XY,t(1;9)(9pter→9p22∷1p13→ 1qter;1pter→ 1p13∷ 9p22→ 9qter)(图1).患者妻子核型为46,XX.
作者:唐思诗;叶远馨;林立;周燕虹 刊期: 2018年第01期
目的 探讨5例戊二酸血症Ⅰ型(glutaric acidemia type Ⅰ,GA-Ⅰ)患者的GCDH基因突变情况,为临床诊治提供参考依据.方法 应用Sanger测序法对泉州地区5例GA-Ⅰ患者GCDH基因的所有外显子及侧翼内含子进行测序,并对测得序列进行分析,以寻找可能的致病突变位点.结果 5例患者均检测到GCDH基因突变,共检测到4种突变位点,包括2种错义突变[c.532G>A (p.G178R)、c.533G>A(p.G178E)]和2种移码突变[c.106_107delAC(p.Q37fs*5)、c.1244-2A>C].其中,c.1244-2A>C突变频率高,c.106_ 107delAC为未见报道的新突变,MutationTaster软件预测其为致病性突变.结论 本研究分析了5例戊二酸血症Ⅰ型患者的GCDH基因突变情况,从基因水平上证实了临床诊断,发现1个新的GCDH基因突变位点,丰富了GCDH基因的突变谱.
作者:林壹明;韩明亚;郑珍珠;林卫华;余科;傅清流 刊期: 2018年第01期
目的 探讨21-羟化酶缺陷症与男性睾丸发育不良的关系.方法 回顾分析8例男性不育患者的临床资料及其21-羟化酶基因的检测结果,总结其临床特征及治疗经验.结果 8例患者均表现为小睾丸(单侧睾丸平均体积为6.1mL),精液分析提示为无精或严重少精症.性激素检测卵泡刺激素、黄体生成素明显低于正常,睾酮正常或偏高,孕酮明显升高,促肾上腺皮质激素正常或偏高,皮质醇正常或偏低.3例伴睾丸肾上腺残余肿瘤.CT检查提示肾上腺皮质增生,5例呈腺瘤改变,1例呈肾上腺髓脂肪瘤.所有患者均给予地塞米松替代治疗.治疗3~6个月后,6例出现精子或精子浓度升高,5例的配偶成功妊娠.在8例患者中,共发现7个已知致病突变.结论 21-羟化酶缺陷症可导致男性睾丸不发育并损害生精功能,通过手术和地塞米松替代治疗可以取得良好的疗效.8例患者均为21-羟化酶基因复合杂合突变,均携带导致男性化表型的p.Ile172Asn致病突变.
作者:蒋波;马定远;陈欢欢;杨晓玉;崔毓桂;许争峰;刘嘉茵 刊期: 2018年第01期
先证者男,27岁,婚后7年未育.身高180 cm,智力发育、表型及外生殖器均无明显异常.精液常规检查提示严重少精,否认腮腺炎病史.Y染色体AZF区及SRY基因检测未见异常.细胞遗传学检查:在征得其知情同意后抽取外周血样,常规进行淋巴细胞培养,制备染色体,G显带分析,计数50个分裂相,镜下分析5个核型,患者核型为47,XY,+mar(图1),其母亲核型为46,XX[33]/47,XX,+mar[7](图2).其父亲和妻子核型未见异常.夫妻二人于2015年8月借助卵胞浆内单精子显微注射技术成功怀孕,孕中期羊水穿刺检查未见胎儿染色体异常,于2016年5月剖宫产一健康女婴.
作者:王娜;刘丽丽;盛晴;许蓬 刊期: 2018年第01期
非免疫性因素是引起胎儿水肿常见的原因,主要表现为各种原因引起的病理性液体蓄积,其病因复杂、死亡率高,预后取决于其潜在的致病因素,特别是患有染色体病或单基因遗传病的胎儿预后较差.本文中我们对非免疫性胎儿水肿的遗传学研究进展进行了综述.
作者:麻希洋;吴庆华 刊期: 2018年第01期
目的 探讨全基因组测序在鉴定新发染色体结构异常方面的应用价值.方法 应用全基因组测序检测1例外周血染色体核型为46,XY,ins(3)(q21p13p21)的患儿,其异常表型包括眼裂小、睑下垂、鼻梁低平等.结果 全基因组测序提示患儿的染色体断裂发生于3号染色体的55 473 257~78 341 929位置,这段序列插入到了3号染色体136 876 730~138 643 831的位置,所涉及的4个染色体断裂点均发生于基因间区,此外患儿在138 643 831~138 694 476之间的序列发生了缺失,其间包含睑裂狭小-睑下垂倒向型内眦赘皮综合征(blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome)的重要致病基因FOXL2.结论 染色体结构异常有可能造成断裂处基因的破坏或者在断裂区域发生染色体微缺失.要准确判断其致病性,需要同时进行基因和基因组层面的检测,而全基因组测序已成为其可选的方案.
作者:张芹;偶健;王玮;冯涛;段程颖;李培培;林春花;李红 刊期: 2018年第01期
目的 探讨BoBs技术联合传统的染色体核型分析对于减少出生缺陷的价值.方法 对690例具有产前诊断指征的单胎孕妇的羊水标本,用BoBs技术检测13、18、21、X、Y染色体的非整倍体异常和9种微缺失/微重复,并与羊水染色体核型分析的结果进行对比.结果 染色体核型分析的异常检出率为6.08%(42/690),其中包括数目异常36例、结构异常6例.BoBs检测的阳性率为5.95%(41/689),除常规羊水核型分析检出的染色体非整倍体外,另检出3例Xp22区微缺失、1例22qll区微重复、1例5p15区微重复,未检出染色体的平衡易位和正常多态性.结论 BoBs技术结合传统的核型分析适用于对大量的产前病例进行快速诊断,提高胎儿染色体异常的检出率.
作者:张健;张燕 刊期: 2018年第01期
目的 对基于胎儿游离DNA特异性位点的无创产前检测数据进行分析.方法 对需要分析的染色体进行特异性位点的序列捕获测序,同时选取其他染色体上的600个位点进行胎儿游离DNA的浓度分析.结果 在21和18号染色体上共捕获到768个特异性位点,可用于判断二者是否存在异常.当低检测的胎儿DNA浓度设定为3%、Z值阈值设定为[-6,6]时,分析结果的特异性为99.37%,敏感性为100%.讨论 开发了一种可靠、便利及成本较低的分析方法.利用较少的测序数据进行无创产前检测,可以准确地检测胎儿的21和18号染色体是否存在异常,并同步分析胎儿DNA的浓度.
作者:宣黎明;孔令印;夏滢颖;冒燕;申静静;祝轶君;薛永峰;孙丹凤;刘慧敏;梁波 刊期: 2018年第01期
目的 探讨Na-C1协同转运蛋白基因SLC12A3 rs11643718位点和上皮细胞钠通道基因SCNN1B rs12447134位点的多态性与朝鲜族原发性高血压的相关性.方法 对204例原发性高血压患者和186名健康对照进行研究,运用改进的多重连接酶检测反应(improved multiplex ligation detectionreaction,iMLDR)技术检测rs11643718、rs12447134位点的多态性.结果 患者组和对照组在SLC12A3 rs11643718位点的基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P值均<0.05),且与收缩压相关(P<0.01,隐性模型);SCNN1B rs12447134位点的基因型与等位基因频率在两组间的差异无统计学意义(P值均> 0.05),但与舒张压存在相关性(P<0.05,隐性模型).结论 SLC12A3基因rs11643718位点的多态性与中国朝鲜族人群原发性高血压易感性相关,可作为预测发病的分子标记物.
作者:史嘉翊;张春军;卜晓波;韩彦龙;邓代千;宋洁 刊期: 2018年第01期
目的 对1例Waardenburg综合征Ⅱ型先证者及其家系成员进行SOX10基因的突变分析,探讨其可能的分子生物学致病原因.方法 抽提先证者及其家系成员的外周血基因组DNA,芯片捕获高通量测序方法对MITF、PAX3、SOX10、SNA12、END3和ENDRB基因的全部外显子及其侧翼序列进行检测.根据高通量测序结果,对先证者及其父母进行突变位点的Sanger测序验证分析.结果 Sanger测序结果显示先证者存在SOX10 c.127 C>T(p.R43X)杂合突变,导致SOX10基因第43位编码精氨酸的密码子(CGA)突变为终止密码子(UGA),产生截短蛋白,影响蛋白质功能的正常发挥.经检索人类基因突变数据库,该突变为未报道过的新突变.患儿父母未检测到该突变.结论 先证者SOX10基因c.127C>T(p.R43X)杂合突变可能是其分子生物学致病原因.
作者:郑雷;闫有圣;陈雪;张钏;张庆华;冯暄;郝胜菊 刊期: 2018年第01期
目的 探讨一个家族性低钾型周期性麻痹(familial hypokalemic periodic paralysis,FPP)家系的致病突变.方法 采集先证者及9名家系成员的外周静脉血样,用PCR扩增目的基因CACNA1S、SCN4A的编码区,将扩增产物纯化后直接送测序,以100名健康个体为对照组.结果 先证者和5例患病亲属(共5男1女)均表现为低钾型周期性麻痹发作且均携带SCN4A基因c.664C>T(p.Arg222Trp)突变.在3名无症状家系成员及100名健康对照中未发现相同的突变.在该家系中未发现CACNA1S基因的突变.结论 SCN4A基因c.664C>T突变是该家系发病的分子基础.家系中的患者均表现为完全外显.
作者:郭曼丽;张国文;马绍刚;许铁;彭易根 刊期: 2018年第01期
目的 对1个遗传性多发性骨软骨瘤(hereditary multiple exostosis,HME)家系的先证者进行候选致病基因EXT1和EXT2的所有外显子检测,以寻找该HEM家系的致病性突变.方法 应用PCR技术扩增EXT1、EXT2的全部外显子并进行直接Sanger测序分析.结果 测序结果显示先证者EXT1基因第4外显子存在c.1202delT(p.I401Tfs*2)杂合缺失突变,该突变导致401位后的编码氨基酸发生移码,并在第402位引入终止密码,使EXT1编码的全长746氨基酸组成的蛋白质缩减至由402个氨基酸组成的截短型蛋白.该家系的其他6例患者均存在EXT1 c.1202delT的杂合移码突变,而表型正常家系成员未检测到该突变,符合基因型-表型共分离.未检测到EXT2基因的可疑突变.结论 EXT1c.1202delT杂合移码突变是导致这个HME家系患者发病的分子机制.
作者:娄桂予;杨科;秦立涛;张玉薇;王红丹;侯巧芳;何淼;廖世秀 刊期: 2018年第01期
目的 探讨南方汉族人群白血病与KIR2DL4等位基因多态性的相关性.方法 提取南方汉族急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)(n=283)、急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)(n=227)、慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)(n=80)患者和306名南方汉族随机正常志愿捐血者的DNA基因组,应用本实验室自行设计的引物对KIR2DL4基因的全部8个外显子进行测序分型,用Assign 4.7分析软件判定基因型.用SPSS 13.0统计软件分别对检出的每个KIR2DL4等位基因、10A型等位基因和9A型等位基因的检出比例分别进行差异显著性分析,并进行P值校准(Pc).结果 ALL、AML、CML患者和正常对照均检出5种等位基因:KIR2DL4* 001、*005、*006、*008、*011.ALL病例组与对照组的KIR2DL4*011等位基因检出比例、10A型KIR2DL4等位基因检出比例的差异有统计学意义(KIR2DL4* 011∶OR=1.66,P=0.01;10A型KIR2DL4∶OR=0.42,P=0.03),但P值经过校准后,差异均无统计学意义(Pc≥0.05).AML、CML病例组分别与对照组检出的各个KIR2DL4等位基因、10A型等位基因和9A型等位基因的检出比例进行比较,组间比较差异均无统计学意义(P>0.05、Pc>0.05).结论 南方汉族ALL、AML、CML白血病与KIR2DL4等位基因多态性无显著关联.
作者:陈瑞;邓志辉 刊期: 2018年第01期
硫胺素又称维生素B1,是体内重要的维生素.作为多种酶的辅酶,其活化形式硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate,TPP)参与细胞的新陈代谢.硫胺素转运和激活缺陷将导致细胞缺乏硫胺素,影响正常的代谢功能,导致多种疾病.本文就硫胺素转运和激活缺陷及其相关疾病做一综述.
作者:冼肖英;林发全 刊期: 2018年第01期
目的 对1例仅表现为哭声无力,声音嘶哑,无特殊面容,不伴有先天性心脏病等其他症状或体征的不典型新生儿猫叫综合征患儿的临床及遗传学特点进行分析.方法 对患儿及其父母外周血淋巴细胞G显带染色体核型分析,对患儿用应荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行验证,之后用染色体微阵列法(chromosome microarray analysis,CMA)进一步精确遗传学分析.结果 患儿染色体核型分析结果为46,XX,del(5)(p14p15),其父母外周血染色体核型分析未见异常.FISH结果证实了此缺失的存在.染色体微阵列检测结果显示患儿chr5p15.33p14.1区域存在25.7 Mb片段缺失.结论 猫叫综合征患者个体表型可存在较大差异,尤其是对于新生儿易导致漏诊、误诊.应用细胞遗传学与分子遗传学技术相结合的综合分析有利于弥补单一方法的不足,更加精确地对缺失片段进行定位.
作者:贺文凤;陈贺;牟海燕;李洁 刊期: 2018年第01期
目的 对一个姨表近亲婚配的遗传性凝血因子Ⅻ(coagulation factor FⅫ,Ⅻ)缺陷症家系进行实验室表型和FⅫ基因突变的分析,探讨其分子发病机制.方法 检测先证者及9名家系成员活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)等凝血常规功能、FⅫ活性(FⅫactivity,FⅫ∶C)和FⅫ抗原(FⅫantigen,FⅫ∶Ag)含量,进行表型诊断;用DNA直接测序法分析先证者FⅫ基因所有14个外显子、侧翼、5'和3'非翻译区及家系成员相应的突变位点区域,用反向测序证实突变.采用ClustalX-2.1-win软件分析突变氨基酸的保守性,并同时采用4个生物信息学评分软件(PolyPhen-2,PROVEAN,SIFT和MutationTaster)分析突变对蛋白质功能的影响.结果 先证者(Ⅳ2)和哥哥(Ⅳ1)APTT明显延长(分别为61.6s和68.6s),FⅫ∶C和FⅫ∶Ag分别降低为12%、10%和11%、10%;先证者祖母(Ⅱ2)、外祖母(Ⅱ3)、父亲(Ⅲ2)、母亲(Ⅲ6)、大姑(Ⅲ1)和大姨(Ⅲ5) APTT正常,FⅫ∶C和FⅫ∶Ag均降低约为正常值的一半;先证者小姑(Ⅲ3)和大舅(Ⅲ4)各项指标及家系成员其它指标均正常.基因测序发现先证者(Ⅳz)和其哥哥(Ⅳ1)FⅫ基因第10外显子存在c.1078G>A(p.Gly341Arg)纯合错义突变;先证者祖母(Ⅱ2)、外祖母(Ⅱ3)、父亲(Ⅲ2)、母亲(Ⅲ6)、大姑(Ⅲ1)和大姨(Ⅲ5)均存在p.Gly341Arg杂合错义突变;先证者小姑(Ⅲ3)和大舅(Ⅲ1)为正常野生型.ClustalX-2.1-win软件保守性分析结果表明,Gly341在同源物种间高度保守.4个生物信息学软件对该突变的预测结果一致:PolyPhen-2评分(0.934分)、PROVEAN评分(-6.214分)均预示为有害突变;MutationTaster评分(0.976分)预示可引起相应疾病;SIFT评分(0.01分)预示可影响蛋白质功能.结论 Gly341Arg纯合错义突变是该家系遗传性FⅫ缺陷症的分子发病机制,与先证者父母近亲结婚有关.
作者:杨丽红;金赛燕;季伟丹;程晓丽;李小龙;金艳慧;王明山 刊期: 2018年第01期
目的 分析伴15q11q13拷贝数重复的自闭症患儿的遗传学特点及基因型-表型对应关系.方法 应用染色体核型分析、染色体微阵列(chromosomal microarray analysis,CMA)和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术联合对患儿及父母进行检测和验证.结果 核型分析提示8例患儿核型均携带标记染色体(supernumerary marker chromosome,SMC),2例患儿核型正常,但CMA结果显示其均在15q11q13区的拷贝数重复(前者为4个重复,后者为3个重复),且均覆盖Prader Willi/Angelman综合征关键区(Prader-Willi/Angelman syndrome critical region,PWACR).通过对其父母进行CMA检测,证实患儿在该区域重复均为新生突变,并应用Chromosome Analysis Suite Software软件对患儿及父母该区域单核苷酸多态性位点进行比对,证实患儿该拷贝数重复片段为母源性,诊断为15q11q13重复综合征.应用该区域特异位点FISH探针对核型分析显示携带SMC的患儿样本进行检测,证实了该SMC即为15q11q13拷贝数重复片段,且为两个拷贝,与CMA检测结果相吻合.结论 联合应用核型分析、CMA和FISH技术对临床10例自闭症患儿做出了诊断,并建立了临床表型与基因型之间的联系.
作者:王维鹏;胡昌明;毕欣;袁海明 刊期: 2018年第01期
目的 探讨1个Peutz Jeghers综合征家系的遗传学病因.方法 收集先证者及其7位3代以内亲属的外周血样或口腔拭子,提取基因组DNA,采用二代测序技术对先证者106个目标基因的外显子以及邻近的内含子区域进行测序,并通过二代测序验证STK11的疑似致病突变.结果 在先证者的STK11基因内检测到一处既往未见报道的杂合突变NM_000455.4:c.419T>C(RefSeq编号Human GRCh37/hg19),该突变导致STK11基因编码蛋白的第140位氨基酸由亮氨酸转变为脯氨酸.先证者母亲的二代测序验证结果为阳性,其余亲属该位点则未发现突变.结论 STK11基因的NM_000455.4:c.419T>C突变可能是先证者发病的原因.
作者:许翠洋;马悦;曹非;赵赫;王永洁;肖泽文;唐洁冰;燕飞虎;孙鹏;张娜;陶冀 刊期: 2018年第01期