潘玉纯;吴维青;罗彩群;谢建生;徐志勇;耿茜;郝颖
目的 探讨1个Peutz Jeghers综合征家系的遗传学病因.方法 收集先证者及其7位3代以内亲属的外周血样或口腔拭子,提取基因组DNA,采用二代测序技术对先证者106个目标基因的外显子以及邻近的内含子区域进行测序,并通过二代测序验证STK11的疑似致病突变.结果 在先证者的STK11基因内检测到一处既往未见报道的杂合突变NM_000455.4:c.419T>C(RefSeq编号Human GRCh37/hg19),该突变导致STK11基因编码蛋白的第140位氨基酸由亮氨酸转变为脯氨酸.先证者母亲的二代测序验证结果为阳性,其余亲属该位点则未发现突变.结论 STK11基因的NM_000455.4:c.419T>C突变可能是先证者发病的原因.
作者:许翠洋;马悦;曹非;赵赫;王永洁;肖泽文;唐洁冰;燕飞虎;孙鹏;张娜;陶冀 刊期: 2018年第01期
目的 探讨Na-C1协同转运蛋白基因SLC12A3 rs11643718位点和上皮细胞钠通道基因SCNN1B rs12447134位点的多态性与朝鲜族原发性高血压的相关性.方法 对204例原发性高血压患者和186名健康对照进行研究,运用改进的多重连接酶检测反应(improved multiplex ligation detectionreaction,iMLDR)技术检测rs11643718、rs12447134位点的多态性.结果 患者组和对照组在SLC12A3 rs11643718位点的基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P值均<0.05),且与收缩压相关(P<0.01,隐性模型);SCNN1B rs12447134位点的基因型与等位基因频率在两组间的差异无统计学意义(P值均> 0.05),但与舒张压存在相关性(P<0.05,隐性模型).结论 SLC12A3基因rs11643718位点的多态性与中国朝鲜族人群原发性高血压易感性相关,可作为预测发病的分子标记物.
作者:史嘉翊;张春军;卜晓波;韩彦龙;邓代千;宋洁 刊期: 2018年第01期
先证者男,27岁,婚后7年未育.身高180 cm,智力发育、表型及外生殖器均无明显异常.精液常规检查提示严重少精,否认腮腺炎病史.Y染色体AZF区及SRY基因检测未见异常.细胞遗传学检查:在征得其知情同意后抽取外周血样,常规进行淋巴细胞培养,制备染色体,G显带分析,计数50个分裂相,镜下分析5个核型,患者核型为47,XY,+mar(图1),其母亲核型为46,XX[33]/47,XX,+mar[7](图2).其父亲和妻子核型未见异常.夫妻二人于2015年8月借助卵胞浆内单精子显微注射技术成功怀孕,孕中期羊水穿刺检查未见胎儿染色体异常,于2016年5月剖宫产一健康女婴.
作者:王娜;刘丽丽;盛晴;许蓬 刊期: 2018年第01期
目的 探讨钙黏蛋白-13 (T cadherin,CDH13)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与中国人群代谢综合征(metabolic syndrome,MS)的相关性.方法 应用TaqMan方法对453例MS患者和526名正常对照的6个CDH13基因的多态性位点(rs11646213、rs12596316、rs3865188、rs12444338、rs12051272以及rs7195409)进行基因分型.评估以上6个多态性位点与MS的相关性.结果 CDH 13基因rs11646213、rs3865188、rs12444338、rs12051272和rs7195409多态性位点的基因型频率及等位基因频率在MS患者和对照者的差异无统计学意义.校正年龄和性别后,CDH13基因rs12596316AG基因型发生MS的风险为rs12596316 AA+GG基因型的1.38倍(P=0.01,95%CI:1.07~1.78);CDH13基因rs12596316等位基因频率在MS和对照组间差异无统计学意义.rs11646213 rs12596316-rs3865188-rs12444338-rs12051272单倍型频率在MS组和对照组的差异无统计学意义.结论 CDH13基因rs11646213、rs3865188、rs12444338、rs12051272和rs7195409位点多态性可能与中国人群MS无相关;CDH13基因rs12596316AG基因型可能增加中国人群MS发病风险.
作者:李奕平;杨莹;鲁帅尧;李显丽;杨曼;熊煜欣;陶文玉;王晓苓;姚宇峰;肖春杰 刊期: 2018年第01期
例1 女,25岁.结婚3年,G3P0,第1、2次妊娠均于12周自然流产,第3次为妊娠16周超声检查发现胎儿多发畸形行引产.患者表型正常,平素月经规律.3次妊娠期间无患病及服药史,无毒害物质及放射线接触史,夫妻非近亲结婚,否认家族遗传病史.细胞遗传学检查:经知情同意后采集肝素抗凝外周静脉血,常规淋巴细胞培养,染色体制备、G显带,计数20个,核型分析5个.患者染色体核型为46,XX,t(7;13)(q34;q22)(图1A).丈夫染色体核型分析及精液检查均未见异常.
作者:王雪松;李娅亨;朱海燕;张海荣 刊期: 2018年第01期
目的 探讨一个家族性低钾型周期性麻痹(familial hypokalemic periodic paralysis,FPP)家系的致病突变.方法 采集先证者及9名家系成员的外周静脉血样,用PCR扩增目的基因CACNA1S、SCN4A的编码区,将扩增产物纯化后直接送测序,以100名健康个体为对照组.结果 先证者和5例患病亲属(共5男1女)均表现为低钾型周期性麻痹发作且均携带SCN4A基因c.664C>T(p.Arg222Trp)突变.在3名无症状家系成员及100名健康对照中未发现相同的突变.在该家系中未发现CACNA1S基因的突变.结论 SCN4A基因c.664C>T突变是该家系发病的分子基础.家系中的患者均表现为完全外显.
作者:郭曼丽;张国文;马绍刚;许铁;彭易根 刊期: 2018年第01期
例1孕妇,28岁,G1P0,孕17+4周时因无创DNA产前检测结果提示性染色体异常高风险来我院就诊.孕妇及其配偶非近亲结婚,否认有家族遗传史、有毒有害物质接触史.此次为促排卵后(因卵泡不破裂)妊娠.行羊膜穿刺羊水细胞培养,胎儿核型为48,XXXX.见图1.夫妻双方染色体检查均正常.
作者:李照侠;朱瑞芳;顾雷雷;张颖;薛原;李洁 刊期: 2018年第01期
目的 探讨荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)在诊断培养后的羊水细胞Y染色体结构异常中的应用价值.方法 采用羊水细胞培养和G、C显带技术制备染色体,应用FISH技术进一步分析确定其核型.结果 G显带结果显示胎儿染色体核型为45,X[45]/46,X,dic(Y;Y)(p11.3;p11.2)[56]/46,XY[2],FISH检测结果与羊水染色体核型分析结果一致.结论 FISH技术结合传统细胞遗传学核型分析,对于诊断Y染色体结构异常非常重要.
作者:戴美珍;郑瑞琳;何哲航;潘一红;郑瑞 刊期: 2018年第01期
目的 探讨一个家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家系APC和MLH1基因的突变情况.方法 通过临床表现、家族史及组织病理学等诊断1例FAP女性患者.患者两年后出现子宫内膜上皮内瘤变(endometrial intraepithelial neoplasia,EIN),而后者是Ⅱ型Lynch综合征的病变之一.提取患者及其家系成员的外周血DNA,采用Sanger测序的方法筛查APC和MLH1基因突变.结果 该家系同时存在APC基因第7外显子的杂合性突变c.637C>T(p.R213X)和MLH1基因第12外显子的杂合性突变c.1153C>T(p.R385C).两种突变同时出现的情况既往未见报道.前者突变造成终止密码子提前出现,后者突变了造成氨基酸的改变.结论 同时出现的APC基因c.637C>T (p.R213X)和MLH1基因c.1153C>T(p.R385C)突变是该家系的致病性突变,其出现临床表现的年龄较晚,且严重程度存在差异.对于FAP患者,应询问其家族史并对APC基因进行突变筛查,同时关注其是否存在肠外病变.对于出现子宫内膜病变的患者,可进行MMR基因的筛查,以确定是否同时存在Lynch综合征.
作者:尚晨光;刘林枝;王小慧;董颖;张岩 刊期: 2018年第01期
患者女,39岁,G3 P0,因习惯性流产就诊.夫妇身体健康,非近亲结婚,否认遗传病家族史,否认有毒有害物质接触史.细胞遗传学检查:在签署知情同意书后,抽取外周血0.5mL接种至RPMI 1640培养基中,在37℃下培养72 h,在终止培养前60 min加入秋水仙素.常规收获中期分裂相细胞,制片,75℃烤片24 h,胰酶消化,G显带处理并染色.结合Ikaros图像分析软件(德国Zeiss公司)分析染色体核型,计数100个细胞,分析10个核型.根据国际人类染色体命名系统(ISCN2013),患者的染色体核型为46,XX,t(1;10)(10pter→10p13∷1p32→ 1qter;1 pter→1p32∷10p13→ 10qter)(图1),其丈夫染色体核型未见异常,拒绝接受家系调查.
作者:孙媛;王桂林;邓胜;张玉洁;梁超;王绪华;刘建勇 刊期: 2018年第01期
例1 女,38岁,孕2产1,孕15+6周产前筛查结果提示21三体高风险(1/64),18三体高风险(1/10),胎儿超声未见异常.孕18周在超声引导下抽取羊水进行染色体培养,常规制片及G显带,计数20个分裂相,分析5个核型,胎儿核型为46,XN,inv(22)(? p11p12),见图1A.孕妇核型为46,XN,inv(22)(?p11p12),其丈夫核型未见异常.孕妇选择继续妊娠,剖宫产一表型正常儿.
作者:邓舒;姜雨婷;潘袁;张馨月;李德军;陈爽;刘睿智 刊期: 2018年第01期
目的 探讨南方汉族人群白血病与KIR2DL4等位基因多态性的相关性.方法 提取南方汉族急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)(n=283)、急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)(n=227)、慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)(n=80)患者和306名南方汉族随机正常志愿捐血者的DNA基因组,应用本实验室自行设计的引物对KIR2DL4基因的全部8个外显子进行测序分型,用Assign 4.7分析软件判定基因型.用SPSS 13.0统计软件分别对检出的每个KIR2DL4等位基因、10A型等位基因和9A型等位基因的检出比例分别进行差异显著性分析,并进行P值校准(Pc).结果 ALL、AML、CML患者和正常对照均检出5种等位基因:KIR2DL4* 001、*005、*006、*008、*011.ALL病例组与对照组的KIR2DL4*011等位基因检出比例、10A型KIR2DL4等位基因检出比例的差异有统计学意义(KIR2DL4* 011∶OR=1.66,P=0.01;10A型KIR2DL4∶OR=0.42,P=0.03),但P值经过校准后,差异均无统计学意义(Pc≥0.05).AML、CML病例组分别与对照组检出的各个KIR2DL4等位基因、10A型等位基因和9A型等位基因的检出比例进行比较,组间比较差异均无统计学意义(P>0.05、Pc>0.05).结论 南方汉族ALL、AML、CML白血病与KIR2DL4等位基因多态性无显著关联.
作者:陈瑞;邓志辉 刊期: 2018年第01期
目的 比较外周血胎儿游离DNA无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)对于不同指征的孕妇的临床检测效能.方法 选择接受NIPT检测的孕妇10 275例,对胎儿的染色体非整倍体进行全基因组低覆盖检测,对高风险者进一步进行产前诊断,对所有孕妇的妊娠结局进行随访.结果 NIPT检测提示72例胎儿为常染色体非整倍体高风险(21三体57例、18三体14例、13三体1例).经羊水染色体检查,确诊21三体56例,18三体13例,13三体1例.NIPT对于21三体和18三体的阳性预测值分别为98.25%和91.67%,对于高龄、血清学筛查高风险、临界风险以及自愿要求进行检查者的阳性预测值分别为100%、95%、90%和50%.随访发现1例血清学筛查提示21三体为高风险者为假阴性.在确诊的56例21三体中,血清学筛查高风险占55%,高龄占29%,临界风险者占l4%,自愿要求者占2%.结论 NIPT对21三体、18三体和13三体的筛查效果较为理想,可以有效监管高龄孕妇人群,对血清学筛查高风险和临界风险人群取得了很好的二级筛查效果,能够大限度地降低出生缺陷的发生率.
作者:张玢;潘凌燕;王慧艳;刘建兵;陆蓓亦;陈英苹;龙伟;虞斌 刊期: 2018年第01期
目的 探索一种检测22q11.2微缺失综合征的新方法.方法 针对22q11.2微缺失综合征特异缺失区内的TBX1基因和内参基因RPP30设计引物和探针,采用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的方法计算TBX1/RPP30的比值,检测22q11.2区段微缺失.结果 通过数字PCR方法计算TBX1/RPP30的比值检测22q11.2微缺失综合征,检出3例微阵列比较基因组杂交检测结果为22q11.2微缺失综合征阳性的样本.在14例临床诊断为先天性心脏病的患儿中检测出2例22q11.2微缺失阳性样本.结论 微滴数字PCR可以准确检测出22q11.2区段微缺失,可提供一种快速、经济的检测先天性心脏病相关染色体22q11.2微缺失综合征的方法.
作者:周香城;张翠翠;李泌;马健;陈秋平;孙善权;张亮 刊期: 2018年第01期
先证者男,27岁,其妻孕2产0,两次均于孕50+天发生胚胎停育.细胞遗传学检查:在获得其知情同意后,抽取双方的外周血样,常规细胞培养,收获制片,G显带分析.先证者核型为46,XY,t(7;13) (7pter→7q34∷13q22→ 13qter;13pter→ 13q22∷7q34→7qter)(图1),其妻核型为46,XX.先证者父母拒绝接受染色体检查.
作者:封纪珍;魏淑彦;杨会欣;李天洁 刊期: 2018年第01期
目的 采用遗传病相关基因外显子测序的方法确定1例皮肤松弛症患儿的致病基因,并对其相关的临床表型及基因型进行总结.方法 收集先证者及其父母的临床资料,首先对先证者进行遗传病相关基因的外显子测序,确定了可能的致病突变,对先证者及其父母进行Sanger测序验证,确定基因突变位点.结果 先证者存在A TP6V0A2基因c.187C>T(p.R63X)杂合突变和c.1189G>C(p.A397P)杂合突变,先证者父母分别携带ATP6V0A2基因c.1189G>C(p.A397P)杂合突变和c.187C>T(p.R63X)杂合突变.结合患儿临床表型,诊断为常染色体隐性遗传皮肤松弛症2A型(autosomal recessive cutis laxa type 2A,ARCL2A).结论 通过遗传学方法确诊了ARCL2A型患儿,总结了ARCL2A患儿的典型临床特征,新突变的发现扩大了ATP6V0A2基因的突变谱.外显子测序可作为诊断复杂遗传病致病基因的重要工具.
作者:张平平;王昕;高志杰;刘晓雁;陈倩 刊期: 2018年第01期
目的 对有不良生育史的男性进行染色体核型分析,探讨染色体异常及多态性与不良生育的关系.方法 对10 172例男性进行常规外周血淋巴细胞培养,染色体制备以及G显带核型分析.结果 共检出染色体异常核型268例,检出率为2.63%,其中包括染色体结构异常205例,数目异常55例,46,XX性发育睾丸疾病8例(2.99%,8/268).染色体多态性748例,检出率7.36%.结论 男性染色体异常和多态性可导致不良生育的发生.在进行遗传咨询时,必须重视男性染色体核型分析.
作者:王游声;黄演林;陈汉彪;郭莉;钟银环;尹爱华 刊期: 2018年第01期
目的 对两个中国人原发性限局性皮肤淀粉样变家系进行致病基因的突变鉴定.方法 在取得知情同意后,采集家系成员的外周血,使用酚-氯仿法提取基因组DNA;应用PCR扩增两家系先证者OSMR基因的全部17个外显子及外显子/内含子衔接区,通过Sanger测序鉴定候选致病突变;通过PCR-限制性片段长度多态性分析以及高分辨熔解曲线分析进行致病突变的家系验证.结果 家系1中6例患者均携带OSMR基因第10外显子c.1538G>A错义突变,家系2中4例患者均携带OSMR基因第14外显子c.2081C>T错义突变;两个家系中所有正常个体及健康对照均未携带上述突变.结论 在两个原发性限局性皮肤淀粉样变家系中发现了OSMR基因内的两个错义突变(c.1538G>A和c.2081C>T).该结果与既往的报道一致,再次证明了这些突变的致病性.
作者:茅彬;姚煦;王铮;赵秀丽 刊期: 2018年第01期
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准.首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题.本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展.
作者:黄辉;沈亦平;顾卫红;王伟;王一鸣;祁鸣;沈珺;邱正庆;于世辉;周在威;陈白雪;陈蕾;陈云弟;崔欢欢;杜娟;高勇;郭一然;胡婵娟;胡亮;黄颐;李培培;李厦戎;李秀蓉;刘雅萍;卢洁;马端;马永毅;彭嵋;宋昉;孙洪业;汪亮;王大伟;王静敏;王玲;王正远;王志农;吴继红;吴静;伍建;许怡民;姚宏;杨东声;杨旭;杨艳玲;张颖;周裕林;朱宝生;曾思聪;彭智宇;黄尚志 刊期: 2018年第01期
目的 明确5例新生儿肝内胆汁淤积症患儿的分子机制.方法 应用新一代测序技术对患儿的SLC25A13基因进行外显子捕获检测,对突变位点进行Sanger测序验证.用PolyPhen 2软件对新突变的致病性进行分析.结果 5例患儿均携带SLC25A13基因的复合突变,共发现8个突变位点,其中2个既往未见报道(c.1357A>G和c.1663dup23).5例患儿的父母均为突变携带者.结论 SLC25A 13基因的突变可能是5例患儿的发病原因,所携带的突变以851de14和1638 1660dup为主.新发现的c.1357A>G和c.1663dup23突变丰富了SLC25A13基因的突变谱.
作者:徐俊杰;高敏;律玉强;唐运萍;魏旭霞;杨露;张开慧;刘毅;盖中涛 刊期: 2018年第01期